Professional Documents
Culture Documents
2
Peptide Bond Formation
3
Peptide Chain
4
تسمية الببتيدات
تسمى الببتيدات حسب نوع و ترتيب األحماض األمينية :
تبدا التسمية بالحمض األميني الطرفي الذي يحتوي على
مجموعة أمين طرفية حرة و التي تظهر بالجهة اليسرى للببتيد.
و يضاف المقطع (يل )yl,بنهاية اسم كل حمض اميني ماعدا
الحمض األميني االخير الذي يحتوي على مجموعة الكربوكسيل.
مثل لوسيل جالسيل تايروزيل سيستايين
))Leu-Gly-Tyr-Cys
5
تعريف البروتينات و تصنيفها
تعتبر البروتينات ببتيدات عديدة ذات وزن الجزيئي كبير.
-1بروتينات بسيطة حيث انها ال تحتوي على اي جزء غير بروتيني
أ -البروتينات الليفية وهي على شكل سالسل طويلة مثل الكوالجينات.
ب -البروتينات المكورة او المنطوية وهي ذات اشكال كروية مثل اللبيومينات.
-2البروتينات المعقدة وهي بروتينات مرتبطة مع اجزاء غير بروتينية مثل
الاليبوبروتينات.
6
مستويات تركيب البروتينات
وتنقسم الى اربعة مستويات وهي:
dimensional 3
localized to regions of an
amino acid chain
formed and stabilized by
hydrogen bonding,
electrostatic and van der
Waals interactions
10
Tertiary Structure
• non-linear
• 3 dimensional
• global but restricted to the
amino acid polymer
• formed and stabilized by
hydrogen bonding, covalent
(e.g. disulfide) bonding,
hydrophobic packing toward
core and hydrophilic
exposure to solvent
• A globular amino acid
polymer folded and
compacted is somewhat
functional (catalytic) and
energetically favorable
interaction! 11
Quaternary Structure
• non-linear
• 3 dimensional
• global, and across
distinct amino acid
polymers
• formed by hydrogen
bonding, covalent
bonding, hydrophobic
packing and hydrophilic
exposure
• favorable, functional
structures occur
frequently and have been
categorized12