A building-block database of distributed polarizabilities

and dipole moments to estimate optical properties of

biomacromolecules in isolation or in an explicitly
solvated medium

Raphael F. Ligórioa, Jose R. Lealb,c, Anna Krawczuka and Leonardo H. R. Dos

Santosb*

aInstitut für Anorganische Chemie, Universität Göttingen, Tammannstrasse 4, D-37077

Göttingen, Germany
b Departamento de Química, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio
Carlos 6627, 31270-901 Belo Horizonte MG, Brazil.
c Departamento de Química, Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do
Maranhão – Campus Grajaú, BR 226, 65940-000 Grajaú MA, Brazil.
*leonardohrs@ufmg.br

Electronic Support Information

1. Building blocks coordinates and properties
PENTA ALA
Table S1: atomic position of each building block within Penta ALA peptide. Values in Atomic
Units. Dummy means atoms included to keep the proper symmetry

CHCH3_NC_1
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 6 -11,007655 -2,017661 -0,171776
H42 1 -11,273728 -2,122162 -2,209657
C24 6 -10,062225 -4,549327 0,808614
H45 1 -9,798608 -4,501139 2,848951
H46 1 -11,401285 -6,055060 0,390039
H47 1 -8,256024 -5,046514 -0,043086
dummy 6 -13,573147 -1,401799 0,962060
dummy 7 -9,181990 -0,051212 0,330702

CHCH3_NC_2
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 6 -5,592644 2,688324 -0,340718
 H28 1 -5,547669 2,622751 1,715682
C19 6 -6,588908 5,246069 -1,209803
H36 1 -6,668843 5,361153 -3,262990
H37 1 -8,490917 5,573936 -0,495675
H38 1 -5,377405 6,769944 -0,542540
dummy 6 -7,264107 0,571642 -1,347942
dummy 7 -3,057010 2,296017 -1,273108

CHCH3_NC_3
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 6 1,241172 0,761938 -1,382335
H27 1 1,511214 2,503698 -2,444550
C17 6 1,326966 -1,486459 -3,178519
H32 1 -0,170075 -1,360981 -4,584854
H33 1 3,130520 -1,576032 -4,165523
H34 1 1,079978 -3,260344 -2,165059
dummy 6 -1,283502 0,839983 -0,000756
dummy 7 3,230298 0,562382 0,476589

CHCH3_NC_4
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 6 7,356893 1,081490 2,358189
H29 1 6,826258 -0,686915 3,267336
C20 6 7,192298 3,238235 4,258309
H39 1 5,280084 3,421916 4,996247
H40 1 8,467296 2,919438 5,841899
H41 1 7,699689 5,036876 3,396594
dummy 6 5,618534 1,588126 0,119998
dummy 7 9,910102 0,839227 1,423153

CHCH3_NC_5
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 6 13,656673 -1,175788 -0,233003
H44 1 14,563174 0,368119 0,781780
C25 6 13,756261 -0,657247 -3,063057
H48 1 12,860342 -2,165815 -4,138500
H49 1 15,698333 -0,467329 -3,716902
H50 1 12,763399 1,087159 -3,517158
dummy 6 10,925830 -1,448475 0,636460
dummy 7 14,992142 -3,518670 0,356213

CONH_1
Atom Atomic
x y z
Label number
 chk 1 -9,312948 0,890439 1,996496
N10 7 -9,181990 -0,051212 0,330702
C18 6 -7,264107 0,571642 -1,347942
O3 8 -6,916398 -0,458826 -3,400562

CONH_2
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 1 -2,614058 3,003342 -3,000129
N8 7 -3,057010 2,296017 -1,273108
C15 6 -1,283502 0,839983 -0,000756
O1 8 -1,667305 -0,251145 2,013881

CONH_3
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 1 2,858589 -0,396654 2,095517
N7 7 3,230298 0,562382 0,476589
C16 6 5,618534 1,588126 0,119998
O2 8 6,288442 2,753142 -1,775020

CONH_4
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 1 10,943971 2,440014 1,205267
N9 7 9,910102 0,839227 1,423153
C23 6 10,925830 -1,448475 0,636460
O4 8 9,788970 -3,474450 0,648743

COOH
Atom Atomic
x y z
Label number
O5 8 -13,649492 0,765528 2,322095
O6 8 -15,440385 -2,741237 0,661215
chk 6 -13,573147 -1,401799 0,962060
H53 1 -15,360450 1,097742 3,017515

NH2_C_SP3
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 7 14,992142 -3,518670 0,356213
dummy 6 13,656673 -1,175788 -0,233003
H51 1 16,814594 -3,386578 -0,227334
H52 1 15,056771 -3,761689 2,257656
 Table S2: dipole moments and polarizabilities for each building block within the Penta ALA
peptide. Values in Atomic Units. QM: Quantum Mechanically reference calculation at
M06HF/aug-cc-pVDZ level of theory for the whole peptide. DB: database results. SD:
standard deviation

CH3_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,19 -0,12 -0,13 21,4 23,2 18,2 -0,4 -0,5 -2,2
DB 0,07 0,03 0,00 22,1 24,4 19,9 -2,9 -0,5 -0,5
SD 0,08 0,07 0,12 2,1 0,3 0,7 1,1 0,9 0,4

CH3_NC_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,09 0,05 -0,03 22,7 26,1 17,4 -0,5 1,1 -0,8
DB 0,08 0,02 -0,01 20,4 26,3 19,7 -0,5 0,7 0,1
SD 0,01 0,11 0,11 0,0 1,7 0,7 1,3 0,4 1,0

CH3_NC_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,17 -0,09 -0,01 24,2 20,1 19,6 -0,4 -0,9 3,7
DB 0,07 -0,01 0,02 21,2 21,8 23,4 -0,7 -1,9 2,9
SD 0,04 0,15 0,02 1,1 1,7 0,3 1,5 0,7 0,1

CH3_NC_4 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,09 -0,02 0,01 21,2 21,4 23,0 -0,9 1,8 3,7
DB 0,08 -0,01 0,01 20,0 21,5 24,9 -0,3 1,0 2,5
SD 0,06 0,14 0,04 1,0 1,0 0,5 1,3 1,3 0,5

CH3_NC_5 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,03 -0,28 -0,10 24,6 18,8 24,2 0,3 -3,2 -0,2
DB 0,06 -0,05 0,00 21,7 20,0 24,8 0,8 -1,9 -1,9
SD 0,01 0,06 0,15 0,8 0,1 1,6 0,3 1,2 1,2

CONH_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,67 0,45 1,70 31,4 21,4 23,4 10,3 -6,8 0,7
DB -0,56 0,49 1,68 26,0 23,9 23,6 9,2 -5,2 2,4
SD 0,03 0,00 0,09 0,7 0,3 1,9 0,0 0,8 0,8

CONH_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,26 0,91 -1,66 38,7 17,4 20,7 -6,5 -0,3 -5,2
DB -0,14 0,92 -1,58 32,7 18,3 22,5 -5,8 -1,3 -5,4
SD 0,00 0,02 0,10 0,2 0,4 2,3 0,3 0,8 0,2

CONH_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -1,04 -1,09 1,26 39,6 16,1 21,3 5,9 4,0 -3,2
DB -0,88 -1,01 1,25 31,7 16,7 25,1 5,2 4,7 -3,6
SD 0,00 0,09 0,04 0,3 1,3 0,8 0,6 0,0 1,4

CONH_4 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,44 1,72 -0,02 33,0 28,2 14,9 -5,1 -5,7 3,8
DB 0,49 1,76 0,07 30,3 27,7 15,5 -3,0 -5,9 3,6
SD 0,02 0,07 0,06 0,2 1,2 1,0 1,0 0,9 0,7

COOH μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,57 0,47 0,12 28,4 19,7 15,8 1,3 -3,2 3,8
DB 0,57 0,46 0,15 24,4 19,4 15,9 0,9 -2,4 4,3
SD 0,02 0,07 0,04 0,2 1,2 0,2 1,6 0,4 0,6

NH2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,14 0,61 0,26 14,1 12,6 10,5 -4,2 1,3 -1,4
DB 0,21 0,63 0,29 12,0 14,2 10,2 -2,5 0,7 -0,9
SD 0,00 0,07 0,06 0,0 1,5 0,1 0,5 0,7 1,5

PENTA GLY
Table S3: atomic position of each building block within Penta GLY peptide. Values in Atomic
Units. Dummy means atoms included to keep the proper symmetry

CH2_NC_1
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 -8,893051 6,437163 -1,342083
dummy 6 -7,360483 2,226286 -0,477156
chk 6 -8,138106 4,727717 0,677278
H34 1 -6,542232 5,496835 1,724564
H35 1 -9,716783 4,467691 1,971551

CH2_NC_2
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 -7,818931 0,217130 1,143473
dummy 6 -4,539311 -2,921517 1,420885
chk 6 -7,204203 -2,372740 0,530257
H26 1 -8,514539 -3,607298 1,527088
H27 1 -7,387695 -2,659034 -1,499309

CH2_NC_3
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 -3,362390 -4,727150 -0,071621
dummy 6 1,019885 -3,982976 -1,034814
chk 6 -0,829023 -5,636486 0,394386
H22 1 -0,704868 -7,573833 -0,288372
H23 1 -0,412338 -5,567511 2,408456

CH2_NC_4
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 3,500529 -4,746803 -0,667640
dummy 6 6,533917 -1,432223 0,036850
chk 6 5,643100 -3,462923 -1,773508
H24 1 7,154503 -4,832786 -2,045062
H25 1 5,099237 -2,660167 -3,588590

CH2_NC_5
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 6 6,757094 4,836943 0,481124
dummy 7 7,615029 0,595831 -1,224165
chk 6 8,667040 2,767882 0,055558
H32 1 9,414616 2,180555 1,880655
H33 1 10,179199 3,501663 -1,131757

CONH_1
Atom Atomic
x y z
Label number
O4 8 -6,397101 2,048652 -2,582878
C19 6 -7,360483 2,226286 -0,477156
N9 7 -7,818931 0,217130 1,143473
chk 1 -8,570664 0,559737 2,874651

CONH_2
Atom Atomic
x y z
Label number
O2 8 -3,589535 -1,900687 3,278108
C16 6 -4,539311 -2,921517 1,420885
N7 7 -3,362390 -4,727150 -0,071621
chk 1 -4,300072 -5,458663 -1,576410

CONH_3
Atom Atomic
x y z
Label number
O1 8 0,360560 -2,161847 -2,316993
C15 6 1,019885 -3,982976 -1,034814
N8 7 3,500529 -4,746803 -0,667640
chk 1 3,852963 -6,257261 0,460715

CONH_4
Atom Atomic
x y z
Label number
O3 8 6,345133 -1,621385 2,344205
N10 7 7,615029 0,595831 -1,224165
C17 6 6,533917 -1,432223 0,036850
chk 1 7,674745 0,586382 -3,141292

NH2_C_SP3
 Atom Atomic
x y z
Label number
chk 7 -8,893051 6,437163 -1,342083
H36 1 -7,389585 6,796022 -2,477809
H37 1 -9,398742 8,125822 -0,586193
dummy 6 -8,138106 4,727717 0,677278

COOH
Atom Atomic
x y z
Label number
O5 8 4,421014 4,267191 -0,389851
O6 8 7,269209 6,841753 1,518773
chk 6 6,757094 4,836943 0,481124
H38 1 3,198739 5,658029 -0,085038

Table S4: dipole moments and polarizabilities for each building block within the Penta GLY
peptide. Values in Atomic Units. QM: Quantum Mechanically reference calculation at
M06HF/aug-cc-pVDZ level of theory for the whole peptide. DB: database results. SD:
standard deviation

CH2_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,05 0,04 -0,26 10,5 11,9 10,1 -1,1 -0,1 1,6
DB -0,06 0,15 -0,07 9,5 10,7 9,5 -0,5 -0,2 1,0
SD 0,03 0,05 0,08 0,3 0,7 1,0 0,2 0,2 0,7

CH2_NC_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,04 0,16 0,02 12,7 10,3 8,1 0,1 0,8 -0,5
DB -0,10 0,14 0,00 11,2 9,1 9,4 -0,1 0,7 -0,3
SD 0,01 0,07 0,08 0,3 0,9 0,8 0,3 0,3 0,6

CH2_NC_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,10 0,15 0,02 10,6 11,4 8,7 0,5 -1,2 -1,1
DB -0,17 0,00 0,02 9,7 10,2 9,8 0,8 -0,8 -0,6
SD 0,07 0,02 0,07 1,1 0,2 0,6 0,1 0,7 0,0

CH2_NC_4 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,14 -0,01 0,09 10,5 10,3 9,8 0,1 -0,4 2,2
DB -0,13 -0,11 0,00 9,4 10,2 10,1 0,2 0,5 1,2
SD 0,03 0,06 0,08 0,4 0,8 0,7 0,4 0,4 0,6

CH2_NC_5 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,01 -0,12 0,03 11,2 9,9 8,0 -0,1 -0,2 -0,1
DB 0,00 -0,16 -0,07 10,5 10,1 9,1 -1,1 -0,3 0,0
SD 0,05 0,03 0,09 0,3 0,4 1,2 0,3 0,4 0,5

CONH_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,58 -0,29 1,65 16,6 32,0 23,6 -3,6 -4,6 -3,8
 DB -0,64 -0,27 1,70 15,6 34,1 23,8 -2,6 -4,6 -2,5
SD 0,02 0,02 0,09 0,0 0,4 2,0 0,5 0,1 1,0

CONH_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,24 -0,86 -1,55 29,5 22,0 21,8 -7,2 0,1 7,1
DB -0,35 -0,96 -1,52 30,6 21,3 21,6 -6,9 0,9 6,5
SD 0,01 0,01 0,10 0,0 0,5 1,9 0,2 1,2 0,3

CONH_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,88 -1,11 0,97 34,8 20,7 15,7 -0,3 -0,6 -5,2
DB 0,92 -1,27 0,95 34,3 21,9 17,3 1,3 -1,6 -6,2
SD μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

CONH_4 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,19 0,61 -1,65 17,5 28,6 25,2 8,0 -1,0 -1,4
DB 0,27 0,55 -1,73 16,8 31,0 25,7 8,2 -0,5 0,7
SD 0,05 0,03 0,08 0,9 0,5 2,0 0,2 0,9 0,1

NH2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,60 0,12 0,41 10,9 14,8 11,0 -1,7 1,1 -2,8
DB 0,52 0,19 0,47 10,6 12,5 13,4 -0,6 1,0 -2,8
SD 0,03 0,03 0,08 0,0 1,1 2,5 0,3 0,6 0,3

COOH μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,32 -0,72 -0,36 27,9 24,0 14,6 -0,5 2,7 4,4
DB -0,22 -0,62 -0,36 22,4 22,2 15,0 -2,2 1,7 4,2
SD 0,05 0,03 0,05 2,2 1,3 0,3 0,1 0,7 0,2

CICLE ALA-GLY
Table S5: atomic position of each building block within Cycle ALA-GLY peptide. Values in
Atomic Units. Dummy means atoms included to keep the proper symmetry

CHCH3_NC_1
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 6 -4,055352 1,902009 1,349642
dummy 7 -5,130228 -2,261624 0,130958
chk 6 -6,088509 0,313695 0,073132
H26 1 -6,328693 0,891573 -1,887269
C23 6 -8,576144 0,551233 1,486648
H43 1 -10,013659 -0,654979 0,641940
H44 1 -9,256445 2,493116 1,450743
H42 1 -8,378101 -0,001512 3,458955

CHCH3_NC_2
 Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 6 4,464289 0,656302 -1,179945
dummy 7 2,506344 4,220892 0,791228
chk 6 4,875493 3,375618 -0,315584
H25 1 5,236809 4,483375 -2,011802
C17 6 7,089874 3,761878 1,478522
H32 1 6,745188 2,940981 3,333855
H33 1 7,428324 5,770657 1,770673
H34 1 8,808769 2,923784 0,718096

CHCH3_NC_3
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 4,742457 -1,153111 0,691262
dummy 6 1,568284 -4,315568 0,844330
chk 6 4,336355 -3,836900 0,234893
H24 1 4,740756 -4,243380 -1,741572
C16 6 6,021801 -5,444112 1,918639
H31 1 5,685052 -5,064466 3,913056
H30 1 8,007903 -5,060498 1,539938
H29 1 5,675792 -7,447222 1,598330

CH2_NC_1
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 -3,673439 4,204452 0,158737
dummy 6 0,588839 5,325815 -0,612082
chk 6 -1,721918 5,948669 0,951477
H38 1 -2,337402 7,865229 0,523643
H37 1 -1,372508 5,775948 2,972161

CH2_NC_2
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 6 -3,656053 -3,253164 -1,795618
dummy 7 0,242074 -5,322981 -1,181079
chk 6 -2,460234 -5,753271 -1,095663
H35 1 -3,011090 -6,402581 0,777811
H36 1 -2,954209 -7,170944 -2,503131

CONH_1
Atom Atomic
x y z
Label number
N9 7 0,242074 -5,322981 -1,181079
O2 8 0,640995 -3,780019 2,907533
C15 6 1,568284 -4,315568 0,844330
chk 1 1,156134 -5,714154 -2,821361
 CONH_2
Atom Atomic
x y z
Label number
O1 8 3,776429 0,196532 -3,356532
N6 7 4,742457 -1,153111 0,691262
C14 6 4,464289 0,656302 -1,179945
chk 1 5,061253 -0,600933 2,500297

CONH_3
Atom Atomic
x y z
Label number
O4 8 0,640428 5,677682 -2,908666
N7 7 2,506344 4,220892 0,791228
C21 6 0,588839 5,325815 -0,612082
chk 1 2,211924 3,850317 2,649963

CONH_4
Atom Atomic
x y z
Label number
O3 8 -2,919627 1,188449 3,248628
C20 6 -4,055352 1,902009 1,349642
N10 7 -3,673439 4,204452 0,158737
chk 1 -4,719780 4,665545 -1,381201

CONH_5
Atom Atomic
x y z
Label number
O5 8 -3,212534 -2,202476 -3,820459
N8 7 -5,130228 -2,261624 0,130958
C22 6 -3,656053 -3,253164 -1,795618
chk 1 -5,331295 -3,249195 1,762926

Table S6: dipole moments and polarizabilities for each building block within the CYCLE
ALA-GLY peptide. Values in Atomic Units. QM: Quantum Mechanically reference calculation
at M06HF/aug-cc-pVDZ level of theory for the whole peptide. DB: database results. SD:
standard deviation

CHCH3_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,03 -0,14 -0,02 28,5 18,8 18,0 0,4 -1,6 1,0
DB -0,01 -0,08 -0,01 26,2 19,9 20,3 0,5 -0,8 0,7
SD 0,09 0,06 0,12 1,1 0,8 0,6 1,6 0,6 0,8

CHCH3_NC_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,06 0,16 -0,10 25,0 21,5 17,1 3,1 2,9 1,0
DB -0,05 0,05 0,03 22,8 22,4 21,3 1,9 2,6 1,7
SD 0,04 0,00 0,15 0,7 0,8 2,4 0,2 0,2 1,1
CHCH3_NC_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz
QM 0,07 0,10 0,04 26,0 23,1 14,5 -2,9 -0,7 0,5
DB 0,04 0,06 0,00 24,8 21,3 20,4 -2,2 1,2 -1,4
SD 0,08 0,01 0,14 1,9 0,6 1,2 0,5 1,3 0,4

CH2_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,12 -0,10 -0,03 9,8 10,9 7,9 -0,8 -1,3 1,0
DB -0,16 -0,07 0,01 10,4 9,4 9,8 -0,6 -1,1 0,2
SD 0,06 0,03 0,08 0,9 0,3 0,7 0,3 0,7 0,2

CH2_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,16 0,02 0,01 9,0 12,5 7,9 0,3 1,1 0,2
DB 0,16 -0,05 0,02 9,3 11,0 9,4 -0,7 0,4 -0,4
SD 0,08 0,02 0,06 1,3 0,1 0,5 0,1 0,6 0,0

CONH_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,32 -0,31 -1,80 31,3 17,7 24,3 2,5 4,1 5,1
DB 0,34 -0,61 -1,70 31,7 16,3 25,5 5,7 1,8 4,9
SD 0,05 0,07 0,05 1,2 0,4 0,9 1,2 0,7 0,5

CONH_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,22 0,03 1,71 14,8 32,2 18,9 1,1 -4,5 -2,5
DB 0,40 -0,06 1,79 14,3 33,7 25,5 2,7 3,0 -3,0
SD 0,04 0,03 0,09 0,1 0,6 1,8 0,7 0,2 1,1

CONH_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,26 -0,65 1,63 30,3 18,3 23,4 -6,0 2,2 -4,3
DB 0,31 -0,53 1,73 30,5 17,5 25,5 -8,6 -0,7 -1,6
SD 0,03 0,06 0,07 0,8 0,1 1,6 0,8 0,7 0,8

CONH_4 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,55 0,76 -1,57 23,9 29,5 19,2 6,1 3,1 -4,0
DB -0,70 0,95 -1,41 20,8 31,0 21,7 7,3 5,2 -2,8
SD 0,08 0,04 0,03 2,1 0,3 0,6 0,3 0,8 0,5

CONH_5 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,28 -0,34 1,81 21,2 25,0 23,6 -6,2 -4,6 1,1
DB -0,51 -0,44 1,70 19,6 29,2 24,8 -7,8 -5,9 0,5
SD 0,04 0,01 0,09 0,8 0,0 1,6 0,4 0,7 1,1
ALA-GLY-ALA-GLY
Table S7: atomic position of each building block within ALA-GLY-ALA-GLY peptide. Values
in Atomic Units. Dummy means atoms included to keep the proper symmetry

CHCH3_NC_1
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 -11,569659 -1,522552 -0,116596
chk 6 -8,963349 -2,291860 0,368875
dummy 6 -7,290563 0,047621 0,238105
C17 6 -8,118263 -4,233742 -1,581701
H27 1 -8,864327 -3,119560 2,250475
H30 1 -8,189884 -3,466703 -3,489946
H31 1 -9,303311 -5,915032 -1,519718
H32 1 -6,175814 -4,816345 -1,231912

CHCH3_NC2
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 0,546698 3,329508 0,401000
chk 6 2,826085 3,342170 -1,103789
C12 6 3,680431 6,047313 -1,595307
dummy 6 4,863021 1,896718 0,328245
H20 1 2,428298 2,400519 -2,889958
H24 1 4,104863 7,030348 0,162139
H25 1 2,215515 7,112740 -2,571917
H26 1 5,382129 6,080950 -2,752008

CH2_NC_1
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 -5,243423 -0,113762 1,871207
chk 6 -3,388279 1,873474 2,119328
dummy 6 -1,266117 1,441105 0,250200
H22 1 -2,643727 1,813570 4,036833
H23 1 -4,263033 3,702351 1,765949

CH2_NC_2
Atom Atomic
x y z
Label number
dummy 7 6,514642 0,658948 -1,291439
chk 6 8,598632 -0,863038 -0,400811
dummy 6 7,889985 -3,593503 -0,010205
H33 1 9,281957 -0,100722 1,384413
H34 1 10,077720 -0,765717 -1,828310

CONH_1
Atom Atomic
x y z
Label number
O3 8 -7,739751 1,858924 -1,145363
N7 7 -5,243423 -0,113762 1,871207
C16 6 -7,290563 0,047621 0,238105
Chk 1 -4,989255 -1,704722 2,912068

CONH_2
Atom Atomic
x y z
Label number
O1 8 4,989633 1,835113 2,646939
N8 7 6,514642 0,658948 -1,291439
C13 6 4,863021 1,896718 0,328245
chk 1 6,257639 0,795008 -3,187401

CONH_3
Atom Atomic
x y z
Label number
O2 8 -1,160481 -0,409315 -1,147253
N6 7 0,546698 3,329508 0,401000
C14 6 -1,266117 1,441105 0,250200
chk 1 0,340529 4,698615 1,728344

COOH
Atom Atomic
x y z
Label number
O4 8 5,451860 -4,109398 -0,584114
O5 8 9,378900 -5,193345 0,752867
chk 6 7,889985 -3,593503 -0,010205
H37 1 5,033097 -5,918055 -0,310860

NH2_C_SP3
Atom Atomic
x y z
Label number
chk 7 -11,569659 -1,522552 -0,116596
dummy 6 -8,963349 -2,291860 0,368875
H35 1 -12,167947 -0,357158 1,284447
H36 1 -12,716912 -3,058711 -0,059904
 Table S8: dipole moments and polarizabilities for each building block within the ALA-GLY-
ALA-GLY peptide. Values in Atomic Units. QM: Quantum Mechanically reference calculation
at M06HF/aug-cc-pVDZ level of theory for the whole peptide. DB: database results. SD:
standard deviation

CHCH3_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,13 0,11 -0,25 21,1 25,0 21,4 2,3 0,2 2,5
DB -0,08 -0,01 -0,01 20,3 25,2 21,0 -0,1 -0,8 2,5
SD 0,02 0,05 0,15 0,1 0,8 1,6 1,1 1,0 1,0

CHCH3_NC_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,12 0,05 0,02 21,8 26,0 18,5 0,7 0,4 -3,2
DB -0,07 0,02 0,02 20,6 25,0 20,8 0,1 0,5 -2,7
SD 0,00 0,15 0,06 0,2 2,3 0,0 1,3 0,2 0,6

CH2_NC_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,13 -0,05 -0,05 11,5 8,1 9,5 0,0 -1,3 1,0
DB -0,15 -0,08 0,04 10,3 9,0 10,3 -0,5 -1,0 0,4
SD 0,02 0,10 0,01 0,3 1,4 0,2 0,4 0,0 0,3

CH2_NC_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,02 0,14 0,05 10,2 9,8 7,8 0,1 -0,6 0,1
DB -0,08 0,14 -0,05 9,4 11,1 9,2 0,8 -0,3 -0,1
SD 0,07 0,01 0,08 0,7 0,2 1,0 0,3 0,6 0,3

CONH_1 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,73 -1,22 1,02 32,0 24,1 19,8 5,7 7,5 -3,5
DB 0,74 -1,22 1,15 28,8 24,6 20,1 6,1 7,4 -2,9
SD 0,04 0,09 0,00 0,4 2,5 0,4 0,5 0,2 0,0

CONH_2 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,17 -0,35 -1,77 27,7 21,3 25,8 -10,5 -1,6 1,2
DB 0,21 -0,27 -1,80 26,1 21,5 25,8 -10,6 -0,8 0,6
SD 0,05 0,04 0,08 1,1 0,4 1,8 0,4 1,0 0,3

CONH_3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,39 1,46 0,97 34,1 23,5 16,8 7,6 -5,3 3,5
DB 0,33 1,51 0,99 30,4 23,4 19,7 5,7 -6,5 3,9
SD 0,02 0,03 0,09 0,5 0,6 2,3 0,1 0,3 0,6

COOH μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM -0,65 0,49 -0,24 22,6 25,1 13,6 -2,2 3,0 -2,0
DB -0,53 0,48 -0,23 21,7 24,6 13,4 0,6 2,2 -2,1
SD 0,02 0,03 0,07 0,7 0,6 0,1 1,0 0,4 1,5

NH2_C_SP3 μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

QM 0,23 -0,28 0,57 18,0 9,7 9,6 -0,4 -0,2 0,6
 DB 0,18 -0,31 0,63 15,7 10,4 10,4 -1,2 0,9 -0,4
SD 0,03 0,00 0,08 0,5 0,4 1,3 0,4 1,7 0,2

2.0 Database entries

Table S9: database dipole moments and polarizabilities entries for all five building blocks

μx μy μz αxx αyy αzz αxy αxz αyz

COOH -0.646 0.355 0.026 22.410 24.927 12.651 -0.391 -0.248 0.502
SD 0.040 0.019 0.061 0.471 0.680 0.242 1.435 0.198 1.157

CHCH3_NC 0.032 -0.088 -0.029 25.594 21.600 19.629 1.723 0.340 -0.592
SD 0.121 0.059 0.135 0.570 1.410 0.739 1.499 0.989 0.727

CONH 1.781 0.432 0.052 28.442 31.890 13.301 -4.232 0.201 -0.753
SD 0.075 0.036 0.072 1.136 0.901 0.562 1.094 0.461 1.016

NH2_C_SP3 -0.281 -0.046 -0.706 16.257 9.978 10.070 0.385 1.020 -0.058
SD 0.038 0.035 0.060 0.367 0.209 0.091 1.257 1.071 0.260

CH2_NC -0.169 -0.031 0.002 10.348 10.046 9.268 -1.214 -0.103 -0.140
SD 0.052 0.072 0.052 0.782 0.634 0.529 0.596 0.457 0.367