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CANALES
So c ie d a d P e r u a
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olecu la r
IÓNICOS
-De Potasio ( K+)
-De sodio ( Na*)
-De calcio (Ca++)
-Cationes
Prof: P. núñez H. inespecíficos
-De Cloro (cl-)
Lima 2013
Membrana, Canales e Iones
BCP-F3.7
Unifying Themes in Ion Channel Structure
Oligomeric Arrangement
With Intrinsic Symmetry
I II III IV
Ca Channels
n=1
Na Channels
K Channels
n=4 Ca-activated K Channels
Cyclic Nuc. Channels
Inward Rectifiers
n=4
G-prot-activated Channels
Ligand-Gated Channels
A c e ty lc h o lin e R e c e p to r
G A B A R e c e p to r
n=5 G ly c in e R e c e p to r
S e ro to n in R e c e p to r
G lu ta m a te R e c e p to r
(A M PA )
(K a in a te )
n = (4 ) (N M D A )
Other Channel Families
C h lo rid e C h a n n e ls
n=2 C lC -0 C l C h a n n e l
G a p J u n c t io n s
n=6 C o n n e x in
A B C S u p e r f a m ily
n=? C FT R C l C hanne
N BD 1 R N BD 2
N BD 1
Structure-Function Relations in a Voltage-Dependent Channel
P loop
Gating
Fast
Selective Inactivation
Oligomerization
+
Diversity in K channels
Structural Class
6T M 4TM 6TM
Vol tag e Ga te d Ea g
Family
Ca
++ cNTP
Ca ++
KVLQ T nKQT2
Subfamily
Sh aker Shab Shaw Sha l Slo nSlo Kir 1 Kir2 Kir3 Kir4 Kir5 nIRK
(Kv1) (Kv2) (Kv3) (Kv4 )
Tipos de canales
1. Pueden ser selectivos al tipo de ión: canales de K+, Na+, de Ca2+, ...
KSJ
despolarización
Canal de
Na+
activado por
voltaje
repolarización
KJS-F9.9
Ionotropico vs metabotropico
Canales activados
por
neurotransmisores
Activación directa
Activación indirecta
KSJ-F13.1
Canal activado por acetilcolina (Ach)
KSJ-F11.13
Crystal Structure of the Streptomyces K+ Channel
Doyle et al. 1998
P-loop
TM1
TM2
•KcsA is a homotetramer
•Each subunit contains two TM segments
•The selectivity filter is formed by an extended
structure positioned by a short tilted helix
Understanding Permeation and Selectivity
+ 1 +
W
_ _
4 subunidades
6 segmentos transmembrana
(McKinnon, 1998)
Canales de Sodio
Cada subunidad tiene seis segmentos transmembrana (S1 a S6) que
se pliegan y dejan un poro central y hay semejanza con los canales
de calcio. Además cuenta el segmento S4 tachonado por con una
hilera de residuos básicos que esta en el interior del campo de la
membrana y se mueve hacia fuera en respuesta a la
despolarización para iniciar una serie de redistribuciones
conformacionales que culmina con la apertura del canal.
La permeación es la capacidad del poro, lo cual es papel del bucle S5-
S6. (Bucle P), que da la selectividad y especificidad para el Na+.
y la asimetría es fundamental para la permeación.
Hodgkin y Huxley planetó que los canales de Na+ pasan por varios
estados conformacionales en el proceso de apertura (activación) y
cierre (inactivación) que se deberían a la compuerta externa “m” la
activación y la compuerta “b” interna a la inactivación teniendo una
dependencia del voltaje intrínseca y funcionan de manera
independiente
Los cuatro segmentos S4 cargados positivamente actúan como aparato
detector de voltaje y constituye el poro regulador.
Canal de sodio (continuación)
From cytosolic side, the pore opens up into a vestibule; the vestibule
facilitates transport by allowing the K ions to remain hydrated even
though they are in the middle of the membrane
Canales de potasio
A Cl- channel
2 sets of 6 transmembrane domains
2 “ATP-binding cassettes” (thus “ABC transport protein”)
Cl-
out
in
N
ATP ATP
R-domain
C
unique among channels
and ABC transporters
Until 2002, we had only guesses about the atomic-scale structures
of ABC transport proteins