Familije proteina-(III prezentacija)

Prvobitno definisane kao grupa proteina sa slicnim biolokim funkcijama

koje su vise od 50% identicne kad se poravnaju.
Familije mogu obuhvatati proteine sa istom funkcijom u razlicitim
organizmima (ortologni).
Mogu isto tako obuhvatati clanove iz multigenskih familija koji su nastali
duplikacijom gena ili njihovom reorganizacijom (paralogni).
Duplikacija gena nastala zbog nepravilnog krianja tokom mejoze moze
dovesti do nastanka familija gena
Homologni proteni su proteini koji posjeduju homologne sekvence,
odreene pozicije u polipeptidnim lancima sadre iste aminokiseline,
nezavisno od vrste
Ortologni su geni u razliitim vrstama nastali evolucijom od zajednickog
nasljeenog gena. Obicno, ortologni geni zadrzavaju istu funkciju tokom
evolucije (primjer mioglobin u sisavaca).
Paralogni geni nastaju duplikacijom unutar genoma. Ovi geni obicno
razvijaju nove funkcije, iako one mogu biti povezane sa funkcijom
njihovog originala.
BLAST-je algoritam za uporedjivanje informacija iz bioloskih sekvenci,
kao sto su to npr. redosljed aminokiselina u razlicitim proteinima ili
redosljed nukleotida u DNA sekvencama.
CITOKROM P450S
Kataliziraju oksidaciju organskih supstanci
Grupa enzima koja ucestvuje u oksidativnom metabolizmu velikog broja
prirodnih supstanci, kao i lijekova, karcinogena i mutagena
Sadrzi hem grupu.
Nalazi se u zivotinjama, biljkama, gljivama i bakterijama cak i virusima
(nije jedino pronaen u E.Coli bakterijama)
Funkcije
Detoksifikacija lijekova, karcinogena, mutagena
Biosinteza steroida, masnih kiselina

Biosinteza toksina
Biokonverzija poliaromatskih ugljikohidrata
MIOSIN
Velika familija aktin-vezujucih motornih proteina
Generira silu pri kontrakciji skeletnih misica.
Takode ucestvuje u kretanju organela