Professional Documents
Culture Documents
1
BİYOFİZİK NEDİR ?
4
Ludwig Ferdinand von Helmholtz
(1821-1894): En büyük
biyofizikçilerden sayılır. Kas
kasılması, sinirde iletim hızını ilk
olarak ölçen, renkli görme ve işitme
teorilerini ortaya koyan bilim adamı.
5
SİSTEM KAVRAMI
SİSTEM: Karşılıklı etkileşim halindeki birtakım parçalardan oluşan
fiziksel veya düşünsel herhangi bir varlığa sistem adı verilir.
Davranış Denklemi
Y= Y (E,α,t)
→E SİSTEM →Y
Etki (forcing) Yanıt (response)
6
Herhangi bir sistem farklı kesitlerde bileşenlerine ayrılabilir ve bu
bileşenlerde yine birer sistem (veya alt sistem) olarak ele alınabilir.
Örneğin;
atom → molekül → hücre → organ → organizma → toplum →
biyosfer
7
BİRER AÇIK SİSTEM OLARAK CANLILAR
Çevresi ile madde ve enerji alışverişinde bulunan sistemlere açık,
madde alışverişi yasaklanmış sistemlere kapalı, madde ve enerji
Alışverişi yasaklanmış sistemlere yalıtık(izole) sistemler denir.
8
Örneğin; bir sinir veya kas hücresinin dinlenim durumunda, hücre
Zarından geçişler devam ettiği halde her bir iyon için net giriş sıfırdır
Ve hücre içi konsantrasyonlar değişmez.
ÖZET olarak;
1. Madde ve enerji alırlar,
2. Aldıkları madde ve enerjiyi olduğu gibi kullanmaz, kendilerine uygun
Kullanışlı hale getirirler
3. Bazı ürünleri çevreye ihraç ederler,
4.Madde ve enerji etkinliğinin çevrimsel bir karakteri vardır
5.Negatif entropi edinebilirler. Yani sistem düzenliliğinin, organizasyon
derecesinin bir ölçüsüdür.
6. Açık sistemlerin girişleri informatik karakterdedir. Alınan madde ve
Enerji dış ortam hakkında mesajlar taşır. Madde ve enerjinin açık sistem
Tarafından kabulü seçimlidir.
7. Kararlı duruma ulaşabilirler. Madde ve enerji alışverişi sürdüğü halde
Sistem kompozisyonu zamandan bağımsız kalabilir,
8. Açık sistemler farklılaşma ve özelleşme yönünde değişime uğrayabilirler.
9. Eşsonuçluluk ilkesi ile karakterize edilirler. Farklı ilk koşullar ve farklı
Yollardan aynı son duruma ulaşabilirler.
9
CANLILARIN ATOMİK VE MOLEKÜLER İÇERİĞİ
Biyolojik türlerin ve bireylerin olağanüstü çeşitliliğine rağmen
Biyolojik moleküller ve biyokimyasal reaksiyonlar o kadar çeşitli
Değildir.
Biyolojik moleküller genellikle
Çinko Zn Kalay Sn
Manganez Mn Silisyum Si
Kobalt Co Vanadyum V
Krom Cr
11
MOLEKÜL İÇİ VE MOLEKÜLLERARASI BAĞLAR
İyonik bağlar
Kovalent bağlar
Hidrojen bağları
Van der Waals
bağları
İYONİK BAĞ: Bir atomdan diğerine elektron transferi ile
oluşur. Elektronu veren atom katyon (+), alan atom ise
anyon’dur (-).
İki iyon arasındaki elektrostatik çekimden
Kaynaklanan etkileşim enerjisi
NaCl için bu bağ enerjisi 500 kJ/mol kadardır.
12
Sulu ortamda b bağ enerjisi suyun ε (dielektrik sabiti)=80 olduğundan
U=10-100 kJ/mol olur.
13
14
iyonizasyon
iyonik bağ ile oluşmuş molekülün yeniden iyonlarına
ayrılması
• karboksil (-COOH) grubu
• amino (-NH2) grubu
elektrolit
iyonlar suda çözündüğünde elektrik iletebilme
yeteneğindedir
KOVALENT BAĞ: Atomların elektronları ortak
kullanması ile oluşan bağdır.
(hidrojen 1, oksijen 2, azot 3, karbon 4)
polar kovalent bağ
ortak elektron bir atoma daha yakın kalır (hidroksil-
OH, sülfidril-SH, azot-hidrojen-NH)
nonpolar bağlanma
elektriksel olarak nötr’e yakındır (karbon-
hidrojen_C-H, karbon-karbon_C-C)
15
16
17
HİDROJEN BAĞI
Bir polar bağdaki hidrojen atomu ile diğer bir polar
bağdaki oksijen veya azot atomları arasında oluşan
çekim gücüdür. (su)
18
Moleküler Bağların Özellikleri
Bağ Gücü Özellikleri Örnekler
SU (H2O)
Vücuttaki en yaygın atom hidrojen,
en yaygın molekül ise sudur.
hidroliz
büyük moleküllü bileşiklerin su ile tepkimeye
girerek daha küçük moleküllere parçalanması
R1-R2 + H-O-H → R1-OH + H-R2
20
Suyun ısınma ısısı ve ısı sığası oldukça yüksektir. Bu özelliği
çözücüdür.
21
Vücut ağırlığının % 60’ı sudur
Bir çözeltinin
içindeki partikül
sayısının sağladığı
basınçtır
Osmotik basınç
I II
¶ ¶ ¶¶¶ ¶¶¶¶
¶ SU ¶¶ ¶¶
¶
¶ ¶ ¶ ¶¶ ¶ ¶
Osmolarite: 1 L çözeltide
çözünmüş partikül sayısı
Plasma osmolaritesi
275 – 295 mOsm/kg
% 1-2 değişim
(cilt,solunum)
Hücre dışı sıvısının ve osmolaritenin
düzenlenmesi
Hipotalamus
Renin-anjiotensin-aldosteron sistemi
Böbrekler
Atrial natriüretik peptid ve diğerleri
ANP atrium hücrelerinde yapılır. 28 aa li
vasodilatör hormon (Atrium hacim veya
basınçla gerilmesi veya atrial atım hızının
artmasıyla salınır)
Normonatremik
su kaybı = Na kaybı
Hiponatremik
su kaybı < Na kaybı
Sıvı yüklenmesi (overhidrasyon)
Su zehirlenmesi
Toplam vücut sıvısı artar, toplam vücut
Na’u normal
Osmoreseptörler:
Hipotalamus
Antidiüretik hormon
Renin-anjiotensin-aldosteron sistemi
Böbrekler
Düşük basınç baroreseptörleri atriumlarda öz: sol atrium
da yer alır.
39
40
Plasma Membrane
41
Difüzyon: Bir kaba konan sıvı veya gaz şeklindeki
maddenin molekülleri, kabın her yerine ortalama olarak
aynı konsantrasyonda dağılır.
42
43
difüzyonun yönü
difüzyonda hareket tek yönlü
değildir
• moleküller devamlı hareket halinde
olduğundan, az yoğun ortamdan çok
yoğun ortama da bir miktar madde
geçişi olur
iki yöne doğru olan difüzyon
akımları arasındaki fark net geçişi
verir 44
difüzyonun gücü
Difüzyon akımının büyüklüğü
çeşitli faktörlere bağlı olarak
değişir:
konsantrasyon farkı
sıcaklık
molekül kitlesi
yüzey alanı
ortam hali
45
difüzyonun hızı
moleküller düz bir çizgide çok
uzağa gidemezler
• dolayısıyla difüzyon süresi
moleküllerin difüze olacakları
mesafenin karesiyle orantılıdır
organizmada dolaşım sistemi
mesafeleri kısaltıcı işlev görür
46
membranlardan difüzyon
hücre zarında difüzyon, aynı molekülün sudaki
difüzyonundan çok daha yavaştır
membranda difüzyonu sınırlayan esas faktör
lipid çift tabakadır
polar ve iyonize moleküller ya hiç ya da çok az
difüze olur
bir maddenin lipidlerde eriyebilirliğinin yüksek
olması membranlardan daha kolay geçmesini
sağlar
47
48
protein kanallar
sodyum, potasyum, klor ve kalsiyum gibi iyonlar
membran lipidlerindeki son derece düşük erirliklerine
rağmen hızla difüze olurlar
bu iyonların geçişi kanal vazifesi gören integral
proteinler yoluyla olur
farklı hücreler, farklı iyonlara farklı derecede geçirgendir
49
iyon kanalları
kanalların kendilerine özel iyonlara karşı spesifitesi
vardır
• bu seçicilik kanal çapına veya kanal duvarını
oluşturan proteinlerin elektrik yüküne bağlı olabilir
kanalın çapı, içerisinden geçecek iyona göre hafifçe
büyüktür
50
elektrokimyasal gradyent
membranlardan iyonların geçişi yalnızca konsantrasyon
gradyentine göre olmaz
plazma membranının dinlenim potansiyeli gereği, pozitif
iyonları içeri çekmeye, negatif iyonları ise dışarı itmeye
yönelen bir kuvvet vardır
konsantrasyon gradyenti ile elektriksel çekim gücü
arasındaki bileşke kuvvet ile iyonun geçişi belirlenir 51
iyon permeabilitesi
53
kolaylaştırılmış difüzyon
net akım konsantrasyon gradyenti ile aynı yöndedir; iki
taraf konsantrasyonu eşitlendiğinde akım durur
enerji gerektirmez
en güzel örnek glikozdur
54
aktif transport
konsantrasyon gradyentine zıt yönde bir taşınım söz
konusudur
iki tarafın konsantrasyonu eşitlense de devam eder;
taşınan madde için bir kararlılık durumu vardır
enerji gerektiren bir olaydır
enerji;
1. ya taşıyıcı protein üzerindeki bağlanma yerinin
membranın bir tarafında diğer tarafa göre daha
yüksek bir afinite göstermesini
2. ya da proteindeki bağlanma bölgesinin membranın bir
tarafından diğer tarafa hareket etme hızını
... değiştirir
55
primer aktif transport
56
sekonder aktif transport
enerji olarak doğrudan ATP değil, iyon konsantrasyon
gradyentini kullanılır
taşıyıcı protein üzerinde asıl taşınacak madde haricinde
bir de enerjiyi sağlayacak olan iyonu bağlayan bölge
vardır
bu iyon genellikle sodyumdur
57
58
simport - antiport taşınım
sekonder aktif transport ile taşınan madde sodyum
iyonları ile aynı yönde taşınıyorsa simport (sodyum co-
transportu),
ters yönde taşınıyorsa antiport (sodyum counter-
transportu) olarak anılır
kural olarak transport mutlaka konsantrasyon
gradyentine zıt yöndedir
59
60
osmoz; suyun difüzyonu
su, polar bir molekül olmasına rağmen hücre
zarından hızla difüze olur
geçiş iki taraf arası osmolarite farkına göredir
su, osmolaritesi düşük olan bölgeden yüksek
osmolariteye sahip tarafa geçer
61
Suyun dayanılmaz özgürlüğü
62
osmotik basınç
63
organizmada osmolarite
vücut sıvıları osmolaritesi 300
mOsm/l’dir
extrasellüler sıvıdaki partiküllerin %85
kadarı sodyum ve klor, hücre
içindekiler ise en çok potasyum
iyonları ile organik maddelerdir
hücreler osmotik basıncı kendilerinden
daha yüksek bir ortama konduğunda
su kaybına uğrayarak büzüşür,
osmotik basıncı düşük ortamda ise su 64
alıp şişerler
Thibodeau&Patton; Anatomy&Physiology, 1993.
65
izotonik solüsyon = membrandan geçebilen
mevcut madde konsantrasyonuna bakılmaksızın,
300 mOsm/l geçemeyen madde içeren solüsyon
hipertonik solüsyon = Membrandan geçebilen
mevcut madde konsantrasyonuna bakılmaksızın,
300 mOsm/l’den fazla geçemeyen madde içeren
solüsyon
hipotonik solüsyon = membrandan geçebilen
mevcut madde konsantrasyonuna bakılmaksızın,
300 mOsm/l’den daha az geçemeyen madde
içeren solüsyon
66
67
Hücrenin çevresi ile seçimli madde alışverişi yapması, gereksinim duyulan
maddelerin kolaylıkla içeriye alınması, reaksiyonlar sonucu artık ürünlerin
dışarıya atılması hücre zarları aracılığı ile gerçekleşir. Biyoelektrik olaylarda
hücre zarlarının bir fonksiyonudur.
DİFÜZYON
Fick I. Yasası
Maddenin moleküler kinetik teorisine göre, mutlak sıcaklığı T olan bir
Ortam içindeki m kütleli moleküllerin ortalama kinetik enerjileri,
k= 1,38x10-23 J/mol (Boltzman sabiti) olmak üzere,
Öte yandan , çözelti çok büyük olmayan bir v hızıyla hareket eden bir
Molekül, hızı ile orantılı ve zıt yönlü
69
F= -6πηav ―› Stokes yasası f=6πηa
η: viskosluk katsayısı
a: yarıçap
D= kT/f yazılabilir
70
ZARLARDA DİFÜZYON VE OSMOS
Eğer zar kalınlığı x2-x1=δ kalınlığına sahip ise; o halde 1. Fick yasası
71
Dinlenim zar potansiyeli: Dinlenim halindeki bir hücrenin iç tarafı dışa
göre negatif bir potansiyeldedir. Buna dinlenim zar potansiyeli denir.
Bu potansiyel farklı hücrelerde -20 ile -100 mV arasında değişir.
Hücre zarlarının uygun koşullarda uyarılması sonucu, hücre içi
Potansiyel dinlenim değerinden +30 ile +50 mV arasında pozitif bir de-
ğere kadar yükselebilir, sonra dinlenim durumuna geri döner.
Potansiyeldeki bu değişim desenine AKSİYON POTANSİYEL denir.
72
1 mol iyon geçişi qi=ziF dir.
μi: elektriksel mobilite
zi : iyon değerliliği
T: mutlak sıcaklık
Bir cins madde için mol başına serbest enerji bir çözelti sisteminin
farklı bölge ve fazlarında farklı değerler alıyorsa, bu öğeler mol başına
serbest enerjinin yüksek olduğu durumdan daha düşük olduğu
duruma geçmeye çalışırlar.
Giçi= Gdışi sistem dengededir
73
R T ln ciçi + ziF Viç = R T ln cdış i + ziF Vdış
Em=Viç-Vdış
74
DONNAN DENGESİ: zarın bir tarafında zarı geçemeyen iyonların varlığında
kurulan dengeye Gibbs-Donnan dengesi denir.
GOLDMAN-HODGKIN-KATZ DENKLEMİ:
75