Professional Documents
Culture Documents
Podrcznik Chemia medyczna przeznaczony jest przede wszystkim dla studentw Akademii Medycznych, jako pomoc dydaktyczna podczas realizacji programu nauczania z chemii na I roku studiw i stanowi teoretyczne uzupenienie do
wicze zawartych w Praktikum z chemii medycznej. W podrczniku przedstawiono wybrane wiadomoci z chemii oglnej, analitycznej, instrumentalnej oraz organicznej. Pocztkowe rozdziay w zwizy i nowy sposb przypominaj studentom
wybrane wiadomoci z programu dydaktycznego szkoy redniej, ktre s niezbdne podczas realizacji nauczania chemii na I roku medycyny. Materia ten dotyczy
wiza chemicznych, roztworw wodnych wraz ze sposobami wyraania ich ste, reakcji w roztworach wodnych oraz waciwoci roztworw buforowych.
Cz z tych wiadomoci przedstawiono w formie zada z rozwizaniami, ktre
stanowi wzorcowe przykady pozwalajce na ostateczne opanowanie podstawowych oblicze chemicznych. W tym te celu zamieszczono na kocu podrcznika
szczegowy ukad okresowy i zestaw tabel z wybranymi parametrami fizykochemicznymi (rozdzia 22).
Przedstawione w podrczniku informacje, dotyczce zagadnie rwnowagi
wodno-elektrolitowej, skadnikw bionieorganicznych oraz rwnowagi kwasowo-zasadowej pynw ustrojowych niezbdne s do poznania i zrozumienia chemicznych podstaw mechanizmw homeostazy w roztworach wodnych ustroju. Wiadomoci te stanowi dla studenta medycyny podstawowy zakres nowej wiedzy chemicznej, ktr bdzie dalej pogbia podczas studiw.
Dalsz cz stanowi chemia organiczna. Oglne podstawy z tego zakresu
studenci zdobyli w szkole redniej i sprawdzili sw wiedz podczas egzaminw
wstpnych na studia medyczne. Na tej podstawie zakadam, e studenci I roku
medycyny maj wiadomoci z chemii organicznej programu dydaktycznego szkoy
redniej, ktre s niezbdne do dalszej realizacji nauczania chemii na studiach.
W celu przypomnienia wiadomoci, na kocu podrcznika zestawiono w tabelach
najwaniejsze grupy funkcyjne (rozdzia 22). Podstawowym zakresem nowej wiedzy chemicznej dla medyka, ktr bdzie dalej zgbia podczas studiw jest
przede wszystkim chemia organiczna realizowana na przykadach zwizkw wystpujcych w modelowym organizmie ywym, jakim jest czowiek.
Podczas mojej wieloletniej pracy dydaktycznej w lskiej Akademii Medycznej mogam obserwowa kopoty studentw z przyswojeniem nieatwych zagadnie przewidzianych programem nauczania chemii, dotyczcych struktury, wa7
Iwona ak
1.
ATOMY, CZSTECZKI,
WIZANIA CHEMICZNE
Iwona ak
1s
2s
2p
3s
3p
4s
3d
4p
5s
4d
5p
6s
4f
5d
6p;
dostpne nie zapenione orbitale o jednakowej energii, np. orbitale p, zajmowane s kolejno przez pojedyncze elektrony ze spinami skierowanymi w t sam
stron, a wszystkie zostan zajte (regua Hunda); przykadowy opis konfiguracji elektronowej w stanie podstawowym i w stanie wzbudzonym atomw ilustruje tabela 1.
Liczba pojedynczo obsadzonych orbitali ma odzwierciedla liczb wiza
kowalencyjnych, jakie moe utworzy atom. Analizujc pierwiastki nalece do
kolejnych grup ukadu okresowego, atwo zauway, e w stanie podstawowym
atomu liczba niesparowanych elektronw walencyjnych berylowcw, borowcw
i wglowcw nie zawsze jest zgodna z ich wartociowoci.
Koncepcja stanw wzbudzonych atomw pozwala wyjani t pozorn
niezgodno zmian konfiguracji elektronowej. W atomie w stanie wzbudzonym
(na skutek zblienia si atomu zdolnego do utworzenia wizania chemicznego)
pojawiaj si dodatkowe niesparowane elektrony walencyjne, w wyniku przejcia
z zapenionego niszego podpoziomu na wolny podpoziom wyszy. Istnienie atomu w stanie wzbudzonym jest ograniczone tylko do atomw zwizanych w czsteczce, wolne atomy w stanie wzbudzonym nie istniej.
Stan wzbudzenia zmienia konfiguracj elektronw walencyjnych w atomach
berylu, boru i wgla (tab. 1), sprawiajc, e liczba niesparowanych elektronw
odzwierciedla wartociowoci tych pierwiastkw w zwizkach chemicznych.
10
Liczba
atomowa
Konfiguracja w stanie
podstawowym
wzbudzonym
Wodr
1s
Beryl
2p
2s
1s
Bor
2p
2s
1s
2p
2s
1s
bez zmiany
Azot
2p
2s
1s
2p
2s
1s
bez zmiany
Tlen
3s
2p
2s
1s
bez zmiany
Wgiel
Sd
11
bez zmiany
Atomy, ktre posiadaj jeden, dwa lub trzy elektony walencyjne mog tworzy odpowiadajc im liczb wiza kowalencyjnych, natomiast atomy z czterema
lub wicej elektronami na powoce walencyjnej mog tworzy tyle wiza, ile
potrzebuj elektronw do zapenienia orbitali s i p swych powok walencyjnych dla
utworzenia oktetu. Przykadowo, beryl tworzy dwa wizania, bor trzy, wgiel czte11
ry, azot trzy, a tlen dwa wizania kowalencyjne. Atom boru (np. w czsteczce BF3)
nie moe utworzy trwaej struktury oktetu, natomiast atomy pierwiastkw, ktre
dysponuj orbitalami d i inne, np. SF6, mog nie spenia reguy oktetu, poniewa
na powoce walencyjnej maj wicej elektronw.
Elektronami niewicymi, ktre nosz rwnie nazw wolnej pary elektronowej, s sparowane elektrony walencyjne nie zaangaowane w tworzeniu wiza kowalencyjnych. Przykadami z tabeli 1 mog by atom azotu (np. w czsteczce amoniaku), ktrego dwa elektrony walencyjne tworz woln par elektronow
(2s), oraz atom tlenu (np. w czsteczce wody), ktry ma dwie pary wolnych elektronw (2s, 2p).
Atomy cz si ze sob, poniewa wytworzona czsteczka jest bardziej
trwaa, ma mniejsz energi ni poszczeglne, pojedyncze atomy. W stanie naturalnym niemal wszystkie pierwiastki chemiczne istniej w postaci czsteczkowej.
Dotychczas nie stworzono uniwersalnej teorii wizania chemicznego, ktra
tumaczyaby jednolicie ca rnorodno i zoono wszystkich struktur czsteczkowych. Opracowano wiele teorii i metod wyjaniajcych rnorodne cechy
i waciwoci wizania chemicznego. Najstarsz jest elektronowa teoria wizania
chemicznego, stworzona przez Lewisa na pocztku XX wieku. Powszechnie znana,
poniewa jest przedmiotem nauczania chemii, zarwno na poziomie podstawowym, jak i rednim, dlatego w podrczniku chemii medycznej mona zrezygnowa
ze szczegowego jej omawiania.
Teoria elektronowa wizania chemicznego opiera si na konfiguracji oktetowej (czasami dubletowej) elektronw walencyjnych (charakterystycznej dla gazw szlachetnych). Wynika z obserwacji, e wiele pierwiastkw gwnych grup
ukadu okresowego ma skonno do przyjmowania konfiguracji elektronowej gazu
szlachetnego w zwizkach chemicznych, co powizane jest z ich waciwociami
chemicznymi. Teoria ta wyjania charakter elektrostatyczny wizania jonowego,
nie tumaczy jednak istoty kadego wizania atomowego. Przykadowo, nie tumaczy, dlaczego wizania kowalencyjne maj okrelone kierunki w przestrzeni. Niewtpliw jej zalet jest fakt, e na podstawie jednolitego kryterium (oktetu lub
dubletu) opisaa rne typy wiza i ich liczby w zwizkach chemicznych.
Podstawy nowoczesnej teorii wiza chemicznych tkwi w mechanice
kwantowej (falowej), dziedzinie wiedzy odznaczajcej si wysokim stopniem abstrakcji i zoonoci opisw matematycznych. Wnikliwe jej poznanie wymagaoby
osobnych studiw. Wnioski wynikajce z tej wiedzy s na og powszechnie zrozumiae. Pojcia majce korzenie w mechanice kwantowej stay si niezbdne
w chemii, z niektrych korzysta si ju na podstawowym poziomie nauczania tego
przedmiotu.
Kwantowymi teoriami wizania chemicznego, ktre wyjaniaj zarwno
charakter i energi wiza w czsteczce oraz geometri czsteczek, s teoria wi12
Hybrydyzacja
Hybrydyzacja orbitali jest procesem ich wymieszania i wyrwnania podczas tworzenia czsteczki, prowadzcym do wytworzenia nowych, jednakowych
13
Hybrydy sp
Wymieszanie orbitalu s z pojedynczym dostpnym orbitalem p doprowadza
do powstania dwch rwnocennych zhybrydyzowanych orbitali sp, ktre nosz
nazw hybryd sp. Oba orbitale sp s liniowe, zorientowane wzgldem siebie pod
ktem 180.
Czsteczki, w ktrych elektrony walencyjne atomu centralnego (tab. 1, beryl
i inne) s zaangaowane w wizania chemiczne i zawieraj hybrydy sp, maj budow liniow. Zgodnie z zasad maksymalnego, wzajemnego unikania si elektronw, wytworzone dwa wizania s maksymalnie oddalone od siebie i tworz kt
180. Taka liniowa budowa jest charakterystyczna dla czsteczek z atomem centralnym, nalecym do berylowcw, np. BeCl2, MgCl2, lub do pierwiastkw przejciowych, np. ZnCl2, HgCl2.
Zhybrydyzowane orbitale sp wyjaniaj waciwoci i struktur wizania potrjnego, najczciej spotykanego w zwizkach wgla. Wizanie to wystpuje midzy dwoma atomami wgla w alkinach, np. w czsteczce acetylenu. W atomie
wgla orbital 2s miesza si jedynie z pojedynczym orbitalem p, tworzc dwa rwnocenne zhybrydyzowane orbitale sp, a pozostae dwa orbitale p nie ulegaj hybrydyzacji.
Po zblieniu si do siebie dwch atomw wgla, posiadajcych zhybrydyzowane orbitale sp nastpuje liniowe nakadanie na siebie po jednym takim orbitalu od kadego atomu, prowadzce do wytworzenia silnego wizania, ktre nazwano wizaniem sigma (), typu sp-sp. Rwnoczenie, obecne w obu atomach orbitale py bocznie nakadaj si na siebie, tworzc wizanie nazwane wizaniem pi
(), typu py-py, podobnie jak to czyni orbitale pz obu atomw wgla, ktre tworz
wizanie , typu pz-pz. Dlatego utworzenie wizania potrjnego wgiel-wgiel jest
14
Hybrydy sp2
Wymieszanie orbitalu s z dwoma dostpnymi orbitalami p doprowadza do
powstania trzech rwnocennych zhybrydyzowanych orbitali sp2, ktre nosz nazw
hybryd sp2. Trzy orbitale sp2 le w paszczynie i zorientowane s wzgldem siebie pod ktem 120.
Czsteczki, w ktrych elektrony walencyjne atomu centralnego (tab. 1, bor i
inne) s zaangaowane w wizania chemiczne i zawieraj hybrydy sp2, s planarne
(paskie). Zgodnie z zasad maksymalnego, wzajemnego unikania si elektronw,
trzy wizania utworzone z hybryd sp2, np. w trifluorku boru (BF3), tworz pask,
trygonaln (trjktn) struktur o ktach midzy wizaniami 120. W czsteczce tej
kady atom fluoru wie si z orbitalem sp2 boru, jednak jeden orbital p boru pozostaje nie zapeniony.
Zhybrydyzowane orbitale sp2 wyjaniaj waciwoci i struktur wizania
podwjnego, czsto spotykanego w zwizkach wgla. Wizanie to wystpuje midzy dwoma atomami wgla w alkenach, np. w czsteczce etylenu. W atomie wgla
orbital 2s miesza si jedynie z dwoma orbitalami p, tworzc trzy rwnocenne hybrydy sp2 lece w paszczynie pod ktem 120 wzgldem siebie, a pozostay jeden orbital p, ktry nie uleg hybrydyzacji, jest prostopady do paszczyzny orbitalu
sp2.
Po zblieniu si do siebie dwch atomw wgla, posiadajcych zhybrydyzowane orbitale sp2, nastpuje liniowe nakadanie na siebie po jednym takim orbitalu od kadego atomu, prowadzce do wytworzenia wizania sigma (), typu sp2sp2. Rwnoczenie, obecne w obu atomach niezhybrydyzowane orbitale p bocznie
nakadaj si na siebie, tworzc wizanie typu p-p. Dlatego utworzenie wizania
podwjnego wgiel-wgiel jest efektem uwsplnienia czterech elektronw. Pozostae dwie hybrydy sp2 z kadego atomu wgla tworz cznie cztery wizania sigma z czterema atomami wodoru, doprowadzajc tym samym do wytworzenia czsteczki etylenu.
Dziki hybrydyzacji sp2 etylen jest czsteczk planarn i trygonaln, z ktami midzy wizaniami, wynoszcymi rednio 120. Dugo wizania midzy atomami wgla wynosi 1,33 , a jego moc 611 kJ/mol. Wizanie podwjne midzy
atomami wgla w etylenie jest dusze od wizania potrjnego w acetylenie.
15
Hybrydy sp3
Wymieszanie orbitalu s z trzema dostpnymi orbitalami p doprowadza do
powstania czterech zhybrydyzowanych orbitali sp3, ktre nosz nazw hybryd sp3.
Cztery rwnocenne orbitale sp3 s przestrzennie ukierunkowane ku naroom regularnego czworocianu (tetraedru) i s niesymetryczne w stosunku do jdra atomu.
Hybrydy sp3 s najczciej wystpujcymi orbitalami zhybrydyzowanymi
atomu wgla, ktre tworz pojedyncze wizania w alkanach, np. w metanie. Atom
wgla (tab. 1) ma cztery elektrony walencyjne, po jednym na dwch rodzajach
orbitali 2s i 2p, w wyniku hybrydyzacji tworzy cztery rwnocenne orbitale atomowe o geometrii tetraedrycznej. W wyniku naoenia si tych czterech orbitali sp3
z orbitalami 1s czterech atomw wodoru powstaje czsteczka metanu, w ktrej kt
tetraedryczny (kt midzy wizaniami) wynosi dokadnie 109,5.
Zhybrydyzowane orbitale sp3 wyjaniaj waciwoci i struktur wizania
pojedynczego midzy dwoma atomami wgla, np. w czsteczce etanu, jak rwnie
w wielu milionach innych zwizkw organicznych.
W etanie wystpuje jedno wizanie wgiel-wgiel. Po zblieniu si do siebie
dwch atomw wgla, ktre posiadaj zhybrydyzowane orbitale sp3, nastpuje
liniowe nakadanie na siebie po jednym takim orbitalu od kadego atomu, z wytworzeniem wizania , typu sp3-sp3. Wizanie C-C ma dugo 1,54 i moc
376 kJ/mol. Wszystkie kty midzy wizaniami w czsteczce etanu s bliskie wartoci kta tetraedrycznego 109,5.
Hybrydyzacja sp3 nie jest ograniczona do zwizkw wgla, moe dotyczy
innych atomw, np. atomu azotu w czsteczce amoniaku lub atomu tlenu w wodzie.
Atom azotu ma pi elektronw walencyjnych, w tym jedn woln par
elektronow (tab. 1), dla osignicia oktetu elektronowego tworzy trzy wizania
kowalencyjne. Atom azotu ulega hybrydyzacji z wytworzeniem czterech orbitali
sp3, wrd ktrych trzy zajte s pojedynczymi elektronami, a jeden przez woln
par elektronow. Liniowe naoenie trzech niezapenionych orbitali sp3 z orbitalami 1s trzech atomw wodoru doprowadza do wytworzenia czsteczki amoniaku.
W czsteczce amoniaku kty midzy wizaniami H-N-H wynosz 107,3, warto
ta jest bardzo bliska wartoci kta tetraedrycznego w metanie. Orbital z woln par
elektronow hybrydy sp3 atomu azotu w amoniaku zajmuje tyle samo przestrzeni,
ile wizanie N-H i peni istotn rol w determinowaniu wasnoci chemicznych
amoniaku.
Atom tlenu ma sze elektronw walencyjnych, w tym dwie wolne pary
elektronowe (tab. 1), dla osignicia oktetu elektronowego tworzy dwa wizania
kowalencyjne. Atom tlenu ulega hybrydyzacji z wytworzeniem czterech orbitali
sp3, wrd ktrych dwa zajte s pojedynczymi elektronami, a dwa przez wolne
pary elektronowe. Liniowe naoenie dwch niezapenionych orbitali sp3 z orbita16
Wizanie jonowe
Wizanie jonowe powstaje w wyniku przycigania elektrostatycznego odmiennych adunkw. Wystpuje midzy dwoma jonami i wynika z przycigania
elektrostatycznego ich przeciwnych adunkw. Na og obecne jest w solach nieorganicznych.
Typowe wizanie jonowe tworzy si midzy pierwiastkiem (metalem) silnie
elektrododatnim (nalecym do litowcw), ktry oddaje elektron, a pierwiastkiem
(niemetalem) silnie elektroujemnym (nalecym do fluorowcw), przyjmujcym
elektron.
Utworzona wica para elektronowa jest niemal cakowicie przesunita do
atomu bardziej elektroujemnego, dziki czemu atomy uczestniczce w tworzeniu
wizania jonowego osigaj konfiguracj oktetow.
Przykadowo, podczas tworzenia NaCl, atom sodu oddaje elektron, przechodzc w jon Na+, ktry osign konfiguracj neonu. Natomiast atom chloru przyjmuje elektron, przechodzc w jon Cl-, o konfiguracji argonu. Wytworzony NaCl
okrela si jako jonowe ciao stae, posiadajce wizanie jonowe.
Wizanie atomowe
Wizanie atomowe, czyli kowalencyjne (kowalentne), powstaje w wyniku
uwsplnienia (sparowania) dwch elektronw o spinie przeciwnym, po jednym od
kadego atomu.
Atomy nie rnice si elektroujemnoci lub rnice si minimalnie tworz wizanie atomowe, w ktrym wica para elektronw rozmieszczona jest
symetrycznie midzy dwoma jdrami atomowymi, zatem przycigana jest przez
oba jdra atomowe w jednakowym stopniu. Atomy uczestniczce w wizaniu osi17
jest niesymetryczny, co oznacza, e chmura elektronowa jest przesunita w kierunku bardziej elektroujemnego z atomw tworzcych wizanie. Wizania z niesymetrycznym rozdziaem elektronw nazywane s wizaniami atomowymi spolaryzowanymi. Waciwoci wynikajc z niesymetrycznego rozkadu elektronw
w czsteczce jest polarno.
Przyjto jako regu ogln, e wizaniami atomowymi spolaryzowanymi s
te, w ktrych rnica elektroujemnoci midzy atomami ma warto mniejsz ni
dwie jednostki. Przy czym, im bardziej zblione s elektroujemnoci atomw biorcych udzia w wizaniu, tym wikszy jest udzia wizania atomowego. Jeli rnica elektroujemnoci jest niewielka, tak jak np. midzy atomem wodoru i atomem
wgla (=0,4), to polarno wizania jest niska.
Wizania pomidzy atomami, ktrych elektroujemnoci rni si o wicej
ni 2 jednostki s w duym stopniu wizaniami jonowymi.
Wizania midzy atomami rnicymi si elektroujemnoci (<2), np.
midzy atomami wodoru i atomami pierwiastkw bardziej elektroujemnych, takich
jak azot, tlen, chlor s spolaryzowane tak, e elektrony wice s odsunite od
atomu wodoru i przesunite ku pierwiastkowi bardziej elektroujemnemu. Dziki
temu atom wodoru pozostaje z czstkowym adunkiem dodatnim, a atom bardziej elektroujemny z czstkowym adunkiem ujemnym.
Efekt indukcyjny oznacza przesunicie elektronw w wizaniu w odpowiedzi na elektroujemno ssiadujcych atomw. Zazwyczaj, metale indukcyjnie
dostarczaj elektronw, natomiast niemetale elektroujemne, np. tlen, chlor, indukcyjnie przycigaj elektrony.
Wizanie koordynacyjne
Wizanie kowalencyjne moe rwnie by utworzone przez wic par
elektronow pochodzc od jednego tylko atomu. Atom oddajcy par elektronow
do wsplnego posiadania nazywa si donorem, a atom drugi, ktry uzupenia sw
powok elektronow do konfiguracji najbliszego gazu szlachetnego nazywa si
akceptorem. Donor wskutek oddania swej wasnej pary elektronowej do wsplnego posiadania uzyskuje adunek dodatni, natomiast akceptor uzyskuje adunek
ujemny. Wizanie koordynacyjne nazywane rwnie wizaniem donorowo-akceptorowym, zaznacza si strzak zamiast kreski we wzorach strukturalnych.
Donorami elektronw podczas tworzenia wiza koordynacyjnych mog by
atomy lub jony bogate w elektrony walencyjne z przynajmniej jedn woln par
elektronow, np. N, O, S, Cl-. Akceptorami zazwyczaj s jony wodoru oraz atomy
majce luk oktetow, przykadowo atomy grupy 13 ukadu okresowego, z borem
na czele.
19
Wolna para elektronowa atomu azotu w czsteczce amoniaku tworzy z jonem wodorowym wizanie koordynacyjne, dziki czemu powstaje jon amoniowy.
W wytworzonym kationie amoniowym nastpuje cakowite wyrwnanie waciwoci, takich jak dugo, sia, polarno, kierunek w przestrzeni, wszystkich czterech
wiza N-H.
Wolne pary elektronowe atomu tlenu w czsteczkach wody s przyczyn
hydratacji, czyli uwodnienia jonw wodorowych w roztworach wodnych z wytworzeniem jonw hydroniowych.
Akceptorami, podobnymi do jonu wodorowego s wszystkie jony metali
przejciowych, ktre w roztworach wodnych przyczaj 4 lub 6 czsteczek wody,
ulegajc hydratacji.
Wizanie koordynacyjne jest typowym wizaniem dla zwizkw kompleksowych, w ktrych wizanie to powstaje midzy metalem a jonem ujemnym lub
koordynowan czsteczk.
Moment dipolowy
Moment dipolowy jest miar cakowitej polarnoci (biegunowoci) czsteczki, pojawia si, gdy rodki cikoci adunkw dodatnich i ujemnych nie pokrywaj si w czsteczce. Jednostk SI jest kulombometr (Cm), a jednostk pozasystemow jest debaj (D), 1D=3,33610-30 Cm.
Cakowita polarno czsteczki wynika z sumy polarnoci wszystkich wiza oraz rozmieszczenia wolnych par elektronowych w czsteczce. Jeli poszczeglne wizania s polarne to cae czsteczki czsto te s polarne, cho zdarzaj si
odstpstwa. Zwizki silnie polarne zwykle rozpuszczaj si w rozpuszczalnikach
polarnych, np. w wodzie, natomiast zwizki niepolarne nie s rozpuszczalne w wodzie.
Stosunkowo wysok warto momentu dipolowego maj czsteczki wody
i amoniaku, poniewa zarwno tlen, jak i azot s bardziej elektroujemne ni wodr.
Duy udzia w cakowitym momencie dipolowym tych czsteczek maj wolne pary
elektronowe (tlenu lub azotu), nie majce zneutralizowanego adunku ujemnego
przez adne przyczone atomy.
Zerow warto momentu dipolowego mog mie czsteczki zawierajce
wizania polarne, np. midzy atomem wgla i wodoru w metanie, etanie oraz innych, ze wzgldu na dokadne znoszenie si polarnoci poszczeglnych wiza,
wynikajce z symetrycznej budowy tych czsteczek. Podobnie w kwadrupolowej
czsteczce CO2 z wizaniami polarnymi, cakowity moment dipolowy czsteczki
jest rwny zeru na skutek pokrycia si rodkw cikoci adunku ujemnego i adunku dodatniego w czsteczce.
20
adunek formalny atomw wchodzcych w skad czsteczki okrela rnica midzy liczb elektronw na powoce walencyjnej danego atomu w czsteczce,
a liczb elektronw posiadanych przez ten sam atom w stanie pierwiastkowym.
Mona go okreli, korzystajc z nastpujcego wzoru:
adunek formalny = A B C
gdzie:
A liczba elektronw walencyjnych,
B poowa elektronw wicych,
C liczba elektronw niewicych.
O
_
O
..
_
O
..
+1
-1
.._
N
..
Struktura
_
C
Liczba
wiza
Wolne pary
elektronowe
adunek
formalny
+1
+1
..
N
Wizania wodorowe
Wizania wodorowe s sabymi oddziaywaniami (okoo 20 kJ/mol), czcymi czsteczki poprzez atom wodoru zwizany z atomem elektroujemnym (O, N,
F), ktry jest przycigany przez woln par elektronow innego elektroujemnego
(O, N, F) atomu. W takim mostkowym wizaniu wodorowym atom wodoru zawsze
jest otoczony dwiema parami elektronw. Asocjaty czsteczek wody i np. ciekego
amoniaku utrzymywane s rwnie dziki wizaniom wodorowym. Hydratacja
alkoholu wynika z tworzenia wiza wodorowych midzy atomem H wody i tlenem grupy OH alkoholu. Zwizki, ktre w stanie ciekym tworz wizania wodorowe maj wysokie temperatury topnienia i wrzenia. Przykadowo, alkohole
dziki wizaniom wodorowym maj wysze temperatury wrzenia od np. alkanw, chloroalkanw i innych. Rozpuszczalno wielu zwizkw organicznych
w wodzie wynika z tworzenia wiza wodorowych. Wizania wodorowe uczestnicz w utrzymywaniu struktury przestrzennej biaek i kwasw nukleinowych.
czsteczki cieczy i cia staych tworz faz skondensowan, lub e substancje, np.
chlorowce, skraplaj si i krzepn w okrelonych temperaturach. Wyrazem dziaania tych si jest rwnie due napicie powierzchniowe cieczy, np. wody.
Niepolarne wglowodory (alkany) w rozpuszczalnikach organicznych, np.
w benzynie, przycigaj si wzajemnie, przede wszystkim dziki siom dyspersyjnym, polegajcym na przyciganiu si falujcych (szybkozmiennych) dipoli. Szybkozmienne dipole s konsekwencj szybkich fluktuacji gstoci adunku ujemnego
na zewntrznej powoce elektronowej atomw, wynikajcych z ruchu elektronw
walencyjnych. Elektrony, pozostajce w nieustannym ruchu, w pewnych momentach mog by rozmieszczone nierwnomiernie, czsteczka na krtko zyskuje obszary dodatnie i obszary ujemne. Chwilowo spolaryzowana czsteczka wywouje
polaryzacj w ssiedniej czsteczce, dziki temu czsteczki sabo przycigaj si
wzajemnie.
Siy dyspersyjne s sabe i dziaaj jedynie na bardzo maych i optymalnych
odlegociach (sprawiajcych, e czsteczki prawie si stykaj), po przekroczeniu
optymalnej odlegoci dalsze zblienie atomw powoduje szybki wzrost si odpychajcych, ktre wynikaj z wzajemnego przenikania si zewntrznych powok
elektronowych oraz odpychania jder atomowych czsteczek.
Siy Van der Waalsa rosn w miar zwikszania si liczby elektronw
w czsteczce, a tym samym wraz ze wzrostem masy czsteczkowej. Czsteczki
zawierajce du liczb elektronw, tj. o duej masie czsteczkowej, przycigaj
si wzajemnie silnie i zwykle maj wysokie temperatury wrzenia.
Czsteczki zawierajce ma liczb elektronw, tj. o maej masie czsteczkowej, przycigaj si wzajemnie sabo i zwykle maj niskie temperatury wrzenia.
Siy przycigania Van der Waalsa s przezwyciane intensywnoci drga czsteczkowych w temperaturze wrzenia okrelonej substancji.
23
2.
WYRAANIE STE
Iwona ak
24
Stenie molowe
Stenie molowe (cm) wyraa liczb moli skadnika A w jednym litrze roztworu. Podstawow jednostk stenia roztworu jest mol/l, ktra okrela liczb
moli (nA) skadnika A zawart w objtoci (V) 1 litra, czyli 1 dm3 roztworu i w ten
sposb powinno by zawsze wyraane.
C m ( mol / l ) =
n A ( mol )
V( litr )
m A 1000
MA V
gdzie:
mA/MA
liczba moli substancji A w V ml roztworu,
mA/MAV lub CA/1000 liczba moli substancji A w 1 ml roztworu,
CAV/1000
liczba moli substancji A w V ml roztworu.
25
Stenie molalne
Molalno (CL) okrela liczb moli (nA) substancji A, przypadajc na jeden
kilogram rozpuszczalnika. Jednostk jest mol/kg. Stenie to nie zaley od temperatury.
CL =
nA
m rozp .
Uamek molowy
Uamek molowy okrela stosunek liczby moli (n) jednego skadnika, np. A
do sumy liczby moli wszystkich skadnikw, np. A i B obecnych w roztworze.
Jego jednostk jest mol/mol. Suma uamkw molowych wszystkich skadnikw
roztworu jest zawsze rwna jednoci.
xA =
nA
nA + nB + ..
xB =
nB
nA + nB + ..
xA + xB + . . = 1
Stenia procentowe
Stenia procentowe wyraane s w trojaki sposb: jako stenia masowo-masowe, masowo-objtociowe i objtociowo-objtociowe.
1. Stenie procentowe masowe (%; %m/m) dawniej procent wagowy
wyraa liczb czci masowych substancji rozpuszczonej (ms) w 100 tych samych
czciach masowych roztworu (mr). Istotn cech stenia procentowego masowego jest niezaleno od temperatury.
Cp =
ms
x 100%
mr
Stenie procentowe masowe wyraa liczb gramw substancji w 100 g roztworu. Przykadowo, 18% HCl oznacza, e w 100 g roztworu kwasu znajduje si
18 g HCl. Za stenie procentowe wagowe przyjmuje si wszystkie stenia, ktrych symbol % nie ma specjalnego oznaczenia.
2. Stenie procentowe objtociowe (% v/v) wyraa stosunek czci objtociowych substancji (Vs) do 100 tych samych czci objtociowych roztworu
(Vr).
Cp =
26
Vs
x 100%
Vr
Ten rodzaj stenia procentowego odnosi si do roztworw substancji ciekych. Przykadowo, 10% (v/v) wodny roztwr etanolu oznacza, e 10 ml czystego
etanolu rozcieczono wod do objtoci 100 ml.
3. Stenie procentowe masowo-objtociowe (% m/V; g/dl) wyraa liczb
czci masowych substancji rozpuszczonej w 100 czciach objtociowych roztworu. Przykadowo, 0,01% (m/V) roztwr CuSO4 oznacza, e w 100 ml roztworu
znajduje si 0,01 g CuSO4. Chocia masa i objto s wyraone w rnych jednostkach, dopuszcza si traktowanie % (m/V) jako specjaln form stenia masowego. Stenie masowe wyraa stosunek masy danego skadnika do objtoci roztworu zawierajcego t mas (mA/V). W przypadku rozcieczonych roztworw
wodnych mona przyj, e gsto (d) rwna si jednoci (d=1), wwczas
m/V=m/m. W innych rozpuszczalnikach zaleno ta nie wystpuje, wwczas zamiast zapisu np. roztwr 0,01% (m/V), naley podawa 0,1 mg/ml. Dla bardziej
rozcieczonych roztworw jednostk masy na jednostk objtoci, poza mg/ml,
jest g/ml, lub ng/l.
Jednostka mg% stosowana czsto w diagnostyce klinicznej nie jest zalecana, odpowiednikiem jest jednostka mg/dl, oznaczajca liczb miligramw substancji zawart w 100 ml roztworu.
Promile (o/oo; g/l) to stenie masowe, wyraajce liczb gramw substancji
rozpuszczonej w litrze roztworu.
27
Rozwizanie:
Masa czsteczkowa kwasu askorbinowego = 176, czyli 1mol = 176 g
1M
176 g
0,05M x
x = 8,8 g
1000 ml roztworu 8,8 g kwasu askorbinowego
250 ml roztworu x g kwasu askorbinowego
x=
250 ml 8,8 g
= 2,2 g
1000 ml
Odp. Naley zway 2,2 g kwasu askorbinowego, wsypa ilociowo do kolby miarowej na 250 ml, rozpuci w wodzie, po czym uzupeni wod do poziomu
kreski (250 ml).
PRZYKAD 2.
Oblicz stenie molowe roztworu, wiedzc e w 100 ml roztworu znajduje si 176
mg kwasu askorbinowego.
Rozwizanie:
176 mg kwasu askorbinowego = 0,176 g kwasu
Sposb 1:
1 mol/ l
1,76 g
28
Sposb 2:
100 ml roztworu = 0,1 l
176 g
1 mol kwasu askorbinowego
0,176 g
0,001 mola kwasu askorbinowego
Cm =
n 0,001mol
=
= 0,01mol / l
V
0,1l
PRZYKAD 3.
Ile milimoli kwasu askorbinowego znajduje si w 250 ml roztworu o steniu
0,05 mol/l.
Rozwizanie:
Stenie 0,05 mol/l oznacza 50 mmol w 1000 ml, czyli:
1000 ml 50 mmol
250 ml
x mmol
x=
250 ml 50 mmol
= 12,5 mmol
1000 ml
Odp. W 250 ml roztworu o steniu 0,05 mol/l znajduje si 12,5 mmol kwasu
askorbinowego.
PRZYKAD 4.
W ilu ml roztworu kwasu askorbinowego o steniu 0,05 mol/l znajduje si 200
moli kwasu.
Rozwizanie:
Stenie 0,05 mol/l = 50 mmol/1000 ml = 50 000 mol/1000 ml,
50 000 mol 1000 ml
200 mol
x
x=
PRZYKAD 5.
Jaka jest liczba moli kwasu askorbinowego w 60 ml roztworu o steniu 0,1 mol/l.
Rozwizanie:
Przeksztacajc wzr na stenie molowe, liczb moli (n) kwasu askorbinowego
mona obliczy:
n = Cm (mol/l) V(l) = 0,1 mol/l 0,06 l = 0,006 mol
Odp. W 60 ml roztworu o steniu 0,1 mol/l znajduje si 0,006 moli kwasu askorbinowego.
PRZYKAD 6.
Do 60 ml roztworu kwasu askorbinowego o steniu 0,1 mol/l dodano wody do
objtoci 100 ml, oblicz jakie jest stenie molowe otrzymanego roztworu.
Rozwizanie:
Obliczamy, ile moli substancji wprowadzono do roztworu. W 60 ml roztworu
o steniu 0,1 mol/l znajduje si 0,006 moli kwasu askorbinowego (co obliczono
w przykadzie 5).
C m (mol/l) =
n (mol)
V(l)
0,006 mol
= 0,06 mol / l
0,1 l
PRZYKAD 7.
Ile gramw CuSO45H2O potrzeba do sporzdzenia 300 g 0,8% roztworu siarczanu
miedzi.
Rozwizanie:
Masy czsteczkowe:
CuSO45H2O = 249,6; CuSO4 = 159,6
0,8% roztwr zawiera 0,8 g CuSO4,
30
czyli:
100 g roztworu 0,8 g CuSO4
300 g roztworu
x
159,6 g CuSO4
249,6 g CuSO45H2O
x g CuSO45H2O
2,4 g CuSO4
x=
x = 2,4 g CuSO4
249,6g 2,4 g
= 3,75g
159,6 g
Odp. Aby sporzdzi 300 g 0,8% roztworu CuSO4 potrzeba 3,75 g CuSO45H2O.
PRZYKAD 8.
Ile otrzyma si gramw roztworu 0,2% z 5 g czystej substancji.
Rozwizanie:
100 g roztworu
x g roztworu
0,2 g substancji
5 g substancji
x=
100 g 5g
= 2500 g
0,2 g
PRZYKAD 9.
Jakie jest stenie procentowe roztworu otrzymanego ze zmieszania 30 g sacharozy
z 570 g wody.
Rozwizanie:
Sposb 1:
30 g sacharozy
100 g roztworu
x g sacharozy
x=
100 g 30 g
= 5g
600 g
ms
x 100%
mr
Cp =
30 g
x100% = 5%
570 g + 30 g
PRZYKAD 10.
Jeli z 250 g wodnego roztworu 0,9% NaCl odparuje 100 g rozpuszczalnika, oblicz
jakie bdzie stenie procentowe roztworu.
Rozwizanie:
Masa rozpuszczonego NaCl w roztworze wynosi:
100 g roztworu
0,9 g NaCl
250 g roztworu
x g NaCl
x=
250 g 0,9 g
= 2,25g NaCl
100 g
x=
2,25 g NaCl
x g NaCl
100 g 2,25g
= 1,5g NaCl
150 g
32
C p 1000 d
M s 100%
C m M s 100%
1000 d
PRZYKAD 11.
Jakie jest stenie molowe 25% wodnego roztworu NaCl, ktrego gsto wynosi
d = 1,2 g/ml i masa molowa 58,45 g/mol.
Rozwizanie:
Sposb 1:
Sposb 2:
Z wartoci d=1,2g/ml wynika, e 1000 ml tego roztworu way 1200 g. Naley obliczy, ile gramw NaCl znajduje si w 1 litrze tego roztworu:
w 100 g roztworu
w 1200 g
25 g NaCl
x
x = 300 g NaCl
58,45 g
300 g
Skoro 5,13 mol NaCl jest w 1 litrze roztworu, to stenie wynosi 5,13 mol/l.
Odp. 25% roztwr NaCl ma stenie 5,13 mol/l.
PRZYKAD 12.
Jakie jest stenie procentowe (% m/m) stonego kwasu siarkowego o steniu
18,4 mol/l, ktrego gsto wynosi d = 1,84 g/ml i masa molowa 98 g/mol.
33
Rozwizanie:
C p(% m/ m) =
PRZYKAD 13.
Stony amoniak jest 30% (m/m). Jakie jest stenie molowe tego roztworu, jeli
jego gsto wynosi d = 0,89 g/ml, a masa molowa 17 g/mol.
Rozwizanie:
Cm =
PRZYKAD 14.
Ilu procentowy jest kwas solny o steniu 12,4 mol/l, gstoci d = 1,19 g/ml, ktrego masa molowa wynosi 36,45 g/mol.
Rozwizanie:
C p(% m/ m) =
PRZYKAD 15.
Jak mas molow w g/mol ma substancja wystpujca w wodnym roztworze 95%,
ktrego stenie molowe wynosi 16,5 mol/l i d = 0,8 g/ml.
34
Rozwizanie:
Przeksztacajc powyszy wzr, mona obliczy mas molow:
Ms =
C p 1000 ml d
C m 100%
Odp. Nieznana substancja, stanowica 95% w roztworze o steniu 16,5 mol/l, posiada mas molow 45 g/mol.
PRZYKAD 16.
Zawarto srebra w stopie wynosi 4 ppm. Ile miligramw srebra znajduje si
w 250 g stopu.
Rozwizanie:
w 1 000 000 mg stopu (czyli w 1 kg) s 4 mg srebra, to
w 0,25 kg stopu jest 1 mg srebra.
Odp. W 250 g stopu znajduje si 1 mg srebra.
PRZYKAD 17.
W 30 g stopu znajduj si 3 mg srebra. Jaka jest zawarto srebra w stopie wyraona w procentach i ppm.
Rozwizanie:
30 g 3 mg
100 g x
x = 10 mg tj. 0,01 g; tj. 0,01%
30 000 mg 3 mg
1 000 000 mg x
x = 100 mg; tj. 100 ppm
35
W wyniku mieszania ze sob roztworw tej samej substancji o rnych steniach otrzymuje si nowy roztwr tej substancji o steniu odmiennym od ste
wyjciowych. Stenie otrzymanego roztworu mona obliczy, znajc stenia
roztworw wyjciowych oraz wartoci jednostek objtociowych lub masowych,
w ktrych roztwory zmieszano.
Czsto miesza si ze sob roztwory wyjciowe w celu otrzymania roztworu
o danym steniu. W takiej sytuacji naley obliczy stosunek objtociowy lub
masowy, w ktrym naley zmiesza ze sob oba roztwory wyjciowe.
Wykonanie takich oblicze jest moliwe wwczas, gdy stenia mieszanych
ze sob roztworw s wyraone w tych samych jednostkach, natomiast jeli s
podane w rnych jednostkach, to naley stenia przeliczy na te same jednostki
przed przystpieniem do oblicze.
Podczas obliczania stenia otrzymanego roztworu (c) w wyniku zmieszania
dwch roztworw wyjciowych (c1, c2) mona korzysta z poniszych zalenoci:
V1c1 + V2c2 = (V1 + V2) c,
36
A(20j)
C(10j)
B(4j)
(A-C)10j = mB lub VB
Stosunek otrzymanych rnic (w naroach z prawej strony kwadratu) wskazuje, w jakim stosunku masowym lub objtociowym naley zmiesza roztwory
wyjciowe, np. 3 jednostki roztworu A z 5 jednostkami roztworu B.
37
3.
ROZTWORY WODNE
Iwona ak
Roztwr rzeczywisty to jednorodna mieszanina (homogeniczny, jednofazowy ukad) dwu lub wicej rodzajw czsteczek nie reagujcych chemicznie ze
sob, ktry nie ma okrelonego skadu. Skad roztworu moe zmienia si w szerokich granicach, stosownie do iloci rozpuszczonych zwizkw chemicznych.
Umownie przyjmuje si, e skadnik roztworu stanowicy wikszo jest nazywany rozpuszczalnikiem, natomiast substancja w nim rozpuszczona zwykle stanowi
mniejszo. Roztwory mog by cieke, gazowe lub stae. Przykadem roztworu
gazowego moe by powietrze, skadajce si z azotu, tlenu, dwutlenku wgla, pary wodnej i innych, natomiast przykadem roztworu staego s stopy, np. zota lub
miedzi.
Roztwory cieke s powszechne. W roztworach ciekych rozpuszczalnikiem
moe by substancja organiczna, np. benzyna, benzen, chloroform, tetrachlorek
wgla, eter, alkohol, w ktrych dobrze rozpuszczaj si podobne hydrofobowe
substancje organiczne, takie jak np.: tuszcze, gumy i inne.
Najpospolitszym rozpuszczalnikiem jest woda, dlatego roztwory wodne s
najbardziej rozpowszechnionymi roztworami ciekymi. Roztwory wodne stanowi
podstawowy skadnik materii ywej oraz rodowiska w ktrym istnieje ycie.
Przewaajc cz skorupy ziemskiej pokrywa roztwr wodny mrz i oceanw,
zawierajcy tysice skadnikw: jonw metali, niemetali, zoonych jonw nieorganicznych i rnorodnych zwizkw organicznych. W tym roztworze powstay
pierwsze organizmy ywe na Ziemi, tu yy i yj rnorodne organizmy, pobierajc potrzebne jony i czsteczki do ycia, wzrostu i rozmnaania. Organizmy, ktre
opuciy pierwotne rodowisko zabray ze sob roztwory wodne w swych pynach tkankowych i wewntrznaczyniowych.
Silnie dipolowy charakter czsteczek wody nadaje jej waciwoci bardzo
dobrego rozpuszczalnika, szczeglnie dla substancji chemicznie podobnych. Podczas rozpuszczania cia staych w wodzie dochodzi do rozerwania wiza midzy
czsteczkami lub jonami i rozsunicia ich od siebie kosztem energii hydratacji,
czyli uwodnienia czsteczek rozpuszczonej substancji przez czsteczki wody.
Roztwory charakteryzuj wasnoci koligatywne, czyli waciwoci zalene
tylko od liczby czsteczek, a niezalene od ich waciwoci fizycznych, mianowi38
40
RWNOWAGI W ROZTWORACH
Szwedzki chemik Svante Arrhenius w 1887 roku jako pierwszy wykaza, e
procesowi rozpuszczania wielu substancji towarzyszy dysocjacja, czyli rozpad
czsteczek na jony naadowane elektrycznie. Wystpienie procesu dysocjacji mona wykry na podstawie pomiarw przewodnictwa elektrycznego roztworw. Fakt
ten umoliwi sklasyfikowanie substancji w dwie grupy: 1) substancje, ktre tworz roztwory przewodzce prd, czyli tzw. elektrolity, 2) substancje tworzce roztwory zasadniczo nie przewodzce prdu, czyli tzw. nieelektrolity.
W roztworze nieelektrolitu nie zachodzi dysocjacja, czsteczki substancji
rozpuszczonej pozostaj niezmienione, s obojtne, nie maj adunku i dlatego
w roztworze nie stwierdza si przewodnictwa elektrycznego. Do nieelektrolitw
nale np: tlen czsteczkowy, azot czsteczkowy, tlenek wgla, glukoza, sacharoza
i inne.
Roztwory elektrolitw mona podzieli na elektrolity mocne i sabe. Mocne
to roztwory substancji praktycznie cakowicie zdysocjowanych, ktre wykazuj
wysokie przewodnictwo elektryczne niewiele zmieniajce si w miar rozcieczania roztworu. Nale do nich: mocne kwasy, mocne zasady oraz wikszo soli.
Elektrolity sabe to roztwory substancji w maym stopniu zdysocjowanych,
ktrych dysocjacja wzrasta w miar rozcieczania roztworu. Roztwory tych elektrolitw s sabymi przewodnikami elektrycznoci, lecz przewodnictwo ich znacznie wzrasta w miar rozcieczania roztworu. Zaliczamy do nich sabe kwasy, sabe
zasady i niektre sole.
W roztworze wodnym substancji ulegajcej dysocjacji (HX), ustala si rwnowaga midzy skadowymi jonami i rozpuszczon niezdysocjowan substancj.
Zapis rwnowagi reakcji odwracalnej:
HX H+ + Xdla ktrej jest speniony warunek rwnowagi:
H + X
HX
42
=K
Wielko K jest sta dysocjacji Kdys, co oznacza, e w okrelonej temperaturze w stanie rwnowagi stosunek ste jonw, powstaych w wyniku dysocjacji
elektrolitycznej, do stenia czsteczek niezdysocjowanych jest wielkoci sta.
Sta dysocjacji kwasu Kk, np. CH3COOH i sta dysocjacji zasady Kz, np. NH3,
przedstawiono poniej:
K CH3COOH
K NH3
[ NH 4 ][OH ]
=
[ NH 3 ]
Staa dysocjacji okrela moc elektrolitu. Warto Kdys wiksza lub rwna 10
oznacza, e odpowiadajcy jej elektrolit jest prawie w 100% zdysocjowany. Natomiast im mniejsza jest warto staej dysocjacji, tym sabszy jest elektrolit. Wielko staej dysocjacji jest niezalena od stenia roztworu, zmienia si natomiast
wraz z temperatur.
Ujemny logarytm ze staej dysocjacji to pK:
pK k = log K k
H + HA
H2A
lub
K k2 =
H + HA 2
HA
43
nia dysocjacji, wwczas cakowite stenie jonw [H+] jest sum ste jonw
wodorowych, powstaych w wyniku obu stopni dysocjacji.
Stopie dysocjacji elektrolitycznej jest to stosunek liczby czsteczek
zdysocjowanych do oglnej liczby wszystkich czsteczek elektrolitu wprowadzonych do roztworu. Wyraany jest uamkiem cakowitego stenia, np. = 0.2 lub
w procentach cakowitego stenia = 20%. Stopie dysocjacji wskazuje, jaka
cz czsteczek wprowadzonych do roztworu jest zdysocjowana na jony.
Stopie dysocjacji zaley od natury chemicznej substancji rozpuszczonej
i rozpuszczalnika, od stenia roztworu (wraz z rozcieczeniem wzrasta stopie
dysocjacji sabych elektrolitw, w bardzo rozcieczonych roztworach s one zdysocjowane prawie w 100%), od obecnoci innych elektrolitw (o wsplnym jonie)
i temperatury.
Mocny elektrolit jest zdysocjowany cakowicie ( = 1= 100%). W wyszych
steniach mocne elektrolity, cho teoretycznie dysocjuj cakowicie, zachowuj
si tak, jakby ich dysocjacja nie bya cakowita. To pozorne zmniejszenie stopnia
dysocjacji jest spowodowane wzajemnym wpywem jonw bdcych w roztworze,
ktry zmniejsza szybkoci poruszania si jonw. Wraz z rozcieczaniem wzrasta
szybko poruszania si jonw, tym samym wzrasta tzw. pozorny stopie dysocjacji oznaczony dowiadczalnie (rzeczywisty stopie dysocjacji mocnych elektrolitw zawsze rwny jest 1 i nie zaley od stenia roztworu).
Waciwoci roztworu zatem nie zale od rzeczywistych molowych ste
poszczeglnych jonw, lecz od ich ste aktywnych efektywnie przejawiajcych
si podczas pomiaru, ktre zale od stopnia ograniczenia ruchw jonw w danym
roztworze. To pozorne stenie aktywnych jonw jest aktywnoci jonu (a).
Zaleno midzy aktywnoci jonw (np. H+) a steniem wyraa wzr:
aH = fa [H+]
fa = aH/[H+];
gdy fa = 1 to [H+] = aH
gdzie:
fa wspczynnik aktywnoci jonw H+.
DYSOCJACJA WODY
Woda jest bardzo sabym elektrolitem, dysocjujcym na jony wg schematu:
(zapis jest uproszczony, nie uwzgldniajcy uwodnienia jonu wodorowego)
H2O H+ + OHW czystej wodzie, we wszystkich roztworach wodnych musi by speniony
nastpujcy warunek:
H + OH
H2O
= K = 1,8 10 16
gdzie:
[H+] = [OH-] w mol/l; [H2O] stenie wody, czyli liczba moli czsteczek niezdysocjowanych wody w 1 litrze.
K[H2O] = Kw = [H+][OH-]
Wskutek bardzo sabej dysocjacji wody mona przyj, e stenie niezdysocjowanych czsteczek wody jest rwne 1000 : 18 = 55,6 mol/l, std iloczyn ste jonw [H+][OH], zwany iloczynem jonowym wody, oznaczany symbolem Kw
wynosi:
Kw = [H+][OH] = 1,8 1016 55,56 = 1014 mol/l
Iloczyn jonowym wody zawsze ma warto 10-14 w temperaturze 25C,
a nieco wzrasta ze wzrostem temperatury.
Jeden litr czystej wody zawiera 107 mola jonw H+ (jonw H3O+) i 107 mola jonw OH. Tylko w czystej wodzie i w temperaturze 25oC stenia jonw wodorowych i wodorotlenowych s sobie rwne. W roztworach wodnych kwasw,
zasad i soli stenia obu jonw s rne, przy zachowanej staoci iloczynu jonowego wody:
[H+][OH] = 1014 mol/l = const.
Z rwnania tego wynika, e:
[H + ] =
10 14
[OH ]
[mol/l] oraz
[OH ] =
10 14
[H + ]
[mol/l]
45
pKw = 14;
pH = 14 + log [OH-]
Aparatami sucymi do pomiaru wartoci pH s pehametry. Ich skala zawiera wartoci pH od 0 do 14, obecnie z odczytem cyfrowym. W pehametrze do
pomiaru pH zestawiono ogniwo ze szklanej elektrody membranowej (czuej na
stenie jonw H+) oraz z elektrody odniesienia, ktre zanurza si w analizowanym
roztworze. Jako elektrody odniesienia najczciej uywa si elektrody chlorosrebrowej w tzw. elektrodzie kombinowanej, ktr stanowi jedna rurka zakoczona
bak szklan, zawierajca obie elektrody konieczne do pomiaru pH. Przed waciwym pomiarem wykonuje si tzw. nastawienie, zwane rwnie justowaniem
pehametru. W tym celu, po wypukaniu elektrody wod destylowan i osuszeniu,
elektrod kombinowan zanurza si w roztworze wzorcowym o znanym pH (warto pH roztworu wzorcowego powinna by bliska spodziewanej wartoci mierzonej) i po przygotowaniu przyrzdu do pomiaru doprowadza si do wywietlenia
waciwej wartoci pH. Po nastawieniu pehametru, elektrod kombinowan przemywa si wod destylowan, osusza i umieszcza w analizowanym roztworze, a nastpnie odczytuje warto pH.
REAKCJE ZOBOJTNIENIA
Wedug definicji Arrheniusa reakcja midzy kwasem i zasad nazywa si reakcj zobojtnienia. Terminu zobojtnianie nie mona przyjmowa dosownie,
46
poniewa roztwr obojtny powsta moe tylko w wyniku reakcji kwasu z zasad
o zblionej mocy, tak jak np. w reakcji 1 mola HCl z 1 molem NaOH.
W roztworach wodnych mog mie miejsce cztery moliwe przypadki, obejmujce reakcje midzy kwasem i zasad, ktre powszechnie nazywa si reakcjami
zobojtniania.
47
HYDROLIZA SOLI
Wszystkie sole (z wyjtkiem, np. niektrych soli rtci lub kadmu) po rozpuszczeniu w wodzie s cakowicie zdysocjowane, dlatego w roztworze obecne s
aniony i kationy.
Hydroliza to reakcja odwrotna do zobojtniania, polegajca na oddziaywaniu produktw dysocjacji soli z wod. Istot reakcji hydrolizy jest zachowanie
staej wartoci zarwno iloczynu jonowego wody, jak i staej dysocjacji sabego
kwasu lub sabej zasady. Hydrolizowa, czyli reagowa z wod mog te sole, ktre
zmusz czsteczki wody do dalszej dysocjacji, powodujc rwnoczenie zmian
odczynu roztworu. W zalenoci od rodzaju soli, ich roztwory wodne mog mie
odczyn kwany, zasadowy lub obojtny.
Rozpuszczajc sl, np. wglan sodu, siarczan sodu lub octan sodu, w wodzie
powstaje roztwr sabozasadowy. Zasadowy charakter powstaego roztworu jest
wynikiem poniszej reakcji:
CH3COO- + H2O CH3COOH + OHdla reakcji tej speniony jest warunek rwnowagi:
CH 3 COOH OH
CH 3 COO
= K hyd
48
REAKCJE UTLENIANIA-REDUKCJI
Reakcje utlenienia-redukcji definiowane s jako reakcje zwizane z przeniesieniem elektronu z jednego atomu na drugi.
49
ILOCZYN ROZPUSZCZALNOCI
Po rozpuszczeniu w wodzie substancji zbudowanej z jonw ustala si rwnowaga midzy jonami w nasyconym roztworze i sta substancj, ktra jest
w nadmiarze. Przykadowo, gdy nadmiar staego chlorku srebra jest w rwnowadze
z nasyconym roztworem chlorku srebra, to:
AgCl(s) Ag+ + Cl-
Ag + Cl
AgCl (s)
=K
Stenie chlorku srebra w fazie staej jest stae i nie moe si zmieni bez
wzgldu na ilo tej fazy staej, znajdujcej si w kontakcie z roztworem.
Dlatego mona zapisa:
[Ag+][Cl-] = K[AgCl(s)] = Ks
PRZYKADOWE OBLICZENIA
PRZYKAD 1.
Jakie jest stenie jonw wodorotlenowych w roztworze HCl o steniu 0,1 mol/l.
50
Rozwizanie:
Przyjmujc, ze stenie jonw wodorowych [H+] wynosi 0,1 mol/l
10 14 10 14
[OH ] =
= 1 = 10 13 mol / l
+
[H ] 10
PRZYKAD 2.
Stenie jonw wodorowych wynosi 104 mol/l. Jakie jest pH tego roztworu.
Rozwizanie:
pH = log (104) = ( 4) = 4
PRZYKAD 3.
Warto pH roztworu wynosi 9. Jakie jest stenie jonw wodorowych w roztworze.
Rozwizanie:
pH = 9 = -log [H+] = 9 to [H+] = 109
PRZYAD 4.
Jakie jest pH 0,01 M roztworu kwasu nadchlorowego.
Rozwizanie:
pH = - log CH = - log 110-2 = 2,0
51
PRZYKAD 5.
Obliczy stenie jonw H+ oraz pH roztworu kwasu siarkowego o steniu rwnym 0,005 mol/l, zakadajc cakowit dysocjacj kwasu.
Rozwizanie:
H2SO4 2H+ + SO42Maksymalne moliwe stenie jonw [H+] wyniesie:
0,005 mol/l 2 = 0,01 mol/l
pH = -log [H+] = -log 10-2 = 2
PRZYKAD 6.
Jakie jest pH 0,01 M roztworu NaOH.
Rozwizanie:
pH = 14 pOH = 14 (- log 102) = 14 ( +2) = 12
PRZYKAD 7.
Oblicz [H+] i pH roztworu 0,2 M CH3COOH. Kk = 1,86 10-5
Rozwizanie:
H + = Kk Ck
1
pK k log C k
2
pH = 2,715
Odp. W 0,2 M roztworze kwasu octowego [H+] wynosi 1,93 103 i roztwr ma
warto pH rzdu 2,715.
52
PRZYKAD 8.
Jakie s wartoci Kz i pH roztworu 0,01 M zasady jednowodorotlenowej, zdysocjowanej w 1%.
Rozwizanie:
= 0,01 = 10-2
OH = K z c z = 10 6 10 2 = 10 8 = 10 4
pOH = 4
pH = 14 pOH = 14 4 = 10
PRZYKAD 9.
Jakie s wartoci Kk i pH, 0,1 M roztworu kwasu jednoprotonowego, zdysocjowanego w 10%.
Rozwizanie:
= 0,1 = 10-1
H + = 10 3 10 1 = 10 4 = 10 2
pH = 2
53
4.
REAKCJE W ROZTWORACH
Iwona ak
RWNOWAGA REAKCJI
Wikszo reakcji chemicznych zachodzi w roztworach wodnych. Reakcja
chemiczna przebiega w dwch kierunkach. Z czsteczek substratw tworz si
produkty, a czsteczki produktw mog ze sob reagowa, odtwarzajc czsteczki
substratu. Czasami uywa si okrelenia, e reakcja jest nieodwracalna, majc na
uwadze jej przebieg, a do wyczerpania substratw. Po zakoczeniu takiej reakcji
trudno jest wykry wymierzalne iloci substratu. W rzeczywistoci i ta reakcja
biegnie tylko do osignicia rwnowagi, w ktrej obok produktw istniej jeszcze
czsteczki substratw. Stan rwnowagi chemicznej dla reakcji odwracalnej, np:
aA + bB cC + dD
gdzie:
a; b; c; d oznaczaj liczby czsteczek substratw (A, B) i produktw (C, D) uczestniczcych w reakcji,
C
A
c
a
D
B
d
b
Staa rwnowagi rwna si iloczynowi ste (mol/l) produktw podzielonemu przez iloczyn ste (mol/l) substratw i informuje o uprzywilejowanym
kierunku reakcji.
Reakcja w prawo bdzie uprzywilejowana wwczas, gdy warto Keq bdzie
wiksza od jednoci, natomiast, gdy uprzywilejowan jest reakcja w lewo, warto
Keq jest mniejsza od jednoci.
Dla staych rwnowagi wikszych od K=103, stenia substratw w stanie
rwnowagi stanowi mniej ni 1% ste pocztkowych, reakcje takie mona ju
zaliczy do nieodwracalnych, w sensie potocznym. Praktycznie nieodwracaln jest
54
reakcja, ktrej staa rwnowagi jest rzdu 1018, nie jest moliwe eksperymentalne
wykrycie substratw w stanie rwnowagi, jednak o ich istnieniu wiadcz rne
obserwacje porednie.
Reakcja przebiega w prawo, gdy produkty s bardziej stabilne, zatem zawieraj mniej energii ni substraty. Jeli produkty maj mniejsz zawarto energii ni
substraty, to w wyniku reakcji wydziela si ciepo i nazywa si reakcj egzotermiczn. Reakcja, w ktrej energia cieplna jest pobierana z otoczenia nazywa si
reakcj endotermiczn. Reakcja, ktrej produkty zawieraj wicej energii ni
substraty przebiega w lewo, w kierunku tworzenia substratw.
Chemicznym odpowiednikiem wydzielanej lub pochanianej energii cieplnej
podczas reakcji chemicznej jest entalpia (H). Zmiany entalpii (H) maj wpyw na
pooenie rwnowagi, ale jej znajomo nie jest wystarczajca do dokadnego
przewidzenia pooenia rwnowagi, poniewa potrzebna jest rwnie znajomo
zmian entropii. Entropia (S) jest funkcj termodynamiczn, opisujc zmiany
uporzdkowania czsteczek nastpujce podczas reakcji.
Entalpi swobodn (G) definiuje rwnanie:
G = H - TS
poniewa nie znamy bezwzgldnych wartoci funkcji termodynamicznych, posugujemy si ich zmianami () w czasie badanych procesw:
G = H - T
S
Staa rwnowagi chemicznej jest wyznaczona przez warto G, czyli
zmiany entalpii swobodnej, na podstawie zalenoci:
G = - RTlnK
gdzie:
R staa gazowa, T temperatura.
55
Przy maych zmianach (S) wielko staej rwnowagi mona okreli na podstawie zmian ciepa reakcji (H), ktr mona mierzy bezporednio jako ciepo wydzielajce si podczas reakcji lub oszacowa w przyblieniu na podstawie entalpii dysocjacji wiza.
Szybko ustalania si rwnowagi midzy steniem produktw i substratw
zmienia si w szerokich granicach i odzwierciedla szybko reakcji chemicznej.
Szybko reakcji chemicznej mona mierzy tempem zaniku substratu w czasie,
bd tempem przyrostu produktu. Oglnie jest zdefiniowana jako zmiana ste
substratw w czasie:
v=
c
t
gdzie:
v szybko reakcji; c stenie; t czas.
Reakcje, ktrych szybko stosuje si do powyszego rwnania kinetycznego, nazywaj si reakcjami pierwszego rzdu. Po scakowaniu rwnania i zmianie na logarytmy dziesitne powstaje zaleno:
log
A0
kt
=
A 2, 303
k=
A
2, 303
log 0
t
A
gdzie:
A0 pocztkowe stenie substratu; A stenie substratu po czasie t, czyli pomniejszone
o stenie substratu x, ktre przereagowao w czasie t reakcji.
56
KWASOWO I ZASADOWO
Wiele reakcji chemicznych wynika z wasnoci kwasowo-zasadowych substancji reagujcych oraz rozpuszczalnika (wody). Obecnie stosowane s dwie definicje kwasw i zasad, definicja Brnsteda-Lowry'ego i definicja Lewisa.
Wedug definicji Brnsteda-Lowry'ego kwasem jest substancja, dostarczajca kationu wodorowego (protonu), a zasad jest substancja, przyjmujca go. W
roztworze dochodzi do reakcji kwas-zasada:
H
A
kwas
B
A+
zasada
sprzona
zasada
H
B
sprzony
kwas
Produkt powstay z kwasu, ktry traci proton nosi nazw zasady sprzonej
z kwasem, natomiast produkt, powstajcy z zasady zyskujcej proton nosi nazw
kwasu sprzonego z zasad.
Przykadowo:
HCl
+ H2O Cl+ H3O+
CH3COOH + H2O CH3COO + H3O+
kwas
zasada
sprzona
sprzony
zasada
kwas
H2O
+ H2O -OH
+ H3O+
H2O
H2O
kwas
+ -NH2 -OH
+ NH3
+ NH3 -OH
+ +NH4
zasada
sprzona
sprzony
zasada
kwas
57
Czsteczka wody moe zachowywa si jak zasada albo jak kwas. W reakcji z kwasami woda jest zasad, ktra przyjmuje proton, przechodzc w jon hydroniowy, H3O+. W reakcji z jonem amidkowym -NH2 lub amoniakiem woda jest
kwasem, ktry dostarcza proton przechodzc w jon hydroksylowy (HO-) oraz powstaje amoniak lub jon amoniowy.
Substancje, mogce reagowa jak kwasy lub zasady nazywa si substancjami amfoterycznymi. Kwasy rni si midzy sob swoimi zdolnociami protonodonorowymi.
Mocne kwasy, np. HCl, HNO3, prawie cakowicie reaguj z wod, stany
rwnowagi tych reakcji s przesunite w prawo, czyli na korzy produktw.
Mocny kwas atwo traci swj proton i jego sprzona zasada ma mae powinowactwo do protonu, dlatego jest sab zasad.
Sabe kwasy, np. kwas octowy, reaguj z wod tylko w nieznacznym
stopniu, stany rwnowagi tych reakcji s przesunite w lewo. Saby kwas z trudnoci traci swj proton i jego sprzona zasada ma due powinowactwo do protonu, dlatego jest mocn zasad.
Jak wiadomo, moc dowolnego kwasu rozpuszczonego w wodzie jest
okrelana poprzez sta kwasowoci lub jonizacji Kk, ktra jest sta rwnowagi
pomnoon przez stenie molowe czystej wody (55,6 mol/l), zwykle wyraa si
za pomoc pK, jako ujemny logarytm Kk. Na podstawie wartoci pK mona
przewidywa, czy dana reakcja kwas-zasada zajdzie.
Okrelony kwas bdzie dostarcza proton chtnie sprzonej zasadzie jakiego sabszego kwasu, czyli o wikszej wartoci pK. Natomiast sprzona zasada
kwasu bdzie odbieraa proton od jakiego mocniejszego kwasu, czyli o mniejszej
wartoci pK. Przykadowo, jon hydroksylowy, bdcy sprzon zasad kwasu
[H2O], bdzie reagowa z kwasem octowym, odbierajc mu proton, poniewa kwas
octowy jest mocniejszym kwasem (pK= 4,7) ni woda (pK=14), a jon hydroksylowy jest mocniejsz sprzon zasad ni jon octanowy:
CH3COOH
mocniejszy
kwas
O H
mocniejsza
zasada
-
CH3COOsabsza
zasada
H2O
sabszy
kwas
ktra jest donorem pary elektronowej. Zgodnie z t definicj kwas musi mie
nieobsadzony, niskoenergetyczny orbital, bd silnie spolaryzowane wizanie
chemiczne z wodorem, ktre umoliwia uwolnienie protonu, dziki czemu kwas
zdolny jest do przyjcia pary elektronowej.
Kwasy Lewisa, poniewa przyjmuj par elektronow od zasady Lewisa
(nukleofila) w polarnej reakcji tworzenia wizania, okrelane s jako elektrofile
(lubice elektrony).
Kwasami Lewisa s kationy rnych metali, np. Mg2+, liczne zwizki metali
przejciowych, np. FeCl3, ZnCl2 i inne oraz zwizki pierwiastkw grupy 13, np.
BF3, AlCl3, ktre maj nie zapenione orbitale walencyjne i mog przyj par
elektronw z zasad Lewisa oraz Cl+, Br+, J+.
Cl
Cl
Al
Cl
trichlorek glinu
kwas Lewisa
CH3
+
CH3
Cl
CH3
Cl
CH3
Al
N+
Cl
CH3
CH3
trimetyloamina
zasada Lewisa
Cl
H + OH2 H3O+ + Cl zasada
Wikszo zwizkw organicznych, ktre zawieraj atom tlenu i azotu s
zasadami Lewisa. Przykadowo, alkohole i kwasy karboksylowe, gdy dostarczaj
proton, dziaaj jak kwasy, natomiast, gdy ich atom tlenu lub azotu przycza proton, dziaaj jak zasady Lewisa.
Kwasy i zasady Lewisa s uyteczne przy rozwaaniu reakcji tworzenia
zwizkw kompleksowych, takich jak w nastpujcym przykadzie:
Cr3+ + 6F- CrF63Nukleofile i elektrofile uczestnicz w podstawowych reakcjach zwizkw
organicznych, tj. w reakcjach podstawienia i przyczenia, czyli addycji. Reakcje te
59
dzieli si na nukleofilowe i elektrofilowe, zalenie od rodzaju odczynnika atakujcego atom wgla. Powszechne odczynniki nukleofilowe zestawiono poniej wedug malejcej nukleofilowoci. Naley pamita, e zdolno do tworzenia wiza
z atomami wgla zaley od wielu czynnikw i nie ma uniwersalnej mocy nukleofilnoci, dlatego uszeregowanie to jest przyblione.
Powszechne nukleofile
silne
-
sabe
rednie
-
J , SH , OH ,
CN-, Br-, N3-
NH3, Cl , F
H2O, ROH,
RCO2H
Podstawienie nukleofilowe
Nukleofilowa wymiana fluorowca na inne grupy funkcyjne jest uniwersaln
reakcj stosowan w syntezach alkoholi, eterw, amin (pierwszorzdowych, drugorzdowych, trzeciorzdowych) i innych zwizkw. Reakcje te s odwracalne, dlatego aby wymusi przebieg reakcji bardziej w jednym kierunku, naley stworzy
waciwe warunki reakcji. Mona to osign, wybierajc silniejszy nukleofil od
grupy odchodzcej, stosujc znaczny nadmiar jednego z substratw lub usuwajc
jeden z produktw.
60
Podstawienie elektrofilowe
Reakcje podstawienia elektrofilowego nale do najczstszych reakcji
zwizkw organicznych i atwo mona je wykona. Poniej przedstawiono przykadowe reakcje podstawienia benzenu.
Chlorowcowanie (halogenowanie)
C6H5H + X2
FeX3
C6H5X
HX
X= Cl, Br
Nitrowanie
C6H5H + HONO2
H2SO4
C6H5NO2
H2O
HONO2 = HNO3
61
Sulfonowanie
C6H5H + HOSO3H
SO3
C6H5SO3H
H2O
HOSO3H = H2SO4
Alkilowanie
C6H5H + RCl
AlCl3
C6H5R
HCl
Acylowanie
O
C6H5H + RCCl
O
AlCl3
C6H5CR
HCl
AB
H2CCH2
A B
W reakcji przyczenia grupa A substratu zostaje przyczona do jednego
atomu wgla podwjnego wizania, a grupa B do drugiego i w produkcie midzy
dwoma atomami pozostaje tylko wizanie pojedyncze. W wyniku reakcji addycji
rozerwaniu ulegaj: wizanie alkenu i wizanie sigma drugiego substratu, a tworzone s dwa wizania sigma.
Reakcje addycji s bardzo powszechne, nie jest moliwe przedstawienie ich
za pomoc jednego oglnego schematu, jednak porwnanie budowy substratu
i produktu umoliwia atwe rozpoznanie tej reakcji.
62
Addycja elektrofilowa
Reakcja addycji elektrofilowej polega na przyczeniu elektrofila do alkenu
z wytworzeniem reaktywnego karbokationu, ktry moe gwatownie reagowa
z neutrofilem przekazujcym mu dwa elektrony, w wyniku czego tworzy si produkt nasycony. Karbokation to dodatnio naadowany atom wgla (ma sze zamiast omiu elektronw), zwizany z trzema innymi atomami.
H
H+
C=C
C+C
karbokation
Addycja nukleofilowa
Reakcja addycji nukleofilowej polega na przyczeniu neutrofila do grupy
elektrofilowej. Przykadami addycji nukleofilowej mog by reakcje przyczenia
nukleofila do grupy karbonylowej aldehydw lub ketonw, prowadzce do powstania alkoholu.
W grupie karbonylowej tlen jest zdecydowanie bardziej elektroujemny ni
wgiel, w zwizku z tym elektrony wizania podwjnego s silnie przesunite
w stron atomu tlenu, powodujc siln polaryzacj wizania, ktra sprawia, e tlen
atwiej przyjmuje adunek ujemny. Wanie dziki tej polaryzacji wikszo reakcji
karbonylowych to reakcje nukleofilowego ataku na karbonylowy atom wgla, ktremu czsto towarzyszy addycja protonu do tlenu.
Nu
Nu
H2O
Nu
+
C=O
CO
C OH
lub ROH
nukleofil
zw. poredni
produkt
Jak wynika z przedstawionej wyej addycji nukleofilowej do grupy karbonylowej, reakcja polega na przyczeniu nukleofila i protonu. Trygonalny atom wgla
grupy karbonylowej o hybrydyzacji sp2 w wyjciowym aldehydzie lub ketonie
przechodzi w tetraedryczny sp3 zhybrydyzowany wgiel w zwizku porednim i w
63
REAKCJE RODNIKOWE
Reakcja rodnikowa to proces, w ktrym nastpuje symetryczne tworzenie
wizania chemicznego w wyniku dostarczenia przez reagujce czsteczki po jednym elektronie. Reakcj rodnikow jest te proces w ktrym nastpuje symetryczne zrywanie wizania chemicznego w taki sposb, e kady fragment odchodzi
z jednym elektronem.
Rodnik, zwany rwnie wolnym rodnikiem, jest to indywiduum molekularne, zawierajce nieparzyst liczb elektronw walencyjnych, dlatego posiada
pojedynczy, niesparowany elektron na jednym ze swych orbitali, tak jak np. Cl-,
ktry powsta w homolitycznej reakcji rozpadu Cl2.
R:A
produkt
substytucji
B
produkt
rodnikowy
64
H:CH3
H:Cl
CH3
CH3
Cl:Cl
Cl:CH3
+ Cl
Naprzemienna kontynuacja tych dwch reakcji jest odpowiedzialna za acuchowy charakter etapu propagacji. Bdzie on trwa dopty, dopki wolne rodniki
bd w rodowisku.
Terminacja, czyli zakoczenie reakcji nastpi wwczas, gdy wolne rodniki
pocz si razem z utworzeniem trwaego produktu, np.:
Cl +
Cl +
H3C
Cl
ClCl
CH3
ClCH3
CH3
H3CCH3
Reakcje rodnikowe opieraj si na tych samych podstawach, (przedstawionych na powyszych przykadach), ktre sprowadzaj si do tego, e wizania
ulegaj rozerwaniu lub tworz si przy udziale rodnikw.
65
R
+
C =C
CC
substrat
rodnikowy
alken
produkt addycji
rodnikowej
Rodnikowy produkt addycji moe przyczy si do drugiej czsteczki alkenu, wytwarzajc wyduony produkt rodnikowy addycji, nastpnie przycza si do
trzeciej, czwartej itd., ostatecznie przeksztacajc wyjciowy monomer (alken)
w polimer. Proces tworzenia polimeru nazywa si polimeryzacj. Przykadem
wolnorodnikowej polimeryzacji moe by synteza polietylenu z etylenu. Katalizatorami polimeryzacji etylenu s nadtlenki organiczne, dostarczajce w wysokiej
temperaturze rodnikw katalitycznych:
ROOR
nadtlenek organiczny
temperatura
2 RO
rodniki katalityczne
CH2=CH2
etylen
ROCH2CH2
wolny rodnik wglowy
Powstajcy w reakcji addycji wolny rodnik wglowy przycza si do kolejnej czsteczki etylenu, potem do nastpnej, itd., wyduajc acuch wglowy.
Etap propagacji trwa, a do momentu, gdy nastpi terminacja, wynikajca z poczenia si dwch rodnikw.
66
5.
ANALIZA MIARECZKOWA
Iwona ak, Anna Balcerzyk
TA =
mA
( g / ml )
V
ne). Wanymi zaletami metod miareczkowych s: dua szybko oznacze i moliwo zastosowania wielu typw reakcji.
Reakcja wykorzystywana w analizie miareczkowej powinna spenia nastpujce warunki:
przebiega bardzo szybko,
przebiega stechiometrycznie, zgodnie z rwnaniem,
powinna istnie moliwo dokadnego ustalenia punktu rwnowanikowego,
zwizki chemiczne, biorce udzia w reakcji powinny by dostatecznie trwae
w roztworze i nie powinny wchodzi w reakcje z innymi skadnikami roztworu.
Metody
odwrotne
68
Acydymetria
(titrantem jest kwas)
Kompleksometria
(oparta na reakcjach tworzenia trwaych,
atwo rozpuszczalnych zwizkw kompleksowych)
Metody
miareczkowe
Redoksymetria
(oparta na reakcjach
Reduktometria
(titrantem jest
reduktor)
utleniania-redukcji)
Oksydymetria
(titrantem jest
Precypitometria
utleniacz)
Alkacymetria
Alkacymetria obejmuje metody oznaczania ste kwasw, zasad, a take
soli mocnych kwasw i sabych zasad oraz soli mocnych zasad i sabych kwasw.
Detekcja punktu kocowego odbywa si metodami instrumentalnymi (np. potencjometrycznie) lub wizualnymi. Wskanikami w alkacymetrii s sabe kwasy lub
zasady organiczne, ktrych formy zdysocjowane i niezdysocjowane rni si zabarwieniem.
69
Zakres pH
Zabarwienie w roztworze
kwanym
zasadowym
Oran metylowy
3,14,4
czerwone
topomaracz.
Fenoloftaleina
8,010,0
bezbarwne
czerwonofiolet.
Czerwie metylowa
4,26,2
czerwone
te
Bkit bromotymolowy
6,77,6
te
niebieskie
pH
14
12
10
fenoloftaleina
8
PR
6
4
oran metylowy
2
0
0
10
15
titrant (ml)
20
25
titrant (ml)
Warto pH 0,1 molowego roztworu HCl wynosi 1. Podczas miareczkowania mocn zasad pocztkowo pH roztworu zmienia si w nieznacznym stopniu. Po
dodaniu 5 ml roztworu NaOH warto pH wzrasta tylko o niespena 0,5 jednostki.
Zmiareczkowanie kwasu w okoo 90% (co ma miejsce po dodaniu niespena 9 ml
titranta) powoduje wzrost wartoci pH roztworu do 2. Wiadomo, e wzrost warto70
Kompleksometria
Kompleksometria obejmuje metody oparte na reakcjach tworzenia trwaych,
rozpuszczalnych zwizkw kompleksowych. Najszerzej rozwinitym dziaem
kompleksometrii jest kompleksonometria. Nazwa ta pochodzi od sowa komplekson, ktrym okrela si kwasy aminopolikarbonowe. Kompleksony charakteryzuj
si wybitnymi zdolnociami tworzenia zwizkw kompleksowych, tzw. chelatw
z kationami metali wielowartociowych. Spord kompleksonw najbardziej znanym jest wersenian disodowy, okrelany skrtem EDTA, od nazwy etylenodiaminotetraoctan.
Wskanikami w kompleksonometrii s najczciej tzw. metalowskaniki, jak
np. czer eriochromowa T. S to zwizki organiczne, ktre w okrelonych warunkach miareczkowania tworz z jonami metali barwne kompleksy. W miar przebiegu reakcji zmniejsza si w roztworze liczba kompleksw metal-wskanik,
a zwiksza liczba bardziej trwaych kompleksw metal-komplekson.
Uwolniony wskanik ma inn barw ni w kompleksie z metalem, a poniewa w pobliu PR nastpuje gwatowny spadek stenia jonw metalu, moliwa
jest wizualna detekcja tego punktu.
71
Redoksometria
Redoksometria obejmuje metody oparte na reakcjach utleniania i redukcji.
Reakcje te moliwe s wtedy, gdy midzy reagujcymi substancjami istnieje rnica potencjau utleniajcego. W miar przebiegu reakcji reduktor ulega utlenieniu
(oddaje elektrony), natomiast utleniacz ulega redukcji (przyjmuje elektrony).
W pewnym momencie nastpuje zrwnanie potencjaw i ustalenie stanu rwnowagi.
Punkt rwnowanikowy (PR) wyznaczany jest potencjometrycznie lub za
pomoc wskanikw. Wskaniki te s ukadami redoks, ktrych forma utleniona
posiada odmienne zabarwienie ni forma zredukowana. Wskanikiem moe by
rwnie sam roztwr mianowany, tak jak ma to miejsce w przypadku miareczkowania roztworem nadmanganianu potasu.
Przykadem analizy manganometrycznej moe by oznaczanie jonw elaza.
Roztwr z jonami elazawymi po zakwaszeniu kwasem siarkowym miareczkuje
si mianowanym roztworem nadmanganianu. Reakcja przebiega zgodnie z rwnaniem:
MnO4- + 5Fe2+ + 8H+ Mn2+ + 5Fe3+ + 4H2O
W miar przebiegu reakcji zanika barwa ta, pochodzca od jonw Fe2+,
natomiast w punkcie kocowym miareczkowania pojawia si zabarwienie rowe,
ktre daj jony Mn2+.
Precypitometria
Podstaw precypitometrii, czyli metod strceniowych s reakcje prowadzce
do powstania zwizkw trudno rozpuszczalnych. Najwaniejsze praktyczne zastosowanie ma argentometria, opierajca si na reakcji oznaczanego zwizku z titrantem, ktrym jest roztwr AgNO3. W wyniku tej reakcji powstaj trudno rozpuszczalne sole srebra. Metod t oznacza si najczciej chlorki, jodki oraz bromki.
72
Wskanikami w metodach strceniowych s zwizki, ktre reagujc z nadmiarem titrantu daj substancje barwne.
Przykadem specyficznego miareczkowania strceniowego moe by metoda
Mohra oznaczania chlorkw. Wskanikiem w tej reakcji jest chromian potasowy.
Roztwr zawierajcy chlorki miareczkuje si mianowanym roztworem azotanu
srebra. Gdy caa ilo chlorkw zostanie wytrcona w postaci soli chlorku srebra,
nadmiar titranta zaczyna strca osad chromianu srebrowego o czerwonobrunatnym zabarwieniu. Zachodzce reakcje przebiegaj nastpujco:
Ag+ +
Cl - AgCl biay
73
0.03x100
= 0 .2 %
15
podczas gdy dla 40 ml bd wynosi ju tylko:
0.03x100
= 0.075%
40
Naley pamita, e pojemno naczy miarowych zmienia si nieco wraz ze
zmian temperatury. Poniewa naczynia s kalibrowane w temp. 200C, dobrze
jest przeprowadza miareczkowanie w zblionej temperaturze. Staa temperatura jest rwnie zalecana ze wzgldu na rozszerzalno ciepln wody, ktra
sprawia, e objtoci roztworw mierzone w rnej temperaturze mog by
odmienne.
f (H X A ) =
74
1
X
f [B(OH )Y ] =
1
Y
Vy C y
mx
=
Mx fx
fy
po przeksztaceniu:
mx =
Vy C y M x f x
Cy =
fy
oraz
V1C 1 V2 C 2
=
f1
f2
mx fy
M x f x Vy
Vy =
mx f y
M x fxCy
po przeksztaceniu: C1 =
V2C 2 f1
V1 f 2
gdzie:
mx masa substancji x; C1 stenie molowe substancji x; Mx masa molowa substancji
x; Cy, C2 stenie molowe titrantu; Vy,2 objto dodawanego odczynnika (titrantu); x,
y, 1, 2 wspczynniki rwnowanoci
PRZYKAD 1.
Na zmiareczkowanie 25 ml roztworu H2SO4 zuyto 35 ml mianowanego 0.1 molowego roztworu NaOH. Oblicz stenie molowe miareczkowanego roztworu kwasu siarkowego.
Rozwizanie:
Reakcja przebiega nastpujco:
2 NaOH + H2SO4 Na2SO4 + 2H2O
Wspczynniki rwnowanoci s nastpujce:
zasady = 1;
kwasu = 0,5
Korzystajc ze wzoru:
V1C1 V2 C 2
=
1
2
75
C1 =
V2C 2 f1
V1 f 2
C1 =
PRZYKAD 2.
Na zmiareczkowanie odwaki NaOH zuyto 35 ml roztworu HCl o steniu molowym 0,1 mol/l. Ile gramw NaOH zawieraa odwaka?
Rozwizanie:
Reakcja przebiega nastpujco:
NaOH + HCl NaCl + H2O
Wspczynniki rwnowanoci s nastpujce:
HCl = 1
NaOH = 1;
Korzystajc z wzoru:
Vy C y
mx
=
Mx fx
fy
znajc MNaOH = 40 g/mol, mona obliczy mas oznaczanej substancji:
mx =
Vy C y M x f x
fy
m NaOH =
0.035 0.1 40 1
= 0.14 g
1
PRZYKAD 3.
Na zmiareczkowanie odwaki 0,1g Na2CO3 zuyto 30 ml roztworu HCl. Oblicz
miano roztworu HCl. Msoli = 106 g/mol; Mkwasu = 36 g/mol.
76
Rozwizanie:
Reakcja przebiega nastpujco:
Na2CO3 + 2HCl 2NaCl + H2CO3
Wspczynniki rwnowanoci s nastpujce:
kwasu = 1
soli = 0,5;
Korzystajc z wzoru:
Vy C y
mx
=
Mx fx
fy
mona obliczy stenie molowe roztworu HCl:
Cy =
mx fy
Cy =
M x f x Vy
0 .1 1
= 0.06 mol/l
106 0.5 0.03
stenie molowe wyraone w jednostkach mol/l naley przeliczy na miano, wyraone w g/ml:
liczba moli n = m/M, gdzie m to masa substancji w gramach
m=Mn
2.16 g 1000 ml
x
1 ml
x = 0.00216 g/ml
PRZYKAD 4.
Jaka potrzebna jest objto 0.1 molowego roztworu HCl do zmiareczkowania
0.2 g odwaki NaOH?
MNaOH = 40 g/mol
Rozwizanie:
Ze stechiometrii rwnania:
NaOH + HCl NaCl + H2O
77
HCl = 1
Korzystajc z wzoru:
Vy C y
mx
=
Mx fx
fy
mona obliczy objto mianowanego roztworu:
Vy =
mx f y
Vy =
M x fxCy
0 .2 1
= 0.05 l
40 1 0.1
Odp. Do zmiareczkowania 0.2 g odwaki NaOH potrzeba 0.05 litra (czyli 50 ml)
roztworu HCl o steniu 0,1 mol/l.
PRZYKAD 5.
Miareczkowano 10 ml roztworu HCl o steniu 0.1 mol/l, mianowanym 0.1 molowym roztworem NaOH. Oblicz, jak zmieni si stenie molowe roztworu HCl po
dodaniu: a) 1 ml roztworu NaOH; b) 9 ml roztworu NaOH.
Rozwizanie:
Zalenoci midzy steniami molowymi i objtociami roztworw tej samej substancji dla K = Z = 1 wyraa rwnanie:
C1 V2
=
C 2 V1
gdzie:
V1 objto niezobojtnionego roztworu HCl; V2 sumaryczna objto roztworu; C1
wyjciowe stenie molowe roztworu HCl; C2 kocowe stenie molowe.
C2 =
78
C1 V1 0.1 9
=
= 0.08 mol / l
V2
11
C2 =
C1 V1 0.1 1
=
= 0.005 mol / l
V2
19
Odp. Stenie roztworu HCl po dodaniu 1 ml NaOH wynosi bdzie 0.08 mol/l,
natomiast po dodaniu 9 ml NaOH 0.005 mol/l.
79
6.
81
Dawka podana
Stenie w surowicy
82
Wydalanie wody w ml
1500
Mocz
1600
Woda z pokarmu
800
Skra
500
Woda z przemian
300
Puca
400
Ka
100
Razem:
2600
Razem:
2600
Dobowa objto moczu nie zmniejsza si poniej 400 ml, czyli objtoci
wody potrzebnej do rozpuszczenia okoo 40 g zwizkw staych wydalanych w dobowej porcji moczu. W moczwce prostej (niedobr wazopresyny) dobowa objto wydalanego moczu moe siga 5 litrw.
Utrata wody wraz z potem i powietrzem wydechowym praktycznie nie podlega regulacji, tymi drogami dobowe straty wynosz okoo 1 litra wody, z ktr
organizm traci okoo 30 mmoli jonw Na+. Przy wysokiej gorczce i przyspieszonym oddechu utrata wody z powietrzem wydechowym moe siga a 1500 ml
w cigu doby. Straty wody i elektrolitw z potem s kompensowane przez nerki.
Tabela 2. Pyny przewodu pokarmowego
Pyn
Wydzielanie dobowe w ml
lina
1500
Sok odkowy
2500
Sok jelitowy
3000
Sok trzustkowy
700
500
Razem:
8200
ELEKTROLITY USTROJOWE
Woda ustrojowa to roztwr rnych jonw nieorganicznych, a take organicznych. Obecno skadnikw mineralnych w formie jonowej wie si z utrzymaniem wody w organizmie, zarwno w kreniu, jak i w tkankach. Jony wpywaj na utrzymanie cinienia osmotycznego, wspuczestnicz w utrzymywaniu staego odczynu rodowiska, poniewa niektre s skadnikami ukadw buforowych.
Elektrolity uczestnicz te w wymianie gazowej i determinuj potencjay bonowe.
Tabela 3. Podstawowe elektrolity przestrzeni wodnych u czowieka
Pyn pozakomrkowy
Elektrolity
Osocze
mmol/l
rdmiszowy
mmol/l
Pyn
wewntrzkomrkowy
mmol/l
KATIONY
Na
K
Ca
++
++
Mg
142,0
146,5
12,0
5,0
5,0
140,0
2,5
1,3
1,0
1,0
5,0 mol/l
30,0
ANIONY
-
Cl
102,0
114,0
4,0
26,0
31,0
10,0
0,5
0,5
3,8
1,1
1,1
60,0
Kwasy organiczne
~5,0
~6,0
zmienne
Biaka
70 g/l
1,53,0 g/l
200300 g/l
HCO3
SO4
--
Fosforany H2PO4
HPO4- -
Roztwr wodny soli, ktry wywiera takie samo cinienie osmotyczne, jakie
panuje w komrkach i tkankach jest roztworem fizjologicznym (tzw. sol fizjologiczn).
Roztwr fizjologiczny o najprostszym skadzie stanowi dla ssakw roztwr
0,9% chlorku sodu. Jest izotoniczny z pynami ustrojowymi, np. z osoczem krwi
lub z pynem komrkowym, lecz nie jest izojonowy, to znaczy e rwnoway tyl84
85
86
87
V =
gdzie:
R staa gazowa; T temperatura bezwzgldna; z adunek jonu; F staa Faradaya;
czewn. stenie jonu na zewntrz komrki; cwewn. stenie jonu wewntrz komrki.
(8,314
J K -1 mol -1 (310K
(+ 1) (96485C
mol
-1
5 mmol/l
ln
= - 90 mV
140 mmol/l
146,5 mmol/l
= 62 log
= + 67 mV
12 mmol/l
88
90
Jony wapnia s czstkami informacyjnymi (wtrnymi przekanikami w dziaaniu hormonw), uczestnicz w rnorodnych procesach sygnalizacji wewntrzkomrkowej u eukariota. Przykadowo, gwatowny wzrost stenia jonw wapnia
w cytoplazmie (dziki otwarciu kanaw wapniowych) wyzwala skurcz komrki
miniowej, natomiast szybkie usunicie jonw wapnia z cytoplazmy (dziki dziaalnoci pomp wapniowych i przenonikw antyportowych Na+/Ca+2) umoliwia
rozkurcz komrki miniowej.
91
93
94
Potencja czynnociowy bony, wynikajcy ze znacznej depolaryzacji i nastpczej szybkiej repolaryzacji bony, przesuwa si przez bon w samowyzwalajcym si cyklu. Rozprzestrzenia si w kierunku dorodkowym jako rodzaj fali, od
miejsca zapocztkowania depolaryzacji do zakoczenia aksonu jako prd czynnociowy o prdkoci okoo 50 metrw na sekund. Na tym polega molekularny mechanizm przewodzenia nerwowego, w ktrym potencjay czynnociowe s bezporedni konsekwencj dziaania kanaw Na+ bramkowanych napiciem (ryc. 3).
Inhibitorami kanaw sodowych s tetrodotoksyna wyizolowana z ryby Tetrodon i saksitoksyna wyizolowana z bruzdnic morskich. S silnymi neurotoksynami, ktre wi si z kanaem sodowym (Ki~1mM), blokujc przepyw jonw
Na+ oraz przewodnictwo nerwowe. Ponadto hamuj rwnie pobudzenie wkien
miniowych.
Kanay wapniowe bramkowane napiciem umoliwiaj przeksztacenie
sygnau elektrycznego w sygna chemiczny na terenie zakocze aksonw, ktrymi
s kolbki presynaptyczne zawierajce wanie te kanay wapniowe (ryc. 3). Depolaryzacja bony kolbki presynaptycznej, wskutek dotarcia prdu czynnociowego,
powoduje otwarcie kanaw Ca++ bramkowanych napiciem. Poniewa stenie
jonw Ca++ w przestrzeni pozakomrkowej jest ponad tysickrotnie wiksze ni
wewntrz ko-mrki, to jony Ca++ szybko wnikaj przez te otwarte kanay do cytoplazmy kolbki presynaptycznej (ryc.3). Wysokie stenie wapnia w kolbce presynaptycznej stymuluje wydzielanie neuroprzekanikw zmagazynowanych w pcherzykach synaptycznych drog egzocytozy do szczeliny synaptycznej.
95
7.
SKADNIKI
BIONIEORGANICZNE
Iwona ak
W pynach ustrojowych, poza omwionymi elektrolitami, obecne s inne fizjologiczne pierwiastki nieorganiczne, odgrywajce istotn rol w procesach yciowych. Najwaniejsze z nich to jony elaza, cynku, miedzi, kobaltu, molibdenu,
selenu, jodu i fluoru. Obecne mog by te pierwiastki toksyczne, takie jak kadm,
ow, rt i inne.
Stenia jonw musz by utrzymywane w odpowiednich granicach, poniewa zbyt mae stenie danego niezbdnego jonu wywiera ujemny wpyw na procesy przebiegajce z jego udziaem i organizm cierpi na jego niedobr. Natomiast
wzrost stenia danego jonu powyej normy moe uwidoczni toksyczne dziaanie
jonu.
MAGNEZ
W organizmie ssakw ldowych zawarto magnezu stanowi 0,10,47% masy ciaa (dlatego naley do makroelementw), z czego 60% przypada na koci. Jony magnezu wystpuj we wszystkich pynach ustrojowych, stanowic istotny
skadnik puli kationw, szczeglne znaczenie maj w przestrzeni wewntrzkomrkowej. S aktywatorami wielu enzymw i uczestnicz w metabolizmie.
W komrce jony magnezu tworz kompleksy metalonukleotydowe w difosfo- i trifosfonukleozydach, przedstawionych na przykadzie ADP i ATP, lecz
dotycz wszystkich innych, mianowicie: GDP i GTP, CDP i CTP oraz UDP i UTP.
O
O
O P O P O
ADENOZYNA
O
O
Mg
2+
Mg-ADP
96
O
-
O P O P O P O
O
O
O
Mg
A D E NOZYNA
2+
, Mg-ATP
Kompleksy ,-Mg-ATP s faworyzowane w roztworach wodnych. ATP w tej postaci wie si take z centrami aktywnymi wielu enzymw.
O
O
O
O P O P O P O
O
O
O
Mg
ADENOZYNA
2+
, Mg-ATP
97
ELAZO
elazo jest metalem niezbdnym w kadym organizmie. U dorosego czowieka cakowita zawarto elaza wynosi 5070 mmol/l, czyli 34 g. Znaczca
cz, 6070% cakowitej puli elaza organizmu, zwizana jest z hemoglobin
i mioglobin. Zaledwie okoo 0,1% znajduje si w osoczu, gdzie elazo transportowane jest przez biako surowicy, transferyn. Natomiast do 25% elaza jest zmagazynowane w komrkach, w poczeniu z biakiem, ferrytyn lub w postaci bardziej stabilnej hemosyderyny (fosforanu elazowego), gwnie w ukadzie siateczkowo-rdbonkowym wtroby, ledziony i szpiku.
elazo wchodzi w skad wielu enzymw (np. katalaza, peroksydaza, akonitaza), zwizkw metaloproteinowych zawierajcych klastery nFe-nS (ferredoksyna
i inne przenoniki elektronw, akonitaza) lub zawierajcych elazo w poczeniu
elazoporfirynowym (hemoproteiny, w tym cytochromy). W organizmie elazo
peni rol w transporcie i metabolizmie O2 oraz w rnych procesach oksydacyjno-redukcyjnych.
elazo wystpuje na dwch stopniach utlenienia +2 i +3, odznacza si take
szczegln aktywnoci w zmianach stopnia utlenienia, na jego zachowanie wpywa wiele czynnikw, np. odczyn, potencja redoks, substancja organiczna.
Wszystkie zwizki Fe+2 s mobilne, ale na og mao stabilne. W obojtnym
pH (okoo 7) Fe+3 jest nierozpuszczalne, dlatego bardzo maa liczba uwodnionych
jonw pozostaje w roztworze i bardzo niewielkie iloci Fe+3 mog zosta wchonite do organizmu. Dlatego praktycznie tylko dwuwartociowe elazo moe ulega
wchanianiu.
Wchaniane elazo do organizmu wie si z apoferrytyn, tworzc ferrytyn luzwki jelita z jonami Fe3+. Ferrytyna luzwki przewodu pokarmowego jest
pierwszym magazynem elaza ustrojowego, ktry pozostaje w rwnowadze z elazem osocza. Pojedyncza czsteczka ferrytyny o sferycznym i wydronym szkielecie moe wiza do 4500 jonw Fe+3. Wchanianie elaza ustaje, gdy apoferrytyna
jest cakowicie wysycona elazem.
Biako osocza apotransferyna po zwizaniu jonw elaza uwalnianych
z magazynw przeksztaca si w transferyn, umoliwiajc w ten sposb solubilizacj i transport elaza w warunkach organizmu, gdzie wolne jony byyby zupenie nierozpuszczalne. Pojedyncza czsteczka transferyny transportuje dwa jony
Fe3+.
Wprowadzanie elaza do komrek odbywa si w kompleksie z transferyn,
po zwizaniu ze specyficznym receptorem na powierzchni komrki. Receptory dla
transferyny obecne s na powierzchni wszystkich komrek. Kompleks transferyna-receptor wnika do komrki drog endocytozy porednio-receptorowej. W endosomie, dziki dziaaniu pompy protonowej dochodzi do zakwaszenia rodowiska
(pH 56), ktre sprzyja uwolnieniu elaza. W komrkach wtroby, szpiku kostnego, ledziony i innych tkanek elazo moe by wykorzystane lub zmagazynowane
98
w ferrytynie. Natomiast apotransferyna zwizana z receptorem w czci pcherzyka endosomalnego powraca do bony komrkowej. Warunki zewntrzkomrkowe,
zwaszcza pH~7,4 sprawiaj, e apotransferyna jest uwalniana z receptora w formie zdolnej do wizania nastpnych jonw elaza. Cay ten cykl krenia transferyny midzy wntrzem komrki a przestrzeni pozakomrkow trwa okoo 15
minut.
Niedobory elaza u ludzi s czste, na og wynikaj z niskiej zawartoci
przyswajalnych form tego pierwiastka w poywieniu lub zaburze w jego wchanianiu. Niedobr elaza powoduje niedokrwisto, ograniczenie wzrostu i oglne
wycieczenie organizmu.
CYNK
Zawarto cynku w organizmie dorosego czowieka wynosi od 1,5 do 2,0 g,
z czego do 80% przypada na minie i koci. Wystpuje gwnie wewntrzkomrkowo, natomiast w surowicy jego stenie mieci si w granicach 8090 g/l,
gdzie niemal cakowicie jest zwizany z biakami (albuminami, 2-makroglobulin, transferyn insulin).
W komrkach cynk jest zwizany z niskoczsteczkowym biakiem, metalotionein, ktre jest biakiem bardzo bogatym w reszty cysteinowe z wolnymi grupami SH, wicymi metale cikie, gwnie kadm i ow. Metalotioneina peni
funkcj ochronn, detoksykacyjn, przeciwdziaajc zatruciu metalami cikimi,
dziki temu, e zwizane z tym biakiem jony metali cikich niezdolne s do innych oddziaywa.
Jony cynku znajduj si w centrach aktywnych wielu enzymw, np. w dysmutazie ponadtlenkowej wraz z jonem miedzi, w centrach enzymw hydrolitycznych, np. peptydazach, esterazach, fosfatazach lub anhydrazie wglanowej katalizujcej rozkad H2CO3. W hydrolazach wystpuj rwnie kationy Mg+2, Mn+2,
Ca+2, Ni+2, ktre w przewaajcych przypadkach s pierwiastkami nie ulegajcymi
reakcjom redoks.
W enzymie zwanym transkarbamoilaz asparaginianow (katalizujcym
pierwszy etap syntezy pirymidyn) znajduje si 6 jonw cynku, po jednym w kadym acuchu regulacyjnym. Pojedynczy jon cynku jest skoordynowany z 4 resztami cysteinowymi, tworzc domen cynkow. Domeny cynkowe uczestnicz
w bezporednich kontaktach midzy podjednostkami regulacyjnymi i katalitycznymi holoenzymu oraz maj znaczenie w efektach allosterycznych tego enzymu.
Syntaza porfobilinogenowa, katalizujca wczesny etap syntezy hemu jest
rwnie enzymem zawierajcym Zn+2, ktrego aktywno hamuje ow.
Cynk jest obecny w wielu biakach wicych kwasy nukleinowe i regulujcych dziaanie genw (czynnikach transkrypcyjnych), w ktrych peni funkcje
strukturalne w tworzeniu domen cynkowych, zwanych palcami cynkowymi zdolnych do bezporedniego oddziaywania z DNA.
99
MIED
Zawarto miedzi w organizmie dorosego czowieka wynosi okoo 80 mg,
z czego najwicej wystpuje w wtrobie, a najmniej w miniach i kociach. We
krwi jest skadnikiem stosunkowo stabilnym, stenie miedzi najczciej utrzymuje
si w granicach 100130 g/100 ml surowicy.
Wewntrzkomrkowa mied wystpuje gwnie w mitochondriach i jdrze
komrkowym. Wykazuje zdolno do tworzenia pocze z kwasami nukleinowymi, w ktrych moe powodowa trwae zmiany strukturalne. Szczeglnie atwo
tworzy poczenia z rnymi biakami zawierajcymi siark, szczeglnie z niskoczsteczkow metalotionein.
Mied jest skadnikiem rnych enzymw biorcych udzia w procesach
oksydacyjno-redukcyjnych, m.in. oksydazy cytochromowej, oksydazy lizylowej,
oksydazy askorbinianowej, plastocjaniny, dysmutazy ponadtlenkowej, ceruloplazminy. Ceruloplazmina biako osocza peni funkcj transportera miedzi.
Jony Cu+2 i Cu+ zwykle skoordynowane s z atomem siarki cysteiny i atomami azotu piercieni imidazolowych reszt histydyny acucha polipeptydowego.
Biaka miedziowe transportujce elektrony maj barw niebiesk, wykazuj charakterystyczne intensywne pasmo absorpcji przy okoo 600 nm.
Midzy miedzi a cynkiem wystpuje antagonizm, natomiast midzy miedzi i elazem synergizm, co ma korzystny wpyw szczeglnie przy syntezie hemoglobiny.
Mied jest niezbdna do prawidowego metabolizmu tkanki cznej, keratynizacji wosw. Jej obecno jest take konieczna dla aktywnoci oksydazy lizylowej, ktra katalizuje oksydacyjn dezaminacj acuchw bocznych lizyn, przeksztacajc je w allizyny bezporednio uczestniczce w tworzeniu wiza krzyowych w polipeptydach kolagenu i elastyny. Brak miedzi uniemoliwia tworzenie
wiza krzyowych i przeksztacenie rozpuszczalnego tropokolagenu oraz tropoelastyny w dojrzae biaka tkanki cznej. Schorzenie to zwane jest latyryzmem.
Omawiany pierwiastek wpywa na metabolizm lipidw i cholesterolu oraz
na waciwoci osonek mielinowych wkien nerwowych.
Niedobr miedzi moe objawia si ograniczeniem wzrostu, podnoci, zaburzeniami ukadu nerwowego, krwiononego, anemi, a take moe mie wpyw
na rozwj osteoporozy.
100
JOD
Jod jest niezbdnym pierwiastkiem, ktrego ilo w organizmie dorosego
czowieka wynosi 2050 mg, z czego do 80% znajduje si w tarczycy. Jest konieczny do biosyntezy hormonw tarczycy, a jego fizjologiczna rola w organizmie
wynika z funkcji, jakie te hormony speniaj.
Nie podlega kumulacji w organizmie, dlatego naley dostarcza go w sposb
cigy. Dzienne zapotrzebowanie na jod dorosego czowieka wynosi 150 g.
Szczeglnie atwo pobierany jest z poywienia i wody. Najlepszym jego rdem
jest ywno pochodzenia morskiego. Ograniczenie pobierania jodu oraz zaburzenie jego metabolizmu powoduj selen i fluor.
Niedobr jodu powoduje zaburzenie czynnoci tarczycy, przerost nabonka
gruczoowego tarczycy, czyli wole, osabienie oglnego metabolizmu, funkcji rozrodczych i umysowych. Wole endemiczne spowodowane jest niedoborem jodu
w poywieniu, stosunkowo czsto obserwuje si go wrd ludnoci poudniowej
czci Polski, szczeglnie grskich rejonw.
SELEN
Selen jest pierwiastkiem niezbdnym dla organizmu, ktrego stenie u ludzi na terenie Polski wynosi rednio 5060 g/l w surowicy krwi. Dzienne zapotrzebowanie dorosego czowieka jest rzdu 50100 g. Natomiast bezpieczna
dzienna dawka selenu nie powinna przekracza 400 g. Najatwiej przyswajalne s
seleniany i aminowe zwizki selenu. Bogatym rdem selenu s orzechy brazylijskie z rejonu lasw Amazonii.
W organizmie selen jest skadnikiem enzymw oksydacyjno-redukcyjnych
i cytochromw. Wana funkcja biologiczna selenu wynika z jego wystpowania
w peroksydazie glutationowej, ktra zabezpiecza lipidy bon komrkowych przed
utlenieniem. Najczciej czy si z cystein i metionin, tworzc selenocystein
oraz selenometionin.
W organizmie selen tworzy sabo rozpuszczalne selenki z metalami toksycznymi, takimi jak np.: Cd, Pb, Hg, ktre mog by odkadane w narzdach miszowych. Dziki tworzeniu selenkw, te metale toksyczne s eliminowane z obiegu, dlatego ich ostre toksyczne dziaanie moe by do pewnego stopnia ograniczone. Natomiast ich nadmierne odkadanie w nerkach i wtrobie moe okaza si
niekorzystne dla oglnego metabolizmu.
Niedobr selenu powoduje uszkodzenie minia sercowego, choroby ukadu
kostnego, ograniczenie sprawnoci ukadu odpornociowego, martwic wtroby,
zwiksza take ryzyko choroby nadcinieniowej i nowotworowej.
Nadmiar selenu jest toksyczny, wywouje zesp okrelany oglnie selenoz,
wrd objaww moe uwidoczni si niedokrwisto, atrofia organw wewntrznych, zesztywnienie koci, wypadanie wosw.
101
FLUOR
Fluor w steniu niskim jest pierwiastkiem niezbdnym, natomiast w nieco
wyszym jest toksyczny dla ssakw. Nieszkodliwa dzienna dawka fluoru dla czowieka dorosego wynosi okoo 1 mg, natomiast ju dawka okoo 5 mg moe doprowadzi do przewlekego zatrucia fluorem, zwanego fluoroz, gdy fluor akumuluje si w organizmie, przede wszystkim w kociach i zbach.
Fizjologiczna rola fluoru polega na jego uczestnictwie w procesach wizania
wapnia, magnezu i fosforu podczas mineralizacji tkanek kostnych. Ponadto fluor
w hydroksyapatycie atwo podstawia grup hydroksylow tworzc fluoroapatyt,
ktry jest bardziej stabilny i odporny na dziaanie kwasw od hydroksyapatytu
tkanki kostnej. Jednak zbyt dua ilo fluoroapatytu w tkankach kostnych powoduje ich przebudow oraz zmiany ich waciwoci fizyko-chemicznych.
Fluor, reagujc z metalami dwuwartociowymi, tworzy fluorki, np. wapnia,
magnezu, cynku, miedzi, elaza, ktre wytrcaj si w tkankach twardych, ich
nagromadzanie moe by toksyczne, a nawet mutagenne. Jednoczenie w ten sposb te fizjologiczne jony metali s eliminowane z biologicznego obiegu i penionych przez nie funkcji metabolicznych, dlatego mog nasili si objawy niedoboru,
np. magnezu, w organizmie. Nadmiar fluoru powoduje u dzieci zaburzenia rozwojowe oraz wpywa niekorzystnie na pobieranie i metabolizm jodu. Brak fluoru zaburza wizanie wapnia, magnezu i fosforu w tkankach kostnych, formowanie zbw i osabia szkliwo.
MOLIBDEN
Molibden jest pierwiastkiem niezbdnym dla organizmw zwierzcych, ktrego zawarto w tkankach mieci si w granicach 0,021 ppm, przy czym to najwysze stenie przypada na tkank kostn. W organizmie czowieka molibden
gromadzony jest w wtrobie, nerkach i zbach. Minimalne zapotrzebowanie na
molibden ustalono na okoo 20 g/dzie.
Molibden wchodzi w skad centrw aktywnych enzymw uczestniczcych
w procesach oksydacyjno-redukcyjnych. Szczeglne znaczenie tego pierwiastka
polega na jego zdolnoci ulegania dwuelektronowym reakcjom redoks na stopniach
utlenienia midzy VI i IV. Molibden uatwia reakcje przenoszenia atomw tlenu na
substrat, jak np. w oksydazie ksantynowej i oksydazie siarczynowej.
W warunkach naturalnych nie wystpuje niedobr tego pierwiastka. Endemiczny niedobr molibdenu odnotowano w niektrych rejonach Chin.
Nadmiar molibdenu jest toksyczny i powoduje deformacje koci podobne do
goca, skonno do prchnicy zbw, zaburzenia gospodarki lipidowej i biakowej.
102
KOBALT
Kobalt jest pierwiastkiem niezbdnym w organizmach zwierzcych. Jego
zawarto w tkankach mieci si w granicach 0,0050,5 ppm, przy czym najwicej
gromadzi si w narzdach miszowych i miniach. Stenie kobaltu w pynach
ustrojowych jest bardzo mae, poniej 1 g/l.
Kobalt jest skadnikiem kobalaminy (witaminy B12), gdzie tworzy kompleks
z koryn (piercie korynowy tym rni si od porfirynowego, e nie posiada metinowego atomu wgla czcego pirolowe piercienie A i D). Witamina B12 odgrywa rol w procesach 1,2-izomeryzacji, rodnikowych reakcjach redoks, w wytwarzaniu krwinek czerwonych i metabolizmie biaek oraz kwasw nukleinowych.
U czowieka niedobr kobaltu jest rzadki, natomiast niedobr witaminy B12 powoduje niedokrwisto i zmiany w narzdach miszowych.
Nadmiar kobaltu w organizmie jest szkodliwy, na og wynika z naraenia
zawodowego i powoduje czerwienic, uszkodzenie nerek, wtroby i osonek mielinowych, kardiomiopatie, przerost gruczou tarczycowego z ograniczon przyswajalnoci jodu.
KADM
Kadm jest pierwiastkiem toksycznym dla ludzi i zwierzt, dlatego przemysowe zanieczyszczenie rodowiska tym metalem stanowi powane zagroenie.
Jest pierwiastkiem charakteryzujcym si wybitnymi zdolnociami akumulacyjnymi. Dugi okres ptrwania w organizmie (1030 lat) przyczynia si do postpujcego odkadania tego pierwiastka w organizmie ludzi zdrowych wraz z wiekiem,
gwnie w nerkach, gdzie gromadzi si ponad 50% caego kadmu.
Maksymalna dzienna dawka dla czowieka dorosego o masie ciaa 70 kg zaproponowana przez FAO/WHO wynosi 70 g kadmu. Wskanikiem naraenia na
nadmierne dawki jest jego poziom we krwi czowieka, mieszczcy si w granicach
0,11,7 g/l. Natomiast, gdy naraenie na kadm w rodowisku jest bardzo wysokie, to poziom jego we krwi moe by wyszy, jak np. byo u mieszkacw Szopienic, u ktrych stenie tego pierwiastka we krwi wynosio 3,67 g/l.
U podstaw duej toksycznoci kadmu ley jego wpyw na systemy enzymatyczne komrek, polegajcy na wypieraniu i zastpowaniu innych fizjologicznych
metali, np. cynku, miedzi, selenu w metaloenzymach oraz na wizaniu si kadmu
z grupami czynnymi SH biaek.
Kadm bardzo atwo wie si z metalotionein, niskoczsteczkowym biakiem cytoplazmatycznym, bogatym w reszty cysteinowe, ktra wie dwuwartociowe kationy cynku, miedzi, selenu, natomiast kadm je wypiera i zastpuje.
Wysza zawarto w organizmie tych dwuwartociowych kationw stymuluje
wzmoon syntez metalotioneiny, ktra wic kadm obnia jego toksyczne dziaanie. Toksyczne dziaanie kadmu w organizmie zwykle sprowadza si do zaburze
103
OW
Ow naley do pierwiastkw toksycznych, jego stenie w niektrych tkankach czowieka wzrasta wraz z wiekiem. Wskanikiem zagroenia organizmu jest
zawarto oowiu we krwi powyej dopuszczalnej normy, wynoszcej u osb dorosych do 200 g/l, natomiast u dzieci do 150 g/l.
Wchonity ow do organizmu, po poczeniu z biakami osocza i erytrocytw kry wraz z krwi i jest odkadany w postaci nierozpuszczalnych zwizkw
oowiu, gwnie w kociach (dugoletni zbiornik oowiu), ale take w tkankach
mikkich. Po wielu latach od momentu ekspozycji na ow moe doj do uruchomienia tego zdeponowanego w kociach oowiu i do wzrostu jego stenia we krwi
pod wpywem np. wzmoonych procesw kociotwrczych lub odchudzania.
Toksyczne dziaanie oowiu uwidacznia si na poziomie molekularnym,
gdy hamuje wiele enzymw, w tym syntaz porfobilinogenow, podstawowy
enzym w syntezie hemu. Poza tym ow wie si z kwasami nukleinowymi
zarwno z DNA, jak i RNA z aminokwasami biaek, z hemoglobin, w ten sposb zaburzajc wiele przemian metabolicznych. Ow zakca metabolizm niezbdnych pierwiastkw ladowych, oglnie dziaa antagonistycznie na inne metale,
hamuje syntez ceruloplazminy, przyspiesza wydalanie miedzi i elaza. Podwyszony poziom miedzi, wapnia i fosforu w diecie obnia pobieranie oowiu przez
organizmy zwierzce i czowieka.
Narzdami najbardziej naraonymi na zatrucie oowiem s: wtroba, nerki,
szpik kostny i mzg. Skutkami toksycznoci oowiu s: zaburzenia w hemopoezie,
nadcinienie ttnicze, neuropatia, uszkodzenie mzgu. Dugotrwaa oowica prowadzi do zmian w orodkowym i obwodowym ukadzie nerwowym. Charakterystycznym objawem przewlekej oowicy jest bladoszare zabarwienie skry i rbek
oowiczy na dzisach.
RT
Rt jest pierwiastkiem toksycznym dla zwierzt i ludzi. Jego obecno
stwierdza si we wszystkich tkankach zwierzcych, w wikszych ilociach w organizmach wodnych, morskich (0,33 ppm) ni w ldowych (0,020,1 ppm). Skaenie zwizkami rtci tkanek ryb stanowi jedno z najwaniejszych rde wchaniania tego pierwiastka przez czowieka, natomiast stosowanie mczki rybnej do
skarmiania zwierzt domowych i drobiu moe by przyczyn wyszej zawartoci
zwizkw rtci w mleku, jajach i misie.
Toksyczne dziaanie rtci wynika z powinowactwa tego metalu do grup sulfhydrylowych, karboksylowych i aminowych aminokwasw biaek, z ktrymi two104
rzy bardzo silne wizania. W konsekwencji dochodzi do zahamowania biochemicznych funkcji wielu enzymw. Toksyczne dziaanie rtci ma te charakter mutagenny i teratogenny, wynikajcy ze zmian w wizaniach fosforowych DNA.
Alkilowe zwizki rtci atwo przedostaj si do komrek mzgowych, naruszajc barier krew-mzg, powoduj uszkodzenia niektrych komrek mzgowych
i zaburzaj metabolizm ukadu nerwowego. Nadmiar rtci obnia zawarto jodu
w tarczycy. Natomiast selen zmniejsza toksyczno rtci, gdy ogranicza czenie
aminokwasw biaek z rtci, poniewa sam wykazuje podobne powinowactwo do
tych zwizkw.
105
8.
ROZTWORY BUFOROWE
Iwona ak, Pawe Niemiec
Kk =
[H 3O + ][A ]
[HA]
[ H 3O + ] = K k
[HA]
C
= Kk k ,
[A ]
Cs
106
Ck
C
= pK k + Ig s
Cs
Ck
Kz =
[OH ] =
[BH + ][OH ]
[B]
[OH ] =
Kw
, co po podstawieniu daje
[H 3O + ]
K z [B]
[BH + ]
Kw
[B]
= Kz
+
[ H 3O ]
[BH + ]
std:
[ H 3O + ] =
K w [BH + ]
K Cs
= w
K z [B]
K z Cz
Podobnie jak w poprzednim przypadku, sl jest dobrze zdysocjowana i stenie [BH+] rwna si cakowitemu steniu soli Cs, natomiast [B] odpowiada steniu sabej zasady Cz, uytej do sporzdzenia buforu.
Po zlogarytmowaniu powyszego wzoru otrzymuje si:
pH = pK w pK z lg
pH = 14 pK z lg
Cs
Cz
lub:
Cs
C
= 14 pK z + Ig z
Cz
Cs
PRZYKAD 1.
Jakie bdzie pH roztworu buforowego otrzymanego ze zmieszania 80 ml kwasu
octowego o steniu 0,2 mol/l i 20 ml octanu sodu o steniu 0,2 mol/l.
107
Rozwizanie:
Naley obliczy stenie molowe kwasu i soli w roztworze buforowym:
[CH 3COOH] =
0,2 mol / l 80 ml
= 0,16 mol / l
80 ml + 20 ml
[CH 3COONa ] =
0,2 mol / l 20 ml
= 0,04 mol / l
80 ml + 20 ml
K CH 3 COOH = 1,86 10 5
pK = -lgK = -lg 1,86 10-5 = - [0,27 + (-5)] = - [0,27 5] = - (- 4,73) = 4,73
pH = pK k + lg
Cs
= 4,73 + lg (0,04 mol / l / 0,16 mol / l) =
Ck
Odp. Gdy stosunek soli do kwasu wynosi 1:4, warto pH buforu octanowego rwna si 4,13.
PRZYKAD 2.
Jakie bdzie pH roztworu buforowego otrzymanego ze zmieszania 50 ml kwasu
octowego o steniu 0,2 mol/l z 50 ml octanu sodu o steniu 0,2 mol/l.
108
Rozwizanie:
[CH 3COOH] =
0,2 mol / l 50 ml
= 0,1 mol/l
50 ml + 50 ml
[CH 3COONa ] =
0,2 mol / l 50 ml
= 0,1 mol / l
50 ml + 50 ml
K CH3COOH = 1,86 10 5
to
pH = pK k + lg
pK CH 3COOH = lg K = 4,73
Cs
= 4,73 + lg1 = 4,73
Ck
Odp. Gdy stosunek soli do kwasu wynosi 1:1, warto pH rwna si wartoci pKk,
czyli 4,73.
PRZYKAD 3.
Jakie bdzie pH roztworu buforowego otrzymanego ze zmieszania 20 ml kwasu
octowego o steniu 0,2 mol/l z 80 ml octanu sodu o steniu 0,2 mol/l.
Rozwizanie:
[CH 3COOH ] =
0,2 mol / l 20 ml
= 0,04 mol / l
20 ml + 80 ml
[CH 3COONa ] =
pH = pK k + lg
0,2 mol / l 80 ml
= 0,16 mol / l
80 ml + 20 ml
Cs
= 4,73 + lg(0,16 / 0,04) = 4,73 + 0,6 = 5,33
Ck
Odp. Gdy stosunek soli do kwasu wynosi 4:1, warto pH buforu octanowego
rwna si 5,33.
109
log f =
zi A
,
1+
gdzie:
f wspczynnik aktywnoci; Ci cakowite stenie molowe roztworu; zi adunek jonu; A = 0,51 dla roztworw wodnych o temperaturze 25oC, sia jonowa roztworu.
1 n
2
Ci z i = 0,5 (0,04 mol/l 12 + 0,04 mol/l 12) = 0,04
2 i =1
12 0,51 0,04
0,102
log f =
=
= 0,82
1,2
1 + 0,04
uwzgldniajc warto wspczynnika aktywnoci, pH tego buforu wynosi:
pH = 4,73 + lg (0,82 0,04/0,16) = 4,73 + lg (0,205) = 4,73 0,69 = 4,04
Obliczona warto pH tego buforu, bez uwzgldnienia wspczynnika
aktywnoci, wynosia 4,13. W buforze tym rnica wynikajca z oblicze jest stosunkowo nieznaczna, rzdu 0,09 jednostki pH. W przypadku buforw bardziej
rozcieczonych rnica ta jest jeszcze mniejsza, wwczas warto wspczynnika
aktywnoci w obliczaniu pH roztworu buforowego mona pomin. Bardzo due
rnice dotycz buforw opartych na solach kwasw wieloprotonowych, np.
w buforze fosforanowym. W takich przypadkach, obliczajc warto pH zawsze
naley uwzgldnia wspczynniki aktywnoci dla obu rodzajw jonw.
Przykady oblicze pH roztworu buforowego, bdcego mieszanin sabej
zasady i jej soli przedstawiono poniej.
110
PRZYKAD 4.
Jakie jest pH roztworu buforowego otrzymanego ze zmieszania 90 ml roztworu
amoniaku o steniu 0,2 mol/l z 10 ml roztworu chlorku amonu o steniu 0,2
mol/l.
Rozwizanie:
[ NH 3 ] =
0,2 mol / l 90 ml
= 0,18 mol / l
90 ml + 10 ml
[ NH 4 Cl] =
0,2 mol / l 10 ml
= 0,02 mol / l
90 ml + 10 ml
K NH3 H 2O = 1,75 10 5 ,
pK NH 3 = lg K NH 3 = 4,75
pH = pK w pK z + lg
Cz
Cs
pK w = 14
pH = 14 4,75 + lg
0,18 mol / l
= 10,2
0,02 mol / l
Odp. Gdy stosunek soli do zasady wynosi 1:9, warto pH buforu amonowego wynosi 10,2.
PRZYKAD 5.
Jakie jest pH roztworu buforowego otrzymanego ze zmieszania 50 ml roztworu
amoniaku o steniu 0,2 mol/l z 50 ml roztworu chlorku amonu o steniu 0,2
mol/l.
Rozwizanie:
[ NH 3 ] = [ NH 4Cl] =
0,2 mol / l 50 ml
= 0,1 mol / l
50 ml + 50 ml
pH = 14 4,75 + lg
0,1 mol / l
= 9,24
0,1 mol / l
111
Odp. Gdy stosunek soli do zasady wynosi 1:1, warto pH buforu amonowego wynosi 9,24.
PRZYKAD 6.
Jakie jest pH roztworu buforowego otrzymanego ze zmieszania 10 ml roztworu
amoniaku o steniu 0,2 mol/l z 90 ml roztworu chlorku amonu o steniu 0,2
mol/l.
Rozwizanie:
[ NH 3 ] =
0,2 mol / l 10 ml
= 0,02 mol / l
10 ml + 90 ml
[ NH 4 Cl] =
0,2 mol / l 90 ml
= 0,18 mol / l
10 ml + 90 ml
pH = 14 4,75 lg
0,18 mol / l
= 8,29
0,02 mol / l
Odp. Gdy stosunek soli do zasady wynosi 9:1, warto pH buforu amonowego wynosi 8,29.
Pojemno buforowa ( ) jest wielkoci charakteryzujc zdolno buforowania przez dany roztwr, czyli przeciwstawiania si zmianom pH po dodaniu do
roztworu mocnego kwasu lub zasady. Miar pojemnoci buforowej jest stosunek liczby dodanych moli jonw H+ lub OH- do zmiany pH w przeliczeniu na 1
litr roztworu buforowego:
dC (mol / l)
pH
gdzie:
dC stenie mocnego kwasu lub mocnej zasady (mol/l), ktre spowodowao zmian pH
roztworu buforowego; pH zmiana wartoci pH roztworu buforowego.
Pojemno buforowa przyjmuje tym wiksz warto, im wiksze jest stenie buforu, natomiast maleje wraz z rozcieczaniem buforu. Bufory o tym samym
steniu maj najwiksz pojemno wwczas, gdy stosunek ich skadnikw
sprzonej pary kwas zasada jest rwny jednoci.
112
PRZYKAD 7.
Do 100 ml 0,2 M roztworu buforowego, bdcego mieszanin roztworu kwasu
octowego o steniu 0,16 mol/l i roztworu octanu sodu o steniu 0,04 mol/l dodano: a) 1 ml HCl o steniu 0,9 mol/l; b) 1 ml NaOH o steniu 0,9 mol/l. Oblicz
pojemno buforow roztworu wobec mocnego kwasu i mocnej zasady.
Rozwizanie:
ad. a. W 1000 ml znajduje si 0,9 mola HCl, to w 1 ml znajdzie si:
1000 ml
1 ml
pH = 4,73 + lg
0,004 mola
= 4,13
0,016 mola
pH = 4,73 + lg
1000 ml
x = 0,0089 mol/l
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,064
pH
0,14
113
ad. b. Stenie NaOH = 0,9 mol/l, dodano 1 ml, ktry zawiera 0,0009 mola NaOH.
1000 ml
1 ml
pH = 4 , 73 lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,081
pH
0,11
Odp. Bufor octanowy (0,2 M), w ktrym stosunek soli do kwasu wynosi 1:4, ma
nisz pojemno buforow wobec mocnego kwasu rzdu 0,064, a wysz
pojemno buforow wobec mocnej zasady rzdu 0,081.
PRZYKAD 8.
Do 100 ml 0,2M roztworu buforowego, bdcego mieszanin roztworu kwasu
octowego o steniu 0,1 mol/l i octanu sodu o steniu 0,1 mol/l dodano: a) 1 ml HCl
o steniu 0,9 mol/l; b) 1 ml NaOH o steniu 0,9 mol/l. Oblicz pojemno buforow tego roztworu wobec mocnego kwasu i mocnej zasady.
Rozwizanie:
W 100 ml buforu znajduje si 0,01 mola CH3COOH i 0,01 mola CH3COONa. Gdy
stosunek soli do kwasu wynosi 1:1, warto pH buforu przed dodaniem do niego
kwasu lub zasady jest rwna wartoci pKk, czyli pH= 4,73
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,11
pH
0,08
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,11
pH
0,08
Odp. Bufor octanowy, w ktrym stosunek soli do kwasu wynosi 1:1, ma jednakow pojemno buforow zarwno wobec mocnego kwasu, jak i mocnej zasady, ktrej wielko jest rzdu 0,11; bdc jednoczenie najwysz z wszystkich buforw octanowych.
PRZYKAD 9.
Do 100 ml 0,2 M roztworu buforowego, bdcego mieszanin roztworu kwasu
octowego o steniu 0,04 mol/l i roztworu octanu sodu o steniu 0,16 mol/l dodano: a) 1 ml HCl o steniu 0,9 mol/l; b) 1 ml NaOH o steniu 0,9 mol/l. Oblicz
pojemno buforow roztworu wobec mocnego kwasu i mocnej zasady.
Rozwizanie:
W 100 ml 0,2 M buforu octanowego znajduje si 0,016 mola soli i 0,004 mola
kwasu, natomiast pH tego buforu o stosunku soli do kwasu 4:1 przed dodaniem
kwasu lub zasady wynosi:
115
pH = 4,73 + lg
0,016 mola
= 5,33
0,004 mola
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,081
pH
0,11
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,064
pH
0,14
Odp. Bufor octanowy (0,2 M), w ktrym stosunek soli do kwasu wynosi 4:1, ma
wysz pojemno buforow wobec mocnego kwasu rzdu 0,081 a nisz pojemno buforow wobec mocnej zasady, rzdu 0,064.
Maksymalna ilo mocnego kwasu, ktra moe by zbuforowana jest zdeterminowana steniem soli obecnej w buforze, natomiast ilo mocnej zasady,
ktra moe by zbuforowana zdeterminowana jest steniem sabego kwasu, obecnego w buforze. W miar zwikszania iloci dodawanej zasady lub kwasu pojemno buforowa zmniejsza si i staje si rwna zeru w momencie, gdy caa zawarta
w buforze sl zamieni si w saby kwas lub cay saby kwas zostanie przeprowadzony w sl. Dlatego pojemno roztworu buforowego zaley od jego stenia;
wzrasta wraz ze wzrostem stenia buforu i maleje wraz z jego rozcieczaniem.
116
PRZYKAD 10.
10 ml 0,2M roztworu buforowego, bdcego mieszanin roztworu kwasu octowego
o steniu 0,1 mol/l i octanu sodu o steniu 0,1 mol/l rozcieczono dziesiciokrotnie otrzymujc 100 ml roztworu. Nastpnie dodano do niego: a) 1 ml HCl
o steniu 0,9 mol/l; b) 1 ml NaOH o steniu 0,9 mol/l. Jaka jest pojemno buforowa tego roztworu wobec mocnego kwasu i mocnej zasady.
Rozwizanie:
W 100 ml buforu znajduje si 0,001 mola CH3COOH i 0,001 mola CH3COONa.
pH rozcieczonego roztworu, przed dodaniem do niego kwasu lub zasady rwne
jest wartoci pK dla kwasu octowego, czyli pH = 4,73, warto ta jest analogiczna
z wartoci pH tego buforu przed rozcieczeniem (patrz przykad 8).
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,007
pH
1,28
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,007
pH
1,28
PRZYKAD 11.
10 ml 0,2M roztworu buforowego, bdcego mieszanin roztworu kwasu octowego
o steniu 0,16 mol/l i octanu sodu o steniu 0,04 mol/l rozcieczono dziesiciokrotnie, otrzymujc 100 ml roztworu. Nastpnie dodano do niego: a) 1 ml NaOH
o steniu 0,9 mol/l; b) 1 ml HCl o steniu 0,9 mol/l. Oblicz pojemno buforow
tego roztworu wobec mocnego kwasu i mocnej zasady.
Rozwizanie:
Stenie skadnikw buforu po rozcieczeniu wynosi w 100 ml 0,0016 mola
CH3COOH i 0,0004 mola CH3COONa. Warto pH 10-krotnie rozcieczonego
buforu przed dodaniem do niego zasady lub kwasu wynosi:
pH = 4,73 + lg
0,0004 mola
= 4,13
0,0016 mola
pH = 4,73 + lg
118
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,01
pH
0,87
ad. b. Stenie dodanego HCl rzdu 0,0009 mola, ponad dwukrotnie przekracza
zdolno buforowania 10-krotnie rozcieczonego buforu octanowego ze
wzgldu na niewystarczajc ilo soli.
Odp. Rozcieczony 10-krotnie bufor octanowy o stosunku soli do kwasu 1:4 ma
pojemno wobec zasady rzdu 0,01, czyli 8-krotnie nisz od pojemnoci
buforu wyjciowego. Natomiast pojemno buforowa wobec mocnego kwasu zostaa przekroczona.
PRZYKAD 12.
10 ml 0,2M roztworu buforowego, bdcego mieszanin roztworu kwasu octowego
o steniu 0,04 mol/l i octanu sodu o steniu 0,16 mol/l rozcieczono dziesiciokrotnie, otrzymujc 100 ml roztworu. Nastpnie dodano do niego: a) 1 ml HCl o steniu 0,9 mol/l; b) 1 ml NaOH o steniu 0,9 mol/l. Oblicz pojemno buforow tego
roztworu wobec mocnego kwasu i mocnej zasady.
Rozwizanie:
Stenie skadnikw buforu po rozcieczeniu wynosi w 100 ml 0,0004 mola
CH3COOH i 0,0016 mola CH3COONa;
pH rozcieczonego buforu przed dodaniem do niego kwasu lub zasady wynosi:
pH = 4,73 + lg
0,0016 mola
= 5,33
0,0004 mola
ad. a. Warto pH 10-krotnie rozcieczonego buforu, po dodaniu do niego mocnego kwasu wynosi:
pH = 4,73 + lg
dC
0,0089 mol / l
=
= 0,01
pH
0,87
119
PRZYKAD 13.
Oblicz pH roztworu buforowego (uwzgldniajc warto siy jonowej i wspczynnika aktywnoci f), bdcego mieszanin kwasu octowego i octanu sodu o steniu: a) 0,1 mol/l CH3COOH i 0,1 mol/l CH3COONa; b) 0,01 mol/l CH3COOH
i 0,01 mol/l CH3COONa.
Rozwizanie:
Sia jonowa roztworu nierozcieczonego wynosi: = 0,1 warto f wynosi:
lg f =
12 0,51 0,1
1 + 0,1
= 0,122
f = 0,75
pH = 4,73 + lg
0,75 0,1
= 4,60
0,1
lg f =
120
12 0,51 0,01
= 0,046
1 + 0,01
f = 0,89
pH = 4,73 + lg
0,89 0,01
= 4,67
0,01
121
9.
RWNOWAGA
KWASOWO-ZASADOWA USTROJU
Iwona ak
122
[H+]
35,544,7 nmol/l
pH
7,357,45
pCO2
HCO3
2428 mmol/l
4448 mmol/l
(-2,5)(+2,0) mmol/l
Nadmiar lub niedobr zasad jest miar zaburze rwnowagi kwasowo-zasadowej. Nadmiar zasad (oznaczany +) stanowi rnic midzy sum ste wszystkich zasad buforujcych (uwzgldniajcych hemoglobin, biaczany, fosforany,
wodorowglany), a tzw. normalnymi zasadami buforujcymi. Pod pojciem niedobr lub nadmiar zasad buforujcych naley rozumie tak ilo mmoli mocnego
kwasu lub mocnej zasady, ktr naley doda do 1 litra krwi, aby stenie zasad
buforujcych wrcio do wartoci prawidowych, czyli aby warto pH krwi doprowadzi do normy. Ocen rwnowagi kwasowo-zasadowej przeprowadza si na
podstawie pomiaru niektrych tylko parametrw tej rwnowagi, czyli pH i pCO2,
gdy wspczesne analizatory rwnowagi kwasowo-zasadowej z reguy dokonuj
pomiaru tych parametrw, natomiast pozostae s wyliczane automatycznie.
W warunkach fizjologicznych utrzymywany jest prawidowy bilans dobowy
jonw H+, ktrego wartoci u czowieka dorosego przedstawia tabela 2.
Tabela 2. Bilans dobowy jonw H+ w organizmie dorosego czowieka
Kationy H+ w cigu 24 godz.
Wytwarzane lub pobierane
Lotny kwas
Wydalane z organizmu
przez puca
CO2
1520 mol
Nielotne kwasy:
1520 mol
mocz
organiczne
15 mmol
H2PO4
SO4
CO2
2-
15 mmol
H2PO4-
30 mmol
40 mmol
40 mmol
NH4
123
W cigu doby czowiek dorosy wytwarza a 1520 moli CO2 i tyle samo
wydala go przez puca. Dwutlenek wgla, powstajcy podczas metabolizmu w mitochondriach, dostaje si drog dyfuzji do cytoplazmy, po czym do pynu rdmiszowego, dalej do pynu wewntrznaczyniowego, skd (z osocza) dyfunduje
do erytrocytw. W erytrocytach pod wpywem specyficznego enzymu, tzw. anhydrazy wglanowej, nastpuje uwodnienie dwutlenku wgla do H2CO3. W erytrocytach kwas wglowy dysocjuje do H+ i HCO3-.
CO2 + H2O H2CO3
H2CO3 H+ + HCO3Anhydraza wglanowa poza erytrocytami wystpuje w cytoplazmie komrek
kanalikw proksymalnych, dystalnych i cewek zbiorczych nerek, komrek okadzinowych bony luzowej trzonu odka, komrek pcherzykowych i rdpcherzykowych trzustki. Wyjtkowo, poza cytoplazm, anhydraza wglanowa w komrkach kanalikw proksymalnych znajduje si w bonie plazmatycznej po stronie
luminalnej, co ma istotne znaczenie w regulacji rwnowagi kwasowo-zasadowej
w nerkach.
W zalenoci od rodzaju i stanu funkcjonalnego komrek, w ktrych wystpuje anhydraza wglanowa, jony H+ mog by albo wydzielane poza komrki, albo
wizane z anionami wewntrzkomrkowymi. Aniony HCO3- s z reguy usuwane
z tych komrek na drodze wymiany z anionami Cl-. Wymieniacz Cl-/HCO3- przemieszcza aniony Cl- i HCO3- na zasadzie antyportu, zgodnie z gradientem ste.
Wymiana jonw zachodzi w stosunku 1:1, ma zatem charakter elektroobojtny.
Z przedstawionego w tabeli 2 bilansu wynika, e ilo nielotnych kwasw
powstajcych w organizmie i przyjtych z poywieniem w cigu doby wynosi
rednio 70 mmol/24 godz. Jednoczenie taka sama ilo nielotnych kwasw zostaje
wydalona z moczem w cigu doby, przede wszystkim jako kationy NH4+ i aniony
H2PO4-.
Podstawowe mechanizmy homeostazy ustrojowej, ktre s odpowiedzialne
za utrzymanie rwnowagi kwasowo-zasadowej wynikaj z funkcjonowania w organizmie roztworw buforowych oraz eliminacji rwnowanikw kwanych poprzez puca i nerki.
Podstawowymi roztworami buforowymi organizmu czowieka s: bufor wodorowglanowy, bufor hemoglobinowy, bufor fosforanowy i bufory biaczanowe,
ktre zestawiono w tabeli 3.
Wikszo uwalnianych jonw H+ w pynach ustrojowych jest natychmiast
przyczana przez skadniki anionowe buforw biaczanowych i fosforanowych
w przestrzeni wewntrzkomrkowej, natomiast w przestrzeni pozakomrkowej
gwnie przez HCO3- buforu wodorowglanowego.
124
Udzia w pojemnoci
buforowej krwi (%)
PZK
70
Hb /HHbO2
PWK
21
Na2HPO4/NaH2PO4
PWK
PWK i PZK
Bufor
NaHCO3/H2CO3
-
Na-biaczany/H-biaczany
gdzie:
PZK pyn zewntrzkomrkowy, PWK pyn wewntrzkomrkowy
BUFOR WODOROWGLANOWY
Bufor wodorowglanowy jest najwaniejszym elementem rwnowagi kwasowo-zasadowej, zarwno ze wzgldw ilociowych, jak i z uwagi na fakt, e jest
najbardziej podatny na oddechowe i metaboliczne mechanizmy regulacyjne. Kwas
wglowy moe by reprezentowany przez swj bezwodnik CO2, z ktrego powstaje:
CO2 + H2O H2CO3 H+ +
[800]
[1]
[0.03]
HCO3[0.03]
HCO 3
H 2 CO 3
pH = pK + log
HCO 3
pCO 2
gdzie:
0,0304 dla przeliczenia prnoci wyraonej w mmHg na [CO2] w mmol/l;
0,226 dla przeliczenia prnoci wyraonej w kPa na [CO2] w mmol/l;
pK H 2 CO 3 = 6,11.
125
pCO2
[kPa]
[mmHg]
Tkankach
7,30
55
Krwi ylnej
6,10
46
PZK
6,10
46
Krwi ttniczej
5,30
40
Powietrzu pcherzykowym
5,30
40
Powietrzu atmosferycznym
0,04
0,3
gdzie:
PZK pyn zewntrzkomrkowy
Z caej puli dwutlenku wgla powstajcego w organizmie okoo 75% wchodzi w reakcj z wod (katalizowan przez anhydraz wglanow), ktrej produktami s jony H+ i HCO3-, okoo 15% dwutlenku wgla tworzy poczenia karbaminianowe z wolnymi grupami -aminowymi N-terminalnych reszt waliny acuchw polipeptydowych, szczeglnie hemoglobiny, a jedynie okoo 5% dwutlenku
wgla jest transportowane w postaci gazu fizycznie rozpuszczonego w wodzie
przestrzeni wewntrznaczyniowej.
Bufor wodorowglanowy dziaa w organizmie w ukadzie otwartym, bezwodnik kwasu wglowego CO2 jest usuwany przez puca. W ten sposb kontrolowane jest stenie kwasu. Natomiast poziom drugiego skadnika regulowany jest
dziaaniem nerek (poprzez resorpcj i regeneracj HCO3-).
Puca zapewniaj eliminacj kocowego produktu przemiany materii oraz
uczestnicz w regulacji rwnowagi kwasowo-zasadowej poprzez utrzymywanie
prawidowego cinienia czstkowego CO2 we krwi i pynie pozakomrkowym.
Poniewa organizm jest ukadem otwartym, pojemno buforowa buforu
wodorowglanowego jest ponad 5-krotnie wysza od obliczonej pojemnoci tego
buforu w ukadzie zamknitym.
Transport dwutlenku wgla odbywa si dziki dyfuzji zgodnej z gradientem ste CO2 po obu stronach bariery pcherzykowo-woniczkowej, ktry jest
utrzymywany poprzez perfuzj naczy krwiononych puc i wentylacj pcherzykw pucnych.
Wentylacja, a zatem eliminacja CO2 s regulowane za porednictwem orodka oddechowego w podwzgrzu, ktrego chemoreceptory s wraliwe na pCO2
126
127
BUFOR HEMOGLOBINIANOWY
Bufor hemoglobinianowy wspdziaa z buforem wodorowglanowym w regulacji rwnowagi kwasowo-zasadowej. Hemoglobina zawiera a 38 reszt histydynowych, ktrych piercienie imidazolowe bior bezporedni udzia w wizaniu
i uwalnianiu jonw H+. Bogactwo w reszty histydynowe hemoglobiny sprawia, e
ma ona szeciokrotnie wikszy udzia w buforowaniu pynu pozakomrkowego ni
biaka osocza. Oksyhemoglobina [Hb(O2)4] jest mocniejszym kwasem (pK = 6.81)
ni deoksyhemoglobina (pK = 8.03). W pucach mol oksyhemoglobiny uwalnia 0.7
mola jonw H+ , w tkankach mol deoksyhemoglobiny wie 0.7 mola jonw H+.
Dziaanie Hb jako buforu jest zatem uzalenione od jej funkcji transportera tlenu.
Procentowe wysycenie hemoglobiny tlenem jest zalene od pO2 w osoczu.
Zaleno t przedstawia tzw. krzywa dysocjacji oksyhemoglobiny:
100
90
80
% HbO8
70
60
50
40
30
20
10
0
0
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
pO2 mmHg
2,7
5,3
8,0
10,7
13,3
pO2 kPa
Ze spaszczenia grnej czci krzywej wynika, e przy cinieniu tlenu powyej 60 mmHg, nawet znaczne zmiany cinienia wywouj tylko mae rnice w wysyceniu tlenem hemoglobiny, co sprzyja prawie maksymalnemu pobieraniu tlenu
w pucach. Jednak przy cinieniu parcjalnym niszym ni 60 mmHg zdolno wizania tlenu gwatownie spada, sprzyja to uwalnianiu tlenu na obwodzie, natomiast
utrudnia lub uniemoliwia pobieranie O2 w pucach z powietrza o niskim pO2. Zakwaszenie krwi, wzrost temperatury oraz wzrost stenia 2,3-difosfoglicerynianu
128
BUFOR FOSFORANOWY
Bufor fosforanowy jest buforem przestrzeni wewntrzkomrkowej, stanowicym okoo 6% pojemnoci buforowej krwi. Dla buforu fosforanowego w zakresie pH okoo 7 wana jest staa rwnowagi nastpujcej reakcji:
H2PO4- HPO42- + H+
Staa K H
2 PO 4
129
Kwasica oznacza stan, w ktrym dochodzi do przesunicia pH krwi w kierunku kwanym, w wyniku np. nagromadzenia we krwi nadmiernych iloci substancji o charakterze kwanym.
Zasadowica oznacza stan, w ktrym dochodzi do przesunicia pH w kierunku zasadowym, w wyniku, np. nagromadzenia we krwi nadmiernych iloci substancji o charakterze zasadowym.
Zaburzeniom rwnowagi kwasowo-zasadowej towarzysz zmiany w rwnowadze wodno-elektrolitowej, zwaszcza moe zaistnie wdrwka jonw potasu
midzy komrk a przestrzeni pozakomrkow. W kwasicy jony potasu przechodz z komrek na zewntrz w wyniku wymiany na pozakomrkowe jony wodorowe. W zasadowicy jony potasu wchodz do komrek w wyniku wymiany na wewntrzkomrkowe jony wodorowe i w osoczu maleje stenie jonw K+.
130
10.
WGLOWODANY
Iwona ak
131
132
D
MONOSACHARYDY I POCHODNE
Klasyfikacja i nomenklatura
Monosacharydy s cukrami prostymi, ktrych nie mona rozoy na inne
skadniki cukrowe, majcymi mas czsteczkow nie przekraczajc 200 daltonw.
Klasyfikuje si je w dwie rodziny: wielowodorotlenowe aldehydy, czyli aldozy
(ryc. 1) i wielowodorotlenowe ketony, czyli ketozy (ryc. 2). Nazw aldoza i ketoza
uywa si w sensie oglnym dla odrnienia monosacharydw, w ktrych grupa
karbonylowa jest kocow (aldehydow) i jej atom wgla jest atomem numer 1,
lub nie jest kocow (ketonow), a jej atom wgla jest atomem numer 2. Kocwka oza oznacza, e przy atomach wgla, poza wglem grupy aldehydowej lub ketonowej, znajduj si grupy OH, tzn. e zwizek naley do wglowodanw.
W kadej rodzinie dalsza klasyfikacja opiera si na liczbie atomw wgla w czsteczce. Dla aldoz majcych 3, 4, 5, 6 atomw wgla w acuchu nazwami podstawowymi s odpowiednio: trioza, tetroza, pentoza, heksoza. Dla ketoz majcych 4,
5, 6, 7 atomw wgla w acuchu nazwami podstawowymi s odpowiednio tetruloza, pentuloza, heksuloza, heptuloza.
CH 2OH
C O
CH2OH
C O
H C OH
CH 2OH
D-(-)-erytruloza
D
CH2OH
dihydroksyaceton
CH 2OH
C O
CH2OH
C O
H C OH
H C OH
CH 2OH
D
D-(+)-rybuloza
HO C H
H C OH
CH2OH
D
D-(+)-ksyluloza
CH2OH
C O
H C OH
H C OH
H C OH
CH2OH
D
D-(+)-psykoza
CH2OH
C O
HO C H
H C OH
H C OH
CH2OH
D
D-(-)-fruktoza
CH2OH
C O
H C OH
OH C H
H C OH
CH2OH
D
D-(+)-sorboza
CH2OH
C O
HO C H
HO C H
H C OH
CH2OH
D
D-(-)-tagatoza
133
134
Nazwa systematyczna
D-erytro-tetroza
D-treo-tetroza
D-arabino-pentoza
D-likso-pentoza
D-rybo-pentoza
D-ksylo-pentoza
D-allo-heksoza
D-altro-heksoza
D-galakto-heksoza
D-gluko-heksoza
D-gulo-heksoza
D-ido-heksoza
D-manno-heksoza
D-talo-heksoza
Ketozy acuchowe
D-glicero-2-tetruloza
D-erytro-2-pentuloza
D-treo-2-pentuloza
D-arabino-2-heksuloza
D-rybo-2-heksuloza
D-ksylo-2-heksuloza
D-likso-2-heksuloza
D-altro-2-heptuloza
Konfiguracja monosacharydw
Monosacharydy, jako zwizki optycznie czynne, wystpuj w dwch szeregach konfiguracyjnych D i L, ktre mona wyprowadzi z odpowiednich enancjomerw aldehydu glicerynowego. Aldehyd glicerynowy posiada jeden wgiel asymetryczny, dlatego jego dwa stereoizomery s enancjomerami, czyli antypodami
optycznymi. Enancjomery rni si konfiguracj, tj. przestrzennym rozmieszczeniem podstawnikw wok asymetrycznego atomu wgla, w ten sposb, e
jedna odmiana stanowi lustrzane odbicie drugiej i ich wzory strukturalne nie daj
si nasun na siebie. Obie czsteczki aldehydu nie maj paszczyzny symetrii, dlatego s czsteczkami chiralnymi. Konfiguracj monosacharydw acuchowych
mona przedstawi za pomoc wzorw rzutowych Fischera, tak jak je przedstawiono poniej dla aldehydu glicerynowego.
H
C O
H C OH
CH2OH
aldehyd D-(+)-glicerynowy
H
C O
HO C H
CH2OH
aldehyd L-(-)-glicerynowy
o waciwej konfiguracji. Spord wglowodanw, monocukry szeregu D s syntetyzowane, metabolizowane i magazynowane przez organizmy rolinne i zwierzce
z bardzo nielicznymi wyjtkami. Znaczenie biologiczne maj tylko D-mono-cukry.
Monosacharydy szeregu L nie s w stanie zastpi w organizmie swych odpowiednikw z szeregu D, poniewa L-cukry nie mog by substratami dla chiralnych enzymw. Dlatego L-monosacharydy praktycznie nie mog by wykorzystywane m.in. jako rdo energii. Syntetyczne cukry i ich pochodne, rwnie jako
skadniki lekw, produkowane na skal przemysow zwykle s mieszaninami racemicznymi. Mieszanina racemiczna (rwnomolowa ilo enancjomeru prawoi lewoskrtnego) cukru moe by wykorzystana przez organizm ywy tylko w 50%,
w odrnieniu od stuprocentowego wykorzystania cukrw pochodzenia biologicznego, izolowanych z organizmw ywych, np. z tkanek rolinnych.
W wiecie oywionym zdarzaj si w tym zakresie wyjtki, poniewa w niektrych organizmach mog si znajdowa pojedyncze monocukry nalece do szeregu L, penice lokalne funkcje swoiste. U ssakw popularne s dwa takie monosacharydy, mianowicie L-fukoza i L-iduronian. Oba nie istniej w stanie wolnym,
lecz s skadnikami oligosacharydw lub polisacharydw. Nie zdarza si, aby te
monosacharydy byy obecne w organizmie jednoczenie w formie D. Pojedyncze
roliny rwnie syntetyzuj niektre L-monocukry, mianowicie: L-arabinoz, L-glukoz, L-galaktoz, L-sorboz i L-ramnoz.
OH przy pitym atomie wgla (C-5) i grup karbonylow pierwszego atomu wgla (C-1) grupy aldehydowej, to powstaje szecioczonowy ukad cykliczny, ktry
ze wzgldu na podobiestwo do struktury piranu nazywany jest piercieniem piranozowym.
Nazw cukru w tej formie piercieniowej tworzy si przez dodanie do rdzenia nazwy piranoza (charakteryzujcej rodzaj piercienia cukrowego utworzonego przez mostek tlenowy) przedrostka, okrelajcego budow cukru i pochodzcego od jego nazwy zwyczajowej, np. gluko- dla glukozy. Z poczenia poszczeglnych czonw powstaje nazwa D-glukopiranoza. Form piranozow mog mie
heksozy i pentozy, natomiast tetrozy nie wystpuj w formie piranozowej.
137
Nazw cukru w tej formie piercieniowej tworzy si przez dodanie do rdzenia nazwy furanoza (charakteryzujcej rodzaj piercienia utworzonego przez
mostek tlenowy) przedrostka, okrelajcego budow cukru i pochodzcego od jego
nazwy zwyczajowej, np. gluko-. Z poczenia poszczeglnych czonw powstaje
nazwa D-glukofuranoza. W formie furanozowej mog istnie zarwno tetrozy,
pentozy, jak i heksozy.
W formie furanozowej konfiguracja grupy -CH(OH)CH2OH zaley wycznie od konfiguracji grupy OH przy czwartym atomie wgla. Jeli jest taka sama,
jak przy pitym atomie wgla w szeregu D-heksoz, to caa grupa -CH(OH)CH2OH
w furanozach bdzie nad powierzchni piercienia, tak jak w przedstawionej powyej D-glukofuranozie.
138
Jeli konfiguracja grupy -OH przy czwartym atomie wgla jest przeciwna
ni grupy OH przy pitym wglu w szeregu D-heksoz, wwczas caa grupa-CH(OH)CH2OH w furanozach bdzie znajdowaa si pod powierzchni piercienia, tak jak w przedstawionej poniej D-galaktofuranozie.
139
Jeli grupa karbonylowa, znajdujca si przy drugim atomie wgla acuchowej ketozy, np. fruktozy, reaguje z grup OH, znajdujc si przy szstym
atomie wgla, tworzc wewntrzczsteczkowy hemiketal, to powstaje szecioczonowy piercie piranozowy, tak jak w przedstawionej poniej D-fruktopiranozie.
Te struktury piercieniowe przewaaj w roztworach wolnej fruktozy.
140
Jeli grupa karbonylowa, znajdujca si przy drugim atomie wgla acuchowej ketozy, np. fruktozy, reaguje z grup OH, przy pitym atomie wgla, tworzc wewntrzczsteczkowy hemiketal, to powstaje picioczonowy piercie furanozowy, tak jak w przedstawionej poniej D-fruktofuranozie. W tej strukturze piercieniowej wystpuje wikszo pochodnych fruktozy.
Anomery
Podczas cyklizacji monosacharydw powstaje nowe centrum asymetrii, ktrym jest pacetalowy atom wgla, czyli C-1 w aldozach i C-2 w ketozach. Nowe
asymetryczne atomy wgla nazywane s anomerycznymi. Zjawisko anomerii dotyczy wszystkich cukrw piercieniowych, lecz nie form acuchowych. Monocukry
piercieniowe wystpuj w dwch dodatkowych postaciach izomerw przestrzennych, nazywanych anomerami. Rni si one pooeniem grupy OH przy anomerycznym atomie wgla oraz takimi wasnociami, jak temperatura topnienia
i skrcalno waciwa.
Anomer monocukru przedstawiony wzorem Hawortha oznacza ten izomer, w ktrym grupa OH przy anomerycznym atomie wgla znajduje si pod
141
Mutarotacja
Mutarotacja to zjawisko, majce miejsce krtko po rozpuszczeniu krystalicznego monosacharydu w wodzie, polegajce na przechodzeniu jednej formy
anomerycznej w drug za porednictwem formy acuchowej monocukru. Towarzyszy temu postpujca zmiana skrcalnoci waciwej roztworu (wzrost lub spadek), a do ustalenia si stanu rwnowagi, w ktrej skrcalno waciwa przyjmie
ju sta warto. Mutarotacja jest podstawowym dowodem piercieniowej budowy
monosacharydw. Mona j obserwowa w wieo sporzdzonych roztworach,
poniewa oba anomery rni si skrcalnoci waciw.
142
zuje pewn gitko, dziki czemu moliwe s odchylenia od jego paskiej budowy. Sugeruje si, e odchylenia te s tak mae, e nie wpywaj istotnie na waciwoci zwizkw w ktrych piercienie cyklopentanu wystpuj. Dlatego czsto
przyjmuje si, e picioczonowym furanozom odpowiada niemal paska konformacja cyklopentanu.
H
O
CH2OH
OH
HOH 2C
H
HO
picioczonowa furanoza
HO
HO
5
4
OH
forma kopertowa
typu C3endo Drybozy
forma skrtu
2deoksy D
Drybozy
Najwaniejszymi konformacjami piercienia furanozowego, ktre s przykadami odchyle od paskiej struktury cyklopentanu, s forma kopertowa i skrtu.
Konformacje te s szczeglnie charakterystyczne dla rybozy i deoksyrybozy, obecnych w kwasach nukleinowych.
W konformacji kopertowej, nazwanej tak ze wzgldu na swj ksztat, przypominajcy otwart kopert z odchylon jedn ciank, a cztery atomy piercienia
le niemal w jednej paszczynie, jednak jeden atom piercienia jest odchylony od
tej paszczyzny o okoo 0.05 nm. Ponad paszczyzn piercienia moe znajdowa
si wgiel C-2 lub C-3, zawsze po tej samej stronie co wgiel pity, konformacje te
nazywane s odpowiednio: C2-endo lub C3-endo. W strukturze RNA -D-ryboza
wystpuje w formie C3-endo, natomiast w DNA -D-deoksyryboza ma konformacj C2-endo.
W konformacji skrtu trzy atomy piercienia znajduj si w jednej paszczynie, natomiast dwa pozostae znajduj si poza ni. Piercieniowe struktury
furanozowe mog ulega szybkim wzajemnym przeksztaceniom midzy rnymi
stanami konformacyjnymi.
Szecioczonowym piranozom odpowiada struktura cykloheksanu, ktry
moe mie konformacje krzesekow, dkow lub zdeformowanej odzi.
144
H
CH2 OH
HO
HO
H O
OH
H
H
OH
H
forma krzesekowa
D
-D-glukopiranozy
forma dkowa
piranozy
forma zdeformowanej
odzi
Te trzy monosacharydy maj identyczn konfiguracj przy asymetrycznych wglach C-3, C-4 i C-5. D-(+)-mannoza rni si tylko tym od D-(+)-glukozy, e ma
odwrotn konfiguracj przy asymetrycznym wglu C-2, czyli przy atomie wgla .
Dlatego te dwa monosacharydy s epimerami. Innymi epimerami wrd aldoheksoz rnicymi si jedynie konfiguracj przy atomie wgla s nastpujce pary
epimerycznych cukrw: D-(+)-alloza i D-(+)-altroza; D-(-)-guloza i D-(-)-idoza;
D-(+)-galaktoza i D-(+)-taloza.
Enolizacja monosacharydw w rodowisku zasadowym doprowadza do rwnowagi midzy aldozami i ketozami. Wzajemna przemiana monosacharydw przez
enolizacj moe mie miejsce w przypadku kadej pary epimerycznych aldoz i odpowiedniej ketozy. Monosacharydy spokrewnione ze sob przez wspln form
endiolow tworz ten sam osazon.
Epimerami s rwnie te pary diastereoizomerw, ktre rni si konfiguracj jedynie przy asymetrycznym wglu C-3, czyli przy atomie wgla lub jedynie przy asymetrycznym atomie wgla C-4, tzn. przy atomie wgla . Epimery te
tworz rne osazony. Przykadowo, wrd aldoheksoz epimerami rnicymi si
jedynie konfiguracj przy asymetrycznym wglu C-3 s D-(+)-altroza i D-(+)mannoza; D-(-)-guloza i D-(+)-galaktoza; D-(-)-idoza i D-(+)-taloza. Wrd aldoheksoz epimerami, ktre rni si jedynie konfiguracj przy asymetrycznym atomie
wgla C-4 s D-(+)-alloza i D-(-)-guloza; D-(+)-altroza i D-(-)-idoza; D-(+)-glukoza
i D-(+)-galaktoza; D-(+)-mannoza i D-(+)-taloza.
W organizmach ywych reakcje epimeryzacji cukrw katalizuj enzymy
zwane epimerazami, np. 4-epimeraza przeksztaca D-glukoz w D-galaktoz.
Powstawanie osazonw
Zasady organiczne, np. fenylohydrazyna, podobnie jak zasady nieorganiczne
(NaOH), powoduj otwarcie piercienia, czemu towarzyszy proces enolizacji monosacharydu. W procesie tworzenia osazonu uczestnicz trzy czsteczki fenylohydrazyny, z czego dwie bezporednio reaguj z grupami karbonylowymi, natomiast
jedna uczestniczy w utlenianiu wgla C-2 grupy hydroksylowej do grupy karbonylowej.
146
H
C
H
H2N
N
H 2N
CHOH
CHOH
(CHOH)3
(CHOH)3
CH2OH
CH2OH
H2O
aldoheksoza
NH
NH3
H
fenylohydrazon
N
H
anilina
H
C
H
N
H
H2N
NH
N
H
(CHOH)3
CH 2OH
C
H 2O
(CHOH)3
CH 2OH
osazon
Utlenienie monosacharydw
Aldozy utleniaj si rwnie atwo, jak inne aldehydy, dlatego prezentuj
wasnoci redukcyjne wobec innych zwizkw. Najatwiej utlenia si wgiel C-1
grupy aldehydowej do grupy karboksylowej, dlatego ju w agodnych warunkach
utleniajcych powstaj kwasy aldonowe, natomiast w bardziej utleniajcych warunkach, kwasy aldarowe. Utlenieniu moe ulec rwnie tylko jeden wgiel C-6
przy zachowaniu nie zmienionego wgla C-1 grupy aldehydowej. Dochodzi do tego wwczas, gdy grupa hydroksylowa przy wglu pacetalowym zaangaowana
jest w wizaniu estrowym, ktre uniemoliwia utlenienie grupy aldehydowej. Przykadem takich estrw aldoz mog by urydynodifosfoglukoza (UDP-D-Glc) lub
urydynodifosfogalaktoza (UDP-D-Gal). Wwczas produktami utlenienia 1-estrw
aldoz s kwasy alduronowe. Z nukleotydowej pochodnej glukozy powstaje kwas D-glukuronowy (GlcUA), a z pochodnej galaktozy powstaje kwas D-galakturonowy
(GalUA).
147
2NAD
CH 2OH
O
H
H
OH
OH
HO
2NADH+2H
COOH
H
H
OH
dehy drogenaza
O UDP UDP-glukozowa
D-glukoza
UDP D-
H
O
H
HO
H
UDP
OH
OH
D-glukuronowy
kwas -D
(GlcUA)
O
COOH
OH
H
HO
H
H
OH
OH
kwas -L-iduronowy
(IdUA)
Redukcja monosacharydw
agodna chemiczna redukcja monosacharydw, np. borowodorkiem sodu
przeksztaca je w alkohole polihydroksylowe, zwane alditolami. Nazwy alditoli
tworzy si dodajc do rdzenia nazwy itol, przedrostek nazwy zwyczajowej monosacharydu, z ktrego si wywodzi.
W organizmie ywym mog zachodzi podobne przemiany. Szczeglnie nasilona redukcja glukozy nastpuje podczas hiperglikemii, towarzyszcej cukrzycy.
Przemiany te s charakterystyczne dla komrek nerww obwodowych, w tym nerwu wzrokowego. Nagromadzony D-sorbitol powoduje pcznienie i uszkodzenie
komrek nerwowych. Natomiast w galaktozemii gromadzi si galaktitol, ktry
odkadajc si w soczewce oka moe przyczynia si do rozwoju zamy.
148
H
C O
H C OH
H C OH
H C OH
NaBH 4
CH2 OH
D
D-ryboza
H
C O
CH2 OH
H C OH
HO C H
H C OH
H C OH
NaBH 4
CH2 OH
H C OH
H C OH
H C OH
CH2 OH
D
D-rybitol
H
C O
H C OH
HO C H
H C OH
HO C H
H C OH
H C OH
HO C H
H C OH
CH 2 OH
CH2 OH
D
D-glukoza
D
D-sorbitol
CH2 OH
H C OH
HO C H
NaBH 4
CH2 OH
D
D-galaktoza
HO C H
H C OH
CH2 OH
D-galaktitol
D
Proces redukcji D-fruktozy prowadzi do powstania dwch alditoli, tj. D-sorbitolu i D-mannitolu.
149
D
D
D
O
HN
O
Warto doda, e D-glukozo-1-fosforan powstaje w wyniku fosforolizy glikogenu, reakcji katalizowanej przez fosforylaz glikogenow w wtrobie lub miniach, w ktrej nie jest wymagane bezporednie uczestnictwo ATP. Pochodne
monosacharydw, majce grup ortofosforanu podstawion przy C-1 nie ulegaj
mutarotacji i dlatego nie mog przeksztaca si z jednej formy anomerycznej
w drug. Estry fosforanowe s reaktywnymi formami monosacharydw w reakcjach katabolicznych, ktrych zasadniczym celem jest odzyskanie i zgromadzenie
w organizmie energii z substratw wglowodanowych. Fosfocukry s rwnie
reaktywnymi intermediatami w wielu reakcjach, tak jak np. aldehyd 3-fosfoglicerynowy.
Estry fosforanowe monosacharydw, z wyjtkiem pirofosforanowych pochodnych, nie s wystarczajco reaktywnymi substratami w reakcjach anabolicz150
nych, np. w syntezie polisacharydw. Dlatego estry fosforanowe s wykorzystywane w organizmie rwnie jako substraty do syntezy aktywnych donorw cukrw
dla reakcji anabolicznych i epimeryzacji. Takimi donorami s fosfonukleotydowe
pochodne cukrw, jak np. urydynodifosfoglukoza (UDP-Glc). W tabeli 2 zestawiono najbardziej typowe fosfonukleotydowe pochodne cukrw.
Tabela 2. Fosfonukleotydowe pochodne cukrw wykorzystywane jako
aktywne donory monosacharydw
Monocukry
D-galaktoza
UDP
Gal
N-acetylo-D-galaktozoamina
UDP
GalNac
N-acetylo-D-glukozoamina
UDP
GlcNAc
D-mannoza
D-glukoza
L-fukoza
Kwas sjalowy
GDP
UDP D
Man
Glc
Fuc
GDP
GDP L D
Fuc
CMP SA
Natomiast 5-fosforybozylo-1-pirofosforan, zawierajcy wizanie makroergiczne, jest wykorzystywany w syntezie nukleotydw purynowych i pirymidynowych. Specyficzn funkcj w rozpoznawaniu biologicznym spenia -D-mannozo6-fosforan, ktry nadaje pitno oligosacharydom enzymw lizosomalnych i jest
ligandem receptora fosfomannozowego.
Ufosforylowane monocukry w organizmie wystpuj w postaci dwuwartociowych anionw i s silniejszymi kwasami ni sam kwas fosforowy. Ten ujemny
adunek, dwigany przez fosfomonosacharydy, uniemoliwia im pokonanie bariery
dwuwarstwy lipidowej bon biologicznych. Tym samym estry fosforanowe s formami cukrw zatrzymywanymi we wntrzu komrki. Dlatego fosfomonocukier,
aby mg opuci komrk, musi wczeniej ulec defosforylacji katalizowanej przez
specyficzn fosfataz.
151
-O S O
CH 2OH
O
H
OH
OH
H
H
HNCOCH3
D
D N acetylogalaktozo
amino 4 0 siarczan
HO
OH
H
O
O
H
O SO3 H
H
H
HO
O
COOH
H
OH
D
Dglukurono
2 0 siarczan
OH
HO
OH
H
OH
H
H
OH
H
O
H
OH
OH
Dgalaktozo
D
D
galaktopiranoza
330siarczan
0 siarczan
COOH
H
CH 2OH
O
HO
D
D 2 Nsiarczan
glukozoaminy
O
O
L idurono
2 0 siarczan
Przedstawione estry siarczanowe monosacharydw s zazwyczaj skadnikami glikozoaminoglikanw, natomiast -D-galaktozo-3-O-siarczan znajduje si
w sulfolipidach. -D-N-Acetylogalaktozoamino-4-O-siarczan i -D-glukurono-2-O-siarczan lub -L-idurono-2-siarczan wystpuj w siarczanie dermatanu. Natomiast
zarwno -D-N-acetylogalaktozoamino4-O-siarczan, jak i -D-N-acetylo-galaktozoamino6-O-siarczan obecne s w siarczanie chondroityny. W siarczanie heparanu stwierdza si -D-N-siarczan glukozoaminy, ktry moe by dodatkowo O-siarczanowany w pozycji przy wglu C-3 i C-6. Taki trzykrotnie siarczanowany monocukier, zwany -D-N-siarczan-glukozoamino-3,6-O-disiarczanem, jest wanym
elementem pentasacharydowej sekwencji odpowiedzialnej za aktywno przeciwkrzepliw heparyny.
152
Deoksycukry
Cukry pozbawione grupy hydroksylowej nazywa si deoksycukrami. Do
najpopularniejszych naley 2-deoksy--D-rybofuranoza, obecna w kwasie deoksyrybonukleinowym (DNA).
H
O
HOCH 2
H
H
OH
OH
H
2-deoksy- D-rybofuranoza
H
CH3
H
OH
OH
H
HO
OH
6-deoksy- L-galaktopiranoza
L-fukoza (Fuc)
Innym, rwnie popularnym deoksycukrem jest -L-fukoza (Fuc), czyli 6-deoksy--L-galaktopiranoza. Zwizek ten jest terminalnym monocukrem w oligosacharydach obojtnych mucyn tchawiczo-oskrzelowych i przewodu pokarmowego
oraz w mucynach wykazujcych aktywno serologiczn ukadu AB0, a take
antygenw Lewis (Le) tj. Le(a), Le(b) i Le(x). Powszechne jest poza tym wystpowanie L-fukozy w rnych oligosacharydach innych glikoprotein, a take glikolipidw.
Aminocukry
Aminocukry s pochodnymi monocukrw, w ktrych grupa hydroksylowa
w pozycji 2 zastpiona jest przez grup aminow. Powstaj one w reakcji transaminacji, w ktrej donorem grupy aminowej jest glutamina, a jej akceptorem jest
heksozo-6-fosforan, np. fruktozo-6-fosforan. Reakcj, w wyniku ktrej powstaje
np. glukozoamina i kwas glutaminowy katalizuje specyficzna aminotransferaza
heksozofosforanowa.
Wikszo aminocukrw wykrywanych w organizmach ywych zazwyczaj
jest acetylowana. W reakcji acetylacji aminocukrw aktywnym donorem grup acetylowych jest acetylo-CoA. W organizmie ssakw w formie nieacetylowanej wystpuje -D-glukozoamina (GlcN), czyli 2-deoksy-2-amino--D-glukopiranoza, np.
w heparynie. Natomiast -D-N-acetyloglukozoamina (GlcNAc) i -D-N-acetylogalaktozoamina (GalNAc) s bardzo popularnymi pochodnymi monocukrw obecnymi w rnorodnych oligosacharydach glikoprotein rozpuszczalnych, bonowych
i macierzy pozakomrkowej oraz w glikozoaminoglikanach.
Powtarzajcym si wielokrotnie monocukrem w chitynie, bdcym polisacharydem budujcym pancerzyki stawonogw jest -D-N-acetyloglukozoamina.
153
CH2OH
H
HO
CH 2OH
O
H
OH
NH2
OH
D-glukozoamina
(GlcN)
HO
NH2
HO
OH
H N C O
H
OH
H
D-N-acetyloglukozoamina
(GlcNAc)
H
H
HO CH
D-N-acetylogalaktozoamina
(GalNAc)
H
OH
COO
HO CH
CH 2OH
kwas N-acetyloneuraminowy
(NANA lub SA)
H
O
CH 2 C N
OH
OH
CH 3
H 3C C N
OH
H N C O
CH3
CH 2OH
O
H
OH
OH
H
OH
D-galaktozoamina
(GalN)
CH 2OH
H
HO
H
H
HO CH
OH
COO
OH
HO CH
CH 2OH
kwas N-glikolyloneuraminowy
(NGNA lub SA)
Kwas N-acetyloneuraminowy (NANA lub SA) i kwas N-glikolyloneuraminowy (NGNA lub SA) zawieraj w swym skadzie pochodn mannozoaminy,
ktra jest acetylowana albo glikolylowana. W kwasach tych znajduje si te reszta
trjwglowa, dlatego zwizki te s dziewiciowglowymi pochodnymi cukrowymi.
NANA i NGNA s najbardziej popularnymi kwasami sjalowymi (SA) obecnymi
w oligosacharydach glikoprotein i glikolipidw ssakw. Kwasy sjalowe zwykle
znajduj si na nieredukujcym kocu oligosacharydw, s nonikami ujemnych
adunkw i nadaj kwany charakter wszystkim oligosacharydom, w ktrych wystpuj. Terminalne reszty kwasw sjalowych w oligosacharydach mog poredniczy w interakcji wirusw z ludzkimi komrkami. Kwas sjalowy w glikoforynie
z powierzchni erytrocytw jest determinant cukrow receptora dla hemaglutyniny
otoczki wirusw grypy. Ich wzajemna interakcja moe prowadzi do aglutynacji
krwinek czerwonych.
154
GLIKOZYDY
W piercieniowych monosacharydach grupa hydroksylowa przy wglu hemiacetalowym, zwana grup glikozydow, jest bardziej reaktywna od pozostaych
grup hydroksylowych. Podobnie jak inne pacetale reaguje, w reakcjach katalizowanych kwasami, z grup hydroksylow alkoholi i fenoli, tworzc acetale, zwane
glikozydami.
Wytworzone wizanie nazywa si wizaniem glikozydowym, natomiast niecukrowy skadnik jest aglikonem. Glikozydowa grupa OH cukru zalenie od pozycji w jakiej si znajduje ( lub ), decyduje o rodzaju anomerii utworzonego
wizania glikozydowego. Std rozrniamy -glikozydy i -glikozydy. W reakcji
tworzenia wizania glikozydowego, czyli glikozylacji, wydziela si czsteczka
wody, a oba skadniki wi si poprzez tlen. Powstaje wwczas O-glikozyd, natomiast wizanie nazywa si wizaniem O-glikozydowym. Inne glikozydy powstaj z poczenia hydroksylowej grupy glikozydowej monocukru z grup iminow
(-NH) lub sulfhydrylow (SH) aglikonu. W zwizkach tych oba skadniki poczone s odpowiednio wizaniami N-glikozydowym i S-glikozydowym. S to tak
zwane N-glikozydy i S-glikozydy.
Nazw glikozydu tworzy si z poczenia nazw aglikonu i nazwy monocukru, jednak w tej ostatniej zamienia si kocwk -oza na -zyd. Kocwka
zyd pozwala odrni glikozydy z wizaniem acetalowym, od aldoz z wizaniem pacetalowym. Na przykad w wyniku dziaania metanolu na -D-glukoz
powstaje metylo--D-glukopiranozyd.
Glikozydy, cho podobnie jak monocukry wystpuj w formach i , nie
wykazuj jednak mutarotacji. Wrd nich jedne s odporne, inne wraliwe na dzia-
155
H
HO
COOH
H
OH
H
H
H
COOH
OH
HO
H
OH
H
H
OH
glukuronid pregnandiolu
(pregnandiolo--D-glukuronopiranozyd)
156
O
OH
CH3
CH3
OH
HO
17
CH2
cukry O
OH
14
OH
cukry O
17
H3C
14
OH
H
digitoksygenina
strofantyna G
(ouabaina)
glikozydy kardiotoniczne
OLIGOSACHARYDY
Monocukry mog reagowa z dowolnymi alkoholami, wrd nich rwnie
z monosacharydami. Dwa cukry poczone wizaniem glikozydowym tworz disacharyd, trzy cukry trisacharyd itd., kolejne oligosacharydy oraz polisacharydy.
Wasnoci disacharydw zale nie tylko od rodzaju wchodzcych w ich skad
monocukrw, lecz take od rodzaju wytworzonego wizania glikozydowego w zakresie pozycji i konfiguracji (, ). Poczenie tylko dwch czsteczek D-glukozy
moe dostarczy a 11 rnych disacharydw. Tak wielk rnorodno charakterystyczn dla wglowodanw rzadko spotyka si wrd innych zwizkw,
przykadowo z poczenia dwch czsteczek alaniny moliwy jest tylko jeden dipeptyd Ala-Ala.
HOCH 2
H
HO
CH 2OH
O
H
OH
OH
H
1
H
1
O
H
H
H
HO
OH
OH
trehaloza
(D-glukopiranozylo-(1
D
D
1)-D-glukopiranozyd)
HOCH 2
O
H
HO
H
OH
OH
HOCH 2
2
O
H
OH
H
HO
CH 2OH
sacharoza
D
(D-glukopiranozylo-(1
D
2)-D-fruktofuranozyd)
158
koniec nieredukujcy
koniec redukujcy
HOCH 2
O
H
HOCH2
HO
HOCH 2
O
H
H
OH
H
H
1
H
OH
4
O
OH
HO
H
OH
OH
OH
HO
maltoza
(D -glukopiranozylo-(1
CH 2
OH
4)-D -glukopiranoza)
H
OH
OH
H
OH
izomaltoza
(D -glukopiranozylo-(1
HOCH 2
HOCH 2
O
HO
H
OH
OH
HOCH 2
O
H
O
H
H
OH
OH
H
OH
laktoza
(D -galaktopiranozylo-(1
6)-D -glukopiranoza)
4)-D -glukopiranoza)
HO
CH 2OH
O
H
H
OH
OH
H
O
H
H
OH
OH
OH
H
celobioza
(D-glukopiranozylo-(1
4)-D-glukopiranaza)
Laktoza jest obecnym w mleku disacharydem, o sodyczy okoo piciokrotnie mniejszej od sacharozy. W jelicie cienkim czowieka laktoza rozkadana jest
przez specyficzn -galaktozydaz (laktaz). Brak tego enzymu lub obniona jego
aktywno wywouje nietolerancj na laktoz.
Maltoza i izomaltoza kady z tych disacharydw zbudowany jest z dwch
czsteczek -D-glukozy, rni si jedynie pozycj wizania -glikozydowego.
Nie wystpuj w stanie wolnym, lecz s produktami degradacji skrobi, pojawiajcymi si w przewodzie pokarmowym zwierzt i czowieka, dziki dziaalnoci
amylaz, ktre s typowymi -glikozydazami. Maltoz rozkada maltaza, czyli -1,4-glukozydaza. Izomaltoz rozkada izomaltaza, czyli -1,6-glukozydaza.
Celobioza jest zbudowana z dwch czsteczek -D-glukozy poczonych ze
sob wizaniem -1,4-glikozydowym. Nie wystpuje w stanie wolnym, lecz jest
produktem degradacji celulozy. Pojawia si w przedodkach zwierzt przeuwajcych, dziki dziaalnoci celulaz, ktre s typowymi -glikozydazami, produkowanymi przez mikroflor bakteryjn yjc u tych zwierzt. Celobioz rozkada na
dwie czsteczki glukozy -1,4-D-glukozydaza bakteryjna, ktra czasem nazywana
jest celobiaz, lecz nazwy tej nie zaleca si.
159
OLIGOSACHARYDY GLIKOPROTEIN
Oligosacharydy obecne w glikoproteinach s poczone z biakiem wizaniem O- lub N-glikozydowym. Wizaniem O-glikozydowym alkalilabilnym jest to,
w ktrym uczestniczy reszta -D-GalNAc i grupa hydroksylowa reszty seryny lub
treoniny ze strony biakowego aglikonu. Glikoproteiny zawierajce ten typ wizania glikozydowego to przede wszystkim mucyny. Wizaniem O-glikozydowym,
ulegajcym rozszczepieniu pod wpywem sabych zasad, jest rwnie wizanie
pomidzy -D-ksyloz a grup hydroksylow seryny lub treoniny. Glikoproteiny
zawierajce ten typ wizania glikozydowego nale do proteoglikanw. Wizanie
glikozydowe alkalistabilne midzy reszt -D-Gal a reszt hydroksylizyny jest
charakterystyczne dla kolagenu. Alkalistabilne jest rwnie wizanie N-glikozydowe midzy -D-GlcNAc a atomem azotu grupy aminowej asparaginy acucha
polipeptydowego. Stanowi ono bardzo popularne wizaniem glikozydowe, obecne
w rozpuszczalnych glikoproteinach typu surowiczego.
Tabela 3. Rodzaje wiza glikozydowych w glikoproteinach
Wizania O-glikozydowe
Wizanie N-glikozydowe
CH2OH
O
HO
H
OH
H
H
C O
CH 3
NH
CH
CO
Ser/Thr
H
HO
OH
OH
NH
CH
CH 2
HO
H
O
H
OH
CH 2
H
H
CH
CH
OH
NH CO
Hyl
160
O
O
H
OH
NH
C
C
HO
H H
Ser/Thr
CH 2OH
CH 2OH
H
H
C O
CH
H 2 CO
Asn
CH 3
Chemiczne odszczepianie N-glikanw przeprowadza si metod hydrazynolizy, ktrej produktami s wolne oligosacharydy pomniejszone o reszt GlcNAc
oraz GlcNAc-Asn-polipeptyd. Natomiast selektywne odszczepienie O-glikanw
(z wyjtkiem alkalistabilnych) przeprowadza si drog -eliminacji alkalicznym
roztworem borowodorku sodu. Powstajcy w tej reakcji alditol moe by dalej
badany po hydrolizie kwanej. Reakcja -eliminacji moe by uyteczna do rnicowania O-glikanw od N-glikanw.
Ser/Thr
W niektrych O-glikanach sekwencja rdzenna moe by niekompletna, zastpuje j wwczas pojedyncza reszta -GalNAc zwizana z biakiem. Podstawowa sekwencja rdzenna w rnych O-oligosacharydach mucyn moe by podsta161
GlcUA
1,3
Gal
1,3
Gal
1,4
Xyl
Ser/Thr
SEKWENCJA RDZENNA
Man
1,6
Man
Man
1,4
GlcNAc
1,4
GlcNAc
1,3
SEKWENCJA RDZENNA
162
Asn
6
Man
4
GlcNAc
4
GlcNAc
Asn
6
Man
4
GlcNAc
4
GlcNAc
Asn
SA
3
SA
3
Gal
4
GlcNAc
2
Gal
4
GlcNAc
2
Man
Man
6
Man
4
GlcNAc
4
GlcNAc
Asn
Fuc
SO4
SO4
GalNAc GalNAc
4
4
GlcNAc GlcNAc
2
2
Man
Man
6
3
Man
4
GlcNAc
4
GlcNAc
Asn
164
0 (H)
Gal1 4GlcNAc R
2
Fuc1
SA
6
Fuc1
SA
6
Fuc1
Gal 1 3GlcNAc R
4
Le
Fuc1
Le
Gal13GlcNAc R
2
Fuc1
Le
Fuc1
Gal14GlcNAc R
3
Fuc1
Determinanty sjalo-Le(x), czyli SA2,3Gal1,4(Fuc1,3)GlcNAc-, s gwnymi ligandami dla rdbonkowych selektyn-E (lektynowych receptorw adhezyjnych CD62E), ktre porednicz w diapedezie leukocytw do miejsc objtych
stanem zapalnym. Lektyny s to biaka, ktre specyficznie rozpoznaj sekwencje
cukrowe w ligandzie, poprzez ktre mog oddziaywa i tworzy kompleks lektyna-ligand.
165
POLISACHARYDY
Polisacharydy klasyfikuje si na jednoskadnikowe, czyli homoglikany, oraz
rnoskadnikowe, czyli heteroglikany. Podzia polisacharydw ze wzgldu na penion funkcj rnicuje je na polisacharydy zapasowe, czyli wewntrzkomrkowe,
oraz strukturalne, czyli pozakomrkowe, ktre peni rol budulcow. Ze wzgldu
na ich pochodzenie mona polisacharydy podzieli na rolinne oraz zwierzce.
HOMOGLIKANY
Skrobia to polisacharyd zapasowy u wikszoci rolin i podstawowy wglowodanowy skadnik odywczy dla czowieka. Jest ona homoglikanem zbudowanym z wielokrotnie powtarzajcych si reszt -D-glukopiranozylowych, dlatego
naley do glukanw. Struktur skrobi tworz dwa glukany, mianowicie amyloza
i amylopektyna, ktre wystpuj w rnych stosunkach ilociowych, zalenie od
pochodzenia. Przecitnie amyloza stanowi 1525%, a amylopektyna 7585%, zdarza si jednak i tak, e skad ten jest zupenie odmienny, tak jak np. w grochu,
gdzie amyloza stanowi a 75% skrobi.
Amyloza to polisacharyd nierozgaziony, liniowy, w ktrym kilkaset reszt
-D-Glc powizanych jest wizaniami -1,4-glikozydowymi. Pod wpywem dziaania gorcej wody na skrobi, amyloza rozpuszcza si. Nierozpuszczaln pozostao (lepki kleik) stanowi amylopektyna. Amyloz mona oddzieli od amylopektyny (z ciepej zawiesiny skrobi w wodzie) przez wytrcanie butanolem lub fenolami, z ktrymi tworzy krysztay, po ozibieniu.
amyloza
166
amylopektyna
Przecitnie na 2530 wiza -1,4-glikozydowych przypada 1 wizanie -1,6-glikozydowe, natomiast cakowita liczba reszt glukozowych moe mieci si
w szerokich granicach od 6000 do 1 000 000. Dlatego na jedn czsteczk amylopektyny przypada dua liczba nieredukujcych kocw, przy praktycznie jednym
kocu redukujcym. Liczne rozgazienia sprawiaj, e amylopektyna w przestrzeni przybiera ksztat sferyczny, przypominajcy nieuporzdkowany kbek, w ktrym jedynie zewntrzne, liniowe acuchy zwijaj si helikalnie.
O
HOCH2
H
HO
OH
H
O
HOCH2
H
H
O
HOCH2
H
OH
CH 2
HO
OH
HOCH2
CH 2
HO
OH
HOCH2
CH 2
HO
OH
CH 2
O
HO
H
CH 2
O
Inulina jest nierozgazionym polisacharydem zapasowym, wystpujcym u niektrych rolin: traw, zoonych
i liliowatych. Wystpuje w bulwach i korzeniach topinambura, karczochw, mniszka i w korzeniach cykorii. Zbudowana jest z 3035 reszt -D-fruktofuranozy poczonych
wizaniami -2-1-glikozydowymi i pojedynczej reszty -D-glukopiranozy na nieredukujcym kocu kadego acucha, ktra poczona jest z przedostatni reszt fruktozy
wizaniem -1-2-glikozydowym (podobnie, jak w sacharozie). Inulina naley do rozpuszczalnych polisacharydw
i nie zabarwia si z jodem. Ma zastosowanie w diagnostyce
laboratoryjnej do oznaczania objtoci pynu pozakomrkowego, jako substancja rozcieczajca si w wodzie osocza i pynu rdmiszowego.
Glikogen jest pospolitym polisacharydem zapasowym w organizmach zwierzcych. Jego najwiksze stenie znajduje si w wtrobie, poniewa stanowi on magazyn
glukozy dla caego organizmu. W innych tkankach zawarto glikogenu koreluje z typem ich oddychania. Duo glikogenu wystpuje w tych, ktre charakteryzuj si znaczn
intensywnoci oddychania beztlenowego, np. w miniach
szkieletowych.
nizmie 1 g cukru dostarcza okoo 17 kJ energii. Podczas godzenia zapasy wglowodanw w organizmie wyczerpuj si w cigu 1 doby normalnej aktywnoci, ale
zawarto glukozy we krwi utrzymywana jest powyej 2,2 mM, czyli 40 mg/dl.
Jest to konieczne, poniewa mzg nie toleruje niskiego stenia glukozy, nawet
przez krtki okres. Glikogen, podobnie jak inne wglowodany, ma wyranie polarny charakter, dziki czemu cechuje si znacznym uwodnieniem. Przecitnie 1 g suchego glikogenu wie 2 g wody. Dlatego, gdyby czowiek gromadzi go w ilociach odpowiadajcych energii zawartej w tuszczach zapasowych, musiaby way prawie 30 kg wicej.
Glikogen jest homoglikanem nalecym do glukanw. Strukturalnie przypomina amylopektyn, lecz jest bardziej rozgaziony, poniewa przecitnie na 8
12 reszt -D-glukopiranozylowych poczonych wizaniami -1,4-glikozydowymi
przypada 1 wizanie -1,6-glikozydowe.
glikogen
Masa czsteczkowa glikogenu wtrobowego jest rzdu 3 miliardw, a glikogenu miniowego rzdu kilku milionw. Dua gsto rozgazie czsteczki
glikogenu przyczynia si do zwikszenia jego rozpuszczalnoci oraz dostarcza
olbrzymiej liczby kocw nieredukujcych, ktre s miejscami dziaania specyficznego enzymu (fosforylazy), katalizujcego fosforoliz glikogenu. Fosforylaza
glikogenowa odcina od nieredukujcego koca glikogenu pojedyncz reszt glukozylow i przenosi j na nieorganiczny ortofosforan, tworzc glukozo-1-fosforan.
W ten sposb moe skraca tylko proste acuchy, a do miejsca oddalonego od
rozgazienia o 4 reszty glukozy. Kolejne wizania nie s ju podatne na dziaanie
fosforylazy. Dlatego na te miejsca dziaa inny enzym, mianowicie -1,4-1,4-transferaza glukanowa (transglukozydaza), ktry odsaniajc wizanie -1,6-glikozydowe przenosi fragment trisacharydowy z tego rozgazienia na inne (dusze), ktre wydua. Hydroliz odsonitego wizania moe przeprowadzi amylo-
168
-1,6-glukozydaza, , ktra poprzez zniwelowanie rozgazienia umoliwia wznowienie dziaania fosforylazy glikogenowej.
Celuloza jest -1,4-glukanem, ktrego nierozgazione, liniowe czsteczki
zbudowane s z 20015 000 reszt -D-glukopiranozylowych, poczonych wizaniami -1,4-glikozydowymi. Liniowe acuchy celulozy, w ktrych ssiadujce ze
sob reszty glukozy obrcone s w stosunku do siebie o 180o, dodatkowo s stabilizowane wizaniami wodorowymi, tworzonymi midzy tlenem wizania pacetalowego a grup hydroksylow w pozycji C-3 nastpnej reszty cukrowej. Celuloza
tworzy struktury nadczsteczkowe. Rwnolegle uoone pojedyncze acuchy celulozy o jednakowej polarnoci s cile zwizane ze sob, dziki midzyacuchowym wizaniom wodorowym, i stanowi wkna elementarne, czce si w
micele, ktre asocjuj w mikrofibryle, a te w fibryle celulozowe.
Struktura celulozy sprawia, e jest wytrzymaa mechanicznie i bardzo odporna na dziaanie czynnikw chemicznych. Nie rozpuszcza si w wodzie i rozpuszczalnikach organicznych. W wodzie natomiast pcznieje, gdy charakteryzuje
si du higroskopijnoci. Stanowi gwny skadnik budulcowy wszystkich cian
komrkowych i wkien wzmacniajcych u rolin, np. we wknach baweny jest
jej okoo 98%.
Celuloza stanowi okoo 50% wszystkich zwizkw organicznych na Ziemi,
dlatego jest najwikszym rezerwuarem glukozy. Gdyby glukoza ta moga by
w peni wykorzystana przez czowieka przestaby istnie problem godu. Niestety,
jest to glukoza konfiguracji , a wikszo organizmw, w tym czowiek i zwierzta wysze, nie wytwarza enzymw zdolnych do hydrolizy -glukanw.
Enzymy hydrolizujce celuloz (celulazy) wytwarzaj mikroorganizmy yjce w przedodkach przeuwaczy, jelicie grubym zwierzt rolinoernych (ko),
w mniejszym stopniu wszystkoernych (trzoda chlewna). Celulaz wytwarzaj
rwnie bakterie yjce w jelicie lepym ptakw (kury, kaczki), dlatego zwierzta
te zdolne s strawi okoo 15% celulozy. Najdoskonalszymi zjadaczami celulozy
s termity. Celulaza hydrolizuje co drugie wizanie -1,4-glikozydowe, od koca
nieredukujcego acucha celulozy, uwalniajc disacharyd celobioz.
Dla organizmu ludzkiego obecno nietrawionej celulozy w pokarmie ma
istotne znaczenie biologiczne, gdy peni ona rol naturalnego wypeniacza jelita, podtrzymujcego i pobudzajcego ich perystaltyk. Przyjmowanie pokarmu
169
pozbawionego celulozy ley u podstaw zbyt wolnego przechodzenia treci pokarmowej przez jelito i jej nadmiernego odwodnienia.
Pektyny s polisacharydami wystpujcymi u rolin w cianie komrkowej
oraz tworzcymi struktur blaszki rodkowej, czyli lepiszcza midzykomrkowego. Roztwory pektyn atwo tworz ele. Zjawisko to wykorzystywane jest podczas
przygotowywania galaretek owocowych. W polimerach tych powtarzajcym si
elementem jest 6-metyloester kwasu D-galakturonowego, ktrego czsteczki poczone s wizaniem -1,4-glikozydowym. Wzdu acucha tego polisacharydu
nie kada czsteczka kwasu galakturonowego jest metylowana.
Chityna to polisacharyd strukturalny (u bezkrgowcw), ktry buduje szkielet zewntrzny skorupiakw i owadw. Wystpuje rwnie u grzybw, jako skadnik cian komrkowych. Chityna jest polimerem N-acetylo-D-glukozoaminy, w
ktrym pojedyncze reszty cukrowe poczone s wizaniami -1,4-glikozydowymi.
chityna
HETEROGLIKANY
Glikozoaminoglikany (mukopolisacharydy) s polisacharydami strukturalnymi u zwierzt wyszych. Wystpuj w substancji midzykomrkowej, najobficiej w tkance cznej oraz jako skadniki bon podstawnych. S rwnie skadnikami luzw i osonek, np. komrki jajowej. Wszystkie, z wyjtkiem kwasu hialuronowego, poczone s kowalencyjnie z biakiem, przynajmniej na etapie biosyntezy.
Glikozoaminoglikany cz si z biakiem poprzez specyficzn sekwencj
rdzenn zawierajc ksyloz, oprcz siarczanw keratanu. Wszystkie glikozoaminoglikany, z wyjtkiem kwasu hialuronowego, s siarczanowane i wystpuj jako
O- i N-estry siarczanowe. Grupy siarczanowe s nonikami ujemnego adunku,
a poniewa powtarzaj si wielokrotnie nadaj charakter polianionowy acuchom
glikozoaminoglikanw. Poza tym, wasnoci kwasowe wikszoci glikozoaminoglikanw wynikaj z obecnoci reszt kwasw heksuronowych: kwasu -D-glukuronowego i jego epimeru kwasu -L-iduronowego, z wyjtkiem siarczanw keratanu.
Glikozoaminoglikany s liniowymi, dugoacuchowymi polimerami utworzonymi z wielokrotnie powtarzajcych si disacharydowych elementw, zazwyczaj utworzonych z kwasu heksuronowego i heksozoaminy. Poniewa we wszy170
CH2OH
-O S
3
COO
O
O
O
COO
OH
O
HNCOCH3
O
O
OH
DGalNAc
OH
DGlcUA
OH
DGlcUA
n
4-siarczan chondroityny
O
SO3
CH 2
COO
O
HO
O
O
COO
OH
OH
O
HNCOCH 3
OH
DGlcUA
DGalNAc
H
OH
DGlcUA
n
6-siarczan chondroityny
-
CH2OH
-O S
3
COO
O
OH
O
O
HNCOCH3
COO
OH
OH
DGlcUA
DGalNAc
O
LldUA
SO3
n
siarczan dermatanu
171
Siarczan dermatanu powstaje z 4-siarczanu chondroityny w wyniku C-5-epimeryzacji wikszoci (powyej 10%, a do 90%) reszt kwasu -D-glukuronowego do kwasu -L-iduronowego. W disacharydowych elementach galaktozoaminoglikanw kwas -D-glukuronowy poczony jest z N-acetylogalaktozoamin
wizaniem -1,3-glikozydowym, natomiast kwas -L-iduronowy czy si z GalNAc
wizaniem -1,3-glikozydowym. Te disacharydowe elementy poczone s midzy
sob zawsze wizaniami -1,4-glikozydowymi. Specyficzna sekwencja heksasacharydowa siarczanu dermatanu wykazuje waciwoci antykoagulacyjne, wynikajce z aktywowania heparynowego kofaktora II, nalecego do serpin (serpiny to
inhibitory proteinaz serynowych).
CH 2OH
O
O
CH 2OH
-
O3SO
O3SO
O
O
COO
OH
O
O
CH 2OH
O
HNCOCH 3
COO
OH
O
HNCOCH 3
COOOH
O
HNCOCH3
OSO3-
OSO3-
OSO3-
Galaktozoaminoglikany s rozkadane przez specyficzne liazy, zwane chondroitynazami. 4-Siarczan chondroityny jest degradowany przez chondroitynaz A,
6-siarczan chondroityny rozkada chondroitynaza C, natomiast siarczan dermatanu
hydrolizuje chondroitynaza B.
Glukozoaminoglikanami s: siarczan heparanu, heparyna, siarczan keratanu i kwas hialuronowy.
Siarczany heparanu i heparyna s blisko spokrewnionymi glikozoaminoglikanami. Wszystkie komrki mog syntetyzowa siarczany heparanu, natomiast
heparyn syntetyzuj i magazynuj gwnie komrki tuczne i bazofile. Siarczany
heparanu w poczeniu z biakami s skadnikami bon plazmatycznych, podstawnych, macierzy pozakomrkowej i wewntrzkomrkowej. Wykazano rwnie
obecno siarczanw heparanu w jdrze komrkowym. Glikozoaminoglikany
wpywaj na procesy adhezji, proliferacji i rnicowania komrek.
Niezmodyfikowany disacharydowy element siarczanu heparanu utworzony
jest z kwasu -D-glukuronowego i -N-acetyloglukozoaminy, ktre poczone s
wizaniem -1,4-glikozydowym.
172
COO
O
COO-
CH 2OH
O
O
O
OH
O
OH
O
OH
OH
D GlcUA
OH
HNCOCH 3
DGlcNAc
DGlcUA
n
niesiarczanowany heparan
COO
O
COO-
CH 2OH
O
O
O
OH
O
OH
O
OH
OH
DGlcUA
OH
DGlcUA
HN SO-3
DGlcN
siarczan heparanu
Disacharydowe elementy cz si midzy sob zawsze wizaniami -1,4-glikozydowymi. W dugich, liniowych acuchach siarczanw heparanu, poza niezmodyfikowanymi disacharydami, s obecne elementy disacharydowe zmodyfikowane w rnym stopniu. Modyfikacj charakterystyczn dla disacharydw siarczanw heparanu jest N-deacetylacja, poczona z nastpczym N-siarczanowaniem. Dlatego w siarczanie heparanu wystpuje N-siarczan glukozoaminy, ktry
czasami moe by rwnie O-siarczanowany przy atomie C-6.
Heparyna to pochodna siarczanu heparanu, gdy powstaje skutkiem kolejnych jego modyfikacji. Modyfikacj najbardziej charakterystyczn dla heparyny
jest C-5 epimeryzacja kwasu D-glukuronowego do kwasu L-iduronowego, nastpujca tylko po N-siarczanowaniu glukozoaminy. Heparyna jest bardziej siarczanowana od siarczanu heparanu. Grupy siarczanowe mog by zwizane O-estrowo
przy atomach C-3 i C-6 N-sulfoglukozoaminy oraz przy atomie C-2 kwasu L-iduronowego.
Dugie acuchy siarczanw heparanu i heparyny nie s jednolite pod wzgldem sekwencji, zwykle nieregularnie przeplataj si fragmenty bogate w GlcNAc
z fragmentami bogatymi w N-siarczanowan glukozoamin.
173
O
COOOH
H 2C O SO3O
COOOH
O SO3-
OH
LldUA
SO3-
HN SO3-
LldUA
DGlcN
heparyna
O
COO-
COOOH
H 2C O SO3O
O
O
OH
O SO3-
OH
LldUA
OH
HN SO3-
DGlcN
DGlcUA
n
heparyna
Heparyna i siarczany heparanu maj dziaanie antykoagulacyjne, ktre realizuj poprzez specyficzn pentasacharydow sekwencj wic antytrombin III.
-
CH2OSO3-
OH
O
O
O
O
OH
HNR ``
CH 2OSO3O
CH2OR
COO
OSO3-
COO
OH
OH
R``
SO-3 lub
lub
HNSO3
R`
OSO3
OH
HNSO3
SO-3
COCH3
174
OH
H 2C O SO3O
HO
H 2C O SO3-
OH
DGal
DGal
O
O
OH
HNCOCH 3
DGlcNAc
siarczan keratanu
175
kowalencyjnie z biakiem. W chrzstce kwas hialuronowy moe oddziaywa niekowalencynie z wieloma rnymi biakami proteoglikanw, tworzc wielkocz-
CH 2OH
COO
O
O
O
OH
HO
O
COO
OH
HNCOCH3
DGlcUA
DGlcNAc
OH
OH
DGlcUA
n
kwas hialuronowy
176
11.
KWASY TUSZCZOWE
I IKOZANOIDY
Iwona ak, Izabela Szotysek-Bodys
Kwasy tuszczowe peni funkcj strukturalno-budulcow w bonach biologicznych jako skadniki fosfolipidw i glikolipidw. Peni funkcj zapasow jako
skadniki obojtnych triacylogliceroli gromadzonych w adipocytach tkanki tuszczowej u zwierzt. Kwasy tuszczowe uczestnicz w kowalencyjnej modyfikacji
biaek, szczeglnie kwas mirystynowy i palmitynowy. W zmodyfikowanych biakach kwasy tuszczowe mog peni rol hydrofobowej kotwicy, ktra umiejscawia
biako we waciwym pooeniu w bonie. Funkcj materiau energetycznego peni wolne kwasy tuszczowe (WTK) uwalniane z triacylogliceroli. Wolne kwasy
tuszczowe w poczeniu z albuminami osocza kr wraz z krwi po caym organizmie, docierajc do komrek wikszoci tkanek i narzdw, w tym do minia
sercowego. Pochodne dwudziestowglowych kwasw tuszczowych peni funkcj
hormonw tkankowych o krtkim okresie ptrwania.
Nazewnictwo
Kwasy tuszczowe maj nazwy systematyczne, jednak nadal powszechnie
uywane s rwnie nazwy zwyczajowe (tab. 13). Nazw systematyczn tworzy
si od nazwy wyjciowego wglowodoru, do ktrej dodaje si okrelenie kwas i kocwk owy. Dziki temu kwasy nasycone maj kocwk anowy np. kwas oktadekanowy, natomiast kwasy nienasycone z wizaniami podwjnymi maj kocwk enowy, np. kwas oktadekenowy.
Nazwy form anionowych soli lub estrw tworzy si od nazwy wyjciowego
wglowodoru, do ktrej dodaje si kocwk ian, np. oktadekanian. Oglny termin acyl oznacza reszt pozbawion grupy OH z funkcyjnej grupy kwasowej
dowolnego kwasu tuszczowego.
177
178
H H
16
15
H C C
H H
14
O
1
2
13 12
11 10
9
8
7
6
5
4
3
C C C C C C C C C C C C C C
O
H H H H H H H H H H H H H
Powszechnie uywa si wzorw skondensowanych i kreskowych. We wzorach kreskowych pomija si symbole atomw wgla i wodoru, ktre umownie
znajduj si w punktach czenia si poszczeglnych odcinkw linii amanych
przedstawiajcych szkielet wglowy.
Kwasy tuszczowe krtkoacuchowe i rednioacuchowy kwas kaprylowy
s substancjami pynnymi w temperaturze pokojowej, rozpuszczalnymi w wodzie,
s lotne z par wodn i charakteryzuj si nieprzyjemnym zapachem zjeczaego
tuszczu.
Kwasy tuszczowe, zawierajce ponad 10 atomw wgla w acuchu, s
substancjami staymi, nierozpuszczalnymi w wodzie, lecz w rozpuszczalnikach hydrofobowych, s nielotne i nie posiadaj charakterystycznego zapachu. Temperatura topnienia kwasw tuszczowych nasyconych wzrasta wraz ze zwikszaniem dugoci acucha alifatycznego kwasu tuszczowego.
Sole kwasw tuszczowych, czyli myda z metalami alkalicznymi s dobrze
rozpuszczalne w wodzie, natomiast sole magnezowe i wapniowe prawie nierozpuszczalne.
180
CH
+ H2O
C H (O H )
C H2
CH2 CH2
+ X
uwodnienie
CH CH
+ XH2
redukcja
R1
CH
CH
R2
R1
C HO + R2
C HO
utlenienie
Ze wzgldu na obecno podwjnego wizania kwasy tuszczowe nienasycone mog wystpowa w dwch formach stereoizomerycznych, cis i trans.
H
H
C C
COO
Kwas tuszczowy jest odmiany cis, gdy podstawniki, czyli oba fragmenty
acucha, pooone s po tej samej stronie paszczyzny wizania podwjnego.
H
C
COO
H
181
182
Kwas tuszczowy jest odmiany trans, gdy podstawniki pooone s po rnych stronach paszczyzny wizania podwjnego.
W naturalnych kwasach tuszczowych powszechna jest konfiguracja cis, ktra powoduje wygicie acucha wglowodorowego w miejscu podwjnego wizania o 120o. Ma to znaczenie dla czsteczkowego upakowania dwuwarstwy lipidowej bon biologicznych.
C OO
120 0
184
PROSTANOIDY I LEUKOTRIENY
Prostanoidy i leukotrieny s pochodnymi 20 wglowych kwasw wielonienasyconych, gwnie arachidonianu, dlatego nale do ikozanoidw. Peni rol
lokalnych hormonw o bardzo krtkim okresie ptrwania. Zwykle dziaaj w pobliu miejsc swego powstawania.
Prostanoidy powstaj w szlaku cyklooksygenazy, ktry prowadzi do cyklizacji rodkowej czci acucha (midzy C8 a C12) kwasu tuszczowego z utworzeniem piercienia cyklopentanowego. Pocztkowo powstaj nadtlenki prostaglandyn
(PGG2 i PGH2), a z tego ostatniego pozostae prostanoidy. Aspiryna hamuje szlak
cyklooksygenazy, poniewa jest nieodwracalnym inhibitorem syntazy prostaglandynowej, ktr acetyluje. Do prostanoidw nale prostaglandyny (PG), prostacykliny (PGI) i tromboksany (TX), majce podstawow struktur kwasu prostanowe
go, z czego wywodzi si ich nazwa.
185
R7
5
COOH
9
8
12
10
14
16
2
18
20
11
13
15
17
CH3
kwas prostanowy
19
R8
Prostaglandyny
Prostaglandyny s syntetyzowane i wydzielane przez niemal wszystkie komrki ssakw, z wyjtkiem erytrocytw. W odrnieniu od tradycyjnych hormonw, ich synteza nie jest ograniczona do wyspecjalizowanych komrek. Prostaglandyny wydzielane s bezporednio po wytworzeniu i nie s magazynowane
w komrkach.
186
Poszczeglne typy prostaglandyn oznacza si symbolami od A do H. Rni si midzy sob grupami funkcyjnymi (ketonow i hydroksylow), ich pooeniem lub pooeniem wizania podwjnego w piercieniu cyklopentanowym, np.
prostaglandyny E maj przy C9 grup ketonow, a prostaglandyny F grup hydroksylow w tej pozycji. Prostaglandyny A rni si od B pooeniem wizania
podwjnego, natomiast obie maj grup ketonow w pozycji C9 piercienia cyklopentanowego. Prostaglandyny G i H s endoperoksydami, czyli cyklicznymi nadtlenkami, rni si tym, e PGG ma przy atomie wgla C15 acucha alifatycznego (R8) przyczon grup wodoronadtlenkow, natomiast PGH w tej pozycji posiada grup hydroksylow.
O
R7
R8
R8
PGA
HO
HO
HO
R7
R7
R8
R8
HO
PGD
PGE
O
R7
R5
R7
R5
OOH
PGF
R7
R8
PGB
R7
OH
PGH2
PGG2
O
H
C OH
9
8
12
10
11
HO
6
14
15
13
2
18
4
16
17
20
19
CH3
OH
PG1
O H
O
C OH
CH3
HO
OH
PG2
O
C OH
HO
OH
PG3
187
kwas dihomo--linolenowy
kwas arachidonowy
kwas ikozapentaenowy
188
Prostacykliny
Prostacykliny (PGI) s syntetyzowane przez komrki rdbonka naczy
krwiononych i silnie hamuj agregacj pytek krwi.
COOH
O
OH
OH
prostacyklina (PGI2)
189
Tromboksany
Tromboksany (TX) powstaj w pytkach krwi. W swej strukturze maj piercie oksanowy, bdcy pochodn piercienia cyklopentanowego. Okres ptrwania aktywnej formy tromboksanu wynosi okoo 1 min, po czym przeksztacany jest
w form nieaktywn.
COOH
O
O
OH
TXA2 (forma aktywna)
t1/2 ~1min
H2O
OH
COOH
HO
OH
Leukotrieny
Leukotrieny (LT) powstaj z 20 wglowych kwasw polienowych w szlaku
lipooksygenazy, w odpowiedzi na bodce immunologiczne i nieimmunologiczne.
Lipooksygenazy katalizuj przyczanie tlenu do atomu wgla w pozycjach 5, 12
i 15 kwasu arachidonowego, powodujc powstanie hydroperoksydw (HPETE).
Jedynie 5-lipooksygenaza uczestniczy w powstawaniu leukotrienw. Leukotrieny
nie nale do prostanoidw, poniewa nie maj struktury kwasu prostanowego.
W swej strukturze zawieraj natomiast ukad trzech sprzonych wiza podwjnych, o czym informuje ich nazwa. Pocztkowo izolowano je z leukocytw,
dlatego te tak zostay nazwane.
190
11
COOH
5
6
LTA4
OH
14
10
11
COOH
12
HO
LTB4
OH
11
7
6
14
COOH
C5H11 S
Cys
CH2
HN CH C NH CH2 COOH
O C
O
Gly
LTC4
Glu
OH
11
7
6
14
COOH
C5H11 S
CH2
H2N CH C NH CH2 COOH
O
LTD4
LTD
OH
11
COOH
7
6
14
C5H11 S
CH2
CH
H2N
LTE4
COOH
adenylanowej oraz pobudza granulocyty do degranulacji i uwalniania lizosomalnych enzymw hydrolitycznych. Przeciwnie, leukotrieny LTC4, LTD4 i LTE4 s
czynnikami humoralnymi, ktre pobudzaj skurcze mini gadkich, w stopniu
nawet 1000-krotnie wyszym ni kurcz minie oskrzeli, np. histamina lub niektre prostaglandyny. W reakcjach katalizowanych przez enzymy w osoczu LTC4 jest
szybko przeksztacany do LTD4, dziki usuniciu reszt kwasu glutaminowego.
Nastpnie LTD4 powoli zostaje przeksztacony do LTE4, skutkiem usunicia reszty
glicyny. Tiopeptydy LTC4, LTD4 i LTE4 skadaj si na wolno reagujce substancje anafilaksji (SRS-A). Substancje te s przyczyn powolnego rozwijania
skurczu o przeduonym charakterze mini gadkich drg oddechowych i odkowo-jelitowych. W organizmie leukotrieny utrzymuj si przez 4 godziny.
192
H3C
Struktura
(R) COOH
(CH2)2
4:0
5:0
a)
CHCH2
CH3
butanowy
masowy
pentanowy
Wystpowanie
maso
izowalerianowy tran
orzech kokosowy i w niewielkich ilociach w rnych tuszczach
orzech kokosowy i w niewielkich ilociach w rnych tuszczach
orzech kokosowy i w niewielkich ilociach w rnych tuszczach
6:0
(CH2)4
heksanowy
kapronowy
8:0
(CH2)6
oktanowy
kaprylowy
10:0
(CH2)8
dekanowy
kaprynowy
12:0
(CH2)10
dodekanowy
laurynowy
14:0
(CH2)12
tetradekanowy
mirystynowy
16:0
(CH2)14
heksadekanowy
palmitynowy
18:0
(CH2)16
oktadekanowy
stearynowy
arachidowy
orzeszki ziemne
orzeszki ziemne, nasiona rzepaku
a)
20:0
(CH2)18
ikozanowy
22:0
(CH2)20
dekozanowy
behenowy
24:0
(CH2)22
tetrakozanowy
lignocerynowy
26:0
(CH2)24
heksakozanowy
cerotynowy
28:0
(CH2)26
oktakozanowy
montanowy
wosk montanowy
w fosfolipidach: sfingomielinie
Dawniej eikozanowy
193
a) dawniej eikozenowy
Tabela 2. Kwasy tuszczowe monoenowe
Symbol
numeryczny
Rodzina
omega
4:1
N AZ W Y I S Y M B O L E K W AS W J E D N O N I E N AS Y C O N Y C H
Struktura
Nazwa
Nazwa
systematyczna
zwyczajowa
H3C (R) COOH
kwas
kwas
Wystpowanie
CH CH
butenowy
krotonowy
olej krotonowy
12:1
(CH2)6CH CH(CH2)2
dodekenowy
linderowy
14:1
(CH2)3CH CH(CH2)7
cis tetradekenowy
mirystoleinowy
16:1
(CH2)5CH CH(CH2)7
cis heksadekenowy
palmitoleinowy
18:1
12
(CH2)10CH CH(CH2)4
cis oktadekenowy
petroselinowy
roliny baldaszkowate
18:1
(CH2)7CH CH(CH2)7
cis oktadekenowy
oleinowy
6
9
wszystkie tuszcze
18:1
(CH2)7CH CH(CH2)7
trans oktadekenowy
elaidynowy
nienaturalny
18:1
(CH2)4CH CH(CH2)10
trans- oktadekenowy
wakcenowy
20:1
(CH2)7CH CH(CH2)9
cis ikozenowy
22:1
(CH2)7CH CH(CH2)11
cis dokozenowy
22:1
(CH2)7CH CH(CH2)11
trans dokozenowy
brasydynowy
24:1
(CH2)7CH CH(CH2)13
cis tetrakozenowy
nerwonowy
12
11
13
13
15
a)
erukowy
nasiona rzepaku
tuszcz zwierzt morskich
w fosfolipidach: sfingomielinie,
cerebrozydach
195
a)
Struktura
Nazwa systematyczna
kwas
Symbol
numeryczny
Rodzina
omega
18:2
(CH2)3(CH2CH CH)2(CH2)7
18:3
(CH2CH CH)3(CH2)7
all cis
18:3
(CH2)3(CH2CH CH)3(CH2)4
all cis
H3C
(R)
COOH
cis, cis
9,12
18:3
(CH2)3(CH CH)3(CH2)7
20:2
(CH2)6(CH2CH CH)2(CH2)6
cis, cis
20:3
(CH2)6(CH2CH CH)3(CH2)3
all cis
20:3
(CH2)3(CH2CH CH)3(CH2)6
all cis
20:4
(CH2)3(CH2CH CH)4(CH2)3
20:5
(CH2CH CH)5(CH2)3
all cis
22:5
(CH2CH CH)5(CH2)5
all cis
22:6
(CH2CH CH)6(CH2)2
all cis
all cis
oktadekadienowy
linolowy
oktadekatrienowy
linolenowy
oktadekatrienowy
linolenowy
9,12,15
6,9,12
Nazwa zwyczajowa
kwas
9,11,13
ikozadienowy
a)
ikozatrienowy
a)
ikozatrienowy
a)
8,11
5,8,11
8,11,14
5,8,11,14
oktadekatrienowy
ikozatetraenowy
5,8,11,14,17
dihomolinolenowy
a)
ikozapentaenowy
7,10,13,16,19
oleostearynowy
arachidonowy
a)
tymnodonowy
dokozapentaenowy
klupanodonowy
dokozaheksaenowy
cerwonowy
4,7,10,13,16,19
Dawniej eikoza
197
12.
LIPIDY I POCHODNE
Iwona ak
Lipidy s czsteczkami nierozpuszczalnymi w wodzie, lecz rozpuszczajcymi si w rozpuszczalnikach organicznych. Zazwyczaj s to estry wyszych kwasw tuszczowych z alkoholami jedno- i wielowodorotlenowymi. Niektre lipidy
s amidami wyszych kwasw tuszczowych z aminoalkoholami.
Triacyloglicerole to magazyny skondensowanej energii, poniewa s zredukowane i wystpuj w postaci nieuwodnionej. Jeden gram bezwodnego tuszczu
magazynuje ponad 6-krotnie wicej energii ni taka sama ilo uwodnionego glikogenu. Dlatego triacyloglicerole stanowi gwny materia zapasowy u zwierzt.
Mog by gromadzone w komrkach w znacznych ilociach, nie wywoujc efektu
osmotycznego. Due iloci lipidw zmagazynowane s w specjalnie do tego celu
przeznaczonych komrkach (adipocytach) tkanki tuszczowej, np. u czowieka
tuszcz ten stanowi okoo 17% ciaru ciaa. Zgromadzony tuszcz stanowi wewntrzkomrkowy zapas paliwa wysokoenergetycznego w organizmie zwierzcym. U dorosego czowieka o wadze 70 kg zapas tuszczu wystarczy minimum na
miesic normalnej aktywnoci yciowej i jest rzdu 565 000 kJ. Triacyloglicerole
uruchamiane z tych zapasw s transportowane w pynach ustrojowych w postaci
kompleksw lipidowo-biakowych zwanych lipoproteinami, bdcych form transportow paliwa energetycznego. Zapasowe tuszcze peni rwnie inn rol te
wok narzdw stanowi poduszki amortyzacyjne, chronice narzdy wewntrzne
przed uciskiem, wstrzsami i urazami mechanicznymi, natomiast tkanka tuszczowa podskrna stanowi izolacj termiczn ustroju.
Tuszcze zoone s skadnikami strukturalnymi wszystkich bon biologicznych. Lipidy peni funkcj izolacyjn i ochronn, zarwno u rolin, jak i zwierzt,
czego przykadem mog by woski. Znaczenie dla organizmu tuszczw pokarmowych wynika bezporednio z dostarczania przez nie wysokoenergetycznych substratw oddechowych oraz niezbdnych witamin rozpuszczalnych w tuszczach (A,
D, E, K).
193
Podzia lipidw
A. Lipidy proste: estry kwasw tuszczowych z rnymi alkoholami.
1. Tuszcze waciwe: estry kwasw tuszczowych z glicerolem.
2. Woski: estry kwasw tuszczowych z alkoholami wyszymi od glicerolu.
B. Lipidy zoone: estry zawierajce dodatkowe grupy.
1. Fosfolipidy: estry lub amidy zawierajce reszt ortofosforanu, czsto rwnie
zasad azotow lub inne skadniki.
2. Glikolipidy: amidy wyszych kwasw tuszczowych z alkoholem, zawierajce wglowodany, w ktrych obecny jest azot, lecz brak ortofosforanu:
a) cerebrozydy,
b) gangliozydy.
C. Pochodne lipidw.
1. Lipidy izoprenowe.
2. Steroidy.
TUSZCZE WACIWE
Tuszcze waciwe, czyli acyloglicerole s estrami wyszych kwasw tuszczowych z alkoholem trjwodorotlenowym, glicerolem. Glicerol jest sodk gst
ciecz, dobrze rozpuszczaln w wodzie. Atomy wgla w glicerolu numeruje si
cyframi od gry do dou, tak jak w aldehydzie L-glicerynowym:
H2C OH
HO C H
H2C OH
glicerol
C1 sn-1
C2 sn-2
C3 sn-3
nitrogliceryna
H 2C O C R
H2C OH
R C O C H
HO C H
H2C OH
H 2C OH
1-acylo-sn-glicerol
2-acylo-sn-glicerol
diacyloglicerole
O
O
O
H 2C O C R 1
H2 C O C R1
HO C H O
R2 C O C H
H 2C O C R 2
H2 C OH
1,2-diacylo-sn-glicerol
1,3-diacylo-sn-glicerol
triacyloglicerole
O
O H2C O C (CH2)14 CH3
CH3(CH2)14C O C H O
H2C O C (CH2)14 CH3
1,2,3-tripalmitoilo-sn-glicerol
(prosty)
O
O H2C O C (CH2)16 CH3
CH3(CH2)7CH CH(CH2)7C O C H O
H2C O C (CH2)14 CH3
1-stearoilo-2-oleilo-3-palmitoilo-sn-glicerol
(mieszany)
1-stearoilo-2,3-dioleilo-sn-glicerol
196
O
H2C O C
O
H C O C
O
H2C O C
1,2,3-tristearoilo-sn-glicerol
Oleje rolinne mog by utwardzone skutkiem uwodornienia, czyli przeksztacone w tuszcze stae na podobiestwo tuszczy zwierzcych, co ma miejsce
np. podczas produkcji margaryny.
WOSKI
Woski, pod wzgldem struktury i waciwoci, s blisko spokrewnione
z acyloglicerolami. Maj konsystencj sta i nie rozpuszczaj si w wodzie. S to
estry wyszych, nasyconych kwasw tuszczowych z dugoacuchowymi alkoholami jednowodorotlenowymi lub piercieniowymi sterolami. U zwierzt, woski
tworz warstwy ochronnej na skrze, sierci i pirach, podobnie jak u rolin na
liciach i owocach.
Lanolina to tuszcz weny owczej, ktry jest mieszanin zawierajc estry
wyszych kwasw tuszczowych ze sterolami: lanosterolem i agnosterolem oraz
estry kwasw tuszczowych z wyszymi nienasyconymi alkoholami jednowodorotlenowymi.
O
C O
palmitoilolanosterol
Lanolina jest dobrze wchaniana przez skr, dlatego stosuje si j do wyrobu maci i kosmetykw.
Olbrot to wosk z czaszki kaszalota i innych wielorybw. W jego skad
wchodzi gwnie ester cetylowy kwasu palmitynowego, cho obecne s rwnie
estry cetylowe kwasu mirystynowego oraz kwasu laurynowego. Uywany jest
w kosmetyce oraz do wyrobu wiec i past do podg.
197
O
CH3
Wosk pszczeli to mieszanina estrw wyszych kwasw tuszczowych z dugoacuchowymi (C3034) alkoholami, skada si gwnie z melisynianu mirycylowego, cerotynianu mirycylowego i palmitynianu mirycylowego.
O
CH3
O
CH 3
(CH2) 29
O C
(CH2) 24
CH 3
cerotynian mirycylowy
FOSFOLIPIDY
Fosfolipidy, gwne skadniki bon biologicznych, wystpuj w znacznych
ilociach w organizmach zwierzcych, natomiast u rolin stanowi niewielki procent ich suchej masy.
Fosfolipidy to tuszczowce zawierajce w swej strukturze ortofosforan poczony wizaniem estrowym. W zalenoci od rodzaju alkoholu obecnego w fosfolipidach wyrnia si glicerofosfolipidy zawierajce glicerol oraz sfingofosfolipidy
zawierajce sfingozyn.
Glicerofosfolipidy
Glicerofosfolipidy s zbudowane z czterech skadnikw: trjwglowego
rdzenia glicerolu, dwch acyli poczonych wizaniami estrowymi z atomami C1
i C2 glicerolu oraz ortofosforanu. Ortofosforan jest poczony wizaniem fosfodiestrowym z atomem C3 glicerolu i z grup hydroksylow innego alkoholu. Alkoholem tym moe by cholina, etanoloamina (kolamina), seryna, inozytol lub te glicerol. Dwa acuchy kwasw tuszczowych, ktre s obecne w glicerofosfolipidach
nie s identyczne, zwykle przy atomie C2 glicerolu znajduje si wyszy kwas
tuszczowy nienasycony, z jednym, dwoma lub wiksz liczb wiza podwjnych, czsto jest nim kwas arachidonowy.
Najprostszym glicerofosfolipidem jest kwas fosfatydowy, czyli sn-3-fosfodiacyloglicerol, ktry w stanie wolnym rzadko wystpuje w organizmie, natomiast
198
jego estrami s wszystkie inne glicerofosfolipidy. Nale do nich fosfatydylocholina (lecytyna), fosfatydyloetanoloamina (kefalina kolaminowa), fosfatydyloseryna
(kefalina serynowa), fosfatydyloinozytol (kefalina inozytolowa), fosfatydyloglicerol i difosfatydyloglicerol, czyli kardiolipina. Kardiolipina wyodrbniona z minia sercowego jest podstawowym skadnikiem wewntrznych bon mitochondrialnych.
O
H 2C O C R
R C O C H O
R C O C H O
H 2C
O P
H2 C O C R
kwas fosfatydowy
fosfatydylocholina (lecytyna)
O
O
H2 C O C R
H
R C O C H O
H2 C O C R
R C O C H O
+
H2 C O P O C C NH3
O
H H
H2C
H2C
O
R
O
OH
OH
HO
5
H2C O C R1
R2 C O C H O
H2C O P O CH 2
O HO C H
OH
CH 2OH
OH
fosfatydyloinozytol
(kefalina inozytolowa)
fosfatydyloglicerol
R C O CH2
R C O CH
O
fosfatydyloseryna
(kefalina serynowa)
O
O
+
H2 C O P O C C NH3
O
H COO
fosfatydyloetanoloamina
(kefalina kolaminowa)
CH3
+
H2 C O P O C C N CH3
CH3
O
H H
H2 C O C R
O
HC O C R
difosfatydyloglicerol
(kardiolipina)
199
CH
Lizofosfolipidy powoduj hemoliz erytrocytw, ktra nastpuje np. po ukszeniu przez we lub pszczoy; w ich jadzie znajduje si fosfolipaza A2.
Lizofosfatydylocholina moe take powsta bez udziau fosfolipazy A2, lecz w
obecnoci acylotransferazy lecytyna:cholesterol (LCAT), enzymu, ktry przenosi
reszt acylow z pozycji C2 lecytyny na cholesterol, wytwarzajc acylocholesterol.
W ten sposb powstaj estry cholesterolu wystpujce w lipoproteinach.
Fosfolipaza D hydrolizuje wizanie fosfoestrowe z zasad, uwalniajc kwas
fosfatydowy i zasad azotow.
Fosfolipazy, poza funkcjami trawiennymi, mog take uruchamia powstawanie bardzo aktywnych czsteczek sygnaowych lub ich bezporednich prekursorw. Fosfolipaza A2 uwalnia np. kwas arachidonowy, ktry jest bezporednim prekursorem prostaglandyn, leukotrienw i tromboksanw, natomiast fosfolipaza C
uwalnia dwa wtrne przekaniki informacji hormonalnej.
Wrd glicerofosfolipidw bonowych wystpuj takie, ktre poza funkcj
budulcow bon peni rwnie rol substancji macierzystych zwizkw biologicznie czynnych o charakterze wtrnych przekanikw. Nale do nich fosfolipidy
inozytolowe, ktre zawieraj kwas stearynowy w pozycji sn-1 i kwas arachidonowy w pozycji sn-2 glicerolu.
200
(a ra ch id o n ia n ) R
H 2C
H 2C
4 ,5 -b is fo s fo ra n
fo s fa tyd ylo in o zyto lu
[P IP 2]
R (s te a ryn ia n )
O
P
OH
OH
HO
fo s fo lip a za C
H 2C
O
O
CH 2OH
P
O
d ia cylo g lice ro l
[D AG]
O
OH
OH
2
HO
3
O
P
1 ,4 ,5 ,-trifo s fo ra n
in o zyto lu
[IP 3]
Diacyloglicerol (DAG) pozostaje w bonie i peni funkcj naturalnego aktywatora kinazy biakowej C, ktra fosforylujc swoiste biaka, uruchamia szlak
przemian waciwy dla komrki efektorowej, np. moe aktywowa wymian jonw H+ pochodzcych z wntrza komrki na jony Na+ pozakomrkowe, doprowadzajc do wzrostu pH cytoplazmy.
DAG jest szybko metabolizowany albo z udziaem fosfolipazy A2, albo ulega fosforylacji do kwasu fosfatydowego, z ktrego ostatecznie odtwarzany jest
fosfatydyloinozytol.
201
H H
O H2 C O C C R1
O
R C O CH
H2 C O C C R1
R C O CH
O
+
H2 C O P O CH2 CH2 NH3
O
CH3
+
O H2 C O P O CH 2 CH2 N CH3
CH3
O
plazmalogen kolaminowy
plazmalogen cholinowy
W plazmalogenach, w odrnieniu od typowych glicerofosfolipidw, wystpuje dugoacuchowy aldehyd w formie enolowej, zazwyczaj jest nim aldehyd
heksadekanowy lub oktadekanowy, poczony z atomem C1 glicerolu wizaniem
eterowym.
CH3
H2 C O CH2 CH 2
C O CH
O
(CH2)13
CH3
CH 3
+
O H2 C O P O CH2 CH 2 N CH3
CH 3
O
202
Sfingofosfolipidy
Sfingofosfolipidy s amidami dugoacuchowych kwasw tuszczowych
i sfingozyny, ktre dodatkowo zawieraj ortofosforan, a take cholin. Sfingozyna jest dugoacuchowym, jednonienasyconym, aminoalkoholem dihydroksylowym,
o wzorze sumarycznym C18H36O2. N-acylosfingozyna nazywa si ceramidem, bdcym prekursorem sfingomielin i glikolipidw sfingozynowych. W ceramidzie
reszta kwasu tuszczowego poczona jest wizaniem amidowym (peptydowym) ze
sfingozyn. Ceramid zestryfikowany fosfocholin jest sfingomielin, jedynym
przedstawicielem sfingofosfolipidw.
H
H3C (CH2)12
H H
C C C C CH2
OH
H 3 C (CH 2)12
H OH
H H
C C C C CH2
OH
H OH
H N
NH3
C O
R
sfingozyna
ceramid (N-acylosfingozyna)
H
H 3C (CH2)12
H H
C C C C CH 2
H OH
H N
O
O P O (CH2)2
O
CH3
+
N CH3
CH 3
C O
R
sfingomielina
Sfingomieliny mog rni si midzy sob rodzajem reszty kwasu tuszczowego, przyczonego do sfingozyny. Mog to by reszty kwasw stearynowego, palmitynowego, lignocerynowego lub nerwonowego, zwykle jednak przewaaj kwasy tuszczowe nasycone. Sfingomieliny pochodzce z rnych rde rni
si acylem, np. sfingomieliny pochodzce z tkanki nerwowej najczciej maj
kwas stearynowy, natomiast z wtroby kwas palmitynowy. Sfingomieliny szczeglnie obficie wystpuj w osonkach mielinowych wkien nerwowych, stanowi
dobre izolatory tkanki nerwowej. S bardziej odporne na utlenianie ni lecytyny
i kefaliny. Wynika to z niskiej zawartoci kwasw monoenowych i praktycznie
braku kwasw polienowych w strukturze sfingomieliny.
203
GLIKOLIPIDY
Wrd glikolipidw majcych istotne znaczenie w budowie bon biologicznych s glikosfingolipidy. Nale do nich cerebrozydy, zbudowane z ceramidu
i reszty monocukrowej, np. galaktopiranozy lub glukopiranozy. Poszczeglne cerebrozydy rni si midzy sob rodzajem kwasu tuszczowego, ktry w nich
wystpuje.
H
H3C
(CH2)12
C C
HO CH2
H
C
CH2
O O
OH
OH
H N
C
HO
OH
galaktocerebrozyd
C C
HOCH2
CH2
O O
H OH
H
OH
O
N
C
SO3
OH
3-O-sulfogalaktocerebrozyd
204
H
H3C
(CH2)12
C C C C
CH2
1Glc4
SA
2,3
1Gal4
1GalNAc3
SA
2,3
1Gal
H OH
H N
C O
R
disjalogangliozyd
cuchy wglowodorowe, to mniejsze wzajemne oddziaywania hydrofobowe midzy ogonami, przez co wiksza pynno dwuwarstwy.
Na pynno dwuwarstwy ma wpyw zawarto cholesterolu, ktry nieobecny jest w bonach bakterii, drody i rolin. U rolin zamiast cholesterolu wystpuje kilka innych steroidw, gwnie -sitosterol i stigmasterol, rnicych si od
cholesterolu tylko bocznymi acuchami alifatycznymi. Cholesterol w duej iloci
stwierdza si w dwuwarstwie lipidowej u zwierzt, z wyjtkiem bon mitochondrialnych. Najobfitsza w cholesterol jest bona komrkowa. W dwuwarstwie lipidowej cholesterol wypenia wolne przestrzenie midzy czsteczkami fosfolipidw
powstae na skutek obecnoci wygitych ogonw nienasyconych acuchw wglowodorowych. Cholesterol usztywnia dwuwarstw lipidow, zmniejszajc pynno i przepuszczalno.
mozasklepianie niweluje otwarte hydrofobowe krawdzie dwuwarstwy, ktre byyby wystawiane na niekorzystne energetycznie oddziaywanie z wod. Dwuwarstwy lipidowe mog zamyka si w mae pcherzyki z hydrofilnym przedziaem
wewntrznym. Takie zamknite struktury (liposomy) s bardziej stabilne, poniewa uniemoliwiaj kontakt hydrofobowych ogonw wglowodorowych z wod.
Liposomy s sztucznymi pcherzykami dwuwarstwy lipidowej, ktre posiadaj
wewntrz zamknit cz roztworu wodnego, w ktrym zostay utworzone.
207
IZOPRENOIDY
Izoprenoidy i ich pochodne steroidy s zespoami strukturalnie rnorodnych, hydrofobowych zwizkw nierozpuszczalnych w wodzie, za to rozpuszczalnych w tuszczach i rozpuszczalnikach organicznych. Zwykle s ekstrahowane
z tkanek wraz z lipidami, ale stanowi tzw. frakcj niezmydlajcych si lipidw.
Izoprenoidy stanowi du grup zwizkw szczeglnie obficie wystpujcych w rolinach. Nale do nich skadniki olejkw eterycznych, ywic, pochodne
karotenowcw, witaminy A, E, K, kauczuk, regulatory wzrostu rolin cytokininy,
gibereliny i kwas abscysynowy.
Pokrewiestwo izoprenoidw i sterydw wynika ze wsplnego, pocztkowego etapu ich szlaku biosyntetycznego, ktry ostatecznie rozchodzi si. Zarwno
izoprenoidy, jak i sterydy pochodz z aktywnej piciowglowej jednostki zwanej
pirofosforanem izopentenylu lub jej formy izomerycznej, zwanej pirofosforanem
3,3-dimetyloallilu. Aktywna jednostka piciowglowa pochodzi natomiast z kondensacji trzech czsteczek aktywnego octanu (acetylo-S-CoA) z wytworzeniem
kolejno, acetoacetylo-S-CoA, 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-S-CoA (HMG-CoA)
i mewalonianu.
Mewalonian, stopniowo fosforylowany (kosztem 3ATP), dekarboksylowany
ostatecznie zostaje przeksztacony w pirofosforan izopentenylu, ktry sam nie jest
zdolny do wzajemnej kondensacji, dlatego nastpuje jego izomeryczna przemiana
do pirofosforanu 3,3-dimetyloallilu.
CH3
H 2 C C CH 2
CH2 O P O P O
O
O
pirofosforan izopentenylu
CH 3
H 3C C CH 2
CH2 O
P~ P
pirofosforan 3,3-dimetyloallilu
Kondensacja tych piciowglowych jednostek (lub ich wielokrotnoci) prowadzi do powstawania rozgazionych, nienasyconych acuchw wglowodorowych lub zwizkw cyklicznych, zwanych terpenami, czyli zwizkw zbudowanych z wielokrotnych jednostek izoprenylowych, z ewentualnymi dalszymi ich
modyfikacjami.
CH3
CH2C=CHCH2
jednostka izoprenylowa
Hemiterpeny, najprostsze zwizki z grupy terpenw, s pochodnymi pojedynczej jednostki izoprenylowej, nale do nich np. cytokininy rolinne. Mono208
CH3
CH3
O
P~ P
H3C
pirofosforan farnezylu (seskwiterpen)
Diterpeny zawieraj cztery jednostki izoprenylowe (C20), naley do nich fitol obecny w chlorofilu i witaminie E, diterpenami s te witaminy A, retinal, kwas
retinojowy. Ponadto s zwizkami prekursorowymi w syntezie karotenowcw
i ksantofili.
CH3
CH3
CH3
CH3
CH2OH
H3C
fitol (diterpen)
Triterpeny zawieraj sze jednostek izoprenylowych (C30), np. moe je reprezentowa skwalen, ktry jest ostatnim izoprenoidem acuchowym w szlaku
syntezy cholesterolu.
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
H3C
skwalen (triterpen)
209
H 3C
H 3C
CH3
CH3
CH3
H 3C
CH3
CH3 CH3
CH3
karoten (tetraterpen)
Grup poliizoprenoli tworz zwizki o dugoci acucha powyej 20 atomw wgla, czyli poczwszy od diterpenw.
O
-
CH 3
CH3
CH3
fosfodolichol (poliizoprenol)
acuchowymi poliizoprenolami s dolichole (C85-C105), najdusze naturalne wglowodorowe acuchy, wystpujce w bonach szorstkiej siateczki rdplazmatycznej u zwierzt i rolin. Fosfodolichole peni rol przenonikw aktywnych
form monocukrw, np. mannozy i glukozy podczas syntezy prekursorowych N-glikanw w cyklu fosfodolicholowym. Difosforan dolicholu jest nonikiem prekursorowego oligosacharydu, gwnego donora w reakcji N-glikozylacji biaek. Do
poliizoprenoli nale rwnie ubichinony, witaminy E i K oraz kauczuk. Ten
ostatni utworzony jest z ponad 1000 jednostek izoprenylowych.
O
H 3C O
H 3C O
4
1
OH
+
2H + 2e
CH3
H 3C O
CH3
H 3C O
CH2 C C CH2 H
CH2 C C CH 2 H
CH3
ubichinon
6-10
2H + 2e
OH
CH3
6-10
ubihydrochinon
Ubichinony s przenonikami elektronw i protonw w acuchu oddechowym. Strukturalnie rni si midzy sob liczb jednostek izoprenylowych, ktrych w czsteczce moe by od 5 do 10. Krgowce i roliny wysze zawieraj ubichinon z 10 jednostkami izoprenylowymi (Q10), natomiast nisze zwierzta i roliny czciej zawieraj ubichinon skadajcy si z 6 jednostek izoprenylowych (Q6).
STEROIDY
Sterydy zawieraj wsplny wielopiercieniowy element strukturalny zwany
steranem, czyli cyklopentanoperhydrofenantrenem. Steran zawiera cztery poczo210
3-beta-hydroksy
3-alfa-hydroksy
10,13-dimetylosteran
wodr 5-beta
konformacja cis
cis
wodr 5-alfa
trans
konformacja trans
piercieni A i B
Sterole
Najwaniejszy sterol zwierzcy to cholesterol, ktry moe mie pochodzenie
egzogenne (z pokarmu) lub endogenne, poniewa jest syntetyzowany de novo,
gwnie w wtrobie. W pynach ustrojowych transportowany jest w lipoproteinach.
Wystpuje we wszystkich komrkach zwierzcych jako skadnik bon biologicznych, z wyjtkiem bon mitochondrialnych, natomiast w cytoplazmie obecny jest
w postaci estrw cholesterolu z kwasami tuszczowymi. Najbogatsze w cholesterol
s nadnercza i mzg. Stwierdza si go rwnie w osonkach mielinowych. Nadmiar
cholesterolu staje si szkodliwy dla organizmu, gdy przyspiesza rozwj zmian
miadycowych w naczyniach krwiononych. W hipercholesterolemii (wysoki
poziom cholesterolu we krwi) znacznie wzrasta ilo niekorzystnych lipoprotein
bogatych w cholesterol (LDL), ktre sprzyjaj odkadaniu cholesterolu w cianach
naczy krwiononych. Jego nadmiar moe by odkadany w postaci kamieni ciowych.
Cholesterol jest cyklicznym, nienasyconym jednowodorotlenowym alkoholem. Grupa hydroksylowa znajduje si przy atomie C3 w pooeniu beta, a wizanie podwjne (midzy C5 i C6) w piercieniu B.
cholesterol
212
Poza dwoma podstawnikami metylowymi (przy C10 i C13) wystpuje rwnie omiowglowy acuch wglowodorowy (przy C17). Struktura wielopiercieniowa cholesterolu jest sztywna i ma charakter hydrofobowy, podobnie jak omiowglowy podstawnik wglowodorowy. Rejon polarny w czsteczce cholesterolu
stanowi jedynie grupa hydroksylowa przy atomie C3, bdca hydrofilow gwk czsteczki. Cholesterol rozpuszcza si w chloroformie, eterze i benzenie.
W skrze czowieka z cholesterolu powstaje 7-dehydrocholesterol, inny sterol, ktry jest prowitamin D3. W reakcji fotochemicznej, pod wpywem sonecznego promieniowania ultrafioletowego, w czsteczce 7-dehydrocholesterolu nastpuje fotoliza wizania midzy atomami C9 a C10, skutkiem czego jest przestawienie wiza podwjnych i wytworzenie prewitaminy D3. Nastpnie spontaniczna
izomeryzacja prowadzi do wytworzenia witaminy D3, czyli cholekalcyferolu. Natomiast w wtrobie i nerkach witamina D3 ulega kolejnym reakcjom hydroksylacji,
ktre doprowadzaj do wytworzenia hormonu witaminowego, tzw. kalcytriolu,
czyli 1,25-dihydroksycholekalcyferolu.
na odkadanie w (lub resorpcj z) kociach oraz absorpcj w nerkach. Dlatego witaminy D (wspdziaajc z parathormonem) zapewniaj utrzymanie cile okrelonego, w miar staego stenia wapnia we krwi. Spadek stenia wapnia we
krwi moe by uzupeniany, poniewa hormon witaminowy, kalcytriol, sprzyja
resorpcji wapnia z koci, szybko sprowadzajc stenie wapnia w pynach ustrojowych do fizjologicznie staego poziomu. Niedobr witaminy D zmniejsza wchanianie wapnia w jelicie cienkim, absorpcj wapnia i fosforanw w nerkach oraz
ich zawarto we krwi. Konsekwencj jest demineralizacja koci, ktra u dzieci
prowadzi do krzywicy, a u dorosych do osteomalacji, czyli zmikczenia koci.
Kwasy ciowe
Kwasy ciowe powstaj z cholesterolu w wtrobie. Gwnym etapem
ograniczajcym nasilenie szlaku syntezy kwasw ciowych jest 7--hydroksylacja cholesterolu zalena od obecnoci tlenu czsteczkowego, NADPH+H+, cytochromu P-450 i witaminy C. W wyniku tej reakcji powstaje 3,7--dihydroksykoprostanian, czyli kwas chenodeoksycholowy. Dalsza 12--hydroksylacja prowadzi
do wytworzenia 3,7,12--trihydroksykoprostanianu, czyli kwasu cholowego, ktry
jest gwnym kwasem ciowym u czowieka.
kwas chenodeoksycholowy
kwas cholowy
214
glikochenodeoksycholan
taurochenodeoksycholan
glikocholan
taurocholan
Wtrne kwasy ciowe powstaj w jelicie dziki aktywnoci bakterii jelitowych. Reakcje te polegaj na dekoniugacji, czyli odszczepieniu glicyny lub tauryny oraz na 7-dehydroksylacji. Wtrnym kwasem ciowym powstajcym z gliko- lub taurocholanu jest kwas deoksycholowy. Wtrny kwas litocholowy powstaje
z gliko- lub taurochenodeoksycholanu. Wtrne kwasy ciowe w 9899% wracaj
do wtroby, dziki wchanianiu zwrotnemu, wycznie w jelicie krtym, tylko niewielka ich ilo, rzdu 12%, jest wydalan wraz z kaem.
215
kwas deoksycholowy
kwas litocholowy
Hormony steroidowe
Cholesterol jest prekursorem piciu gwnych klas hormonw steroidowych.
cholesterol (C27)
pregnenolon (C21)
progestageny (C21)
androgeny
(C19)
glukokortykoidy
(C21)
mineralokortykoidy
(C21)
estrogeny
(C18)
Gwnymi miejscami ich powstawania s: ciako te, a podczas ciy oysko dla progestagenw, jajnik dla estrogenw, jdra dla androgenw i kora nadnerczy dla glukokortykoidw i mineralokortykoidw.
Progesteron, gwny gestagen, powstaje z pregnenolonu w wyniku utlenienia jego grupy 3-hydroksylowej do grupy 3-ketonowej, a ponadto w wyniku izomeryzacji podwjnego wizania 5 do wizania 4. Progesteron odpowiedzialny
jest za zmiany w endometrium macicy, przygotowujce do implantacji zapodnionej komrki jajowej podczas fazy lutealnej cyklu pciowego. Ponadto, progesteron
216
pregnenolon
progesteron
kortyzol
kortyzon
kortykosteron
217
aldosteron
218
androstendion
testosteron
estron
estradiol
estriol
219
220
13.
AMINOKWASY
I POCHODNE
Iwona ak
Aminokwasy s najmniejszymi elementami strukturalnymi biaek, polipeptydw i peptydw we wszystkich organizmach ywych, od bakterii do czowieka
wcznie. Wystpuj rwnie w stanie wolnym, penic inne funkcje biologiczne.
Mog by substratami w utlenianiu komrkowym, w syntezie rnorodnych
zwizkw wanych biologicznie, np. zasad azotowych. Aminokwasy lub ich pochodne s neuroprzekanikami, neurohormonami lub klasycznymi hormonami.
Podstawowych aminokwasw biakowych jest 20 (tab. 1), wszystkie one posiadaj wasne kodony genetyczne, warunkujce wbudowanie ich w acuch polipeptydowy. Aminokwasy okrela si za pomoc nazw zwyczajowych, chemicznych oraz trjliterowymi lub jednoliterowymi skrtami midzynarodowymi. Te
ostatnie s szczeglnie uyteczne do zapisywania sekwencji polipeptydowej.
Aminokwasy stanowi rnorodn grup czsteczek, ale maj wsplny element strukturalny. Wsplnym elementem wszystkich aminokwasw biakowych
jest wgiel , do ktrego przyczona jest grupa -karboksylowa i pierwszorzdowa grupa -aminowa lub drugorzdowa grupa -aminowa (tylko w prolinie).
Zwizanie grupy aminowej proliny w strukturze piercieniowej acucha bocznego
sprawia, e jest iminokwasem. Wszystkie aminokwasy wystpujce w biakach s
-aminokwasami.
Wgiel jest atomem asymetrycznym we wszystkich aminokwasach biakowych, z wyjtkiem glicyny, dlatego aminokwasy s zwizkami optycznie czynnymi, skrcaj paszczyzn wiata spolaryzowanego w prawo (+) lub w lewo (-)
oraz wystpuj w dwch stereoizomerycznych formach L i D. Wszystkie aminokwasy wystpujce w organizmach wyszych zwierzt, rolin i czowieka s enancjomerami o konfiguracji L, dlatego pominito ten symbol w nazwie przedstawionych wzorw aminokwasw.
221
Skrty
Typ
Gly (G)
Endo
Grupy -aminokwasowe
acuchy boczne
aminokwasw (R)
Glicyna
(glikokol)
kwas aminooctowy
Alanina
kw.(+)2-aminopropionowy
H C COO
NH 3+
H
Ala (A)
CH3 C COO
Endo
Walina
kw.(+)2-amino-3-metylomasowy
Val (V)
CH3
Egzo
CH3
Leucyna
kw.(-)2-amino-4metylowalerianowy
Izoleucyna
kw.(+)2-amino-3-metylowalerianowy
Leu (L)
CH3
Fenyloalanina
kw.(-)2-amino-3-fenylopropionowy
CH C COO
NH3+
H
CH CH2 C COO
NH 3+
Ile (I)
Egzo
NH3+
H
Met (M)
Egzo
Phe (F)
CH2 C COO
Egzo
NH 3 +
H
Tyrozyna
kw.(-)2-amino-3-(4- hydroksyfenylo)
propionowy
Tryptofan
kw.(-)2-amino-3-(3-indolylo)-propionowy
CH3 H
Metionina
kw.(-)2-amino-2-metylotiomasowy
CH3
Egzo
NH3
H
Tyr (Y)
Endo
CH2 C COO
HO
NH3+
H
Trp (W)
CH2 C COO
Egzo
NH3+
N
H
Prolina
kw.(-)2-pirolidynokarboksylowy
Pro (P)
Endo
H2C
NH2+
H2C
222
COO
H2C
Nazwy
Seryna
kw.(-)2-amino-3-hydroksypropionowy
Treonina
kw.(-)2-amino-3-hydroksymasowy
Cysteina
kw.(+)2-amino-3-merkaptopropionowy
Kwas
asparaginowy
Skrty
Grupy -aminokwasowe
acuchy boczne
aminokwasw (R)
Typ
Ser (S)
HO CH 2 C COO
Endo
NH3+
OH H
Thr (T)
CH3 CH C COO
Egzo
NH 3+
H
Cys (C)
HS CH 2 C COO
Endo
NH3+
H
Asp (D)
Endo
kw(+)2-aminobursztynowy
Kwas
glutaminowy
NH 3
Glu (E)
Endo
H
OOC CH2 CH2 C COO
kw.(+)2-aminoglutarowy
Asparagina
kwas 2-aminobursztynoamowy
NH 3
Asn (N)
Endo
NH 3+
H
Glutamina
kwas 2-amino-glutaroamowy
Gln (Q)
Endo
NH3
Histydyna
kw.(-)-amino--imidazolo-4-propionowy
Lizyna
kw.(+)2,6-diamino-heksanowy
Arginina
kw.(+)2-amino-5-guanidynowalerianowy
His (H)
Egzo
HN
Lys (K)
Egzo
H3 N CH2
NH
H
CH2 C COO
NH3+
H
CH2 CH2 CH 2 C COO
NH3 +
NH2
Arg (R)
Egzo
Egzo egzogenne
223
Aminokwas naley do szeregu L wwczas, gdy jego konfiguracja przy atomie wgla jest taka sama, jak konfiguracja L-seryny i tym samym aldehydu L-glicerynowego. We wzorze Fischera, czyli pionowym zapisie atomw acucha
wglowego aminokwasu z grup karboksylow na grnym kocu, konfiguracj L
przedstawia si w ten sposb, e grupa aminowa znajduje si po lewej stronie,
natomiast gdy znajduje si po prawej stronie, to aminokwas jest konfiguracji D.
Wszystkim L-aminokwasom biakowym odpowiada konfiguracja absolutna
S, wg regu pierwszestwa, z wyjtkiem L-cysteiny, ktra ma konfiguracj R.
D-Aminokwasy
COOH
+
H3N C H
R
pH<pI
ANION
JON OBOJNACZY
COO-
+H
- H+
H3N C H
R
pH=pI
-H
+H
COOH2N C H
R
pH>pI
Dysocjacja grupy -aminowej okrelona wartoci pK wynosi 8,910,6, natomiast warto pK grupy -karboksylowej 1,72,6. Wraz ze zmian pH rodowiska zmienia si stan zjonizowania tych grup.
224
W rodowisku kwanym (pH<pI) cofnita jest dysocjacja grupy karboksylowej, uprotonowana pozostaje grupa aminowa, ktra nadaje ugrupowaniu -aminokwasowemu charakter kationu.
W rodowisku zasadowym (pH>pI) zostaje cofnita dysocjacja grupy aminowej, natomiast zjonizowana pozostaje grupa karboksylowa, nadajca ugrupowaniu -aminokwasowemu charakter anionu. Dziki tym grupom aminokwasy monoaminomonokarboksylowe s amfolitami, czyli w obecnoci zasad reaguj jak
aniony, natomiast w obecnoci kwasw jak kationy. Jednak grupy funkcyjne
przyczone do atomu wgla mog reagowa, jak kation lub aniony tylko
w wolnych aminokwasach, poniewa w peptydach, polipeptydach, biakach one
wanie tworz wizania peptydowe i dlatego nie maj wpywu na stan jonizacji
zwizanej czsteczki aminokwasu (z wyjtkiem N-kocowych i C-kocowych
aminokwasw).
Aminokwasy rni si natomiast midzy sob acuchem bocznym (R) poczonym z atomem wgla . W najmniejszym aminokwasie, glicynie, pojedynczy
atom wodoru zajmuje miejsce acucha bocznego, zwykle tworzonego przez rne
acuchy alifatyczne lub aromatyczne w innych aminokwasach (tab. 1). W acuchach bocznych aminokwasw mog by obecne rne grupy zdolne do jonizacji
(np. NH2, -COOH). Grupy te, niezalenie od postaci aminokwasu (wolnej lub
zwizanej w polipeptydzie), maj wpyw na stan jonizacji czsteczki aminokwasu,
ale take makroczsteczki, w ktrej wystpuj, dlatego natura acuchw bocznych
odpowiedzialna jest za wasnoci fizykochemiczne aminokwasw.
Aminokwasy hydrofobowe stanowi wan grup wrd aminokwasw
biakowych. Alifatyczne acuchy boczne, chemicznie niereaktywne i hydrofobowe maj aminokwasy: alanina, walina, leucyna, izoleucyna, metionina i prolina.
W tym ostatnim aminokwasie acuch wglowodorowy jest zamknity poprzez
grup -aminow. Cyklizacja usztywnia konformacj proliny. Alifatyczny acuch
boczny cysteiny jest rwnie hydrofobowy, lecz zawiera bardzo reaktywn grup
tiolow SH. Warto pK grupy SH (Cys) wynosi 8,3. Dwie takie grupy atwo
tworz disulfidy w reakcji agodnego utleniania. Wytworzone wizanie disulfidowe w cystynie stosunkowo atwo ulega rozszczepieniu przez agodn redukcj,
z odtworzeniem dwch tioli. Aminokwasy z aromatycznymi acuchami bocznymi
s rwnie hydrofobowe. Charakter silnie hydrofobowy maj fenyloalanina i tryptofan, mniej hydrofobowa jest tyrozyna, poniewa zawiera reaktywn grup hydroksylow, ktra moe uczestniczy w tworzeniu wiza wodorowych lub w fosfoestryfikacji. Warto pK grupy hydroksylowej (Tyr) wynosi 10,1.
Aminokwasy polarne mona zrnicowa na obdarzone adunkiem i pozbawione adunku. Do obdarzonych adunkiem nale aminokwasy z acuchami
bocznymi, zawierajcymi grupy kwasowe lub zasadowe.
225
moe by z cystein, ktra powstaje z egzogennej metioniny, lecz rwnie z endogennej seryny. W przypadku braku nawet jednego aminokwasu, w organizmie
zaczynaj przewaa procesy rozkadu biaek nad ich syntez, czego konsekwencj
jest ujemny bilans azotu.
W organizmie zwierzcym niektre aminokwasy biakowe s glukogenne,
inne ketogenne.
Aminokwasami glukogennymi s te, ktre mog by substratami w szlaku
glukoneogenezy, odpowiedzialnym za syntez glukozy z niecukrowych prekursorw. Nale do nich glicyna, alanina, walina, seryna, cysteina, metionina, treonina,
asparaginian, glutaminian, histydyna, arginina i prolina.
Aminokwasy ketogenne to te, ktrych przemiany dostarczaj -ketokwas
acetooctan, ktry jest prekursorem cia ketonowych. Spontaniczna dekarboksylacja
acetooctanu dostarcza aceton, natomiast redukcja acetooctanu przeksztaca go w 3-hydroksymalan. Ketogennymi aminokwasami s fenyloalanina, tyrozyna, leucyna, izoleucyna, lizyna i tryptofan.
Aminokwas biakowy jako donor aktywnych grup metylowych. Wrd
aminokwasw biakowych jest metionina, ktra, poza sw rol w tworzeniu struktury pierwszorzdowej polipeptydw i biaek, wystpuje rwnie w formie pochodnej S-adenozylometioniny (S-5-[(3-amino-3-karboksypropylo)-metylenosulfonio]-5-deoksyadenozyny), penicej rol donora aktywnego metylu w reakcjach
metylacji. S-adenozylometionina powstaje w wyniku adenylacji metioniny przy
udziale ATP.
NH2
N
N
H
H 2C H2C C COO + ATP
H 3C S
NH3 +
COO
+
Pi + PP i + H C H2C H2C S CH2
N H3+
H 3C
OH OH
metionina
S-adenozylometionina
227
OH
+
H 3N CH 2
CH CH 2
H
CH 2 C COO
NH 3+
5-hydroksylizyna
COOH
NH2+
HO
4-hydroksyprolina
Grupy hydroksylowe hydroksylizyn s zwykle podstawione, poniewa stanowi miejsca akceptorowe dla jednostek cukrowych podczas procesu glikozylacji
enzymatycznej kolagenu. Jednostkami cukrowymi poczonymi wizaniem O-glikozydowym z hydroksylizyn s pojedyncze reszty -galaktozy albo disacharydy
skadajce si z glukozy i galaktozy. Grupy hydroksylowe hydroksyprolin kolagenu s wolne, niepodstawione.
Allizyna (6-oksonorleucyna, kwas 2-aminoadypoaldehydowy), aldehydowa
pochodna lizyny, z ktrej powstaje w wyniku reakcji oksydacyjnej -dezaminacji
katalizowanej przez oksydaz lizylow, jest charakterystyczna dla kolagenu i elastyny. Reszty allizyny uczestnicz w tworzeniu wiza krzyowych w kolagenie
i elastynie.
Poliaminokwasy, desmozyna (4-(4-amino-4-karboksybutylo)-1-(5-amino-5-karboksypentenylo)-3,5-bis(3-amino-3-karboksypropylo)pirydynium) lub jej izomer izodesmozyna (2-(4-amino-4-karboksybutylo)-1-(5-amino-5-karboksypentenylo)-3,5-bis(3-amino-3-karboksypropylo)pirydynium), s charakterystyczne dla elastyny, drugiego po kolagenie, biaka tkanki cznej. Desmozyna tworzona jest
z trzech reszt allizyn pochodzcych z trzech rnych acuchw polipeptydowych
oraz jednej reszty lizyny z czwartego polipeptydu.
H
H C CH 2 CH 2 CH2
O
C COO
NH 3
(CH2)2
(CH2)3
(CH 2)2
+
N
(CH2)4
allizyna
desmozyna
228
NH3+
NH3+
-alanina
-Alanina w organizmie ssakw powstaje podczas przemian zasad pirymidynowych. Rola biologiczna -alaniny wynika z jej udziau w strukturze kwasu
pantotenowego, koenzymu A (CoA) oraz karnozyny.
Kwas -aminomasowy (GABA) powstaje z glutaminianu w mzgu. Peni
rol hamujcego neuroprzekanika w synapsach, ktry stymuluje otwieranie kanaw chlorkowych w bonie postsynaptycznej. W ten sposb utrzymuje wysok
ujemn warto potencjau bonowego komrki postsynaptycznej, utrudniajc wytworzenie potencjau czynnociowego.
Aminokwasy niebiakowe mog peni rol metabolitw porednich w przemianach biologicznie wanych dla organizmu. Takimi metabolitami s ornityna
(kwas 2,5-diaminowalerianowy) i cytrulina (kwas 2-amino-5-ureidowalerianowy),
ktre uczestnicz w biosyntezie mocznika, lub kwas -aminolewulinowy, kluczowy metabolit poredni w syntezie porfiryn.
C
CH2 CH 2 CH 2 CH COO
+
NH3
+
H3N
CH2 CH 2 CH2
CH COO
NH
C O
NH 3
NH 2
ornityna
cytrulina
CH2 C CH 2 CH2 COO
NH3+ O
kwas -aminolewulinowy
Aminokwasy niebiakowe mog by rwnie metabolitami porednimi przemian aminokwasw biakowych, ktre dodatkowo peni jeszcze inne swoiste
funkcje biologiczne. Homocysteina (kwas 2-amino-4-merkaptomasowy) jest zarwno produktem demetylacji metioniny, jak rwnie metabolitem porednim bio-
229
syntezy metioniny. Z przemian cysteiny powstaje tauryna (kwas 2-aminoetanosulfonowy), wystpujca w ci w poczeniu z kwasami ciowymi.
NH3+
HS
CH2 CH2
CH 2 CH2 SO3
CH COO
NH 3+
homocysteina
tauryna
Dopa, czyli 3,4-dihydroksyfenyloalanina jest produktem hydroksylacji tyrozyny i jednoczenie prekursorem noradrenaliny i adrenaliny.
H
CH 2 C COO-
HO
NH 3+
HO
dopa
acylo-CoA
CH 3
H
O
+
H 3 C N CH 2 C CH 2 C
O
CH
OH
3
CH 3
H
O
+
H 3 C N CH 2 C CH 2 C
O
CH
O
3
C O
R
karnityna
acylokarnityna
J
O
CH2
C COO
NH3
3,5,3 -trijodotyronina
230
HO
J
O
H
CH2 C COO
NH3+
tyroksyna
HO H
C C COO
H NH
C O
H 3N
NH
CH
O CH2 CH COO
+NH3
O C
+
N N C H
CH2
Cl2 CH
chloramfenikol
cykloseryna
azaseryna
AMINY BIOGENNE
Aminy biogenne, to pochodne aminokwasw, ktre s zwizkami o rnych funkcjach biologicznych, wrd nich s przede wszystkim substancje o charakterze hormonalnym, ale rwnie o wasnociach toksycznych. Aminy biogenne
powstaj w reakcji dekarboksylacji aminokwasw obojtnych lub zasadowych.
Monoaminy pierwszorzdowe powstaj z aminokwasw obojtnych, natomiast
z aminokwasw zasadowych diaminy pierwszorzdowe. Aminy biogenne dzieli si
na: alifatyczne, fenolowe i heterocykliczne.
Aminy alifatyczne dzieli si na monoaminy, diaminy i poliaminy. Monoamin alifatyczn jest etanoloamina (kolamina), ktra wystpuje jako skadnik
kefalin kolaminowych, powstaje z seryny.
COO
+
H 3N C H
H C OH
dekarboksylacja
CO 2
H
+
H 3N C H
H C OH
seryna
etanoloamina
Inn monoamin jest cysteamina, powstajca w wyniku reakcji dekarboksylacji cysteiny, wany skadnik pantoteiny koenzymu A (CoA) i ACP (biaka przenoszcego acyle kompleksu syntazy kwasw tuszczowych).
231
Do diamin alifatycznych nale: 1,3-diaminopropan, kadaweryna (1,5-diaminopentan) i putrescyna (1,4-diaminobutan), ktre s zwizkami o waciwociach trujcych. Stanowi powszechne produkty dziaania bakterii gnilnych i maj
bardzo nieprzyjemny zapach. Czsteczki te powstaj rwnie w tkankach ssakw,
gdzie wystpuj jako skadniki naturalnych poliamin.
COO
+
H 3N C H
H
+
H 3N C H
CH 2
CH 2
dekarboksylacja
CH 2
CH 2
CO 2
CH 2
CH 2
CH 2
+
NH3
CH 2
+
NH3
lizyna
kadaweryna
COO
+
H 3N C H
H
+
H 3N C H
CH 2
CH 2
dekarboksylacja
CH 2
+
H C NH 3
CH 2
+
H C NH 3
CO 2
ornityna
putrescyna (1,4-diaminobutan)
Naturalne poliaminy, spermidyna i spermina, s alifatycznymi polikationami, ktre asocjuj odwracalnie z wewntrzkomrkowymi polianionami, szczeglnie z DNA i RNA. Wykazuj dziaanie biologiczne, polegajce na stymulacji
syntezy DNA i RNA, wpywaj na proliferacj, wzrost i rnicowanie komrek
oraz stymuluj agregacj rybosomw. Jednoczenie s inhibitorami niektrych
enzymw, wrd nich kinaz biakowych. Farmakologiczne dawki poliamin obniaj temperatur i cinienie.
spermidyna
H2
+
H3N
CH2
CH2
N
CH2 +
1,3-diaminopropan
232
CH2
CH2
CH2
putrescyna
CH2 +
NH 3
spermina
H2
+
H3 N
CH 2
CH2
N
CH 2 +
CH2
CH2
1,3-diaminopropan
CH2
CH 2
putrescyna
+
N
H2
CH2
CH 2
CH 2 +
NH 3
1,3-diaminopropan
O2
H
+
N H2
CH3
233
CH
NH
dekarboksylacja
CO2
H
+
N
C H
H3
CH2
C
+
HN
CH
NH
C
H
C
H
histydyna
histamina
~CH3
Serotonina jest stymulatorem skurczu mini gadkich i czynnikiem zwajcym naczynia krwionone. Jest neuroprzekanikiem w niektrych synapsach
w mzgu. Pochodn serotoniny jest melatonina powstajca w szyszynce w wyniku
jej N-acetylacji i O-metylacji grupy hydroksylowej przy C5. Melatonina powoduje
skupianie barwnika w komrkach pigmentowych, melanocytach. Dziaa w tym
zakresie antagonistycznie do intermedyny, czyli malanotropiny. Ponadto, melatonina hamuje wydzielanie gonadotropin poprzez wpyw hamujcy na receptory
liberyn. Hamuje funkcje jajnikw do okresu pokwitania, zapobiegajc przedwczesnemu dojrzewaniu pciowemu. Synteza melatoniny odbywa si gwnie w nocy,
natomiast w dzie jest zablokowana pod wpywem wiata. W krajach poudniowych, o duym nasonecznieniu, wydzielanie melatoniny przez szyszynk jest
obnione. Niskie stenie melatoniny w mniejszym stopniu hamuje uwalnianie
gonadotropin, przypuszczalnie dlatego dojrzewanie pciowe modziey jest szybsze
w tych krajach.
235
14.
PEPTYDY
Iwona ak
Peptydy powstaj w wyniku poczenia wizaniem peptydowym (amidowym) dwch lub wicej aminokwasw. Synteza peptydu biegnie tylko w jednym
kierunku.
Reakcja kondensacji midzy grup -karboksylow jednego aminokwasu,
a grup -aminow drugiego dostarcza dipeptydu, w ktrym oba aminokwasy poczone s wizaniem peptydowym. Dipeptyd zawiera woln grup -aminow
i -karboksylow, dlatego moe reagowa z grup aminow kolejnego aminokwasu, tworzc nowe wizanie peptydowe i przeksztacajc si w tripeptyd. Tripeptyd
nadal zawiera woln grup -aminow i -karboksylow i moe by dalej wyduany o kolejne reszty aminokwasowe. Dugie proste acuchy utworzone z reszt
aminokwasowych poczonych wizaniami peptydowymi mog by oligopeptydami, gdy zawieraj do 25 reszt aminokwasowych, lub polipeptydami, gdy zawieraj
ich ponad 25. Polipeptydy s biakami, gdy maj w swym skadzie 100 lub wicej
reszt aminokwasowych i ktrych masa czsteczkowa jest 10 000 Da lub wysza.
Zgodnie z przyjt konwencj, w kadym zapisie acuchw peptydowych woln
grup aminow umieszcza si po lewej stronie, woln grup karboksylow po prawej, natomiast cznik midzy resztami aminokwasowymi oznacza wizanie peptydowe.
Rwnowaga reakcji kondensacji aminokwasw jest silnie przesunita w kierunku odwrotnym, dlatego aby nastpia synteza wiza peptydowych wymagana jest znaczna ilo energii swobodnej oraz obecno aktywnych form aminokwasw. Aktywnymi formami aminokwasw, podczas biosyntezy polipeptydw
w organizmie, s aminoacylo-tRNA. Wikszo peptydw wystpujca w organizmach wyszych powstaje w wyniku kontrolowanego proteolitycznego rozszczepienia duszych polipeptydw, ktre zostay zsyntetyzowane zgodnie z informacj
zakodowan w DNA. Niektre di- i tripeptydy mog powstawa w wyniku bezporednich pocze aktywnych pochodnych kwasowych, tak jak to ma miejsce, np.
podczas syntezy glutationu (aktywowane ATP: grupa -karboksylowa glutaminianu i grupa karboksylowa cysteiny). W wyniku bezporednich pocze aminokwasowych powstaj u bakterii antybiotyki peptydowe zawierajce od 2 do 15 lub
wicej reszt aminokwasowych. Proces zachodzi na specyficznym kompleksie en236
N
+
forma
ketonowa
forma
enolowa
H
C
N
C'
paszczyzna wizania
peptydowego
COO
CH
CH2 H2 C
CH2
+
NH3
karnozyna
+
NH 2
N
COO
CH
CH2 H2 C
CH2
+
NH3
CH3
+
NH
N
anseryna
Karnozyna, czyli N-(-alanylo)histydyna, w znacznych ilociach wystpuje w miniach szkieletowych wyszych krgowcw i czowieka. Wzmaga aktywno ATP-azy miozynowej oraz chelatuje jony Cu+2 i pobudza pobieranie zwizkw miedzi.
Homokarnozyna, czyli (N-(4-aminobutyrylo)histydyna, jest dipeptydem
orodkowego ukadu nerwowego, wystpujcym w tkance mzgowej, ktrego
funkcja nie jest znana.
Anseryna, czyli -metylokarnozyna N-(3-aminopropionylo)--metylohistydyna), wystpuje w miniach szkieletowych wyszych krgowcw, ktre odznaczaj si szybk czynnoci skurczow, np. minie koczyn krlika lub minie
piersiowe ptakw. Anseryny brak w miniach czowieka. U niszych krgowcw,
np. u ryb kostnoszkieletowych wystpuje ona w znacznych ilociach, w porwnaniu ze ladow iloci karnozyny.
Biologicznie aktywnym tripeptydem jest tyreoliberyna, czyli pobudzajcy
czynnik produkowany przez podwzgrze. Tyreoliberyna (piroglutamylohistydyloprolinamid) pobudza uwalnianie tyreotropiny przez przedni pat przysadki.
238
H 2C
O C
CH2 O
CH
O
CH
N
H
CH 2
CH2
CH2
CH
CH2
CONH 2
HC C
+
H N NH
C
H
C N CH2
C N
CH
H2C
H2C SH
COO
2H
forma zredukowana
(GSH)
C N CH2
CH
H2C
H2C
+
HC NH3
COO
O H
H2C
H2C
2H
+
HC NH3
COO
glutation
H O
- COO OOC CH2 N C H O
HC N C
CH2
CH2
CH2
+
H3N CH
OOC
239
A sp
A gr
V al
T yr
Ile
H is
P ro
P he
angiotensyna II
Angiotensyna II zwa naczynia krwionone i jest najsilniejszym czynnikiem podwyszajcym cinienie krwi. Pobudza kor nadnerczy do syntezy aldosteronu, ktry zwiksza resorpcj zwrotn jonw Na+ w nerkach, przeciwdziaajc ich
utracie wraz z moczem.
Bradykinina to nonapeptyd, ktry rozszerza naczynia krwionone i obnia
cinienie krwi, zatem dziaa antagonistycznie do angiotensyny II. Odpowiedzialna
jest rwnie za uczucie blu, ktry towarzyszy uszkodzeniu (zranieniu) skry.
Bradykinina stanowi typow kinin powstajc ze specjalnych biaek, kininogenw, nalecych do 2-globulin osocza pod wpywem swoistych enzymw proteolitycznych, zwanych kalikreinami.
A rg
P ro
P ro
G ly
P he
Ser
P ro
P he
A rg
bradykinina
Nonapeptydami wykazujcymi aktywno hormonw klasycznych s wazopresyna i oksytocyna, produkowane w podwzgrzu, a magazynowane w tylnym
pacie przysadki mzgowej. Maj prawie identyczn sekwencj aminokwasow,
rni si jedynie dwoma aminokwasami, dlatego hormony te wywouj pewne
wsplne efekty biologiczne.
Wazopresyna (hormon antydiuretyczny, ADH) zwiksza wchanianie zwrotne wody w dystalnych kanalikach nerkowych. Niedobr ADH prowadzi do moczwki prostej.
Cys
Tyr
Pro
+
Arg
Gly NH3
(Lys)
wazopresyna
Tyr
S
Ile
Gln
Asn Cys
S
oksytocyna
240
Pro
Leu Gly
+
NH3
Niektre peptydy wykazuj aktywno biologiczn antybiotykw. Antybiotyki peptydowe maj bardzo charakterystyczn cykliczn struktur i mog zawiera D-aminokwasy.
Penicylina jest produkowana przez ple Penicillium, gdzie powstaje z waliny i cysteiny, ktre tworz czteroczonowy piercie -laktamowy i piercie tiazolidynowy. Do piercienia -laktamowego przyczana jest wizaniem peptydowym zmienna grupa kwasowa (R), ktra moe by rna i przez to rne s rodzaje penicylin, np. w benzylopenicylinie jest ni grupa benzylowa. Penicylina,
poprzez reaktywny piercie -laktamowy zawierajcy wizanie peptydowe, nieodwracalnie hamuje transpeptydaz glikopeptydow kluczowy enzym w syntezie
cian komrek bakterii.
R
C O
H3 C
H3 C
-
OOC
H N
S H
C
C
C H
C
C
O
piercie
laktamu
piercie
tiazolidyny
penicylina
H2C
reszta benzylowa
Pro
Pro
D
O Thr
Val
O
C
MeVal
Val
O
Thr O
C
NH2
N
D
O
Sar
- sarkozyna
MeVal - N-metylowalina Val
Sar
CH3
O
CH3
aktynomycyna D
241
Lac mleczan
Hiv hydroksyizowalerianian
walinomycyna
242
Orn ornityna
gramicydyna S
Gramicydyna A jest rwnie polipeptydowym antybiotykiem jonoforowym, zbudowanym z 15 naprzemiennie wystpujcych reszt L- i D-aminokwasowych, ktry na N-kocu ma grup formylow. Przyjmuje stuktur -helisy.
O
H
C
(D)-Leu (L)-Ala
(D)-Val
(L)-Val
(L)-Trp (D)-Leu
(L)-Trp (D)-Leu
(L)-Trp
(D)-Leu
(D)-Val
15
(L)-Trp
C O
N H
CH2
CH2
OH
gramicydyna A
Poprzez N-formylowe koce dwa takie polipeptydy cz si, tworzc dimeryczny, funkcjonalny kana jonowy dla kationw jednowartociowych (np. Na+),
lecz nie dla dwuwartociowych. Kana ten spontanicznie otwiera si i zamyka,
przepuszczajc w cigu sekundy ponad 107 kationw. Por tego kanau wycielony
jest polarnymi grupami karbonylowymi peptydu, a hydrofobowe acuchy boczne
ustawione s na obwodzie kanau. Uoenie to umoliwiaj zestawione naprzemienne reszty L- i D-aminokwasowe.
243
15.
POLIPEPTYDY I BIAKA
Iwona ak
244
szkielet polipeptydowy
H
N
H3 N
N
H
H
N
O
N
H
H
N
O
R
N
H
C - koniec
H
N
O
N
H
H
N
O
10
11
H
N
N
H
12
wego stercz acuchy boczne aminokwasw (R). Najpowszechniejszymi sposobami fadowania polipeptydw s -helisa i struktura-, czyli harmonijkowa lub
pofadowanej kartki. W -helisie paszczyzny wiza peptydowych ukadaj si
spiralnie w ten sposb, e s styczne do hipotetycznego walca. Dziki temu powstaje cylindryczna struktura, utworzona ze szkieletu polipeptydu, od ktrej na
boki stercz acuchy boczne aminokwasw (R). Przekrj poprzeczny -helisy
przedstawiono na poniszym rysunku. Na jeden skok -helisy przypada 3,6 reszt
aminokwasowych. Odlegoci midzy ssiednimi resztami aminokwasowymi wynosz 0,15 nm wzdu osi helisy, a caa dugo skoku rwna si 0,54 nm. Struktura -helisy jest najkorzystniejsza energetycznie, stabilizowana wieloma wizaniami wodorowymi. Wizania wodorowe tworzone s midzy atomem tlenu karbonywizanie wodorowe
O
C
H
C
N
R1
C
O
C
H
R3
R2
N
N
H
C
O
R4
246
oddziaywania hydrofobowe
mostek
oddziaywanie wizanie wodisiarczkowy jonowe
dorowe
Oddziaywania te sprawiaj, e liniowe rejony szkieletu polipeptydowego (o konformacji helikalnej lub harmonijkowej) zginaj si i faduj w przestrzeni tak, e
zbliaj do siebie odlege liniowo sekwencje. Rozpuszczalne polipeptydy zazwyczaj przybieraj ksztat globularny. rodowisko sprzyja fadowaniu acucha polipeptydowego. Utrzymywanie na powierzchni sekwencji hydrofobowych, zwrconych do rodowiska hydrofilnego jest niekorzystne energetycznie. Woda wypycha ze swego otoczenia niepolarne acuchy boczne aminokwasw, dziki temu sekwencje zawierajce te aminokwasy chowaj si w hydrofobowym wntrzu makroczsteczki, natomiast wikszo polarnych sekwencji z acuchami
bocznymi obdarzonymi adunkami pozostaje na powierzchni struktury trzeciorzdowej. Zupenie odmienna sytuacja moe mie miejsce w obrbie struktury
trzeciorzdowej integralnego biaka bonowego. Zwykle powierzchnia zwrcona
do dwuwarstwy lipidowej takiego biaka jest hydrofobowa, a jego wntrze hydrofilne.
Ostateczny ksztat polipeptydu moe by dwojaki, globularny lub fibrylarny.
Globularne polipeptydy maj ksztat zbliony do kulistego, natomiast fibrylarne
polipeptydy maj ksztat wyduony, prosty. Niektre polipeptydy posiadaj regiony o sekwencji 40100 reszt aminokwasowych, zdolne do tworzenia odrbnej trjwymiarowej struktury niezalenej od struktury pozostaej czci makroczsteczki,
zarwno pod wzgldem strukturalnym jak i funkcjonalnym.
Regiony te zwane s moduami peptydowymi (ryc. 1), a biaka zawierajce
zestaw kilku rnych moduw biakami mozaikowymi.
Struktura moduu ma stabilny globularny ksztat, odmienny od reszty czsteczki, ktry pozostaje zachowany po wyizolowaniu jednostek z natywnego bia247
modu EGF-podobny
(G)
modu CCP
(C)
modu Ig (I)
immunoglobulinowy
modu fibronektynowy
typ I (F1)
Ryc. 1. Konformacje przestrzenne niektrych moduw biakowych (wg. 27, zmodyfikowane). Rejony o strukturze przedstawiono w postaci paskich strzaek.
248
249
dowisku naturalnym organizmu ( ukad in vivo) lub w rodowisku, ktre odpowiada warunkom naturalnym, ale poza organizmem (ukad in vitro).
Denaturacja biaek
Denaturacja polega na zniszczeniu (w rnym stopniu) struktury drugo-,
trzecio- lub czwartorzdowej biaka, czyli natywnej konformacji, czego konsekwencj jest utrata specyficznych biologicznych aktywnoci biaek.
Denaturacja biaek zachodzi pod wpywem rnych czynnikw, zarwno
chemicznych jak i fizycznych. Zjawisko to obserwujemy pod wpywem wysokiej
temperatury, mocnych kwasw lub zasad nieorganicznych, niektrych kwasw
organicznych, rozpuszczalnikw organicznych, takich jak: alkohol lub aceton
w temperaturze pokojowej, oraz kationw metali cikich. W zalenoci od intensywnoci dziaania tych czynnikw (w tym czasu oddziaywania), wielko zmian
denaturacyjnych moe by rna, od minimalnych do cakowitego zniszczenia
oddziaywa stabilizujcych konformacj biaka. Z drugiej strony, jedne biaka s
bardziej wraliwe na czynniki denaturujce (np. lipoproteiny), inne s stosunkowo
stabilne (np. albuminy).
Czynnikami denaturujcymi, czsto wykorzystywanymi w badaniach dowiadczalnych s roztwory: 8M mocznika lub 6M chlorowodorku guanidyny, ktre
zrywaj w biaku wizania niekowalencyjne.
O
H2N C NH2
mocznik
NH2+ClH2N C NH2
chlorowodorek guanidyny
Wanym czynnikiem denaturujcym jest anionowy detergent siarczan dodecylu sodu (SDS), ktry niszczy niemal wszystkie oddziaywania niekowalencyjne
w natywnych biakach. Aniony SDS wi si w stosunku jeden anion na dwie
reszty aminokwasowe, nadajc powstaemu kompleksowi SDS ze zdenaturowanym
biakiem duy ujemny adunek, ktry jest znacznie wyszy ni natywnego biaka
i w przyblieniu jest proporcjonalny do masy czsteczkowej biaka.
Czynniki redukujce biaka: -merkaptoetanol i ditiotreitol, mog cakowicie redukowa mostki disiarczkowe w biaku do grup SH i wraz z mocznikiem
sprawia, e acuch polipeptydowy przybiera konformacj kbka statycznego.
251
OH OH
HO
CH2 CH2 SH
merkaptoetanol
HS
CH2 CH CH
CH2 SH
ditiotreitol
252
CH
R
N
CH3
CH
CH
pH 8-9
C H C OOH
te tra p e p tyd
2 ,4 -d in itro -1 -flu o ro b e n ze n
O 2N
HF
N O2
O 2N
CH
CH3
N O2
6 M HCl
R
N
H
CH
H
C
O
CH
R
N
N O2
R
N
CH
C OOH
h yd ro liza
H
O 2N
CH
C OOH
3 H 2N
CH
C OOH
CH3
N -D N P -a la n in a
CH
R
N
CH3
H
C
CH
CH
N CH
H
C OOH
te tra p e p tyd
ch lo re k d a n s ylu
H 3C
CH3
N
HCl
CH3
H 3C
SO 2C l
H
N
SO 2
H 3C
CH
R
N
CH
CH3
6M HCl
h yd ro liza
H
C
O
O
CH
R
N
CH
C
O
CH3
N
R
3 H 2N
CH
C OOH
H
SO 2
dansyloalanina
CH
C OOH
CH3
OH
CH3
N CH
N CH
R
N CH COOH
tetrapeptyd
chlorek dabsylu
H3C
N
H
H3C
H3C
SO2 N
CH
CH3
6M HCl
R
N
H
H
N
SO2Cl
CH
H
C
O
CH
R
N C H C OH
H
hydroliza
H3C
H3C
H3C
HCl
SO2
R
CH COOH
3 H2N CH COOH
CH3
dabsyloalanina
Mimo duej czuoci wikszoci omwionych metod oznaczania aminokwasw N-kocowych, nie mona ich stosowa wielokrotnie do analizy tej samej prby polipeptydu, poniewa podczas hydrolizy kwasowej polipeptyd ulega cakowitej degradacji do wolnych aminokwasw.
255
CH
R
N CH
CH
R
N CH COOH
H2N
hydrazyna
tetrapeptyd
O
3 H2N
CH
R
NH2
N NH2
H2 N CH COOH
H
hydrazydy
Alternatywn drog prowadzc do identyfikacji C-kocowego lub N-kocowego aminokwasu stanowi hydroliza enzymatyczna polipeptydu z zastosowaniem specyficznych egzopeptydaz, mianowicie karboksypeptydaz, ktre odszczepiaj po jednej reszcie aminokwasowej od C-koca poczwszy, lub aminopeptydaz
odszczepiajcych kolejne reszty od N-koca. Karboksypeptydaza A charakteryzuje
si szerok specyficznoci, z C-koca polipeptydu najszybciej uwalnia Tyr, Phe,
Trp, Leu, Ile, Met, Thr, Gln, His, Ala, Val, nie uwalnia Pro, ani Arg, natomiast
pozostae aminokwasy odcza wolno lub bardzo wolno. Karboksypeptydaza B
odcza od C-koca polipeptydu tylko aminokwasy zasadowe. W degradacji enzymatycznej ideaem byoby, gdyby enzym odszczepia tylko jeden aminokwas (od
C- lub N-koca) i dalej nie dziaa, jednak tak nie jest, poniewa enzym po odszczepieniu jednego aminokwasu zaraz odszczepia nastpny, ktry pojawi si na
kocu. Dlatego produkt reakcji enzymatycznej stanowi mieszanina wolnych aminokwasw i oligopeptydw.
Wszystkie powysze sposoby postpowania wymagaj stosunkowo duej
iloci biaka do analiz, co nie zawsze da si osign, wwczas jest to ujemna strona wszystkich omwionych wyej metod analizy polipeptydw.
256
Idealn reakcj pozwalajc na ustalenie sekwencji aminokwasw od N-koca polipeptydu jest degradacja Edmana, ktra polega na reakcji znakowania
N-kocowego aminokwasu fenyloizotiocjanianem, ktry w rodowisku zasadowym reaguje z woln grup -aminow, tworzc fenylotiokarbamylow pochodn
peptydu (ryc. 6). W rodowisku lekko kwanym z pochodnej tej odszczepia si 2-fenylo-2-tiohydantoinowa (PTH) pochodna N-kocowego aminokwasu i jednoczenie uwalnia si peptyd pomniejszony o jeden aminokwas (N-kocowy). Skrcony o jedn reszt aminokwasow peptyd moe zosta poddany kolejnemu cykloO
H2N
CH
CH3
N CH
CH
N CH COOH
tetrapeptyd
fenyloizotiocyjanian
N
OH-
S H
C N
O
CH
CH 3
R
N CH
H
C
CH
R
N CH COOH
R
H
O
fenylotiokarbamylowa pochodna tetrapeptydu
H+
NH
CH
S
H2N
CH
C
O
O
CH
R
N CH COOH
H
tripeptyd
CH3
PTH-alanina
257
wi znakowania i odszczepiania. Uwolnione PTH-aminokwasy mog by zidentyfikowane chromatograficznie, np. wysokocinieniow chromatografi cieczow
(HPLC). Technika sekwencjonowania biaek zostaa zautomatyzowana, automat
sucy do ustalania sekwencji aminokwasw nazywa si sekwenatorem, w ktrym
degradacj Edmana prowadzi si w fazie staej. Technika zostaa udoskonalona do
tego stopnia, e jest moliwe poznanie sekwencji okoo 50 aminokwasw od N-koca polipeptydu, wykorzystujc pikomolowe iloci materiau wyjciowego.
W celu ustalenia sekwencji dugiego polipeptydu naley go najpierw rozci
na mniejsze fragmenty skadajce si z 2050 reszt, ktre po rozdzieleniu poddaje
si sekwencjonowaniu. Specyficzne pocicie polipeptydu mona osign metodami chemicznymi lub enzymatycznymi.
Specyficzn chemiczn hydroliz polipeptydu mona przeprowadzi bromocyjanem (BrCN), ktry rozrywa wizanie peptydowe utworzone przez grup
karboksylow metioniny (ryc. 7). W wyniku tej reakcji metionina zostaje przeksztacona w lakton homoseryny, znajdujcy si na C-kocu jednego z dwch pep-
CH
CH
C H2
C H2
CH
CH
S
C H3
BrC N
CH
C H2
C H2
S+
CH
CN
C H3
CH
O
C
CH
H2C
CH
O
C
H+
H 2O
CH
O
CH
H2C
H 2N
CH
C
H
l akton ho m oseryny
peptydy chymotrypsynowe
Asn-Val-Lys-Ala-Gly-Trp
Gly-Lys
peptydy trypsynowe
Asn-Val-Lys-Ala-Gly-Trp-Gly-Lys
wystarczy do okrelenia sekwencji caego analizowanego biaka, ktrym jest pojedynczy polipeptyd.
Ustalenie sekwencji biaka oligomerycznego jest bardziej skomplikowane,
poniewa naley najpierw doprowadzi do dysocjacji poszczeglnych podjednostek polipeptydowych. Jeli podjednostki poczone s tylko wizaniami niekowalencyjnymi, wystarczy zastosowa czynniki denaturujce, takie jak roztwr 8M
mocznika lub roztwr 6M chlorowodorku guanidyny, eby doprowadzi do ich
dysocjacji.
Pod wpywem czynnikw denaturujcych struktura biaka zostaje czciowo
rozpleciona, dziki zerwaniu wiza niekowalencyjnych, i poszczeglne acuchy
polipeptydowe przyjmuj konformacj kbka statycznego. Jeli istniej w biaku
wizania disiarczkowe, naley je zerwa na drodze redukcji biaka, takimi zwizkami s -merkaptoetanol i ditiotreitol.
-Merkaptoetanol zrywa odwracalnie mostki disiarczkowe w biaku, tworzc mieszane mostki z acuchami bocznymi cysteiny. Przy znacznym nadmiarze
-merkaptoetanolu mieszane mostki disiarczkowe ulegaj dalszej redukcji do wolnych grup sulfhydrylowych w polipeptydach.
Podobne rozdzielenie acuchw polipeptydowych poczonych wizaniami
disiarczkowymi osiga si stosujc ditiotreitol.
Dla zabezpieczenia reszt cysteinowych przed rekombinacj przeprowadza
si ich alkilowanie jodooctanem do stabilnej S-karboksymetylowej pochodnej cysteiny.
R CH2 SH
JCH2COO- jodooctan
JR CH 2 S CH 2 COO-
Uwolnione polipeptydy rozdziela si np. chromatograficznie, po czym mona realizowa procedur, zmierzajc do ustalenia ich sekwencji, omwion wyej.
260
261
Rozmieszczenie
wewntrzkomrkowe,
zewntrzkomrkowe
Wystpowanie
w narzdach
Wystpowanie
w organellach
proste;
zoone:
glikoproteiny, lipoproteiny,
metaloproteiny, fosfoproteiny,
nukleoproteiny, chromoproteiny
Oglny ksztat,
rozpuszczalno i adunek
globularne (kuliste)
biaka obojtne: (albuminy, globuliny)
kwane (prolaminy, gluteliny)
zasadowe (histony, protaminy)
fibrylarne (wkienkowe, skleroproteiny)
BIAKA GLOBULARNE
Biaka globularne s rozpuszczalne w wodzie i rozcieczonych roztworach
soli. Ich czsteczki maj ksztat kulisty lub elipsoidalny. Zwarta struktura wynika
262
ze specyficznego pofadowania acucha polipeptydowego, spowodowanego w duym stopniu przez oddziaywania hydrofobowe midzy niepolarnymi resztami
aminokwasowymi, lokalizowanymi we wntrzu struktury globularnej. Na powierzchni makroczsteczki znajduj si hydrofilne reszty aminokwasowe otoczone
powok hydratacyjn, ktra zapewnia cisy kontakt biaka z rozpuszczalnikiem
(wod) i stanowi podstaw dobrej rozpuszczalnoci biaek globularnych. Biakami
globularnymi s wszystkie enzymy, biaka krwi (z wyjtkiem fibrynogenu) i pozostaych pynw biologicznych oraz wikszo innych biaek aktywnych biologicznie. Globularnymi biakami zasadowymi s histony oraz polipeptydy protaminy,
ktre oddziauj z kwasami nukleinowymi.
HISTONY
Histony to biaka zasadowe jder komrkowych i jednoczenie najsilniej dodatnio naadowane w roztworach o pH okoo 7, wrd dotd poznanych biaek,
poza protaminami. Histony maj nisk mas czsteczkow rzdu 11 00023 000
(najwikszy jest histon H1) oraz punkt izoelektryczny (pI), mieszczcy si w granicach 1011. W strukturze pierwszorzdowej wykazuj przewag sumy aminokwasw zasadowych nad kwanymi. Charakteryzuj si znaczn zawartoci reszt
lizynowych i argininowych. Wartoci stosunkw molowych lizyny do argininy s
podstaw wyrniania trzech frakcji histonowych: VLR, SLR i AR.
Histony silnie lizynowe (ang. very lysine-rich; VLR) cechuj wartoci stosunku molowego Lys/Arg powyej 4.
Histony umiarkowanie lizynowe (ang. slightly lysine-rich; SLR) cechuj
wartoci stosunku molowego Lys/Arg w granicach od 1 do 4.
Histony argininowe (ang. arginine rich; AR) cechuj wartoci stosunku molowego Lys/Arg poniej jednoci.
W skadzie aminokwasowym histonw brak jest reszt tryptofanu, cysteiny
(z wyjtkiem histonu H3), mao znajduje si tyrozyny i fenyloalaniny. Nieznaczne
iloci aminokwasw aromatycznych sprawiaj, e histony odznaczaj si niskim
pochanianiem wiata w nadfiolecie.
Histony klasyfikuje si w 5 klas, rnicych si rozmiarem, skadem aminokwasowym i dodatnim adunkiem. Histony okrela si liter H z odpowiednim
znakiem numerycznym klasy, mianowicie: histony H1 (silnie lizynowe), histony
H2A i H2B (umiarkowanie lizynowe), histony H3 i H4 (argininowe). W erytrocytach jdrzastych wystpuje histon H5 (silnie lizynowy), ktry jest alternatywn
form (skrajnym wariantem) H1. Histon H5 wie si szczeglnie silnie z DNA
chromatyny nie ulegajcej transkrypcji. Histony H3 s jedynymi, ktre zawieraj
reszty cysteiny uczestniczce w tworzeniu mostkw disiarczkowych.
263
Struktura pierwszorzdowa wikszoci histonw jest konserwatywna i zachowawcza. Najbardziej konserwatywn struktur pierwszorzdow ma histon H4,
ktry pozbawiony jest cakowicie specyficznoci gatunkowej. Najbardziej zmienn
sekwencj aminokwasow ma histon H1 zarwno w obrbie jednego gatunku, jak
i midzy gatunkami.
Histony s zasocjowane z jdrowym DNA komrki eukariotycznej, wsptworzc jego nukleosomaln struktur. Histony H2A, H2B, H3 i H4 (po dwie czsteczki z kadego) oddziauj ze sob, tworzc oktamer histonowy, na ktrym nawinita jest helisa DNA nukleosomu. Histon H1 znajduje si poza oktamerem,
oddziauje zewntrznie z nici DNA i atwo oddysocjowuje. Moe by zastpowany przez histon H5, w szczeglnie nieaktywnej chromatynie, tak jak np. w erytrocytach ptakw. Histony maj wpyw na zmian stabilnoci konformacji chromatyny (euchromatynaheterochromatyna), midzy innymi poprzez wykorzystywanie
alternatywnych odmian histonw oraz poprzez modyfikacje chemiczne (acetylacja), ktrym ulegaj histony.
Histony, w odrnieniu od protamin, daj si wytrca amoniakiem z kwanego ekstraktu, poniewa s nierozpuszczalne (z wyjtkiem histonw z przewag
lizyny) w nadmiarze tego rozpuszczalnika. Rozpuszczaj si natomiast w nadmiarze alkaliw nieorganicznych oraz s kwasorozpuszczalne.
PROTAMINY
Protaminy s silnie zasadowymi polipeptydami zwizanymi z DNA, szczeglnie w komrkach spermy, gdzie stanowi ostateczny produkt przeksztace
skadnikw biakowych, towarzyszcych spermatogenezie. Podczas spermatogenezy i spermiogenezy, szczeglnie w tworzonych gwkach plemnikw, ma miejsce
zastpienie histonw somatycznych protaminami. Najlepiej poznano waciwoci
protamin spermy ryb, ktre charakteryzuj si nisk mas czsteczkow, rzdu
40005000 oraz niewielk liczb reszt aminokwasowych w acuchu polipeptydowym (okoo 30), z czego 50% stanowi reszty argininy, decydujce o wybitnej
zasadowoci protamin. Polipeptydy te pozbawione s aminokwasw kwanych,
cysteiny, histydyny i lizyny.
Protaminy ssakw maj wysz mas czasteczkow i bardziej zrnicowany
skad aminokwasowy, poniewa zawieraj reszty cysteiny, histydyny, lizyny, a nawet aminokwasy kwane.
BIAKA FIBRYLARNE
Biaka fibrylarne s praktycznie nierozpuszczalne w wodzie i w rozcieczonych roztworach soli, z wyjtkiem rozpuszczalnego fibrynogenu osocza krwi. Cha-
264
rakteryzuj si rwnolegym uoeniem polipeptydw, w postaci dugich wkienek tworzcych elementy strukturalne, szczeglnie tkanki cznej.
Wewntrzkomrkowymi biakami fibrylarnymi s keratyny- i keratyny-.
Keratyna- jest zbudowana z trzech prawoskrtnych helis zwinitych wok siebie
w postaci lewoskrtnego superhelisu.
Zewntrzkomrkowymi biakami fibrylarnymi s kolageny i elastyna. Dotychczas opisano ponad 10 gwnych typw kolagenw. Kolageny s glikoproteinami, przewanie o niewielkiej zawartoci cukrw.
Biaka kolagenowe stanowi 2040% wszystkich biaek zwierzcych. Powszechnie wystpuj w skrze, cignach, wizadach, chrzstkach, kociach, zbach i innych rodzajach tkanki cznej, gdzie stanowi gwne tworzywo wkien
klejodajnych (kolagenowych). Elastyna stanowi tworzywo wkien sprystych,
ktre s bardzo rozcigliwe.
Kolageny s biakami nierozpuszczalnymi, ktre charakteryzuj si du
wytrzymaoci na rozciganie. Zerwanie wkna o rednicy 1 mm wymaga obcienia, co najmniej 10 kg.
Nierozpuszczalno kolagenu i elastyny wynika z ich usieciowania kowalencyjnymi wizaniami poprzecznymi (krzyowymi). Brak tego usieciowania w kolagenie modych zwierzt sprawia, e mona go izolowa w formie rozpuszczalnej.
Powtarzajcym si elementem w kolagenie jest tropokolagen, czsteczka o ksztacie sztywnej liny o dugoci okoo 300 nm, rednicy 1,5 nm i masie czsteczkowej
okoo 300 000. Tropokolagen tworz trzy lewoskrtne helisy zwinite wok siebie
w prawoskrtny superhelis.
LIPOPROTEINY
Lipoproteiny (Lp) s globularnymi, zoonymi czstkami, ktre transportuj
w pynach ustrojowych hydrofobowe triacyloglicerole, estry cholesterolu i cholesterol. W ich strukturze mona wyrni amfipatyczn powok, utworzon przez
biaka, zwane apolipoproteinami (apoLp), fosfolipidy i cholesterol. Powoka ta
otacza hydrofobowy rdze lipoprotein zoony z triacylogliceroli i estrw cholesterolu. Lipoproteiny klasyfikuje si na podstawie rnic w ich podstawowej wasnoci fizycznej, ktr jest gsto, na pi gwnych klas: chylomikrony, lipoproteiny
o bardzo maej gstoci (VLDL), lipoproteiny o poredniej gstoci (IDL), lipoproteiny o maej gstoci (LDL) i lipoproteiny o duej gstoci (HDL). Ogln charakterystyk gwnych klas dojrzaych form lipoprotein osocza krwi zestawiono
w tabeli 2.
Rnice w gstoci poszczeglnych klas lipoprotein wynikaj przede wszystkim z rnej proporcji skadnika lipidowego do biakowego, tj. odmiennego skadu ilociowego. Poza skadem ilociowym lipoproteiny rni si skadem jako
265
266
AI
Masa
czsteczkowa
(kDa)
28,3
Gwne miejsce
powstawania
jelito, wtroba
AII
17,0
wtroba, jelito
AIV
B48
46,0
265,0
jelito
jelito
chylomikro-
550,0
wtroba
CI
6,5
wtroba
aktywator LCAT
CII
8,8
wtroba
CIII
8,9
wtroba
wystpujc w lipoproteinach
zawierajcych apoE zapobiega
wizaniu apoE z receptorem
apoE stanowi to sposb na
zapobieganie przedwczesnemu
usuwaniu z krenia chylomikronw, VLDL, IDL
20,0
wtroba ?
39,0
wtroba
(-1,-2,-3,-4)
gdzie:
LCAT acylotransferaza lecytyna: cholesterol;
LRP (ang. LDL receptor related protein) biako podobne do receptora LDL
267
268
GLIKOPROTEINY
Glikoproteiny s biakami, ktre maj wglowodany kowalencyjnie przyczone do czci polipeptydowej. Wrd biaek zoonych s najliczniejsz i najpowszechniejsz grup. Wrd glikoprotein s zarwno biaka globularne, jak i fibrylarne. Wiele enzymw, hormonw, biaek transportowych, immunoglobulin,
biaek wydzielin luzowych, biaek osocza, biaek bon plazmatycznych podstawnych wycznie z typowymi biakami strukturalnymi macierzy pozakomrkowej,
np. kolageny, naley do glikoprotein.
Komponenty cukrowe glikoprotein mog spenia rnorodne funkcje, m.in.
utrzymuj waciw konformacj acuchw polipeptydowych, ochraniaj je przed
rozpadem proteolitycznym, determinuj czas ptrwania glikoprotein w pynach
ustrojowych i uatwiaj transport biaka zarwno wewntrz, jak i na zewntrz komrki. Wi rne patogeny, np. bakterie i wirusy. Peni one rol determinant
antygenowych i uczestnicz w zjawiskach biologicznego rozpoznawania i adhezji,
przyczyniajc si do biologicznej specyficznoci komrkowej, narzdowej, osobniczej i gatunkowej.
W zalenoci od typu wiza glikozydowych obecnych w glikoproteinach,
biaka te podzielono umownie na:
glikoproteiny typu surowiczego, w ktrych skadniki wglowodanowe s poczone przede wszystkim wizaniem N-glikozydowym z polipeptydem; ta
zwyczajowa nazwa przyjta dla biaek surowicy (bdcych w wikszoci glikoproteinami, ktre maj przede wszystkim ten typ wizania, cho zawieraj czasami rwnie wizania O-glikozydowe) obejmuje take wiele innych biaek nie
wystpujcych w surowicy, w tym take glikoproteiny bonowe i macierzy pozakomrkowej;
glikoproteiny typu mucyny, zawierajce wizanie O-glikozydowe poprzez
-GlcNAc;
glikoproteiny typu proteoglikany, zawierajce glikozoaminoglikany poczone wizaniem O-glikozydowym, utworzonym przez ksyloz i reszt seryny lub
treoniny, cho niektre zawieraj rwnie inne wizania O-glikozydowe i/lub
N-glikozydowe;
glikoproteiny typu kolagenu, typowe biaka strukturalne, zawierajce unikalne alkalistabilne wizanie O-glikozydowe.
Glikoproteiny zawierajce reszty kwasw sjalowych w swych jednostkach
oligosacharydowych zwyczajowo nazywane s sjaloglikoproteinami, a pozbawione
tego monocukru asjaloglikoproteinami.
Indywidualne glikoproteiny zazwyczaj skadaj si z szeregu izoform.
Istnienie rnych izoform tej samej glikoproteiny wynika przede wszystkim z rnorodnoci struktury ich oligosacharydw. Mikroheterogenno oligosacharydowa
269
wynika rwnie z rnych proporcji midzy oligosacharydami obojtnymi i kwanymi oraz odmiennej zawartoci w nich nonikw adunkw ujemnych. Heterogenno oligosacharydw glikoprotein moduluje funkcje biologiczne tych makroczsteczek, czyli bioaktywno.
Zrnicowanie oligosacharydw dotyczy poszczeglnych glikoprotein w obrbie jednego, ale rwnie w obrbie rnych gatunkw. Odmienno oligosacharydw glikoprotein moe rwnie dotyczy rnych etapw ontogenezy.
Masa czsteczkowa glikoprotein waha si w szerokich granicach, np. od
14 500 Da dla rybonukleazy B do 2106 Da dla wikszoci mucyn. Zawarto wglowodanw w glikoproteinach moe waha si od okoo 0,4 do 85% masy. Na pojedynczy acuch polipeptydowy przypada moe jedna jednostka oligosacharydowa, jak np. w acuchu cikim immunoglobuliny IgG, kilka jednostek, jak np.
w 1-kwanej glikoproteinie, w pojedynczych podjednostkach ludzkiej gonadotropiny kosmwkowej (hCG), kilkanacie
jednostek, jak np. w 2-makroglobulinie,
a nawet kilkaset, jak w mucynach z gruczow podszczkowych, luzu drg odkowo-jelitowych, tchawiczo-oskrzelowych i szyjki macicy.
Glikoproteiny typu surowiczego
nale do biaek globularnych, ktrych
ksztat zazwyczaj jest sferyczny, jak np.
w przedstawionym obok modelu hCG .
Glikoproteiny typu mucyny s zasadniczymi skadnikami kadej wydzieliny luzowej, warunkujcymi wasnoci fizykochemiczne luzu. Mucyny maj powinowactwo do kationw dwu- i trjwartociowych, lipidw, lekw o strukturze
trzeciorzdowych amin oraz wi wolne rodniki tlenowe i hydroksylowe. Mucyny
mog mie budow podjednostkow, zwykle zoon z czterech monomerw, jak
np. mucyny przewodu pokarmowego, ktrej model strukturalny przedstawiono
poniej.
Czsteczka mucyny ze luzu odkowego ma charakterystyczny rozpostarty ksztat podobny do skrzyde wiatraka, utworzony przez cztery monomery poczone wizaniami disiarczkowymi. Pojedynczy monomer mucyn przewodu pokarmowego przypomina szczotk do butelek, ktrej trzonek stanowi nieglikozylowany region polipeptydu (ok. 25%) o strukturze globularnej, wraliwej na dziaanie enzymw proteolitycznych. Reszt polipeptydu (ok.75%) stanowi region bardzo gsto glikozylowany, ktry oporny jest na dziaanie proteaz. Konformacja
270
REDUKCJA
REDUKCJA
Trypsyna
Trypsyna
NH2
COOH
II
III
IV
dermalnego czynnika wzrostowego (EGF), z moduami immunoglobulinopodobnymi, domeny z moduami CCP, czyli podobnymi do biaek dopeniacza i inne.
Przykadami proteoglikanw o budowie mozaikowej s zarwno biaka bon podstawnych, np. perlekan z trzema acuchami siarczanu heparanu lub wersikan
z wieloma acuchami siarczanu chondroityny, jak i proteoglikany bon plazmatycznych, np. trombomodulina, ktra odpowiedzialna jest za aktywno antykrzepliw rdbonkw.
Najbardziej charakterystyczn struktur przestrzenn maj wielkoczsteczkowe, pozakomrkowe proteoglikany typu agrekan z chrzstki oraz typu wersikan
z fibroblastw. Proteoglikany te zawieraj acuchy siarczanu chondroityny i siarczanu keratanu kowalencyjnie przyczone do rdzenia biakowego. Niekowalencyjna asocjacja wielu (ok. 140) takich rdzeni biakowych z dugim acuchem kwasu hialuronowego (poprzez biaka wice) doprowadza do wytworzenia kompleksu o dugoci okoo 2 m, ktry zwany jest agrekanem. Proteoglikany tego typu s
silnie uwodnione i spryste, odginaj si po zdeformowaniu, dlatego chrzstka
moe amortyzowa siy odksztacajce.
syndekan
dekoryna
wersikan
serglicyna
Inne mae proteoglikany mog rwnie zawiera liczne acuchy glikozoaminoglikanowe siarczanu chondroityny, tak jak np. serglicyna wystpujca
w ziarnistociach pytek krwi, ktra jest nonikiem czynnikw wzrostowych.
272
Ryc. 10. Eliminacja glikohormonw z krenia (wg 32, za zgod wydawcy i redaktora).
273
274
16.
CHEMICZNE MODYFIKACJE
RESZT AMINOKWASOWYCH
Iwona ak
FOSFORYLACJA
Reakcje fosforylacji polegaj na przeniesieniu kocowej grupy fosforanowej
(czyli ) z ATP na atom tlenu grupy hydroksylowej specyficznej reszty aminokwasowej, mianowicie: Ser, Thr lub Tyr.
H O
ATP
H O
ADP
N C C
H CH2
N C C
fosfataza
H CH2
kinaza serynowa
OH
reszta serynypolipeptydu
H O
O
-
O P O
O
N C C
H CH2
Pi
OH
reszta serynypolipeptydu
reszta fosfoserynypolipeptydu
275
Doczona do biaka grupa fosforanowa moe tworzy trzy wizania wodorowe, ktre dziki tetraedrycznemu ukadowi przestrzennemu s silnie ukierunkowane. Zmiany te mog powodowa znoszenie dotychczasowych oddziaywa elektrostatycznych w biaku i przyczynia si do tworzenia nowych oddziaywa. Powstajce w ten sposb zmiany strukturalne mog zasadniczo zmienia aktywno
biologiczn biaka, w tym aktywno katalityczn, wizanie substratu, jeli fosforylowanym biakiem jest enzym.
Fosforylacja jest skutecznym sposobem aktywacji wielu biaek, ale s i takie
biaka, ktre w wyniku fosforylacji ulegaj inaktywacji (np. fosforylaza glikogenowa jest aktywowana, a syntaza glikogenowa inaktywowana). Wiele enzymw,
kanaw i innych biaek wewntrzkomrkowych jest regulowana dziki fosforylacji. Proces ten zachodzi wewntrz komrki, gdzie jest due stenie ATP. Biaka
zewntrzkomrkowe nie s regulowane przez odwracaln fosforylacj.
Reakcje fosforylacji, zachodzce w organizmie s katalizowane enzymatycznie przez kinazy (fosfotransferazy), wrd ktrych wyrnia si dwie klasy: kinazy
biakowe fosforylujce Ser lub Thr (klasa I) i kinazy biakowe fosforylujce Tyr
(klasa II). Defosforylacj, czyli hydroliz wizania z regeneracj grupy wodorotlenowej aminokwasu w biaku i uwolnieniem ortofosforanu (Pi), katalizuj fosfatazy, ktre znosz skutki dziaania kinaz.
Biaka mog podlega cyklicznej przemianie midzy form ufosforylowan
i nieufosforylowan, z szybkoci zalen od aktywnoci kinaz i fosfataz w komrce. Fosforylacja i defosforylacja mog przebiega w czasie krtszym ni jedna
sekunda lub trwa kilka godzin. Skutkiem fosforylacji jest czsto silne wzmocnienie pocztkowego sygnau np. hormonalnego. Jedna czsteczka zaktywowanej kinazy moe w krtkich odstpach czasu ufosforylowa setki biaek docelowych,
ktre jeli s enzymami, przeksztac du ilo substratu.
KARBOKSYLACJA
Karboksylacja reszt glutaminianu do -karboksyglutaminianu w biakach
uczestniczcych w krzepniciu krwi dostarcza miejsc wicych jony Ca+2, przeksztacajc je ze sabych chelatorw wapnia w silne. Reakcja katalizowana jest
przez system enzymatyczny zaleny od witaminy K.
Jednym z biaek uczestniczcych w krzepniciu krwi jest protrombina, ktra
w rejonie swego N-koca polipeptydu posiada 10 reszt glutaminianu, ulegajcych
procesowi karboksylacji. Wytworzone -karboksyglutaminiany w protrombinie
wi jony wapnia, dziki czemu protrombina wie si z fosfolipidami bonowymi pytek krwi.
Zwizanie protrombiny z powierzchni pytek krwi uprzystpnia j innym
czynnikom krzepnicia (mianowicie: czynnikowi X i V), ktre przeksztacaj pro-
276
H O
N C C
H CH2
HCO3
N C C
O2
H CH 2
HC COO
COO
Wit K
CH2
COO
reszta karboksyglutamylowapolipeptydu
reszta glutamylowapolipeptydu
ACETYLACJA
Acetylacja jest modyfikacj chemiczn szczeglnie rozpowszechnion
wrd biaek jder komrkowych. Proces ten katalizuj acylotransferazy przenoszce reszt acetylow z acetylo-CoA na grup -aminow acucha bocznego lizyny. W wyniku tej odwracalnej reakcji acetylacji powstaje N-acetylolizyna. Acetylacja obnia adunek dodatni lizyny. Acetylacja reszt lizyny w N-kocowych domenach histonw rdzeniowych oktameru nukleosomowego towarzyszy aktywnej
transkrypcji chromatyny.
O
H O
N C C
H3C C S CoA
H O
CoASH
acetylotransferaza
H CH 2
N C C
H CH 2
CH 2
CH 2
CH 2
CH 2
CH 2
+NH3
deacetylaza
CH 3COOoctan
CH 2
N H
C O
reszta lizyny-polipeptydu
CH 3
reszta N -acetylolizynypolipeptydu
277
W nieodwracalnej acetylacji biaek modyfikowana jest grupa -aminowa N-kocowego aminokwasu polipeptydu, sprawia to, e tak zmodyfikowane biako
ma zmniejszon podatno na proteoliz.
METYLACJA
Reakcj metylacji katalizuj metylotransferazy, ktre przenosz grup metylow z aktywnego donora (S-adenozylometioniny lub betainy) na akceptor metylu.
Akceptorami grupy metylowej mog by atomy azotu grupy aminowej w aminokwasach zasadowych i glutaminie oraz atom tlenu w asparaginie.
H O
H O
N C C
N C C
H CH2
H CH2
CH2
CH 3OH
COO
CH2
H2O
C O CH3
O
reszta metyloglutamylowapolipeptydu
reszta glutaminianupolipeptydu
HYDROKSYLACJA
Reakcji hydroksylacji ulegaj dwa aminokwasy, mianowicie lizyna i prolina,
ktre w wyniku tej reakcji s przeksztacane do 5-hydroksylizyny oraz 4-hydroksyproliny, a nieco rzadziej do 3-hydroksyproliny. Proces hydroksylacji jest katalizowany przez dioksygenazy, inaczej zwane hydroksylazami lub oksygenazami hydroksylujcymi.
H O
H O
NADPH+ + H+
N C C
COO
H CH2
CH2
CH2
CH2
+NH3
reszta lizynypolipeptydu
CH2
NADP
CH2
C O
COO
2-oksoglutaran
O2
N C C
COO
H CH2
askorbinian
CH2
H C OH
5-dioksygenaza
lizyny 2-oksoglutaranu
CH2
CH2
CO2
CH2
COO
+ NH
3
bursztynian
Dioksygenazy wbudowuj jeden atom zaktywowanego tlenu czsteczkowego w substrat (lizyn lub prolin) z wytworzeniem w nim grupy OH. Podczas
278
przebiegu reakcji potrzebny jest czynnik redukujcy (NADPH+H+), ktry powoduje redukcj drugiego atomu tlenu do wody.
O
C
N
CH
H2 C
CH2
CH2
NADPH+ + H+
NADP
COO
CH2
CH2
C O
COO
O2
COO
C
N
CH
askorbinian
4-dioksygenaza
proliny 2-oksoglutaranu
CH2
H2 C
C
H
CH2
CO2
CH2
COO
OH
reszta
4-hydroksyprolinypolipeptydu
bursztynian
Hydroksylacja proliny i lizyny przebiega w obecnoci 2-oksoglutaranu, ktry przeksztacany jest w oksydacyjnej dekarboksylacji do bursztynianu. Proces
hydroksylacji do hydroksylizyny i hydroksyproliny wymaga obecnoci witaminy C
(askorbinianu) jako czynnika redukujcego. Askorbinian utrzymuje w niezmiennym stanie jon elazawy, znajdujcy si w centrum aktywnym oksygenaz hydroksylujcych.
ACYLACJA
Acylacja jest chemiczn modyfikacj biaek, w wyniku ktrej rozpuszczalne
biako cytoplazmatyczne uzyskuje hydrofobow kotwic (acyl), ktra umoliwia
zaczepienie biaka w bonie. Przykadami acylacji mog by reakcje mirystylacji
i palmitylacji.
Mirystylacja polega na przeniesieniu reszty kwasu mirystynowego (C14)
(lub innej grupy acylowej) na N-kocow reszt glicyny polipeptydu. W wyniku
tej reakcji powstaje na N-kocu polipeptydu N-mirystoiloglicyna, w ktrej obecne
jest wizanie peptydowe wytworzone z grupy COOH kwasu mirystynowego
i grupy NH2- aminokwasu. Aktywnym donorem reszty acylowej jest mirystoilo-CoA. Reakcj katalizuje enzym transferaza N-mirystoilu. Mirystylacja umoliwia
zmodyfikowanemu biaku interakcj z receptorem bonowym lub z dwuwarstw
lipidow.
279
O
C N CH 2 C polipeptyd
H
N-mirystoiloglicyna-N-koca polipeptydu
Palmitylacja polega na przeniesieniu reszty kwasu palmitynowego z palmitoilo-CoA na grup hydrosulfidow reszt cysteiny. W wyniku reakcji powstaj
pochodne S-palmitoilowe biaka. Do biaka rodopsyny przyczone s dwie grupy
S-palmitoilowe, ktre su do zakotwiczenia rodopsyny w bonie.
O
C O
C S CH2 C H
N H
S-palmitoilocysteina-polipeptydu
PRENYLACJA
Prenylacja polega na przyczaniu do biaek pochodnych izoprenowych, takich jak jednostka farnezylowa (C15) lub geranylogeranylowa (C20).
Farnezylacja jest reakcj przyczania wizaniem tioeterowym grup farnezylowych do reszt cysteiny, znajdujcych si przy C-kocu polipeptydu.
S Cys
S-farnezylocysteina-polipeptydu
X
X
Y C
O
O
C-koniec polipeptydu
Reszty cysteinowe, ulegajce farnezylacji, znajduj si w specyficznej sekwencji aminokwasowej CXXY (C cysteina; X reszty alifatyczne; Y reszta
z grup karboksylow). Po przyczeniu farnezylu do cysteiny, reszty XXY s proteolitycznie usuwane, a nowa kocowa grupa karboksylowa ulega metylacji. Farnezylacji ulega wiele biaek, szczeglnie te, ktre uczestnicz w przekazywaniu
sygnaw lub w docelowym kierowaniu biaek. Przykadowo, biako ras, dopki
nie ulegnie farnezylacji nie jest zdolne przekaza sygnaw wzrostowych, gdy nie
zostao wczone do bony komrkowej. Zamiast farnezylacji zachodzi geranylogeranylacja wwczas, gdy w rejonie C-koca polipeptydu wystpuje jedna ze
specyficznych sekwencji aminokwasowych: CC, CYC lub CCYY (C cysteina;
Y to reszta aminokwasowa z grup karboksylow). Jednostka geranylogeranylu
280
przyczana jest do jednej lub obu reszt cystein. Modyfikacja ta zachodzi w maych biakach wicych GTP z rodziny rab, ktre bior udzia w kierowaniu
biaek do bon siateczki rdplazmatycznej. Przyczenie tej wysoce hydrofobowej
kotwicy jest niezbdne do zwizania biaka z bon.
GLIKOZYLOFOSFATYDYLOINOZYTOLOWE-POCHODNE
Niektre biaka wystpujce na powierzchni komrki s zakotwiczone
w bonie poprzez jednostki glikozylofosfatydyloinozytolowe (GPI), znajdujce si
na C-kocu polipeptydu.
C koniec
polipeptydu
O
Asp C NH
CH 2
CH 2
reszta
fosfoetanoloaminy
O
O P O
jednostka
oligosacharydowa
O 6Man1
2Man1
6
Gal1
2Gal1
Man1
6 Inozytol 1
4GlcN1
6
Gal1
2
O P O
O
Gal1
H 2C
jednostka
fosfatydyloinozytolu
O
O C
CH CH 2
O
C O
zakotwiczenia
w bonie
281
RACEMIZACJA
Reakcja racemizacji L-asparaginianu w D-asparaginian jest chemiczn modyfikacj biaek, zwizan z wiekiem. Biakiem podatnym na t modyfikacj jest np.
-krystalina prawidowej soczewki. Reakcja racemizacji nasilona jest w zamie.
ADP-RYBOZYLACJA
Proces ADP-rybozylacji moe regulowa funkcj wielu biaek, w tym enzymatycznych, przypuszczalnie zaangaowany jest te w tak wane zjawiska biologiczne, jak pami i uczenie.
Mono-ADP-rybozylacja polega na przeniesieniu pojedynczej reszty adenozynodifosforybozy (ADP-rybozy) na biako akceptorowe w reakcji katalizowanej
przez mono-ADP-rybozylotransferaz. Donorem grup ADP-rybozy jest dinukleotyd nikotynamidoadeninowy (NAD+). W procesie tym mog by modyfikowane
biaka pozajdrowe komrki, mianowicie czynnik elongacyjny EF2 procesu translacji lub biako G przez niektre toksyny.
Szkodliwe dziaanie toksyny bonicy z Corynebacterium diphtheriae (gen
tej toksyny pochodzi z lizogennego faga yjcego w tych bakteriach), wynika
z faktu, e fragment A jej polipeptydu wykazuje aktywno katalityczn ADP-rybozylotransferazy i modyfikuje czynnik elongacyjny EF-2 translacji. ADP-rybozylowany czynnik EF-2 nie jest zdolny do przeprowadzania translokacji rosncego
polipeptydu, blokujc proces translacji. Obecny w cytoplazmie nawet pojedynczy
fragment A tej toksyny moe zabi komrk.
Toksyna cholery wykazuje rwnie aktywno ADP-rybozylotransferazy
i katalizuje ADP-rybozylacj reszty argininy w podjednostce- biaek Gs. Modyfikacja ta w wysokim stopniu hamuje zdolno biaka Gs do hydrolizowania GTP
do GDP, tym samym utrzymuje przeduon jego aktywno stymulowania cyklazy adenylanowej i w ten sposb doprowadza do znacznego wzrostu stenia
cAMP.
Proces poli-ADP-rybozylacji modyfikuje biaka jdrowe, takie jak histony
H1, endonukleazy. Reakcj poli-ADP-rybozylacji katalizuje ADP-rybozylotransferaza polimeryzujca, inaczej zwana syntaz poli(ADPR), ktra sprawia, e
w modyfikowanym biaku znajduj si polimery adenozynodifosforybozy, czyli
poli(ADPR).
Polimeryzacja grup ADP-rybozy nastpuje poprzez wytwarzanie wiza glikozydowych pomidzy atomem C1 rybozy jednego monomeru ADP-rybozy (ktry
powsta z NAD po usuniciu amidu kwasu nikotynowego), a atomem C-2 rybozy
282
innego monomeru ADP-rybozy. Wytwarzanie wiza glikozydowych midzy poszczeglnymi monomerami doprowadza do wytworzenia oligomeru lub polimeru,
czyli poli(ADPR).
NH 2
CONH2
N
O
BIAKO
AKCEPTOROWE
OH
CH 2
CH2
+
NAD
OH
OH
OH
OH
NH 2
CONH 2
N
N
N
nikotynamid
O
BIAKO
AKCEPTOROWE
CH 2
OH
OH
O
O
CH2
2'
OH
OH
ADP-rybozylowane biako
miejsce przyczenia
kolejnej czsteczki ADPR
przy tworzeniu poli (ADPR)
acuch poli-ADP-rybozy zwykle poczony jest z atomem tlenu grupy -karboksylowej kwasu glutaminowego lub O-fosfoseryny modyfikowanego biaka. Modyfikacja ta jest odwracalna, poniewa moe nastpi hydrolityczne rozerwanie kolejnych wiza glikozydowych midzy resztami rybozy-rybozy kolejnych monomerw i usunicie tych czsteczek.
ADENYLACJA
Adenylacja polega na kowalencyjnym przyczeniu adenozynomonofosforanu (AMP) wizaniem fosfodiestrowym do grupy hydroksylowej acucha bocznego aminokwasu w biaku. Reakcja katalizowana jest przez transferaz adenylilow.
Przykadem biaka ulegajcego adenylacji moe by syntetaza glutaminianowa. W tym biaku enzymatycznym akceptorem AMP jest grupa hydroksylowa
283
H O
N C C
N C C
H CH2
H CH2
ATP
PPi
transferaza adenylilowa
OH
O
O P O ryboza adenina
O
reszta tyrozynylowapolipeptydu
reszta AMP-O-tyrozynylowa
polipeptydu
UBIKWITYNACJA
Ubikwitynacja jest posttranslacyjn modyfikacj biaka, ktra polega na poczeniu wizaniem izopeptydowym ubikwityny poprzez jej C-kocow reszt
glicyny z grup -aminow lizyny biaka podlegajcego tej modyfikacji. W wyniku
reakcji powstaje zmodyfikowane biako zawierajce monoubikwityn. Wizanie
izopeptydowe wystpuje, gdy uczestniczy w nim inna grupa aminowa ni -aminowa, przykadowo -aminowa aminokwasu.
Ubikwityna jest polipeptydem (75 reszt aminokwasowych), czsto okrelanym jako niskoczsteczkowe biako (masa czsteczkowa rzdu 8500 D), ktre jest
wysoce termostabilne, czyli ma niezwyk wytrzymao na wysok temperatur,
szeroki zakres zmian pH i polarnoci rodowiska.
Monoubikwitynacja oznacza, e biako zostao zmodyfikowane pojedynczymi resztami ubikwityny. Multiubikwitynacja oznacza, e do biaka doczone s
liczne reszty ubikwityny, ktre tworz acuchy poliubikwitynowe proste lub rozgazione. Proces ubikwitynacji katalizuj trzy enzymy (E1, E2, E3), energia
(ATP) wymagana jest tylko na pocztkowym etapie aktywacji ubikwityny.
Po monoubikwitynacji z reguy ma miejsce wizanie si czsteczek ubikwityny midzy sob poprzez ich C-kocow grup karboksylow glicyny a miejscem
akceptorowym innej czsteczki ubikwityny, ktrym jest grupa -aminowa reszt
284
Proces ubikwitynacji jest uniwersalnym systemem u eukariota oznakowywania biaek, przeznaczonych do zniszczenia. Oznakowanie biaka ubikwityn,
szczeglnie w formie acuchw poliubikwitynowych, ukierunkowuje biako na
drog proteolizy. Ubikwitynowane biaka szybko ulegaj degradacji przez proteazy
pozalizosomalne w strukturach zwanych proteasomami, dziki czemu biaka s
eliminowane z puli biaek podobnych, ale niezmodyfikowanych. W ten sposb
degradowane s w cytoplazmie biaka nieprawidowo zsyntetyzowane, le rozmieszczone w strukturach subkomrkowych lub starzejce si.
1 biako
(CH 2)2
(CH2)2
C O
C O
NH
NH
(CH2)n
(CH 2)n
NH 2
NH
C O
NH 2
(CH 2)n NH 2
(CH 2)n
poliamina
2 biako
2 biako
wizanie N, N-bis
( glutamylo)poliaminowe
286
Proces inicjuje reakcja oksydacyjnej dezaminacji reszt lizyny w polipeptydach tropokolagenu lub elastyny, ktrej produktem jest aldehydowa pochodna lizyny, semialdehyd 2-aminoadypinianu, zwany allizyn. Reakcj katalizuje oksydaza lizynowa, (miedzioproteina). W dalszych, zoonych etapach tworzenia wiza poprzecznych, mog by zaangaowane dwie, trzy lub cztery reszty aminokwasowe, przy czym ostateczny typ wizania poprzecznego zaley od tego, czy na
wstpie oddziauj ze sob reszty lizyny i allizyny (ryc. 2), czy dwie allizyny
(ryc. 3).
O C
H C
(C H 2 )2
CH2
CH2
N H
+
NH 3
+
H3 N CH2
C O
CH2
(C H 2 ) 2
C H
H N
O C
H C
O
(C H 2 ) 2
CH2
C O
C CH2
H
N H
(C H 2 ) 2
C H
H N
O C
H C
C O
H
(C H 2 ) 2
CH2
N H
(C H 2 ) 2
C
O
C H
H N
H
H O
N C C
CH2
C
HC
O C
H C
(C H 2 ) 2
N H
CH2
CH
N
C O
(C H 2 ) 2
H C
O
H
C H
H N
Produktem reakcji midzy reszt lizyny jednego polipeptydu a allizyn drugiego polipeptydu jest najpierw poczenie typu zasady Schiffa w postaci dehydrolizynonorleucyny, ktre ulega redukcji do stabilnej pochodnej lizynonorleucyny,
stanowicej wizanie poprzeczne w kolagenie i elastynie (ryc. 2).
W wyniku kondensacji aldolowej dwch allizyn pochodzcych z rnych
acuchw tropokolagenu powstaje midzy nimi aldolowe wizanie poprzeczne,
czyli z woln grup aldehydow. Aldolowe wizanie poprzeczne midzy dwoma
polipeptydami moe by wykorzystane do przyczenia trzeciego acucha tropokolagenu poprzez jego piercie imidazolowy reszty histydyny. Ostatecznie uformowane wizanie tego typu nazywa si poprzecznym wizaniem histydynowoaldolowym (ryc. 3).
Innego typu wizanie krzyowe powstaje w elastynie, ktre czy cztery acuchy polipeptydowe poprzez poliaminokwas desmozyn lub jej izomeryczn posta izodesmozyn. Oba poliaminokwasy zawieraj jednakowy piercie pirydynowy, lecz rni si pooeniem reszt lizynowych, w desmozynie znajduj si
w pozycjach 3, 4, 5, a w izodesmozynie 2, 3, 5.
(CH2)2
(CH2)3
(CH2)2
+
N
(CH2)4
desmozyna
W procesie tworzenia tego typu wizania krzyowego uczestnicz trzy czsteczki allizyn pochodzce z rnych polipeptydw oraz jedna czsteczka lizyny
z czwartego polipeptydu elastyny. Produktem kondensacji tych czterech reszt jest
heterocykliczny piercie pirymidynowy desmozyny lub izodesmozyny.
GLIKOZYLACJA
Glikozylacja biaek polega na przyczaniu wizaniem glikozydowym cukrowcw do okrelonych reszt aminokwasowych polipeptydu. Wynikiem tych
reakcji jest dobudowanie skadnika wglowodanowego do biaka i przeksztacenie go w glikoprotein. Wszystkie biaka sekrecyjne ulegaj glikozylacji, zatem s
glikoproteinami, przynajmniej na etapie transportu z retikulum endoplazmatycznego, poprzez aparat Golgiego do bony plazmatycznej. Reakcje glikozylacji polipeptydw odpowiedzialne s za nadanie polipeptydom specyficznego cukrowego pit289
291
292
293
GLIKACJA NIEENZYMATYCZNA
Nieenzymatyczna glikacja jest bezporedni reakcj chemiczn midzy redukujcym cukrem, najczciej glukoz, a pierwszorzdow woln grup aminow
biaka, w ktrej nie powstaje glikozyd. Reakcje tego typu mog mie miejsce
w organizmie ywym.
Pocztkowy produkt jest labiln zasad Schiffa (aldoimin), ktra ulega powolnemu przegrupowaniu Amadori do stabilnej ketoaminowej pochodnej biaka.
Produkty przegrupowania Amadori mog przybiera konformacj cykliczn piranozy lub furanozy (ryc. 5).
Ostatecznym produktem nieenzymatycznej glikacji biaka jest N-(1-amino-1-deoksyfrukto)-biako, ktre nie jest glikozydem, dlatego reakcji tej nie mona
nazywa reakcj glikozylacji.
W organizmie ywym nieenzymatyczne przyczenie cukrowca naley rozpatrywa jako strukturaln i funkcjonaln modyfikacj biaek, majc znaczenie
w mechanizmie starzenia, ktra ma szczeglnie wyrany wpyw na biaka o dugim
okresie ptrwania w organizmie. Reakcja ma miejsce w cigu naturalnego procesu
starzenia si biaek i uwydatniana jest w stanach patologicznych.
Tej chemicznej modyfikacji sprzyja podwyszony poziom monocukrw redukujcych, tak jak to ma miejsce w cukrzycy. Efektywno glikacji nieenzymatycznej jest wprost proporcjonalna do czasu trwania reakcji i do stopnia hiperglikemii.
Wiele rnych biaek moe zawiera cukier wczony w procesie glikacji
nieenzymatycznej. Wrd nich znajduje si hemoglobina, albumina i inne biaka
surowicy, krystalina, biaka bon plazmatycznych, podstawnych, osonek mielinowych orodkowego i obwodowego ukadu nerwowego, biaka macierzy cznotkankowej, np. kolagen.
Analityczne oznaczanie glikowanych biaek (szczeglnie albuminy i hemoglobiny) jest wykorzystywane w diagnostyce hiperglikemii do monitorowania postpw leczenia cukrzycy, gdy moe dostarcza informacji na temat wyrwnania
metabolizmu cukrw. Ze wzgldu na krtszy okres ptrwania albuminy (17 dni)
w porwnaniu z hemoglobin (120 dni), pomiar glikowanej albuminy moe dostarczy informacji w znacznie krtszym czasie ni pomiar glikowanej hemoglobiny,
ktra jest raczej dugotrwaym wskanikiem wyrwnania metabolizmu w cukrzycy.
294
H C NH biako
H C O
H C OH
H C OH
HO C H
NH2 biako
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH
H C OH
CH2 OH
CH2 OH
glukoza
zasada Schiffa
przegrupowanie
Amadori
H2 C NH biako
C O
HO C H
H C OH
H C OH
CH2 OH
ketoamina
biako
biako
O
CH 2 NH
OH
N-podstawiona-1-amino-1deoksyfruktopiranoza
HOCH2
CH2NH
OH
N-podstawiona-1-amino-1deoksyfruktofuranoza
Glikowane biaka bon plazmatycznych i podstawnych oraz glikowany kolagen cian naczy mog zaburza molekularn lub elektryczn integralno kapilarnej bariery filtracyjnej, co moe prowadzi do zwikszonej przepuszczalnoci mikronaczyniowej, np. w nerkach.
Glikacja krystaliny soczewki oka powoduje zmiany konformacyjne, uatwiajce tworzenie wiza krzyowych w tym biaku i przyczynia si do powstawania
wielkoczsteczkowych agregatw krystaliny, ktre charakteryzuj si zwikszonym pochanianiem wiata. Powyszy mechanizm sprzyja wytworzeniu katarakty
u osb chorych na cukrzyc.
Glikacja apolipoproteiny B-100 na tyle modyfikuje to biako, e lipoproteiny
LDL nie s rozpoznawane przez receptor wysokiego powinowactwa i stenie
295
LDL wzrasta w kreniu. Wzrost stenia LDL sprzyja rozwojowi zmian miadycowych.
Glikacja nieenzymatyczna uwaana jest rwnie za pierwszy etap wielu reakcji, ktrym ulegaj biaka poza organizmem (in vitro), w obecnoci redukujcych
cukrw, np. podczas duszego przechowywania mleka i jego przetworw lub
w czasie pieczenia chleba.
W 1992 roku Polskie Sownictwo Biochemiczne zalecio stosowanie terminu
glikacja na okrelenie wszystkich reakcji polegajcych na przyczaniu cukru do
biaka, niezalenie od tego, czy tworzone jest wizanie glikozydowe, czy nie. Produktem glikacji ma by zarwno glikozyd, ktrym jest glikoproteina, jak i produkt
reakcji nieenzymatycznej, nie bdcy glikozydem, tak jak np. glikohemoglobina.
Tymczasem termin glikacja stosowany jest praktycznie do okrelania reakcji nieenzmatycznego przyczania cukrw do biaek, w celu odrnienia tego procesu od
glikozylacji enzymatycznej. Reakcje enzymatycznego przyczania cukrw do
biaek wizaniami glikozydowymi nadal okrela si powszechnym terminem glikozylacja.
296
17.
PORFIRYNY I POCHODNE
Iwona ak
Porfiryny s makrocyklicznymi zwizkami, utworzonymi z czterech piercieni pirolowych, poczonych jednowglowymi mostkami metinowymi.
Pirol jest picioczonowym, heterocyklicznym zwizkiem aromatycznym,
ktry zawiera sze elektronw w cyklicznym sprzonym ukadzie nakadajcych si piciu orbitali p (kady z czterech atomw C dostarcza 1 elektron , atom
azotu o hybrydyzacji sp2 dostarcza woln par elektronow, czyli dwa). Wolna para elektronowa atomu azotu w pirolu jest mniej reaktywna poniewa jest czci
sekstetu aromatycznego. W wyniku tego pirol jest znacznie mniej zasadowy i mniej
nukleofilowy ni aminy alifatyczne. Atomy wgla pirolu natomiast s bogatsze
w elektrony i bardziej nukleofilowe ni atomy wgla jedynego wizania podwjnego jakiego zwizku, dlatego piercie pirolowy jest reaktywniejszy wobec elektrofili.
Pirol mona otrzyma w wyniku dziaania na furan amoniakiem w obecnoci
tlenku glinu jako katalizatora i w temperaturze 400C.
W organizmie pirol powstaje w postaci porfobilinogenu, ktry jest produktem reakcji kondensacji dwch czsteczek kwasu -aminolewulinowego (na poniszym rysunku pojedyncze czsteczki -aminolewulinianu w obrbie porfobilinogenu, zaznaczono poprzez wykropkowanie). Reakcj katalizuje syntaza porfobilinogenowa.
H
HC
HC
CH
N
H
HC
H
I
N
IV NH
CH
H
HC
HN II
N
III
pirol
CH
CH
porfina
porfobilinogen
297
IV
III
6
II 34
typ I symetryczny
298
COO
CH 2
OOC CH 2 CH 2
H
H
I
C
N
H H H
HN II
IV NH
H
H N H
C
C
III
H
H
C
OOC H 2C
H 2C
H 2C
-
OOC
CH 2
OOC CH 2 CH 2
COO
CH2
CH2
OOC
6H+
H 2C
na wietle
IV NH
H 2C
samoutlenienie
H 2C
CH2
COO
CH
COO
CH 2
HN II
CH 2
N
III
HC
CH
CH 2
COO
OOC
CH 2 CH 2
CH 2
I
N
HC
CH2 CH 2
COO
CH2 COO
COO
COO
uroporfirynogen III
uroporfiryna III
COO
CH 2
CH2
CH3 CH 2
CH3 CH2
H
H3C
H2C
H2C
-
OOC
H
I
N
H H H
CH3
NH
HN
II
IV
H
CH2
H N H
CH2
III
H
H
COO
CH2 CH 3
I
N
HC
+
6H
H3C
na wietle
IV NH
H2C
samoutlenienie
H2C
-
HC
CH
CH 3
HN II
N
III
CH
OOC
CH 2
COO
CH2 CH3
CH2
CH2
COO
COO
koproporfirynogen III
CH 2
koproporfiryna III
300
Uroporfiryn III wykryto pierwotnie w moczu, lecz nie jest to jedyne miejsce jej wystpowania w organizmie. Koproporfiryn III stwierdzono pierwotnie
w kale, obecna jest rwnie w moczu.
Koproporfirynogen III powstaje z uroporfirynogenu III w cytoplazmie komrki w reakcji dekarboksylacji, ktra przeksztaca wszystkie boczne podstawniki
acetylowe uroporfirynogenu w podstawniki metylowe koproporfirynogenu. W stanach patologicznych pojawiaj si uroporfiryna I i koproporfiryna I, ktre powstaj
na tych samych zasadach, jak ich fizjologiczne izomery typu III.
Koproporfirynogen III w mitochondriach przeksztacany jest w protoporfirynogen III w reakcji oksydacyjnej dekarboksylacji, przeksztacajcej dwie grupy
propylowe piercieni pirolowych (I i II) w grupy winylowe. Reakcj katalizuje
oksydaza koproporfirynowa, ktra moe dziaa wycznie na koproporfirynogen
III, fakt ten wyjania zupeny brak w materiale biologicznym protoporfirynogenu I
i protoporfiryny I.
Barwna protoporfiryna III powstaje w mitochondriach z bezbarwnego protoporfirynogenu III w enzymatycznej reakcji utlenienia, tworzcej mostki metinowe
w tej porfirynie.
CH3
CH 2
CH3 CH
H
H3C
H2C
H2C
-
OOC
H
I
N
H H H
CH 3
NH
HN
IV
II
H
CH
H N H
CH 2
III
H
H
CH3 CH
I
N
HC
+
6H
H 3C
utlenienie
IV NH
oksydaza
protoporfirynogenowa
H 2C
H 2C
-
CH
CH3
HN II
CH
HC
N
III
CH
OOC
CH2 CH3
CH2 CH3
CH2
CH2
COO
COO
protoporfirynogen III
CH2
Wstawienie do czsteczki protoporfiryny IX centralnego jonu metalu, mianowicie elaza lub magnezu, determinuje dalsze przeksztacenie porfiryny albo
w kierunku hemu, albo chlorofili. Dalsze modyfikacje prowadzce do chlorofili polegaj na doczeniu pitego piercienia pirolowego, poczeniu jednego podstawnika bocznego z dugim hydrofobowym izoprenoidem, czsteczk fitolu oraz
usuniciu pewnych wiza podwjnych w niektrych piercieniach pirolowych.
301
CH2
CH3 CH
I
N
HC
H3C
-
CH
CH3
+2
IV N
Fe N II
HC
N
III
OOC H 2C H2C
CH CH2
CH
CH2 CH3
CH2
COO
elazoprotoporfiryna (hem)
elazoprotoporfiryna, czyli hem to grupa prostetyczna wszystkich hemoprotein, do ktrych nale hemoglobiny, mioglobina, cytochromy i niektre enzymy,
mianowicie katalaza oraz peroksydaza. We wszystkich tych biakach oglna struktura hemu jest podobna, natomiast rni si struktur acucha polipeptydowego,
ktry jest specyficzny dla kadego typu biaka. Poza tym, biaka te rni si wartociowoci atomu elaza w ich hemie. Atom elaza wystpuje w postaci jonu
elazawego (+2) w hemach funkcjonalnej hemoglobiny, oksyhemoglobiny, mioglobiny i oksymioglobiny i tylko w tej postaci transportuje tlen. Atom elaza
przyjmuje posta jonu elazowego (+3) w hemach methemoglobiny, w katalazie
i peroksydazie. elazo w postaci jonu zmieniajcego wartociowo (+2 lub +3)
wystpuje w cytochromach, zalenie od ich aktualnego stanu funkcjonalnego, mianowicie po przyjciu elektronu lub jego oddaniu.
Atom elaza wie si z 4 atomami azotu piroli poprzez dwa wizania kowalencyjne i dwa wizania koordynacyjne. Poza tym, moe tworzy dwa dodatkowe
wizania, mianowicie kade po innej stronie paskiej paszczyzny hemu, ktre
okrela si jako pit i szst pozycj koordynacyjn jonu elaza Fe+2.
Pit pozycj koordynacyjn elaza w hemie hemoglobiny i mioglobiny zajmuje reszta histydyny proksymalnej acucha polipeptydowego globiny, zwizana
z nim kowalencyjnie.
W szstej pozycji koordynacyjnej elaza znajduje si miejsce dla czsteczki
tlenu lub tlenku wgla, a w nieutlenowanej hemoglobinie pozycja koordynacyjna 6
nie jest obsadzona.
302
H
2
HC
His-93
proksymalna
N
HC
NH His-64
dystalna
C
CH2
303
CH 3
CH 3 CH S CH 2
I
N
HC
H 3C
OOC H 2C H 2C
CH
CH3
+2
IV N
Fe N II
HC
N
III
CH S CH 2
CH
B
I
A
K
O
CH3
CH 2 CH 3
CH 2
COO
hem cytochromw c i c1
CH3
(CH2
CH2
CH CH2)3
CH3 CH2
H C OH
H
-
I
N
HC
O
C
CH
CH 3
+2
IV N
Fe N II
HC
N
III
CH CH2
CH
CH2 CH3
CH2
COO
BARWNIKI CIOWE
Barwniki ciowe powstaj w wyniku rozerwania makrocyklicznej struktury hemu i stanowi form zwizkw wydalniczych, w ktrej usuwany jest z organizmu hem, gwnie starych, eliminowanych z obiegu erytrocytw, ale rwnie
hem pochodzcy z wszystkich innych hemoprotein. W reakcji oksydacyjnego rozszczepienia piercienia elazoporfirynowego, ktra zachodzi w ukadzie siateczkowo-rdbonkowym, powstaje liniowy tetrapirol, zwany biliwerdyn, ktry jest
304
zielonym barwnikiem ciowym. Ten rozpuszczalny w wodzie barwnik jest kocowym produktem rozkadu hemu u ptakw, gadw i pazw. U ludzi i innych ssakw biliwerdyna ulega redukcji do bilirubiny, czerwonopomaraczowego barwnika ciowego. Widocznym dowodem tych reakcji rozkadu hemu s zmiany koloru siniaka w rnym czasie od wynaczynienia krwi do tkanek. Czsteczki bilirubiny s lipofilne, dlatego we krwi transportowane s w poczeniu z albumin. Bilirubina jest bardzo skutecznym przeciwutleniaczem, w przeciwiestwie do biliwerdyny. Bilirubina unieszkodliwiajc dwa rodniki hydroksylowe jest utleniana do
biliwerdyny. Nastpnie biliwerdyna szybko ponownie ulega redukcji do bilirubiny.
Bilirubina zwizana z albumin wykazuje okoo 1/10 efektywnoci witaminy C
w ochronie przed nadtlenkami rozpuszczalnymi w wodzie. Bilirubina to rwnie
szczeglnie silny przeciwutleniacz w bonach biakowo-lipidowych, gdzie rywalizuje z witamin E.
COO COO
CH2
CH 3 CH
CH2
CH3 CH2
CH2 CH 3
III
II
N
H
C
H
CH2
CH2
IV
N
H
C
H
C
H
CH 3 CH
I
N
H
biliwerdyna
COO COO
CH2
CH 3 CH
II
N
H
CH2
CH3 CH2
C
H
III
N
H
CH2
CH2
CH2 CH 3
H
C
H
IV
N
H
C
H
CH 3 CH
I
N
H
bilirubina
W wtrobie bilirubina sprzgana jest z dwoma czsteczkami kwasu glukuronowego. W wyniku tej reakcji powstaje diglukuronid bilirubiny, ktry charakteryzuje si zwikszon polarnoci i rozpuszczalnoci w wodzie. W tej formie bilirubina wydzielana jest do ci, a nastpnie do jelit.
305
C
O O
OH
OH
H
OH
O
C
O O
HO
H2C
CH2
H2C
CH2
OH
OH
CH2
CH 3 CH
II
N
H
CH2
CH3
III
N
H
C
H
CH 3 CH
CH 3
IV
N
H
H
C
H
I
N
H
C
H
diglukuronid bilirubiny
CH2
CH3 CH2
CH 3 CH2
II
N
H
HO
III
N
H
H
C
H
CH3
CH2
CH3 CH2
CH2 CH 3
C
H
IV
N
H
I
N
H
H
C
H
OH
urobilina
COO
COO
CH 3
CH 2
CH 2
CH 3 CH 2
CH 3 CH 2
II
N
H
C
H
III
N
H
CH 2 CH3
OH
HO
mezobilifuscyny
306
CH3
IV
N
H
C
H
CH 3 CH2
I
N
H
18.
ZASADY AZOTOWE
I NUKLEOTYDY
Iwona ak
N
HC
H
C
3
2
4
1
5C H
6
CH
pirymidyna
NH2
HN
N
O
N
H
N
H
OH
OH
laktym
laktym
HO
cytozyna [Cyt]
CH3
laktym
HO
laktam
N
H
NH2
CH3
HN
laktam
laktam
HO
N
tymina [Thy]
uracyl [Ura]
Zmodyfikowane zasady pirymidynowe, np. metylowane, wystpuj w kwasach nukleinowych zarwno u prokariota, jak i eukariota, w tym take u czowieka (np. 5-metylocytozyna), niektre obecne s tylko u wirusw np. 5-hydroksymetylocytozyna.
NH2
N
O
NH2
CH3
N
H
5-metylocytozyna
CH2OH
N
N
H
5-hydroksymetylocytozyna
308
H
C
6
3
5C
4
N
7
8 CH
N
H
puryna
dzi w skad sekstetu elektronw , podobnie jak atom azotu w piercieniu pirolowym. W przyrodzie puryna nie wystpuje w wolnej postaci, lecz gwnie w formie
aminowych i ketonowych (lub hydroksylowych) pochodnych. Grupy aminowe
przyczone do aromatycznego piercienia purynowego zachowuj si podobnie
jak grupy aminowe aminokwasw, mog przechodzi w form kationow po przyczeniu jonu H+.
Najwaniejsze gwne zasady purynowe to adenina i guanina, ktre s obecne we wszystkich kwasach nukleinowych. W niektrych moe wystpowa rwnie hipoksantyna, bdca jednoczenie metabolitem porednim przemian adeniny.
O
NH2
N
laktam
N
H
H2N
NH
laktam
N
H
laktym
N
H
adenina [Ade]
H2N
N
H
OH
N
laktam
HN
OH
N
HN
HN
laktym
N
laktym
N
H
guanina [Gua]
N
H
hipoksantyna [Hyp]
309
O
N
HN
O
HN
N
H
N
H
ksantyna
H
N
O
N
H
N
H
kwas moczowy
W kwasach nukleinowych, zarwno pochodzenia eukariotycznego, jak i prokariotycznego, wystpuj zmodyfikowane zasady purynowe, gwnie metylowane.
O
O
N
HN
H3C
N
N
H
H3C
2-dimetyloguanina
HN
H2N
H3C
CH3
CH3
N
N7-metyloguanina
N
H
N 6,N 6-dimetyloadenina
Reakcje metylowania zasad azotowych u prokariota s jednym z waniejszych elementw systemu zabezpieczajcego DNA przed negatywnymi skutkami
dziaania endogennych enzymw restrykcyjnych.
Metylowane puryny s obecne u rolin, rwnie poza kwasami nukleinowymi jako tzw. zasady rolinne (alkaloidy). Nale do nich midzy innymi kofeina, teofilina i teobromina. Kofeina, zwana te tein, obficie wystpuje w ziarnach
kawy, teofilina w liciach herbaty, teobromina w owocach kakaowych. Wszystkie
maj zastosowanie farmakologiczne.
O
O
H3C
O
N
N
N
H
CH3
teofilina
(1,3-dimetyloksantyna)
H3C
O
CH3
N
N
N
HN
O
CH3
CH3
CH3
kofeina
(1,3,7-trimetyloksantyna)
teobromina
(3,7-dimetyloksantyna)
Pirymidyny (pH 7)
Puryny (pH 7)
10
Uracyl
8
Cytozyna
14
Tymina
230
260
300
nm
Adenina
12
10
8
Guanina
6
4
2
230
260
300
nm
Nukleozydy
Nukleozydy s N-glikozydami, z wyjtkiem pseudourydyny, ktra jest C-glikozydem. Skadnikiem cukrowym jest albo -D-rybofuranoza albo -D-2-deoksyrybofuranoza. Atomy wgla w czsteczkach monocukrw s oznaczane numerem z primem (np. 2'), dla odrnienia pozycji atomu w obrbie reszty cukrowej od
pozycji w zasadowym fragmencie czsteczki.
Wizanie -N-glikozydowe w nukleozydach pirymidynowych czy anomeryczny atom wgla (C1) rybozy lub deoksyrybozy z pierwszym atomem azotu (N1)
zasady pirymidynowej.
Zasada tworzenia nazw nukleozydw opiera si na rodzaju zasady azotowej,
wystpujcej w nukleozydzie. Mianowicie, nazwy nukleozydw pirymidynowych
tworzy si, dodajc do pocztkowego czonu nazwy zasady, kocwk -dyna,
np. cyty-dyna, ury-dyna, tymi-dyna. Tymidyna zawiera deoksyryboz i jest nukleozydem przede wszystkim charakterystycznym dla DNA. W niektrych kwasach
rybonukleinowych (tRNA) moe wystpowa rybotymina, ale jest to nietypowy
nukleozyd.
311
NH2
N
O
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
OH H
tymidyna (dT)
O
NH
HN
O
HOCH2 O
H
H
H
H
cytydyna (C)
CH3
HN
HN
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
urydyna (U)
O
O
N
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
pseudourydyna
CH3
HN
N
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
rybotymina
312
O
N
N
O
N
NH
N
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
NH
NH2
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
inozyna (I)
guanozyna (G)
Wizania -N-glikozydowe w nukleozydach i nukleotydach mog wystpowa w dwch konformacjach, syn i anty. W naturalnych nukleozydach dominuje
konformacja anty, natomiast syn jest niekorzystna energetycznie.
NH2
NH2
N
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
syn
HOCH2 O
H
H
H
H
OH OH
anty
N
N
N
N
Nukleotydy
Nukleotydy s estrami fosforanowymi nukleozydw. Nazwy nukleotydw
tworzy si od nazw nukleozydw, np. cytydynomonofosforan. Powszechnie stosowane skrty trjliterowe nukleotydw, np. CMP, pochodz od nazw angielskich
(np. cytidine monophosphate). W nazwie zazwyczaj zamieszcza si cyfr wskazujc na pozycj zwizanej grupy fosforanowej.
Ortofosforan zastpuje przede wszystkim grup -OH przy pitym atomie
wgla (C5') rybozy lub deoksyrybozy. Tylko nukleozydo-5'-fosforany s wykorzystywane w organizmie do biosyntezy kwasw nukleinowych. Ortofosforan moe
zastpowa rwnie grup -OH przy trzecim atomie wgla (C3') rybozy lub deoksyrybozy. Naturalne nukleozydo-3'-fosforany s produktami rozpadu kwasw nukleinowych w organizmie.
313
N H2
N
N H2
N
N
C H2 O
H
H
H
H
OH OH
N
HO
OO-
C H2 O
H
H
H
H
OH
O
O-
P
O
O
-
adenozyno- 3'-monofosforan
Nukleotyd tyminowy wystpuje w formie 2'-deoksytymidyno-5'-monofosforanu (dTMP), poniewa przede wszystkim jest skadnikiem DNA, wyjtkowo natomiast w formie fosforybotyminy (TMP) w czsteczce tRNA. Fosforybotymina
powstaje dopiero posttranskrypcyjnie w wyniku reakcji metylacji urydynomonofosforanu.
O
CH3
HN
O
O
HN
CH2 O
H
H
H
H
H
OH
2'-deoksytymidyno-5'-monofosforan [dTMP]
CH2 O
H
H
H
H
OH OH
urydyno-5'-monofosforan [UMP]
Nukleotyd uracylowy wystpuje wycznie w formie rybourydyno-5'-monofosforanu. Nukleotydy adeninowe, guaninowe i cytozynowe istniej zarwno
w formie rybonukleotydw, jak i deoksyrybonukleotydw.
314
NH2
O
N
O
O
NH
P O
O-
NH2
O- P O
O CH2 O
H
H
H
H
OH OH
O CH2 O
H
H
H
H
OH OH
cytydyno-5'-monofosforan [CMP]
guanidyno-5'-monofosforan [GMP]
NH
P O
O CH2 O
H
H
H
H
OH OH
inozyno-5'-monofosforan [IMP]
Grupy fosforanowe nukleotydw maj charakter kwasowy i w fizjologicznym pH okoo 7 wystpuj w postaci dianionw. Wizanie estrowe w nukleotydach moe ulega hydrolizie z uwolnieniem nukleozydu i nieorganicznego fosforanu HPO42-, ktry oznacza si skrtem Pi.
315
NH2
N
N
O-
P O
O-
P O
O-
CH2 O
H
H
H
H
OH
OH
adenina
ryboza
adenozyno-5'-monofosforan [AMP]
adenozyno-5'-difosforan [ADP]
adenozyno-5'-trifosforan [ATP]
N H2
N
N
O
-
O
O
C H2 O
H
H
H
H
OH
cy kliczny 3'-5'-A M P
N
O
-
O
O
NH
N
N H2
C H2 O
H
H
H
H
OH
cy kliczny 3'-5'-G M P
Cykliczny GMP jest pobudzajcym informatorem w procesie widzenia. Czsteczka ta tworzona jest przez cyklaz guanylanow, a rozkadana przez specyficzn fosfodiesteraz. W komrkach prcikowych siatkwki znajduj si bonowe
kanay specyficzne wobec kationw, ktre s bramkowane przez cGMP. Zwizanie
przynajmniej trzech czsteczek cGMP otwiera pojedynczy kana, co ma miejsce
wwczas, gdy wzrasta stenie cGMP w cytoplazmie (w ciemnoci). Zmniejszenie
poziomu cGMP bezporednio zamyka kanay specyficzne wobec kationw w bonie komrkowej, co ma miejsce na wietle, dziki dziaaniu specyficznej fosfodie-
317
O
O
C CH 2 CH 2 HN
H CH 3
N
N
C C C CH 2 O P O P O CH 2
O
HO CH 3
O
O
HS CH 2 CH 2 HN
cys team ina
alanina
kwas pantoinowy
-
kwas pantotenowy
OH
P
O
O
-
pantoteina
318
NH 2
N H2
N
N
O
O
CH 2
OH
H
OH
O-
H
H
O
O-
C H2 O
H
H
H
H
OH OH
NH2
NH2
N
N
O
O
CH2
P
O
OH
H
OH
O
O
CH2 O
H
H
H
H
OH OH
NH 2
N
N
CH 2
P
O
OH
H
OH
O
O
-
P
O
CH 2 O
H
H
H
H
OH O
O
OH
OH
NADP (forma utleniona)
H
N H2
N H2
N
N
O
C H2
O
H
OH
H
OH
P
O-
O
O
P
O-
N
N
C H2 O
H
H
H
H
OH O
O
OH
OH
N A D P H + H + (fo rm a z re d u k o w a n a )
319
H 3C
NH
N
C H2
ry bitol
OH
OH
OH
C H2 O
O-
O
ortofosfo ran
F M N (form a utlenion a)
320
O
H 3C
H 3C
NH
N
N H2
C H2
H
OH
OH
OH
N
O
C H2 O
P
O
O
P
O
-
C H2 O
H
H
H
H
OH OH
H 3C
H 3C
CH2
NH
OH
OH
OH
CH2 O
N H2
N
N
P
O
O
-
P
O
N
N
C H2 O
H
H
H
H
OH OH
F A D H 2 (fo rm a zred u k ow an a)
Dinukleotyd flawinoadeninowy (FAD), poza fosforyboflawin (FMN) skada si z nukleotydu adeninowego. Podobnie jak dinukleotyd nikotynamidoadeninowy przenosi protony i elektrony, dlatego wystpuje w dwch formach utlenionej
(FAD) i zredukowanej (FADH2). Koenzym flawinowy moe uczestniczy w reakcjach utleniania bezporedniego substratu, np. bursztynianu do fumaranu, redukujc si do FADH2. Zredukowany FADH2 jest dostarczycielem protonw i elektronw na bezporednie akceptory, takie jak cytochromy. Moe te dostarcza je na
tlen czsteczkowy, np. w reakcji katalizowanej przez oksydaz ksantynow, ktrej
produktem jest nadtlenek wodoru, poza kwasem moczowym. Koenzymy flawinowe (zarwno FMN lub FAD) mog te poredniczy w przenoszeniu protonw
i elektronw z koenzymw nikotynamidoadeninowych na akceptory. Koenzymy
flawinowe tworz stosunkowo silne poczenia nukleotydoproteinowe z apoenzymem, dlatego s raczej grupami prostetycznymi, a nie typowymi koenzymami
zdolnymi do oddysocjowywania od apoenzymu.
Adenozyno-3'-fosfo-5'-fosfosiarczan (PAPS) jest aktywnym donorem grup
siarczanowych w reakcjach siarczanowania (sulfonowania) rnych akceptorw,
321
w tym endogennych np. heteroglikanw, lub egzogennych np. zwizkw toksycznych lub hydrofobowych, w procesach detoksykacji wewntrzkomrkowej.
N H2
N
N
O
-
O
O
P
O
C H2 O
H
H
H
H
OH
O
Adenozylometionina jest nukleozydow form aktywnego metylu wykorzystywan w rekcjach metylacji rnorodnych substratw do wanych biologicznie produktw, np. choliny, adrenaliny, kreatyny i in.
NH2
N
N
C OO
+
H C H2C H2C S CH2
+
H3N
H3C
OH OH
ku biosyntezy de novo puryn w organizmie. Fakt ten ley u podstaw terapeutycznego zastosowania allopurynolu w leczeniu hiperurykemii (wzrost we krwi stenia kwasu moczowego) i dny moczanowej.
W ostatnich latach syntetyczne analogi nukleozydw wprowadza si do leczenia zakanych chorb wirusowych, w tym AIDS, ktre osigno rozmiary
wiatowej epidemii. Syntetycznym analogiem naturalnego nukleozydu 2'-deoksyguanozyny jest 9-(2-hydroksyetoksymetylo)guanina, okrelana skrtem ACV
i znana pod nazw acyklowir. Strukturalnie rni si od naturalnego odpowiednika
tylko brakiem fragmentu czsteczki monocukru, obejmujcego dwa atomy wgli
(C2' i C3') rybozy.
O
N
HO
NH
N
NH2
9-(2-hydroksyetoksymetylo)guanina
(ACV)
HN
O
HOCH2 O
N3
3'-azydo-2'-deoksytymidyna
AZT
323
Wirus ten naley do typu RNA ze stadium profaga typu DNA, dlatego w jego cyklu yciowym ma miejsce odwrotna transkrypcja katalizowana przez odwrotn transkryptaz. Podczas terapii zidowudyn, po wbudowaniu przez odwrotn
transkryptaz AZT zamiast naturalnego fosforanu 2'-deoksytymidyny do de novo
syntetyzowanego DNA, jego synteza zostaje zatrzymana, poniewa analog ten ma
grup azydow zamiast grupy -OH w pozycji 3' deoksyrybozy i niemoliwe jest
przyczenie nastpnego nukleotydu. Ujemne dziaanie zidowudyny w organizmie
polega na jego wysokiej toksycznoci wobec szpiku kostnego.
Niekorzystn stron stosowanych syntetycznych analogw nukleozydw
w terapii antywirusowej jest szybkie nabywanie opornoci na te leki przez wirusy.
Due nadzieje budzi chemioterapia zoona, polegajca przykadowo na zastosowaniu kombinacji analogw nukleozydw z syntetycznymi inhibitorami proteaz
(mimetykami peptydw).
Mutagenny efekt analogw zasad azotowych zosta przedstawiony w rozdziale 20.
324
19.
KWASY NUKLEINOWE
Iwona ak
325
NH2
N
C
N
O
5'
CH2 O
O
H
H
H
H
HN
3'
H
T
O
O
N
O P O '
CH3
CH2 O
H
H
H
H
3'
H
O
-
P O
NH2
N
A
N
5'
CH2 O
H
H
H
H
3'
H
O
-
P O
O
O
N
G
N
NH
NH2
5'
CH2 O
H
H
H
H
3'
H
O
3
Polinukleotyd polarny o kierunku 53, z rdzeniem utworzonym z powtarzajcych si
reszt fosfodeoksyrybozy, od ktrego stercz na bok zasady azotowe
326
Kwas deoksyrybonukleinowy
Polimer deoksyrybonukleotydw stanowi informacj genetyczn we wszystkich organizmach ywych, z wyjtkiem niektrych wirusw typu RNA. Eukariotyczny DNA wystpuje w postaci acuchowego dwuniciowego polimeru, natomiast prokariotyczny DNA to z reguy struktura zamknita, kolista. Czsteczka
DNA jedynie u bakteriofaga (174) jest jednoniciowa, lecz w cyklu yciowym tego faga pojawia si struktura dwuniciowa DNA.
Czsteczki DNA s olbrzymie, ich masy czsteczkowe mog siga 1,9 106
daltonw, wielko 2,6 106 kilozasad (kb), a dugo do 12 cm.
Obie nici DNA biegn w przeciwnych kierunkach, czyli s antyrwnolege
w odniesieniu do ich 5'3' kierunkw i maj komplementarn sekwencj. Komplementarno przeciwlegych nici wynika ze struktury zasad azotowych i przestrzennych ogranicze rdzenia fosfocukrowego DNA. Komplementarne pary pirymidyna puryna o podobnej geometrii i wymiarach s utrzymywane wizaniami
wodorowymi. Tymina tworzy par z adenin, stabilizowan dwoma wizaniami
wodorowymi.
H
O
H3C
H
H
N
cukier
N
O
cukier
TA
H
H
O
N
N
cukier
N
N
N
cukier
N
H
CG
W obrbie dwuniciowego DNA wyrnia si tzw. pasmo matrycowe, inaczej zwane nonsensownym lub wiodcym, ktre zaczyna si kocem 3', zawiera
informacj genetyczn i jest matryc do transkrypcji czsteczek RNA. Drugie,
przeciwlege do matrycowego to tzw. pasmo kodujce, inaczej zwane, sensow327
nym lub opniajcym, ktre zaczyna si kocem 5'. Sekwencja tego pasma odpowiada transkryptowi (pocztkowy produkt transkrypcji), ktry koduje biako (poza
faktem, e zamiast T jest U) i std wywodzi si jego nazwa.
W latach 19491953 Erwin Chargaff wraz z wsppracownikami przeprowadzili szczegowe badania z zastosowaniem metod chromatograficznych nad
zalenociami ilociowo-jakociowymi midzy zasadami azotowymi w hydrolizatach DNA, pochodzcych z rnych rde. Wyniki tych analiz chemicznych (znane jako reguy Chargaffa) nie byy zrozumiae a do czasu zaproponowania i zdefiniowania modelu dedukcyjnego dwuniciowej, helikalnej struktury drugorzdowej
DNA przez Jamesa Watsona i Francisa Cricka w 1953 roku. Zaproponowany przestrzenny model Watsona-Cricka wyjani, e reguy Chargaffa odzwierciedlaj
podstawowe cechy struktury DNA.
Podstawowymi reguami Chargaffa s nastpujce prawidowoci:
zawarto molowa A rwna si T,
zawarto molowa G rwna si C,
suma ste A+G rwna si sumie ste C+T.
Z regu tych wynika, e wystarczy zna udzia procentowy tylko jednego z
czterech nukleotydw (np. A), aby ustali udzia procentowy wszystkich pozostaych trzech nukleotydw (T, C, G) w analizowanej czsteczce DNA.
Natomiast stosunek sumy ste molowych A+T do sumy ste G+C jest
gatunkowo specyficzny, w zwizku z tym wszystkie czsteczki DNA mona sklasyfikowa w trzy typy, mianowicie:
czsteczki DNA, w ktrych [A] + [T] > [G] + [C],
czsteczki DNA, w ktrych [A] + [T] < [G] + [C],
czsteczki DNA, w ktrych [A] + [T] = [G] + [C].
Czsteczki DNA pierwszego typu s najbardziej powszechne, z reguy rnice midzy sum AT a sum GC okazuj si stosunkowo niewielkie, przedstawicielami ich mog by zarwno czsteczki DNA pochodzce z wirusw (Polyoma),
bakterii (Mycoplasma), drody, muszek (Drosophila), jak i z organizmu czowieka. Przedstawicielem DNA trzeciego typu mog by czsteczki DNA wywodzce si
z Echerichia coli. Rzadko wystpuj czsteczki DNA drugiego typu, obecne np.
u Alcaligenes faecalis.
Kwasy deoksyrybonukleinowe lub ich rejony mog wystpowa w trzech
gwnych formach przestrzennych (strukturach drugorzdowych) zwanych A, B
i Z. Dominujc struktur drugorzdow DNA jest forma B, bdca regularn prawoskrtn helis, zgodn z modelem Watsona i Cricka. Oba antyrwnolege acuchy B-DNA zwijaj si helikalnie wok osi helisy, do ktrej pary zasad azotowych ukadaj si prostopadle.
328
B-DNA
A-DNA
Z-DNA
Schematyczne diagramy gwnych form: A-, B-, Z-DNA. (wg [12], zmodyfikowane)
W centrum helisy DNA znajduj si zasady azotowe obu nici, ktrych paszczyzny uoone s jedna nad drug w formie charakterystycznych dwch stosw,
stabilizowanych warstwowo oddziaywaniami hydrofobowymi. Na zewntrz helisy
DNA umiejscowione s oba rdzenie fosfocukrowe, pomidzy ktrymi przebiegaj
helikalnie dwie bruzdy (rowki): maa o szerokoci 6 i dua o szerokoci 12 .
rdze cukrowo-fosforanowy
329
330
Kwasy rybonukleinowe
Czsteczki kwasw rybonukleinowych s znacznie mniejsze od czsteczek
DNA, ich masa czsteczkowa osiga 35 000 daltonw. Wszystkie czsteczki RNA
s formami jednoniciowymi, niektre mog tworzy rejony dwuniciowe, stabilizowane wizaniami wodorowymi midzy komplementarnymi zasadami azotowymi. Rejony dwuniciowe w obrbie pojedynczej nici polinukleotydowej powstaj
midzy sekwencjami komplementarnymi, ktre s rozmieszczone w rnych rejonach liniowej struktury pierwszorzdowej, oddziauj ze sob parami i s stabilizowane wizaniami wodorowymi. Oddziaywania te sprawiaj, e pojawiaj si
sparowane rejony dwuniciowe w obrbie pojedynczej nici polinukleotydowej.
Rejony sparowane nadaj okrelon struktur przestrzenn czsteczce.
RNA zamiast deoksyrybozy zawiera ryboz, a zamiast tyminy uracyl. Wyrnia si trzy gwne typy RNA, z ktrych kady spenia odmienne funkcje, s to:
informacyjny RNA (mRNA), transportujcy RNA (tRNA) i rybosomalny RNA
(rRNA).
Wszystkie wymienione typy kwasw rybonukleinowych eukariotycznych s
produktami rnorodnych modyfikacji chemicznych, ktre maj miejsce po transkrypcji i skadaj si na proces okrelany mianem dojrzewania RNA, ktremu
podlega wikszo pierwotnych transkryptw (bezporednich produktw transkrypcji). Proces dojrzewania RNA obejmuje nastpujce zmiany: 1) usuwanie
pewnych sekwencji nukleotydowych przez endonukleazy, rybozymy i egzonukleazy; 2) dodawanie nukleotydw do koca 5' i 3' pierwotnego transkryptu lub produktu jego rozcicia; 3) chemiczne modyfikacje (gwnie metylacje) niektrych
nukleotydw w obrbie zasad azotowych lub reszt monocukrowych. Kwasy rybo-
331
mRNA
Informacyjny RNA suy jako matryca w syntezie biaka. W komrce jest
tyle specyficznych rodzajw czsteczek mRNA, ile komrka syntetyzuje rodzajw
acuchw polipeptydowych. Informacyjne RNA stanowi okoo 5% wszystkich
kwasw rybonukleinowych w komrce. Dojrzae czsteczki mRNA maj podobny plan budowy w komrkach eukariotycznych.
czapeczka
sekwencja kodujca
ogon poli(A)
P~P-N7CH3G
N6CH3A
N6CH3A
AAAA.....AAAAAA
W budowie wikszoci eukariotycznych mRNA charakterystyczne jest wystpowanie trzech staych elementw, mianowicie czapeczki (ang. cap) znajdujcej
si na kocu 5', specyficznej sekwencji kodujcej i ogona poli(A), ktry wystpuje na kocu 3'.
Czapeczk stanowi reszta N7-metyloguanozyny o odwrconej orientacji
(w porwnaniu z typowymi wizaniami 3'5'-fosfodiestrowymi), ktra poczona
jest mostkiem 5'-5'-trifosforanowym, najczciej z N6-metyloadenozyn. Ta szczeglna chemiczna modyfikacja powstaje kotranskrypcyjnie, zanim syntetyzowany
RNA osignie dugo 2030 nukleotydw. Dwa pierwsze nukleotydy za czapeczk mog by metylowane, zarwno w pozycji atomu azotu zasady azotowej (zwykle jest to N6 adeniny), jak i w pozycji C2' rybozy.
Funkcja czapeczki polega na ochronie pre-mRNA oraz mRNA przed dziaaniem 5'-egzonukleaz, ponadto uczestniczy w procesie dojrzewania mRNA (np.
w splicingu), w transporcie mRNA z jdra do cytoplazmy i translacji.
Sekwencja kodujca (czyli rejon ulegajcy translacji) jest specyficzna dla
kadego rodzaju mRNA, tym samym odmienne rodzaje mRNA rni si sekwencj kodujc. Sekwencja kodujca mRNA jest komplementarna do sekwencji eksonw pojedynczej nici matrycowej DNA, przy czym U jest komplementarna do A
w nici DNA. Tym samym sekwencja kodujca mRNA stanowi kopi eksonw nici
kodujcej DNA, jednak w mRNA wystpuje U wszdzie tam, gdzie w kodujcej
nici DNA wystpuje T.
332
HO OH
C C
HC H H CH
O
H2 N
5'
H2 C O
NH2
O
P
O
HN
N
O
CH3
O
O P
O
O
O P
5'
O CH2
O
O
HC H H CH
2'
3'
C C
OCH 3
O
NH
CH 2
P
O
O
HC H H CH
3'
C C
OH
W procesie dojrzewania sekwencja kodujca jest skadana z eksonw premRNA, po wyciciu sekwencji interweniujcych, zwanych intronami (niekodujcych), ktre przerywaj sekwencje kodujce zwane eksonami. Proces rozcinania
pre-mRNA, wycinania intronw i skadania eksonw nazywa si skadaniem
mRNA (ang. splicing). Reakcje te zachodz w jdrze komrkowym i wymagaj
obecnoci w intronie sekwencji na kocu 5'-GU-3', a na kocu 3' sekwencji
5'-AG-3', poprzedzonej sekwencj bogat w pochodne pirymidyny, zwan traktem
polipirymidynowym, przed ktr ma znajdowa si sekwencja rozgazienia.
Podczas skadania mRNA, w wyniku ataku grupy 2'-hydroksylowej z reszty
nukleotydu adeninowego sekwencji rozgazienia na wizanie z udziaem G z 5'
koca, powstaje charakterystyczna czsteczka o ksztacie lassa oraz wolny ekson 1.
Po czym nastpuje rozcicie po reszcie G w sekwencji AG na kocu 3' intronu, w wyniku czego intron zostaje uwolniony w postaci lassa i zdegradowany,
a dwie sekwencje eksonowe cz si ze sob. Podczas dojrzewania alternatywnego moe mie miejsce przeksztacanie pre-mRNA w wicej ni jeden rodzaj dojrzaego mRNA, dziki rnym sposobom skadania (tzw. alternatywne skadanie).
Alternatywne skadanie mRNA wynika ze zrnicowanego uycia miejsc splicingowych 5' i 3', dziki wykorzystaniu rnych promotorw, uyciu rnych
miejsc poli(A) i ostatecznie z pozostawienia jednych, a usunicia innych eksonw.
333
tRNA
Czsteczki tRNA peni funkcje czsteczek adaptorowych, ktre dostarczaj
aminokwasy do rybosomw, gdzie tworzone s wizania peptydowe midzy aminokwasami w kolejnoci okrelonej przez mRNA.
Transportujce RNA stanowi okoo 15% wszystkich kwasw rybonukleinowych w komrce. Istnieje przynajmniej jeden tRNA dla kadego z dwudziestu
aminokwasw (cznie 61 tRNA).
Czsteczki tRNA s mae, jak na kwasy nukleinowe, ich liniowa sekwencja
moe mie dugo od 60 do 95 nukleotydw, zazwyczaj 76. Na kocu 5' czsteczki znajduje si monofosforan, zwykle przy guanozynie, a na kocu 3' staa trjnukleotydowa sekwencja 5'-CCA-3'. W sekwencji tej do grupy -OH przy C2' lub C3'
rybozy nukleotydu adeninowego przycza si aminokwas wizaniem estrowym.
Sekwencja 5'-CCA-3 prokariotycznych tRNA jest zakodowana w genie, natomiast
334
5p
PTLA
DHU
PTLA
TC
G
T
G
C
PTLA
ANTYKODONOWA
335
336
wa in vitro rybozym RNazy P wymaga wikszego stenia jonw Mg2+ od stenia magnezu obecnego w komrkach.
rRNA
Rybosomalne RNA s jednoniciowymi polirybonukleotydami, wystpujcymi w komrkach jako gwne skadniki rybosomw oraz jderka. Stanowi okoo 80% komrkowego kwasu rybonukleinowego. Masa czsteczkowa wikszoci
rRNA jest bardzo dua, poniewa pojedyncza czsteczka moe zawiera kilka tysicy nukleotydw, z wyjtkiem nielicznych, ktrych pojedyncza czsteczka posiada 121 lub 158 nukleotydw.
Charakterystyczn modyfikacj chemiczn dla czsteczek rRNA stanowi
metylacja, wykryto 24 swoiste metylacje zasad azotowych, przy czym grupa metylowa dodawana jest gwnie do piercienia adeniny. Ponadto, czsto obserwuje si
metylacj prowadzc do 2'-O-metylorybozy, ktra moe zachodzi w ponad 100
miejscach czsteczki rRNA. Reakcje metylacji, zachodzce w jdrze komrkowym, przeprowadzaj niskoczsteczkowe czstki RNP, ktrych snRNA s komplementarne do rejonw rRNA, z ktrymi tworz pary, definiujc w ten sposb
miejsca metylacji. Aktywnym donorem grup metylowych jest S-adenozylometionina.
Struktura drugorzdowa wszystkich czsteczek rRNA wyrnia si obecnoci sparowanych rejonw dwuniciowych, tzw. ramion, poprzedzielanych rejonami niesparowanymi, jednoniciowymi, tzw. ptlami. Obecno w
PTLE
RAMIONA
polirybonukleotydzie rejonw ramion i ptli sprzyja specyficznym oddziaywaniom i wizaniu biaek, tym samym tworzeniu kompleksw rybonukleoproteinowych RNP, majcych istotne znaczenie w formowaniu rybosomw.
337
W komrkach eukariotycznych wystpuj 4 rodzaje rRNA. Wielkoczsteczkowy rRNA, ktrego acuch polirybonukleinowy tworzy 4718 nukleotydw,
okrela si jako 28S rRNA.
[Wielko S (Swedberg) jest liczbow wartoci wspczynnika sedymentacji (s),
zdefiniowanego szybkoci, z jak makroczsteczki sedymentuj (opadaj) w polu
wirowania (przyspieszenia odrodkowego, tysickrotnie wikszego od pola grawitacji ziemskiej), osiganego w ultrawirwkach. Wartoci S s nieaddytywne, poniewa zale od masy i ksztatu czsteczki.]
Mniejsz czsteczk jest 18S rRNA, ktra skada si z 1874 reszt nukleotydowych. Niskoczsteczkowe rRNA s dwa, jeden z nich, mianowicie 5,8S rRNA
(skadajcy si z 158 nukleotydw), wystpuje tylko u eukariota, drugi natomiast,
5S rRNA (skadajcy si z 121 nukleotydw), poza tym, e jest obecny w komrkach eukariotycznych, charakterystyczny jest rwnie dla komrek prokariotycznych. W komrkach prokariotycznych wystpuj 3 rodzaje rRNA, mianowicie:
23S rRNA, 16S rRNA i 5S rRNA.
Dojrzae czsteczki rRNA powstaj z pierwotnego transkryptu pre-rRNA,
pojedynczego dugiego prekursora, w wyniku serii modyfikacji i ci w tzw. zewntrznych transkrybowanych sekwencjach lub wewntrznych transkrybowanych
sekwencjach rozdzielajcych, skadajcych si na proces dojrzewania. W komrkach ssakw pierwotny transkrypt o wielkoci rzdu 13 500 nukleotydw zawiera
po jednej kopii 18S rRNA, 5,8S rRNA i 28S rRNA. Natomiast eukariotyczny 5S
rRNA powstaje z odrbnego genu w procesie transkrypcji katalizowanej przez
polimeraz RNA (III), odmienn od polimerazy RNA (I), ktra transkrybuje prerRNA dla trzech pozostaych rybosomalnych kwasw rybonukleinowych. Proces
dojrzewania transkryptu 5S rRNA jest znacznie ograniczony lub te nie zachodzi
wcale. Wszystkie trzy prokariotyczne rRNA transkrybowane s przez jedn polimeraz RNA III w formie pojedynczej nici pierwotnego transkryptu, na ktrej
znajduj si rwnie sekwencje pre-tRNA.
Proces dojrzewania pre-rRNA katalizowany jest enzymatycznie, w tym rwnie przez rybozymy. Udowodniono (przynajmniej u jednego przedstawiciela eukariota), e wystpujcy w pre-rRNA u Tetrahymena termophila intron przeprowadza autokatalityczny splicing. W ukadzie in vitro intron ten wymaga kofaktora,
ktrym jest guanozyna lub jej ufosforylowane pochodne, natomiast zupenie nie
potrzebuje obecnoci biaek do wycicia si z prekursora. Intron ten spenia kryteria typowego rybozymu. Rybozym ten, poza wasnoci samowycinania, posiada
zdolno katalizowania ligacji uwolnionych fragmentw rRNA. Rybozymy, czyli
katalityczne, krtkie czsteczki RNA, charakteryzuj si minimalnymi wymogami
sekwencyjnymi, koniecznymi do ujawnienia swych wasnoci. Fakt ten sta si
podstaw konstruowania syntetycznych rybozymw, ktre mog rozcina inne
czsteczki RNA, w nadziei, e bdzie mona je stosowa w terapii, do inaktywacji
odpowiednich mRNA, wirusw i do zabijania komrek nowotworowych.
338
Dojrzewajce czsteczki rRNA zwijaj si w przestrzeni, cz si z biakami rybosomowymi, podlegajc samoorganizacji prowadzcej do wytworzenia rybosomw. Oznacza to, e informacje o strukturze rybosomw s zawarte w strukturze ich skadnikw.
Rybosomy to typowe RNP, czyli kompleksy rybonukleoproteinowe o olbrzymiej masie czsteczkowej, rzdu 2,75 106 daltonw u prokariota (70 S) i rzdu 4,5 106 daltonw u eukariota (80 S). Kady rybosom skada si z dwch podjednostek, wikszej i mniejszej.
Rybosomy eukariotyczne w swej duej podjednostce (o wielkoci 60S,
czyli 3 106 Da) zawieraj trzy rodzaje rRNA (28S, 5,8S, 5S) i okoo 45 rnych
biaek, natomiast w maej podjednostce (o wielkoci 40S, czyli 1,5 106 Da) jeden
rodzaj rRNA (18S) oraz okoo 30 rnych biaek.
Rybosomy prokariotyczne w swej duej podjednostce (o wielkoci 50S,
czyli 1,7 106 Da) zawieraj dwa rodzaje rRNA (23S, 5S) oraz okoo 31 rnych
biaek, natomiast w maej podjednostce (o wielkoci 30S, czyli 0,95 106 Da) jeden
rodzaj rRNA (16S) oraz okoo 21 rnych biaek.
339
75
80
85
temp.
341
100
80
60
40
20
0
70
80
90
100
110
temperatura topnienia
342
C
dsDNA
ssDNA
343
jednoniciowy
Absorbancja
dwuniciowy
220
260
300
nm
344
Denaturacji i renaturacji DNA, poza zmian absorpcji wiata w ultrafiolecie, towarzysz zmiany innych wasnoci fizycznych, jak lepko i skrcalno
optyczna.
Wasnoci spektroskopowe makroczsteczek pozwalaj okreli przyblion
czysto preparatw kwasw nukleinowych, na podstawie wartoci stosunku
absorbancji przy 260 nm i 280 nm (A260/A280). Wolny od zanieczyszcze dwuniciowy DNA ma warto wspczynnika A260/A280 rwn 1,8, czysty RNA okoo 2,
czyste biaka poniej 1 (okoo 0,5). Preparat DNA, ktrego warto wspczynnika
A260/A280 jest wiksza od wartoci 1.8, moe by zanieczyszczony RNA. Jeli
wspczynnik A260/A280 ma warto poniej 1.8, to preparat zanieczyszczony moe
by biakami.
345
20.
CZYNNIKI MODYFIKUJCE
STRUKTUR DNA
Iwona ak, Pawe Niemiec
Czynniki chemiczne lub fizyczne o charakterze mutagennym s niejednorodn grup. Wszystkie reaguj bezporednio z DNA, wprowadzajc modyfikacje
w strukturze nukleotydw, lece u podstaw zmian sekwencji zasad azotowych.
Chemicznymi czynnikami modyfikujcymi struktur DNA s: kwas azotawy, hydroksylamina, zwizki alkilujce, analogi zasad azotowych, barwniki akrydynowe,
policykliczne wglowodory aromatyczne oraz reaktywne formy tlenu. Charakter
mutagenny wykazuj niektre leki, np.: pewne klasy cytostatykw, antybiotykw
oraz lekw psychotropowych. Do fizycznych czynnikw mutagennych zalicza si
promienie X, promienie , , , UV oraz hipertermi.
O
N
kwas azotawy
deaminacja
N
H
cytozyna
NH2
O
N
N
N
adenina
N
H
uracyl
N
H
kwas azotawy
HN
deaminacja
N
N
H
hipoksantyna
346
O
N
HN
H2N
kwas azotawy
deaminacja
N
H
HN
O
guanina
N
N
H
H
ksantyna
OH
O
N
CH3 S O CH3
H2N C N
CH2CH3
N
HONH
O
metylosulfonian metylu
hydroksylamina
etylonitrozomocznik
Do zwizkw alkilujcych nale midzy innymi sulfonian dietylowy, sulfonian etylometylowy oraz metylosulfonian metylu, etylonitrozomocznik i diepoksybutan. Obecno grup metylowych, etylowych i innych w tych zwizkach, powoduje alkilacj zasad azotowych. Najwiksz wraliwo na alkilacj w -helisie
wykazuje atom azotu (N7) guaniny. W dalszej kolejnoci mog ulega alkilacji
atomy azotu guaniny (N1), adeniny (N1 i N3) i cytozyny (N3). Pod wpywem tych
zwizkw obserwuje si liczne tranzycje i transwersje typu: ATTA, ATGC,
GCCG, GCAT, GCTA. Analogiczny mechanizm dziaania (z mechanizmem bifunkcyjnych zwizkw alkilujcych) wykazuj niektre pochodne platyny
(Pt), wykorzystywane w terapii przeciwnowotworowej. Do grupy tej naley midzy innymi cis-diamino-dichloroplatyna (cDDP).
H3N
Cl-
Pt
ClNH3
trans -diamino-dichloroplatyna
ClCl-
Pt
NH3
NH3
cis -diamino-dichloroplatyna
Rezultatem budowy cDDP (centralnie pooony atom Pt z dwiema reaktywnymi grupami Cl-) jest skonno do atwej zamiany ligandw w rodowisku wodnym i do formowania kompleksw z grupami funkcyjnymi o ujemnym adunku,
czyli z grupami nukleofilowymi w czsteczkach substancji biologicznie czynnych.
347
Mona wyrni dwa rodzaje oddziaywa tego cytostatyku z DNA. S to monofunkcyjne oraz bifunkcyjne reakcje zwizku. Efekt monofunkcyjny dotyczy rzadkich przypadkw, kiedy jeden z atomw chloru unieczynniany jest przez np. H2O
(ryc. a) lub biako niehistonowe ryc. b (okoo 0,15% wszystkich adduktw
cDDPDNA).
a)
b)
c)
d)
Bifunkcyjne dziaanie cis-platyny jest znacznie czciej spotykane i silniejsze od monofunkcyjnego. Reakcja wymiany obu ligandw moe mie dwojaki
charakter: jeden z nich polega na midzyniciowym wizaniu krzyowym z zasadami nalecymi do dwch rnych nici (ryc. c), stanowi mniej ni 1% cakowitej
iloci adduktw cDDPDNA. Drugi, najwaniejszy pod wzgldem terapeutycznym, polega na wewntrzniciowym wizaniu krzyowym z zasadami azotowymi
nalecymi do tej samej nici (ryc. d), stanowi okoo 98% wszystkich adduktw
cDDPDNA. Odlego midzy dwoma labilnymi ligandami Cl- w czsteczce
cDDP jest rzdu 0,33 nm, niemal taka sama, jak odlego midzy dwiema ssiadujcymi zasadami w -helisie. Std w krzyowych wizaniach wewntrzniciowych dominuj oddziaywania typu 1,2-wiza wewntrzniciowych. Oddziaywania te nie wystpuj w izomerze trans-DDP, u ktrego odlego midzy dwoma
labilnymi ligandami Cl- rwna si 0,45 nm. Trans-diamino-dichloroplatyna nie
wykazuje wic waciwoci genotoksycznych.
Analogi zasad azotowych s strukturalnie podobne do zasad wystpujcych
w czsteczce DNA, dziki temu mog by rozpoznawane i wbudowywane podczas
TA CGTTG
A TGCA A C
5Bu
TA CGBTG
A TGCA A C
O
Br
HN
zmiana
tautomeryczna
TA CGBTG
A TGCGA C
N
H
5 - bromouracyl
5-bromouracyl
( 5Bu )
5Bu
348
replikacja
TA CGCTG
A TGCGA C
H 2N
N
proflawina
NH 2
H 2N
NH 2
CH 3
akryflawina
Interkalatorem jest te bromek etydyny. Czsteczka tego zwizku zawiera cztery piercienie o rozmiarach zblionych do pary zasad puryna-pirymidyna.
Mechanizm dziaania bromku etydyny jest podobny do mechanizmu dziaania
barwnikw akrydynowych. Zwizek ten wykorzystuje si powszechnie jako barwnik DNA, stosowany w elektroforezie agarozowej. Pod wpywem UV zwizany
z DNA bromek etydyny emituje wiato o zabarwieniu pomaraczowym.
NH2
H2N
N+
CH3Br-
Wielopiercieniowe wglowodory aromatyczne, takie jak np. benzo[a]piren czy benzo[a]antracen tworz addukty z DNA. S to produkty reakcji przyczania (addycji) atomw lub czsteczek (w tym przypadku wielopiercieniowych
wglowodorw aromatycznych) do czsteczki innego zwizku (w tym przypadku
DNA).
349
O
cytochrom P 450
aktywacja metaboliczna
HO
OH
benzo[a]piren
7, 8 -diol - 9, 10 - tlenek
Wielopiercieniowe wglowodory aromatyczne zaliczane s do promutagenw, czyli zwizkw, ktre staj si waciwymi mutagenami dopiero po metabolicznym przeksztaceniu w organizmie. W aktywacji metabolicznej czsto uczestniczy kompleks cytochromu P450. Podobne zwizki wystpuj w dymie papierosowym, kawie, herbacie oraz przede wszystkim w pokarmach pochodzenia zwierzcego. Najwicej znajduje si ich w tzw. czerwonym misie.
Addukty z DNA tworz take niektre heterocykliczne aminy aromatyczne, powstajce rwnie podczas obrbki termicznej biakowych produktw ywnociowych, szczeglnie podczas dugotrwaego smaenia misa w temperaturze
powyej 150C, skutkiem pirolizy aminokwasw (glicyna, kwas glutaminowy,
tryptofan, fenyloalanina). Dziki czeniu si z kreatynin i cukrem tworz mutagenne heterocykliczne aminy aromatyczne, np:. 3-amino-1-metylo-5H-pirydo
[4,3-b]indol (Trp-P-2), 2-amino-6-metylodipirydo [1,2-a:3,2-d]indol (Glu-P-1),
2-amino-5-fenylopirydyna.
CH3
N
NH2
N
H
( Trp - P -2)
N
N
NH2
NH2
2 - amino- 5 - fenylopirydyna
N
CH3
(Glu
- P-1)
( Glu-P-1)
Wolne rodniki reagujce z DNA to rodnik hydroksylowy (OH), jon wodorkowy (H) oraz anion ponadtlenkowy (O2-). Gwn, aktywn form tlenu, odpowiedzialn za powstanie wikszoci oksydacyjnych uszkodze czsteczki DNA,
jest rodnik hydroksylowy. Wynika to z jego silnie elektrofilowego charakteru,
ktry warunkuje dwa podstawowe typy przemian skadowych czsteczki DNA:
350
O
CH3
HN
OH
N
H
tymina
N
H
glikol tyminy
H2N
O
N
HN
HN
OH
N
guanina
CH3
OH
HN
OH
N
H
H2N
N
H
N
CHO
NH2
Fapy-guanina
Rodniki hydroksylowe, poza oddziaywaniem z zasadami azotowymi i biakami, mog rwnie reagowa z piercieniami deoksyrybozy. Rodnik hydroksylowy moe indukowa oderwanie kadego atomu wodoru zwizanego z czsteczk
cukru. Nie wszystkie uszkodzenia piercienia cukrowego s wynikiem bezporedniej reakcji rodnika hydroksylowego z czsteczk cukru. Dua ich cz moe
powstawa take na skutek oderwania atomu wodoru od czsteczki cukru przez
powstay rodnik zasady azotowej.
2
O
O
CH3
CH3
HN
promieniowanie UV
N
H
tymina
O
CH3
NH
N
H
N
H
dimer tymidynowy
Wynikiem tej reakcji jest powstanie piercienia cyklobutanowego, ktry powoduje zblienie ssiadujcych pirymidyn, odksztacenia w szkielecie cukrowofosforanowym DNA, prowadzce w rezultacie do delecji takiego dimeru.
352
21.
ANALIZA
INSTRUMENTALNA
Instrumentalna analiza chemiczna powstaa dziki konstruowaniu precyzyjnych aparatw pomiarowych, ktre pozwalaj wykorzysta wasnoci fizykochemiczne zwizkw do ich analizy jakociowo-ilociowej. Spord rnych technik
analizy instrumentalnej omwiono tylko niektre, podstawowe z zakresu technik
optycznych, elektrycznych i chromatograficznych.
ABSORPCJOMETRIA
Iwona ak, Beata Sarecka
Absorpcjometria jest analityczn technik optyczn, wykorzystujc zdolno substancji chemicznych bdcych w roztworze do pochaniania wiata ca
sw objtoci oraz pomiar natenia wizki wiata. Czsteczki zwizkw zdolnych do absorpcji promieniowania wietlnego s ukadami rezonansowymi, zdolnymi do drga z czstotliwoci zgodn z czstotliwoci drga fal elektromagnetycznych o okrelonej dugoci fali. Rne substancje pochaniaj promieniowanie
zwykle o odmiennej dugoci fali, jeli jednak pochaniaj fale tej samej dugoci,
to z rn intensywnoci.
Substancje mog pochania promieniowanie elektromagnetyczne w zakresie wiata widzialnego (VIS od ang. visible), tzn. o dugoci od 400 do 750 nm
(zakres kolorymetrii), lub nadfioletu (UV od ang. ultra violet), tzn. o dugoci od
200 do 400 nm, czy te podczerwieni (IR od ang. infra red), obejmujcej obszar
powyej 750 nm: podczerwie bliska zakres dugoci fal 7502500 nm; podczerwie 2,525 m.; podczerwie daleka powyej 25 m do uamkw milimetra. Promieniowanie o dugoci fal 0,4200 nm to daleki nadfiolet, ktry charakteryzuje si tym, e jest pochaniany przez atomy tlenu, dlatego analizy w spektrofotometrze z tym zakresem wykonuje si po usuniciu z niego powietrza, czyli w
prni.
rdem promieniowania mog by lampy spektralne (np. deuterowe, wodorowe, rtciowe, sodowe), lasery lub lampy arowe. Lampy spektralne i lasery daj
353
widmo liniowe, natomiast lampy arowe widmo cige. W celu otrzymania okrelonej dugoci fali uywa si odpowiednich monochromatorw. W monochromatorze znajduje si ukad (pryzmat, siatka dyfrakcyjna lub filtry), ktry przez odpowiednie ustawienie na szczelin wyjciow pozwala skierowa wizk promieniowania o danej dugoci fali. Ze szczeliny wyjciowej wizka monochromatyczna
wpada do pomieszczenia pomiarowego, w ktrym przechodzi przez odpowiednie
naczynie (kuwet) z roztworem zawierajcym analizowany zwizek.
Kuwety powinny by wykonane z materiau przezroczystego dla okrelonych dugoci fal. Najpowszechniejszym materiaem przezroczystym jest kwarc,
stosowany dla fal o dugoci: 200400 nm, 400750 nm oraz 7502500 nm. Poza
tym, dla fal o dugoci 400750 nm stosuje si rwnie wysokojakociowe szko,
a dla duszych fal podczerwieni krysztay: NaCl (w zakresie 2,515 m), KBr (do
25 m), CsBr (w zakresie 2540 m) i specjalne gatunki polietylenu przezroczystego dla fal o dugoci w granicach 15300 m.
Podstaw kolorymetrycznego oznaczania stenia substancji w roztworze
stanowi zaleno midzy intensywnoci zabarwienia roztworu, a steniem zawartej w nim substancji. Metoda ta suy do oznaczania stenia substancji majcych wasn barw. Barwa substancji zaley od selektywnej absorpcji okrelonej
dugoci wiata widzialnego i jest barw dopeniajc do pochonitej. Na zabarwienie roztworu skadaj si fale elektromagnetyczne nie zaabsorbowane przez
analizowan substancj, czyli promieniowanie przepuszczone. Przykadowo, czerwona barwa roztworu substancji moe by wynikiem pochaniania zieleni, ktra
jest barw dopeniajc do czerwieni lub zdolnoci analizowanej substancji do
przepuszczania wycznie promieniowania czerwonego. Podobnie ta barwa roztworu substancji moe by wynikiem pochaniania fal niebieskich, ktre s barw
dopeniajc do tej lub zdolnoci analizowanej substancji do przepuszczania
wycznie promieniowania tego.
Roztwory substancji bezbarwnych to takie, w ktrych aden z rodzajw
promieni widzialnych nie ulega pochoniciu.
Substancje bezbarwne mona oznacza ilociowo metod kolorymetyczn,
lecz po przeprowadzeniu ich w barwne pochodne na drodze stechiometrycznych
reakcji chemicznych, ktre powinny przebiega szybko i do koca, powinny by
powtarzalne i specyficzne oraz atwe do przeprowadzenia. Specyficzno reakcji
zwykle okrela uyty odczynnik barwicy, ktry powinien reagowa tylko z badan substancj i nie powinien wchodzi w reakcj z adn inn substancj obecn
w roztworze. Powstaa barwa powinna by: trwaa, niewraliwa na wiato, niepodatna na zmiany pH, niezalena od zmian temperatury i nadmiaru odczynnika barwicego.
Efekty absorpcji w zakresie wiata widzialnego i ultrafioletu obserwuje si
w widmach zwizkw zawierajcych grupy chromoforowe oraz ugrupowania
354
\
C
/
\
C
/
\
C
/
C
/
C
\
C
/
\
C
NH2,
OH,
OCH3,
SH,
Cl,
Br
I
I0
T% =
I
100
I0
I
1
= log 0 = c 1
T
I
gdzie:
wspczynnik absorpcji; c stenie roztworu; l grubo warstwy roztworu absorbujcego w cm.
355
A
l / mol cm
cl
to
c=
l/ mol cm
staje si asymptot krzywej, niemoliwe okazuje si przyporzdkowanie pojedynczej wartoci absorbancji tylko jednego stenia, bo w miar postpu krzywej,
jednej wartoci absorbancji mona przyporzdkowa nieskoczenie wiele ste.
3
1
ABSORBANCJA
STENIE
Prawo Bouguera-Lamberta-Beera stosuje si tylko do pocztkowego odcinka
wykresu zalenoci absorbancji do stenia. Jest on prostoliniowy i nazywa si
wykresem kalibracyjnym (1), z ktrego mona odczyta szukane stenie roztworu po zmierzeniu wartoci jego absorbancji. W wykresie kalibracyjnym mog
zdarza si odchylenia od prostoliniowej zalenoci, mianowicie: ujemne (2)
gdy absorbancja zwiksza si wolniej wraz ze zwikszaniem stenia, ni wynikaoby to z proporcjonalnej zalenoci, lub dodatnie (3) gdy absorbancja zwiksza si znaczniej wraz ze zwikszaniem stenia, ni wynikaoby to z proporcjonalnej zalenoci. Przyczynami odchyle od prawa Lamberta-Beera mog by
takie zjawiska, jak: dimeryzacja, dysocjacja lub asocjacja, ktre mog wpywa na
wasnoci optyczne substancji oraz zale od stenia. Wykres kalibracyjny wykorzystuje si w zakresie prostoliniowej zalenoci.
Ponadto, stenie substancji, speniajcej prawo Bouguera-Lamberta-Beera
w zakresie ste, dla ktrych zaleno absorbancji od stenia jest prostoliniowa,
mona oznaczy bez sporzdzania wykresu kalibracyjnego. W tym celu mierzy si
warto absorbancji roztworu analizowanej substancji o znanym steniu (wzorzec) oraz roztworu analizowanego o nieznanym steniu. Stenie oznaczane
oblicza si po przeksztaceniu nastpujcej proporcji:
Aw : Ax = cw : cx
cx = cw Ax / Aw
gdzie:
Aw absorbancja roztworu o znanym steniu (wzorca); Ax absorbancja roztworu analizowanego o nieznanym steniu; cw stenie znane, wzorca; cx stenie oznaczane
357
Aparaty suce do pomiaru absorbancji to absorpcjometry. Stenie zwizkw barwnych oceniano pierwotnie przez intensywno zabarwienia, czyli koloru,
std wywodzi si wci uywana nazwa kolorymetria, odnoszca si do absorpcjometrii w wietle widzialnym. Przyrzdem sucym do tego typu pomiarw jest
kolorymetr, ktry mona traktowa jako uproszczony spektrofotometr.
Przyrzdy stosowane do pomiaru absorpcji promieniowania mona najoglniej podzieli na:
1) fotokolorymetry w ktrych wiato monochromatyczne uzyskuje si
przez specjalne filtry wietlne;
2) spektrofotometry zawierajce pryzmaty lub siatki dyfrakcyjne do uzyskiwania monochromatyzacji wiata.
Na oglny schemat budowy tych aparatw skada si: a) rdo wiata, b)
regulator natenia wizki promieniowania, c) monochromatory, d) pojemnik na
roztwr badany, e) detektor, f) wskanik pomiaru.
Przy pomiarze absorbancji pierwsz czynnoci, jak naley wykona jest
nastawienie aparatu na wymagan dugo fali. Nastpnie trzeba przepuci wizk
wiata monochromatycznego (przy ustawieniu wskanika cyfrowego na 100%
przepuszczalnoci) przez kuwet zawierajc roztwr porwnawczy (np. woda lub
uywany rozpuszczalnik) bd tzw. prb lep (jest to roztwr o takim samym
skadzie i pH, jak roztwr badany, nie zawierajcy jednak oznaczanego skadnika).
Jest to podstawowa zasada oznacze absorpcjometrycznych, pozwalajca na wyeliminowanie wpywu odczynnikw i zawartych w nich zanieczyszcze na ostateczny wynik pomiaru. Kolejny etap to przeczenie wskanika cyfrowego na
absorbancj, ktra powinna wynosi 0,00. Dopiero po wyzerowaniu aparatu na
prbie lepej mona odczyta absorbancj roztworu badanego, umieszczonego
w identycznej kuwecie.
Metody kolorytmetryczne nale do najatwiejszych i najszybszych metod
analitycznych, s uniwersalne, dokadne i czue.
POLARYMETRIA
Iwona ak, Izabela Szotysek-Bodys
Polarymetria to technika analityczna, ktra wykorzystuje zjawisko skrcania
paszczyzny wiata spolaryzowanego do wykrywania lub oznaczania stenia
substancji optycznie czynnej, m.in. w analizie rodkw leczniczych. Przyrzdem
sucym do oznaczania kta skrcenia paszczyzny wiata spolaryzowanego jest
polarymetr. Wizk wiata liniowo spolaryzowanego otrzymuje si po przepusz-
358
czeniu wizki wiata monochromatycznego (lampy sodowej) przez pryzmat Nicola (nikol).
Pryzmat Nicola to dwuomny kryszta szpatu islandzkiego (krystaliczny
CaCO3), ktry szlifuje si pod ktem 68, przecina wzdu przektnej, po czym
obie powki skleja balsamem kanadyjskim o wspczynniku zaamania rwnym
1,54; gwny przekrj jest paszczyzn polaryzacji pryzmatu.
balsam kanadyjski
90
68
promie nadzwyczajny
promie zwyczajny
niu drugi pryzmat Nicola nie przepuszcza wizki wiata spolaryzowanego wychodzcego z pierwszego. Wizka odbija si od warstwy balsamu w drugim pryzmacie
i dalej biegnie jako wizka promieni zwyczajnych.
Schemat budowy polarymetru
gdzie:
1 rdo wiata; 2 filtr ty dajcy wiato monochromatyczne; 3 soczewka dajca
wizk promieni rwnolegych; 4 polaryzator; 5 pytka kwarcowa; 6 rurka polarymetru; 7 analizator; 8 okular
W polarymetrach pierwszy pryzmat Nicola jest nieruchomy i nosi nazw polaryzatora, poniewa suy do wytwarzania wizki wiata spolaryzowanego.
Drugi to analizator, ktry jest ruchomy wok osi optycznej i sprzony ze skal
ktow, suc do odczytu wielkoci kta skrcenia.
Zasada dziaania polarymetru opiera si na tym, e jeli midzy pryzmatami
Nicola (skrzyowane) umieci si substancj optycznie czynn, ktra skrca paszczyzn wiata spolaryzowanego o kt , to pole widzenia w okularze rozjani si
proporcjonalnie do stenia tego zwizku.
W celu osignicia pierwotnego zaciemnienia naley obrci analizator dokadnie o kt . W przypadku jednych zwizkw optycznie czynnych, analizator
naley obrci w prawo (substancje prawoskrtne), w przypadku drugich w lewo
(substancje lewoskrtne). Kt skrcenia odczytuje si na skali ktowej z dokadnoci do 0,05 za pomoc noniusza.
Najczciej uywane s polarymetry pcieniowe: dwucieniowe (dwupolowe) lub trjcieniowe (trjpolowe), ktre umoliwiaj porwnanie natenia wiata
opuszczajcego polaryzator z nateniem wiata przechodzcego przez analizator.
W polarymetrach tych cz wizki wiata przepuszcza si przez dodatkowy pryzmat lub pytk kwarcow, ktre rozdzielaj pole widzenia w okularze. Dziki
temu w okularze moe ukaza si jednoczenie pole maksymalnie jasne obok pola
ciemniejszego.
Polarymetr jest tak uregulowany, e jeli w rurce polarymetru nie ma substancji optycznie czynnej i zerowa kreska podziaki ktowej pokrywa si z zerow
kresk podziaki noniusza, wtedy wszystkie czci pola widzenia w okularze s
jednolicie szaro owietlone (wygaszone), tak jak w pozycji b na rysunku, przedstawiajcym rodzaje pl widzenia w polarymetrze.
360
Jeli w rurce polarymetrycznej umieci si substancj optycznie czynn lewoskrtn, wwczas pojawi si pasek jasny w rodkowej czci pola widzenia,
ktremu towarzysz po bokach pola ciemne, tak jak w pozycji a na rysunku.
Rodzaje pl widzenia w polarymetrze
lewoskrtna
substancja
wygaszenie cakowite
prawoskrtna
substancja
Jeeli w rurce polarymetrycznej umieci si substancj prawoskrtn, wwczas pojawia si pasek ciemny w rodkowej czci pola widzenia, ktremu towarzysz po bokach pola jasne, tak jak w pozycji c na rysunku.
Podstaw polarymetrii jest zaleno wyraona wzorem:
= []D c l
gdzie:
zmierzony kt skrcenia paszczyzny wiata spolaryzowanego; []D skrcalno
waciwa; c stenie zwizku optycznie czynnego, w g/ml roztworu; l grubo warstwy
roztworu, przez ktr przechodzi wizka wiata spolaryzowanego, w dm
361
20
D
gdzie:
[]D20 skrcalno waciwa rozpuszczonej substancji wyraona w stopniach; indeks
grny 20 oznacza temperatur pomiaru; indeks dolny D wiato monochromatyczne, czyli
linia D lampy sodowej (589,3 nm); zmierzony kt skrcenia paszczyzny wiata spolaryzowanego wyraony w stopniach; c stenie roztworu wyraone w g/ml; l grubo
warstwy roztworu, wyraona w dm, przez ktr przechodzi wiato spolaryzowane.
20
D
l (dm)
M
100
Pozwala ona na porwnywanie zdolnoci do skrcania wiata spolaryzowanego w skali molowej. Poniewa warto iloczynu skrcalnoci waciwej i masy
molowej byaby liczb zbyt du, niewygodn w uyciu, zostaa podzielona przez
100.
CHROMATOGRAFIA
Iwona ak
Chromatografia jest metod suc do rozdzielania mieszanin substancji,
w ktrej wykorzystywane s rne fizykochemiczne oddziaywania rozdzielanych
substancji z dwoma fazami: ruchom i nieruchom. Faz nieruchom moe by
362
Chromatografia adsorpcyjna
W chromatografii adsorpcyjnej wykorzystuje si zjawisko adsorpcji, ktre
jest nastpstwem czsteczkowych oddziaywa dyspersyjnych, tworzenia si sabych wiza chemicznych, wodorowych, doprowadzajcych do nagromadzania si
substancji rozpuszczonej na powierzchni ciaa staego, zwanego adsorbentem.
Wielko adsorpcji okrela si stosunkiem iloci masy substancji zaadsorbowanej,
zwanej adsorbatem, przypadajcej na jednostk masy adsorbenta. Wielko ta zaley od temperatury oraz rodzaju adsorbatu i adsorbenta. Adsorbentami mog by:
el skrobiowy, sacharoza, wglan wapniowy, fosforan wapniowy, fosforan magnezowy, tlenek magnezowy, el krzemionkowy, wgiel aktywny i inne. Adsorbenty
mona podzieli na dwie zasadnicze grupy, tj. polarne, np. el krzemionkowy,
i niepolarne, np. wgiel aktywny. Faz ruchom uywan do elucji s zwykle cieke zwizki organiczne o rnych stopniach polarnoci, od wglowodorw po alkohole i kwasy organiczne. Moc elucyjn poszczeglnych rozpuszczalnikw mona okreli, wyznaczajc warto wspczynnika Rf (rate of flow szybko przepywu) dla substancji testowanej, zachowujc jednakowe warunki dowiadczalne
(te same: adsorbent, adsorbat i temperatura).
Rf =
Rf jest to stosunek odlegoci przebytej przez migrujc substancj do odlegoci przebytej przez czoo rozpuszczalnika w tym samym czasie.
W chromatografii adsorpcyjnej rozdzielenie mieszaniny substancji odbywa
si gwnie dziki rnicom w ich adsorpcji przez adsorbent. Substancje sabiej
adsorbowane przez adsorbent s wymywane przez rozpuszczalnik wczeniej. Natomiast silniej adsorbowane przez adsorbent pozostaj z nim zwizane. Czasami
dla ich wymycia z adsorbentu naley zastosowa wiele rozpuszczalnikw o rosncej mocy eluowania (zdolnoci wymywania) lub elucj gradientow, polegajc na
cigym zwikszaniu mocy rozpuszczalnika wymywajcego.
Chromatografia podziaowa
W chromatografii podziaowej rozdzielenie mieszaniny opiera si na rnej
rozpuszczalnoci jej zwizkw w dwch nie mieszajcych si rozpuszczalnikach.
Jeden z rozpuszczalnikw, unieruchomiony na noniku, stanowi faz nieruchom,
natomiast drugi przemieszcza si wzgldem pierwszego i stanowi faz ruchom.
Rozdzielane substancje dziel si pomidzy faz ruchom i nieruchom zgodnie
363
k=
Najszybciej wdruj skadniki posiadajce najwiksz warto wspczynnika podziau. Podczas chromatografii podziaowej, poza podziaem skadnikw
midzy dwie fazy cieke, czsto maj miejsce zjawiska zwizane w mniejszym lub
wikszym stopniu z adsorpcj skadnikw z nonikiem. Siy adsorpcji hamuj ruch
podczas procesu chromatograficznego.
Rozdzielane substancje w danych warunkach chromatograficznych charakteryzuje rna szybko wdrowania, okrelona wspczynnikiem Rf.
Substancje, ktre maj identyczne wartoci wspczynnikw Rf, nie mog
by rozdzielone w danych warunkach chromatograficznych.
Jeli substancja ma wspczynnik szybkoci przepywu Rf = 1, to oznacza,
e wdruje ona wraz z czoem rozpuszczalnika, czyli jest bardzo dobrze rozpuszczalna w fazie ruchomej, a nierozpuszczalna w fazie nieruchomej.
Jeeli natomiast substancja ma warto Rf = 0, to oznacza, e substancja ta
jest na tyle sabo rozpuszczalna w fazie ruchomej, e pozostaa na linii startowej,
nie bdc w stanie migrowa.
W chromatografii podziaowej najczciej stosowanymi technikami s chromatografie: bibuowa, kolumnowa i cienkowarstwowa.
W chromatografii bibuowej nonikiem fazy nieruchomej jest bibua, w ktrej kierunek wkien celulozowych moe czasami mie niekorzystny wpyw na
zdolno rozdzielcz tego nonika.
364
w ziarnach, np. im bd one wiksze, tym wiksze czsteczki bd do nich wnikay. Przykadowo, zdolnoci rozdzielcze Sephadexw serii G (G-15 G-200) s
rne, np. na Sephadexie G-75 najlepiej rozdzielane s substancje o masach czsteczkowych mieszczcych si w zakresie 3000150 000, a np. na Sephadexie
G-200 o masach w zakresie 5000800 000.
Techniki z uyciem sit molekularnych s podobne do stosowanych w przypadku chromatografii podziaowej, mianowicie technika kolumnowa lub cienkowarstwowa. W obu przypadkach, zasada rozdzielania polega na tym, e czsteczki
mniejsze od wielkoci porw wchodz do kanalikw w poszczeglnych ziarnach
sit, natomiast czsteczki od nich wiksze lub o wyduonym ksztacie nie mog
wej do wntrza kanalikw w ziarnach. Czsteczki wiksze wystpuj tylko
w pynie otaczajcym ziarna, maj wic krtsz drog do przebycia, ni czsteczki
mniejsze, ktre znajduj si w pynie o wikszej objtoci (jest to pyn otaczajcy
porowate ziarna, jak i wypeniajcy kanaliki w ziarnach), dlatego maj dusz
drog do przebycia od czsteczek wikszych. Czsteczki wiksze przemieszczaj
si przez sita molekularne szybciej i ulegaj elucji jako frakcje pocztkowe, natomiast mniejsze poruszaj si znacznie wolniej, poddajc si elucji jako frakcje pniejsze.
Sczenie molekularne czsto wykorzystywane jest do odsalania roztworw
biaek izolowanych z materiau biologicznego metodami wysalania. Podczas rozdziau czsteczki soli wnikaj do kanalikw ziaren i eluowane s znacznie pniej
od frakcji biaek, ktre nie majc moliwoci wejcia do kanalikw ziaren, szczeglnie Sephadexu G-25, wczenie wymywane s z kolumny niemal z objtoci
swobodn kolumny (Vo), czyli objtoci rozpuszczalnika wypeniajcego przestrze midzy ziarnami.
Sita molekularne najczciej stosuje si do rozdziau biaek, peptydw, kwasw nukleinowych i innych zwizkw, zarwno w badaniach analitycznych, jak i
w celach preparatywnych. Sczenie molekularne mona take wykorzysta do
wyznaczenia masy czsteczkowej, np. biaek. W tym celu naley wyznaczy objto elucyjn (Ve) dla danego biaka i objto swobodn kolumny (Vo). Midzy
okrelon wzgldn objtoci elucyjn biaka (Ve/Vo) a logarytmem jego masy
czsteczkowej wystpuje zaleno liniowa. Dziki temu, po wystandaryzowaniu
sita molekularnego wzorcowymi biakami o znanej masie czsteczkowej, wykrela
si krzyw wzorcow (zalenoci Ve/Vo do log10 masy czsteczkowej), z ktrej
mona odczyta mas czsteczkow badanego biaka, znajc jego wzgldn objto elucyjn.
Chromatografia jonowymienna
W metodzie tej nonikiem s wymieniacze jonowe (jonity), wysokoczsteczkowe, usieciowane zwizki nierozpuszczalne, ktre posiadaj atwo dysocju366
jce grupy chemiczne, kwane lub zasadowe. W cile okrelonych warunkach (pH
i mocy jonowej roztworu) mog one wiza jony z roztworu oraz oddawa je
w przypadku zmiany tych warunkw.
Kationity zawieraj dysocjujce grupy kwane (obdarzone adunkiem ujemnym), np. COO-H+, SO3-H+, fenolowe lub fosforanowe, ktre na zasadzie podwjnej wymiany, przyczaj z roztworu rozdzielanej mieszaniny kationy, np.
Ca++, oddajc atom wodoru.
Anionity zawieraj dysocjujce grupy zasadowe, np. N(CH3)3+OH-, lub aktywne ugrupowania amin I-, II- lub III-rzdowych (obdarzone adunkiem dodatnim), ktre przyczaj z roztworu rozdzielanej mieszaniny aniony, np. Cl-.
W chromatografii jonowymiennej podstaw rozdziau mieszaniny czsteczek jest
ich cakowity adunek. Dlatego na kolumnie kationitowej z rozdzielanej mieszaniny zostan zatrzymane tylko kationy, natomiast aniony i czsteczki obojtne nie
mog by zwizane, dlatego wypyn z kolumny wraz z frontem rozpuszczalnika.
Zwizane z jonitem kationy mona nastpnie wymy z kolumny przez przemycie
roztworem jonw dodatnich, np. Na+ o wzrastajcym gradiencie, ktre konkuruj
z badanymi kationami o wizanie z obdarzonymi adunkami ujemnymi grupami
jonitu, lub te uwolni je poprzez zwikszenie pH buforu elucyjnego. Miar pojemnoci wymieniacza jest stenie aktywnych (obdarzonych adunkiem) grup
wymieniacza na jednostk masy jonitu.
W chromatografii jonowymiennej nonikami mog by te sita molekularne,
zawierajce dodatkowo obdarzone adunkiem dodatnim grupy dietyloaminoetylowe (DEAE), np. DEAE-Sephadex, DEAE-celuloza, s one anionitami czsto wykorzystywanymi do rozdziau i oczyszczania biaek o wypadkowym adunku ujemnym (biaek anionowych). Sita molekularne zawierajce obdarzone adunkiem
ujemnym grupy karboksymetylowe (CM), np. CM-Sephadex, CM-celuloza, s kationitami, czsto wykorzystywanymi do rozdziau i oczyszczania biaek o wypadkowym adunku dodatnim (biaek kationowych).
Chromatografia powinowactwa
Chromatografia powinowactwa wykorzystuje specyficzne, niekowalencyjne
i o wysokim powinowactwie wizanie si biaka z inn czsteczk zwan ligandem, dlatego umoliwia wyodrbnienie jednego biaka z mieszaniny wielu rnych
biaek. Przykadowo, czstymi kombinacjami specyficznych par ligandw i oczyszczanych biaek s np.: hormon jako ligand w celu oczyszczenia rozpoznawanego
i wicego go specyficznie receptora; lektyna w celu oczyszczenia glikoproteiny; przeciwciao, aby wyizolowa antygen, inhibitor do oczyszczenia enzymu.
Specyficzne ligandy s zwykle unieruchomione na porowatych nonikach (sitach
molekularnych) na Sepharose, Sephadexie, jak np. konkanawalina A-Sephadex.
Mieszanin biaek nakada si na immobilizowane ligandem sita molekularne,
367
uformowane na ksztat zoa wypeniajcego kolumn. Na noniku zostanie zatrzymane jedynie biako specyficznie wice si z ligandem, natomiast wszystkie
pozostae biaka pozostan w buforze elucyjnym, ktry opuci kolumn. Biako
zwizane z ligandem na kolumnie mona uwolni w dwojaki sposb: albo przez
przemycie kolumny roztworem zawierajcym woln form liganda lub poprzez
zmian pH, czy te stenia soli w buforze elucyjnym.
ELEKTROFOREZA
Iwona ak
Elektroforeza jest technik rozdzielania zwizkw obdarzonych adunkiem,
ktra wykorzystuje zjawisko ruchu czstek w polu elektrycznym. Pod wpywem
pola elektrycznego czstki obdarzone adunkiem dodatnim, czyli kationy, wdruj
do katody, tzn. elektrody ujemnej, w procesie zwanym kataforez. Czstki obdarzone adunkiem ujemnym aniony wdruj w polu elektrycznym do anody, tj.
elektrody dodatniej, w procesie zwanym anaforez. Podstaw rozdziau elektroforetycznego czstek jest ich zrnicowana szybko wdrwki w polu elektrycznym, manifestujca si tym, e w jednakowym czasie odmienne czstki przewdruj rne odlegoci.
Szybko przemieszczania czstek obdarzonych adunkiem w polu elektrycznym zaley od trzech zasadniczych grup czynnikw, mianowicie: 1) wasnoci czstek wdrujcych; 2) wasnoci rodowiska, w ktrym czstki wdruj; 3) od
parametrw charakteryzujcych przepywajcy prd.
Wasnoci czstek wdrujcych w polu elektrycznym, ktre maj najwikszy
wpyw na szybko przemieszczania, to wielko wypadkowego adunku elektrycznego, masa i ksztat czstek. Wielko masy i wypadkowego adunku czstek
dziaaj przeciwstawnie na szybko wdrwki. Im wikszy wypadkowy adunek
czstek, tym szybciej si poruszaj, ale im wiksza masa, tym wolniejsza wdrwka czstek. Zatem szybko migracji czstek w polu elektrycznym zaley od stosunku adunek/masa. Ksztat czstek wpywa na szybko ich przemieszczania,
dziki obnianiu lub wzmaganiu oporu rodowiska, ktry przeciwdziaa ruchowi
czstek. Opr rodowiska dla czstek o ksztacie bliskim kuli (globularnym) bdzie
mniejszy (dziki czemu ruch tych czstek jest szybszy) ni tych o rozpostartej konformacji przestrzennej.
rodowisko, w ktrym czstki wdruj, rodzaj uytego buforu i jego waciwoci, takie jak lepko, sia jonowa, pH i temperatura, wpywaj na rozdzia
elektroforetyczny. Im wiksza lepko, tym wikszy opr rodowiska ma do pokonania przemieszczajca si czstka. Natomiast od siy jonowej i pH buforu elektroforetycznego moe zalee wielko adunku rozdzielanej czstki.
368
Zastosowanie buforu o wartoci pH odpowiadajcej wartoci pI rozdzielanych czstek uniemoliwi ich rozdzia, poniewa w tych warunkach czstki wystpuj w formie jonu obojnaczego i nie poruszaj si w polu elektrycznym. Dla czstek rozpuszczalnych w rodowisku zasadowym najwaciwszy bdzie bufor o pH
wyszym od pI kadej rozdzielanej czstki mieszaniny. Przykadowo, bufor elektroforetyczny o wartoci pH okoo 9 stwarza warunki, w ktrych wikszo biaek
wykazuje ujemny wypadkowy adunek i w polu elektrycznym wdruje w kierunku
anody.
Nie bez znaczenia jest rodzaj nonika, ktrego pory s wypenione buforem
z czstkami obdarzonymi adunkiem elektrycznym. Nonikiem do elektroforezy
moe by bibua (rnego rodzaju), inny nonik celulozowy, w tym octan celulozy
oraz obecnie powszechnie stosowane rne ele obojtne (agarozowy, poliakrylamidowy) w przypadku elektroforezy elowej. Bibua jest nonikiem o duej opornoci, natomiast ele cechuje maa oporno oraz niska adsorpcja czstek. Dodatkowo, ele s sitami molekularnymi, w zwizku z tym przez kanaliki w elu mae
czstki przechodz swobodnie, natomiast wiksze s zatrzymywane. Usieciowanie
elu, np. poliakrylamidowego, decydujce o wielkoci kanalikw w elu, mona
kontrolowa stosownie do potrzeb przez wybr odpowiednich ste akrylamidu
i odczynnika sieciujcego metylenobisakrylamidu, tworzcego wizania poprzeczne. W elu bd tym mniejsze kanaliki, im wiksze zastosuje si stenie akrylamidu.
Nie bez znaczenia dla rozdziau s wskaniki charakteryzujce przepywajcy prd, czyli wielko przyoonego napicia, a waciwie jego spadek wzdu
drogi wdrwki czstek, wielko natenia. Przyoenie niskiego napicia prdu
sprawia, e niskie jest jego natenie i wydzielanie ciepa, lecz szybko wdrwki
czstek okazuje si wolna. W takich warunkach wydua si czas potrzebny do
osignicia rozdziau elektroforetycznego. Zbyt dugi czas trwania rozdziau moe
by niepodany ze wzgldu na towarzyszce niekorzystne procesy, m.in. dyfuzj,
ktra powoduje rozmycie brzegw rozdzielonych stref. Pod wzgldem wielkoci
przyoonego napicia rozrnia si elektroforez niskonapiciow, w ktrej spadek napicia wynosi do kilkunastu V/cm, oraz elektroforez wysokonapiciow
przy spadku napicia rzdu 50 V/cm i wicej.
370
22.
DODATKI
Iwona ak, Pawe Niemiec
Okrelenie
Wielokrotno
tera
1012
giga
109
mega
106
kilo
103
hekto
102
da
deka
101
decy
10-1
centy
10-2
mili
10-3
mikro
10-6
nano
10-9
piko
10-12
371
HNO3
Gsto
372
H2SO4
Stenia
%
mol/l
mol/l
mol/l
1,00
0,360
0,099
0,333
0,052
0,261
0,027
1,02
4,388
1,227
3,982
0,644
3,242
0,337
1,05
10,52
3,029
9,259
1,543
7,704
0,825
1,10
20,39
6,150
17,58
3,068
14,73
1,652
1,15
30,14
9,505
25,48
4,649
21,38
2,507
1,20
40,62
13,30
32,94
6,273
27,72
3,391
1,32
51,71
10,83
41,95
5,646
1,38
62,70
13,73
48,45
6,817
1,42
71,63
16,14
52,51
7,603
1,46
82,39
19,09
56,41
8,397
1,50
96,73
23,02
60,17
9,202
1,56
65,59
10,43
1,62
70,82
11,70
1,74
81,16
14,40
1,78
85,16
15,46
1,84
96
18
NaOH
Gsto
Stenia
%
mol/l
mol/l
1,00
0,197
0,035
0,159
0,040
1,02
2,38
0,433
1,94
0,494
1,05
5,66
1,06
4,66
1,222
1,10
11,03
2,16
9,19
2,527
1,14
15,22
3,09
12,83
3,655
1,18
19,35
4,07
16,44
4,850
1,22
23,38
5,08
20,07
6,122
1,26
27,32
6,14
23,73
7,475
1,30
31,15
7,22
27,41
8,906
1,34
34,90
8,34
31,14
10,43
1,40
40,37
10,07
36,99
12,95
1,46
45,66
11,88
43,12
15,74
1,52
50,80
13,76
49,44
18,78
0,990
Stenie
mol/l
Gsto
mol/l
1,89
1,10
0,926
19,06
10,37
0,982
3,78
2,18
0,918
21,50
11,59
0,974
5,75
3,29
0,910
24,03
12,84
0,962
8,82
4,98
0,902
26,67
14,12
0,954
10,95
6,13
0,894
29,33
15,40
0,946
13,14
7,29
0,886
32,09
16,69
0,938
15,47
8,52
0,880
34,35
17,75
373
374
Kk
4,2 10-7
4,8 10-11
4,5 10-4
1,6 10-2
7 10-7
7,5 10-3
6,2 10-8
10-12
1 10-14
1,1 10-7
1,3 10-2
3,2 10-8
1,1 10-2
Ks
8,9 10-12
8 10-8
1,3 10-6
4,7 10-9
3,2 10-4
5,0 10-3
1,5 10-9
4 10-19
5 10-22
8 10-73
8 10-37
8,5 10-17
5,5 10-51
1 10-22
1,1 10-18
1,6 10-54
5 10-33
7 10-29
375
Kk
pKk
2,1 10
-4
1,86 10
-5
3,68
4,73
1,4 10
-5
4,85
1,6 10
-5
4,80
1,5 10
-3
2,82
6,6 10
-5
4,18
-5
8 10 (K1)
6,4 10
-5
4,1
4,19
-4
3,06
-3
8,7 10 (K1)
o-fosforowy
7,5 10 (K1)
2,12
Jabkowy
-4
3,40
n-masowy
Mlekowy
Moczowy
Szczawiowy
4 10 (K1)
1,5 10
-5
1,39 10
1,3 10
-4
-4
-2
6,5 10 (K1)
4,82
3,86
3,89
1,19
376
Kk
pKk
1,75 10
9,3 10
-10
-5
4,75
(K1)
9,03
9,6 10
-4
3,02
5,2 10
-4
3,28
2,77 10
3 10
4,56
-4
3,25
-12
11,09
5,6 10
8,4 10
-5
-6
5,52
1,07 10
-8
7,97
4,38 10
-4
3,36
1,71 10
-9
8,77
5,65 10
-4
3,24
( 10-3)
Zwizek
max
[nm]
( 10-3)
Adenina
260
245
13,3
8,05
Nikotynowego
kwasu amid
260
4,6
Adenozyna
260
14,9
Ryboflawina
450
12,2
375
10,6
260
27,7
267
9,7
207
9,6
Zwizek
259
15,4
Tymidyna
Cytozyna
267
6,1
Tymina
264
7,9
Cytydyna, CMP,
CDP, CTP
271
9,1
Tryptofan
(w 0,1 M HCl)
278
5,6
218
33,5
FAD
450
11,3
280
5,43
375
9,3
Tryptofan
(w 0,1 M NaOH)
221
34,6
260
37
Fenyloalanina
(w HCl i NaOH)
258
0,2
Tyrozyna
(w 0,1 M HCl)
274
1,34
223
8,2
Guanina
262
7,58
294
2,33
246
10,9
Tyrozyna
(w 0,1 M NaOH)
240
11,1
252
13.6
Uracyl
260
8,2
260
18
Urydyna
262
10,1
340
6,22
261
8,1
260
15
Guanozyna
+
NAD , NADP
NADH, NADPH
378
Inne zwizki
Aminokwasy
Cukry
-D-glukoza
-D-glukoza
D-galaktoza
-D-galaktoza
-D-galaktoza
D-mannoza
-D-mannoza
D-fruktoza
-D-fruktoza
Sacharoza
Cukier inwertowany
Laktoza
Maltoza
Skrobia
Glikogen
L-alanina *
L-fenyloalanina *
L-histydyna *
L-leucyna *
L-walina *
L-treonina *
L-prolina *
L-tryptofan *
Kwas L-winowy
Kwas mezowinowy
Cholesterol c
Witamina C
Witamina D2 c
[
]D20
-24
-56
+52,7
+112,2
+18,7
+80,2
+150,7o
+52,8o
+14,6
-17o
-92
-133o
+66,5
-20
+52,3
+140,7
+196
+198
+33o
-7,5o
+7,5o
+22,5o
+62o
-30o
-80o
-34o
+14,1o
0o
-39,5o
+ 24o
+52o
Gwiazdka (*) przy nazwie substancji oznacza, e jej rozpuszczalnikiem jest kwas octowy lodowaty, litera c w indeksie grnym (c) wskazuje, e rozpuszczalnikiem jest chloroform. Rozpuszczalnikiem pozostaych zwizkw jest woda.
379
Struktura grupy
funkcyjnej
Przykad
Alkany
CH3CH3
Alkeny
Alkiny
H2C
-an
etan
Areny
C
C
C
C
Halogenki
eten (etylen)
brak kocwki
chlorometan
Cl
(X = F, Cl, Br, I)
Etery
brak kocwki
benzen
H3C
Alkohole
-yn
etyn
(acetylen)
-en
CH2
H
C
Kocwka nazwy
H3C
H3C
-ol
metanol
H3C
CH3
NH2
eter
eter
dimetylowy
-amina
metyloamina (I rz)
Aminy
H3C
dimetyloamina
(II rz)
CH3
trimetyloamina
(III rz)
CH3
H3C
N
CH3
Nitryle
Zwizki
380
-nitryl
H3C
Nitrowe
Sulfidy
etanonitryl
+
H3C N
O
C
H3C
O
_
O
CH3
brak kocwki
nitrometan
sulfid
sulfid
dimetylowy
cd. tabeli 13
Nazwa klasy
zwizku
Struktura grupy
funkcyjnej
_
Przykad
Sulfotlenki
H3C
S
_
O
Sulfony
2+
Tiole
Aldehydy
H3C
H3C
H3C
H3C
OH
H3C
H3C
NH2
H3C
OH
-an
O
CH3
octan metylu
-amid
acetamid (I rz)
NH2
H3C
O
C
CH3
Amidy
-al
etanal
(acetaldehyd)
-on
propanon
(aceton)
kwas owy
kwas etanowy
(octowy)
O
C
SH
Estry
CH3
CH3
Kwasy karboksylowe
sulfotlenek
sulfotlenek
dimetylowy
sulfon
sulfon
dimetylowy
-tiol
metanotiol
2+
_
O
Ketony
Kocwka nazwy
H3C
N-metyloacetamid
(II rz)
CH3
CH3
CH3
NN-dimetylo
acetamid
(III rz)
Chlorki
kwasu
karboksylowego
Bezwodniki
kwasu
karboksylowego
O
C
O
Cl
H3C
O
C
O
O
O
C
H3C
Cl
O
CH3
chlorek ilu,
-ylu
chlorek acetylu
bezwodnik
owy
bezwodnik octowy
Wizania, przy ktrych nie wpisano atomw, cz si z atomem wgla lub wodoru pozostaej czci
czsteczki.
381
382
383
384
23.
LITERATURA RDOWA
I UZUPENIAJCA
386
Chylomikrony
VLDL
IDL
LDL
HDL
< 0,95
0,951,006
1,0061,019
1,0191,063
1,0631,210
180500
3080
2530
2025
713
10 00080 000
5 00010 000
2 300
175360
12
510
1520
20 25
4055
B48, C, E, A
B100, C, E
B100, C, E
B100
A, C, D, E
8090
5070
2025
510
35
% Cholesterolu wolnego
13
710
710
58
35
% Estrw Cholesterolu
25
413
1012
4045
1520
% Fosfolipidw
38
1520
1520
2022
2030
jelito cienkie
wtroba
we krwi
we krwi
we krwi
(a ich prekursory
w wtrobie i jelicie)
Transportuj TAG i cholesterol (egzogenny) z jelit do innych tkanek (tuszczowej, mini i in.).
Dostarczanie egzogennego cholesterolu do wtroby w formie chylomikronw resztkowych.
Transportuj TAG i
cholesterol syntetyzowane w organizmie (endogenne) z
wtroby do tkanek
obwodowych. Gwne rdo IDL i LDL.
Gwna funkcja