Opgave 2 Plectasin - et antimikrobielt peptid

Visse sygdomsfremkaldende bakterier har udviklet resistens mod mange forskellige typer
antibiotika, og de kan derfor være svære at bekæmpe.
Sakaldte antimikrobielle peptider kan være en mulig løsning på problemet, da de angriber
bakterierne anderledes end normale antibiotika. Plectasin er et antimikrobielt peptid, der består af
40 aminosyr er, se figur 2. I a og b.

a) b)

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu
1510
Asp Asp Met Gln Cys His Asn His Cys Lys
1L 15 20

Ser lle Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys
21 25 30

Ala Lys Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr
31 35 rm

Figur 2'1. Plectasin. a) Primærstruktur. b) Sekundær og teftiær struktur. Aminosyrernes farver er anføi1 efter hvor
hydrofobe eller hydrofile, de er. Røde aminosyrer er mest hydrofobe, og blå er mest hydrofile. Gul fbrve illustrerer
disulfidbindinger.

1. Beskriv primær-, sekundær- og tertiærskukturen af plectasin . rnddragfigur 2. t

Disulfidbindingerne i plectasin dannes ved reaktion mellem sidekæderne af to cysteinmolekyler, se

figur 2.2.

R_SH + HS_R **-_) R_S_S_R + 2H* + 2e

Figur 2.2. Dannelse af disulfidbinding ved reaktion mellem to sidekæder fra cysteinmolekyler (angivet sorn R-SH)

2. Argument6r for, at svovl oxideres i reaktionen , vist i figur 2.2 .

5
 De fleste antimikrobielle peptider virker ved at ødelægge cellemembranen. Her adskiller plectasin
sig ved fortrinsvis at forhindre dannelse af cellevæggen.

3. Giv forslag til, hvorfor det er en fordel, at plectasin fortrinsvist virker på cellevægge

Forskere har fundet frem til en rnodel for, hvordan plectasin binder sig til cellevæggen, sefigur 2.3

Plectasin
\

, His 18
t
.tt
i
N-ternrinal
a'.
*,
rGly3 il
Phe 2
i-l

l /t
rt-/\
1'
'.. .rJ \
i1 lt

\. : i.l
il

Figru 2.3. Binding af plectasin til cellevæg. Cellevæggen er blå og plectasin er grøn.
Farvekoder for atourer: N - mørkeblå, O - Lød, H - hvid og P - gul.
Tal angiver aminosyrernes placering i plectasins primærslmktur.

4. Forklar, hvilke typer bindinger der dannes, når plectasin bindes til cellevæggerl ifølge
modellen, vist i.fi gur 2, 3.

6
Plectasin stammer oprindeligt fra en svamp, men kan fremstilles i forskellige varianter, hvor nogle
af aminosyrerne er ændrede. Man har bl.a. fremstillet en variant af plectasin, som kaldes N22114.
Effekten afNZ2ll4 på hæmning af væksten af en række multiresistente bakterier blev undersøgt og
sammenlignet med det oprindelige plectasin, samt med et almindeligt antibiotikum (vancomycin),
sefigur 2.4.

Multiresistent Vancomycin Plectasin Pfectasin NZZLL4

bakteriestamme MHK, ms/L MHK, mell MHK, mell
MRSA t 32 L

MSSA T 0,5 8 t
MSSA 2 0,5 1 0,5
VRSA >64 T6 2

Figar 2.4. Antimikrobiel aktivitet af plectasin mod forskellige multiresistente bakterier. MHK står for 'mindste
hæmmende koncentration'.

5. Analys6r resultaterne,vistifigur 2.4, og wrder effekten af de to typer plectasin.