Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem

Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék

Biomérnöki műveletek labor

Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve

Gyakorlat dátuma:
2021.10. 20.

Laborvezető: Czinkóczky Réka

E-mail cím: czinkoczky.reka@vbk.bme.hu

Készítette: 47/14. csoport

Kiss Virág Tünde : Folytonos fermentációs modell

Juhász Andrea Julianna : Folytonos fermentációs kiegészített modell

Kántor Gergely : Folytonos, sejtvisszatartásos fermentációs modell

Pozsár Adrienn : Félfolytonos fermentációs modell

Kleineisel Ádám Viktor : Rátáplálásos fermentációs modell

Budapest  2021
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Fermentációs kinetika - Folytonos fermentációs modell szimuláció

Készítette: Kis Virág Tünde

Eredeti: µ=D 43 óránál, 8,3-ig szakaszos rész, tranziens szakasz

µmax növelés esetén 0.2-ről 0.3-ra, µ=D 40 órára csökken

µ és S görbe 8,3-ig csökken nullára meredeken, majd újra elkezd növekedni. X meredekebben
fog nőni, P görbe meredeksége nem változik.

2
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

µ csökkentése 0.2-ről 0.16-ra, ekkor µ=D 45 óránál lesz. A 8,3-as pontig a Mu és az S

meredeksége csökken az eredetihez képest.

Ks érték növelése 0.5-ről 0.75-re µ=D 42 óránál lesz, csak minimális az eltérés az eredetihez
képest. A 8,3-as pontig a görbék lefutása nem sokban különbözik a változtatás előttihez
képest, minimálisan csökkent a µ és S görbék meredeksége.

3
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Ks csökkentése 0.5-ről 0.3-ra. A µ=D 44 óránál lesz ebben az esetben. 8,3-as érték előtt
enyhén meredekebb a µ, S és x görbék lefutása mint az előző esetben, de sokban nem

különbözik.

Ha a hozamot növelem 0.5-ről 0.75-re, akikor a µ=D 41 óránál lesz. 8,3as érték előtti
szakaszos részben a µ és S görbék kevésbé meredeken csökkennek. Mikrobakoncentráció nő.
Ha a hozamot csökkentem 0.5-ről 0.3-ra, akkor µ=D 45 óránál fog bekövetkezni. A S
görbe az eredetihez képest sokkal meredekebben fog csökkenni, a µ sokkal gyorsabban
csökken és a D alá megy mielőtt beállna. Az x görbe laposabb lesz.
Paraméterek:
starttime=0
stoptime=50
dt=0.025
mumax=0.2
Ks=0.5
k1=0.03
k2=0.08
Y=0.5
T1=8.3
Sf=13.8
d1=0.123

Init x=1
Init S=14.9
Init P=0

d/dt(x)=mu*x-d*x
d/dt(s)=(-1/Y)*mu*x+d*(sf-s)
d/dt(P)=k1*x+k2*mu*x-d*p
mu=mumax*(S/(S+Ks))
J=d*x
D=if time>T1 then D1 else 0

4
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Fermentációs kinetika - Folytonos fermentációs kiegészített modell

szimuláció
Készítette: Juhász Andrea Julianna

I. Általános elmélet

Ebben a modellben - folytonos fermentáció modellhez képest - a mikróba sejtek

pusztulását is figyelembe vesszük, vagyis bekalkuláljuk, hogy a megtermelt sejttömeg
nem fog végtelen ideig terméket termelni.

A változás = szaporodás – kimosódás – pusztulás

dx/dt=μ *x - D*x - kD*x

ahol

μ – mikróba fajlagos szaporodási sebessége (1/idő) pl. (1/nap)

x- mikróba sejttömege (g/dm3) (kg/m3,)

D – higítási sebesség (1/idő) pl. (1/nap)

kD– pusztulási koefficiens (1/idő) pl. (1/nap)

steady state esetén (dx/dt=0):

D*x= μ *x -kD*x

D= μ - kD

Ebben a modellben a hozam (Yx/s) nem egy konstans érték, hanem

Yx/s= 1/Yc + 1/Yeg+ m/μ

ahol

m – fenntartási koefficiens

Yc - beépített szénhozam

Yeg – maximális növekedési energia hozam

μ – mikróba fajlagos szaporodási sebessége (1/idő) pl. (1/nap)

Állandósult állapot esetén

μ=D

5
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

J= D*x

ahol:

J- biomassza produktivítás (g/(l*h) )

x- mikróba sejttömege (g/dm3) (kg/m3,)

D – higítási sebesség (1/idő) pl. (1/nap)

II. A modellezés:

A modellben – Madonna program - két értéket állítottunk:

m-t (fenntartási koefficiens) és kD-t (pusztulási koefficiens)

Mind a két paraméter 0, illetve 0,1 értéket vehetett fel.

1. A programozás (egyenletek, konstansok):

method rk4

starttime=0
stoptime=40
dt=0.025
mumax=0.2
Ks=0.5
k1=0.03
k2=0.08
y=0.5
init x=1
init s=14.9
init p=0
t1=8.3
sf=13.8
d1=0.123
m= 0
kd=0
d=if time>t1 then d1 else 0
d/dt(x)=mu*x-d*x-kd*x
d/dt(s)=(-1/y)*mu*x+d*(sf-s)
mu=mumax*(s/(ks+s))
d/dt(p)=k1*x+k2*mu*x-D*p
J=d*x
ykorr=1/((1/y)+(m/mu))

6
Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

2. A kapott eredmények ábrázolása

2.1 Az első eset, ahol m=0 és kd=0

Leolvasott produktivítás és higítás:

J=0,949
D1=0,1629

7
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

2.2. A második eset, ahol m=0,1 és kd=0

Leolvasott produktivítás és higítás:

J=0,989
D1=0,1631

8
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

2.3. A harmadik eset, ahol m=0 és kd=0.1

Leolvasott produktivítás és higítás:

J=0,1868
d1=0,07508
9
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

2.4. A negyedik eset, ahol m=0,1 és kd=0.1

Leolvasott produktivítás és higítás:

J=0,1868
D1=0,0752
10
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

3. Az eredmények összefoglalása, konklúziók

m=0 m=0,1
kD = 0 J=0,949 J=0,989
D1=0,1629 D1=0,1631

kD = 0,1 J=0,1868 J=0,1868

D1=0,07508 D1=0,0752

A modellezés során kapott eredményekből megállapítható, hogy

- az x görbe lefutására az m érték nem bírt hatással, ha a kD érték nulla marad, letörés
nem volt tapasztalható
- az j görbe lefutására az m érték kis hatással bírt, ha a kD érték nulla marad
- az x görbe lefutására a kD érték állítása bírt hatással, letörés volt tapasztalható, ha az
értéket növeltük
- az j görbe lefutására a kD érték bír hatással
- jelentősebb biomassza produktivítás (j) érhető el, ha a pusztulási koefficiens ( kD)
magasabb kisebb higítási sebesség (D) esetén is.

11
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Fermentációs kinetika -Folytonos, sejtvisszatartásos modell szimuláció

Készítette: Kántor Gergely

A sejtvisszatartásos/recirkulációs fermentáció során az elvezetett fermentlé egy részét

megfelelően megszűrve, a sejttartalmat visszavezetjük a reaktorba, így effektívebbé téve a
folyamatos fermentációt.

Egyenletek, konstansok:

starttime=0
stoptime=40
dt=0.025

mumax=0.2
ks=0.5
k1=0.03
k2=0.08
y=0.5
init x=1
init s=14.9
init p=0
t1=8.3
sf=13.8
d1=0.123
a=ezt változtatjuk
b=ezt is

d=if time>t1 then d1 else 0

j=d*x

cf=(1+a)/a

mu=mumax*s/(ks+s)
d/dt(x)=mu*x-(1+a)*d*x+a*cf*d*b*x
d/dt(s)=(-1/y)*mu*x+d*(sf-s)
d/dt(p)=k1*x+k2*mu*x-d*p

„d=if time>t1 then d1 else 0” azt jelenti, hogy rögtön t1 időpillanat után kezdjük el a higítást

(Sajnos a kapkodásom közben elfelejtettem feljegyezni a kezdeti „a” és „b” értékeket)

12
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Az eredeti grafikon:

Az adatok alapján szimulált sejtvisszatartásos/recirkulációs fermentáció, ahol:

 mumax a maximális fajlagos szaporodási sebesség
 ks a féltelítési állandó
 k1 és k2 a reakciósebességi állandók
 y a hozam
 x a sejttömeg
 s a szubsztrátkoncentráció
 p a termékkoncentráció
 t1 az első olyan időpillanat ahol hígítást alkalmazunk
 sf a befolyó szubszrát koncentrációja
 d1 a hígítás sebessége
 a a reaktorból távozó fermentlé egy hányada (%)
 b(*x) a szűrés hatékonyság (%)
 J a produktivitás
 cf a koncentrációs faktor
 mu az adott időpillanatban vett fajlagos szaporodási sebesség
 d/dt(x) sejttömegváltozás sebessége
 d/dt(s) szubsztrát koncentrációváltozás sebesésge
 d/dt(p) a termék koncentrációváltozás sebessége

13
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Ezek után:
1. eset:

Az első esetben az „a” az ?, a „b” ?. Ekkor a maximális produktivitás 16,91, az optimális

hígítás sebessége 0,6196.
(Sajnos a kapkodásom közben elfelejtettem feljegyezni a kezdeti „a” és „b” értékeket)

14
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

2. eset:

Az második esetben az „a” az 1, a „b” 0,5. Ekkor a maximális produktivitás 1,424, az

optimális hígítás sebessége 0,1621.
Megfigyelhető, hogy annak ellenére, hogy az visszatevés hányadát megnöveltük, a szűrés
hatékonysága lecsökkent, így csökkent a maximális produktivitás és az optimális hígítási
sebesség is.

15
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

3. eset:

Az harmadik esetben az „a” az 1, a „b” 0. Ekkor a maximális produktivitás 0,3911, az

optimális hígítás sebessége 0,0860.
Szintén megfigyelhető, hogy a „b” csökkenése további produktivitási maximum csökkenéssel
járt. Ekkor konkrétan szinte semennyire sem szűrjük ki a mikróbákat az elvezetett
fermentléből.

16
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

4. eset:

Az negyedik esetben az „a” az 0,5, a „b” 0,75. Ekkor a maximális produktivitás 8,153, az
optimális hígítás sebessége 0,3404.
Megfigyelhető, hogy megnövelve a szűrés hatékonyságát a produktivitási maximum és az
optimális hígítás sebessége jelentősen megnőtt az előző két esethez képest.

17
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

5. eset:

Az ötödik esetben az „a” az 0,5, a „b” 0,9. Ekkor a maximális produktivitás 36,8, az optimális
elvétel sebessége 0,7203.
Az előző, 4. esethez képest az „a” értéket nem változtatva, mindössze a hatékonyságot 0,15-
tel megnövelve ~négyszeres Jmax növekedést tapasztalunk.

18
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Eredmények:

jmax d
1. eset 16,91 0,6196
2. eset 1,424 0,1621
3. eset 0,3911 0,0860
4. eset 8,153 0,3404
5. eset 36,8 0,7203

Konklúzió:

Megfelelően beállított hígítási sebesség és szűrési hatékonyság aránnyal nagyságrendekkel

javítható a produktivitási maximum sejtvisszatartásos/recirkulációs folytonos fermentáció
során.

19
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Fermentációs kinetika -Félfolytonos modell szimuláció

Készítette: Pozsár Adrienn

Félfolytonos fermentáció ábrázolása a Madonna nevű programmal:

A félfolytonos fermentáció ismétlődő szakaszos fermentációk sorozatának fogható fel.
Görbéje a megadott paraméterek felhasználásával nagy kiugrásokat mutatott, de a mikrobára
vonatkozó értékek megváltoztatásával összenyomható, illetve szét is húzható a görbe x és y
tengely mentén is egyaránt.
A turbidosztát dinamikusan állítja be az áramlási sebességet (és így a hígítási sebességet),
hogy állandó legyen a zavarosság. Két féle működést különböztetünk meg az idő
függvényében, amelyekhez két szemmel láthatóan jól elkülöníthető görbe tartozik.
A diagramok a mikroba szaporodási sebességét ábrázolják az idő függvényében.
a mikrobákra vonatkozó értékek közül, amelyek nagy mértékben befolyásolták a görbe
lefutását a tárfogat (V), a hozam (Y), a maximális fajlagos növekedési sebesség (mümax)
illetve a befolyó szubsztrát koncentrációja, azaz az Sf.
Az értékek megfelelő irányba történő eltolásával egyértelműen látható, hogy a terméknek
nincs ráhatása (illetve elhanyagolható hatása van) a görbe alakjára.
1. turbidosztát esetén:

20
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

A fenti táblázat az általam beállított értékeket mutatja

Ábráról leolvasott értékek értelmezése:
Az x 0,77 és 0,83 közötti értékeket vesz fel a mümax, a V, sF és az Y kiugróan nagy mértékű
megváltoztatásának következtében. A megfelelő lefutású görbealak beállításnak érdekében a
kisebb finomításokat a ks, az r és az x értékek eltolásával végeztem. Ennek eredményeképpen
a görbe az x és y tengely irányában is „összenyomódott”, sokkal szűkebb tartományban
mozognak az értékek, illetve kisebb értékeket is vesznek fel a görbe pontjai.
Megadott paraméterek:
starttime =0
stoptime =80
dt =0.025
mumax =0.2
ks =0.5
k1 =0.03
k2 =0.08
Y =0.5
t1 =8.3
d1 =0.123
sf =13.8

v =0.8
f =t1
r =3

init x =1
init s =14.9
init p =0

Felhasznált egyenletek:
d/dt(x)=mu*x-d*x
d/dt(s)=-1/Y*mu*x+d*(sf-s)
d/dt(p)=k1*x+k2*x*mu-d*p
21
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

mu=mumax*s/(s+ks)

d=if time>t1 then d1 else 0

d1=pulse(v,f,r)

Megadott és módosított adatok összehasonlítása:

paraméter megadott módosított
mumax 0,2 0,46
ks 0,5 0,21
k1 0,03 0,03
k2 0,08 0,08
y 0,5 0,03
t1 8,3 8,3
sf 13,8 27,6
v 0,8 0,07
r 3 2,1
x 1 0,4
s 14,9 13,9067
p 0 0
(a nagy mértékben változó paramétereket jelöltem zöld színnel)
2. exponenciális fázisban:

A fenti diagram az exponenciális fázisban ábrázolja a görbét. A megadott paraméterek

változtatásával az x és az y tengely mentén is megnyúlik a görbe, így az xmax a lehető
legnagyobb lesz, 5 és 13 között fog mozogni. Tehát az adott pontok mindkét tengelyen
nagyobb értékeket fognak felvenni. Ezesetben is elmondható, hogy a
mikrobaszaporodásra jellemző értékek átformálásával kaptam meg a kívánt görbét.
22
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Megadott és módosított adatok módosítása:

paraméter megadott módosított
mumax 0,2 0,51
ks 0,5 0,78
k1 0,03 0,03
k2 0,08 0,08
y 0,5 0,66
t1 8,3 8,3
sf 13,8 27,6
v 0,8 0,96
r 3 2
x 1 0,4
s 14,9 13,9067
p 0 0

a fenti táblázat az általam beállított értékeket mutatja

(Észrevétel: a második esetben az átállított paraméterek szórását kisebbnek látom mint

a turbidosztát esetén.)

23
Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

24
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Ferementációs kinetika - Rátáplálásos fermentációs modell szimuláció

Készítette: Kleineisel Ádám Viktor

Az eredeti paraméterekkel készült szimuláción jól látható, hogy 22,5 óra után kapcsol be a
pumpa és hogy, 27 órától áll be a kvázi steady state állapot a rendszerben.

25
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

A µmax érték lejjebb állításakor tett észrevételek az eredeti állapothoz képest:

 A kvázi stady state állapot beállása sokkal később történik meg, 47,5 óra után.
 A pumpa bekapcsolásának ideje továbbra is 22,5 óra.
 A szakaszos fázisban a következő változások vehetőek észre:
o A szubsztrát kevésbé fogy
o Kevesebb termék keletkezik
o Sokkal alacsonyabb a mikroba koncentráció

A µmax érték feljebb állításakor tett észrevételek az eredeti állapothoz képest:

 A kvázi steady state állapot előbb beállt, 25 órától.
 A pumpa bekapcsolásának ideje továbbra is 22,5 óra.
 A szakaszos fázisban a következő változások vehetőek észre:
o A szubsztrát elfogy 17 óránál („gyorsabb” a mikroba)
o Termék képződésben kis növekedést lehet felfedezni, de nagyjából hasonló
o A mikroba koncentráció hamarabb beáll a standard értékre, mint az eredeti
esetben.

26
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

A Ks érték lejjebb állításakor tett észrevételek az eredeti állapothoz képest:

 A kvázi steady state állapot nagyon kicsit előbb áll be, 26,6 órától.
 A pumpa bekapcsolásának ideje továbbra is 22,5 óra.
 A szakaszos fázisban a következő változások vehetőek észre:
o Csak a szubsztrát görbéje kicsit meredekebb (jobban szereti a szubsztrátot a
mikroba, ha kicsi a Ks)
o A többi értékre nincs hatással

27
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

A Ks érték feljebb állításakor tett észrevételek az eredeti állapothoz képest:

 A kvázi steady state állapot picit később áll be, 28 órától.
 A pumpa bekapcsolásának ideje továbbra is 22,5 óra.
 A szakaszos fázisban a következő változások vehetőek észre:
o A szubsztrát görbe kicsit laposabb (nagyobb Ks esetén a mikroba nem szereti
annyira a szubsztrátot)
o A többi értékre nincs hatással
A hozam növelése esetében tett észrevételek az eredeti állapothoz képest:
 A kvázi steady state állapot kicsit később áll be.
 A pumpa bekapcsolásának ideje továbbra is 22,5 óra.
 A szakaszos fázisban a következő változások vehetőek észre:
o A szubsztrát nem fogy el annyira
A hozam csökkentése esetében tett észrevételek az eredeti állapothoz képest:
 A kvázi steady state állapot elérése ugyan ott maradt, 27 óránál.
 A pumpa bekapcsolásának ideje továbbra is 22,5 óra.
 A szakaszos fázisban a következő változások vehetőek észre:
o A szubsztrát elfogy teljesen

Adatok:

method rk4

starttime=0
stoptime=50
dt=0.025

mumax=0.3

28
 Fermentációs kinetika gyakorlat jegyzőkönyve 47/14.. csoport

Ks=0.1
k1=0.03
k2=0.08
Y=0.8
t1=22.5
Sf=10
F1=0.5

init V=1
init Mx=0.01
init Ms=10
init Mp=0

d/dt(Mx)=Rx*V
d/dt(Ms)=Rs*V+F*Sf
d/dt(Mp)=Rp*V
mu=mumax*(s/(s+Ks))
D=F/V
d/dt(V)=F
x=Mx/V
S=Ms/V
P=Mp/V
Rx=mu*x
Rs=-(1/Y)*mu*x
Rp=k1*x+k2*mu*x
F=if time>t1 then F1 else 0

29