INTEC

GENOMICS
Workshop No 1
CD: Carlos Vergara C. BSc. Esp. MSc PhD (c)
Sebastián Jiménez

1- Albinism in humans is inherited as a simple recessive trait. For the following families,
determine the genotypes of the parents and offspring. (When two alternative genotypes are
possible, list both.)

(a) Two normal parents have five children, four normal and one albino.
(b) A normal male and an albino female have six children, all normal.
(c) A normal male and an albino female have six children, three normal and three albino.
(d) Construct a pedigree of the families in (b) and (c). Assume that one of the normal
children in (b) and one of the albino children in (c) become the parents of eight children.
Add these children to the pedigree, predicting their phenotypes (normal or albino).
2- Consider the following pedigree.

Predict the mode of inheritance of the trait of interest and the most probable genotype of
each individual. Assume that the alleles “A” and “a” control the expression.

3- The following pedigree is for myopia (nearsightedness) in humans.

Predict whether the disorder is inherited as the result of a dominant or recessive trait.
Determine the most probable genotype for each individual based on your prediction.

El modo de herencia es autosómico recesivo, la mutación ocurre en ambas copias de los

alelos. La descendencia afectada heredaría una copia mutada de cada padre. Los padres son
portadores de la enfermedad ya que no hay signos ni síntomas visibles.

4. Tay–Sachs disease (TSD) is an inborn error of metabolism that results in death, often by
the age of 2. You are a genetic counselor interviewing a phenotypically normal couple who
tell you the male had a female first cousin (on his father’s side) who died from TSD and the
female had a maternal uncle with TSD.
There are no other known cases in either of the families, and none of the matings have been
between related individuals. Assume that this trait is very rare. Draw a pedigree of the
families of this couple, showing the relevant individuals.
(a) Calculate the probability that the female is carrier for TSD.
(b) Calculate the probability that the male is carrier for TSD.
(c) Calculate the probability that both are carriers for TSD.
(d) Calculate the probability that neither is heterozygous.
(e) Calculate the probability that one is heterozygous.
(f) Calculate the probability this couple have a daughter with TSD.

Enfermedad de Tay-sachs también llamada deficiencia de hexosaminidasa A es un trastorno

autosómico recesivo. Dos alelos de tay-sachs deben estar presentes para exhibir la
enfermedad. los portadores del alelo único no exhiben. Cuando ambos padres son
portadores, existe un 25 % de posibilidades de riesgo para el niño afectado. ambos sexos se
ven afectados por igual.

De la pregunta anterior obtenemos que:

Lado materno: su tío tiene la enfermedad, por lo tanto, sus padres son heterocigotos para la
enfermedad, por lo que la madre tendrá 1/3 de posibilidades de tener la enfermedad,
cuando cruzamos entre dos padres de la madre que es Tt *Tt = obtenemos Tt será 1/3 de
probabilidad de tener una madre heterocigota o si cruzamos entre los padres homocigotos
TT* TT = obtenemos TT 1/3 de probabilidad de enfermedad.

Por lo tanto, para concluir, la madre tendrá 1/3 de probabilidad de ser homocigota o
heterocigota para la enfermedad {TT o Tt}

Lado paterno: su primo tiene, para contraer una enfermedad, la persona debe ser portadora
de la enfermedad. Teniendo en cuenta que los padres, los padres, la madre pueden ser
homocigotos TT, el padre del padre será heterocigoto Tt, entonces, si cruzamos TT*Tt = los
descendientes serán 1/4 TT, 1/2 será Tt, padre de ser heterocigoto Tt es 1/3 de probabilidad.

-La madre será Tt actuará como portadora

-El padre será Tt actuará como portador

Tt*Tt =los descendientes serán TT [ 1/4 ] ,Tt [1/2] ,tt [1/4 ].

2/36 niños tendrán el alelo portador Tt o 1/36 tendrán el alelo dominante TT que no actúa
como portador de la enfermedad

si los padres no son portadores, deben ser homocigotos para la enfermedad TT * TT [2/3 de
probabilidad de los cálculos anteriores para cada padre], por lo que los descendientes serán
2/3 * 2/3 = 4/9 = 16/36 serán homocigotos para el alelo , no exhibirán enfermedad .

¿Cuál es la probabilidad de que uno de ellos sea portador y el otro no?

habrá dos probabilidades, TT{madre} *Tt [padre], Tt [madre} *TT [padre}

TT{madre} 1/3 *Tt [padre] 2/3 ;

los descendientes 1/2 TT y 1/2 serán Tt, por lo que obtenemos 1/2*2/3*1/2 = 2/18 = 4/36
tendrá posibilidades de ser Tt o 4/36 tendrá posibilidades de ser TT.

TT{madre} *Tt [padre]

igual que arriba habrá 4/36 tendrán TT o 4/36 tendrán el alelo Tt.

así que para concluir

posibilidad de que el niño sea TT

1/36+ 16/36 +4/36 + 4/36 = 25/36 será TT

posibilidad de ser Tt

2/36 + 4/36+ 4/36 = 10/36 tendrá Tt

probabilidad de ser tt = 1/36

25/36+10/36+ 1/36 = 36/36

5- You and your partner have no children. You stand to inherit a sizeable fortune from your
crazy Uncle Irving if you can produce three daughters in your family of three children. What
is the probability of doing just that?
hombre × mujer
XX × XY
XX XY XX XY
XX- representa que el niño es una niña
XY- representa que el niño es niño

Ahora probabilidad de tener una niña como primer hijo = 2/4 = 1/2
Probabilidad de tener una niña como segundo hijo = 1/2
Probabilidad de tener una niña como tercer hijo = 1/2

Entonces, la probabilidad de tener tres hijas de cada tres hijos es = 1/2 × 1/2 × 1/2 = 1/8

6- If you could convince Uncle Irving that simply having three children all of the same sex
would do, then what would be the probability of your receiving the inheritance?

3 niñas o 3 niños = (1/2 × 1/2 × 1/2) + (1/2 × 1/2 × 1/2) = 1/8 + 1/8 = 2/8 = 1/ 4

7- In quest of the family stipulated in #2 above, you produce a boy as your first child. Now
what is the probability of inheriting the fortune?

Primero es niño. Por lo tanto, su probabilidad será 1. Ahora, habrá próximos dos niños.
Probabilidad de los próximos dos niños = 1/2 × 1/2 = 1/4

8- Finally, you have convinced Uncle Irving that you will agree to try for at least three girls
out of four children. How likely are you to become wealthy given those conditions
Al menos 3 niñas de 4 = (3 niñas y 1 niño) O (4 niñas) = (1/2 × 1/2 × 1/2 × 1/2) + (1/2 × 1/2 ×
1 /2 × 1/2) = (1/16) + (1/16) = 2/16 = 1/8

Part II How to use bioinformatic resources.

1. To begin the search, access the OMIM site at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov

2. In the tab “All databases” find OMIM database and in the “SEARCH” box, type “sickle-cell
anemia” and click on the “search”.
3. Select the entry (#603903).
4. Examine the list of subject headings in the left-hand column and read some of the
information about sickle-cell anemia.
5. Select one or two references at the bottom of the page and follow them to their abstracts
in PubMed.
6. Using the information in this entry, answer the following questions:
a. What is OMIM?
OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) es una base de datos en línea que contiene
información sobre enfermedades genéticas y trastornos hereditarios en humanos. OMIM es
una importante fuente de información para investigadores, médicos y pacientes, ya que
proporciona información detallada sobre los genes, las proteínas y las enfermedades
asociadas con ellos, así como también referencias a la literatura científica relevante.

b. Which gene is mutated in individuals with sickle-cell anemia?

La anemia de células falciformes es causada por una mutación en el gen HBB, que codifica la
hemoglobina beta. La mutación resulta en una forma anormal de hemoglobina que se
agrupa en forma de hojas de abanico, causando la deformación de los glóbulos rojos y
dificultad para transportar oxígeno. La anemia de células falciformes es un trastorno
hereditario que se transmite por herencia autosómica recesiva.

c. What are the major symptoms of this disorder?

Los principales síntomas de la anemia de células falciformes incluyen:
Fatiga y debilidad: debido a la falta de oxígeno en los tejidos.
Dolor agudo: especialmente en las articulaciones y huesos, causado por la obstrucción de los
vasos sanguíneos por células falciformes.
Piel y ojos amarillentos (ictericia): debido a la acumulación de bilirrubina en el hígado.
Problemas respiratorios: incluyendo neumonía, bronquitis y otitis, debido a la formación de
coágulos de sangre en los pulmones.
Anemia crónica: debido a la destrucción prematura de los glóbulos rojos deformados.
Estos síntomas pueden variar en gravedad y frecuencia, y algunos pacientes pueden
experimentar complicaciones graves, como infecciones, trombosis y crisis vasooclusivas, que
pueden ser potencialmente mortales.

En muchos niños con anemia de células falciformes, se desarrolla asplenia funcional durante
el primer año de vida y la septicemia es la principal causa de muerte en la niñez. El riesgo de
septicemia en la anemia de células falciformes es mayor durante los primeros 3 años de vida
y se reduce notablemente con el tratamiento profiláctico con penicilina

d. What was the first published scientific description of sickle-cell anemia?

La primera descripción científica de la anemia de células falciformes fue publicada en 1910
por el Dr. James B. Herrick, médico e investigador estadounidense. En su artículo, el Dr.
Herrick describió a un paciente con una forma inusual de anemia caracterizada por la
presencia de glóbulos rojos de forma anormal, que luego identificó como en forma de media
luna o de hoz. Esta fue la primera vez que la anemia de células falciformes se reconoció
como una condición médica distinta, y el artículo del Dr. Herrick sentó las bases para futuras
investigaciones sobre la genética y la patogenia de este trastorno.

e. Describe two other features of this disorder that you learned from the OMIM database
and state where in the database you found this information.
La base genética de la enfermedad de células falciformes es una transversión de A a T en el
sexto codón del gen HBB. Las complejidades de la expresión del gen de la globina dificultan
el desarrollo de tratamientos para las hemoglobinopatías basados en la terapia génica. Lan
et al. (1998)utilizó un enfoque genético alternativo a la terapia de células falciformes basado
en la reparación del ARN. Utilizaron una ribozima del grupo I de empalme trans para alterar
las transcripciones de beta-globina mutante en precursores de eritrocitos derivados de
sangre periférica de personas con enfermedad de células falciformes. Los transcritos de la
globina beta falciforme se convirtieron en ARNm que codifican la proteína anti-drepanocítica
gamma-globina. En esta reacción de corte y empalme, la ribozima reconoció el transcrito de
la globina beta falciforme mediante el emparejamiento de bases con una región accesible
del ARN corriente arriba del nucleótido mutante a través de una secuencia guía interna
(IGS), escindió el ARN de la globina beta falciforme, liberó el producto de escisión que
contenía la mutación y empalmados en la secuencia revisada para el transcrito de globina.
Lan et al. (1998)generaron precursores de eritrocitos a partir de sangre de cordón umbilical
normal y de sangre periférica de pacientes con enfermedad de células falciformes mediante
el cultivo de células sanguíneas en medio sin suero suplementado con eritropoyetina, FLT3
( 600007 ) e IL3 ( 147740 ). Esta parte la saque del apartado de Terapia de Genes.

f. Describe the type of mutation in sickle cell anemia.

La mutación en la anemia de células falciformes es una mutación puntual en el gen beta-
globina (HBB), que se encuentra en el cromosoma 11. Esta mutación cambia un solo
aminoácido en la proteína de la hemoglobina, de ácido glutámico a valina, en la posición 6
de la cadena beta-globina.
Este cambio en un solo aminoácido conduce a la formación de moléculas de hemoglobina
anormales que tienden a polimerizarse, es decir, a pegarse entre sí, en condiciones de bajo
oxígeno. La polimerización de la hemoglobina conduce a la formación de células rojas de la
sangre rígidas y en forma de hoja de abanico que tienen dificultades para pasar a través de
los pequeños vasos sanguíneos. Esto causa un bloqueo en el flujo de sangre y puede causar
dolor, daño tisular y otras complicaciones asociadas con la anemia de células falciformes.
Esta mutación es un ejemplo de una mutación missense, que es un tipo de mutación
genética que resulta en un cambio en la secuencia de aminoácidos de una proteína.
g. How affects this mutation the structure of the hemoglobin?

La mutación de la anemia de células falciformes afecta la estructura de la hemoglobina al

cambiar un solo aminoácido en la cadena de beta-globina, de ácido glutámico a valina en la
posición 6. Este cambio conduce a la formación de moléculas de hemoglobina anormales
que tienden a unirse o polimerizar en condiciones de bajo oxígeno.
Normalmente, las moléculas de hemoglobina son flexibles y tienen forma de disco, lo que
les permite transportar de manera eficiente el oxígeno a los tejidos del cuerpo. Sin embargo,
en la anemia de células falciformes, las moléculas anormales de hemoglobina tienden a
agruparse y formar células rígidas con forma de hoz que pueden obstruir el flujo de sangre a
través de los vasos sanguíneos más pequeños. Esto puede conducir a una reducción del
suministro de oxígeno a los tejidos del cuerpo, lo que puede causar dolor, daño a los tejidos
y otras complicaciones asociadas con la anemia de células falciformes.
Las moléculas de hemoglobina anormales también tienen una capacidad reducida para
liberar oxígeno a los tejidos del cuerpo, lo que puede contribuir aún más a los síntomas y
complicaciones de la anemia de células falciformes. En general, la mutación de la anemia de
células falciformes altera la estructura y función normales de la hemoglobina, lo que lleva a
los síntomas y complicaciones característicos de este trastorno.