Enzymy

Mgr. Petr Rašovský

TOP kurzy s.r.o
Osnova
Charakteristika Podmínky působení
Druhy enzymů Proenzym (zymogen)
Specifita enzymů Rozdělení enzymů
Princip fungování enzymů oxidoreduktázy
reakční kinetika transferázy
aktivní centrum hydrolázy
jednosložkový enzym lyázy
dvousložkový enzym ligázy
Aktivace a inhibice enzymů izomerázy
Způsoby působení enzymů Katalytické jedy
kompetitivní
nekompetitivní
allosterické
Charakteristika enzymů
 zpravidla bílkoviny
 biokatalyzátory – snižováním aktivační energie (a tím
i teploty) umožňují průběh mnoha reakcí v lidském
těle
 žádna reakce v našem těle by neprobíhala bez účasti
enzymů
 jediná buňka je schopna vytvořit asi 2500 enzymů, z
toho v jednu chvíli je jich aktivních asi 1000
 jsou účinnější než běžné anorganické katalyzátory
 př. H2O2 → H2 + O2
BUREL KATALÁZA

H2O2 H2O2
Druhy enzymů
 Z hlediska složení enzymů rozlišujeme:
1) Jednosložkové enzymy
 skládají se pouze z molekuly bílkoviny

BÍLKOVINA

2) Dvousložkové enzymy
 skládají se z bílkovinné části (apoenzym) a nebílkovinné
části (kofaktor)
 celek apoenzymu a kofaktoru nazýváme holoenzym

APOENZYM
KOFAKTOR

HOLOENZYM
Kofaktor
 Kofaktorem může být:
 koenzym
 s apoenzymem je poután slabě, snadno se může oddělit
(oddisociovat) a přejít na jiný apoenzym

APOENZYM KOENZYM

 prostetická skupina
 s apoenzymem je poutána silně, např. kovalentní vazbou

APOENZYM PROSTETICKÁ SKUPINA

Specifita enzymů
 Specifita účinku/funkční
 enzymy mohou ovlivňovat jen určitou přeměnu substrátu (tzn.
určitý typ reakce; např. oxidaci)
OXIDÁZA
METHANOL
METHANAL ETHANOL
ACETALDEHYD PROPANOL
PROPANAL

 Specifita substrátová
 enzymy mohou ovlivňovat jen jediný typ substrátu
 umožňuje velice přesnou „hodinářskou“ práci

ACETALDEHYDREDUKTÁZA

METHANAL ETHANOL
ACETALDEHYD PROPANAL
Princip fungování enzymů
 Reakční kinetika
 využívá k vysvětlení principu fungování enzymů reakční
koordinátu
 reakční koordináta je graf zobrazující změny energie částic v
průběhu reakce

 Aktivační energie
 k tomu, aby reakce proběhla je nutné dodat určitou aktivační
energii EA
 probíhá reakce: A + B → AB
 při enzymové katalýze dochází ke snižování aktivační energie
 probíhají reakce: A + E → AE a AE + B → AB + E
 Reakční koordináta
ZOBRAZUJE ZMĚNY ENERGIE ČÁSTIC
E ZA ČAS (V PRŮBĚHU REAKCE)
NORMÁLNÍ PRŮBĚH REAKCE A + B → AB
ENERGIE VÝCHOZÍCH LÁTEK A + B
EA…B ENERGIE AKTIVOVANÉHO KOMPLEXU
ENERGIE PRODUKTU AB
AKTIVAČNÍ ENERGIE EA
EA
EAE ENZYMOVĚ KATALYZOVANÁ REAKCE:
EA…B
ENERGIE VÝCHOZÍCH LÁTEK A + B
ENERGIE REAKCE: A + E → AE
EA ENERGIE REAKCE: AE + B → AB + E
ENERGIE PRODUKTU AB
AKTIVAČNÍ ENERGIE EA
EA + B

EAB AKTIVAČNÍ ENERGIE ENZYMOVĚ

KATALYZOVANÉ REAKCE JE
MNOHOKRÁT MENŠÍ

t
Princip fungování enzymů II
 Aktivní místo/centrum
 každý enzym má své aktivní centrum
 aktivní centrum má určitý prostorový tvar a nacházejí se v něm
určité funkční skupiny
 to, jaké funkční skupin aktivní centrum obsahuje určuje afinitu
(příchylnost) k substrátu
AKTIVNÍ MÍSTO

ENZYM
Princip fungování enzymů III
 Jednosložkový enzym
 tvar aktivního centra umožňuje navázání substrátu a
proběhnutí reakce
PRODUKTY

SUBSTRÁT
ENZYM

 mluvíme o tom, že enzymy fungují na tzv. principu zámku a

klíče

 dnes se již mluví i o tom, že enzym není zcela rigidní (pevná)

struktura, ale že je to struktura templátová (měnící se) a
může tak dle potřeby „obepnout“ substrát
Princip fungování enzymů IV
 Dvousložkový enzym
 obdobně jako jednosložkový enzym funguje na principu zámku a
klíče
 na substrát se nejdříve naváže kofaktor, načež dojde ke spojení
s apoenzymem
KOFAKTOR

APOENZYM HOLOENZYM SUBSTRÁT

PRODUKTY

 podle toho, jakou má kofaktor povahu buď zůstává navázaný na

apoenzymy (tzn. prostetická skupina) nebo se odpojí a může se
navázat na jiný apoenzym (tzn. koenzym)
Aktivace a inhibice enzymů
 pro řízení dějů probíhajících v buňce využívá tělo různé
látky:
 aktivátory slouží k aktivaci nebo urychlení reakce
 inhibitory slouží k zpomalení až zastavení reakce
 ovlivňování reakcí pomocí aktivátorů a inhibitorů
nazýváme allosterické ovlivňování
 „nad“ aktivátory a inhibitory ještě velice často
nelézáme určitý hormon, který jejich produkci
spouští
Kompetitivní inhibice
 compeete – soutěžit
 inhibitor je podobný substrátu a „soutěží“ s ním o
navázání na aktivní místo enzymu
SUBSTRÁT

ENZYM
INHIBITOR

 na aktivní místo se naváže ten, který „má převahu“

 v příkladě výše došlo k inhibici enzymu
Nekompetitivní inhibice
 způsobena katalytickými jedy
 katalytické jedy jako ionty těžkých kovů, či alkohol
nemají podobnou strukturu jako substrát, ale navazují se
rovněž na aktivní místo
SUBSTRÁT

Pb2+
ENZYM KATALYTICKÝ JED
 naváže-li se katalytický jed na aktivní místo, dojde k
znehodnocení enzymu (přestává pracovat)
Allosterická inhibice
 kromě aktivního místa mají některé enzymy i tzv.
allosterické místo
ALLOSTERICKÉ MÍSTO AKTIVNÍ MÍSTO

INHIBITOR
SUBSTRÁT

ENZYM
 za normálních okolností by substrát zapadl do aktivního
místa a proběhla by reakce
 naváže-li se na allosterické místo inhibitor, dojde k
prostorové změně aktivního centra a enzym je nefunkční
 Podmínky působení enzymů
 aktivitu enzymů ovlivňuje mnoho vnějších faktorů,
neboť enzymy jsou velmi citlivé látky
 hlavními faktory jsou: 60°C
DENATURACE
50°C
 teplota 40°C MALÁ AKTIVITA
0
 fungují jen ve velmi úzkém rozmezí teplot
OPTIMUM
 při vyšších teplotách dochází k denaturaci
 pH 10°C
MALÁ AKTIVITA
 většina enzymů je aktivních v neutrálním pH
7
 koncentrace enzymu S
 čím vyšší koncentrace, tím vyšší rychlost reakce S
 koncentrace substrátu S
S
 čím více substrátu, tím rychleji reakce probíhá E S
14 E E
S
E
Zymogen
 zymogen = proenzym
 jedná se o neaktivní formu enzymu
 v trávící soustavě se nachází zymogeny aktivované
pankreatickou lipázou
 v krevní plazmě se nachází globulární fibrinogen, který se mění
na vláknitý fibrin v případě krvácení (působí trombin)

FIBRIN

FIBRINOGEN TROMBIN

 organismus se tak sám brání proti poškození

 aktivátory jsou nejčastěji ionty kovů jako Mg2+ a Zn2+
Rozdělení enzymů
 enzymy dělíme do šesti hlavních kategorií
 oxidoreduktázy
 transferázy
 hydrolázy
 lyázy
 ligázy (syntetázy)
 izomerázy
 pro velké množství enzymů byl vytvořen jejich kompletní
seznam, kde jsou enzymy vedeny pod čtyřčíselným kódem

EC 1.1.1.1

 první číslo zařazuje enzym do jedné z hlavních kategorií

Oxidoreduktázy
 katalyzují přenos elektronů, vodíku (protonů), kyslíku
 důležité pro proces dýchání a fotosyntézu
 koenzymy: NAD, NADP, FMN, FAD
 tyto koenzymy označujeme přenašeče vodíku (přijímají a
odevzdávají jej; jeho přijímáním se ox. a odevzdáním se red.)
 přirovnání: luk (děj je energeticky náročný a vodík je možné
jakoby „vystřelit“ na místo určení)
- -
COO COO
+
H 3N CH HN C
aspartátox idasa +

CH 2 CH 2
+ H 2C 2
+ H

- -
COO DOŠLO K OXIDACI COO
ASPARTÁT
 Transferázy
 přenášejí různé funkční skupiny
 koenzymy:
 ATP – přenáší fosfátové skupiny
 koenzym A – vnáší acetyl (zbytek od CH3COOH) do Krebsova
cyklu
DOŠLO K PŘENOSU AMINOSKUPINY
- -
- COO COO
COO -
COO
+
+ O CH H 3N CH
H 3N CH aspartátam inotransferáza
+ O CH

CH 2
CH 2 + CH 2
CH 2
- CH 2 CH 2
COO -
COO -
-
COO COO
 Hydrolázy
 katalyzují hydrolytické štěpení substrátu (tzn. štěpení za
účasti vody)
 jejich kofaktorem nejsou často koenzymy, ale kovové
ionty

H2O DOŠLO K ROZŠTĚPENÍ VAZBY ZA ÚČASTI VODY

- -
COO COO
- +
CO NH CH COO H 3N CH
+ dipeptidasa +
H 3N CH CH 2 H 3N CH CH 2
+ H 2O +
CH 2 CH 2 CH 2 CH 2
- - - -
COO COO COO COO
Lyázy
 katalyzují štěpení nehydrolytické (bez účasti vody)
 jejich součástí jsou často koenzymy transferáz

NEHYDROLYTICKÉ ŠTĚPENÍ
-
COO
-
+ H COO
H 3N CH aspartátam inolyasa C +
CH 2 + NH4
C
-
- OOC H
COO
Ligázy (syntetázy)
 katalyzují syntézu jednoduchých molekul na složitější za
spotřeby ATP
 např. Ac-Co-A-syntetáza
 často obsahují koenzymy transferáz
 Aminoacyl-tRNA syntetáza (aaRS) umožňuje navázání
jedné z dvaceti proteinogenních AK na příslušnou
molekulu transferové RNA

aspartát-tR N A -ligasa Asp

Asp
L -A sp + tR N A + ATP L -A sp + R N A + AMP + P
Izomerázy
 katalyzují reakce uvnitř molekuly jednoho substrátu
 přesouvají tak atomy (skupiny) z jednoho atomu uhlíku na druhý
 většinou neobsahují koenzymy

DOŠLO KE ZMĚNĚ KONFIGURACE

- -
COO NA CHIRÁLNÍM CENTRU COO
+ +
H 3N C H H C NH3
aspartátacenóza

CH 2 CH 2

- -
COO COO
Katalytické jedy
 látky, které způsobují poškození enzymů
 poškození může být dvou typů:
 reversibilní (vratné) – katalytický jed se naváže a je možné jej
jistými cestami opět z enzymu odstranit
 irreversibilní (nevratné) – katalytický jed se naváže a již jej není
možné odstranit, enzym je nevratně poškozený
 katalytické jedy se naváží na enzym a znemožní
navázání substrátu (nekompetitivní inhibice)
 katalytickými jedy jsou ionty těžkých kovů jako Pb2+, či
Cd2+ nebo i další látky (např. alkohol)
METHANOL Cd2+
Pb2+