Professional Documents
Culture Documents
Molbi Össz
Molbi Össz
Molekuláris Biológia
Főbb társtudományai:
o biokémia
o genetika
o sejtbiológia
peptid
kötés elsődleges szerkezet:
az aminosavak sorrendje
részleges
aminosav DNS génkönyvtár
szekvencia azonosítása szűrése
meghatározása
Beer törvény:
A = -log(I1/I0) = ε l c
A gélelektroforézis során
elektromos erőtérben futtatókád minta
vándorló töltéssel
rendelkező Minta felvitele agaróz vagy poliakrilamid gélre.
makromolekulákat Futtatás elektromos térben.
gél mátrix
A nukleinsavak negatív tápegység
töltéssel rendelkeznek, ezért
a pozitív pólus (anód) felé pórusok
agaróz gél
migrálnak a gélben.
A gélelektroforézis méret
a molekulák méretükkel fordítottan arányosan
szerinti elválasztást tesz haladnak át a gélen
lehetővé, mivel a hosszabb
fragmentumok lassabban
migrálnak a gélben. • a gél agaróz vagy poliakrilamid
• az elrendezés lehet horizontális vagy
vertikális
DNS elválasztása gélelektroforézissel
zsebek (wells)
Polimerázok:
- DNS polimerázok: DNS szintézis DNS templátról
- RNS polimerázok: RNS szintézise DNS templátról
- Reverz transzkriptáz: DNS szintézis RNS templátról
Nukleázok:
- endonukleázok
- restrikciós endonukleázok: meghatározott felismerőhelynél hasító endonukleázok
- exonukleázok
Ligázok: foszfodiészter kötés létrehozása poli- és oligonukleotidok 5'-P és 3'-OH vége között
Végmódosító enzimek:
- Polinukleotid kináz: ATP g-foszfátját defoszforilált 5' véghez köti
- Alkalikus foszfatáz: 5' foszfát csoport lehasítása
Nukleinsav polimeráz enzimek
P P P OH
OH P P P P P P P P P
Templátjuk (a másolandó minta nukleinsav)
egy egyesszálú nukleinsav szekvencia,
amelyet úgy másolnak le, hogy egy második
Polimeráz szálba minden nukleotidhoz egy vele
+ nukleotid báziskomplementer nukleotidot építenek
be.
P P P P P P P P P OH
A nukleinsav szál 3’-végi OH csoportjához
kapcsolják a beépítendő nukleotidot.
Ezért a szintézis mindig 5’ – 3’ irányba
halad.
OH P P P P P P P P P
DNS polimeráz
P P P OH
Templátjuk: DNS
P P P P P P P P P OH
OH P P P P P P P P P
Reverz transzkriptáz
P P P OH
Templátjuk: RNS
P P P P P P P P P OH
Az így szintetizált DNS szálat nevezik cDNS-
nek (complementary/komplenter DNS).
OH P P P P P P P P P
RNS polimeráz
Templátjuk: DNS
Képesek lánckezdésre.
RNS polimeráz
+ NTP Az új RNS szál szintézise az ú.n. promóter
régiótól indul.
P
P P P P P P
P OH
OH P P P P P P P P P
Nukleázok
A nukleázok nukleinsavakat
bontanak úgy, hogy a nukleotidok
közötti foszfoészter kötést bontják
fel.
Az endonukleázok a polinukleotid
láncon belül képesek hasítani, míg az DNS
exonukleázok csak a polinukleotid lánc
végeiről képesek eltávolítani
nukleotidokat. Endonukleáz Exonukleáz
pl.
RNase A: endoribonukleáz
Nuclease P1: ssDNS és ssRNS specifikus láncon belüli hasítások nukleotidok eltávolítása
endonukleáz a láncvégekről
5’-TTTAAA-3’ ez palindrom
3’-AAATTT-5’ A restrikciós felismerőhelyen az enzim
szimmetrikusan hasítja a DNS két szálát, ezzel
ragadós véget (sticky end, túlnyúló ssDNS szakasz)
5’-TTAATT-3’ ez nem palindrom vagy tompa DNS véget (blunt end, duplaszálú vég)
3’-AATTAA-5’ hozva létre.
Restrikciós endonukleázok
Vektor DNS
A DNS fragmentumok összekapcsolását, a 3'-OH és
5'-P csoportok közötti kovalens kötések létrehozását
DNS ligáz (pl. T4 DNS ligáz) enzimekkel lehet
elvégezni.
a komplementer végek
bázispárosodnak
vektor
DNS
molekula
DNS
fragmentum
ligálása
bejuttatás baktérium
sejtekbe (transzformáció)
felszaporítás
Baktérium kolóniák
a rekombináns DNS a
sejtekből nagy
mennyiségben
visszaizolálható
Klónozó vektorok
rekombináns DNS
létrehozása
a plazmid
felszaporodik a gazdasejtben
humán kromoszómális DNS Kellően nagy számú rekombináns plazmidot előállítva, a kiindulási
hasítás restrikciós DNS minden darabja megvan rekombináns molekulában.
endonukleázzal
rekombináns DNS
RNS
kiindulási szövet pucolás A cDNS könyvtár egy adott transzkriptómot reprezentáló
minta klón gyűjtemény.
tisztítás oligo-dT oszlopon
mRNS
mRNS mRNS
DNS KLÓNOZÁS
REVERZ TRANSZKRIPCIÓ ÉS
cDNS KLÓNOZÁS
gének
PCR
A Polimeráz Láncreakció (PCR) egy adott DNS szakasz klónozás nélküli, in vitro
felszaporítására alkalmas eljárás.
Polimeráz Láncreakció (PCR)
Szükséges reagensek:
A PCR ciklusokba szervezett, egy ciklus 3 lépésből áll:
o templát DNS
5’-ATTGCGTGAACAGTGCTGACGGTTGCACCTG-3’ o hőstabil DNS polimeráz
3’-TAACGCACTTGTCACGACTGCCAACGTGGAC-5’
95 ˚C
o szintézis indító oligonukleotidok
(primerek)
5’-ATTGCGTGAACAGTGCTGACGGTTGCACCTG-3’
denaturáció
o dNTP
a templát szálai elválnak
egymástól
3’-TAACGCACTTGTCACGACTGCCAACGTGGAC-5’
72 ˚C
A hőstabil DNS (pl. Taq) polimeráz a
5’-ATTGCGTGAACAGTGCTGACGGTTGCACCTG-3’
elongáció 3’-TAACGCACTTGTCACGACTGCCAACGTGGAC-5’ primerektől indulva építi be a dNTP-ket egy
a primerektől kiindulva 5’-ATTGCGTGAACAGTGCAGACGGTTGCACCTG-3’
három lépésből álló, ciklikus reakcióban.
megtörténik a szintézis 3’-TAACGCACTTGTCACGACTGCCAACGTGGAC-5’
Hibridizációs technikák
Nukleinsav hibridizáció
minta 1 minta 2
Northern blot
Hasonló módon működő módszer RNS szakaszok azonosítására
• RNS molekulák méretének meghatározása (pl. splicing variánsok)
• RNS molekulák mennyiségének meghatározása
Southern blot
Kolónia hibridizáció
minta A minta B
A DNS microarray egy nagy áteresztőképességű
módszer több ezer féle nukleinsav egyidejű
vizsgálatára hibridizációs módszerrel.
Felhasználható
o Transzkriptomikai vizsgálatokhoz
egyedi géneket reprezentáló szekvenciák
o Variáns analízishez
felülethez rögzítve o Funkcionális genomikai vizsgálatokhoz
DNS bázissorrendjének meghatározása
DNS szekvenálás
DNS szekvenálás technológia generációi
A Maxam-Gilbert szekvenálás DNS szálak specifikus hasításán majd ezt követő gélelektroforézisen;
az elterjedtebbé vált Sanger szekvenálás DNS szintézisen majd ezt követő gélelektroforézisen alapult.
A kapilláris szekvenálás a
Sanger-szekvenálás
jelenleg is alkalmazott Kapilláris gélelektroforézissel
A primertől indulva a DNS A szintézis a lánctermináló
formája. meghatározzák, hogy a szál
polimeráz DNS szálat nukleotidoknál elakad, a szál
szintetizál fluoreszcensen jelölt lesz melyik pozíciójában milyen
A reakcióban összemérik a nuklainsav bázis található
• DNS-t,
• DNS polimerázt,
• primert,
• nukleotidokat (dNTP),
• és kis koncentrációban
fluoreszcensen jelölt
lánctermináló
nukleotidokat.
Kapilláris szekvenálás
Kapilláris szekvenátorok
Újgenerációs szekvenálási eljárások (NGS)
Szekvencia meghatározás DNS szintézis során történik fluoreszcensen jelölt reverzibilis lánc terminátor
nukleotidokkal.
A DNS szálait egy motor fehérje szétválasztja, Minden nukleinsav bázis jellemző
Nanopórus és egy póruson keresztül átjuttatja egy biológiai csökkenést idéz elő az ionáramban, ami
szekvenálás membrán pozitív oldalára alapján a szekvencia kikövetkeztethető
jellemző
ionáram ionáram
változás
DNS bázis
Immunkémiai technikák
Polyklonális és monoklonális ellenanyagok
Az SDS-PAGE-dzsel elválaszott fehérje mintákat membránra viszik át, majd a fehérje jelenlétét megfelelő (az adott
fehérjére specifikus) ellenanyag segítségével mutatják ki.
Indirekt detekció: az elsődleges ellenanyagot felismerő másodlagos ellenanyag jelölt (izotóppal, fluoreszcensen
vagy kapcsolt enzimmel).
A másodlagos ellenanyag az elsődleges ellenanyagot termelő állatfaj immunoglobulinjára specifikus.
Előnyei: érzékenyebb; nem kell minden ellenanyagot jelölni; nincs veszélye az elsődleges ea. specifitásváltozásának
Fehérje kimutatása immunoprecipitációval
gyöngy
Amennyiben vízben oldhatatlan csapadék nem jön létre, az
ellenanyag-antigén komplex szilárd hordozóhoz kötött ellenanyag
kötő fehérjékkel (protein A, protein G) tisztítható.
A vizsgálni kívánt fehérjét klónozzák, fúziós fehérjeként Az ellenanyag - antigén komplexszel együtt az antigénnel
expresszálják egy protein tag-gel. kölcsönható fehérjék is kikötődnek.
A protein tag-et kötő mátrixhoz a fúziós fehérje, és az Mosás és eluálás után SDS-PAGE, partnerek azonosítása
azzal kölcsönható fehérje partnerek is kikötődnek. rájuk specifikus ellenanyaggal.
kölcsönható
partnerek
gyöngy
gyöngy
Elolvasandó
Köszönöm a figyelmet!
A citoszkeleton (sejtváz) szerveződése
A citoszkeletális rendszerhez köthető funkciók
2023.
A citoszkeleton szerepe
Szerep/feladat:
- a sejt szilárdítása („váz”, a membránhoz és az extracelluláris mátrixhoz kapcsolódva)
- a sejten belüli mozgások (aktívan és passzívan) és anyagtranszport lehetővé tétele
- a sejtmozgás megvalósítása és a sejtalak meghatározása
A sejtmozgások (izom összehúzódás, leukociták migrációja, sejtfeszíni képletek mozgása, alakváltozás, osztódás,
kromoszómák elmozdulása, vezikuláris transzport, stb) létrejöttében a citoszkeleton aktívan két mechanizmussal vesz részt:
1, pár nm-es alegységekből épülnek fel az akár az egész sejtet átérő, hosszú filamentumok
2, dinamikus struktúrák: folyamatos fel- és leépülés jellemzi őket, gyorsan válaszolnak a környezeti ingerekre (kiv. intermedier filam.)
3, az alegységek nem kovalens kötésekkel kapcsolódnak egymáshoz (kiv. egyes intermedier filamentumok!)
4, az alegységekből képződő „egysoros” protofilamentumok laterálisan kapcsolódnak egymáshoz, így ellenállóbbak a polimerek
Mikrofilamentumok (aktin citoszkeleton)
• aktin monomerekből felépülő aktin polimer szálak két láncának helikális felcsavarodásával jön létre
• minden eukarióta sejtben megtalálható
• behálózza az egész sejtet, plazmamembrán alatt a legkoncentráltabb
Szerepe:
• sejtalak meghatározás és sejtmozgás
• Sejtek egymáshoz és az ECM-hez kapcsolása
• kölcsönhatása a miozinnal kontrakciót eredményez
(stress fibers – kontraktilis kötegek, contractile ring – sejtosztódáskor a két leánysejt elkülönülése)
• átrendeződése a sejt alakjának megváltozását eredményezi
stressz
fibrillumok
mikrovillusok
(apikális membrán)
harántcsíkolt
izomszövet
szarkomer
Mikrofilamentumok (aktin citoszkeleton)
• a legnagyobb mennyiségben előforduló fehérje eukarióta sejtekben (izomsejtekben az összfehérje 10%, más sejtekben 1-5%)
• evolúciósan az egyik legkonzerváltabb fehérje; 43 kDa, 375 AS.
• emlősökben több aktin gén:
-aktin (izomsejtekben; mindegyik jellemző egy-egy izom típusra)
- és -aktin (nem-izom sejtekben is megtalálhatóak)
a). Az ATP-G-aktin alegységek hozzáadása gyorsabb a (+) végen, mint a (–) végen, viszont a G-aktin
disszociációjának mértéke hasonló. Ez a különbség alacsonyabb kritikus koncentrációt okoz a (+) végen.
b). Az egyensúlyi állapotban, az ATP-G-aktin alegységek jobban preferálják a (+) véget, míg az ADP-G-aktin
alegységek a (–) végről szerelődnek le.
A ledisszociált ADP-G-aktin monomerek ADP -> ATP cserét követően újra felhasználódhatnak polimerizációra
(De! nagyon lassú az ADP-ATP csere, így nem jellemző a dinamikus instabilitás).
Taposómalom mechanizmus: A filamentum mérete alapvetően nem változik meg, de a dinamikus átrendeződés
eredményeként az újonnan beépülő alegységek folyamatosan tolódnak a (-) vég felé, míg végül leválnak onnan.
Az aktin filamentumok elrendeződése a sejtekben
Mi teszi lehetővé, hogy sok eltérő elrendeződésű és változó stabilitású filamentum jöjjön létre?
Aktint-keresztkötô-fehérjék (a kötegekben és hálózatokban az aktin fil.-okat kapcsolják össze)
• két aktint-kötô rész, amit különböző hosszúságú fehérjerészlet kapcsol össze (pl. -actinin)
Membrán-mikrofilament-kötô fehérjék
• a membránhoz kapcsolják a kötegeket és a hálózatot
• integráns vagy azokhoz kapcsolódó periferikus membrán fehérjék
(pl. izomsejtekben: a distrophin, vvt-kben: spectrin)
Aktin-kötő fehérjék a sejtben
Az aktin filamentum motorfehérjéje, a miozin
A mozgások nagyobb részében azonban az aktin nem önmagában a polimerizáció-depolimerizációval vesz részt, hanem az ATP
hidrolízis során felszabaduló energiát mozgási energiává alakító mechano-enzimekkel, a miozin motor fehérjékkel kölcsönhatva.
mechanokémiai enzim:
• ATP hidrolízist konformáció változásokhoz kapcsolva történik az elmozdulás
• minden eukarióta sejtben jellemzőek (fehérje szupercsalád)
• a miozin II az izom kontrakció és citokinezis motorja
• ugyanakkor az I és V miozinok a vezikulumok transzportjában játszanak szerepet
• a legtöbb miozin + vég-motor (az aktin filamentum + vége felé halad)
Miozinok szerkezete:
• nehéz és több könnyû lánc, három domén
• fej rész: aktin és ATP-kötô hely, felelős az erő generálásáért
• nyak rész: a fejrész aktivitását szabályozza
• farok rész kapcsolódás membránhoz vagy másik miozin molekulához (miozin dimer vagy miozin filamentum)
A mikrotubulus rendszer
A legtöbb eukarióta sejt citoplazmáját behálózó, akár többszáz mikrométer hosszú csőszerű képződmény.
csillók (keresztmetszet)
Funkciói:
• intracelluláris transzport irányítása (vezikulák mozgása)
• membránnal borított sejtalkotók pozícionálása
• csillók, flagellumok mozgatása
• kromoszóma párok sejtosztódáskor való szétválasztása
lumen
(üreg)
50 nm
Ha a GTP hidrolízis gyorsabb, mint az új alegység bekapcsolódása, akkor elindul a mikrotubulus depolimerizáció
katasztrófa („kirojtolódik” a mikrotubulus, megszűnnek a laterális kölcsönhatások, majd disszociálnak a GDP-tubulin alegységek)
mikrotubulus
metafázis anafázis
Dyneinek: a - vég irányába elmozduló motor fehérjék (membrán felől MTOC felé)
Retrográd axonális transzportban (szinapszistól a sejttest felé) és endocitotikus vezikulumok transzportjában vesznek részt.
Rendkívül nagy (MW 1 000 000), multimer fehérjékből álló szupercsalád.
Felépítésük: fej, nyél és farok domének
A csillók szerveződése
Csillók mozgása:
a széli mikrotubulus párokat rugalmas nexin fonalak kapcsolják össze.
A dynein fejek elmozdulása elcsúsztatja a szomszédos mikrotubulus párt,
azonban az elcsúszást korlátozzák az összeköttetések, így a csilló meghajlik.
Intermedier filamentumok (IFs)
Szerveződés:
• dimerek: az -helikális részek kölcsönhatásával (coiled-coil)
• tetramerek: dimerek laterálisan kölcsönhatnak (ez a tulajdonképpeni IF építőkő!)
• protofilamentum: tetramerek vég a véghez kapcsolódnak (2 nm)
• protofibrillum: protofilamentumok laterálisan kölcsönhatnak
• intermedier filamentum: négy protofibrillum kapcsolódik (10 nm)
antiparallel tetramer
protofilamentum
intermedier filamentum
protofibrillum
Intermedier filamentumok típusai
Vimentin
Számos mesenchymalis sejtben
Laminok
• Sejtmagi lokalizáció
• A sejtmaghártyát belülről borító nukleáris lamina-t
alkotják
• „Rácsos szerkezet”, kromoszómák, magmembrán
pórusok kihorgonyzódnak hozzá
- A sejtváz
- A mikrotubulus váz
- Az aktin váz
- Motorfehérjék
- Az intermedier filamentumok
A pro- és eukarióta sejtek szerveződése
A fontosabb eukarióta sejtorganellumok
2023.
A pro- és eukarióta sejt szerveződése
Prokarióta Eukarióta
Haploid genom (n) Örökítőanyag Leggyakrabban diploid genom (2n)
Ált. egy cirkuláris DNS molekula Ált. több, lineáris DNS molekula kromoszómába
„csomagolva”
1-10 Mb genomnagyság Genomméret, jellemzők 10 Mb-10 Gb (igen változó)
Működési egységekbe szerveződött gének „szabdalt gének” (exon-intron), nagy arányú nem
kódoló DNS
Transzkripció és transzláció térben és időben nem Génműködés Transzkripció és transzláció térben és időben
elkülönülő elkülönül
Nincs elkülönült, membránnal határolt sejtmag Sejtmag szerveződése A DNS kettős membránnal körülvett sejtmagban
(nukleoid) található
Nincsenek specifikus sejtorganellumok Organellumok, Bonyolult endomembrán, rendszerint specifikus
endomembrán rendszer funkciókat ellátó organellumok
Nincs bonyolult és organizált, az eukariótákra jellemző Citoszkeletális struktúrák Mikrofilamentumokból, mikrotubulusokból és
citoszkeletális rendszer intermedier filamentumokból felépülő hálózat
Van peptidoglükán sejtfal, változó számú sejtnyúlvány Sejtfal, sejtnyúlványok Nem mindenhol található sejtfal (növények,
(ostor, csilló, pilus) gombák van), citoszkeletális struktúrák által
felépített sejtnyúlványok (ostor, csilló, mikrovillus, …)
Főbb eukarióta sejtorganellumok és makromolekula komplexek
Az eukarióta sejt membránjai
Organellum/ összes
sejtmembrán membrán %
Plazmamembrán 2-5 %
Sejtmag 0,2-1 %
Golgi apparátus 7-10 %
Endoplazmatikus 50-60 %
retikulum
Lizoszóma 0,5 %
Peroxiszóma 0,5 %
Mitokondrium kettős 20-40 %
membrán
A(z) (endo)membránok szerepe
ELHATÁROLNAK
biztosítják:
• kompartmentek kialakulását
- eltérő összetétel a membrán két oldalán
- eltérő koncentráció viszonyok
- ellentétes irányú reakciók térbeli elkülönítését
ÖSSZEKÖTNEK
biztosítják:
• kapcsolat a környezettel
- anyagáramlást – irányított anyagtranszport
- információ áramlást
- szerkezeti kapcsolat a sejt és környezete között
FELÜLETET ALKOTNAK
biztosítják:
• reakciók számára a felszínt
- időben és térben rendezik a folyamatot
A biológiai membránok szerkezete
• Fehérjék
- integráns membránfehérjék
- perifériás membránfehérjék
• Szénhidrátok
- kovalensen kapcsolódnak a lipidekhez, fehérjékhez
Foszfolipidek / foszfogliceridek
Zsírsav
Glicerin
amid kötés
Ceramid
Szfingozin
szfingozin (aminoalkohol; C18) zsírsav
Zsírsav
szfingomielin
glükocerebrozid
Koleszterin
https://www.asbmb.org/asbmb-today/science/100117/the-many-layers-of-cholesterol-regulation
Kettős hatás:
• lokálisan csökkenti a membrán fluiditást
• ugyanakkor gátolja a gélszerű állapot kialakulását
Membrán aszimmetria
Külső rétegben:
- kolin tartalmú lipidek (foszfatidil-kolin , szfingomielin )
Belső rétegben:
- primer amino-csoportot tartalmazó lipidek, nettó töltéssel rendelkező lipidek
(foszfatidil-szerin , foszfatidil-etanolamin )
• Töltésbelikülönbség
• Citoszolikus fehérjék membránhoz
- negatív töltések a belső felszínen kötődésében fontosak (PS, PI)
Fázis tranzíció: folyadékkristályos (fluid) állapotból – gélkristályos (gél) állapotba történő átalakulás a fázistranzíciós
hőmérsékleten (Tm)
Integráns membránfehérjék:
transzmembrán fehérjék Glikozil-foszfatidil-inozitol (GPI)
a-helikális TM szegmens (1 vagy több) horgonnyal kapcsolódó fehérjék
b-hordó
csak a membrán egyik rétegéhez kapcsolódnak Amid kötés a horgony és a fehérje
a-helikális szegmenssel C-terminális COOH csoportja között
lipid horgonnyal (acil-, prenil-, GPI horgony)
Prenilált fehérjék
Izoprén polimerek kapcsolódnak tioészter
kötéssel a C-terminálishoz közeli Cys aminosavhoz
Acilált fehérjék
Mirisztinsav (C14) – amid kötés a fehérje
N-terminális glicinjével
• Glikolipidek
• Glikoproteinek
• Integráns proteoglikán molekulák
• szolubilis glikoproteinek,
proteoglikánok asszociációja
Szerepe:
• Mechanikai védelem
• Kémiai védelem (alacsony pH, degradáló enzimek)
• Sejt-sejt felismerési folyamatokban
(sejt-sejt adhézió, szövetek, szervek szerveződésében)
Membrántutajok (lipid raft-ok)
RAFT – membrántutaj
• a környezetétől eltérő, jellegzetes lipid és fehérje összetételű membránrégió
a membránban (mint a tengerben úszó tutajok)
• akár több 100 nm-es átmérőjűek is lehetnek
• főként immunrendszer sejtjein, idegi szinapszisokban gyakoriak
• funkcionális szerep:
- jelátvitelben részt vevő molekulák
„összetartása”, toborzása
- transzportfolyamatok (pl. sejten belüli
fehérje szortírozás) biztosítása
A foszfolipid réteg permeabilitása
Szabadon átjárható:
gázok (CO2, N2, O2) Határoló funkció
Apoláros molekulák eltérő összetételű terek alakulhatnak ki a membrán két oldalán
koncentráció gradiensek alakulhatnak ki a membrán két oldalán
Többé-kevésbé átjárható:
kis töltetlen, poláros molekulák (etanol, víz)
Intracelluláris Vérben
Nem átjárható: konc. (mM) mérhető
konc. (mM)
nagy töltetlen, poláros molekulák (glükóz),
ionok (Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Cl-, HCO3-, HPO42-), K+ 140 4
töltött poláros molekulák (aminosavak, ATP, Na+ 12 145
glükóz-6-P) Cl- 4 116
X- (fehérjék) 138 9
Nyugalmi membránpotenciál:
-70 mV (neuronok)
Transzportfolyamatok csoportosítása energetika alapján
Leggyakoribb típusai:
• nem szabályozott (nyugvó) csatornák
• ligandummal szabályozott (ligand gated): neurotranszmitter, nukleotid
• feszültség szabályozott (voltage gated)
• másodlagos hírvivő által szabályozott (second messenger gated)
• mechanoszenzitív csatornák (mechanically gated)
• vázizom sejteken
(neuromuscularis junctio)
• 5 polipeptid alegység
(2a, 1β, 1γ, 1δ)
• 2 acetilkolin kötőhely
Uniporter:
Pl. eritrocita glükóz
transzporter (GLUT1)
A karrier-mediált transzport az enzimek által katalizált reakciókra hasonlít (karrier kvázi mint egy membránhoz kötött enzim). Ha minden
kötőhely telített, a transzport sebessége maximális (Vmax). KM az a szubsztrát koncentráció, ahol a transzportsebesség a Vmax fele.
Szimporterek
Állati/humán plazmamembrán:
Na+-kapcsolt anyagfelvétel
- cukrok, aminosavak felvétele
- pl. Na+ / glükóz szimporter (kotranszporter)
(vékonybélhám, vese)
Ez a pumpa használja el a
sejtek ATP készletének jelentős
részét (neuronok: az ATP
készlet több, mint fele
használódik el a Na+/K+ ATPáz
működtetésére)
Ca++ bekötődés
Konformációváltozás
ADP-ATP csere
Konformáció változás
a Ca++-ok a szarkoplazmatikus
retikulum lumenébe kerülnek
regeneráció
ABC transzporterek (pumpák)
• Baktériumok plazmamembránja:
* E. coli – 5 % gének, 78 gén kódolja ezt a szupercsaládot
* import, export funkció
2023.
Az extracelluláris mátrix
Extracelluláris mátrix
Adhéziós
Kollagén Proteoglikánok
glikoproteinek
+ szignálmolekulák!
Elasztin
Fibrillin
Az ECM szerepe:
1. szövetformálás, fizikai támasz biztosítása a sejteknek
2. a sejt-sejt és sejt-mátrix kölcsönhatások lehetővé tétele
3. a sejtmozgásokhoz kellő környezet létrehozása
4. a sejtek osztódásának, növekedésének szabályozása
Glülózaminoglikánok (GAG)
Hialuronsav Előfordulás
- a legegyszerűbb GAG Üvegtest, ízületek
- ált. nem kapcsolódik fehérjéhez embrionális kötőszövet fő alkotója
- alkotói: N-acetil-glükózamin és glükuronsav (segíti a sejtproliferációt)
Glükózaminoglikán
Speciális szerkezet (kovalens keresztkötések) és szokatlan poszttranszlációs módosítások (lizin, prolin hidroxiláció) jellemzik.
A fehérje rendkívül gazdag prolinban és glicinben (minden 3. aminosav Gly).
Több, mint 20 kollagén gént azonosítottak eddig, a különféle szövetek eltérő mennyiségben expresszálják
a különböző kollagén típusokat.
A szervezetünkben a leggyakoribb az I. típusú kollagén (bőr, csont legfontosabb kollagénje).
Primer defektusok
2, Ehlers-Danlos szindróma
1, osteogenesis imperfecta - col5A1, col5A2 vagy col1A1 mutációk
- „üvegcsont betegség” - laza ízületek, törékeny bőr, gyenge érfal
- ismétlődő csonttörések - a sérült bőr papirusszerű hegekkel gyógyul
- csontdeformációk - koraszülött csecsemők
- hallásvesztés
Fibrillin
- mikrofibrillumok egyik képviselője
Elasztin - az elasztinokhoz kapcsolódó glikoprotein
- az elasztikus rost kialakulásakor a mikrofibrillumok alakítják
Az elasztin erősen hidrofób fehérje ki azt a hálózatot, melyre rárakódnak az elasztin fehérjék
- sok lizin keresztkötés az elasztin molekulák között - a fibrillin génjében bekövetkező mutációk okozzák a
- dohányzás tüdő elasztikus rostjai degradálódnak Marfan-szindrómát: hosszú végtagok, gerincferdülés,
tüdőtágulat (emphysema) szemlencse problémák, aorta aneurysma
Multiadhéziós fehérjék (fibronektin, laminin)
2, sebgyógyulás
* ECM és epithel sérülés utáni helyreállítása
* Myofibroblast migráció a sérülés helyére
myofibroblast sejtek
3, Tumorok növekedése, metastasis képzés mikroszkópos felvétele
(tubulin immunfestés)
* A kötőszöveti sejtek proteázokat szekretálnak
(kollagenáz, mátrix metalloproteináz)
A prokarióta és eukarióta genomok szerveződésének
jellegzetességei
Prokarióta és eukarióta genomok
Kísérleti elrendezés:
egerekbe S. pneumoniae oltottak: hővel elölt S törzs
o élő R törzs S törzs R törzs hővel elölt + élő R törzs
o élő S törzs S törzs
o hővel elölt S törzs
o hővel elölt S törzs élő R Ezekből az
törzzsel kombinálva egerekből élő S
baktériumokat
lehet kimutatni!!
2, A kétféle jelölt
fágizolátummal baktériumokat
fertőztek, a fertőzést követően
a baktériumon kívül maradt
fágrészeket eltávolították.
3, A baktériumsejteket
vizsgálták, melyik jelölt fággal
történt fertőzést követően
Csak a 32P jelölt fágfertőzés után volt detektálható a sejtekben detektálható a sejtekben
radioaktivitás, tehát radioaktív jel.
nem a fehérje az örökítő anyag, hanem a DNS!!!
Virális genomok
Relaxált és szuperhelikális
cirkuláris DNS-ek.
Lk = T + W
Részei:
o Kódoló szekvencia / régió
o Szabályozó szekvenciák (promóterek, enhanszerek, splice helyek, stb)
De:
C-érték ellentmondás (C-value paradox): A DNS mennyisége nem
szigorúan arányos az organizmus komplexitásával (evolúciós helyzetével).
• 54% ismétlődő
szekvencia (45%
transzpozon)
• 17958 lncRNA
• 7569 sncRNA
• 14761 pszeudogén
[2022 adatok]
Az eukarióta gének
o Egyedi (magányos) gének
o Duplikált gének: egymáshoz közel (~ 5-50 pl.
kb) elhelyezkedő hasonló, de nem azonos β-globin géncsalád : 5 β-globin gén, ezek eltérő időben
szekvenciájú gének fejeződnek ki
o Felnőttkori (HBB,HBD)
o Fötális/magzati (HBG1, HBG2)
Duplikált gének csoportját, amelyek hasonló o Embrionális (HBE1)
de nem azonos fehérjéket kódolnak
géncsaládnak nevezzük. A géncsaládban található duplikált gének között az evolúció
során random mutációk által szekvencia eltérések alakulnak ki,
A kódolt homológ fehérjéket fehérje családnak amelyek befolyásolhatják a képződő fehérjék tulajdonságait. A
nevezzük. hasznos mutációk megőrződnek.
A géncsalád tagjai egy kiindulási (ősi) gén Pszeudogének: funkcionális génekhez hasonló szekvencia és
duplikációival jönnek létre, leggyakrabban a exon-intron szerkezet, de mutációk miatt nem funkcióképesek.
meiózis során bekövetkező egyenlőtlen Ugyancsak génduplikációval jönnek létre.
crossing-over által. pl. 2 pszeudogént találunk a humán β-globin gén klaszterben
Géncsaládok
Olyan géntermékek génjei, amelyekre nagy mennyiségben van szükség a sejtben több kópiában is
előfordulhatnak.
Például:
o rRNS gének több mint 100 kópiában vannak jelen minden eukarióta genomban, hogy a sejtekben
fennálló nagymértékű rRNS igényt ki tudják elégíteni
o tRNS gének
o Hiszton fehérje gén klaszterek
Ismétlődő DNS elemek
Miniszatelliták (VNTR):
o 14 – 100 bp
o 20 – 50 tandem ismétlődés
o 1 – 5 kb szakaszok
Genetikai ujjlenyomat:
STR vagy VNTR lókuszok
ismétlésszám eltérésein alapuló
személy azonosítás:
o Apasági vizsgálatoknál öröklődő
Combined DNA Index System mintázat vizsgálat.
(CODIS), USA o Teljes VNTR mintázat azonosság
13 STR lókusz
személy azonosításkor
AMEL: nem meghatározás
kriminalisztikában
Közbeékelt ismétlődések - Mobilis genetikai elemek: transzpozonok, retrotranszpozonok
Szerkezetük:
o Rövid transzpozon végi direkt ismétlődések.
o 250-600 bp, az adott transzpozonra jellemző LTR direkt ismétlődések. Ezek retrovírusokban
is megtalálhatóak.
o Közbülső fehérje kódoló szakasz. Retrovírusokra is jellemző fehérjéket kódol, de nem kódol
vírusburok fehérjéket.
példák:
o Élesztő Ty elem
o Drosophila copia elem
o A humán genom 8%-át teszik ki LTR-retrotranszpozonok. Leggyakoribbak (~443 ezer kópia)
az ERV (endogenous retroviruses) elemek, ezek döntő része csak LTR szekvencia, az ERV
elemek közötti rekombinációval jönnek létre. Ez a különböző pozíciókban lévő elemek
közötti rekombináció genomi átrendeződésekhez vezethet.
Nem-LTR retrotranszpozonok
Két típusuk:
A LINE elemek szélein rövid direkt ismétlődéseket találunk, ezek között két fehérje kódoló ORF-et
o ORF1: 1kb RNS kötő fehérjét kódol.
o ORF2: 4kb reverz transzkriptáz homológot kódol, DNS endonukleáz aktivitása is van.
A humán genomban a teljes hosszúságú LINE elemek 6 kb hosszúak, de az átlagméretük 900 bp mert a legtöbb
elem trunkált. 900.000 pozícióban találhatóak, a genom 21%-át adják.
A humán LINE elemek 3 szekvenciájában eltérő családot alkotnak: L1, L2, L3.
Csak az L1 elemek képesek transzpozícióra, az L2 és L3 elemek defektívek.
A LINE elemeknek csak ~0,01%-a teljes és funkcionális.
o ~ 1,6 millió pozícióban találhatóak, abből 1,1 millió Alu elem. Az Alu
elemek a 7SL RNS-hez (szignál felismerő részecske komponens) mutatnak
hasonlóságot, ebből evolválódhattak.
Plazmidok:
Extrakromoszómális cirkuláris dsDNS elemek.
Baktériumokban gyakoriak, de előfordulnak archeákban,
eukariótákban is. Virulencia, antibiotikum rezisztencia, stb.
géneket hordozhatnak.
Stringens vagy relaxált replikáció – alacsony vagy magas kópia
szám.
Klónozó vektorokként is használtak.
pl. élesztő 2 μm plazmid
Episzómák:
Olyan plazmidok, amelyek önállóan is replikálódhatnak a
citoplazmában, de képesek integrálódni a bakteriális
kromoszómába is.
Organellum genomok
Mitokondrium és kloroplaszt genetikai állománya.
Cirkuláris, prokarióta kromoszómára emlékeztető
dsDNS genomok.
Eredetük: endoszimbiózissal, gén transzfer a
nukleáris genomba, saját fehérje szintetizáló
rendszer bakteriális jellemzőkkel.
Köszönöm a figyelmet!
Az eukarióta kromatin szerkezete
A kromatin szerkezete
N-terminális farok:
mind a 4 core hiszton (H2A, H2B, H3, H4) rendelkezik vele, 19-39
aminosav hosszúságú.
C-terminális farok:
H2A és H2B rendelkezik vele.
A nukleoszóma
összeszerelődése során
két H3-H4 dimer egy H3-H4
tetramert képez,
majd ehhez kapcsolódik két
H2A-H2B dimer.
A nukleoszóma
összeszerelődése a replikációt
követően hamar bekövetkezik,
hiszton chaperon fehérjék
segítik.
A kromatin szerkezete
(a) (b)
o A sejtmagból kivont kromatin alacsony só koncentráció o Fiziológiás sókoncentrációnál a kromatin szál
mellett gyöngyfüzér szerű szerkezetet képez. kondenzáltabb, ~30 nm átmérőjű szerkezetet vesz fel, ez
a 30 nm-es rost.
o A gyöngyfüzér ~10 nm átmérőjű, ezért 10 nm-es rostnak
is nevezik, benne a gyöngyszemek a nukleoszómák. o A nem aktívan replikálódó vagy átírás alatt álló kromatin
szakaszok 30 nm-es rost formájában fordulnak elő.
o A nukleoszómákat linker DNS szakaszok kötik össze.
o A nukleoszómán található DNS és a hozzá tartozó linker
szakasz együtt ~200 bp DNS-t tartalmaz. A linker hossza
~10 – 90 bp között változhat.
o Az aktívan replikálódó vagy átírás alatt álló kromatin
szakaszok 10 nm-es rost formájában fordulnak elő.
A kromatin szerkezete
A fiziológiás körülmények között kialakuló 30 nm-es rost a 10 nm-
es rost további felcsavarodásával jön létre.
(a)
szolenoid szerkezet: a 10 nm-es rost helikálisan tekeredik fel, egy
csavarulatban 6 nukleoszóma található
(b)
two-start helix (cikk-cakk szerkezet): minden második egymást
követő nukleoszóma egymásra rendeződéséből két nukleoszóma
fonal jön létre, amelyek egymásra tekerednek bal kezes dupla
hélixet alkotva.
A módosítások
o megváltoztathatják a hisztonok kémiai tulajdonságait és
ezáltal a DNS-hez való kötődésük erősségét
o megváltoztathatják (létrehozhatják vagy eltüntethetik)
egyes kromatin (hiszton) kötő fehérjék kötőhelyét Egy nukleoszóma hiszton fehérjéin megfigyelhető
poszttranszlációs módosításokok összessége összefüggésben
áll a kromatin funkcionális állapotával: ez a hiszton kód.
A kromatin kód olvasása
például:
o bromodomén acetilált lizint ismer fel
o chromodomén metilált lizint ismer fel
Epigenetikai memória:
10 nm-es rost
o a sejtosztódás során
o interfázisos sejtmagban
30 nm-es rost
kromatin
hurkok,
kromonéma
kromatida
mitotikus
kromoszóma
Vége
Köszönöm a figyelmet!
A DNS megkettőződése: a replikáció
A molekuláris biológia centrális dogmája
transzkripció transzláció
replikáció
Replikáció
Szemikonzervatív
mechanizmus:
Konzervatív mechanizmus:
a lemásolt templát szál
a két új DNS szál egymással
és a róla másolt új DNS
alkot duplaszálú DNS-t
szál képez egymással
duplaszálú DNS-t
Meselson-Stahl kísérlet
Az eredmények a szemikonzervatív
replikációt támogatták.
A DNS szintézise
Ezért szükség van egy a templáttal komplementer rövid DNS vagy RNS
láncindító oligonukleotidra, ú.n. primerre, amelynek 3’-OH
csoportjáról indulva a DNS polimeráz bele tud kezdeni az új szál
szintézisébe.
A replikációval járó DNS topológiai probléma, hogy a két szál szétnyitása miatt a replikációs
villa előtt pozitív supercoil csavarulatok jönnek létre.
Topoizomeráz II: Kovalensen kötődik a DNS mindkét szálához, így duplaszálú törést hoz létre,
ahol átbújtat egy másik, kereszteződő DNS-t, majd zárja a DNS láncot. Ez ATP igényes folyamat.
Negatív supercoilt hoz létre a még nem szétnyílt szülői DNS-ben.
Prokarióta replikációs villa
„a ribonukleinsav és deoxyribonukleinsav
biológia szintézisének mechanizmusának
felfedezéséért"
Telomeráz
„a kromoszómák
telomerek és
telomeráz enzim általi
védelmének
felfedezéséért”
Vége
Köszönöm a figyelmet!
DNS hibák típusai, kialakulásuk forrásai, DNS
hibajavító mechanizmusok
DNS hibajavítás
Deamináció:
Bázis alkilálása
Melyik oldalon
vezethetnek Texasban?
o Excíziós DNS hibajavító rendszerek. Működésüket a DNS duplaszálú szerkezete teszi lehetővé. Alapműködésük
hasonló: eltávolítják a hibás, nem megfelelően illeszkedő nukleotidokat, majd a hiányt a másik szál alapján DNS
polimeráz és ligáz felhasználásával pótolják.
o Bázis excíziós repair (BER)
o Mismatch repair (MMR)
o Nukleotid excíziós repair (NER)
Különböző DNS
károsítóhatások eltérő
hibákat okoznak a DNS
szerkezetében.
A különféle hibákat
nekik megfelelő,
különféle hibajavító
rendszerek javítják.
A károsodások
következményei
lehetnek:
o Sejtciklus leállás
o Apoptózis
o Transzkripció és
replikáció gátlása
o Mutációk
DNS hibák közvetlen javítása
Bázis mismatch-eket valamint kis inszerciókat és deléciókat a mismatch repair rendszer (MMR)
javítja.
Ez a rendszer a replikációt követően működik, szálspecifikus
módon. Hogyan különböztetheti meg a régi és az új DNS szálat?
o Gram negatív baktériumokban a régi szál metilált, az új nem.
o Késlekedő szálon Okazaki fragmentumok közti nick-ek jelenléte.
Köszönöm a figyelmet!
A gének átírásának (a transzkripció)
mechanizmusa
A genetikai információ áramlás R
5’-C G U U A G C U G A A U C-3’
Génenként eltérő DNS szál szolgálhat templátul
Fontos:
A templát szál / értelmes szál megkülönböztetés csak egy génen belül érvényes.
A DNS mindkét szála szolgálhat templátul különböző géneknek (egyes géneknek az
egyik, másik géneknek a másik).
A transzkripció biokémiai mechanizmusa
5’
Promóter: az RNS polimeráz kötődési helye a génen, aszimmetrikus szekvencia így irányultságot ad a transzkripciónak
Transzkripciós start hely (TSS): a transzkripció során átírt első nukleotid pozíciója, +1 számozású
Kódoló szekvencia (CDS): aminosavakat kódoló nukleotidokat tartalmazó szakasz
Downstream: a transzkripció során az RNS polimeráz haladási irányába eső
Upstream: downstream-mel ellentétes irány
Elsődleges transzkript(um) / naszcens RNS: a transzkripció során képződő, még nem processzált RNS
Az transzkripciót folyamatát RNS polimeráz katalizálja
RNS szál DNS templát alapján történő szintézisét katalizálja.
az UP elemhez az α alegységek
kötődhetnek.
A prokarióták génszerveződésének jellegzetességei R
Prokarióták Eukarióták
eukariótákban egy
transzkripciós egységről
jellemzően egyetlen
polipeptidlánciot kódoló RNS
íródik át.
RNS pol I.
core promóter és upstream kontroll elem
A legfontosabbak:
Eukariótákban a transzkripció inicializációjához az RNS polimerázok mellett szükség van még úgynevezett
általános transzkripciós faktorokra (General Transcription Factor, GTF) is. Ezek:
Funkcióik:
o Segítik az RNS polimeráz promóterhez pozícionálását
o Elősegítik a DNS két szálának szétválasztását
o Elősegítik az RNS polimeráz promótertől való elszabadulását, az elongáció megkezdését
Az általános transzkripciós faktorok
Kulcsfontosságú ismeretek:
A DNS átírását (transzkripció) az RNS polimeráz enzim végzi, amely egyesével kapcsol ribonukleotidokat a növekvő
RNS lánc 3’ végéhez.
A templátként szolgáló DNS szál bázissorrendje (szekvenciája) meghatározza képződő RNS molekula bázissorrendjét.
A transzkripció iniciációja során az RNS polimeráz a promóterhez kötődik a DNS molekulán és lokálisan megolvasztja
a duplaszálú DNS-t, ezáltal hozzáférhetővé téve az egyesszálú templát szálat, majd polimerizálja a templáttal
komplementer első két nukleotidot. A 12-14 bázispárnyi egyesszálúvá vált (felolvadt) régiót transzkripciós
buboréknak nevezik.
Az RNS szál meghosszabbítása (elongációja) során az RNS polimeráz a DNS mentén halad felolvasztva a DNS-t a
polimeráz előtt, így a templát szál bejuthat az enzim aktív helyére. A DNS szétvált komplementer szálai a polimeráz
mögött ismét összeilleszkednek. A transzkripciós buborék együtt halad az RNS polimerázzal, ahogy az enzim a
templáttal komplementer ribonukleotidokat ad a növekvő RNS szál 3’ végéhez.
Amint az RNS polimeráz a terminációs szekvenciához ér a DNS-en, az enzim abbahagyja a transzkripciót, ami a kész
RNS molekula felszabadulását és a polimeráznak a DNS-ről való disszociációját eredményezi.
Transzkripció
Felvetődhet, hogy:
1) Nem azonos genetikai információt
hordoznak.
2) Azonos genetikai információkat eltérő
módon fejeznek ki.
o Cisz-hatású szabályozó elemek: A szabályozott génnel azonos DNS szakaszon lévő DNS
szekvenciák, promóterek, operátorok, szabályozó szakaszok. Ezek fehérje faktorok kötő
helyei.
helix-loop-helix:
β-lemez DNS felismerő fehérjék:
Leucin cipzárhoz hasonló szerkezet.
Kétszálú β-lemez fekszik a DNS nagyárkába. Egy rövidebb és egy hosszabb α-hélixből, valamint
ezeket összekötő hurokból áll, amely flexibilitást
biztosít.
Két ilyen szerkezet dimert képez egymással, a
dimerből kinyúló hélixek a DNS nagyárkába
fekszenek.
A transzkripciós regulátorok dimerizációja
o A transzkripciós regulátorok gyakran dimerként kötődnek
az általuk felismert DNS-hez.
A baktériumokban
különböző
Háztartási gének, a legtöbb gén exponenciálisan faktorok segítik
replikálódó sejtekben eltérő funkciójú
Stacionárius-fázis gének és általános stressz válasz géncsoportok
gének
transzkripcióját.
A citoplazmában lévő rossz térszerkezetű fehérjék
által indukált gének: dajka fehérje (chaperon,
fehérje szerkezet kialakulását segítő) és proteáz Ez önmagában
(fehérje bontó) rendszer elemeit kódoló gének
azonban nem
A periplazmatikus térben és a sejtmembránban lévő rossz magyarázza,
térszerkezetű fehérjék által indukált gének; a sejtburok hogyan
integritásának helyreállításában szerepet játszó gének
szabályozódik az
Flagellum összeszerelődéséért felelős gének egyes génekről
Vas felvételéért felelős gének átírt
transzkriptumok
Nitrogén metabolizmusban szerepet játszó gének mennyisége.
Pozitív és negatív szabályozás
A bioszintetikus útvonalakban
szereplő géneket a végtermék
általában negatívan szabályozza.
A triptofán operonban 5
struktúrgén található, melyek a a
triptofán bioszintéziséhez
szükségesek.
A szabályozás célja:
Az E. coli sejtek számára a glükóz könnyebben hasznosítható
energiaforrás, mint a laktóz, ha glükóz rendelkezésre áll, akkor a sejtek
annak a felhasználását preferálják. Így a szabályozás célja, hogy:
• ne termelődjenek a laktóz bontásához szükséges enzimek (ne legyen
aktív a lac operon), ha nincs a tápoldatban laktóz
• ha van a tápoldatban laktóz, akkor is csak akkor legyen aktív a lac
operon, ha glükóz nincs jelen
• azaz: csak akkor legyen aktív a lac operon, ha laktóz van, glükóz
viszont nincs
A lac operon szabályozása: negatív és pozitív szabályozás
A szabályozás célja: csak akkor legyen aktív a lac operon, ha laktóz van,
glükóz viszont nincs a tápoldatban.
Negatív szabályozás:
• A lac oprontól független lacI génről lac represszor fehérje termelődik.
• A lac represszor önmagában (tetramerként) kötődik a lac operátorhoz,
és gátolja a transzkripciót.
• Ha laktóz jelen van, az inducerként kötődve a lac represszorhoz gátolja
annak operátorhoz kötődését, így derepresszálja az operont.
Pozitív szabályozás:
• A CAP transzkripciós aktivátornak is van kötőhelye a lac operon
promótere közelében.
• A CAP koaktivátora a cAMP, ezzel kapcsolódva köt csak az operonhoz.
• Glükóz hiányában a sejtben megemelkedik a cAMP szint.
• Magas cAMP szint mellett a CAP a cAMP koaktivátorral kötődve
kapcsolódik a lac promóterhez, és fokozza onnan a transzkripciót.
A lac operon szabályozása: negatív és pozitív szabályozás
Az attenuáció a génkifejeződés
szabályozásának egy olyan formája, amely
nem a transzkripció iniciációjának DNS kötő
faktorok segítségével történő szabályozásán
alapul, hanem a kapcsolt transzláció
működésétől függ.
o Enhanszerek: a szabályozott géntől nagy távolságban (több ezer-tízezer bp), upstream vagy downstream is
elhelyezkedhetnek, orientáció független módon. Általában ~50-200 bp hosszúak, több rövid (6-10 bp)
regulátor elemet tartalmaznak, ezek transzkripciós faktorok kötőhelyei.
pl.
o Az élesztő GAL4 transzkripciós faktora galaktóz
metabolizmusában szereplő géneket aktivál.
o A GAL4 az általa szabályozott gének szabályozó
régiójában található 17 bp hosszú UASGAL4
szekvenciá(k)hoz kötődik.
o A GAL4 két funkcionálisan önálló doménre bontható:
• N-terminális DNS-kötő domén (~50 aminosav)
• C-terminális aktivációs domén (~20 aminosav) Az eukarióta transzkripciós regulátorokra
(aktivátorokra és represszorokra is) általában
jellemző az ilyen moduláris felépítés
Az eukarióta transzkripciós regulátorok csoportban működnek
Alegységei különböző
aktivátor doménekkel
rendelkező transzkripciós
faktorokkal hatnak kölcsön,
azok hatását mintegy
hídként szolgálva közvetítik.
A transzkripciós regulátorok elősegíthetik a transzkripciós starthely elhagyását
kromatin Az eukarióta
kompetitív átrendező
komplexek transzkripciós
DNS kötés
toborzása represszorok a
prokariótáknál
jellemző polimeráz
aktivációs
kötőhely
felület blokkoláson túl
blokkolása számos más
hiszton mechanizmussal
deacetilázok hathatnak.
toborzása
közvetlen Gyakran
kölcsönhatás korepresszorokat
általános toboroznak, melyek
transzkripciós hiszton metil-
transzferázok
kromatin módosító
faktorokkal
toborzása hatásúak is
lehetnek.
Jellemző kromatin jelek aktív és inaktív géneken
Inzulátor (szigetelő) szekvenciák
Eukarióta Prokarióta
Eltérések:
Szerepe:
o Megkülönböztetés: megjelöli az mRNS transzkriptumokat –
csak az RNS polimeráz II által szintetizált RNS-eken lesz ez a
módosítás, mivel csak ennek a polimeráznak van CTD-je.
o Hozzá egy fehérje komplex, a CBC (cap-binding complex, cap-
kötő komplex) kapcsolódik, amely szerepet játszik az RNS
további érésében és exportjában.
o Szerepet játszik a splicing folyamatában.
o Szükséges az mRNS exportjához.
o Fokozza az mRNS stabilitását (védi az exonukleázoktól).
o Transzláció során segíti az mRNS 5’ végének felismerését.
Az eukarióták génjei szabdaltak
össze-spliceolt exonok,
a splicing helyéhez exon junction
complex (EJC) kapcsolódik
snRNS átrendeződések a splicing során
Példa:
transzkripciós aktivátor ill. represszor
keletkezése ugyan arról a génről
Az RNS 3’-végének poliadenilációja
Funkciói:
o fokozza az mRNS stabilitását
A poly-A farok helye a genomban kódolt a 3’ vágás és o mRNS export a magból
poliadenilációt helyét megszabó konszenzus o hozzájárul a transzláció iniciációjához
szekvenciákkal.
rRNS gének:
• humán 200 rRNS gén
• 5 kromoszómán klaszterekben
• ezek (és a hozzájuk asszociálódó faktorok)
alkotják a sejtmagvacskát
Tandem ismétlődő rRNS géneken folyó transzkripció
elektronmikroszkópos képe
Az rRNS-ek transzkripciója és érése
Érésük:
o 5’ szekvencia lehasítása - RNase P (egy ribozim).
o 3’ UU cseréje CCA-ra.
o Intron eltávolítás fehérje enzimmel (nem spliceoszóma
felhasználásával).
o pre-tRNS bázisok mintegy 10% kémiai módosításon esik át,
például:
• guanin dimetilációja
• adenozin deaminációja inozinná
• uridin átalakítása dihidrouridinné
• uridin átalakítása pszeudouridinné
A microRNS-ek transzkripciója és érése
A miRNS-ek a genomban kódolt, kis (20-24 nt), nem kódoló,
szabályozó hatással bíró RNS molekulák.
1. alternatív splicing
2. alternatív poliadenilációs hely használat
3. hibásan processzált mRNS-ek magi exoszómális degradációja
4. transzláció iniciációja
5. mRNS degradációja P bodyban (decapping, deadeniláció,
citoplazmatikus exoszóma általi bontás)
6. poliA farok nélküli mRNS-ek citoplazmatikus poliadenilációja
7. miRNS általi transzlációs gátlás
8. a. tRNS-ek és b. rRNS-ek érése
9. RNS processzálási folyamatokból származó RNS maradványok magi
exoszómális degradációja
Köszönöm a figyelmet!
Transzláció: a fehérjék bioszintézise
Transzláció
A genetikai kód szinte teljesen univerzális, ezzel alátámasztva a földi élet közös (egyszeri) eredetét.
Néhány kivétel ismert a kód univerzalitása alól, ezekben az esetekben legtöbbször egy-egy STOP
kodon kerül felhasználásra aminosav kódolására.
o A legtöbb aminosavat több (2-6) kodon kódolja, az azonos aminosavat meghatározó különböző kodonokat
szinonim kodonoknak nevezzük.
G-C-U-U-G-U-U-U-A-C-G-A
Transzláció – leolvasási keret
Minden leolvasási keretben eltérő aminosav A 3-mal (kodon hossza) maradék nélkül nem osztható
szekvenciát kapunk a dekódolással, így a 3 hosszúságú deléciók és inverziók eltolják a leolvasási
leolvasási keret elviekben akár 3 fehérjét is keretet – ezek a frame shift vagy keret eltolási mutációk.
kódolhatna. A mutációt követő aminosav szekvencia az eredetitől
(Átfedő leolvasási keretek a valóságban is eltérő, mert másik leolvasási keret (frame) kódolja.
előfordulnak, de nagyon ritkák.)
Transzláció
A tRNS háromdimenziós
szerkezete L alakot formáz,
melynek átellenes végein
találhatóak az aminosav
akceptor kar és az antikodon
kar.
Néhány tRNS-ekben előforduló módosított nukleotid
Transzláció – tRNS-ek
Magyarázat:
Egy tRNS több kodont is felismerhet (lötyögés
jelensége), ami magyarázatul szolgál arra, hogyan
lehet kevesebb tRNS mint kodon.
Lötyögés (wobble)
Visszatekintve a kódtáblára:
új peptidil-tRNS a növekvő
A polipeptid lánc szintézise N-terminális ➔ C-terminális irányú. polipeptid lánc C-
terminálisához kapcsolva
A fehérjeszintézis során a készülő polipeptid lánc C-terminális karboxil csoportja
és az újonnan a lánchoz adódó aktivált aminosav amino-csoportja között alakul
ki peptid kötés.
S: svedberg egység
– ülepedési állandó, A prokarióta és eukarióta
mérettel
logaritmikusan
riboszómák mind
arányos szerkezetileg mind
funkcionálisan hasonlóak.
A riboszómákban a rRNS :
fehérje tömegaránya 2 : 1
A riboszóma szerkezetének
kialakításáért az rRNS-ek
felelősek.
A transzláció iniciációja során biztosítani kell, hogy a legelső kodon azonosítása megfelelően
történjen, különben leolvasási keret eltolódás következik be.
Emellett az iniciáció a fehérje szintézis alapvető szabályozási pontja.
Az iniciátor tRNSi eltér a transzláció elongációja során metionint szállító tRNS-től, de ugyan az a
szintetáz enzim tölti fel.
Kizárólag az iniciátor Met-tRNSi képes a 60S-sel nem asszociált 40S kis alegység P helyéhez
kötődni. (A többi aminoacil-tRNS-ek a 80S riboszóma A-helyéhez kötnek.)
Prokariótákban:
o EF-Tu: aminoacil-tRNS riboszómához szállítását végzi
o EF-Ts: EF-Tu guanozin cserélő faktora (GDP→GTP)
o EF-G: a riboszóma mRNS-en történő transzlokációját segíti
Eukariótákban:
o eEF-1A: aminoacil-tRNS riboszómához szállítását végzi
o eEF-1B: eEF-1A guanozin cserélő faktora (GDP→GTP)
o eEF2: a riboszóma mRNS-en történő transzlokációját segíti
Transzláció – elongáció
Eukarióákban:
o eRF1: tRNS-hez hasonló szerkezetű, az A helyre
kötődve a STOP kodont ismeri fel.
o eRF3: GTP kötő fehérje. eRF3:GTP ellenőrzi, hogy
eRF1 megfelelő kodonhoz kötődött-e, majd a GTP-t
hidrolizálva elősegíti a P helyen a peptidil-tRNS
kötés felszakítását, így felszabadítva az elkészült
fehérjét.
Prokariótákban:
o RF1 és RF2: eRF1-nek felel meg
o RF3: eRF3-nak felel meg
o Iniciáció:
Hatásuk lehet:
o peptidil transzfer gátlása
o az alegységek elmozdulásának gátlása
o polipetid csatorna elzárása
o stb
Inhibítor Hatás
Baktériumokon ható
Tetracycline Aminoacil-tRNS A helyre kötődését gátolja
Streptomycin Iniciáció – elongáció átmenetet gátolja
Chloramphenicol Peptidil transzferáz reakciót gátolja
Erythromycin A polipeptid kimeneti csatornát köti és blokkolja
Baktériumokon és eukariótákon is ható
Puromycin A polipeptidlánc végéhez kapcsolódva idő előtti terminációt okoz
Eukariótákon ható
Cycloheximide Gátolja a riboszóma transzlokációját
Anisomycin Peptidil transzferáz reakciót gátolja
további fehérje
alegységek kötése
A fehérje térszerkezetének felvételét folding-nak nevezik.
A fehérje a folding során energetikailag kedvező állapotba
(legalacsonyabb szabad energia) kerül.
Köszönöm a figyelmet!
Protein sorting
Protein sorting
A fehérje transzlokációt
biztosító címzések
meghatározásában a rövid
szorting szignál szekvenciát
alkotó aminosavak minősége,
sorrendje és a belőlük
kialakuló peptid rész
térszerkezete egyaránt
szerepet játszik.
Mitokondrium
o A mitokondriumok és a kloroplasztiszok a
citoplazmában található, dupla biológiai
membránnal határolt organellumok.
sztróma
Transzport a mitokondriumba
Transzport a citoplazmából a
mitokondrium mátrixba:
A mitokondriumba kerülő fehérjék foldingja nem játszódik le szintézisüket követően, hanem Hsp70
chaperonokkal kapcsolódva kitekeredett (unfolded) állapotban maradnak.
A transzport előtt ATP hidrolízissel összekapcsolva a Hsp70 disszociál a fehérjéről, majd a mitokondrium
mátrixba jutott részhez a mitokondriális Hsp70 kapcsolódik ismét.
A transzporthoz szükséges energiát részben az ATP hidrolízis, részben a belső membrán két oldala
között fennálló elektrokémiai proton gradiens biztosítja.
Transzport a mitokondriumba
Transzport az ER-ba:
transzmembrán transzport membránba épült
transzlokátorokkal, a transzport rendszerint a
fehérje transzlációja közben történik, a fehérje
rendszerint unfolded állapotban van.
Az ER szignál peptidhez és a riboszómához kapcsolódott SRP kötődik az ER membrán citoszolikus oldalán lévő
SRP-receptorhoz, ami a riboszómát a szintetizálódó polipeptid lánccal együtt a transzlokátorhoz továbbítja.
A riboszóma a transzlokátorhoz kapcsolódik, a kötődés az SRP-hez és SRP-receptorhoz megszűnik. A
fehérjeszintézis folytatódik, a szintetizálódó peptidlánc egyenesen az ER lumenbe transzlokálódik.
A transzlokátort (Sec61 komplex) három transzmembrán fehérje alegység alkotja. A teljes komplex egy fánk-alakú szerkezet,
ami egy vizes csatornát képez. A riboszóma úgy kapcsolódik a transzlokátorhoz, hogy a kilépő polipeptidláncot vezető
csatorna egyenesen a transzlokátor alkotta csatornában folytatódik.
Az endoplazmatikus retikulummal kapcsolatos transzportfolyamatok
funkciója:
• helyes térszerkezet kialakulásának (folding)
elősegítése
• stabilitás biztosítása
• sejtek közötti kapcsolódás, antigenicitás
A foldingot elősegíti:
A fehérjék foldingját az ER-ben működésükhöz Ca2+-
o diszulfid hidak kialakulása
ot igénylő chaperonok, a calnexin és calreticulin
o glikoziláció: lectinek (szénhidrát-kötő fehérjék,
segítik elő.
chaperonok)
Az oligoszacharid részekhez kötődnek és kitekeredett
(un-folded) állapotban tartják a fehérjét,
megakadályozzák a helytelen térszerkezetű szakaszok
kialakulását és aggregációját, valamint elősegítik más
chaperonok kapcsolódását is.
A folyamat során:
o A fehérjére egy többlépéses mechanizmussal
poliubiquitin lánc kapcsolódik.
o A többalegységes proteaszóma degradálja a
poliubiquitinált fehérjét.
Vezikuláris transzport:
A transzport membránnal körülvett csomagokban, vezikulumokban
történik.
A vezikulum lefűződik az egyik kompartmentről és fúzionál egy
másikkal, tartalmát egyikből a másikba átvíve, pl. ER-ből a Golgi-ba
Intracelluláris Vezikuláris Transzport
→ szekretoros
→ endocitikus
→ visszairányítás
Intracelluláris Vezikuláris Transzport – burkos vezikulumok
A különböző útvonalak egyes lépéseiben eltérő típusú
vezikulumok vesznek részt
Vezikulum típusok:
1. clathrin burkos: clathrin + egyéb fehérjék
2. COPI burkos: COP fehérje alegységek
Mielőtt a vezikulum a cél membránnal fuzionál a
3. COPII burkos: Sec23/Sec24, Sec13/Sec31, Sec16 burok fehérjék eltávolításra kerülnek.
Intracelluláris Vezikuláris Transzport – transzport útvonalak
Köszönöm a figyelmet!
Sejtek közötti
kommunikáció https://www.moleculardevices.co
m/sites/default/files/applications/
banners/cellular-signaling-and-
responses.jpg
Sejtek közötti kommunikáció (Szignáltranszdukció)
LÉPÉSEI:
Endokrin
- a jelmolekula a jelet termelő sejttől távolra jut a véráramon
keresztül
- távoli hatás
- hormonok pl. inzulin
Parakrin
- a jelmolekula a jelet termelő sejt közelében marad
- hatás a közelben
- neurotranszmitterek, növekedési faktorok
Autokrin
- a sejt önmaga által termelt jelre válaszol
- növekedési faktorok, tumor sejtek
A jelmolekula transzportja (3) alapján a jelzés típusa
Kontaktus-függő
- a jelmolekula a jelet termelő sejt felszínéhez kötött
- fizikai kapcsolat alakul ki a jelet termelő és a jelet
gap junctions membrán-kötött membrán-kötött felfogó sejt között
jelmolekula receptor
Átfedések:
• Adrenalin: neurotranszmitter (parakrin) és hormon
(endokrin) is
• EGF: kontakt-függő, vagy parakrin, autokrin
Az extracelluláris jelzés típusai (3)
Szinaptikus Endokrin
• gyors • lassabb
• magas koncentrációban • a jel hígul
• a jel célzottan diffundál • nem célzott
• alacsonyabb affinitású receptor • magas affinitású receptor
Jelmolekulák, ligandok (1)
✓Rövid féléletidő
✓Intracelluláris receptor
✓Enzimaktivitás szabályozás
Kortikoidok
Nemi hormonok
Tiroxin ✓sejtmembránon átdiffundálnak
Retinsav ✓transzkripció szabályzás
D vitamin ✓hatás lassan alakul ki, de tartós (órák, napok)
Jelmolekulák, ligandok (1)
Acetil-kolin
Adrenalin/Epinephrin
Dopamin
Szerotonin
Hisztamin
γ-amino-vajsav
✓Rövid féléletidő
Neurotranszmisszió,
✓Enzimaktivitás szabályozás,
metabolizmus szabályozás,
gyors hatásidő
izomműködés, stb
Jelmolekulák, ligandok (1)
4. Peptid/fehérje molekulák
• sejtfelszíni receptorhoz kötődnek
inzulin
Eritropoietin
Peptid hormonok
Növekedési faktorok, ✓Hatásuk néhány perc – órák
Interleukinok ( IL-x), ✓Hatásuk lehet enzimaktivitás szabályzása (gyors hatás),
Citokinek valamint transzkripció szabályzás (lassabb, tartós hatás)
Interferonok (INF-α, β, γ)
Jelmolekulák, ligandok (1)
Prosztaglandin E2
https://bodell.mtchs.org/OnlineBio/BIOCD/text/chapter32/32images/32-12.gif
Jelmolekula érzékelése (4), receptorok
- Fehérjék
- Sejtmembránban, citoplazmában, sejtmagban
- Legalább két funkcionális domén:
- Ligand-kötő domén: felismeri és köti a ligandot
- Effektor domén: sejtfunkciós hatást kapcsol a ligand kötődéshez
Sejtfelszíni receptorok
3 domén: extracelluláris domén – ligand kötés
transzmembrán domén
intracelluláris domén – kölcsönhat más fehérjékkel
1. Ioncsatorna receptorok
- Pl. acetilkolin, GABA, glutamát kötése
- konformáció változás → csatorna nyitás vagy zárás
https://www.news-
medical.net/image.axd?pi
cture=2018%2F10%2Fshut
terstock_479593594.jpg
https://www.nature.com/scitable/content/ne0000/ne0000/ne0000/ne0000/14673543/U4.cp2.1_nature01307-f1.2.jpg
Jelmolekula érzékelése (4), Sejtfelszíni receptorok típusai
http://www.macmillanhighered.com/externalcontent/learningcurve.bfwpub.com
/question_pics/Life10eLC_Ch07.29_30.jpg
https://img.brainkart.com/article/article-Cytokine-Receptors-OjU.jpg
Jelmolekula érzékelése (4), Jel-Receptor kapcsolat
A sejten/ben lévő receptorok határozzák meg, hogy a sejt milyen külső jel(ek)re reagál
Minden receptor csak egy (illetve egyféle típusú) jelmolekulát köt = receptor ligandkötő specifitása
A kiváltott sejtválasz alapján a ligand-receptor komplexre jellemző egy effektor specifitás
Ugyanaz a jel => különböző szövetekben különböző Eltérő jel => ugyanazon szövetben hasonló típusú receptorok =>
receptor típusok => eltérő jelátviteli útvonal => eltérő ugyanaz a sejtválasz
sejtválasz májsejtek: glükagon => cAMP útvonal => glikogén lebontás
adrenalin => ß-adrenerg út => glikogén lebontás
Jelmolekula érzékelése (4), Ligand-Receptor kötés
Ligand analógok:
Muscarin: acetilkolin
agonista a muszkarinos
Ach receptorokon
Atropin: acetilkolin
antagonista a muszkarinos
Ach receptorokon
Jelmolekula érzékelése (4), Jel-Receptor kapcsolat
kon[R][L]=koff[RL]
Tesztkérdés:
A sejtek gyakran a
jelmolekulák specifikus
kombinációira reagálnak.
Extracelluláris jel
Receptor
Direkt transzdukció
Intracelluláris
jelátviő fehérjék
Indirekt transzdukció
Célfehérjék
Gyakori mechanizmusok a jelátvitelben (5;6)
• Jelközvetítő fehérjék:
• Foszforilációs változások
(Kinázok/Foszfatázok)
• G fehérjék közreműködése
Intracelluláris
jelátviő • Adaptor/Scaffold fehérjék részvétele
fehérjék
• Másodlagos jelátvivők (Amplifier
fehérjék szintetizálják)
Gyakori mechanizmusok a jelátvitelben (5;6)
O
Foszforiláció - Defoszforiláció Protein OH + ATP Protein O P
O
+ ADP
Kinázok Pi
Protein H2 O
Phosphatase
• lehetnek receptorok és intracelluláris protein kinázok
• Specifikus aminosavakat foszforilálnak (célfehérje kör)
• Aktivitás alapján két típusa: - Tirozin (Tyr) kinázok: - receptorok (RTK-növ. faktor receptor)
- szolubilis intracell. tirozin-kinázok (JAK)
- Szerin-treonin (Ser/Thr) kinázok: -receptorok (RSTK:TGFβ receptor)
- non-receptorok (PKA; PKC; MAPK; RAF)
• Aktivitásuk szabályzott
(foszforiláció, fehérje kötés, másodlagos messenger)
Foszfatázok
• Protein tirozin foszfatázok
• Protein szerin/treonin foszfatázok
Gyakori mechanizmusok a jelátvitelben (5;6)
protein-GTP (active)
GDP
GEF GAP
GTP Pi
protein-GDP (inactive)
O H2C O C R2
O R1 C O CH
O H2C O C R2 H2C OH
diacylglycerol
• diffúzibilisek – jel szétterjed a sejten belül
R1 C O CH O
H2C O P O
(vagy a membránban – DAG) cleavage by O H OPO32 H
6
• termelődésük jelamplifikációt okoz 1 6 1 2
Phospholipase C OH OPO 2
3 OH OPO3
H OH H OH
2 5 2 5
OH H OH H
H H H H
PIP2 3 4 3 4
2
phosphatidylinositol- H OPO32 H 3 OPO
IP 3
4,5-bisphosphate inositol-1,4,5-trisphosphate
Jelpályák áttekintése (5;6)
INTRACELLULÁRIS (sejtmagi)
RECEPTOROK
SEJTFELSZÍNI RECEPTOROK
Intracelluláris receptorok (5;6)
Sejtmagi receptorok
• Ligand: kis lipofil molekulák
szteroid hormonok (aldoszteron, kortizol, nemi hormonok)
tiroid hormonok (tiroxin)
D-vitamin, retinsav
vérben - órákig, napokig keringhetnek
• tiroid hormon,
retinsav jelátvitel
INTRACELLULÁRIS (sejtmagi)
RECEPTOROK
SEJTFELSZÍNI RECEPTOROK
Sejtfelszíni receptorok (5;6)
1. Ioncsatorna receptorok
• integráns membránfehérjék
• nyitható-zárható, ligand-függő ionpermeábilis csatorna 2. Csatorna
nyitás
• gyors válasz (ms-os reakció)
• főként szinaptikus jelátvitelben szerepelnek
• szelektivitás: - ligandkötés (neurotranszmitter)
- ionáram (ioncsatorna)
Általános jellemzők:
a legnagyobb sejtfelszíni receptor család (több 1000 Hormonkötéskor – a receptor G fehérjét aktivál
emlősökben)
G fehérje aktivációja
Receptor-ligand kötés: konformáció
változás, a G-fehérje által kötött GDP
GTP-re cserélődik
G-fehérje aktiváció
Pl. ß-adrenerg receptor Pl. α2-Adrenerg receptor Pl. α1-Adrenerg receptor Pl. szívizom M2-acetilkolin
receptor
G fehérjével kapcsolt receptorok jelátviteli útvonalai
cAMP
• másodlagos hírvivő
molekula
• Adenilát-cikláz szintetizálja
• cAMP foszfodiésztreáz
bontja
Adenilát cikláz
• ATP → cAMP képződés
• transzmembrán fehérje MÁSODLAGOS JELÁTVIVŐ szerepe jelátvitelben:
• Gαs protein (serkentő) α alegysége aktiválja jelamplifikáció, felerősödik a jel
• Gαi protein (gátló) α alegység gátolja diffúzibilis, a jelképzés helyétől szétterjed a jel
G fehérjével kapcsolt receptorok jelátviteli útvonalai
• Gαs fehérje Adenilát-ciklázt enzimet aktivál => cAMP => protein kináz A-t aktiváció
https://www.researchgate.net/publication/281393919/figure/fig2/AS:2806512668
38531@1443923884174/PKA-structure-showing-classical-and-oxidative-activation-
Classical-activation-of-PKA.png
Glükagon → glükagon receptor (G-protein kapcsolt receptor) kötés → Gαs fehérje aktiváció
→ adenilát-cikláz aktiváció → cAMP szint növekedés
→ PKA aktiváció
+ -
Glikogén foszforiláz kináz Glikogén szintáz (GS)
(GPK)
• Gyors sejtválasz
Foszfolipáz C-ß
• Plazmamembránhoz kapcsoló enzim
• Gqα G-fehérje alegység aktiválja
• A foszfoészter kötést bontja a foszfatidil-
inozitol-4,5-biszfoszfátban (PIP2)
↓
Termékek: Inozitol-1,4,5-trifoszfát (IP3) másodlagos
Diacil glicerol (DAG) jelátvivők
- Ca2+/calmodulin-függő protein-kinázok
(pl. miozin könnyűlánc kináz)
- cAMP foszfodiészteráz
- NO szintáz
G fehérjével kapcsolt receptorok jelátviteli útvonalai
G fehérjékkel kapcsolt
receptorok (GPCRs)
Saját enzimaktivitással Intracelluláris protein kinázzal
asszociált receptorok
rendelkező receptorok
Receptor tirozin kinázok (RTK) jelpályája Ligand kötés → Tyr kináz domén aktiválás
Ras:
GAP Monomer GTP-áz, molekuláris kapcsoló
Ras aktiváció – proliferáció, differenciáció
Ras hiperaktivitása – rákos daganat (30 %)
A Ras fehérje aktivitását befolyásoló
faktorok:
GEF: guanil nukleotid kicserélő fehérje
GAP: GTPázt aktiváló fehérje
A Ras fehérje az autofoszforilálódott receptor tirozin kinázon öszeszerelődő, GEF tartalmú komplex révén aktiválódik.
Saját enzimaktivitással rendelkező receptorok
Receptor tirozin kinázok (RTK) jelpályája
A, Ras aktiváció
• indirekt úton a GEF aktiválásán keresztül
Ligandkötött receptor – dimerizáció
(oligomerizáció)
A GTP-kötött (és így aktiválódott) RAS számos fehérjével 3, A GEF aktiválja a Ras fehérjét (GDP-GTP csere)
képes interakcióba lépni és így továbbítani a jelet.
4, Az aktivált MAPK (szerin/treonin kináz) transzkripciós faktorokat, a sejtciklus szabályozásban résztvevő fehérjéket és
egyéb effektor fehérjéket aktivál a foszfát-csoport transzfer révén.
Saját enzimaktivitással rendelkező receptorok
Receptor tirozin kinázok jelpályája
B, PIP3 – PKB útvonal
A ligandkötés során aktiválódó receptor tirozin-kinázok nem csak a RAS aktivációban játszanak szerepet!
✓Ciklinek
Cdk(s): Ciklin-függő-kináz(ok)
Szerin-treonin protein-kinázok
✓Ciklin-dependens kinázok (CDK)
Mennyiségük nem változik a ciklus során
DE:
✓Ciklin-dependens kináz inhibitorok (CKI) Az aktivitásuk ciklikusan változik a ciklus során.
- Aktiválják a CDK-kat
Cdc25 foszfatáz:
Wee1: Protein kináz defoszforilálva a
foszforilálva inaktiválja Wee1 által
a komplexet foszforilált helyeket
aktiválja a Cdk-t
A retinoblastoma fehérje hiperfoszforilációja és az így felszabaduló E2F transzkripciós aktivitása döntő lépés a
G1 fázis restrikciós pontjának átlépése során.
A restrikciós pont átlépése után a sejtciklus már nem fordítható vissza és végbemegy a sejtosztódás folyamata.
Visszacsatolások, amelyek a G1/S tranzíciót szabályozzák:
- E2F fokozza saját transzkripcióját
- E2F fokozza G1/S és S-ciklinek transzkripcióját, ez fokozott G1/S-Cdk és S-Cdk aktivációt eredményez, ami fokozza
Rb foszforilációját és ennek következtében az E2F aktivációt
Az S (szintézis) fázis szabályozó rendszere
Következtetés
a G1 fázisú sejtek replikáció kompetensek,
a G2 fázisban lévők nem képesek újra replikációt kezdeni, hiába biztosított az S-Cdk aktivitás
Az S (szintézis) fázis szabályozó rendszere
Korai G1
Cdc6 koncentrációja növekszik, kapcsolódik az ORC-hez.
Ez elősegíti az Mcm fehérjék kapcsolódását: létrejön a pre-replikációs komplex
(pre-RC).
S-fázis: S-Cdk aktiválódik -> ORC foszforiláció: elindulhat a replikáció
Reiniciáció gátlása:
Az S-Cdk foszforilálja a Cdc6-t, így az lebomlik (SCF komplex általi ubiquitináció,
proteoszómális lebontás)
Ezzel kizárt az pre-RC komplex újra összeszerelődése.
M-Cdk aktivációja:
A G2 végén aktiválódik a Cdc25 foszfatáz: eltávolítja az M-Cdk-t gátló foszfát csoportokat
Cdc25 aktiválója: Polo kináz és az M-Cdk pozitív feedback
(az M-Cdk által foszforilálva a Wee1 is gátlódik)
Profázis
Prometafázis
Anafázis
A testvérkromatidok szétválnak -
Metafázis kinetochor mikrotubulus rövidülése
Telofázis - citokinézis
Mi történik, ha a sejt DNS állományát károsodás éri? (pl. ionizáló sugárzás -> duplaszálú törés)
p21 CDK
inhibitor
Tumorbiológiai alapok
2023
A daganatos elváltozások főbb ismérvei
Normál sejtek osztódására csak akkor kerül sor, ha ez szükséges a szervezet működése szempontjából és
jelen vannak a sejtosztódást elindító növekedési faktorok.
Forrás: Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality
Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries ( https://doi.org/10.3322/caac.21660)
A jó- és rosszindulatú daganatok főbb eltérései
K. Yamagiwa
A tumorképződés lehetséges okai
A vírusfertőzések a daganatos
betegségek kb. 15%-áért felelősek
A tumorképződés lehetséges okai
Gastrointestinal
cancer
Humán rosszindulatú
daganatok kialakulásában
szerepet játszó fontosabb
vírusok (onkovírusok):
Merkel cell
carcinoma
Proto-onkogén:
• A normális sejtben előforduló,
annak osztódását, túlélését elősegítő fehérjét kódoló gén.
• Funkciónyeréses mutáns változata (onkogén) a sejtekben hibásan
működik (megváltozott a szerkezete, vagy rossz helyen/rossz intenzitással
működik), így fokozva a sejtosztódást, növekedést, túlélést, stb.
Tumorszupresszor gén:
• A sejt osztódásának szabályozásában gátló hatású gén, vagy a
DNS hibajavításban szerepet játszó fehérjét kódoló gén, ami a
rákos sejtben inaktiválódik, vagy hiányzik (funkcióvesztés).
(Proto)onkogének
Protoonkogéneket a
szignalizációs útvonalak
több szintjén is találunk
⚫ Növekedési faktor
receptorok
⚫ Intracelluláris protein-
kinázok
⚫ Transzkripciós faktorok
Protoonkogén aktiváció
Protoonkogén
DNS repair folyamatokban részt vevő fehérjék génjeinek funkcióvesztéses mutációja gyakran játszik szerepet
„családilag öröklődő” daganatok létrejöttében
A rosszindulatú daganatok genetikai, patológiai, terápiás válaszadás szempontjából egyaránt heterogén betegségcsoport
- intertumor heterogenitás: az egyes páciensek daganatai egyediek a bennük azonosítható mutációk kombinációja révén
- intratumor heterogenitás: egy adott páciens daganatát alkotó sejtek sem egyformák genetikailag
(folyamatos adaptáció-szelekció érvényesül)
Intertumor heterogenitás
Intratumor heterogenitás
Robert A. Weinberg & Douglas Hanahan
- listázzák a daganatokra általánosan
Tumorsejt
jellemző képességeket, jellemvonásokat
szubklónok (Cell, 2000 és 2011; Hallmarks of cancer)