Témavezetői értékelés

Erdős Gábor részére

Erdős Gábor 2014. decemberében csatlakozott az általam vezetett MTA Lendület

Bioinformatikai Kutatócsoporthoz mint biomérnök hallgató, és az egyetem elvégzése után
Phd hallgatóként folytatta kutatómunkáját témavezetésem alatt. Doktori témája az
eredendően rendezetlen fehérjék bioinformatikai vizsgálata volt.

Gábor doktoranduszként minden szempontból kiemelkedő munkát végzett és ezt az elért

eredményei is világosan tükrözik. Kifejlesztett egy motívumszűrő eljárást, és ezt alkalmazta
az LC8 lineáris motívum kötő fehérjére. Ez lehetővé tette új kötő partnereket azonosítását,
ami rávilágított a fehérje egy korábban nem ismert új funkcionális szerepére egy fontos
jelátviteli útvonalban. Emellett olyan módszerek kifejlesztésén dolgozott, amelyek képesek a
rendezetlenséget közvetlenül a szekvenciából jósolni. A korábban kifejlesztett IUPred és
ANCHOR rendezetlenség és rendezetlen kötőhely predikciós módszereket
újraimplementálta modern programnyelven, elérhetővé tette programcsomag formájában és
új funkciókkal bővítette. A módszerekhez teljesen új web szervereket készített, amik
felhasználóbarát és informatív módon prezentálták az eredményeket. Ezek a fejlesztések
nagyban hozzájárult ahhoz, hogy a módszerek széles körben használtak legyenek. Jelenleg
az IUPred módszer továbbfejlesztésén dolgozik mélytanulásos módszerek felhasználásával.
Munkájának eredményessége megmutatkozik cikkeinek magas össz-impakt faktorában és
az azokra kapott hivatkozások kiugróan magas számában is.

Gábor eddigi eredményeit több hazai és nemzetközi konferencián is bemutatta, és ezek az

előadások nagyon pozitív visszhangot váltottak ki. A doktori értekezéséhez felhasznált
publikációk mellett további hazai és nemzetközi együttműködési projektben és részt vett, és
aktív résztvevője a rendezetlen fehérje kutatás nemzetközi közösségnek. Ezek közül is
kiemelkedik a csoport többi tagjával együttműködésben készített ANCHOR módszer új
verziója, ami a Nature Methods által leközölt átfogó nemzetközi tesztelés során jelenleg a
legjobb módszernek bizonyult területén. Gábor munkája azt is lehetővé tette, hogy a
rendezetlen fehérjék vizsgálatára szolgáló módszerünket ipari felhasználók számára is
értékesíthessük. Magasszintű kutatásai mellett Gábor az oktatásban is nagy örömmel vesz
részt. Különböző programozási órái nagyon népszerűek a hallgatók körében, és nagyon
fontos résztvevője az ELTÉn nemrégiben indult bioinformatikai specializáción folyó
oktatásnak is. Kiváló kutatási eredményeinek köszönhetően doktori ösztöndíjban is
részesült, illetve elnyerte a Joseph Cours ösztöndíjat.

Összességében Gábor eddigi eredményei és az általa fejlesztett bioinformatikai módszerek

alapvető fontossággal bírnak a rendezetlen fehérjék kutatásában. Kiemelkedő eredményei
alapján a doktori védésre bocsátását és a sikeres védés után a doktori cím odaítélést
messzemenőleg támogatom.

Budapest, 2022.06.01.

Dosztányi Zsuzsanna témavezető

MTA-ELTE Lendület Bioinformatikai Kutatócsoport