KEANEKARAGAMAN

CENDAWAN MIKORIZA ARBUSKULA (CMA)

DI HUTAN PANTAI UJUNG GENTENG,
SUKABUMI-JAWA BARAT

RITA TRI PUSPITASARI

SEKOLAH PASCASARJANA
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
BOGOR
2005
 ABSTRACT

RITA TRI PUSPITASARI. Diversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi (AMF) at

Coastal Forest Ujung Genteng, Sukabumi-West Java. Supervised by Nampiah
Sukarno, Kartini Kramadibrata, dan Dede Setiadi.
Indonesia is one of the countries that has a megadiversity of microorganisms
and has a large area of coastal forests. However, research on microbial diversity
particularly AMF as one of the dominant microbes in a coastal forest ecosystems has
not been done extensively. The main objective of this research was to study the
diversity and distribution of AMF in coastal forest and to analyse effects of salinity on
the fungal and plant community at Coastal Forest Ujung Genteng Cape, Sukabumi -
West Java.
This research was carried out in two parts: field, green house and laboratorium
experimental activities. Field experimental activities were conducted for vegetation
analysis, collecting of plant root system, rhizosphere soils from tree and pole phase,.
seedling of understorey plants for fungal colonization analysis, isolation and
identification of AMF and soil characteristics, include salinity. Green house and
laboratorium activities were carried out for isolation, identification and colonization
analysis of AMF. Field research location was divided into three zones, first zone was
0 – 70 m distance from coastal area (P), second zone was 71 – 140 m distance from
coastal area (T), and third zone was 141 m distance from coastal until forest up to area
in the center (H).
Twenty three AMF species from 45 plant rizosphere were identified. The fungi
belong to 5 species of Acaulospora, 2 species of Gigaspora, 13 species of Glomus, 1
species of Paraglomus and 2 species of Scutellospora. Glomus geosporum was the
most dominant AMF in the ecosystem with the value of frequency was 16.49% -
23.67%. Glomus etunicatum, Acaulospora foveata, A. longula, A. scrobiculata, A.
tuberculata, and Scutellospora auriglobosa were the AMF that had frequency higher
than other species but less than G. geosporum in the field. Results from vegetation
analysis indicated that Ujung Genteng Coastal Forest had 68 plant species belonging
to 40 families. Dysoxylum parasiticum and Piper cf. baccatum were dominant plants
in the ecosystem. The plant community measured at the three zones experimental sites
were differed. The similarity index value of the plant community (Is) between coastal
P) and center (T) area was 35.42%, between center (T) and forest center (H) was
32.53%, and between coastal edge (P) and forest center (H) was 27.04%. There was
no correlation between diversity of plant and diversity of AMF onserved. Diversity of
AMF were influenced with all interaction environment factors especially salinity. Two
species of AMF had a narrow distribution and found only in a rhizosphere of one plant
species . Glomus sp 5. found only in Guettarda speciosa rhizosphere and Glomus sp6.
in Salacia sp. rhizosphere. Nineteen species were identified from P zone, 17 species
from T zone and 14 species from H zone, with the index diversity values of AMF
were 0.73 – 6.64, 0.85 – 4.93 and 1.26 – 4.84, respectively. The salinity at Ujung
Genteng Cape was falled in moderate degree with the value of 420 – 1735 µs/cm. The
salinity influenced the diversity of AMF and plant community structures. Nineteen
species were identified from P zone, 17 species from T zone and 14 species from H
zone, with the index diversity values of AMF (D) were 0.73 – 6.64, 0.73 – 6.50 and
1.26 – 4.84, respectively.
 KEANEKARAGAMAN
CENDAWAN MIKORIZA ARBUSKULA (CMA)
DI HUTAN PANTAI UJUNG GENTENG,
SUKABUMI-JAWA BARAT

RITA TRI PUSPITASARI

Tesis
Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Magister Sains pada
Depertemen Biologi Fakultas Matematika dan dan Ilmu Pengetahuan Alam

SEKOLAH PASCASARJANA
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
BOGOR
2005
Judul Tesis : Keanekaragaman Cendawan Mikoriza Arbuskula (CMA) di Hutan
Pantai Ujung Genteng, Sukabumi-Jawa Barat
Nama : Rita Tri Puspitasari
NIM : G425010141

Disetujui
Komisi Pembimbing

Dr. Ir. Nampiah Sukarno

Ketua

Dr. Kartini Kramadibrata Dr. Ir. H. Dede Setiadi, MS.

Anggota Anggota

Diketahui

Ketua Departemen Biologi Dekan Sekolah Pascasarjana

Dr. Ir. Dedi Duryadi S., DEA Prof. Dr. Ir. Syafrida Manuwoto, M.Sc.

Tanggal Ujian : 29 Desember 2005 Tanggal Lulus :

 SURAT PERNYATAAN

Saya yang bertanda tangan di bawah ini :

Nama : Rita Tri Puspitasari

NIM : G425010141

Program Studi : Biologi (BIO)

dengan ini menyatakan bahwa tesis dengan judul ”Keanekaragaman Cendawan

Mikoriza Arbuskula (CMA) di Hutan Pantai Ujung Genteng, Sukabumi-Jawa

Barat” adalah benar-benar merupakan hasil penelitian yang saya lakukan di bawah

bimbingan Komisi Pembimbing saya, dan belum pernah diteliti oleh peneliti lain.

Penelitian tersebut dilakukan di Semenanjung Ujung Genteng, Sukabumi-Jawa Barat,

dan di Laboratorium Mikologi IPB serta di Laboratorium Mikoriza Herbarium

Bogoriense sejak Februari 2003 sampai dengan Juli 2005.

Bogor, Desember 2005

Rita Tri Puspitasari

G425010141
 PRAKATA
Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT atas segala karunia-Nya
sehingga penulisan Tesis yang berjudul Keanekaragaman Cendawan Mikoriza
Arbuskula (CMA) di Hutan Pantai Ujung Genteng, Sukabumi-Jawa Barat berhasil
diselesaikan.
Terima kasih dan penghargaan yang setinggi-tingginya penulis ucapkan kepada:
x Ibu Dr. Ir. Nampiah Sukarno, Ibu Dr. Kartini Kramadibrata dan Bapak Dr. Ir. H.
Dede Setiadi, MS. selaku pembimbing, yang telah banyak memberi arahan sejak
penulisan proposal, penelitian hingga penulisan tesis ini selesai. Serta Ibu Dr. Ir.
Panca Dewi Manu Hara Karti, M.Si. sebagai penguji yang telah memberi koreksi dan
masukan.
x Rektor Universitas Muhammadiyah Jakarta dan Dekan Fakultas Pertanian
Universitas Muhammadiyah Jakarta yang telah memberi izin untuk studi lanjut.
x Pimpinan Institut Pertanian Bogor, Dekan Sekolah Pascasarjana dan Ketua Program
studi Biologi, atas kesempatan yang telah diberikan untuk mengikuti program S2 ini.
x Kepala Botani Pusat Penelitian Biologi-LIPI, dan Kepala Laboratorium Mikologi
IPB yang telah memberi fasilitas penelitian.
x Staf pengajar dan pegawai di lingkungan Program Studi Biologi, FMIPA IPB.
x Teman-temanku: Dr. Ir. Happy Widiastuti, M.Si. yang telah memberi masukan dan
dukungan, Rida Oktorida, S.Si, Ijoh, Hadi Prastyo, S.Si, Yenni Lucia, SP, M.Si.,
Bapak Ujang Hapid, Nury Nuryada Aradea, S.Si. yang telah membantu selama di
laboratorium,Vivi Sumarna, S.Si pemandu saat survey, dan Nurhasanah, S.Si, M.Si.
serta Ir. Elfarisna, M.Si. yang telah memberi semangat dan bantuan selama penulisan.
x Ayahanda Prof. Dr. H. Noeng Muhadjir, Ibunda Hj. Hafni Zahara yang telah
memberi nasehat, semangat dan doa. Khususnya pada suamiku Ir. Tejo Padmono dan
anak-anakku tercinta, Poppy, Affan dan Sekar atas segala dukungan semangat,
kesabaran, pengertian dan doa sehingga tesis ini dapat diselesaikan.
Terima kasih, semoga tesis ini bermanfaat.
Bogor, Desember 2005

Rita Tri Puspitasari

 RIWAYAT HIDUP

Penulis dilahirkan di Jogjakarta pada tanggal 31 Mei 1966 dari Ayah Prof. Dr.
H. Noeng Muhadjir dan Ibu Hj. Hafni Zahara. Penulis merupakan anak ke tiga dari
empat bersaudara. Pada tanggal 12 Januari 1991 penulis menikah dengan Ir.Tejo
Padmono dan dikaruniai tiga orang anak yaitu Aphrodita Puspateja (Poppy) (14
tahun), Affan Ibrahim Puspateja (11½tahun), dan Aulia Sekar Puspateja (9 tahun).
Tahun 1979 penulis lulus SD Negeri II Laboratorium IKIP Jogjakarta, Sekolah
Menengah Pertama di SMP Negeri 8 Jogjakarta lulus tahun 1982, dan Sekolah
Menengah Atas di SMA Negeri 6 Jogjakarta lulus tahun 1985. Penulis masuk
Universitas Kristen Satya Wacana, Salatiga tahun 1985. Penulis memilih sub
Program Mikrobiologi Industri, Program Studi Biologi Lingkungan, Fakultas Biologi
dan lulus Sarjana Biologi tahun 1990. Pada tahun 2001 penulis melanjutkan studi di
Program Pascasarjana IPB, FMIPA Program Studi Biologi, sub Program
Mikrobiologi dengan beasiswa dari Universitas Muhammadiyah Jakarta selama 1
tahun, selanjutnya BPPS sampai selesai.
Tahun 1990 penulis pertama kerja di perusahaan advertising di Jakarta dan
merangkap mengajar di Universitas Surapati Jakarta sampai tahun 1991. Dan sejak
tahun 1992 penulis menjadi staf pengajar di Fakultas Pertanian Universitas
Muhammadiyah Jakarta sampai sekarang. Selama menjadi staf pengajar, penulis
menjabat sebagai Kepala Laboratorium dari tahun 1994-1998 dan tahun 2000-2001
menjabat sebagai Sekretaris Jurusan.
 DAFTAR ISI

Halaman
DAFTAR TABEL ……………………………………...………………………. ix
DAFTAR GAMBAR ………………………………..….…………………......... x
DAFTAR LAMPIRAN……………………………..…….……………………... xii
PENDAHULUAN ……………………………………………………………..... 1
Latar Belakang …………………………………………………………... 1
Tujuan Penelitian ……………………………………………………...… 3
Pendekatan ……………………………………………………………..... 3
Hipotesis …………………………………………………………............ 4
KEADAAN UMUM LOKASI PENELITIAN ………………………………..... 5
TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................................ 6
Salinitas Tanah dan Beberapa Sifat Tanah lain ………………………..... 6
Simbiosis Mikoriza Arbuskula (MA) …......…………………………...... 8
Kolonisasi ……………………………………………………………….. 10
Proses Infeksi CMA ..………………………………………………….... 11
Pertumbuhan Hifa Eksternal dan Produksi Spora ………………………. 15
Cendawan Mikoriza Arbuskula ................................................................. 17
Ekologi dan Fisiologi CMA pada Kondisi Salin ……...............………… 18
Peranan CMA dalam Penyerapan Unsur Hara ………………………….. 20
Keanekaragaman CMA dan Keanekaragaman Tumbuhan pada
berbagai Ekosistem ................................................................................... 22
Peranan CMA dalam Komunitas Tumbuhan ............................................ 24
BAHAN DAN METODE ……………………………………………………..... 26
Waktu dan Tempat ……………………………………………………... 26
Bahan dan Alat ……………………………………………………......... 26
Metode Penelitian …………………………………………………......... 26
Analisa Data …………………………………………………………..... 32
Analisa Pendukung …………………………………………………….. 33
Penyimpanan Spesimen ………………………………………………... 33
HASIL DAN PEMBAHASAN ……………………………………………....... 34
Analisa Vegetasi ……………………………………………………….. 34
Keanekaragaman CMA ………………………………………………... 41
Hubungan antara CMA dan Vegetasi ………………………………….. 75
PEMBAHASAN UMUM ................................................................................... 95
SIMPULAN DAN SARAN……………………………………………………. 98
DAFTAR PUSTAKA …………………………………………………………. 100
 DAFTAR TABEL

Halaman
1 Nilai penting spesies tumbuhan fase pohon dan tiang pada zona 0-70 m
dari pantai (P) daerah Ujung Genteng ..……………………………………….. 36

2 Nilai penting spesies tumbuhan fase pohon dan tiang zona di 71-140 m
dari pantai (T) daerah Ujung Genteng …….…………………………………... 37

3 Nilai penting spesies tumbuhan fase pohon dan tiang zona di 141 m
dari pantai sampai tengah hutan (H) daerah Ujung Genteng ………………….. 38

4 Identitas spora CMA yang berhasil diisolasi dari vegetasi di Ujung Genteng ... 41

5 Seri pengamatan dan jumlah spesies CMA hasil identifikasi ………………… 76

6 Frekuensi mutlak dan frekuensi relatif keterdapatan setiap spesies CMA …… 77

7 Nilai penting tumbuhan, dan kerapatan, kekayaan serta keragaman CMA

di lapang pada rizosfer tumbuhan …………………………………………… 80

8 Spesies tumbuhan, kekayaan, kerapatan dan keragaman CMA pada biakan pot
dengan inang tumbuhan anakan ……………………………………………… 81

9 Sifat tanah Semenanjung Ujung Genteng …………………………………...... 85

10 Indeks Keragaman CMA pada Zona P, T, dan H .............................................. 88

ix
 DAFTAR GAMBAR

Halaman
1 Struktur taksonomi secara umum pada CMA dan kaitannya dengan cendawan
lain berdasarkan urutan gen SSU rRNA (Walker dan Schüȕler 2004) ……..... 17

2 Bagan alir penelitian …………………………………………………………. 28

3 Peta lokasi penelitian dan letak jalur pengamatan di hutan pantai Ujung
Genteng, Desa Batu, Kabupaten Sukabumi …………………………………. 30

4 Spora Acaulospora foveata ………………………………………………….. 43

5 Spora Acaulospora longula ……………………………..………………….... 44

6 Spora Acaulospora scrobiculata ………………………….………………..... 45

7 Acaulospora tuberculata ……………………………….…………………..... 46

8 Spora Acaulospora cf. undulata ……………………………………………... 47

9 Spora Gigaspora cf. gigantea ……………………………………………….. 48

10 Spora Gigaspora ramisporophora ………………………………………….. 48

11.Glomus clavisporum ……………………………………………………..….. 49

12 Glomus cf. deserticola ……………………………………………..……….. 50

13 Spora Glomus etunicatum ………………………………………………….. 52

14 Glomus geosporum .…………………………………………………..…….. 53

15 Glomus cf. microaggregatum ….………………………………………..….. 54

16 Glomus rubiforme ………………………………………………………….. 56

17 Spora Glomus tortuosum ….…………………………………………….... 56

18 Glomus sp1. …………………………….……………………………..….... 57

19 Spora Glomus sp2. ………………………………………………………..... 58