‫الوحدة ‪ :2‬العالقة بين بنية ووظيفية للبروتين‪.

‬‬
‫برنامج راستوب ‪ Rastop‬هو أحد البرامج المستعملة في عرض ودراسة البنية الفراغية للجزيئات الحيوية‬ ‫‪‬‬
‫وخاصة منها البروتينات‪.‬‬

‫النماذج‬

‫النموذج الشريطي ‪ :‬يوضح‬

‫الكرة والعود‪ :‬يوضح انواع‬
‫البنيات‪ 6‬الثانوية ومناطق‬
‫الذرات‪ 6‬المكونة لبروتين‬
‫االنعطاف‬

‫مستويات البنية الفراغية للبروتين‪:‬‬ ‫‪‬‬

‫الهدف من انتقال من بنية الى اخرى هو الوصول بروتين الى صورته وظيفية‪.‬‬ ‫‪‬‬
‫وهي تتابع احماض أمينية مرتبطة فيما بينها بروابط بيبتدية ( سلسلة بيبتدية التي نشات من عملية‬
‫الترجمة )‪.‬‬
‫البنية األولية‬

‫تتمثل في انطواء البنية األولية لتشكل البنية الحلزونية ‪ α‬و البنية الثانوية ‪β‬وتحافظ هذه البنية على‬
‫البنية‬ ‫تماسكها عن طريق انشاء روابط هيدروجينية بين المجاميع الحمضية ‪CO‬والمجاميع االمينية ‪NH.‬‬
‫الثانوية‬

‫وهي تطور البنية الثانوية عن طريق انطواء السلسلة البيبتيدية المحتوية على عدد من البنيات‬
‫الثانوية‪ ,‬يحدث االنطواء في المناطق البنية وتسمى هذه المناطق بالمناطق االنعطاف‪ ,‬تحافظ هذه بنية‬
‫البنية‬ ‫على استقرارها بروابط والتي هي ‪ :‬الروابط الهيدروجينية ‪ ،‬الروابط الشاردية ‪ ،‬الجذور الكارهة‬
‫الثالثية‬ ‫للماء والجذور الكبريتية‪.‬‬

‫هي تجمع لسلسلتين او اكثر لكل منها بنية ثالثية وتسمى كل سلسلة ضمن البنية الرابعية بتحت وحدة‬
‫تتماسك كل تحت الوحدات فيما بينها بروابط ضعيفة عادة تكون روابط الهيدروجينية او الكارهة‬
‫البنية‬ ‫للماء‪.‬‬
‫الرابعية‬
 ‫تعريف الحمض االميني هو مركب عضوي يتميز بالخاصية الحمقلية (يسلك سلوك الحمض في وسط قاعدي‬ ‫‪‬‬
‫ويسلك سلوك القواعد في الوسط الحامضي)‪.‬‬
‫صيغته‪NH2-CH-COOH‬‬
‫‪R‬‬

‫سلوك الحمض االميني‪:‬‬ ‫‪‬‬

‫‪+‬‬ ‫‪PH< PHi‬‬ ‫‪PH=Pi‬‬ ‫‪PH>PHi‬‬

‫‪-‬‬
‫الحمض االميني يسلك‬
‫الحمض اميني يسلك سلوك‬ ‫الحمض‬
‫سلوك الحمض في وسط‬
‫القاعدة في وسط حامضي‬ ‫االميني معتدل‬
‫قاعدي‬

‫عالقة البنية الفراغية وظيفية البروتين‪:‬‬ ‫‪‬‬

‫االختالف في عدد ونوع وتتابع االحماض االمينية يؤدي الى اختالف في البنيات الفراغية للبروتين وبالتالي‬ ‫‪‬‬
‫اختالف وظيفة البروتين‪.‬‬
‫تحافظ البروتينات على بنيتها الفراغية نتيجة لعدد من الروابط التي تنشا بين المجموعات الكيميائية في جذور‬ ‫‪‬‬
‫االحماض االمينية في مواقع محددة تؤدي المحافظة على هذه الروابط على محافظة على البنية الفراغية‬
‫للبروتينات وبالتالي محافظة على وظيفتها‪.‬‬
‫العوامل المؤثرة على التفكيك هذه الروابط هي عوامل فيزيائية كالحرارة والكيميائية كا ‪PH‬‬ ‫‪‬‬
‫التخريب العكسي‪ :‬هو الذي يستطيع فيه البروتين العودة الى بنيته‪ 6‬وبتالي استرجاع وظيفته‪.‬‬ ‫‪‬‬
‫التخريب الغير عكسي‪ :‬هو الذي ال يستطيع فيه البروتين استرجاع بنيته‪ 6‬وبالتالي وظيفته‪.‬‬ ‫‪‬‬