Professional Documents
Culture Documents
DOKTORA TEZİ
Canan USLAN
Kimya Programı
NİSAN 2018
İSTANBUL TEKNİK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ
DOKTORA TEZİ
Canan USLAN
(509122002)
Kimya Programı
NİSAN 2018
İTÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü’nün 509122002 numaralı Doktora Öğrencisi Canan
USLAN, ilgili yönetmeliklerin belirlediği gerekli tüm şartları yerine getirdikten sonra
hazırladığı “POLİETİLENGLİKOL SÜBSTİTÜE YENİ MAKROMOLEKÜLLERİN
SENTEZİ, FİZİKSEL VE BİYOLOJİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ”
başlıklı tezini aşağıda imzaları olan jüri önünde başarı ile sunmuştur.
iii
iv
Sevgili aileme,
v
vi
ÖNSÖZ
vii
viii
İÇİNDEKİLER
Sayfa
ix
3.7 2(3), 9(10), 16(17), 23(24)-Tetrakis[Propargil Poli(etilen glikol) Monometil
Eter 2000]ftalosiyaninatoçinko(II) Bileşiğinin (7) Sentezi (ZnPc(PEGME)4) ...... 53
3.8 2(3), 9(10), 16(17), 23(24)-Tetrakis[Propargil Poli(etilen glikol) Monometil
Eter 2000]ftalosiyaninatoindiyum(III)asetat Bileşiğinin (8) Sentezi
(InPc(PEGME)4)..................................................................................................... 54
3.9 2(3), 9(10), 16(17), 23(24)-Tetrakis[Propargil Poli(etilen glikol) Monometil
Eter 2000]ftalosiyaninatolutesyum(III)asetat Bileşiğinin (9) Sentezi
(LuPc(PEGME2000)4) ........................................................................................... 55
4. SONUÇ VE YORUMLAR .................................................................................. 57
4.1 SiPc(PEG1000)2 Bileşiğinin (2) Sentezi ve Karakterizasyonu ........................ 57
4.2 SiPc(PEG1000)2 Bileşiğinin (2) Temel Hal Elektronik Absorpsiyon Spektrumu
................................................................................................................................ 58
4.3 SiPc(PEG1000)2 Bileşiğinin (2) Floresans Ölçümleri ..................................... 61
4.4 SiPc(PEG1000)2 Bileşiğinin (2) Singlet Oksijen Kuantum Verimi ................. 64
4.5 SiPc(PEG1000)2 Bileşiğinin (2) Fotobozunma Çalışmaları............................. 67
4.6 SiPc(PEG1000)2 Bileşiğinin (2) Fotositotoksisite Çalışmaları ........................ 69
4.7 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin (7, 8, 9) Sentez ve
Karakterizasyonları................................................................................................. 70
4.8 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin (7, 8, 9) Agragasyon
Ölçümleri ................................................................................................................ 76
4.9 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Farklı Çözücülerdeki UV-
Vis Spektrumu Ölçümleri ....................................................................................... 81
4.10 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Singlet Oksijen Kuantum
Verimi () Ölçümleri ........................................................................................... 84
4.11 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Floresans Özelliklerinin
İncelenmesi ............................................................................................................. 89
4.12 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin DNA ile Etkileşimleri ... 90
4.13 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin BSA ile Etkileşimleri .. 102
4.14 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Termal Özelliklerinin
İncelenmesi ........................................................................................................... 106
4.15 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Polarize Mikroskop
Görüntüleri ........................................................................................................... 109
KAYNAKLAR ........................................................................................................ 111
EKLER ............................................................................................................. 127
ÖZGEÇMİŞ ............................................................................................................ 135
x
KISALTMALAR
xi
xii
SEMBOLLER
xiii
xiv
ÇİZELGE LİSTESİ
Sayfa
xv
xvi
ŞEKİL LİSTESİ
Sayfa
xvii
Şekil 2.32 : Tetraetilen glikol grupları ile sübstitüe edilmiş okta periferal ZnPc
bileşiği. .................................................................................................. 27
Şekil 2.33 : Trietilen glikol zincirleri içeren asimetrik ZnPc bileşiği. ....................... 27
Şekil 2.34 : Farklı zincir uzunluklarında etilen glikol monometil eter grupları içeren
tetra ve okta sübstitüte metalli ve metalsiz Pc bileşiği.......................... 28
Şekil 2.35 : PEG grupları içeren amfifilik ve dikatyonik ZnPc bileşikleri. ............... 29
Şekil 2.36 : PEG zincirleri ile monosübstitüte olmuş üç yeni ZnPc bileşiği. ............ 30
Şekil 2.37 : Farklı uzunlukta PEG zincirleri ile okta sübstitüe edilmiş metalsiz
ftalosiyanin bileşiği sentez şeması (Siklotetramerizasyon). ................. 30
Şekil 2.38 : Farklı uzunlukta PEG zincirleri ile okta sübstitüe edilmiş CuPc bileşiği
sentez şeması (‘Klik’ Kimya). .............................................................. 31
Şekil 2.39 : cis-A2B2 tipi ZnPc bileşikleri. ................................................................ 32
Şekil 2.40 : Bis-ZnPc bileşiği. ................................................................................... 32
Şekil 2.41 : Brij 58 polimerini içeren ZnPc bileşiği. ................................................. 33
Şekil 2.42 : PEG ile konjuge edilmiş simetrik ZnPc bileşiği..................................... 34
Şekil 2.43 : PEG ile konjuge edilmiş asimetrik ZnPc bileşiği. .................................. 34
Şekil 2.44 : PEG 500 grupları ile tetra sübstitüe olmuş metalsiz ve metalli Pc
bileşikleri............................................................................................... 35
Şekil 2.45 : Naftalen ve di(etilen glikol) grupları içeren Zn(II), Cu(II), Co(II) ve
Ni(II) Pc bileşikleri. .............................................................................. 36
Şekil 2.46 : Metoksipolietilen glikol türevi blok kopolimeri içeren ZnPc bileşiği. ... 37
Şekil 2.47 : Kanser hücrelerinin sağlıklı hücrelerden farklı gelişimi (Url-1). ........... 39
Şekil 2.48 : PDT’nin hastaya uygulanma şeması. ..................................................... 40
Şekil 2.49 : Bir fotoalgılayıcının ışık etkisi ile uyarılması sonucu reaktif oksijen
türlerinin oluşumu. ................................................................................ 41
Şekil 2.50 : DNA molekülünün çift sarmal yapısı ve içerdiği bazlar. ....................... 42
Şekil 2.51 : DNA molekülünün çeşitli bağlanma modelleri (de Almeida ve diğ,
2017). .................................................................................................... 43
Şekil 2.52 : DNA molekülünde interkalasyon ve oluklara bağlanma (Gattuso ve diğ,
2015). .................................................................................................... 44
Şekil 3.1 : 1 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 49
Şekil 3.2 : 2 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 50
Şekil 3.3 : 3 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 51
Şekil 3.4 : 4 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 51
Şekil 3.5 : 5 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 52
Şekil 3.6 : 6 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 53
Şekil 3.7 : 7 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 54
Şekil 3.8 : 8 bileşiğinin sentezi. ................................................................................. 55
Şekil 3.9 : 9 bileşiğinin sentezi .................................................................................. 56
Şekil 4.1 : 2 bileşiğinin UV-Vis spektrumu. .............................................................. 58
Şekil 4.2 : 2 bileşiğinin DMSO içinde farklı derişimlerdeki absorpsiyon spektrumu:
1.2x10-5, 1.0x10-5, 8x10-6, 6x10-6, 4x10-6, 2x10-6 M. ............................ 60
Şekil 4.3 : 2 bileşiğinin su içinde farklı derişimlerdeki absorpsiyon spektrumu:
1.2x10-5, 1.0x10-5, 8x10-6, 6x10-6, 4x10-6, 2x10-6 M. ............................ 60
Şekil 4.4 : 2 bileşiğinin farklı çözücülerdeki normalize absorpsiyon spektrumu
Derişim = 1.00x10-5M. .......................................................................... 61
Şekil 4.5 : 2 bileşiğinin DMSO içindeki emisyon, absorpsiyon ve eksitasyon
spektrumu (Eksitasyon dalgaboyu = 640 nm, Derişim = 1.00x10-5M. . 62
Şekil 4.6 : 2 bileşiğinin su içindeki emisyon, absorpsiyon ve eksitasyon spektrumu
(Eksitasyon dalgaboyu = 640 nm, Derişim = 1.00x10-5M. ................... 62
xviii
Şekil 4.7 : 2 bileşiğinin DMSO’daki floresans sönüm eğrisi, Derişim = 1.00x10-
5
M.......................................................................................................... 63
Şekil 4.8 : 2 bileşiğinin su içindeki floresans sönüm eğrisi, Derişim = 1.00x10-5M. 64
Şekil 4.9 : Singlet oksijen kuantum verimi ölçüm düzeneği şeması. ........................ 65
Şekil 4.10 : DMSO içindeki singlet oksijen kuantum verimi ölçümü sırasında DPBF
ve 2 bileşiğinin (Derişim = 1.00x10-5M) elektronik absorpsiyon
spektrumundaki değişiklik. ................................................................... 65
Şekil 4.11 : Su içindeki singlet oksijen kuantum verimi ölçümü sırasında ADMA ve
2 bileşiğinin (Derişim = 1.00x10-5M) elektronik absorpsiyon
spektrumundaki değişiklik. ................................................................... 66
Şekil 4.12 : 2 bileşiğinin DMSO içerisinde fotobozunma sırasında elektronik
absorbansındaki değişiklik (Derişim = 1.20x10-5M). ........................... 68
Şekil 4.13 : 2 bileşiğinin suda fotobozunma sırasında elektronik absorbansındaki
değişiklik (Derişim = 1.20x10-5M). ...................................................... 68
Şekil 4.14 : 2 bileşiğinin farklı derişimlerde (0, 0.25, 0.50, 1, 2 ve 3 µM) HeLa ve
HuH-7 tümör hücreleri ile 24 saat inkübe edildikten sonra 2 J/cm2 ışığa
maruz bırakılması sonucu gösterdiği fototoksisite. .............................. 70
Şekil 4.15 : 6 bileşiğinin FT-IR spektrumu. .............................................................. 71
Şekil 4.16 : 7 bileşiğinin FT-IR spektrumu. .............................................................. 72
Şekil 4.17 : 7 bileşiğinin UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ....................................... 73
Şekil 4.18 : 8 bileşiğinin FT-IR spektrumu. .............................................................. 74
Şekil 4.19 : 8 bileşiğinin UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ....................................... 74
Şekil 4.20 : 9 bileşiğinin FT-IR spektrumu. .............................................................. 75
Şekil 4.21 : 9 bileşiğinin UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ....................................... 76
Şekil 4.22 : 7 bileşiğinin DMSO içerisinde farklı derişimlerdeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu: 1x10-5 M, 8.0x10-6 M, 6x10-6 M, 4x10-6 M, 2x10-6 M, 1x10-
6
M......................................................................................................... 77
Şekil 4.23 : 7 bileşiğinin su içerisinde farklı derişimlerdeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu: 1x10-5 M, 8.0x10-6 M, 6x10-6 M, 4x10-6 M, 2x10-6 M, 1x10-6
M. .......................................................................................................... 77
Şekil 4.24 : 8 bileşiğinin DMSO içerisinde farklı derişimlerdeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu: 1x10-5 M, 8.0x10-6 M, 6x10-6 M, 4x10-6 M, 2x10-6 M, 1x10-
6
M......................................................................................................... 78
Şekil 4.25 : 8 bileşiğinin su içerisinde farklı derişimlerdeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu: 1x10-5 M, 8.0x10-6 M, 6x10-6 M, 4x10-6 M, 2x10-6 M, 1x10-
6
M......................................................................................................... 79
Şekil 4.26 : 9 bileşiğinin DMSO içerisinde farklı derişimlerdeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu: 1x10-5 M, 8.0x10-6 M, 6x10-6 M, 4x10-6 M, 2x10-6 M, 1x10-
6
M......................................................................................................... 80
Şekil 4.27 : 9 bileşiğinin su içerisinde farklı derişimlerdeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu: 1x10-5 M, 8.0x10-6 M, 6x10-6 M, 4x10-6 M, 2x10-6 M, 1x10-
6
M......................................................................................................... 81
Şekil 4.28 : 7 bileşiğinin farklı çözücüler içerisindeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu (Derişim = 7.5x10-6M). ....................................................... 82
Şekil 4.29 : 8 bileşiğinin farklı çözücüler içerisindeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu (Derişim = 7.5x10-6M). ....................................................... 83
Şekil 4.30 : 9 bileşiğinin farklı çözücüler içerisindeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu (Derişim = 7.5x10-6M). ....................................................... 84
Şekil 4.31 : 7 bileşiğinin DMSO içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne
ait UV-Vis absorpsiyon spektrumu....................................................... 86
xix
Şekil 4.32 : 8 bileşiğinin DMSO içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne
ait UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ...................................................... 86
Şekil 4.33 : 9 bileşiğinin DMSO içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne
ait UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ...................................................... 87
Şekil 4.34 : 7 bileşiğinin su içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne ait
UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ........................................................... 87
Şekil 4.35 : 8 bileşiğinin su içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne ait
UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ........................................................... 88
Şekil 4.36 : 9 bileşiğinin su içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne ait
UV-Vis absorpsiyon spektrumu. ........................................................... 88
Şekil 4.37 : 7 bileşiğinin DMSO içerisinde alınan absorpsiyon, emisyon ve
eksitasyon spektrumu. ........................................................................... 89
Şekil 4.38 : 7 bileşiğinin DMSO içerisinde alınan floresans ömür spektrumu.......... 90
Şekil 4.39 : 7 bileşiğinin CT-DNA ile titreşimini gösteren UV-Vis absorpsiyon
spektrumu. ............................................................................................. 91
Şekil 4.40 : 8 bileşiğinin CT-DNA ile titreşimini gösteren UV-Vis absorpsiyon
spektrumu. ............................................................................................. 91
Şekil 4.41 : 9 bileşiğinin CT-DNA ile titreşimini gösteren UV-Vis absorpsiyon
spektrumu. ............................................................................................. 92
Şekil 4.42 : 7 bileşiğinin ilavesi sonucu DNA-SYBR kompleksinin floresans
emisyonundaki artış. ............................................................................. 94
Şekil 4.43 : 7 bileşiğinin varlığında CT-DNA’nın termal bozunma sıcaklığının
değişim profilinin UV-Vis spektrumu ile incelenmesi. ........................ 95
Şekil 4.44 : 8 bileşiğinin varlığında CT-DNA’nın termal bozunma sıcaklığının
değişim profilinin UV-Vis spektrumu ile incelenmesi. ........................ 95
Şekil 4.45 : 9 bileşiğinin varlığında CT-DNA’nın termal bozunma sıcaklığının
değişim profilinin UV-Vis spektrumu ile incelenmesi. ........................ 96
Şekil 4.46 : 7, 8 ve 9 bileşikleri varlığında CT-DNA’nın termal bozunma eğrileri .. 97
Şekil 4.47 : DNA’nın molekül içi düzenlenmesi sonucunda oluşan motifler (Maiti ve
diğ, 2011). ............................................................................................. 97
Şekil 4.48 : DNA’nın farklı motiflerinin erime eğrileri (Maiti ve diğ, 2011). .......... 98
Şekil 4.49 : Proteinlerdeki iyonik ve hidrofobik etkileşimler (Url-2). .................... 100
Şekil 4.50 : 7, 8 ve 9 bileşiklerinin van’t hoff grafikleri. ........................................ 101
Şekil 4.51 : 7 bileşiğinin ilavesiyle BSA’nın floresans emisyon spektrumundaki
değişikliklerin incelenmesi . ............................................................... 103
Şekil 4.52 : 8 bileşiğinin ilavesiyle BSA’nın floresans emisyon spektrumundaki
değişikliklerin incelenmesi. ................................................................ 103
Şekil 4.53 : 9 bileşiğinin ilavesiyle BSA’nın floresans emisyon spektrumundaki
değişikliklerin incelenmesi. ................................................................ 104
Şekil 4.54 : 7, 8 ve 9 bileşiklerine ait Stern-Volmer sabitlerini veren eğim
çizgileri..... .......................................................................................... 104
Şekil 4.55 : 7, 8 ve 9 bileşiklerinin BSA ile etkileşimine göre bağlanma sabitleri (kb)
ve bağlanma sayılarını (n) veren eğriler. ............................................ 105
Şekil 4.56 : 6 bileşiğinin DSC grafiği. ..................................................................... 106
Şekil 4.57 : 7 bileşiğinin DSC grafiği. ..................................................................... 107
Şekil 4.58 : 8 bileşiğinin DSC grafiği. ..................................................................... 107
Şekil 4.59 : 9 bileşiğinin DSC grafiği. ..................................................................... 108
Şekil 4.60 : 6, 7, 8 ve 9 bileşiklerinin TGA grafiği. ................................................ 108
Şekil 4.61 : 7 bileşiğinin polarize optik mikroskop görüntüleri. ............................. 109
Şekil 4.62 : 8 bileşiğinin polarize optik mikroskop görüntüsü. ............................... 109
xx
Şekil 4.63 : 9 bileşiğinin polarize optik mikroskop görüntüsü. ............................... 110
Şekil A.1 : 2 bileşiğinin 1H-NMR Spektrumu ......................................................... 128
Şekil A.2 : 7 bileşiğine ait 1H-NMR Spektrumu ..................................................... 129
Şekil A.3 : 8 bileşiğine ait 1H-NMR Spektrumu ..................................................... 130
Şekil A.4 : 9 bileşiğine ait 1H-NMR Spektrumu ..................................................... 131
Şekil A.5 : 7 bileşiğinin LC-MS Spektrumu ........................................................... 132
Şekil A.6 : 8 bileşiğinin LC-MS Spektrumu ........................................................... 133
Şekil A.7 : 9 bileşiğinin LC-MS Spektrumu ........................................................... 134
xxi
xxii
POLİETİLENGLİKOL SÜBSTİTÜE YENİ MAKROMOLEKÜLLERİN
SENTEZİ, FİZİKSEL VE BİYOLOJİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ
ÖZET
xxiii
Medikal uygulamalar için ftalosiyaninlerin biyolojik özelliklerinin belirlenmesi de
birçok açıdan önemlidir. Bu amaçla ftalosiyaninlerin DNA (deoksiribonükleik asit) ve
BSA (bovin serum albumin) gibi biyolojik materyaller ile olan etkileşimi çeşitli
araştırmalarla incelenmiştir. Bu gibi biyolojik moleküllerle kolay etkileşim gösteren
kimyasal gruplarla sübstitüe edilmiş ftalosiyanin molekülleri ile yapılan araştırmalarda
alınan sonuçlar oldukça başarılıdır. Poli(etilen glikol) (PEG) türevleri bu anlamda en
iyi sonuç veren sübsititüentlerden olmuştur. Hem fiziksel hem de biyolojik
uygulamalarda kullanılabilir ftalosiyanin bileşiklerinin organik çözücülerin yanında
suda da çözünebilir olması gerekmektedir.
Literatürde farklı uzunlukta poli(etilen glikol) türevleri ile eksenel veya periferal
konumlardan sübstitüe edilmiş Pc örnekleri mevcuttur. Ancak zincir uzunluğu
1000’den düşük olan poli(etilen glikol) grupları yerine genellikle poli(etilen glikol)
metil eter’in kullanıldığı Pc bileşiklerinin sentezlendiği görülmüştür. Literatürdeki
çalışmaların çoğunda elde edilen PEG sübstitüe Pc bileşiklerinin hem fiziksel hem de
biyolojik özelliklerinin birlikte araştırıldığı çalışmaların sayısı daha azdır.
Dolayısıyla bu tez çalışmasının ilk kısmında hem iki ucunda OH grubu olan hem de
zincir uzunluğu ortalama 1000 olan poli(etilen glikol) seçilmiştir. Bu maddeyi
benzerlerinden ayıran en önemli özellik her iki ucunda serbest OH gruplarının
bulunmasıdır. Çünkü serbest OH fonksiyonel grupları birbirleriyle reaksiyona girerek
dimer, trimer veya daha büyük oligomer yapılar oluşturabileceği için sentezin
polimerleşme olmadan durdurulabilmesi ancak optimum şartların sağlanmasıyla
mümkün olmuştur. Bu şartlar çok fazla sayıda deneme yapılarak bulunmuştur.
Bu tez kapsamında, öncelikle hidroksil fonksiyonel grupları ile sonlanmış, ortalama
molekül kütlesi 1000 olan poli(etilen glikol) blokları (PEG1000) ile silisyum(IV)
ftalosiyanin diklorür bileşiği arasında gerçekleşen kondenzasyon reaksiyonu ile
eksenel konumlardan sübstitüe olmuş silisyum ftalosiyanin bileşiğinin
(SiPc(PEG1000)2) (2) sentezi gerçekleştirilmiştir. Suda yüksek çözünürlük gösteren
yeni ftalosiyanin molekülü 1H-NMR, FT-IR ve UV-Vis spektrofotometri yöntemleri
kullanılarak karakterize edilmiştir. Molekülün yapısal tayininde elementel analiz
verileri de belirleyici olmuştur. Buna göre, (O-CH2-CH2) ünitelerinin toplam sayısı 44
olarak hesaplanmış, 1H-NMR spektrumundan elde edilen integral alanlar ile SiPc ve
PEG1000 arasındaki oran 1:2 olarak belirlenmiştir. 2 no’lu bileşiğin floresans kuantum
verimi, floresans ömrü, singlet oksijen kuantum verimi ve fotobozunma kuantum
verimi gibi fotofiziksel ve fotokimyasal özellikleri hem DMSO hem de su içerisinde
incelenmiştir. Literatürde sentezlenen analoglarına göre, daha uzun zincir ve iki
ucunda OH fonksiyonel grubu içeren yeni Pc bileşiği, içerdiği bu uzun zincirlerden
dolayı agregasyunu minimum seviyede tutmuş, bu da singlet oksijen veriminin artışına
olanak sağlamıştır. Bunun dışında 2 no’lu bileşiğin, HeLa ve HuH tümör hücrelerine
karşı gösterdiği fotositotoksisite araştırılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre, HeLa
tümör hücrelerinin, HuH hücrelerine göre, 2 no’lu bileşikle PDT tedavisine daha iyi
yanıt verdiği görülmüştür. Tüm fiziksel ve biyolojik ölçüm sonuçları göz önüne
alındığında, SiPc(PEG1000)2 bileşiğinin (2), PDT için iyi bir potansiyel fotoalgılayıcı
madde olabileceği görülmüştür.
Tezin ikinci kısmında olarak ise, ortalama molekül kütlesi 2000 olan poli(etilen
glikol) metil eter (PEGME2000) blokları ile periferal konumlardan tetra-sübstitüe
edilmiş çinko (Zn), indiyum (In(III)) asetat ve lutesyum (Lu(III)) asetat içeren yeni Pc
moleküllerinin sentezleri hedeflenmiştir. Bu amaçla öncelikle, bu metal iyonlarını
içeren tetraiyodo ftalosiyaninlerin sentezi siklotetramerizasyon ile iyodoftalonitril
xxiv
molekülünden yola çıkılarak gerçekleştirilmiştir. Tetraiyodo-çinko(II) ftalosiyanin
(3), Tetraiyodo-indiyum(III) asetat ftalosiyanin (4) ve tetraiyodo-lutesyum(III) asetat
ftalosiyanin (5) bileşikleri elde edildikten sonra, Sonogashira Kenetlenme Reaksiyonu
yardımı ile bu Pc bileşiklerinin periferal konumları, propargil fonksiyonel grubu ile
sonlanan PEGME2000 bileşiği (6) ile tetra-sübstitüe edilmiştir. Elde edilen yeni Pc
molekülleri, ZnPc(PEGME2000)4 (7), InPc(PEGME2000)4 (8) ve
LuPc(PEGME2000)4 (9), H-NMR, FT-IR, UV-Vis spektrofotometri yöntemleri
1
xxv
xxvi
THE SYNTHESIS OF POLYETHYLENEGLYCOL SUBSTITUTED NEW
MACROMOLECULES AND INVESTIGATION OF THEIR PHYSICAL AND
BIOLOGICAL PROPERTIES
SUMMARY
xxvii
external orbitals. These electrons are at the minimum energy level when their spins are
in the same direction and in different orbitals. Singlet oxygen, on the contrary to
molecular oxygen, has two electrons whose spins are opposite to each other and these
electrons have higher energy and shorter lifespan than electrons in the ground state.
The reactivity of singlet oxygen is quite high so it causes a destruction of existing
tumorous tissue. Photodegradations of the Pc molecules are also important for medical
applications. Changes in the intensity of characteristic absorption bands because of the
light are followed by taking UV-Vis spectrum for the photodegradation studies of the
Pcs.
It is also important in many respects to determine the biological properties of
phthalocyanines for medical applications. Unless some modifications are made, Pcs
have some disadvantages resulting from their natural planar structure, which increases
the limitations in biologicals applications. Aggregation and insolubility phenomena
are the most important restrictions on the use of Pcs in many applications. The water
solubility of Pc molecules plays a decisive role in biomedical research. Phthalocyanine
compounds have to be soluble in water as well as organic solvents for physical and
biological applications. The results of studies on Pc molecules substituted with
chemical groups that interact easily with biological molecules are quite successful. For
this purpose, the interaction of Pcs with biological materials such as DNA
(deoxyribonucleic acid) and BSA (bovine serum albumin) has been investigated in
various searches. Among the Pc compounds that have been gained solubility in water
with the help of different methods, Pcs substituted with poly(ethylene glycol) (PEG)
derivatives are the most important molecules in medical practices in terms of their
water solubility and biocompatibility. Poly(ethylene glycol) (PEG) blocks are among
the best yielding substituents in this sense.
There are examples of Pcs substituted at axial or peripheral positions with different
lengths of PEG derivatives in the literature. It has been observed that Pc compounds
susbstituted with PEG blocks having a chain length of less than 1000 are synthesized
with PEGME blocks with smaller chains. In the majority of publications, the studies
that include the investigations of both physical and biological properties of PEG
substituted Pcs are not explored extensively. In the first part of this thesis, a novel
poly(ethylene glycol)-conjugated silicon phthalocyanine (2) axially substituted with
long PEG chains (average molecular weight is 1000) was synthesized by the
condensation reaction between poly(ethylene glycol) blocks bearing hydroxyl
functional units at both ends and silicon phthalocyanine dichloride.
Therefore, in this study, PEG blocks with an average molecular weight of 1000 bearing
OH groups at both ends was selected. The most important feature distinguishing this
substance from its analogues is the presence of free OH groups at both ends. Because
free OH functional groups can react with each other to form dimer, trimer or larger
oligomeric structures. Thus, the reaction conditions should be optimized to obtain the
expected product as well as to stop the polimerization at the same time. These
conditions have been found with so many trials.
The chemical structure of the novel compound (2) was characterized by 1H-NMR, FT-
IR and UV-Vis spectrophotometric methods. Elemental analysis data were also use to
approve the number of PEG groups that are exist in the structure. According to the 1H-
NMR analysis result of novel PEG-conjugate silicon phthalocyanine, the peaks
observed between 8.45 and 9.67 ppm are attributed to the peripheral hydrogen atoms
on the Pc core. Signals belonging to the CH2 protons were perceived at a high field
xxviii
between 0.28–0.34 ppm for Si–O–CH2 because of magnetic anisotropy of the localized
18 π electrons in the Pc structure. The total number of ethylene glycol units was found
as 44 which gives the ratio of silicon Pc and PEG1000 units as 1:2. As a result, apart
from the other examples of PEG-substituted silicon phthalocyanine compounds in the
literature, the novel silicon phthalocyanine engaged with two PEG 1000 blocks was
accomplished successfully.
The most important purpose of this study was to obtain the compound with the
property of high water solubility. Incorporation of long-chain PEG units into Pc core
increased water solubility due to the high hydrophilicity of the terminated OH
functional groups on the main polymer backbone. The photophysical and
photochemical properties of the novel compound such as fluorescence quantum yield,
fluorescence lifetime, singlet oxygen quantum yield and photodegradation quantum
yield were determined in both DMSO and water. According to analogues of the new
compounds reported previously in the literature, the superiority of the new Pc
compound over the previous ones is to have longer PEG blocks having OH at both
ends. These axially substituted PEGME blocks decreased the aggregation to a
minimum level which allowed high the singlet oxygen quantum yield.
For biological studies, the photocytotoxicity of the compound against HeLa and HuH
tumor cells was investigated. The results showed that HeLa cells are more responsive
to PDT application.
Considering all the physical and biological measurements, it has been found that the
new silicon phthalocyanine compound may be a good potential photosensitizer for
PDT.
The second scope of this thesis focused on the synthesis of novel Pc molecules
containing zinc, indium and lutetium metal ions which are substituted with
poly(ethylene glycol) methyl ether (PEGME) blocks having an average molecular
mass of 2000, peripherally. For this purpose, the tetraiodo-substituted
metallophthalocyanines were prepared by the treatment of iodophthalonitrile
derivatives with anhydrous zinc, indium and lutetium acetate salts in the presence of
DBU. After obtaining of tetraiodo-zinc(II) phthalocyanine (3), tetraiodo-indium(III)
acetate phthalocyanine (4) and tetraiodo-lutetium(III) acetate phthalocyanine (5),
PEGME2000 tetra-substituted derivatives of them on the peripheral positions were
obtained via Sonogashira Coupling Reaction with quite high yields. PEGME2000
blocks were firstly treated with propargyl bromide which correspond to compound 6.
Then these PEGME2000-propargyl derivative (6) reacted with compounds 3, 4, 5 to
yield ZnPc(PEGME2000)4 (7), InPc(PEGME2000)4 (8), LuPc(PEGME2000)4 (9)
respectively.
Novel tetra-substituted Pc compounds were characterized by 1H-NMR, FT-IR and
UV-Vis spectrophotometric methods. These new macromolecules show high
solubility in water and most of organic solvents.
The photophysical and the photochemical properties of the compounds were
investigated in both DMSO and water. Because of the heavy atom effect of indium
and lutetium elements, the fluorescence quantum yields of the 8 and 9 could not be
measured.
The biological properties of the compounds were determined by examining the
interactions of molecules with biological molecules such as DNA and BSA. The
solutions of molecules in water were titrated with the solution of CT-DNA and the
xxix
changes in the Q bands were observed on UV-Vis spectrophotometer. To determine
the effects of these molecules on the denaturation of double-strand DNA structure, the
changes in absorptions at certain temperatures have been examined by using UV-vis
spectra. Thermodynamic parameters were also used to clarify the types of binding
modes.
As a result, the fact that three new Pc molecules substituted with PEGME2000 blocks
with high reaction yields did not show aggregation in water and DMSO which was
proved with whose graphics fit the Lambert-Beer law. The singlet oxygen quantum
yields were found to be higher when compared to the reference materials. They were
found to be stable when exposed to light during time intervals used during the
measurements, ie they did not degrade. The interactions with BSA and DNA have been
demonstrated using UV-vis, fluorescence spectra, thermal denaturation plots and
thermodynamic parameters (enthalpy, entropy and Gibbs free energy). New Pc
compounds bound to DNA with hydrophobic interactions via PEG blocks non-
specifically and spontaneously. All thermodynamic parameters together with thermal
denaturation values and Pc-DNA binding constants proved that the lutetium and
indium-acetate pcs have higher binding ability than the zinc derivative.
These properties of new compounds have been shown to be promising for medical
applications.
xxx
1. GİRİŞ
Tezin ikinci aşmasında ise, bu defa farkıl metal atomları içeren Pc halkasının periferal
konumlarına tetra-sübstitüe olacak şekilde, türevlendirilmiş PEG grupları,
Sonogashira Kenetlenme Reaksiyonu yardımıyla bağlanmıştır. Yeni Pc bileşikleri
oldukça yüksek reaksiyon verimleri ile elde edilmiştir. Yeni Pc bileşiklerinin
fotokimyasal ve fotofiziksel özelliklerinin yanısıra, DNA ve BSA gibi biyolojik
moleküllerle olan etkileşimleri de incelenmiştir.
1
2
2. GENEL BİLGİLER
3
Şekil 2.2 : Dimerik etilen süksinat bileşiği.
4
Makrosiklik ligantlar sahip oldukları iki benzersiz özellik nedeniyle bu derece yaygın
ve yoğun ilgi görmüşlerdir; 1) metal iyonu yarıçapına göre birbirine yakın olan metal
iyonları arasında ayrım yapabilme (halka boyutu etkisi), 2) açık zincirli analoglarına
göre kıyaslandığında gösterdikleri yüksek kompleks kararlılık sabitleri (makrosiklik
etki) (Chandra ve Gupta, 2002). Genel olarak makrosiklik bileşiklerin oluşumu,
merkezde bulunan boşluğun boyutuna, makrohalkanın rijitliğine, yapıda olan donör
atomların doğasına ve koordinasyonda yer alan anyonun kompleks oluşturma
özelliklerine doğrudan bağlıdır (Newkome ve diğ, 1977). Bu bileşiklerin sentezinde
dört temel yaklaşım izlenmektedir: a) geleneksel organik sentez, b) uygun metal
iyonunun varlığı ile halkalaşmanın gerçekleştirilmesi (kalıp etkisi), c) bu iki yöntem
ile elde edilen bileşiğin modifikasyonu, d) yüksek seyreltme tekniği. Birçok durumda
organik makromolekülün elde edilmesinde belirli avantajlar söz konusudur. Organik
ürünün saflaştırılması, komplekslerin saflaştırılmasına göre daha kolay olabilir ve
fiziksel bir takım yöntemler ile karakterizasyon daha kolay gerçekleştirilebilir. Buna
karşın, organik makromoleküller genelde düşük reaksiyon verimlerine sahiptir ve
sentez süresince bir takım yan reaksiyonlar gerçekleşebilir. Sentez aşamasındaki halka
kapanma basmağı, yüksek seyreltme koşulları altında gerçekleştirilerek veya açık
zincirli başlangıç moleküllerinde rotasyonu engellemek için daha rijit bir grup ilavesi
yapılarak bu problemin üstesinden gelmek mümkün olabilmektedir (Ziegler ve diğ,
1933; Shaw, 1975). Makrosiklik komplekslerin sentezi için en etkili yöntemlerden biri,
in-situ yaklaşımı olarak tanımlanan, metal iyonunun varlığıyla halkalaşma
reaksiyonunun veriminin önemli ölçüde arttırıldığı yöntemdir. Bu yöntemde, metal
iyonu, kondenzasyon tepkimesini, polimerik ürünlerin oluşumuna yol açacak
tepkimlerden ziyade halkalaşmaya doğru ilerleterek tepkimenin sterik seyrinin
yönlendirilmesinde önemli bir rol oynar (metal kalıp etkisi) (Lindoy ve Busch, 1971).
Katyon ve anyonun boyutları arasındaki denge, reaksiyon ortamındaki metal tuzunun
ayrılma derecesini belirlediğinden, metal iyonu ve anyon kalıp işlemi için önemlidir
(Rest ve diğ, 1976).
Pirol yapısı, C4H4NH formülü ile gösterilen, beş üyeli aromatik heterosiklik bir
organik bileşiktir (Şekil 2.5). Doğada örnekleri görülen çok sayıda pirol türevi vardır.
Doğada varolmasının yanısıra sentetik olarak da elde edilen porfirinler ve tamamen
5
sentetik yöntemler kullanılarak elde edilen ftalosiyaninler, tetrapirol türevi
makrosiklik bileşiklere örnektir. Bu moleküller, merkezlerinde yer alan boşluğa alkali
ve toprak alkali metal iyonlarını koordine ederek çok kararlı katılma bileşikleri
oluşturabilen ligantlardır.
2.2.1 Porfirinler
Porfirinler, 4 tane pirol grubunun metilen köprüleri ile birbirine bağlanması sonucu
oluşan makroyapılı aromatik moleküllerdir (Şekil 2.6).
Bakır, demir, magnezyum, cobalt, çinko gibi metallerle koordinasyon yapmış halde
çok sayıda metalloporfirin yapısı doğada bulunmaktadır. Hemoglobin, miyoglobin,
sitokrom oksidaz yapısında demir bulunduran porfirinlere, klorofil ise yapısında
magnezyum olan porfirine örnektir. Basit yapılı porfirinler, 400 nm civarında kuvvetli
6
absorpsiyon bantları vermelerine karşın, yakın IR bölgede gösterdikleri absorpsiyonlar
zayıftır (Rajora ve diğ, 2017).
2.2.2 Klorinler
7
Genellikle porfirin türevlerinden yola çıkılarak sentezleri yapılmıştır. Klorinler,
elektromanyetik spektrumun ~380-450 nm aralığında güçlü absorpsiyon yaparlar.
~600-700 nm aralığında yaptıkları absorpsiyon ise buna göre daha azdır.
2.2.3 Tetrabenzoporfirinler
2.2.4 Porfirazinler
8
Azot atomlarının metilen gruplarının yerini almasıyla makrohalka yapısının elektronik
karakterinde, dolayısıyla da fizikokimyasal özelliklerinde değişiklikler gözlenir.
Porfirinlerin UV-vis spektrumlarında, 300-400 nm aralığında gözlemlenen Soret bandı
karakteristik iken, sübstitüe olmayan porfirazinlerde buna ek olarak 530-620 nm
aralığında gözlenen Q bandları da karakterizasyona etki eder (Rodriguez-Morgade ve
Stuzhin, 2004).
2.2.5 Ftalosiyaninler
Ftalosiyanin bileşiği, ilk olarak 1900’lü yılların başında tesadüf eseri elde
edilmesinden sonra yapsının tam olarak aydınlatılmasıyla birlikte önemli bir
makromolekül grubu olarak birçok alanda kullanılır olmuştur (Leznoff ve Lever,
1996). Ftalosiyaninler, dört izoindol biriminin 1,3-konumlarından aza köprüleri ile
bağlanması sonucu oluşan 18 π-elektronlu düzlemsel yapıdaki sentetik makrosiklik
bileşiklerdir (Şekil 2.11).
9
ftalosiyanin halkasına entegre edilmesinde, bu geleneksel yöntemden farklı olarak,
katalizörler eşliğinde yürütülen bazı organik reaksiyonlardan da faydalanılmaktadır.
Sentezlenen ftalosiyanin bileşiklerinin yapısal çeşitlilik kazanmasına sübstitüentlerden
başka, halka yapılarının merkezindeki boşluğa çok sayıda metal atomunun
yerleşebilmesi de katkı yapmaktadır.
10
Ftalosiyaninlerde agregasyon kavramı, çözünebilir özellikte ftalosiyaninlerin
sentezlenmesi ve bu bileşiklerin spektroskopik çalışmalarının yapılmasıyla incelenir
hale gelmiştir. Eşsiz simetri özellikleri, metal kompleksleri oluşturmaları, görünür
bölgede kendilerine has elektronik absorpsiyon özelliklerinden dolayı ftalosiyaninler,
agregasyon çalışmalarında önemli yer tutmuştur. Yapısal özelliklerindeki
değişikliklerin (nötral veya katyonik oluşu, koordinasyon türü, periferal
sübstitüentlerin sayısı) agregasyona önemli etkiler yaptığı bilinmektedir (Snow, 2012).
11
değişen özellikler olarak tanımlanabilir. Bir ftalosiyanin molekülü, ultraviyole veya
görünür bölge ışığını absorpladığında, düşük enerjili dolu orbitaldeki bir elektron
yüksek enerjili boş orbitale uyarılmış olur. Uyarılmış elektronik hallerden biri,
elektron spinlerinin spin manyetik momenti olmaksızın, anti parallel olduğu en düşük
uyarılmış singlet haldir (S1). Diğeri ise, elektron spinlerinin paralel olduğu ve
dolayısıyla net bir spin manyetik momentin varolduğu en düşük uyarılmış triplet haldir
(T1). Bu uyarılmış hal enerjileri, kararlı-hal elektronik absorpsiyon ve luminesans
spektrumları ile ölçülür. Ftalosiyanin moleküllerine ait uyarılmış hal enerji diyagramı
ve bozunma kinetikleri Şekil 2.14’te görülmektedir.
12
- İç dönüşüm, IC (S1 S0 + ısı) olarak adlandırılan aynı spinli haller arasındaki
‘izinli’ geçişler, kIC hız sabiti ile karakterize edilir.
- Sistemler arası geçiş, ISC (S1 T1 + ısı, T1 S0 + ısı) olarak adlandırılan
triplet ve singlet haller arasındaki ‘yasaklı’ geçişler, kISC (kISC’) hız sabiti ile
karakterize edilir.
S1 ve T1 hallerindeki fotofiziksel dinamikler, uyarılmış hal ömürleri (τS, τF, τT, τP)
luminesans verimleri (ФF, ФP) triplet verimi (ФT) gibi gözlemlenebilir parametreler
kullanılarak karakterize edilir.
τS = τF = 1 / (kF + kIC + kISC)
τT = τP = 1 / (kP + kISC’)
ФF = kF / (kF + kIC + kISC)
ФT = kISC / (kF + kIC + kISC)
ФP = ФT × kP (kP + kISC’)
Luminesans verimleri (ФF, ФP) kararlı-hal luminesans ölçümleri ile belirlenir.
Uyarılmış-hal ömürleri (τS, τF, τT, τP), yoğun bir ışık şiddetinin çok hızlı bir şekilde
ftalosiyanin molekülü ile etkileştirilip sonrasında elektronik absorpsiyon ve
luminesans sinyallerinin zamanla değişim analizinin yapıldığı zaman-çözümlemeli
spektroskopi ile ölçülür. S1 halin ömrü, τS (= τF ), S1 halinden daha yüksek enerjili Sn
haline veya S1 halinden S0 haline geçiş olan floresans prosesinin zaman değişimli
geçici absorpsiyonu ile belirlenir. Benzer bir yöntemle, T1 halin ömrü, τT (=τP), T1
halinden daha yüksek enerjili Tn haline geçiş olan T-T absorpsiyonunun veya T1
halinden S0 haline geçiş olan fosforesans prosesinin zaman-çözümlemeli ölçümleri ile
elde edilir.
Floresans özellik gösteren maddeler arasında kıyas yapabilmek için kullanılan en
önemli parametrelerden biri floresans kuantum verimidir (ФF). Deneysel bir
çalışmada, ilk olarak floresans prosesinin sinyali, uyarılma dalgaboyu (λex) ile
belirlenir. Uyarılma gerçekleştikten sonra, molekül, uyarılmış halde ortalama olarak
kaldığı süre boyunca belirli bir yoğunluk dağılımı ile karakteristik spektrumunu verir.
Bu zaman periyodu, belirlenen deney koşullarında, söz konusu molekül için
karakteristik olup, floresans ömür, τF, olarak ifade edilir. ФF ise absorbe edilen
fotonların, yayılan fotonlara dönüşüm veriminin doğrudan ölçümüdür (Würth ve diğ,
2013; Rurack ve Spieles, 2011). Floresans kuantum verimini hesaplamak için en
yaygın kullanılan yöntemde, analizi yapılmak istenen numune, aynı şartlar altında,
geleneksel florometrik ölçümler ile floresans kuantum verimi belirlenmiş referans bir
13
numuneye karşı ölçülür ve floresanas kuantum verimi denklem 2.1’de verilen formül
ile hesaplanır.
F. Astd . n2
ФF = Фstd
F × (2.1)
Fstd . A. n2std
ФF = Numunenin ölçümde kullanılan çözücüdeki floresans kuantum verimi
Фstd
F = Referans maddenin floresans kuantum verimi
14
Şekil 2.15 : O2 molekülünün elektronik konfigürasyonları.
Ftalosiyaninlerin singlet oksijen kuantum verimlerini hesaplamak için, suda veya diğer
organik çözücülerde, içerisinde singlet oksijeni söndürücü etki gösterecek kimyasal
bileşiğin çözeltisini de içerecek şekilde hazırlanan çözeltileri kullanılır. Bu çözeltiler,
ışık ile etkileştirilerek, kimyasal söndürücü etki gösteren bileşiğin spektral
özelliklerinin takibi yapılır. Analizi yapılmak istenen madde, aynı şartlar altında,
singlet oksijen kuantum verimi belirlenmiş olan referans bir numuneye karşı ölçülür
ve singlet oksijen kuantum verimi denklem 2.2’de verilen formül ile hesaplanır.
𝑠𝑡𝑑
R . 𝐼𝑎𝑏𝑠
Ф∆ = Ф∆𝑠𝑡𝑑 × 𝑠𝑡𝑑 (2.2)
R . I𝑎𝑏𝑠
ФΔ = Numunenin singlet oksijen kuantum verimi
Ф∆𝑠𝑡𝑑 = Referans maddenin singlet oksijen kuantum verimi
R = Sönümleyici bileşiğinin numune varlığında fotosönümleme oranı sabiti
Rstd = Sönümleyici bileşiğin referans madde varlığında fotosönümleme oranı sabiti
Iabs = Numune tarafından absorplanan ışık miktarı
𝑠𝑡𝑑
I𝑎𝑏𝑠 = Referans madde tarafından absorplanan ışık miktarı
Fotobozunma (fotodegradasyon), ftalosiyaninlerin özellikle fotokatalizör olarak
kullanıldıkları uygulamalarda, fotokararlılıklarının belirlenmesi açısından önemli olan
bir fotokimyasal özelliktir. Maddenin ışığa maruz kalmasıyla, Q ve B bantlarının
yoğunluklarında gözlenen azalma ile karakterize edilir. Bu prosese ilişkin sayısal
sonuca denklem 2.3’te verilen formül ile fotobozunma kuantum verimi (Фd) değeri
hesaplanarak ulaşılabilmektedir.
(𝐶0 − 𝐶𝑡 ). 𝑉. 𝑁𝐴
Ф𝑑 = (2.3)
𝐼𝑎𝑏𝑠 . 𝑆. 𝑡
15
Фd = Numunenin fotobozunma kuantum verimi
C0 = Numunenin ışık etkisinden önceki konsantrasyonu
Ct = Numunenin ışık etkisinden sonraki konsantrasyonu
V = Çözeltinin hacmi
NA = Avogadro sayısı
t = Işığın etki süresi
S = Ölçümde kullanılan küvet hacmi
Iabs = Işık şiddeti
16
sentezlenebilmektedir. Bu yöntemle sentezlenen ftalosiyaninlerde, ftalosiyanin
çekirdeği, monomer olarak, polimerik yapıdaki tekrar eden grupları oluşturmaktadır.
Bu yapılar yüksek derecede π-konjugasyonuna sahip olduklarından, son derece iyi
iletken malzemeler olarak davranmaktadırlar. Düşük molekül kütleli
ftalosiyaninlerinin saflaştırılmasında temel kromatografik yöntemler oldukça verimli
sonuçlar verirken, polimerik yapıda olan bu ftalosiyaninlerin organik çözücülerdeki
çözünürlükleri oldukça düşük olduğundan veya çözünür olmadıklarından, son ürünü,
reaksiyona girmeyen monomerlerden, ara reaksiyon ürünlerinden, metal tuzlarından
veya yan ürünlerden ayırmak, klasik kromatografi teknikleri ile mümkün
olmamaktadır.
Sütçüler ve diğ. (2017) polistiren grubu içeren asimetrik yapılı, THF’te agregasyon
göstermeyen çinko ftalosiyanin sentezlemişlerdir (Şekil 2.16). Bu bileşiğin termal
özellikleri incelenmiş, fotodinamik aktiviteleri ise araştırılmamıştır.
Şekil 2.16 : Son grup olarak asimetrik ZnPc içeren polistiren yapısı.
17
2.6 Etilen Glikol veya PEG Grupları ile Türevlendirilmiş Ftalosiyaninler
18
Gijsens ve diğ. (2002) alüminyum ftalosiyanin tetrasülfonat bileşiğinin (AlPcS4)
tümör hücrelerine yönelik hedef dağılımını sağlamak için bu bileşiği içeren PEG-
lipozom türevi konjuge yapılar (Şekil 2.18) sentezleyerek ftalosiyanin bileşiğinin
fotodinamik aktivitesini artırmayı amaçlamışlardır.
2.6.1 Eksenel konumlardan etilen glikol veya PEG grupları ile türevlendirilmiş
ftalosiyaninler
Brasseur ve diğ. (1999) eksenel konumdan, ortalama molekül kütlesi 2000 g olan PEG
gruplarını ve ayrıca ortalama molekül kütlesi 13000 ve 23000 arasında değişen
polivinil alkol (PVA) polimerik yapısını, AlPc bileşiğine entegre ederek suda çözünür
özellikte ftalosiyaninler (Şekil 2.19) elde etmişlerdir. Bu moleküllerin fotodinamik
aktivtelerini belirlemek amacıyla ayrıntılı biyolojik çalışmalar yapmışlar ancak
bileşiklerin fotofiziksel ve fotokimyasal özelliklerinin karakterizasyonunu
çalışmamışlardır.
19
Şekil 2.19 : PEG blokları içeren AlPc bileşiği.
Şekil 2.20 : PEG 5000 grupları ile sübstitüe edilmiş SiPc bileşiği.
Lo ve diğ. (2003), ortalama molekül kütlesi 750 g olan iki tane poli(etilen glikol) metil
eter grubunun eksenel konumlardan bağlı olduğu SiPc bileşiklerini sentezlemişlerdir
(Şekil 2.21). Pc makrohalkasının periferal konumlarına, moleküllerin fotoalgılayıcı
özelliklerini arttırmak amacıyla ağır halojen atomları sübstitüe etmişlerdir
20
Şekil 2.21 : PEG 750 blokları ile sübstitüe edilmiş SiPc bileşiği.
Lo ve diğ. (2007), benzer şekilde, PEG gruplarını (PEGME 550) da içeren, farklı
sübstitüentlerin eksenel konumlardan bağlı olduğu silisyum(IV) ftalosiyaninler
sentezleyerek, in vitro çalışmalarla bu bileşiklerin fotodinamik etkilerini
araştırmışlardır.
Huang ve diğ. (2004) eksenel konumlardan ortalama molekül ağırlıkları 550 veya 750
olan PEGME zincirlerinin bağlı olduğu sübstitute olmayan ve halojen sübstitute
silisyum(IV) ftalosiyaninler sentezlemişlerdir (Şekil 2.22). Sentezlenen bileşiklerin
fotodinamik aktiviteleri ölçüldüğünde daha uzun zincirli PEG 750 gruplarının Pc
halkasının hidrofilikliğini artırdığını ve agregasyonu önlemede daha etkili olduğu
bulunmuştur. Bununla birlikte PEG 550 gruplarının bağlı olduğu bileşiğin singlet
oksijen kuantum verimi PEG 750 gruplarının bağlı olduğu bileşiğe göre daha az
ölçülmüştür.
Şekil 2.22 : PEG 550 ve PEG 750 grupları ile sübstitüe edilmiş SiPc bileşiği.
21
Eksenel konumlardan sübstitüe edilmiş SiPc ler ile ilgili elde edilen verimli
sonuçlardan sonra, merkezde silisyum atomu içeren ftalosiyaninler ile ilgili yapılan
çalışmalar giderek önem kazanmış ve SiPc’ler PDT için umut verici fotoalgılıyıcılar
olmaya başlamıştır. SiPc’ler yüksek dalga boylarında (>600 nm) absorpsiyon yaparlar.
Agregasyon eğilimleri düşük, singlet oksijen verimleri yüksektir (Ben-Hur ve
Rosenthal, 1989). 1993 yılında sentezlenen Pc 4 bileşiği (Şekil 2.23), oldukça dikkat
çekmiştir (Morris ve diğ, 2003; Antunez ve diğ, 1993). Biyolojik çalışmalar bu
bileşiğin V79 kültür hücresinde in vitro düzeyde ve tümörlü farelerde in vivo düzeyde
fototoksisite gösterdiğini ortaya koymuştur. Pc 4 bileşiği eksenel olarak bir hidroksi
ve aminosiloksi grubuna sahiptir. Silisyum atomunun çapı Pc halkasına tam uygundur.
Yüksek fototoksisiteye sahiptir. Bu bileşik, PDT amaçlı gönüllü hastalara
uygulanmıştır (Kenney ve diğ, 1992). Hofman ve diğ. (2007), eksenel konumlardan
monometoksi PEG 750 ve solketal gruplarının bağlı olduğu SiPc ve solketal gruplarını
içeren ZnPc bileşikleri sentezleyerek, bu bileşiklerin suda çözünürlüklerini, Pc4
bileşiği ile karşılaştırarak (Şekil 2.23), in vitro hücre çalışmalarıyla fotodinamik
aktivitelerini incelemişlerdir. Si(PEG750)2Pc bileşiğinin suda oldukça iyi çözünürlük
gösterdiğini tespit etmişlerdir.
Şekil 2.23 : Pc4 bileşiği ile karşılaştırılan, PEG750 ve solketal grupları ile sübstitüe
edilmiş SiPc bileşiği.
Bandera ve diğ. (2016), eksenel konumlardan sübstitüe olmuş, farklı uzunlukta etilen
glikol zincirleri (trietilen glikol ve PEG 600) ile türevlendirilmiş, birçok organik
22
çözücüde ve suda çözünen yeni silisyum ftalosiyanin bileşikleri sentezlemişlerdir
(Şekil 2.24). Bileşiklerin fotofiziksel ve elektrokimyasal özellikleri araştırılmıştır.
Standart ftalosiyanin bileşiği ile karşılaştırıldıklarında, sentezlenen tüm bileşiklerin
floresans kuantum verimleri daha yüksek bulunmuştur.
23
Şekil 2.26 : Ru(L2)2Pc bileşiği.
2.6.2 Periferal konumlardan etilen glikol veya PEG grupları ile türevlendirilmiş
ftalosiyaninler
24
Sonogashira reaksiyonudur (Sonogashira, 2007; Dumoulin ve diğ, 2011). Tez
kapsamında sentezlenen, periferal konumlardan sübstitüe olmuş ftalosiyaninler,
Sonogashira kenetlenme reaksiyonu ile elde edilmiştir.
Şekil 2.28 : 1,4-di- α-konumlarından PEG grupları ile sübstitüe edilmiş ZnPc
bileşiği.
Bai ve diğ. (2011), trietilen glikol monometil eter ve ortalama molekül ağırlığı 550
olan polietilen glikol monometil eter zincirleri içeren asimetrik çinko ftalosiyaninler
sentezleyerek (Şekil 2.29), bu bileşiklerin PDT için etkili olabilecek fotoalgılayıcı
moleküller olarak kullanımlarını araştırmışlardır. Fotokimyasal ölçümlerde, trietilen
glikol monometil eter içeren yapının uzun zincirli analoglarına göre daha az singlet
oksijen kuantum verimine sahip olduğu bulunmuştur.
25
Şekil 2.29 : Trietilen glikol monmetil eter ve PEGME 550 grupları ile sübstitüte
edilmiş asimetrik ZnPc bileşikleri.
Tuncel ve diğ. (2011), hidroksil grubu ile sonlanan tetraetilen glikol zincirleri içeren
tetra ve okta türevi, suda yüksek çözünürlüğe sahip çinko ftalosiyanin bileşikleri
sentezleyerek (Şekil 2.30, Şekil 2.31, Şekil 2.32), bu bileşiklerin PDT’de fotoalgılayıcı
olarak kullanılma potansiyellerini araştırmışlardır. Yapılan çalışmada, fotofiziksel ve
fotokimyasal ölçümlerden alınan sonuçlar, plazma proteinlerine bağlanma ölçümleri
ve fototoksisite deneyleri sonuçları ile birlikte incelenmiş ve PDT ajanı olarak
kullanılabilecek en uygun ftalosiyanin bileşiği belirlenmiştir.
Şekil 2.30 : Tetraetilen glikol grupları ile sübstitüe edilmiş tetra periferal ZnPc
bileşiği.
26
Şekil 2.31 : Tetraetilen glikol grupları ile sübstitüe edilmiş tetra non-periferal ZnPc
bileşiği.
Şekil 2.32 : Tetraetilen glikol grupları ile sübstitüe edilmiş okta periferal ZnPc
bileşiği.
Li ve diğ. (2011), bir, iki ve sekiz tri(etilen glikol) zincirleri içeren asimetrik üç yeni
çinko(II) ftalosiyanin bileşikleri sentezleyerek (Şekil 2.33) bileşiklerin spektroskopik
özelliklerini incelemişlerdir. Polar organik çözücülerde yüksek çözünürlük gösteren
bu yapıların floresans kuantum verimleri ölçülmüştür.
Mineo ve diğ. (2011), trietilen glikol metil eter (TEGME) ve farklı zincir
uzunluklarında poli(etilen glikol) metil eter (PEGME 350 veya 750) grupları içeren,
suda çözünür, tetra ve okta sübstitüe metalli ve metalsiz ftalosiyanin bileşiklerinin
sentezini gerçekleştirmişlerdir (Şekil 2.34). Bileşiklerin sudaki çözeltilerinin
davranışları ve spektroskopik özellikleri, UV-Vis, lüminesans ve dinamik ışık saçılım
27
ölçümleri ile belirlenmiştir. Daha uzun (PEGME 750) zincirleri içeren ftalosiyanin
moleküllerinin sulu çözeltilerinde daha az agregasyon görülmüştür. Moleküllerin
fotodinamik aktiviteleri incelenmemiştir.
Şekil 2.34 : Farklı zincir uzunluklarında etilen glikol monometil eter grupları içeren
tetra ve okta sübstitüte metalli ve metalsiz Pc bileşiği.
Ongarora ve diğ. (2012), PEG grupları içeren yeni amfifilik ve dikatyonik çinko
ftalosiyaninler sentezlemişlerdir (Şekil 2.35). Sentezlenen tüm bileşikler polar organik
çözücülerde yüksek çözünürlük gösterirken suda çözünürlük göstermemişlerdir.
Bileşiklerin kanser hücreleri üzerindeki fotodinamik aktiviteleri araştırılmış, en uzun
PEG zincirlerini içeren bileşiğin en yüksek fototoksisiteye sahip olduğu bulunmuştur.
28
Şekil 2.35 : PEG grupları içeren amfifilik ve dikatyonik ZnPc bileşikleri.
Zhao ve diğ. (2013), farklı uzunlukta PEG zincirleri ile monosübstitüte olmuş üç yeni
çinko(II) ftalosiyanin (Şekil 2.36) sentezlemişlerdir. Bu bileşiklerin suda miseller
oluşturmak üzere kendiliğinden bir araya gelme ve silika nanopartikülleri ile
kapsüllenme özellikleri ile birlikte fotodinamik aktiviteleri incelenmiştir. Belirli
dalgaboyunda gösterdikleri yoğun floresanas emisyonları bileşiklerin agregasyon
göstermediğini kanıtlamıştır.
29
Şekil 2.36 : PEG zincirleri ile monosübstitüte olmuş üç yeni ZnPc bileşiği.
Şekil 2.37 : Farklı uzunlukta PEG zincirleri ile okta sübstitüe edilmiş metalsiz
ftalosiyanin bileşiği sentez şeması (Siklotetramerizasyon).
30
Şekil 2.38 : Farklı uzunlukta PEG zincirleri ile okta sübstitüe edilmiş CuPc bileşiği
sentez şeması (‘Klik’ Kimya).
31
Şekil 2.39 : cis-A2B2 tipi ZnPc bileşikleri.
Jin ve diğ. (2015), amfifilik çinko ftalosiyanin ve bir poli(etilen glikol) türevi olan
biyolojik uyumlu Brij 58 polimerini içeren konjuge yapı sentezlemişlerdir (Şekil 2.41).
Sentezlenen bu bileşik ile su içerisinde oldukça iyi dağılım gösteren monomoleküler
32
miseller oluşturularak nanoyapılar elde edilmiştir. Nanoyapıların, Sedef Hastalığının
fotodinamik terapi ile tedavisindeki rolü araştırılmıştır.
33
Şekil 2.42 : PEG ile konjuge edilmiş simetrik ZnPc bileşiği.
Pinto ve diğ. (2016), poli(etilen glikol) 500 (PEG500) grupları içeren tetra sübstitüe
metalli ve metalsiz ftalosiyanin bileşikleri sentezleyerek (Şekil 2.44), bileşiklerin
fotofiziksel özelliklerini incelemişlerdir. Metalsiz ve çinko(II) komplekslerinin yüksek
34
floresans kuantum verimine sahip olduklarını, mangan(III) komplekslerinin floresans
özellik göstermediklerini belirtmişlerdir.
Şekil 2.44 : PEG 500 grupları ile tetra sübstitüe olmuş metalsiz ve metalli Pc
bileşikleri.
35
Şekil 2.45 : Naftalen ve di(etilen glikol) grupları içeren Zn(II), Cu(II), Co(II) ve
Ni(II) Pc bileşikleri.
Li ve diğ. (2017), metoksipolietilen glikol türevi blok kopolimeri içeren termo duyarlı,
belirli sıcaklı aralığında agregasyon olmayan ve suda çözünür çinko(II)
tetraaminoftalosiyanin bileşiği (Şekil 2.46) sentezlemişlerdir. Bileşiğin fotodinamik
terapide fotoalgılayıcı olarak kullanılma potansiyeli araştırılmış, yeterli ölçüde singlet
oksijen kuantum verimine sahip olduğu ve HeLa hücrelerine karşı fototoksik etki
gösterdiği bulunmuştur.
36
Şekil 2.46 : Metoksipolietilen glikol türevi blok kopolimeri içeren ZnPc bileşiği.
37
2.7 Ftalosiyaninlerin Kullanım Alanları
38
Şekil 2.47 : Kanser hücrelerinin sağlıklı hücrelerden farklı gelişimi (Url-1).
Günümüzde tanısı konulmuş 200’den fazla kanser çeşidi vardır. Tüm bu kanser
türlerine yönelik kullanılan en yaygın tedavi metotları arasında ameliyat, kemoterapi,
radyoterapi, immünoterapi ve hedefli terapi gibi yöntemler sayılabilir. Tedavi amaçlı
görünür bölge, ultraviyole (UV) veya yakın infrared (IR) bölgesindeki ışığın
kullanıldığı tüm uygulamalar fototerapi olarak, bu bölgelerdeki ışığın ışığa duyarlı bir
kemoterapotik ajan ile birlikte kullanıldığı uygulamalar ise fotokemoterapi olarak
adlandırılmaktadır. PDT ise fotokemoterapinin bir alt dalı olarak bilinmektedir
(Bonnett, 2000). Fotodinamik Terapi (PDT), bu tedavi yöntemlerine alternatif olarak
kullanılan ve son yıllarda özellikle bazı kanser türleri için oldukça etkili olduğu
kanıtlanan bir yöntemdir.
39
ve tümörlü dokuların yok edilmesini sağlayarak bu bölgenin iyileşmesini sağlar. (Şekil
2.48). Aynı etki prensibi ile, PDT sayesinde kanser hücrelerine saldırması için
bağışıklık sistemi uyarılabilir veya tümörlü bölgeleri besleyen kan damarlarının yok
edilmesi sağlanabilir.
40
Şekil 2.49 : Bir fotoalgılayıcının ışık etkisi ile uyarılması sonucu reaktif oksijen
türlerinin oluşumu.
Singlet oksijen ve radikaller oldukça reaktif ve kısa ömürleri oldukları için yalnızca
PS lokalizasyonunun olduğu bölgeyi ve yakınındaki molekülleri etkileyebilirler
(Barata ve diğ, 2015). PDT 'nin en önemli faydaları; tedavi sonrasında, tedaviden
etkilenmiş olan bölgelerin normal dokuların yenilenmesiyle iyileşebilmesidir
(Ashwood ve Burtis, 1999). İdeal bir fotoalgılayıcı molekülden beklenen, ışığa maruz
bırakıldığı zaman hem tümöre hem de tümör içeren dokulara yoğun bir şekilde nüfuz
etmesi ve sitotoksik ajan üretiminde fotokimyasal olarak etkin olabilmesidir (Abaktilla
ve diğ, 2007). Ne ışık ne de fotoalgılayıcı tek başına bir sitotoksik tür
oluşturmayacağından, hem hastalıklı hem de normal doku birlikte aynı ışık dozuna
maruz kalabilir (Akkaya ve diğ, 2006).
41
açabilecek fotomoleküler işaretleyicilerin sentezi araştırılmıştır. Bu yöntem, tümörlü
bölgelerde aşırı mikarda toplanabilecek biyoişaretleyicilerin enzimatik
reaksiyonlarına dayanmaktadır (Achard ve diğ, 2017).
Çift zincirli sarmal şeklindeki kıvrılmış yapısının 1953 yılında aydınlatılması ile
birlikte, DNA molekülünün hedef alındığı bilimsel çalışmalar bu tarihten itibaren hızla
artmıştır. Azot içeren Adenin (A), Timin (T), Guanin (G) ve Sitozin (C) bazları
arasındaki hidrojen bağlarının etkisinde iki polinükleotid zincirin bir arada tutulması
ile DNA molekülü heliks yapısını alır (Şekil 2.50).
42
ilaçlar için en etkili olan interkalatif bağlanma (Şekil 2.51) (de Almeida ve diğ, 2017).
Bu etkileşimler, DNA’ya bağlanan maddenin moleküler yapısına geometrik şekline,
yapısal hacmine ve stereokimyasal özelliklerine bağlı olabilmektedir (Reedijk, 2009;
Nahid ve Moghadam, 2013; Uslan ve Sesalan, 2012; Turanlı-Yıldız ve diğ, 2011;
Uslan ve Sesalan, 2013; Uslan ve diğ, 2012).
Şekil 2.51 : DNA molekülünün çeşitli bağlanma modelleri (de Almeida ve diğ,
2017).
43
azaltır ve zincirlerin yapısına hasar vererek, çift sarmal yapının bozulmasına neden
olur (Nogueira ve diğ, 2015). DNA’nın heliks yapısı içinde, karşılıklı iki zincir
arasında büyük oluk (major) ve küçük oluk (minor) şeklinde boşluklar bulunmaktadır.
Oluklara bağlanma (Şekil 2.52) (Gattuso ve diğ, 2015), baz çiftlerinin bu boşuklara
bakan taraftaki fonksiyonel gruplar ile bağlanan moleküllerin doğrudan etkileşimi ile
gerçekleştiğinden oldukça güçlü bir bağlanma modudur. A-T baz çiftlerini içeren
bölgelerin, G-C baz çiftlerini içeren bölgelere göre daha dar olması, sterik engelin
azalmasını sağladığından, bağlanan moleküller, genelde A-T seçiciliği gösterirler
(Nelson ve diğ, 2007; Özkan, 2016).
Bugüne kadar yaklaşık 130 adet antitümör ilacı kanser tedavisinde kullanılmak üzere
Gıda ve İlaç İdaresinden (FDA) onay almıştır. Bu ilaçlar; platin temelli ilaçlar (cis
platin, oksaliplatin ve karbopiatin), poliaromatikler (daunorubisin ve doksorubisin) ve
mustardlardır (DNA bazlarını alkilleyiciler ve urasil mustard). Kemoterapi ilacı olarak
kanser tedavisinde kullanılan bu ilaçlar DNA ile tanımlanan mekanizmalar üzerinden
etkileşime girerler. Platin temelli olanlar, DNA'nın pürin bazlarıyla koordine kovalent
bağ yaparlar; mustardlar DNA bazlarını alkillerler; poliaromatikler ise DNA’nın çift
sarmal yapısının içine kovalent olmayan etkileşimlerle yerleşip (interkalasyon) çift
sarmal yapıyla kararlı kompleks oluşturur ve böylece DNA’nın kendini replike
etmesini engellerler (Bischoff ve Hoffmann, 2002).
DNA ilaçlarının büyük çoğunluğu genellikle pozitif yük taşıyan düşük molekül
ağırlıklı aromatik yapılardır. Aromatik düzlemsel molekül ve baz çiftleri arasında van
44
der Waals kuvvetleri, π-π düzenlenmesi ve hidrofobik etkileşimler etkindir (Gaiduk ve
diğ, 1990).
DNA’nın çift sarmalları negatif yüklüdür ve pozitif yüklü parçalarla kuvvetli bir
etkileşime girmektedir (Barton ve Hall, 1997). Makromoleküllere ligand bağlanması
biyolojide ve tıpta biyolojik proseslerin yönetim sisteminde önemli bir rol
oynamaktadır.
45
PDT’de kullanılan fotoalgılayıcı ilaçların, kan akışına enjekte edildikten sonra, kanın
başlıca bileşenlerinden olan serum proteinleri ile etkileşime girerek, bu ilaçların
biyodağılımında etkili olduğu tespit edilmiştir. Polietilen glikol türevi sübstitüentler
içeren yapıların biyolojik olarak aktif oldukları, protein komplekslerinin polar
kısımları ve metal iyonları ile aktif olarak etkileşime girerek, bu maddelerin
konformasyonlarında değişiklik oluşturdukları yapılan çalışmalarda görülmüştür
(Lebedeva ve diğ, 2015; Ti ve diğ, 2014).
Periferal pozisyonlarına alkil, alkoksi, oligo yan zincirleri ve taç eterler gibi gruplar
bağlanarak ftalosiyaninlere termotropik sıvı kristal özellik kazandırılabilir. Piechocki
ve grubunun (1982) sentezlediği Pc’ler, periferal konumlarda sekiz alkoksimetil
zinciri taşıyan bileşiklerdir.
46
taşımaktadır. Bu amaca yönelik çok sayıda, farklı sübstitüentler içeren ftalosiyaninler
sentezlenmesine rağmen, sıvı kristal özellik gösteren bu Pc’lerden çok azının yapıları,
ince film oluşturabilme özellikleri açısından araştırılmıştır (Antonio Duro ve diğ,
1996; Fujikake ve Murashige, 2004).
47
48
3. DENEYSEL KISIM
49
λmax, nm (log ε) 357 (4.63), 608 (4.34), 677 (5.14). UV-vis (su): λmax, nm (log ε) 357
(4.78), 616 (4.21), 682 (5.15). FT-IR: ν, cm-1 3497 (OH), 2866 (CH-CH), 1638 (C=C),
1520 (C=C), 1453 (C=C), 1348, 1335, 1291 (C-O), 1081 (Si-O), 945, 843. 1H NMR
(200 MHz; DMSO-d6; Me4Si): δH, ppm 0.28-0.34 (4H, t, Si-O-CH2), 0.71-0.88 (4H, t,
Si-O-CH2-CH2), 1.11-1.33 (8H, t, Si-O-(CH2)2-CH2), 1.53-1.60 (4H, t, Si-O-(CH2)3 -
CH2), 2.24-2.33 (4H, t, Si-O-(CH2)4 -CH2), 2.75-2.85 (4H, t, Si-O-(CH2)5 -CH2), 3.04-
3.13 (4H, t, Si-O-(CH2)6 -CH2), 4.61-4.5 (2H, br s, OH), 8.45-8.51 (8H, m, Hα), 9.61-
9.67 (8H, m, Hβ).
10 mL’lik tek boyunlu reaksiyon balonunda 100 mg (0.4 mmol) 4-iyodoftalonitril, 1.5
mL DMAE içerisinde, 13.63 mg (0.1 mmol) çinko(II) klorür tuzu varlığında 18 saat
süreyle argon atmosferi altında 170 ˚C’de karıştırılır. Reaksiyon bitiminde çözücü
reaksiyon ortamından uzaklaştırılır, mavi renkli katı metanol ile yıkanıp, 5000 g de 10
50
dakika santrifüj edilerek, süzülür ve vakumda P2O5 ile kurumaya bırakılır (Şekil 3.3).
Verim: 70 mg (65.8%) (Eva ve diğ, 1998).
51
3.5 2(3), 9(10), 16(17), 23(24)-Tetra[iyodo]ftalosiyaninatolutesyum(III)asetat
Bileşiğinin (5) Sentezi
3.6 Propargil Poli(etilen glikol) Monometil Eter (2000) Bileşiğinin (6) Sentezi
100 mL’lik 3 boyunlu reaksiyon balonunda 2.5 g PEGME (Mn = 2000 g.mol-1, 1.25
mmol) 50 mL THF’te çözüldükten sonra 200 mg NaH (5 mmol) ilave edilir. Reaksiyon
oda sıcaklığında ve azot atmosferinde gaz çıkışı bitene kadar karıştırıldıktan sonra buz
banyosunda, 2 saat boyunca karıştırılmaya devam edilir. Daha sonra 1.85 g propargyl
bromür (12.5 mmol) reaksiyon ortamına damla damla ilave edilir. Reaksiyon oda
sıcaklığında 30 saat devam ettirilip, sonlandırılır. Reaksiyon karışımı süzülür,
süzüntüye yaklaşık 25 mL saf su ilave edilip, 25 mL dikorometan ile 1 kez
ekstraksiyon yapılır. Diklorometan fazı kurutulup, buharlaştırılır. Dietileterde
çöktürme denemesi yapılır, beyaz renkli katı çökelti oluşumu gözlendikten sonra tüm
madde çöktürülür (Şekil 3.6). Verim: 2.11 g (%73). C92H182O45 (2006) için
hesaplanan: C, 55.03; H, 9.07; O, 35.89 %. Bulunan: C, 56.04; H, 9.29; O, 34.92 %.
52
FT-IR (ν, cm-1): 3248 (H-C≡C), 2882 (alifatik -CH), 1466, 1341 (C=C), 1101 (C-O),
945, 841. 1H NMR (500 MHz; DMSO-d6; Me4Si): δH, ppm 4.15-4.20 (2H, s, O-CH2-
C≡C), 3.44-3.80 (176H, m, -(O-CH2-CH2)44, 2.40-2.45 (1H, s, C≡CH), 2.16-2.33 (3H,
s, O-CH3) (François ve diğ, 2011; Zill ve diğ, 2012; Zhang ve diğ, 2014).
Şlenk tüp içerisine, 25 mg (0.023 mmol) tetraiyodo-ZnPc (3), 0.754 g (0.37 mmol)
propargil PEGME2000 (6), 6.5 mL kuru THF ve 2 mL trietilamin ilave edilir.
Çözücüden 30 dakika boyunca argon gazı geçirilir. Sırası ile 2.87 mg (0.00316 mmol)
PdCl2(PPh3)2 ve 1.62 mg (0.00852 mmol) CuI ilaveleri yapıldıktan sonra reaksiyon
karışım argon altında 16 saat boyunca oda sıcaklığında karışmaya bırakılır. Reaksiyon
sonlandırıldıktan sonra THF reaksiyon karışımından uzaklaştırılır. Saflaştırma işlemi
kolon kromatografisi ile, Bio-Beads S-X3 Support dolgu maddesi olarak;
diklorometan elüent olarak kullanılarak gerçekleştirilir (Şekil 3.7). Verim: 166 mg
(84%). C400H736O180N8Zn (8593) için hesaplanan: C, 55.85; H, 8.56; N, 1.30 %.
Bulunan: C, 54.94; H, 7.98; N, 1.05 %. UV-Vis (DMSO) λmax nm (log ε): 351(4.95),
637(4.49), 691(5.06). UV-Vis (suda) λmaxnm (log ε): 346(4.95), 646(4.67), 691(4.82).
FT-IR (ν, cm-1): 2884, 2741 (-CH2), 2695 (-CH), 2166 (-C≡C-), 1100 (-C-O). 1H NMR
(500 MHz; DMSO-d6; Me4Si): δH, ppm 7.91-7.33 (3H, m, aromatik-H), 4.56-4.14 (2H,
m, O-CH2-C≡C), 3.94-3.12 (176H, m, -(O-CH2-CH2)44, 3.37 (3H, m, O-CH3).
53
Şekil 3.7 : 7 bileşiğinin sentezi.
Şlenk tüpü içerisinde, 20 mg (0.017 mmol) tetraiyodo-InPc (4), 0.680 g (0.37 mmol)
propargil PEGME2000 (6), 6.5 mL kuru THF ve 2 mL trietilamin ile birlikte
karıştırılarak, çözücü sisteminden 30 dakika boyunca argon gazı geçirilir. Sırası ile
2.87 mg (0.00316 mmol) PdCl2(PPh3)2 ve 1.62 mg (0.00852 mmol) CuI ilaveleri
yapıldıktan sonra reaksiyon karışımı argon altında 16 saat boyunca oda sıcaklığında
karışmaya bırakılır. Reaksiyon sonlandırıldıktan sonra reaksiyon ortamındaki çözücü
sistemi vakum altında uçurulur. Saflaştırma işlemi kolon kromatografisi ile, Bio-Beads
S-X3 Support dolgu maddesi; diklorometan elüent olarak kullanılarak gerçekleştirilir
(Şekil 3.8). Verim: 115 mg (78%). C402H739O182N8In (8701.8) için hesaplanan: C,
54
55.43; H, 8.49; N, 1.28 %. Bulunan: C,54.78; H, 8.30; N, 1.10 %. UV-Vis (DMSO)
λmax nm (log ε): 350(4.92), 637(4.37), 703 (5.00). UV-Vis (suda) λmax nm (log ε):
345(4.92), 664(4.45), 706(4.75). FT-IR (ν, cm-1): 2883, 2742 (-CH2), 2695 (-CH), 2163
(-C≡C-), 1740 (-C=O), 1105 (-C-O). 1H NMR (500 MHz; DMSO-d6; Me4Si): δH, ppm
8.16-7.39 (3H, m, aromatik-H), 4.48-4.06 (2H, m, O-CH2-C≡C), 3.94-2.58 (176H, m,
-(O-CH2-CH2)44, 3.38 (3H, m, O-CH3).
Şlenk tüpü içerisinde, 20 mg (0.016 mmol) tetraiyodo-LuPc (5), 0.680 g (0.37 mmol)
propargil PEGME2000 (6), 6.5 mL kuru THF ve 2 mL trietilamin ile birlikte
karıştırılarak, çözücü sisteminden 30 dakika boyunca argon gazı geçirilir. Sırası ile
55
2.87 mg (0.00316 mmol) PdCl2(PPh3)2 ve 1.62 mg (0.00852 mmol) CuI ilaveleri
yapıldıktan sonra reaksiyon karışımı argon atmosferi altında 16 saat boyunca oda
sıcaklığında karışmaya bırakılır. Reaksiyon sonlandırıldıktan sonra reaksiyon
ortamındaki çözücü sistemi vakum altında uçurulur. Saflaştırma işlemi kolon
kromatografisi ile, Bio-Beads S-X3 Support dolgu maddesi; diklorometan elüent
olarak kullanılarak gerçekleştirilir (Şekil 3.9). Verim: 117 mg (83%).
C402H739O182N8Lu (8761.9) için hesaplanan: C, 55.05; H, 8.43; N, 1.27 %. Bulunan:
C, 53.98; H, 7.95; N, 0.97 %. UV-Vis (DMSO) λmax nm (log ε): 353(4.94), 640(4.42),
692(4.96). UV-Vis (suda) λmax nm (log ε): 346(4.91), 649(4.43), 696(4.83). FT-IR (ν,
cm-1):2883, 2741 (-CH2), 2695 (-CH), 2168 (-C≡C-), 1740 (-C=O), 1099 (-C-O). 1H
NMR (500 MHz; DMSO-d6; Me4Si): δH, ppm 7.64-7.42 (3H, m, aromatik-H), 4.41-
4.26 (2H, m, O-CH2-C≡C), 3.69-3.55 (176H, m, -(O-CH2-CH2)44, 3.38 (3H, m, O-
CH3).
56
4. SONUÇ VE YORUMLAR
Bu tez çalışması kapsamında çeşitli sentez yöntemleri ile ftalosiyanin halkasına farklı
konumlardan polietilen glikol türevleri sübstitüe edilerek, yeni ftalosiyanin
makromolekülleri sentezlenmiştir. Elde edilen bileşiklerin karakterizasyonları,
elemental analiz, FT-IR, 1H-NMR, LC-MS, UV-Vis gibi spektroskopik yöntemler
kullanılarak yapılmıştır. Makromoleküllerin, fotokimyasal, fotofiziksel ve biyolojik
ölçümleri yapılarak, medikal uygulamalardaki potansiyelleri araştırılmıştır.
57
Bileşiğe ait FT-IR spekturumunda, OH grubuna ait gerilme titreşimleri 3497 cm-1’de,
alifatik C-H bağlarına ait titreşimler 2866 cm-1’de, Si-O bağlarına ait titreşimler ise
1081 cm-1’de gözlenmişir.
58
SiPc(OH)2 bileşiğinin DMSO’daki UV-Vis spektrumu ile kıyaslandığında, SiPc-
PEG1000 bileşiğinin Q bandında 5 nm kırmızıya kayma gözlenmiştir. a verisi
Seotsanyana-Mokhosi ve diğ. (2001); b verisi Dinçer ve diğ. (2015) çalışmalarından
alınmıştır.
59
Şekil 4.2 : 2 bileşiğinin DMSO içinde farklı derişimlerdeki absorpsiyon spektrumu:
1.2x10-5, 1.0x10-5, 8x10-6, 6x10-6, 4x10-6, 2x10-6 M.
SiPc(PEG1000)2 (2) bileşiğinin, 1×10-5 derişime sahip farklı çözücülerde (DMSO, su,
DMF, kloroform ve toluen) alınan UV-Vis spektrumları, bileşiğin fotokimyasal ve
fotofiziksel ölçümlerinde kullanılacak en uygun çözücü seçimini belirlemek için
60
kullanılmıştır (Şekil 4.4). Kullanılan bu çözücülerde, SiPc-PEG1000 bileşiğinin
agregasyon göstermediği tespit edilmiştir.
61
Şekil 4.5 : 2 bileşiğinin DMSO içindeki emisyon, absorpsiyon ve eksitasyon
spektrumu (Eksitasyon dalgaboyu = 640 nm, Derişim = 1.00x10-5M.
62
Bileşiğin uyarılma spektrumu, absorpsiyon spektrumu ile benzerlik göstermektedir.
Absorpsiyon ve uyarılma spekrumları arasındaki bu benzerlik, floresans süresince
bileşiğin bozunmaya uğramadığını göstermiştir.
Bileşiğin floresans ömrü (τF) zaman taramalı tek foton sayan (TCSPC) floresans
spektrofotometre cihazı ile DMSO (Şekil 4.7) ve suda (Şekil 4.8) ölçülmüştür.
63
Şekil 4.8 : 2 bileşiğinin su içindeki floresans sönüm eğrisi, Derişim = 1.00x10-5M.
SiPc(PEG1000)2 bileşiğinin (2) singlet oksijen kuantum verimi () ölçümü, deneysel
yöntem (Şekil 4.9) ile bileşiğin suda ve DMSO içerisindeki çözeltileri kullanılarak
gerçekleştirilmiştir. DMSO içerisinde yapılan ölçümlerde, kimyasal sönümleyici
64
olarak 1,3-difenilisobenzofuran (DPBF); suda yapılan ölçümlerde ise antrasen-9,10-
diil-bis-metilmalonat kullanılmıştır.
DMSO’da yapılan ölçümler için standart referans madde olarak sübstitüte olmamış
çinko ftalosiyanin (std = 0.67) bileşiği; suda yapılan ölçümler için ise sülfolanmış
çinko ftalosiyanin (std = 0.45) bileşiği kullanılmıştır (Ogunsipe ve Nyokong, 2005).
DPBF için 417 nm’deki absorbans pikinin (Şekil 4.10), ADMA için ise 380 nm’deki
absorbans pikinin (Şekil 4.11) sönümlenmesi UV-Vis spektrofotometre cihazı ile
görüntülenmiştir.
Şekil 4.10 : DMSO içindeki singlet oksijen kuantum verimi ölçümü sırasında DPBF
ve 2 bileşiğinin (Derişim = 1.00x10-5M) elektronik absorpsiyon spektrumundaki
değişiklik.
65
Şekil 4.11 : Su içindeki singlet oksijen kuantum verimi ölçümü sırasında ADMA ve
2 bileşiğinin (Derişim = 1.00x10-5M) elektronik absorpsiyon spektrumundaki
değişiklik.
66
Çizelge 4.2 : Sübstitüentsiz (SiPc) ve PEG1000 sübstitüe (SiPc(PEG1000)2) SiPc
bileşiklerinin DMSO ve su içerisindeki fotokimyasal ve fotofiziksel verileri.
67
Şekil 4.12 : 2 bileşiğinin DMSO içerisinde fotobozunma sırasında elektronik
absorbansındaki değişiklik (Derişim = 1.20x10-5M).
68
SiPc(PEG1000)2 bileşiğinin (2) ışıkla etkileşimi sonunda alınan UV-Vis
spektrumlarında, herhangi bir fototransformasyon oluşumu gözlenmeksizin, sadece Q
ve B bandlarının absorpsiyon şiddetlerindeki azalma ile fotobozunmanın gerçekleştiği
görülmüştür. Ölçümlerde yeni herhangi bir pik oluşumu veya Q ve B bandlarının
dalgaboylarında herhangi bir kayma gözlenmemiştir. DMSO ve suda yapılan ölçümler
için hesaplanan d değerleri birbirine çok yakın çıkmıştır. (d= 1.04×10-5 DMSO’da;
d= 1.09×10-5 suda) (Çizelge 4.2).
Suda çözünür özellikteki Pc’ler ile yapılan medikal araştırmalarda, HeLa servikal
kanser hücreleri ve HuH karaciğer kanser hücreleri ile yapılan çalışmalarda alınan
sonuçlar bu konuda yapılan araştırmaları yoğunlaştırmıştır (Fukushima ve diğ, 1998;
Maftoum-Costa ve diğ, 2008; Rello-Varona ve diğ, 2008)
69
Şekil 4.14 : 2 bileşiğinin farklı derişimlerde (0, 0.25, 0.50, 1, 2 ve 3 µM) HeLa ve
HuH-7 tümör hücreleri ile 24 saat inkübe edildikten sonra 2 J/cm2 ışığa maruz
bırakılması sonucu gösterdiği fototoksisite.
Bileşiğin 0.5 µM derişiminde, her iki kanser hücresi tipi için de, PDT uygulamasından
sonra canlı kalan hücrelerin yüzde ellinin altında azaldığı görülmüştür. Hücrelerin
yüzde ellisini öldürmek için gerekli ilaç derişimi, yarı maksimal etkili derişim (IC50)
olarak tanımlanmaktadır. SiPc-PEG bileşiğinin IC50 değeri, HeLa hücreleri için 0.28
µM; HuH-7 hücreleri için 0.4 µM olarak belirlenmiştir. Buna göre, PDT ile tedaviye,
bileşiğin düşük derişimlerde (0.5 µM’a kadar), HeLa hücrelerinin, HuH-7 hücrelerine
oranla daha iyi cevap verdiği tespit edilmiştir.
70
klorür, indiyum ve lutesyum asetat tuzları ile reaksiyona girmesi sonucu oluşan
tetraiyodo-metal Pc’lerin (3, 4 ve 5), propargil poli(etilen glikol) monometil 2000 eter
(6) ile Sonogashira Kenetlenme tepkimesi sonucu sentezlenmişlerdir.
71
ZnPc(PEGME2000)4 bileşiği (7), tetraiyodo-çinko Pc’nin 6 bileşiğiyle reaksiyona
girmesi sonucu oluşmuştur. 7 bileşiğinin FT-IR spektrumunda sırasıyla 2883 ve 1100
cm-1’lerde gözlenen alifatik C-H ve C-O pikleri PEGME2000 bloklarının bağlandığı
göstermektedir (Şekil 4.16). Ayrıca 6 numaralı bileşiğe ait olan 3248 cm-1’de gözlenen
asetilen pikinin yok olması hedeflenen bileşiğin (7) oluştuğunu göstermektedir.
72
Şekil 4.17 : 7 bileşiğinin UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
73
Şekil 4.18 : 8 bileşiğinin FT-IR spektrumu.
74
8 bileşiğinin 1H NMR spektrumunda, aromatik protonlar 8.16-7.39 ppm aralığında
multiplet olarak gözlenmiştir. 4.48-4.06 ppm arasındaki pikler O-CH2-C≡C
grubundaki protonların varlığını göstermektedir. 3.94-2.58 ppm arasındaki pikler,
PEGME2000 bloklarındaki -(O-CH2-CH2)44 protonlarının varlığını gösterirken, 3.38
ppm’de gözlenen pikler, O-CH3 protonlarının varlığını göstermektedir. 8 no’lu
bileşiğin 8701 olarak hesaplanan ortalama molekül kütlesi değeri, elemental analiz
sonucu ile uyumlu çıkmış ve LC-MS kütle spektrumundaki moleküler iyon piklerinin
gösterdiği geniş dağılımla desteklenmiştir
75
Şekil 4.21 : 9 bileşiğinin UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
76
y = 118461x - 0,0293
Absorbans
R² = 0,9993
1
0,5
0
0,00E+00 5,00E-06 1,00E-05
Derişim (M)
y = 66622x + 0,0044
R² = 0,9996
0,5
Absorbans
0
0,00E+00 5,00E-06 1,00E-05
Derişim (M)
77
7 bileşiğinin DMSO ve su içerisindeki agregasyon eğilimleri incelendiğinde, DMSO
içerisinde 637 nm’de; su içerisinde ise 646 nm’de H agregasyonunu işaret eden omuz
pikleri görülmüştür. Sudaki H agregasyonunun absorbansı, Q bandının absorbans
değerine oldukça yakın çıkmıştır. Bu da çözelti halindeyken en az monomerler kadar
H-agregatların da oluştuğunu göstermektedir. Suda, 1x10-5 M derişimindeki Q
bandının dalgaboyuyla, omuz pikinin dalgaboyu arasında 45 nm fark vardır. Bu sonuç,
7 bileşiğinin yapısında, agregatların da önemli olduğunu ve bileşiğin daha düzlemsel
yapıda, yüz yüze paketlendiğini göstermiştir (Yan ve diğ, 2016).
1 y = 99616x + 0,0038
Absorbans
R² = 0,9999
0,5
0
0,00E+00 5,00E-06 1,00E-05
Derişim (M)
78
y = 56864x - 0,0009
0,5 R² = 0,9998
Absorbans
0
0,00E+00 5,00E-06 1,00E-05
Derişim (M)
79
1
y = 92932x - 0,0044
R² = 0,9997
Absorbans
0,5
0
0,00E+00 5,00E-06 1,00E-05
Derişim (M)
80
y = 69213x + 0,001
0,5 R² = 0,9998
Absorbans
0
0,00E+00 5,00E-06 1,00E-05
Derişim (M)
81
su+triton-X içerisindeki çözeltilerinin UV-Vis spektrumları alınmıştır. Bileşikler,
yapılarındaki hidrofilik PEGME gruplarından dolayı, farklı polariteye sahip bu
çözücülerde oldukça iyi çözünürlük göstermişlerdir. Kullanılan çözücünün polarlığına
göre maddelerin Q bantlarında 685 ve 695 nm aralığındaki farklı dalgaboylarına
kaymaların olduğu gözlenirken, Q bandı dışında farklı bantların oluşumuna
rastlanmamıştır (Şekil 4.28, Şekil 4.29, Şekil, 4.30). Bu çalışmanın sonucuna göre,
PDT çalışmaları ve bileşiklere ait, π → π* ve n → π* geçişlerine karşılık gelen
karakteristik Q ve B bantlarını tespit etmek için DMSO ve su çözücüleri seçilmiştir.
82
Şekil 4.29 : 8 bileşiğinin farklı çözücüler içerisindeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu (Derişim = 7.5x10-6M).
83
Şekil 4.30 : 9 bileşiğinin farklı çözücüler içerisindeki UV-Vis absorpsiyon
spektrumu (Derişim = 7.5x10-6M).
PEGME 2000 sübstitüe yeni ftalosiyanin bileşiklerinin singlet oksijen kuantum verimi
() ölçümleri, bileşiklerin DMSO ve suda hazırlanan çözeltileri kullanılarak
gerçekleştirilmiştir. DMSO’da yapılan ölçümler için kimyasal sönümleyici madde
olarak 1,3-difenilisobenzofuran (DPBF); hesaplamalarında referans madde olarak
sübstitüte olmayan ZnPc bileşiğine ait değeri kullanılmıştır. Suda yapılan
84
ölçümlerde antrasen-9,10-diil-bis-metilmalonat bileşiği, kimyasal sönümleyici madde
olarak; ZnPcSmix bileşiğine ait değeri ise referans değer olarak kullanılmıştır. Şekil
4.9’daki deneysel düzenek kullanılarak yapılan ölçümlerde DPBF için 417 nm’deki
(Şekil 4.31, Şekil 4.32, Şekil 4.33); ADMA için ise 380 mn’deki (Şekil 4.34, Şekil
4.35, Şekil 4.36) absorbans piklerinin sönümlenmeleri dikkate alınmıştır. Ölçüm
boyunca ışıkla uyarılma süresi arttıkça, DPBF ve ADMA absorpsiyonlarının bu
dalgaboylarında azaldığı gözlenmiştir. Buna karşın 7, 8 ve 9 bileşiklerinin Q
bantlarının absorpsiyon şiddetinde herhangi bir değişiklik görülmemiştir. DMSO’daki
ölçüm sonuçları kullanılarak hesaplanan değerleri Zn, In ve Lu metallerinin atom
numarası artışlarıyla orantılı olarak beklenildiği gibi artmıştır. DMSO içerisinde
yapılan ölçümlerde en yüksek değeri lutesyum metalinin ağır atom etkisinden
dolayı 9 bileşiğinde görülmüştür (= 0.68). Sudaki veriler ile hesaplanan
değerlerinden ZnPc(PEGME2000)4 (7) bileşiği için bulunan değeri en yüksek
çıkarken, bunu sırası ile LuPc-PEGME ve InPc-PEGME bileşikleri için bulunan
değerleri izlemiştir (Çizelge 4.3) (a: Seotsanyana-Mokhosi ve diğ, 2001; b: Idowu ve
Nyokong, 2009)
85
2,5
DPBF Absorbansı
2
1,5
1 y = -0,0122x + 2,3594
R² = 0,9929
0,5
0
0 10 20 30 40 50 60 70
Zaman (s)
Şekil 4.31 : 7 bileşiğinin DMSO içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne
ait UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
2,5
DPBF Absorbansı
2
1,5
1 y = -0,0103x + 2,2599
0,5 R² = 0,987
0
0 10 20 30 40 50 60 70
Zaman (s)
Şekil 4.32 : 8 bileşiğinin DMSO içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne
ait UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
86
2,5
DPBF Absorbansı
2
1,5
1
y = -0,0169x + 2,2782
0,5 R² = 0,9803
0
0 10 20 30 40 50 60 70
Zaman (s)
Şekil 4.33 : 9 bileşiğinin DMSO içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne
ait UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
1,1
ADMA Absorbansı
0,9
y = -6E-05x + 1,0451
0,8
R² = 0,9848
0,7
0 500 1000 1500 2000 2500 3000
Zaman (s)
Şekil 4.34 : 7 bileşiğinin su içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne ait
UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
87
1,15
ADMA Absorbansı
1,1
1,05
y = -3E-05x + 1,1396
R² = 0,9661
1
0 500 1000 1500 2000 2500
Zaman (s)
Şekil 4.35 : 8 bileşiğinin su içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne ait
UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
ADMA Absorbansı
0,95
y = -4E-05x + 1,0191
R² = 0,9695
0,9
0 500 1000 1500
Zaman (s)
Şekil 4.36 : 9 bileşiğinin su içerisinde singlet oksijen kuantum verimi ölçümüne ait
UV-Vis absorpsiyon spektrumu.
88
4.11 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Floresans Özelliklerinin
İncelenmesi
700 0,7
600 0,6
Emisyon
0,5
500 Absorbans
0,4
Eksitasyon
Absorbans
Şiddet (a.u.)
400
0,3
300
0,2
200
0,1
100 0
0 -0,1
500 550 600 650 700 750 800
Dalgaboyu (nm)
89
Şekil 4.38 : 7 bileşiğinin DMSO içerisinde alınan floresans ömür spektrumu.
90
Şekil 4.39 : 7 bileşiğinin CT-DNA ile titreşimini gösteren UV-Vis absorpsiyon
spektrumu.
91
Şekil 4.41 : 9 bileşiğinin CT-DNA ile titreşimini gösteren UV-Vis absorpsiyon
spektrumu.
Hem H-agregatlar hem de monomerik Pc’ler DNA ile etkileşime girerler. Fakat sulu
çözeltide monomerik yapı baskındır. 7 bileşiği 1200 µL DNA, 8 bileşiği 1800 µL DNA
ve 9 bileşiği1400 µL DNA ile maksimum etkileşime girmiştir. H agregatlar DNA
ilavesiyle seyreldikçe monomerik yapılar baskın hale gelmiştir. 8 ve 9 bileşiklerindeki
asetat grupları da ayrıca DNA ile etkileşime girmiştir. 8 bileşiğinde, DNA ilavesiyle
monomerlere ait Q bandı absorbansıyla agregatlara ait omuz piki absorbans
değerlerinin arasındaki fark açılmıştır. Bu durum, sulu çözeltide monomerlerin daha
baskın olduğunu göstermiştir. PEGME gruplarının agregasyona sebep olduğu ancak
asetat gruplarının Pc’lerin birbirinden uzaklaşmasını sağlayarak agregasyonu azalttığı
düşünülmüştür.
Bileşiklere ait CT-DNA bağlanma sabitleri (Ka ) (4.1)’de formül ile hesaplanmıştır.
𝐶 𝐶 1
= + (4.2)
∆∈𝑎 ∆∈𝑎 ∆∈ 𝐾𝑎
∆∈ = [∈𝑏 -∈𝑓 ]
92
Ka = Pc-DNA bağlanma sabiti
Bir maddenin DNA’yı tercih edip etmediğini anlamak için uygulanan yöntemlerden
biri de ticari olarak kullanılan bir DNA boyası varlığında, sentezlenen maddenin ilave
edilip, DNA-boya kompleksinin floresansındaki artış veya azalışı takip etmektir. Ka
değerlerini doğrulamak için DNA sarmalının içine girebilen ve UV ışığı altında
DNA’nın görünmesini sağlamak amacıyla kullanılan SYBR GREEN I (SYBR)
boyasından yararlanılmaktadır. SYBR Green boyasının DNA ile emisyonu 520 nm’de
oldukça fazladır. SYBR ticari olarak 10000X derişimde kullanılmaktadır. Bu değer
seyreltilerek 1X değerinde çalışılmıştır. In(III) ve Lu (III) metalleri içeren bileşiklerin,
bu metallerin gösterdiği ağır atom etkisinden dolayı floresans ölçümleri alınamamıştır.
3×10-5 M, 1500µL DNA ile 1000µL 1X SYBR boyasının olduğu kuartz küvete 1.15,
2.22, 3.21, 4.14, 5, 5.81, 6.56, 7.27 µM derşimlerinde 100’er µL 7 maddesinden ilave
edilmiştir.
𝐹0
= 1 + 𝐾𝑠𝑣 [𝑃𝑐] (4.2)
𝐹
(4.2) eşitliğinde,
[Pc]’ye karşı F0/F grafiği çizilmiştir. Grafiğin eğimi Ksv (Stern Volmer) sabitini
vermektedir.
93
SYBR-DNA kompleksinin bulunduğu ortama ZnPc(PEGME2000)4 bileşiği (7) ilave
edildiğinde, SYBR-DNA kompleksinin floresans şiddeti artmıştır (Şekil 4.42).
1,16
1,15
1,14
1,13
F(DNA-SYBR)
Çift sarmal DNA’nin termal denaturasyon sıcaklığı (Tm), iki protein zinciri arasındaki
hidrojen bağlarının koparak iki adet tek zincirin oluştuğu sıcaklık olarak
tanımlanmaktadır (Duan ve diğ, 2009). 7, 8 ve 9 bileşikleri DNA ile etkileşime
girdikleri oranda bu Tm değeri değişecektir. Bu amaçla, 3 mL’lik küvete 2500 µL ve
8.76×10-5 M CT-DNA ile 1500 µL, 6×10-5 M 7, 8 veya 9 bileşiklerinden konulduktan
sonra 5’er derecelik artışlarla sıcaklık artışına geçilmiştir. DNA ve Pc içeren
çözeltilerin 25ºC’den 90ºC’ye kadar olan sıcaklık aralığında 200-350 nm aralığındaki
UV-Vis absorbansları ölçülerek, 260 nm’deki UV-Vis absorbans değerleri
belirlenmiştir (Şekil 4.43, Şekil 4.44, Şekil 4.45).
94
Şekil 4.43 : 7 bileşiğinin varlığında CT-DNA’nın termal bozunma sıcaklığının
değişim profilinin UV-Vis spektrumu ile incelenmesi.
95
Şekil 4.45 : 9 bileşiğinin varlığında CT-DNA’nın termal bozunma sıcaklığının
değişim profilinin UV-Vis spektrumu ile incelenmesi.
Bu çalışmada, 260 nm’deki absorbans değişimi takibi sonucunda çift sarmal DNA
denaturasyon sıcaklığı 70.1±1°C bulunmuştur. 7, 8 ve 9 bileşiklerinin varlığında,
sıcaklık arttıkça, DNA’nın ortamdaki uzun, esnek ve serbest harekete sahip PEGME
zincirleri ile sarılması sonucunda, çift sarmalın daha kompakt küre haline gelerek
kararlılığını arttırdığı görülmüştür. PEG yapısının, DNA kondenzasyonu için
kullanılan özel bir madde olduğu bilinmektedir. Yani DNA sarmalının halka şeklinden
küre şekline dönüşüp (coil-sphere induction) ortamda çökmesini sağlar. Bu çalışmada
da, ortamda PEGME zincirlerinin oluşu DNA’nın kendi içinde katlanıp
düzenlenmesine ve daha küresel yapıya dönüşmesine sebep olmuş; bu da erime
eğrilerinde net şekilde görülmüştür (Şekil 4.46).
96
Şekil 4.46 : 7, 8 ve 9 bileşikleri varlığında CT-DNA’nın termal bozunma eğrileri
Şekil 4.47 : DNA’nın molekül içi düzenlenmesi sonucunda oluşan motifler (Maiti ve
diğ, 2011).
97
Şekil 4.48 : DNA’nın farklı motiflerinin erime eğrileri (Maiti ve diğ, 2011).
98
7, 8 ve 9 bileşiklerinin DNA ile olan etkileşimleri ayrıca termodinamik parametreler
kullanılarak belirlenmiştir. Bu amaçla Pc-DNA çözeltilerinin 293.15, 303.15, 313.15,
323.15, 333.15 K sıcaklıklarındaki UV-Vis absorpsiyon spektrumları alınarak DNA
ve Pc ler arasındaki reaksiyonların kompleks denge sabitleri belirlenmiştir.
Van’t Hoff eşitliği In K ya karşı 1/T grafiği çizildiğinde lineer bir doğru vermektedir.
𝑑 ln 𝐾
1
= −∆𝐻 0 /𝑅
𝑑 (𝑇) (4.5)
Doğrunun eğimi –ΔH0/R değerine eşittir. ΔS0 ise aşağıdaki eşitlik (4.6) kullanılarak
hesaplanmıştır.
99
kuvvettir. Hidrofobik R grubununa sahip amino asitler apolardır ve bu tür amino asitler
polipeptidin su ile temas etmediği iç kısımlarda bulunurlar (Şekil 4.49).
Termodinamik değerler (standart entalpi; ΔH°, entropi; ΔS° ve Gibbs Serbest Enerjisi;
ΔG°) bu etkileşimlerin kendiliğinden olup olmadığı ve türü hakkında bilgi
vermektedir. ΔH° > 0 ve ΔS° > 0 olduğu takdirde etkileşimin hidrofobik; ΔS° < 0 ve
ΔH° < 0 olduğu takdirde moleküller arası hidrojen bağı oluştuğu ve van der Waals
kuvvetleri; ΔH° < 0 ve ΔS° > 0 olması durumunda ise baskın etkileşim türünün
elektrostatik olduğu öngörülmüştür (Ross ve Subramanian, 1981; Breslauer ve diğ,
1987; Corda ve diğ, 2011). Buna göre, 7, 8 ve 9 bileşiklerinin, DNA ile kendiliğinden
(ΔG°<0) ve ΔH° > 0 ile ΔS° > 0 olduğundan, hidrofobik etkileşime girdikleri
görülmüştür (Çizelge 4.5).
100
PEGME2000 uzun zincirlerinin serbest hareketinden dolayı DNA heliksini sarması
sonucu, kararlı 7(8,9)-DNA komplekslerinin entropi-kontrollü, spontane ve non-
spesifik bağlanmayla oluştuğu düşünülmüştür (Şekil 4.50).
ZnPc(PEGME2000)4
293.15 2100.9 -18.550 11.34 29.89
303.15 2314.8 -19.573 11.34 30.91
313.15 2680.5 -20.593 11.34 31,94
323.15 3035.8 -21.613 11.34 32.96
333.15 3717.1 -22.634 11.34 33.98
InPc(PEGME2000)4
293.15 68.0 -10.516 53.91 64.42
303.15 129.6 -12.715 53.91 66.62
313.15 493.4 -14.914 53.91 68.82
323.15 612.5 -17.112 53.91 71.02
333.15 847.5 -19.311 53.91 73.22
LuPc(PEGME2000)4
293.15 24.0 -16.244 22.28 38.52
303.15 1111.6 -17.559 22.28 39.84
313.15 1405.5 -18.874 22.28 41.15
323.15 1621.4 -20.189 22.28 42.46
333.15 2580.3 -21.504 22.28 43.78
101
ve dolayısıyla çinko türevine oranla Kb değerlerinin daha yüksek bulunmasına sebep
olduğu saptanmıştır.
Kanda bulunan önemli plazma proteinlerden olan BSA molekülü, ilaç salınımı
proseslerinde hedef alınan bir yapıdır. Ftalosiyaninler fotoalgılayıcılar olarak BSA
molekülüne bağlanma eğilimi göstermektedirler ve bu sayede hedeflenen dokulara
transferleri mümkün olmaktadır. Bu nedenle BSA’nın fotoalgılayıcıya bağlanma
özelliklerinin belirlenmesi PDT çalışmaları açısından çok önemlidir.
102
Şekil 4.51 : 7 bileşiğinin ilavesiyle BSA’nın floresans emisyon spektrumundaki
değişikliklerin incelenmesi .
103
Şekil 4.53 : 9 bileşiğinin ilavesiyle BSA’nın floresans emisyon spektrumundaki
değişikliklerin incelenmesi.
Şekil 4.54’te verilen grafikteki eğimlerden, 7 ve 8 bileşiklerine ait Ksv değeri 10x105
M-1 olarak hesaplanmış, 9 bileşiği için ise bu değer 99x105 M-1 olarak bulunmuştur.
Bulunan değerler, literatürde verilen farklı metalleri ve sübstitüentleri içeren Pc
türevlerinin sonuçları ile uyumlu çıkmıştır (Ogunsipe ve diğ, 2004).
104
7, 8 ve 9 bileşiklerine ait bimoleküler sönümlenme sabiti (kq) değerleri Çizelge 4.6’da
verilmiştir. Elde edilen sonuçlara göre, oda sıcaklığında Pc bileşiklerinin BSA
sönümleme mekanizmalarının, difüzyon kontrollü olmadığı saptanmıştır (Murov ve
diğ, 1993). Pc-BSA komplekslerine ait bağlanma sabitleri (kb) ve BSA üzerindeki
bağlanma yerlerinin sayısı (n) literatüre göre hesaplanmıştır (Çolak ve diğ, 2016).
Şekil 4.55’te grafikteki eğimlerden n değerleri ve kesimlerden kb değerleri
hesaplanmıştır. Sonuçlar, Pc-BSA etkileşimleri için literatürde verilen değerler ile
uyumlu bulunmuştur (Çolak ve diğ, 2016).
7 10 1 1.23 1.428
8 10 1 1.44 1.53
9 99 9.9 1.38 1.42
Şekil 4.55 : 7, 8 ve 9 bileşiklerinin BSA ile etkileşimine göre bağlanma sabitleri (kb)
ve bağlanma sayılarını (n) veren eğriler.
105
4.14 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Termal Özelliklerinin
İncelenmesi
DSC ölçümleri, -10°C ile 80°C sıcaklık aralığında 10°C/dakika ısıtma ve soğutma
hızlarında azot atmosferinde 2 tekrarlı olarak gerçekleştirilmiştir. Termal gravimetrik
analizler, oda sıcaklığından 700°C’ye kadar, 10°C/dakika ısıtma hızında ve 150
mL/dakika akdış hızındaki azot atmosferinde gerçekleştirilmiştir.
Isınma
Soğuma
-10 10 30 50 70
Sıcaklık ( C)
DSC analizi sonucunda, 7 bileşiğinin 49.7°C ve 55.5°C sıcaklık aralığında 115 J.g-1
ısı soğurma kapasitesine sahip olduğu ve 53.9°C’de erimeye başladığı gözlenmiştir.
Soğumaya geçişte, 31.3°C ve 35.6°C sıcaklık aralığında -108 J.g-1’e karşılık gelen bir
soğuma eğrisi gözlenmiştir (Şekil 4.57).
106
Isı Akış yönü
Endo
Isınma
Soğuma
-10 10 30 50 70
Sıcaklık ( C)
Isınma
Soğuma
-10 10 30 50 70
Sıcaklık ( C)
107
gözlenmiştir (Şekil 4.59). Bu dört farklı sıcaklık değerinin, 9 maddesinin dört tane
farklı izomerinden dolayı oluştuğu düşünülmüştür.
Isınma
Soğuma
-10 10 30 50 70
Sıcaklık ( C)
100%
80%
6 7
Kütle (ağ. %)
60%
40% 8 9
20%
0%
50 150 250 350 450 550
Sıcaklık ( C)
Şekil 4.60 : 6, 7, 8 ve 9 bileşiklerinin TGA grafiği.
108
4.15 PEGME2000 Sübstitüe Ftalosiyanin Bileşiklerinin Polarize Mikroskop
Görüntüleri
109
Şekil 4.63 : 9 bileşiğinin polarize optik mikroskop görüntüsü.
110
KAYNAKLAR
Achard, M., Acherar, S., Althuser, P., Andre, J. C., Arnoux, P., Heyob, M. B., ...
Youssef, Z. (2017). PDTeam’s Project: Targeting to improve PDT
selectivity, Abstracts / Photodiagnosis and Photodynamic Therapy, 17,
A4-A78.
Ağar, E., Şaşmaz, S., Keskin, İ., & Akdemir, N. (1998). Synthesis and
characterization of new tetraaza-bridged polymeric phthalocyanines,
Dyes and Pigments, 36(3), 249-258. doi: 10.1016/S0143-
7208(97)00022-3.
Agostinis, P., Berg, K., Cengel, K. A., Foster, T. H., Girotti, A. W., Gollnick, S.
O., … Golab, J. (2011). Photodynamic therapy of cancer : an update,
American Cancer Society, 61, 250-281. doi: 10.3322/caac.20114.
Akkaya, E. U., Atılgan, S., Doğan, A. L., Dost, Z., & Guc, D. (2006). Water soluble
distyryl-boradiazaindacenes as efficient photosensitizers for
photodynamic therapy, Chemical Communications., 4398-4400. doi:
10.1039/B612347C.
Allemann, E., Brasseur, N., Benrezzak, O., Rousseau, J., Kudrevich, S. V., Boyle,
R. W., ... Van Lier, J. E. (1995). PEG-coated poly (lactic acid )
nanoparticles for the delivery of hexadecafluoro zinc phthalocyanine to
EMT-6 mouse mammary tumours, Journal of Pharmacy and
Pharmacology, 47, 382-387. doi: 10.1111/j.2042-
7158.1995.tb05815.x.
Antonio Duro, J., de la Torre, G., Barbera, J., Serrano, J. L., & Torres, T. (1996).
Synthesis and Liquid-Crystal Behavior of Metal-Free and Metal-
Containing Phthalocyanines Substituted with Long-Chain Amide
Groups, Chemistry of Materials, 8(5), 1061-1066. doi:
10.1021/cm950478f.
Ashwood, & E. R., Burtis, C. A. (1999). Tietz Textbook of Clinical Chemistry, W. B.
Saunders Company, Philadelphia, Pennsylvania.
Atilla, D., Saydan, N., Durmuş, M., Gürek, A. G., Khan, T., Rück, A., ... Ahsen,
V. (2007). Synthesis and photodynamic potential of tetra- and octa-
triethyleneoxysulfonyl substituted zinc phthalocyanines, Journal of
Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, 186(2-3), 298-307.
doi: 10.1016/j.jphotochem.2006.08.022.
Baeyer, A. (1886). Ueber ein condensationsproduct von pyrrol mit aceton, European
Journal of Inorganic Chemistry, 19(2), 2184-2185. doi:
10.1002/cber.188601902121.
Bağda, E., Bağda, E., & Durmuş, M. (2017). G-quadruplex and calf thymus DNA
interaction of quaternized tetra and octa pyridyloxy substituted indium
111
(III) phthalocyanines, Journal of Photochemistry and Photobiology B:
Biology, 175, 9-19. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2017.08.008.
Bağda, E., Yabaş, E., & Bağda, E. (2017). Analytical approaches for clarification of
DNA-double decker phthalocyanine binding mechanism: As an
alternative anticancer chemotherapeutic, Spectrochimica Acta - Part A:
Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 172, 199-204. doi:
10.1016/j.saa.2016.01.019.
Bai, M., Lo, P. C., Ye, J., Wu, C., Fong, W. P., & Ng, D. K. P. (2011). Facile
synthesis of pegylated zinc(ii) phthalocyanines via transesterification
and their in vitro photodynamic activities, Organic & Biomolecular
Chemistry, 9(20), 7028-7032. doi: 10.1039/c1ob05955f.
Bandera, Y., Burdette, M. K., Shetzline, J. A., Jenkins, R., Creager, S. E., &
Foulger, S. H. (2016). Synthesis of water soluble axially disubstituted
silicon (IV) phthalocyanines with alkyne & azide functionality, Dyes
and Pigments, 125, 72-79. doi: 10.1016/j.dyepig.2015.10.007.
Barata, J. F. B., Zamarron, A., Neves, M. G. P. M. S., Faustino, M. A. F., Tome,
A. C., Cavaleiro, J. A. S., ... Sanz-Rodriguez, F. (2015).
Photodynamic effects induced by meso-tris(pentafluorophenyl)corrole
and its cyclodextrin conjugates on cytoskeletal components of HeLa
cells, European Journal of Medicinal Chemistry, 92, 135-144. doi:
10.1016/j.ejmech.2014.12.025.
Barker, C. A., Findlay, K. S., Bettington, S., Batsanov, A. S., Perepichka, I. F.,
Bryce, M. R., & Beeby, A. (2006). Synthesis of new axially-
disubstituted silicon-phthalocyanine derivatives: optical and structural
characterisation, Tetrahedron, 62(40), 9433-9439. doi:
10.1016/j.tet.2006.07.046.
Barton, J. K. & Hall, D. B. (1997). Sensitivity of DNA-mediated electron transfer to
the intervening pi-stack: A probe for the integrity of the DNA base
stack, Journal of the American Chemical Society., 119, 5045-6. doi:
10.1021/ja970366k.
Bechet, D., Auger, F., Couleaud, P., Marty, E., Ravasi, L., Durieux, N., ... Heyob,
M. B. (2015). Multifunctional ultrasmall nanoplatforms for vascular-
targeted interstitial photodynamic therapy of brain tumors guided by
real-time MRI, Nanomedicine, Nanotechnology, Biology, and
Medicine, 11(3), 657-670 doi: 10.1016/j.nano.2014.12.007.
Ben-Hur, E. & Rosenthal, I. (1989). In Phthalocyanines:Properties and
Applications, Vol. 1, Leznoff C. C, Lever A. B. P. (Eds.) Wiley-VCH:
New York, Chapter 6.
Morris, R. L., Azizuddin, K., Lam, M., Berlin, J., Nieminen, A. L., Kenney, M.
E., ... Oleinick, N. L. (2003). Fluorescence resonance energy transfer
reveals a binding site of a photosensitizer for photodynamic therapy,
Cancer Research., 63(17), 5194-5197.
Bilgin, A., Yağcı, Ç., Mendi, A., & Yıldız, U. (2007). Synthesis and characterization
of new polymeric phthalocyanines substituted with diaza-18-crown-6
macrocycles through ethyleneoxy bridges, Polyhedron, 26(3), 617-625.
doi: 10.1016/j.poly.2006.08.027.
112
Bilgin, A., Yağcı, Ç., Mendi, A., & Yıldız, U. (2008). Synthesis and characterization
of new monomeric and polymeric phthalocyanines, Journal of Applied
Polymer Science, 110, 2115-2126 doi: 10.1002/app.28774.
Bilgin, A., Yanmaz, D., & Yalcı, Ç. (2014). Synthesis and properties of novel
polymeric metal-free and metallophthalocyanines containing
peripherally long 1,2-bis[(3-oxapropyl)oxa]benzene derivatives,
Turkish Journal of Chemistry, 38(6), 1135-1152 doi: 10.3906/kim-
1407-15.
Bischoff, G., & Hoffmann, S. (2002). DNA-binding of drugs used in medicinal
therapies, Current Medicinal Chemistry, 9, 312-348. doi:
10.2174/0929867023371085.
Bonnett, R. (2000). In Chemical Aspects of Photodynamic Therapy, Gordon and
Breach Science Publishers, London.
Bulin, A. L., Truillet, C, Chouikrat, Lux, F., Frochot, C., Amans, D., ... Dujardin,
C. (2013). X-ray induced singlet oxygen activation with
nanoscintillator-coupled porphyrins, The Journal of Physical
Chemistry, 117(41), 21583-21589. doi: 10.1021/jp4077189.
Butje, K., & Nakamato, K. (1990). Interaction of water-soluble Cu(II), Ni(II), and
Co(III) porphyrins with polynucleotides, Journal of Inorganic
Biochemistry, 39(1), 75-92. doi: 10.1016/0162-0134(90)80016-Q.
Breslauer, J. K., Remeta, D. P., Chou, W., Ferrante, R., Curry, J., Zaunczkowski,
D., ... Marky, L. A. (1987). Enthalpy-entropy compensations in drug-
DNA binding studies, Proceedings of the National Academy of
Sciences, 84(24), 8922-8926. doi: 10.1073/pnas.84.24.8922.
Calzavara, P. G. (1999). Photodynamic therapy: The present and the future, J. Eur.
Acad. Dermatol. Venereol 2 (Suppl 2), 71.
Can, O. S., Kuş, A., Kaya, E. N., Durmuş, M., & Bulut, M. (2017). Synthesis and
characterization of 6,8-di-tert-butyl-3-[p-(propynyl)phenoxy]coumarin
substituted phthalocyanines and investigation of their photophysical
and photochemical properties, Inorganica Chimica Acta, 465, 31-37.
doi: 10.1016/j.ica.2017.05.031.
Carvalho, C. M. B., Brocksom, T. J., & de Oliveira, K. T. (2013)
Tetrabenzoporphyrins: synthetic developments and applications,
Chemical Society Reviews, 42(8), 3302. doi: 10.1039/c3cs35500d.
Castano, A. P., Demidova, T. N., & Hamblin, M. R. (2004). Mechanisms in
photodynamic therapy: Part one - Photosensitizers, photochemistry and
cellular localization, Photodiagnosis and Photodynamic Therapy, 1(4),
279-293. doi: 10.1016/S1572-1000(05)00007-4.
Chandra, S., & Gupta, K. (2002). Twelve-, fourteen- and sixteen-membered
macrocyclic ligands and a study of the effect of ring size on ligand field
strength, Transition Metal Chemistry, 27(3), 329-332. doi:
10.1023/A:1014898706298.
Chen, K., Pan, S., Zhuang, X., Lv, H., Que, S., Xie, S., ... Peng, Y. (2016). Effect
of diblock copolymer properties on the photophysical properties of
113
dendrimer silicon phthalocyanine nanoconjugates, Journal of
Nanoparticle Research, 18(7), 1-9. doi: 10.1007/s11051-016-3444-8.
Cho, I. & Lim, Y. (1988). Synthesis and morphology of new discogenic
phthalocyanine derivatives, Molecular Crystals and Liquid Crystals
Incorporating Nonlinear Optics, 154, 9-26. doi:
10.1080/00268948808078718.
Clarkson, G. J., Cook, A., McKeown, N. B., Treacher, K. E., & Ali-Adib, Z.
(1996). Synthesis and characterization of mesogenic phthalocyanines
containing a single poly(oxyethylene) side chain: An example of steric
disturbance of the hexagonal columnar mesophase, Macromolecules,
29(3), 913-917. doi: 10.1021/ma951195b.
Corda, E., Girotti, S., Gonzalez-Ruiz, V., Martin, A., Mussardo, P., Olives, A. I.,
& Rajesh, J. (2011). Study of non-covalent interactions of luotonin A
derivatives and the DNA minor groove as a first step in the study of
their analytical potential as DNA probes, Analytical and Bioanalytical
Chemistry, 400, 321-327. doi: 10.1007/s00216-010-4640-5.
Curtis, N. F. (1968). Macrocyclic coordination compounds formed by condensation
of metal-amine complexes with aliphatic carbonyl compounds,
Coordination Chemistry Reviews, 3(1), 3-47. doi: 10.1016/S0010-
8545(00)80104-6.
Çolak, S., Durmuş, M., & Yildiz, S. Z. (2016). Tetrakis{2-[N-((3-
morpholino)propyl)carbamate]oxyethyl} zinc(II) phthalocyanine and
its water soluble derivatives: Synthesis, photophysical, photochemical
and protein binding properties, Journal of Photochemistry and
Photobiology A: Chemistry, 325, 125-134. doi:
10.1016/j.jphotochem.2016.04.006.
de Almeida, S. M. V., Ribeiro, A. G., de Lima Silva, G. C., Ferreira Alves, J. E.,
Beltrao, E. I. C., de Oliveira, J. F., ... Alves de Lima, M. do C.
(2017). DNA binding and Topoisomerase inhibition: How can these
mechanisms be explored to design more specific anticancer agents?,
Biomedicine & Pharmacotherapy, 96, 1538-1556. doi:
10.1016/j.biopha.2017.11.054.
Dilkes, M. G, DeJode, M. L, Rowntree-Taylor, A., McGilligan, J. A, Kenyon, G.
S, & McKelvie, P. (1996). m-THPS photodynamic therapy for head
and neck cancer, Lasers in Medical Science, 11(1), 23-29. doi:
10.1007/BF02161289.
Dinçer, H., Mert, H., Çalışkan, E., Atmaca, G. Y., & Erdoğmuş, A. (2015).
Synthesis and photophysicochemical studies of poly(ethylene glycol)
conjugated symmetrical and asymmetrical zinc phthalocyanines,
Journal of Molecular Structure, 1102, 190-196. doi:
10.1016/j.molstruc.2015.08.067.
Duan, W., Wang, Z., & Cook, M. J. (2009). Synthesis of tetra (trimethylammonio)
phthalocyaninato zinc tetra iodide, and a spectrophotometric
investigation of its interaction with calf thymus DNA, Journal of
Porphyrins and Phthalocyanines, 13, 1255-1261. doi:
10.1142/S1088424609001625.
114
Dudkin, S. V., Makarova, E. A., & Lukyanets, E. A. (2016). Synthesis of chlorins,
bacteriochlorins and their tetraaza analogues, Russian Chemical
Reviews, 85(7), 700-730. doi: 10.1070/RCR4565.
Dumoulin, F., Ali, H., Ahsen, V., & van Lier, J. E. (2011). Preparation of
amphiphilic glycerol-substituted zinc phthalocyanines using copper-
free Sonogashira cross-coupling in aqueous medium, Tetrahedron
Letters, 52, 4395-4397. doi: 10.1016/j.tetlet.2011.06.010.
Durmuş, M., Ahsen, V., & Nyokong, T. (2007). Photophysical and photochemical
studies of long chain-substituted zinc phthalocyanines, Journal of
Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, 186(2-3), 323-329.
doi: 10.1016/j.jphotochem.2006.08.025.
Eldar, M., Yerushalmi, Y., Kessler, E., Scheinowitz, M., Goldbourt, U., Ben Hur,
E., ... Battler, A. (1990). Preferential uptake of a water-soluble
phthalocyanine by atherosclerotic plaques in rabbits, Atherosclerosis,
84(2-3), 135-139. doi: 10.1016/0021-9150(90)90083-U.
Engel, M. K., Bassoul, P., Bosio, L., Lehmann, H., Hanack, M., & Simon, J.
(1993). Mesomorphic molecular materials. Influence of chain length on
the structural properties of octa-alkyl substituted phthalocyanines,
Liquid Crystals, 15(5), 709-722. doi: 10.1080/02678299308036489.
Eva, M. M., Haisch, P., Vazquez, P., & Torres, T. (1998). Synthesis and
characterization of tetraethynylphthalocyanines, Tetrahedron, 54(17),
4397-4404. doi: 10.1016/S0040-4020(98)00153-7.
Finikova, O. S., Cheprakov, A. V., Beletskaya, I. P., Carroll, P. J., & Vinogradov,
S. A. (2004). Novel versatile synthesis of substituted
tetrabenzoporphyrins, The Journal of Organic Chemistry, 69(2), 522-
535. doi: 10.1021/jo0350054.
François, A., Laroche, A., Pinaud, N., Salmon, L., Ruiz, J., Robert, J., & Astruc,
D. (2011). Encapsulation of docetaxel into PEGylated gold
nanoparticles for vectorization to cancer cells, ChemMedChem, 6,
2003-2008. doi: 10.1002/cmdc.201100311.
Fujikake, H. & Murashige, T. (2004). Time-of-flight analysis of charge mobility in
a Cu-phthalocyanine-based discotic liquid crystal semiconductor,
Applied Physics Letters, 85(16), 3474-3476. doi: 10.1063/1.1805178.
Fukushima, K., Tabata, K., & Okura, I. (1998). Photochemical properties of water-
soluble fluorinated zinc phthalocyanines and their photocytotoxicity
against HeLa cells, Journal of Porphyrins and Phthalocyanines, 2(3),
219-222. doi: 10.1002/(SICI)1099-1409.
Gaiduk, M. I., Ghissov, V. I., Grigryants, V. V., Mirnov, A. F., Rumyantsera, V.
D., & Sukhin, G. M. (1990). Fiber-Laser Ir luminescence diagnostics
of malignant-tumors using rare-earth porphyrins, Journal of
Photochemistry and Photobiology B: Biology, 7(1), 15-20. doi:
10.1016/1011-1344(90)85139-N.
Gattuso, H., Duchanois, T., Besancenot, V., Barbieux, C., Assfeld, X., Becuwe, P.,
... Monari, A. (2015). Interaction of iron II complexes with B-DNA.
115
insights from molecular modeling, spectroscopy, and cellular biology,
Frontiers in Chemistry, 3, 1-12. doi: 10.3389/fchem.2015.00067.
Gijsens, A., Derycke, A., Missiaen, L., De Vos, D., Huwyler, J., Eberle, A., & De
Witte, P. (2002). Targeting of the photocytotoxic compound A1PcS4
to Hela cells by transferrin conjugated PEG-liposomes, International
Journal of Cancer, 101(1), 78-85. doi: 10.1002/ijc.10548.
Güngör, Ö., Özpınar, G. A., Durmuş, M., & Ahsen, V. (2016). The effect of
“on/off” molecular switching on the photophysical and photochemical
properties of axially calixarene substituted activatable silicon(IV)
phthalocyanine photosensitizers, Dalton Transactions, 45, 7634-7641.
doi: 10.1039/c6dt00874g.
Hahn, U., Setaro, F., Ragas, X., Gray-Weale, A., Nonell, S., & Torres, T. (2011).
Microenvironment-switchable singlet oxygen generation by axially-
coordinated hydrophilic ruthenium phthalocyanine dendrimers,
Physical Chemistry Chemical Physics, 13(8), 3385-3393. doi:
10.1039/C0CP01015D.
Hamblin, M. R., Miller, J. L., Rizvi, I., Loew, H. G., & Hasan, T. (2003).
Pegylation of charged polymer-photosensitiser conjugates: Effects on
photodynamic efficacy, British Journal of Cancer, 89(5), 937-943. doi:
10.1038/sj.bjc.6601210.
Hanack, M., Beck, A., & Lehmann, H. (1987). Synthesis of Liquid-Crystalline
Phthalocyanines, Synthesis, 8, 703-705. doi: 10.1055/s-1987-28050.
Hofman, J. W., Van Zeeland, F., Turker, S., Talsma, H., Lambrechts, S. A. G.,
Sakharov, D. V., ... Van Nostrum, C. F. (2007). Peripheral and axial
substitution of phthalocyanines with solketal groups: Synthesis and in
vitro evaluation for photodynamic therapy, Journal of Medicinal
Chemistry, 50(7), 1485-1494. doi: 10.1021/jm061136w.
Hönigsmann, H., Szeimies, R. M, & Knobler, R. (2008). Photochemotherapy and
Photodynamic Therapy, in Fitzpatrick’s Dermatology in General
Medicine, Ed. Wolf K., Goldsmith L., Gilchrest B., Paller A., Leffell D.
7. Baskı. New York: Mc Graw Hill, 2249-2262.
Huang, J. D., Wamg, S. Q., Lo, P. C., Fong, W. P., & Ng, D. K. P. (2004).
Halogenated silicon(IV) phthalocyanines with axial poly(ethylene
glycol) chains. Synthesis, spectroscopic, complexation with bovine
serum albumin and in vitro photodynamic activities, New Journal of
Chemistry, 28, 348-354. doi: 10.1039/b307934a.
Idowu, M., & Nyokong, T. (2009). Interaction of water-soluble CdTe quantum dots
with octacarboxy metallophthalocyanines: A photophysical and
photochemical study, Journal of Luminescence, 129(4), 356-362. doi:
10.1016/j.jlumin.2008.11.005.
Ishii, K. (2012). Functional singlet oxygen generators based on phthalocyanines,
Coordination Chemistry Reviews, 256(15-16), 1556-1568. doi:
10.1016/j.ccr.2012.03.022.
116
Jager, E. & Uhlig, E. (1964). Ein neues nickelchelat mit allseitig geschlossenem
ring‐ system, Zeitschrift für Chemie, 4(11), 437. doi:
10.1002/zfch.19640041117.
Jeong, J., Kumar, R. S., Mergu, N., & Son, Y. A. (2017). Photophysical,
electrochemical, thermal and aggregation properties of new metal
phthalocyanines, Journal of Molecular Structure, 1147, 469-479. doi:
10.1016/j.molstruc.2017.06.125.
Jin, Y., Zhang, B., Kang, H., Du, L., & Li, M. (2015). Nanostructures of an
amphiphilic zinc phthalocyanine polymer conjugate for photodynamic
therapy of psoriasis, Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 128, 405-
409. doi: 10.1016/j.colsurfb.2015.02.038.
Kenney, M. E., Oleinick, N. L., & Rihter, B. D. (1992). Phthalocyanine
photosensitizers for photodynamic therapy and methods for their
synthesis and use, U. S. Patent, WO9201753.
Köksoy, B., Orman, E. B., Kuruca, H., Bulut, M., Durmuş, M., & Özkaya, A. R.
(2016). Mono and double-decker lutetium phthalocyanines bearing
iodine groups: electrochemical and electrochromic properties, Journal
of The Electrochemical Society, 163(10), H927-H936 doi:
10.1149/2.0421610jes.
Lebedeva, N. S., Gubarev, Y. A., Vyugin, A. I., & Koifman, O. I. (2015).
Investigation of interaction between alkoxy substituted phthalocyanines
with different lengths of alkyl residue and bovine serum albumin,
Journal of Luminescence, 166, 71-76. doi:
10.1016/j.jlumin.2015.04.041.
Leznoff, C.C., & Lever, A.B.P. (1996). Phthalocyanines: properties and
applications. VCH.
Li, H., Fronczek, F. R., & Vicente, M. G. H. (2011). Pegylated phthalocyanines:
Synthesis and spectroscopic properties, Tetrahedron Letters, 52(50),
6675-6678. doi: 10.1016/j.tetlet.2011.10.002.
Li, H., Nguyen, N., Fronczek, F. R., & Vicente, M. G. H. (2009). Syntheses and
properties of octa-, tetra- and di-hydroxy-substituted phthalocyanines,
Tetrahedron, 65(17), 3357-3363. doi: 10.1016/j.tet.2009.02.012.
Li, M., Khoshdel, E., & Haddleton, D. M. (2013). Synthesis of water soluble
PEGylated (copper) phthalocyanines via Mitsunobu reaction and Cu(i)-
catalysed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) "click" chemistry,
Polymer Chemistry, 4(16), 4405-4411. doi: 10.1039/c3py00609c.
Li, Y. H., Zhao, D., Li, Y., Liu, Y., Duan, Q., & Kakuchi, T. (2107). Synthesis of
water-soluble and thermoresponsive phthalocyanine ended block
copolymers as potential photosensitizer, Dyes and Pigments, 142, 88-
89. doi: 10.1016/j.dyepig.2017.03.010.
Liang, Q., Zhao, P., Woo, J. W., Park, Y. S., Niu, L., & Zhang, F. (2010). Synthesis,
characterization and electrical properties of novel steric phthalocyanine
polymers, Macromolecular Research, 18(2), 113-119 doi:
10.1007/s13233-009-0059-2.
117
Lindoy, L. F., & Busch , D. H. (1971). In Preparative Inorganic Reactions, Jolly, W.
L., Ed.; Wiley-Interscience, New York, 6, 1.
Liu, C., Zhu, Y., & Tang, M. (2016). Theoretical studies on binding modes of copper-
based nucleases with DNA, Journal of Molecular Graphics and
Modelling, 64, 11-29. doi: 10.1016/j.jmgm.2015.12.003.
Liu, J. Y., Jiang, X. J., Fong, W. P., & Ng, D. K. P. (2008). Highly photocytotoxic
1,4-dipegylated zinc(II) phthalocyanines. Effects of the chain length on
the in vitro photodynamic activities, Organic & Biomolecular
Chemistry, 6(24), 4560-4566. doi: 10.1039/b814627f.
Liu, W., Jensen, T. J., Fronczek, F. R., Hammer, R. P., Smith, K. M., & Vicente,
M. G. H. (2005). Synthesis and cellular studies of non-aggregated
water-soluble phthalocyanines, Journal of Medicinal Chemistry, 48(4),
1033-1041. doi: 10.1021/jm049375b.
Lo, P. C, Chan, C. M. H., Liu, J. Y., Fong, W. P., & Ng, D. K. P. (2007). Highly
photocytotoxic glucosylated silicon(IV) phthalocyanines. Effects of
peripheral chloro substitution on the photophysical and photodynamic
properties, Journal of Medicinal Chemistry, 50(9), 2100-2107. doi:
10.1021/jm061415j.
Lo, P. C., Leung, S. C. H., Chan, E. Y. M., Fong, W. P., Ko, W. H., & Ng, D. K.
P. (2007). Photodynamic effects of a novel series of silicon(IV)
phthalocyanines against human colon adenocarcinoma cells,
Photodiagnosis and Photodynamic Theraphy, 4(2), 117-123. doi:
10.1016 /j.pdpdt.2007.03.001.
Lowery, M. K., Starshak, A. J., Esposito, J. N., Krueger, P. C., & Kenney, M. E.
(1965). Dichloro(phthalocyanino)silicon, Inorganic Chemistry, 4(1),
128-128. doi: 10.1021/ic50023a036.
Lv, F., Cao, B., Cui, Y., & Liu, T. (2012). Zinc phthalocyanine labelled polyethylene
glycol: preparation, characterization, interaction with bovine serum
albumin and near infrared fluorescence imaging in vivo, Molecules,
17(6), 6348-6361. doi: 10.3390/molecules17066348.
Maftoum-Costa, M., Naves, K. T., Oliveira, A. L., Tedesco, A. C., da Silva, N. S.,
& Pacheco-Soares, C. (2008). Mitochondria, endoplasmic reticulum
and actin filament behavior after PDT with chloroaluminum
phthalocyanine liposomal in HeLa cells, Cell Biology International,
32(8), 1024-1028. doi: 10.1016/j.cellbi.2008.04.005.
Maiti, S., Kankia, B., Khutsishvili, I., & Marky, L. A. (2011). Melting behavior and
ligand binding of DNA intramolecular secondary structures,
Biophysical Chemistry, 159, 162-171. doi: 10.1016/j.bpc.2011.06.006.
Melson, G. A. (1979). Coordination Chemistry of Macrocyclic Compounds, Plenum
Press, ISBN 0-306-40140-1.
Mineo, P., Alicata, R., Micali, N., Villari, V., & Scamporrino, E. (2011). Water-
soluble star polymers with a phthalocyanine as the core and
poly(ethylene glycol) chains as branches, Journal of Applied Polymer
Science, 126(4), 1359-1368. doi: 10.1002/app.36631.
118
Minnock, A., Vernon, D. I., Schofield, J., Griffiths, J., Parish, J. H., & Brown, S.
B. (1996). Photoinactivation of bacteria. Use of a cationic water-soluble
zinc phthalocyanine to photoinactivate both gram-negative and gram-
positive bacteria, Journal of Photochemistry and Photobiology B:
Biology, 32(3), 159-164 doi: 10.1016/1011-1344(95)07148-2.
Moeno, S., Krause, R. W. M., Ermilov, E. A., Kuzyniak, W., & Hopfner, M.
(2014). Synthesis and characterization of novel zinc phthalocyanines as
potential photosensitizers for photodynamic therapy of cancers,
Photochemical & Photobiological Sciences, 13, 963-970. doi:
10.1039/C3PP50393C.
Murov, S. L., Carmichael, I., & Hug, G. L. (1993). Handbook of photochemistry,
second ed, Marcel Dekker, New York.
Mwanza, D., Khene, S., & Mashazi, P. (2017). Tetra (4-propargyloxyphenoxy)
phthalocyanines: Facile synthesis, fluorescence and thermal properties,
Polyhedron, 134, 263-274. doi: 10.1016/j.poly.2017.06.029
Nahid, S., & Moghadam, N. H. (2013). Study on the interaction of the antiviral drug,
zidovudine with DNA using neutral red (NR) and methyleneblue (MB)
dyes, Journal of Luminescence, 134, 629-634. doi:
10.1016/j.jlumin.2012.07.017.
Nalawade, T. M., Bhat, K., & Sogi, S. H. P. (2015). Bactericidal activity of propylene
glycol, glycerine, polyethylene glycol 400, and polyethylene glycol
1000 against selected microorganisms, Jtournal of International
Society of Preventive & Community Density, 5(2), 114-119. doi:
10.4103/2231-0762.155736.
Nelson, S. M., Fergusson, L. R., & Denny, W. A. (2007). Non covalent/DNA
interactions: minor groove binding agents, Mutation Research, 623, 24-
40. doi: 10.1016/j.mrfmmm.2007.03.012.
Nesterova, I. V., Verdree, V. T., Pakhomov, S., Strickler, K. L., Allen, M. W.,
Hammer, R. P., & Soper, S. A. (2007). Metallophthalocyanine near-
IR fluorophores: oligonucleotide conjugates and their applications in
PCR assays, Bioconjugate Chemistry, 18(6), 2159-2168. doi:
10.1021/bc700233w.
Newkome, G. R., Sauer, J. D., Roper, J. M., & Hager, D. C. (1977). Construction
of synthetic macrocyclic compounds possessing subheterocyclic rings,
specifically pyridine, furan, and thiophene, Chemical Reviews, 77(4),
513-597. doi: 10.1021/cr60308a003.
Nogueira, J. J., Oppel, M., & Gonzalez, L. (2015). Enhancing intersystemcrossing
in phenotiazinium dyes by intercalation into DNA, Angewandte Chemie
International Edititon in English, 54, 4375-4378. doi:
10.1002/anie.201411456.
Nwe, K., Andolina, C. M., & Morrow, J. R. (2008). Tethered dinuclear
europium(III) macrocyclic catalysts for the cleavage of RNA, Journal
of the American Chemical Society, 130(44), 14861-14871. doi:
10.1021/ja8037799.
119
Ogunsipe, A. & Nyokong, T. (2005). Photophysicochemical consequences of bovine
serum albumin binding to non-transition metal phthalocyanine
sulfonates, Photochemical & Photobiological Sciences, 4(7), 510. doi:
10.1039/b416304d.
Ogunsipe, A. & Nyokong, T. (2005). Photophysical and photochemical studies of
sulphonated non-transition metal phthalocyanines in aqueous and non-
aqueous media, Journal of Photochemistry and Photobiology A:
Chemistry, 173(2), 211-220. doi: 10.1016/j.jphotochem.2005.03.001.
Ogunsipe, A., Chen, J., & Nyokong, T. (2004). Photophysical and photochemical
studies of zinc(II) phthalocyanine derivatives—effects of substituents
and solvents, New Journal of Chemistry, 28, 822-827. doi:
10.1002/hlca.200390279.
Ongarora, B. G., Hu, X., Verberne-Sutton, S. D., Garno, J. C., & Vicente, M. G.
H. (2012). Syntheses and photodynamic activity of pegylated cationic
Zn(II)-phthalocyanines in HEp2 cells, Theranostics, 2(9), 850-870. doi:
10.7150/thno.4547.
Ongarora, B. G., Zhou, Z., Okoth, E. A., Kolesnichenko, I., Smith, K. M., &
Vicente, M. G. H. (2014). Synthesis, spectroscopic, and cellular
properties of α-pegylated cis-A2B2- and A3B-types ZnPcs, Journal of
Porphyrins and Phthalocyanines, 18(10-11), 1021-1033. doi:
10.1142/S1088424614500849.
Özil, M., Ağar, E., Şaşmaz, S., Kahveci, B., Akdemir, N., & Gümrükçüoğlu, I. E.
(2007). Microwave-assisted synthesis and characterization of the
monomeric phthalocyanines containing naphthalene-amide group
moieties and the polymeric phthalocyanines containing oxa-aza bridge,
Dyes and Pigments, 75(3), 732-740. doi:
10.1016/j.dyepig.2006.07.026.
Özkan, Ş. (2016). Çeşitli Hidrazon Türevleri ile Nükleik Asitlerin Bağlanma
Mekanizmalarının Florimetrik Yöntemle İncelenmesi, (Yüksek Lisans
Tezi), Namık Kemal Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü.
Pedersen, C. J. (1967). Cyclic polyethers and their complexes with metal salts,
Journal of the American Chemical Society, 89(26), 7017-7036 doi:
10.1021/ja01002a035.
Phillips, D. (1997). Chemical mechanisms in photodynamic therapy with
phthalocyanines, Progress in Reaction Kinetics, 22, 3/4, 175-300.
Piechocki, C., Simon, J., Skoulios, D., Guillon, D., & Weber, P. (1982). Discotic
Mesophases Obtained from Substituted Metallophthalocyanines-
Toward Liquid Crystalline One Dimensional Conductors, Journal of
the American Chemical Society, 104(19), 5245-5247. doi:
10.1021/ja00383a050.
Pinto, S. M. A., Tome, V. A., Calvete, M. J. F., Pereira, M. M., Burrows, H. D.,
Cardoso, A. M. S., ... Geraldes, C. F. G. C. (2016). The quest for
biocompatible phthalocyanines for molecular imaging: Photophysics,
relaxometry and cytotoxicity studies, Journal of Inorganic
Biochemistry, 154, 50-59. doi: 10.1016/j.jinorgbio.2015.10.013.
120
Rajora, M. A., Lou, J. W. H., & Zheng, G. (2017). Advancing porphyrin's
biomedical utility via supramolecular chemistry, Chemical Society
Reviews, 46(21), 6433-6469. doi: 10.1039/C7CS00525C.
Reedijk, J. (2009). Platinum anticancer coordination compounds: study of DNA
binding inspires new drug design, European Journal of Inorganic
Chemistry, 10, 1301312. doi: 10.1002/ejic.200900054.
Rello-Varona, S., Stockert, J. C., Canete, M., Acedo, P., & Villanueva, A. (2008).
Mitotic catastrophe induced in HeLa cells by photodynamic treatment
with Zn(II)-phthalocyanine, International Journal of Oncology, 32(6),
1189-1196. doi: doi.org/10.3892/ijo.32.6.1189.
Rest, A. J., Smith, S. A., & Tyler, I. D. (1976). The template synthesis of 2, 2, 7, 7,
12, 12, 17, 17-octamethyl-21, 22, 23, 24-tetraoxaquaterene: factors
affecting the choice of template agent, Inorganica Chimica Acta, 16,
L1-L2. doi: 10.1016/S0020-1693(00)91672-4.
Rodriguez-Morgade, M. S., & Stuzhin, P. A. (2004). The chemistry of
porphyrazines: an overview, Journal of Porphyrins and
Phthalocyanines, 8(9), 1129-1165. doi: 10.1142/S1088424604000490.
Rosenthal, I., Shafirovich, V. Y., Geacintov, N. E., Ben Hur, E., & Horowitz, B.
(1994). The photochemical properties of fluoroaluminum
phthalocyanine, Photochemistry and Photobology, 60, 215-220. doi:
10.1111/j.1751-1097.1994.tb05093.x.
Ross, P. D. & Subramanian, S. (1981). Thermodynamics of protein association
reactions: Forces contributing to stability, Biochemistry, 20(11), 3096-
3102. doi: 10.1021/bi00514a017.
Rossiter, C. S., Mathews, R. A., & Morrow, J. R. (2007). Cleavage of an RNA
analog by Zn(II) macrocyclic catalysts appended with a methyl or an
acridine group, Journal of Inorganic Biochemistry, 101(6), 925-934.
doi: 10.1016/j.jinorgbio.2007.03.002.
Rostovtseva, T. K., Nestorovich, E. M., & Bezrukov, S. M. (2002). Partitioning of
differently sized poly(ethylene glycol)s into OmpF porin, Biophysical
Journal, 82(1), 160-169. doi: 10.1016/S0006-3495(02)75383-6.
Rurack, K., & Spieles, M. (2011). Fluorescence quantum yields of a series of red and
near-infrared dyes emitting at 600-1000 nm, Analytical Chemistry,
83(4), 1232-1242. doi: 10.1021/ac101329h.
Sekkat, N., Van Den Bergh, H., Nyokong, T., & Lange, N. (2012). Like a bolt from
the blue: Phthalocyanines in biomedical optics, Molecules, 17(1), 98-
144 doi: 10.3390/molecules17010098.
Seotsanyana-Mokhosi, I., Kuznetsova, N., & Nyokong, T. (2001). Photochemical
studies of tetra-2,3-pyridinoporphyrazines, Journal of Photochemistry
and Photobiology A: Chemistry, 140(3), 215-222. doi: 10.1016/S1010-
6030(01)00427-0.
Shaw, B. L. (1975). Formation of large rings, internal metalation reactions, and
internal entropy effects, Journal of the American Chemical Society,
97(13), 3856-3857. doi: 10.1021/ja00846a072.
121
Sherman, M. R., Williams, L. D., Saifer, M. G. P., French, J. A., Kwak, L. W., &
Oppenheim, J. J. (1997). Conjugation of High-Molecular Weight
Poly(ethylene glycol) to Cytokines: Granulocyte-Macrophage Colony-
Stimulating Factors as Model Substrates, ACS Symposium Series, Vol.
680. Chapter 11, 155-169.
Sibrian-Vazquez, M., Ortiz, J., Nesterova, I. V., Fernandez-Lazaro, F.,
SastreSantos, A., Soper, S. A., & Vicente, M. G. H. (2007). Synthesis
and properties of cell targeted Zn(II)-phthalocyanine-peptide
conjugates, Bioconjugate Chemistry, 18(2), 410-420. doi:
10.1021/bc060297b.
Snow, A. W. (2012). Phthalocyanine Aggregation, The Porphyrin Handbook:
Phthalocyanines: Properties and Materials (Vol. 17). Elsevier Inc. doi:
10.1016/B978-0-08-092391-8.50009-1.
Sonogashira, K. (2007). Cross Coupling Reactions to sp Carbon Atoms. In Metal
Catalyzed Cross Coupling Reactions (eds F. Diederich and P. J. Stang).
doi: 10.1002/9783527612222.ch5.
Spagnul, C., Turner, L. C., & Boyle, R. W. (2015). Immobilized photosensitizers
for antimicrobial applications, Journal of Photochemistry and
Photobiology B: Biology, 150, 11-30. doi:
10.1016/j.jphotobiol.2015.04.021.
Spesia, M. B., Caminos, D. A., Pons, P., & Durantini, E. N. (2009). Mechanistic
insight of the photodynamic inactivation of Escherichia coli by a
tetracationic zinc(II) phthalocyanine derivative, Photodiagnosis and
Photodynamic Therapy, 6(1), 52-61. doi: 10.1016/j.pdpdt.2009.01.003.
Stillman, M. J., & Nyokong, T. (1989). In Phthalocyanines: Properties and
Applications, Chapter 3, VCH, New York.
Sütçüler, Y. A., Sevim, A. M., Çanak, T. Ç., Serhatlı, İ. E., & Gül, A. (2017). A
novel polystyrene with non-symmetrical zinc phthalocyanines as
terminal group, Dyes and Pigments, 144, 58-68. doi:
10.1016/j.dyepig.2017.05.013.
Taniguchi, M. & Lindsey, J. S. (2017). Synthetic chlorins, possible surrogates for
chlorophylls, prepared by derivatization of porphyrins, Chemical
Reviews, 117(2), 344-535. doi: 10.1021/acs.chemrev.5b00696.
Teles Ferreira, J., Pina, J., Alberto Fontes Ribeiro, C., Fernandes, R., Tome, J. P.
C., Rodriguez-Morgade, M. S., & Torres, T. (2017). PEG- containing
ruthenium phthalocyanines as photosensitizers for photodynamic
therapy: synthesis, characterization and in vitro evaluation, Journal of
Materials Chemistry B, 5(29), 5862-5869. doi: 10.1039/C7TB00958E.
Thompson, M. C., & Busch, D. H. (1964). Reactions of coordinated ligands. IX.
Utilization of the template hypothesis to synthesize macrocyclic ligands
in Situ, Journal of the American Chemical Society, 86(18), 3651-3656.
doi: 10.1021/ja01072a012.
Ti, Y., Lv, Y., & Chen, D. (2014). The preparation and characterization of Fe-
octacarboxyl acid phthalocyanine - Polyethylene glycol/polyurethane
122
blends, Journal of Polymer Research, 21(5). doi: 10.1007/s10965-014-
0462-z.
Tope, W. D. & Shaffer, J. J. (2003). Photodynamic Therapy in Dermatology, Ed.
Bolognia J. L., Jorizzo J. L., Rapini R. P. 2. Baskı. Philadelphia:
Elsevier, 2127-2141.
Touti, F., Singh, A. K., Maurin, P., Canaple, L., Beuf, O., Samarut, J., &
Hasserodt, J. (2011). An electroneutral macrocyclic iron(II) complex
that enhances MRI contrast in vivo, Journal of Medicinal Chemistry,
54(12), 4274-4278. doi: 10.1021/jm2002298.
Tuncel, S., Dumoulin, F., Gailer, J., Sooriyaarachchi, M., Atilla, D., Durmuş, M.,
... Ahsen, V. (2011). A set of highly water-soluble tetraethyleneglycol-
substituted Zn(ii) phthalocyanines: synthesis, photochemical and
photophysical properties, interaction with plasma proteins and in vitro
phototoxicity, Dalton Transactions, 40(16), 4067-4079. doi:
10.1039/C0DT01260B.
Tuncer, S., Özçeşmeci, İ., Sesalan, B. Ş., & Kalkan Burat, A. (2017). Spectroscopic
and thermodynamic approach to the interaction of nonperipherally
substituted cationic phthalocyanines with calf thymus (CT)-DNA,
Turkish Journal of Chemistry, doi: 10.3906/kim-1705-59.
Turanlı-Yıldız, B., Sezgin, T., Akar, Z. P., Uslan, C., Sesalan, B. Ş., & Gül, A.
(2011). The use of novel photobleachable phthalocyanines to image
DNA, Synthetic Metals, 161(15-16), 1720-1724. doi:
10.1016/j.synthmet.2011.06.012.
Url-1 <http://www.cancerresearchuk.org/about-cancer/what-is-cancer >, erişim
tarihi 01.04.2018.
Url-2 <http://www.academic.brooklyn.cuny.edu/biology/bio4fv/page/hydropho.htm
>, erişim tarihi 30.03.2018.
Uslan, C. & Sesalan, B. Ş. (2012). Synthesis of novel DNA-interacting
phthalocyanines, Dyes and Pigments, 94(1), 127-135. doi:
10.1016/j.dyepig.2011.12.003.
Uslan, C. & Sesalan, B. Ş. (2013). The synthesis, photochemical and biological
properties of new silicon phthalocyanines, Inorganica Chimica Acta,
394, 353-362. doi: 10.1016/j.ica.2012.08.004.
Uslan, C. Sesalan, B. Ş., & Durmuş, M. (2012). Synthesis of new water soluble
phthalocyanines and investigation of their photochemical,
photophysical and biological properties, Journal of Photochemistry and
Photobiology A: Chemistry, 235, 56-64. doi:
10.1016/j.jphotochem.2012.03.010.
Vorlander, D. (1894). Aethylenester zweibasischer Säuren und Phenole, Justus
Liebigs Ann. Chem., 280, 167-206. doi: 10.1002/jlac.18942800202.
Yan, Q., Cai, K., & Zhao, D. (2016). Supramolecular aggregates with distinct optical
properties from PDI oligomers of similar structures, Physical
Chemistry Chemical Physics, 18(3), 1905-1910. doi:
10.1039/C5CP05561J.
123
Yang, Y. C., Ward, J. R., & Seiders, R. P. (1985). Dimerization of cobalt (II)
tetrasulfonated pthalocyanine in water and aqueous alcoholic solutions,
Inorganic Chemistry, 24(12), 1765-1769. doi: 10.1021/ic00206a011.
Wainwright, M. (1998). Photodynamic antimicrobial chemotherapy (PACT), Journal
of Antimicrobial Chemotherapy, 42(1), 13-28. doi:
10.1093/jac/42.1.13.
Walter, M. G., Rudine, A. B. & Wamser, C. C. (2010). Porphyrins and
phthalocyanines in solar photovoltaic cells, Journal of Porphyrins and
Phthalocyanines, 14(9), 759-792. doi: 10.1142/S1088424610002689.
Wang, A., Ma, Y. J., Zhou, L., Lu, S., Lin, Y., Zhou, J. H., & Wei, S. H. (2013).
Comparison of two strategies for conferring water solubility to a zinc
phthalocyanine substituted with 1,2-diethylamino, Dyes an Pigments,
99, 348-356. doi: 10.1016/j.dyepig.2013.05.020.
Wöhrle, D. (2001) Phthalocyanines in macromolecular phases - Methods of synthesis
and properties of the materials, Macromolecular Rapid
Communications, 22(2), 68-97. doi: 10.1002/1521-
3927(20010201)22:2<68::AID-M.
Wöhrle, D., Benters, R., Suvorova, O., Schnurpfeil, G., Trombach, N., &
Bogdahn-Rai, T. (2000). Syntheses of structurally uniform polymeric
phthalocyanines, Journal of Porphyrins and Phthalocyanines, 4(5),
491-497. doi: 10.1002/1099-1409.
Wöhrle, D., Suvorova, O., Gerdes, R., Bartels, O., Lapok, L., Baziakina, N., ...
Slodek, A. (2004). Efficient oxidations and photooxidations with
molecular oxygen using metal phthalocyanines as catalysts and
photocatalysts, Journal of Porphyrins and Phthalocyanines, 8(8), 1020-
1041. doi: 10.1142/S1088424604000398.
Würth, C., Grabolle, M., Pauli, J., Spieles, M., & Resch-Genger, U. (2013).
Relative and absolute determination of fluorescence quantum yields of
transparent samples, Nature Protocols, 8(8), 1535-1550. doi:
10.1038/nprot.2013.087.
Zhang, B., Zhang, H., Elupula, R., Alb, A. M., & Grayson, S. M. (2014). Efficient
synthesis of high purity homo-arm and mikto-arm poly(ethylene glycol)
stars using epoxide and azide-alkyne coupling chemistry,
Macromolecular Rapid Communications, 35, 146-151. doi:
10.1002/marc.201300623.
Zhang, X. F., & Xu, H. J. (1993). Influence of halogenation and aggregation on
photosensitizing properties of zinc phthalocyanine (ZnPC), Journal of
the Chemical Society, Faraday Transactions, 89(18), 3347-3351 doi:
10.1039/ft9938903347.
Zhao, B., Duan, W., Lo, P. C., Duan, L., Wu, C., & Ng, D. K. P. (2013). Mono-
PEGylated zinc(II) phthalocyanines: preparation, nanoparticle
formation, and in vitro photodynamic activity, Chemistry – An Asian
Journal, 8(1), 55-59. doi: 10.1002/asia.201200897.
Ziegler, K., Eberle, H., & Ohlinger, H. (1933). Über vielgliedrige Ringsysteme. I.
Die präparativ ergiebige Synthese der Polymethylenketone mit mehr als
124
6 Ringgliedern, European Journal of Organic Chemistry, 504(1), 94-
130. doi: 10.1002/jlac.19335040109.
Zill, A. T., Licha, K., Haag, R., & Zimmerman, S. C. (2012). Synthesis and
properties of fluorescent dyes conjugated to hyperbranched
polyglycerols, New Journal of Chemistry, 36(2), 419-427. doi:
10.1039/C1NJ20476A.
125
126
EKLER
127
EK A.
128
Şekil A.2 : 7 bileşiğine ait 1H-NMR Spektrumu
129
Şekil A.3 : 8 bileşiğine ait 1H-NMR Spektrumu
130
Şekil A.4 : 9 bileşiğine ait 1H-NMR Spektrumu
131
Şekil A.5 : 7 bileşiğinin LC-MS Spektrumu
132
Şekil A.6 : 8 bileşiğinin LC-MS Spektrumu
133
Şekil A.7 : 9 bileşiğinin LC-MS Spektrumu
134
ÖZGEÇMİŞ
ÖĞRENİM DURUMU:
Lisans : 2009, Gazi Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya
Bölümü
Yüksek lisans : 2012, İstanbul Teknik Üniversitesi, Kimya Anabilim Dalı,
Kimya Programı
Uslan, C., Durmuş İşleyen, N., Öztürk, Y., Turanlı Yıldız, B., Z. Çakar, Z. P.,
Hepuzer Gürsel, Y., Sesalan, B. Ş. 2016. Synthesis of a novel SiPc-PEG1000 and
evaluation of its antibacterial properties, page:338, P-185, 13th European
Biological Inorganic Chemistry Conference, August 28th – September 01st, 2016
Budapest, Hungary.
Uslan, C., Durmuş İşleyen, N., Öztürk, Y., Turanlı Yıldız, B., Z. Çakar, Z. P.,
Göksel, M., Durmuş, M., Hepuzer Gürsel, Y., Sesalan, B. Ş. 2017. A novel of
PEG-conjugated phthalocyanine and evaluation of its photocytotoxicity and
antibacterial properties for photodynamic therapy, Journal of Porphyrins
Phthalocyanines, 21, 1–15.
135