Professional Documents
Culture Documents
MİKROBİYOLOJİ LABORATUVAR
UYGULAMA KİTAPÇIĞI
Dönem I
Adı-Soyadı:…………………………………………
Numara: ………………………………………………….
2022-2023
0
ÖNSÖZ
Sevgili Öğrencilerimiz,
Mikroskopik inceleme için gönderilen hasta materyali veya kültürdeki kolonisinden alınan örneğin
2. Boyasız preparat hazırlama ve lam üzerine yayılmasını açıklayabilmeli ve uygulayabilmeli
Basit boyama yöntemler Mikroskopik inceleme için hazırlanan preparatın kurutulması ve tesbit işlemini açıklayabilmeli ve
o Mikroskopik inceleme için boyasız uygulayabilmeli
Basit boyama yöntemlerini açıklayabilmeli
preparat hazırlama ve Basit Boyama
Mikroskopik inceleme için hazırlanan preparatın metilen mavisi ile boyanma basamaklarını açıklayabilmeli
Yöntemlerini açıklayabilmeli
Mikroskopta metilen mavisi ile boyalı preparatta hücreleri ve mikroorganizmaların morfolojilerini tanımlayabilmeli
Mikroskopik inceleme için gönderilen hasta materyali veya kültür kolonisinden negatif preparat hazırlama
basamaklarını açıklayabilmeli
Negatif preparatlarda mikroorganizmaları tanımlayabilmeli
Tarih ve saat
Hasta adı ve soyadı
Hasta yaşı ve cinsiyeti
Dosya veya protokol numarası
Servis veya poliklinik adı
Örneğin cinsi ve alınma zamanı
Kullanılan antibiyotik veya diğer ilaçlar
Klinik bulgular ve öntanı
Varsa altta yatan hastalık
İzleyen doktorun adı ve tel numarası
Çeşitli laboratuvar malzemeleri içinde mikrobiyoloji laboratuvarı için gerekli olan araç
gereçlerden önemli olanlar
1. Santrifüj 19. Cam Balon, Erlen, Beher, Mezur
2. Etüv (İnkübatör) 20. Penset
3. Otoklav 21. Pipet , Otomatik pipet ve ucu
4. Pastör fırını 22. Buzdolabı ve derin dondurucular
5. Benmari 23. Lam, Lamel
6. Ultraviyole (UV) lambası 24. Steril bistüri ucu ve sapı
7. Bek (alev) 25. Anaerobik kabin veya jar
8. Öze 26. Kesici-Delici Tıbbi Atık kovası
9. Hassas Terazi 27. Tıbbi ve Evsel Atık kovaları
10. Mikroskop (Işık ve Floresan) 28. Eldiven (steril ve non steril)
11. Eküvyon çubuğu (Swab) 29. Maske (Cerrahi ve hepa filtreli)
12. Dispenser (antibiyotik disk dağıtıcısı) 30. Gözlük
13. Sterilizasyon filtreleri 31. Göz yıkama solusyonu
14. Değişik hacimli steril enjektörler 32. Muhtelif Besiyerleri
15. pH metre 33. Boya kapları (şale)
16. Havlu peçete, sıvı sabun, dezenfektan 34. Havan veya doku homojenizatörü
17. Petri kutusu 35. Distile su cihazı
18. Cam tüp
Şekil 1 : Mikrobiyoloji laboratuvarında kullanılan muhtelif araç gereçler
Santrifüjler
Santrifüjler sıvı ortamlardaki parçacıkların çöktürülmesi amacı ile kullanılan gereçlerdir.
Etüvler
Aerob, fakültatif, anaerob ve kapnofilik (karbondioksitli ortamda üreyebilen)
mikroorganizmaların üretilmesi için istenilen ısıya ayarlanabilen sıcak hava dolaplarıdır.
Otoklav (Laboratuvar tipi)
Belirli ısı ve basınç derecelerine ayarlanabilen basınca dayanıklı kazanlardır. Laboratuvar tipi
Otoklav ile sterilizasyonda temel ilke, ön vakumsuz olarak 1 atmosfer basınç altında, 121
◦C‘de 15 dakika süreyle doymuş su buharına maruzyettir.
Pastör fırını
170◦C‘de 1 saat, 160◦C‘de 2 saat veya 150◦C‘de 2.5 saat kuru sıcak hava ile sterilizasyon
yapmaya yarayan cihazdır. Elektrikle çalışan ısıtıcı sistemi ve malzemelerin konulduğu sıcak
hava dolabı şeklinde bölümü vardır.
Benmari
İstenilen ayarlardaki ısı derecelerinde sıcak su elde etmeye ve suyu bu derecelerde sabit
tutmaya yarayan, kapağı bulunan küvet şeklinde cihazdır. Bazı ısıya dayanıksız solusyon veya
sıvıların sterilizasyonunda benmari (sıcak su banyosu) ile sterilizasyon (tindalizasyon) işlemi
uygulanır. Bu amaçla üç gün süreyle, her gün 56◦C‘de veya 60◦C‘de 1 saatlik uygulama
yapmak gerekir.
Ultraviyole lambası
Oda havasının ve yüzeylerin ultraviyole ışını ile sterilizasyon veya dezenfeksiyonunda
kullanılan lambalardır.
Bek
Doğal gaz veya sanayi tipi gaz ile çalışan, küçük ocaklardır. Özellikle hasta örnekleri ile
yapılacak işlemler öncesi özelerin yakma ve hazırlanan preparatların alevden geçirilmesi ve
çalışma sırasında kısmi olarak korumalı bir steril alan sağlamada kullanılır.
Petri kutusu
Genel üretim ve antibiyogram amaçlı katı besiyerlerinin hazırlanmasında kullanılan geniş,
yuvarlak görünümde, yaklaşık 2 cm derinlikte, isteğe bağlı değişen çaplarda, birbirine geçen
kapak ve alt kısımdan oluşan cam veya plastik malzemedir.
Öze
Çabuk ısınan ve çabuk soğuyan, 4-5 cm boyunda platin telden yapılmış, ucu halka biçiminde
yada iğne ucu tarzında düz olan ve incelenecek hasta materyalinden veya üremiş tek
koloniden alarak besiyeri yüzeyine ekim yapmaya yarayan çelikten veya piyasada hazır halde
satılan tek kullanımlık steril plastikten bir gereçtir.
Lam
Direkt inceleme veya boyama için preparat hazırlanmasında kullanılan dikdörtgen şeklinde
camlardır.
Lamel
Çeşitli amaçlarla kullanılan, ortalama 2x2 cm boyutlarında, kare şeklinde, çok ince camdan
yapılmış malzemedir.
Eküvyon çubuk (swab)
Çeşitli vücut bölgelerinden inceleme örneklerinin alınması ve bazı ekimlerin yapılmasında
kullanılan pamuk uçlu, ahşap veya plastik saplı örnek alma çubuğudur.
Cam Balon ve Erlenmayer
Besiyerleri ve solusyonların hazırlanmasında kullanılan yüksek ısıya dayanıklı, 50-3000 ml
hacimli cam malzemelerdir.
Mezur
Silindir şeklinde üzerinde ölçüler bulunan cam kaptır. Hacmi 10-1000ml arasında olabilir.
Besiyerine eklenecek olan distile suyun miktarını ölçmek amacı için kullanılır.
Pipet
Üzeri çizgilerle çeşitli ölçülere ayrılmış 1ml-25 ml arasında değişen hacimli cam
borucuklardır. Hazırlanacak malzemelere eklenecek herhangi bir sıvının ölçümünde kullanılır.
Otomatik pipet ve ucu
5 µl- 5000 µl arasındaki ölçülerde otomatik pipetler olmakla birlikte daha çok 1ml den küçük
hacimlerde çalışılması gereken testlerde kullanılır. Otomatik pipetler için özel olarak
hazırlanan plastik pipet uçları bir kez kullanılır ve atılır. Özellikle serolojik testlerde ve
moleküler testlerde otomatik pipetlerin kullanılması gerekmektedir. Moleküler testlerde ve
bakteriyolojide kullanılan plastik pipet uçları otoklavda steril edildikten sonra kullanılmalıdır.
Serolojik tetkikler için steril olması gerekmez.
Hassas terazi
Besiyeri veya doku örneğini tartmada kullanılan, 10 gramın altındaki ölçümlerde 0.01 gram
ağırlığa kadar tartım yapabilen terazilerdir.
pH metre
Sıvı besi yerlerinin ve diğer sıvıların pH değerlerini doğrulamak için, en azından 0,1
hassasiyetinde elektrometrik pH metreler kullanılır. Elektrik veya pille çalışan aletlerdir.
Distile su cihazı
Besi yerleri veya diğer solüsyonlar için çok lüzumlu olan saf suyu elde etmede kullanılan
aletlerdir.
Havan veya Doku homojenizatörü
Havan porselen veya camdan yapılmış kalın ve ağzı geniş kaplardır. İçinde doku örneği veya
her hangi bir katı madde parçası ezilir. Doku homojenizatörleri havan ile aynı amaçla
kullanılmak üzere elektrikli doku ezicileridir.
Mikroskop
Mikroskop, çıplak gözle görülemeyecek kadar küçük organizmaların ve cisimlerin birkaç
mercek yardımıyle büyütülerek görüntüsünün incelenmesini sağlayan bir alettir. Genel olarak
mikroskop mekanik ve optik kısım olmak üzere iki büyük kısma ayrılarak incelenir. Mekanik
kısmı ayak, gövde, tabla ve tüpten ibarettir. Optik kısmı ise okülerle objektifleri taşıyan ve
dairesel dönebilen rovelver denilen kısımdan ibarettir. Çok çeşitli mikroskop türleri olmasına
rağmen mikrobiyoloji alanında en sık kullanılanları; Işık mikroskobu (Şekil 2), Floresan
mikroskop, Elektron mikroskop, İnvert mikroskop, Faz kontrast ve karanlık alan
mikroskoplarıdır.
1 2 3 4 5
Pozitif sonuç – aceleci, zikzak, yuvarlanma veya diğer anlamlı yer değiştirme
şeklinde hareketlerin gözlenmesi.
Negatif sonuç – hareket görülmemesi veya sadece Brownian hareket varlığı
Mikroorganizmaların hareket organelleri ince yapılı olduğu için ışık mikroskobunda
görülmeleri mümkün değildir. Bu nedenle karanlık alan mikroskobundan kullanılır.
Karanlık alan mikroskopta mikroorganizmalar, karanlık zemin üzerinde parlak
görüntü verir.
1. Preparatın kurutulması
Üzerine materyal sürülmüş olan lamın tespit edilmeden önce mutlaka kurutulması gerekir.
Kurutma işlemi oda ısısında, yada etüvde tutmak suretiyle yapılır. Alev üzerinde kurutmak
bakterilerin morfolojik yapılarını bozabileceği için sakıncalıdır.
2. Preparatın tespit edilmesi
Lam üzerine sürümü yapılan ve kurutulan hücrelerin lama yapışmasını sağlamak amcayla
tespit edilmesi gerekir. Tespit işlemi iki grup altında toplanır:
A. Fiziksel tespit: Bakteriyolojik incelemelerde en sık kullanılan yöntemdir.
1. Havada kurutarak tespit: En az 2-3 saat bekletilerek yapılır. Yavaş ve pek
güvenilir olmayıp, sık kullanılmamaktadır.
2. Alevde tespit: Preparat, yayma yapılan yüzey üstte kalacak şekilde bir
ucundan tutulur. Lamın alt yüzeyi yanmakta olan bek alevinin içerisinde
45ºC eğimle üç defa sokulup çıkarılarak aleve yalatılır. Bu işlem sırasında
preparatın uzun süre alev içerisinde kalmamasına ve materyalin
yanmamasına özen gösterilir. İşlemin sonunda lam, elin üst yüzüne
dokundurulduğunda dayanılabilecek derecede sıcak olmalıdır. Boyama
işlemine başlanmadan önce lamın soğuması beklenmelidir. En sık
kullanılan tespit yöntemidir.
B. Kimyasal tespit: Lökosit, eritrosit, protozoon gibi hücrelerin bulunduğu
preparatların ısı ile tespit edilmesi halinde bu hücreler zarar görebilirler. Bu
yüzden bu tür preparatların tespitinde kimyasal tespit sıvılarından yararlanılır. Bu
amaçla yayması yapılarak kurutulmuş preparat üzerine ilave edilmiş saf etil alkol
ile 8-10 dakika, saf metil alkol ile 3-5 dakika veya aseton ile 5 dakika süreyle
muamele edilerek tespit işlemi yapılabilir.
3. Basit boyama işlemi
Bu yöntemle mikroorganizmaların boyanmasında tek bir boya eriyiği kullanılır. Bu
boyamada mikroorganizmaların yalnızca morfolojik yapılarının incelenmesi ve görünür hale
gelmelerinin sağlanması amaçlanır. Tüm hücreler aynı renkte boyanmış olarak görülür.
1. Bazik boyalarla basit boyama: Metilen mavisi, sulu fuksin, kristal viyole, safranin
gibi boyalardan sadece biri kullanılarak basit boyama yapılır. En sık kullanılan yöntem
ise metilen mavisiyle boyama yöntemidir.
Metilen mavisiyle boyama:
Löffler’in metilen mavisi eriyiği kullanılır. Bakterilerin çoğu bu boyayı yoğun bir
şekilde absorbe ettikleri için görünür hale gelmelerini kolaylaştırır.
Tespit edilmiş, soğutulmuş preparatın üzerine, tüm yüzeyi kaplayacak şekilde boya
dökülür, 1 dakika bekletildikten sonra musluk suyuyla yavaşça yıkanır. Havada veya
zaman kazanmak için kurutma kağıdı arasında kuruması sağlanır. Mikroskopta
immersiyon objektifi ile incelenir. Tüm bakteriler ve hücreler mavi renge boyanmış
olarak görülür.
2. Asit boyalarla basit boyama: Asit boyalar bakterileri boyamadığı için yalnızca
zemini boyarlar. Boyalı zemin üzerinde bakteriler renksiz olarak görülürler. Zor
boya alan bazı mikroorganizmaları ve daha çok bakteri kapsüllerini görebilmek
için kullanılır. Bu boyama yöntemine negatif boyama adı da verilir. Bu amaçla
gelenllikle çini mürekkebi veya nigrosin kullanılır.
Çini mürekkebi veya Nigrosin ile Negatif boyama
Bir lam üzerine uç kısmına yakın olarak bir damla çini mürekkebi/nigrosin
damlatılır. İncelenecek bakteri kolonisinden öze ile bir miktar alınarak çini
mürekkebi/nigrosin boyası ile iyice karıştırılır. Bir lam yada lamelle bu karışıma
45º eğimle temas ettirilip lam boyunca sürüklenerek yayılır. Havada kurutulan
preparat, alkol yada alevden geçirilerek tespit edilir. Mikroskopta immersiyon
objektifi ile incelenir. Kapsüllü bakterilerde, kapsül yapısı boyanmadığı için
siyaha boyanmış zemin üzerinde, etrafında boyanmamış boşluklar olarak
görülürler.
Şekil 2.4. Kültür örneğinden Çini mürekkebi ve Nigrosin boya ile Negatif
boyama
UYGULAMA-3
GRAM BOYAMA
Amaç: Bileşik boyama yöntemlerinden biri olan ve rutin bakteriyolojide sıkça kullanılan
Gram boyama’yı tanımlayabilmesi ve uygulayabilmesi amaçlanmıştır
Öğrenme Hedefleri:
1. Bileşik boyama yöntemlerini sayabilmeli ve özelliklerini açıklayabilmeli
2. İncelenecek örneğin lam üzerine yayılmasını uygulayabilmeli
3. Gram boyama basamaklarını açıklayabilmeli ve uygulayabilmeli
4. Gram boyama yönteminde görülen hücreleri tanımlayabilmeli
5. Gram olumlu ve olumsuz mikroorganizmaları mikroskopta tanımlayabilmeli
Bileşik boyama işleminde preparat birden fazla boya ile boyanır. Bu yöntem ayırt edici bir
boyama yöntemi olup, Gram boyanma özelliklerine göre bakterilerin gruplara ( gram negatif
veya gram pozitif) ve morfolojik yapılarına göre (kok, diplokok, basil, kokobasil) ayrımları
mümkündür.
Şekil 3.2. Gram boyanmış üretral örnekte Şekil 3.3 Karışık bakteri kültüründen yapılan
Pembe boyalı lökositler içnde Gram negatif Gram negatif basiller ve Gram pozitif koklar
Diplokok bakteriler ( Neisseria gonorrhoeae)
UYGULAMA-4
Mikobakteriler bakteriyolojik boyalar ile güç boyanırlar. Ancak fenollü ve yoğun boya
eriyiklerinin uzun süre ve ısı ile uygulanması sonucunda boyanabilirler. Bir kez boyandıktan
sonra diğer bakterilerin aksine asit-alkol uygulaması ile boyalarını bırakmazlar. Bu boyanma
özelliğine sahip bakterilere aside dirençli bakteri (Asidorezistan bakteri, ARB) denir.
Tüberküloz çeşitli organları tutabilmesine karşın en sık tutulan organ akciğerlerdir. Bu
nedenle tanıda en sık kullanılan hasta örneği balgamdır. Balgam incelemesi en kolay, en ucuz,
en sık kullanılan ve tanısal değeri oldukça yüksek bir yöntemdir. Boyanmış yayma
preparatların mikroskopla incelenmesi ile aside dirençli bakteri (ARB) saptanması, klinik
örnekte mikobakteri varlığını gösteren ilk bakteriyolojik kanıttır.
Şekil 4.2. EZN Boyama Yöntemi ile boyanmış bir balgam örneğinde
birçok kırmızı aside-dirençli basiller.
KAYNAKLAR