Professional Documents
Culture Documents
:الكفاءة القاعدية
يقدم بناء عىل اسس علمية ارشادات ملشلك اختالل وظيفي عضوي بتجنيد املعارف املتعلقة ابالتصال عىل
مستوى اجلزيئات احلامة للمعلومة
املوارد املسهتدفة:
تظهر الربوتينات ببنيات فراغية خمتلفة ،حمددة بعدد وطبيعة وتتايل األحامض األمنية اليت تدخل يف بناهئا.
تتكون جزيئات األحامض األمينية من مجموعة وظيفية أمينية قاعدية ))NH2ومجموعة وظيفية محضية
كربوكسيلية ))COOHمرتبطتان بـالكربون αوهام مصدرا اخلاصية األمفوتريية.
يوجد عرشون نوًعا من األحامض األمينية تدخل يف بنية الربوتينات الطبيعية ختتلف فامي بيهنا يف السلسةل
اجلانبية (وجود وظائف قابةل للتأين).
ُتصنف األحامض األمينية حسب السلسةل اجلانبية إىل:
أحامض أمينية قاعدية (لزيين ،أرجنني ،هيستدين).
1
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
تسكل األحامض األمينية سلوك األ حامض (تفقد بروتوانت) وسلوك القواعد (تكتسب
بروتوانت) وذكل تبًع ا دلرجة محوضة الوسط ذلكل تسمى مبركبات أمفوتريية (محقلية) ،كام
ختتلف البيبتيدات عن بعضها ابلقدرة عىل التفكك الشاردي لسالسلها اجلانبية اليت حتدد
طبيعهتا األمفوتريية وخصائصها الكهرابئية.
ترتبط األحامض األمينية املتتالية يف سلسةل بيبتيدية بروابط تاكفؤية تدعى الرابطة البيبتيدية (.
)CONH
تتوقف البنية الفراغية وابلتايل التخصص الوظيفي للربوتني ،عىل الروابط اليت تنشأ بني
أحامض أمينية حمددة (جسور ثنائية الكربيت شاردية ،)...،وممتوضعة بطريقة دقيقة يف
السلسةل أو السالسل البيبتيدية حسب الرساةل الوراثية.
املد الانشطة املرافقة للك مرحةل املراحل
ة
وضعية تأخذ الربوتينات اليت يمت تركيهبا عىل مستوى متعدد الريبوزوم بنيات فراغية حمددة ومعقدة ،ليمت
انطالق بعدها توجيه هذه الربوتينات حنو املاكن اذلي تؤدي فيه وظيفهتا احملددة داخل أو خارج اخللية.
تتكون هذه الربوتينات من إرتباط مجموعة من األحامض األمينية ،وختتلف فامي بيهنا من حيث
عدد ،نوع وترتيب األحامض األمينية اليت تدخل يف تركيهبا ،وذكل حسب املعلومات الوراثية
.املشفرة للك بروتني
ما يه العالقة بني بنية الربوتني وختصصه الوظيفي؟ طرح
املشلكة
الفرضيات املورثة تتحمك يف بنية الربوتني عن طريق حتديد عدد و نوع و ترتيب الاحامض الامنية
.و بنية الربوتني تتحمك يف ختصصه الوظيفي
التقيص و هممة :01حتديد مستوايت البنية الفراغية
البحث السند:
بعد هناية معلية الرتمجة تتشلك سالسل بيبتيدية متر خالل تطّو رها (إلتفافها وإ نطواهئا) إىل بنية
فراغية (ثالثية األبعاد) وظيفية بـأربعة مستوايت بنيوية تصف تدرج تعقيد بنيهتا الفراغية كام هو
موحض يف الوثيقة (.)1
2
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
إبستعامل ُم ربمج حمااكة راستوب ( )Rastopمقنا بمتثيل مناذج جزيئية لبنيات فراغية لبعض
الربوتينات الوظيفية كام هو ُم وحض يف الوثيقة (.)2
3
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
:التعلمية
انطالقا من معطيات الوثيقة 1تعرف عىل مستوايت البنية الفراغية للربوتينات املوحضة يف
الوثيقة 2مع التعليل
:الاجابة
أن هرمون األنسولني يتكون من سلسلتني بيبتيديتني (أصلهام مورثة واحدة) تضمنتا بنيات
اثنوية حلزونية ) α(3ومناطق إنعطاف ،فهو ذو بنية اثلثية.
أن بروتني امليوغلوبني يتكون من سلسةل بيبتيدية واحدة تضمنت بنيات اثنوية حلزونية α
) (8-10ومناطق إنعطاف ،فهو ذو بنية اثلثية.
أن إنزمي اللزيوزمي يتكون من سلسةل بيبتيدية واحدة تضمنت بنيات اثنوية حلزونية α(8-
) ،10بنيات اثنوية ورقية ) β (2ومناطق إنعطاف ،فهو ذو بنية اثلثية.
أن بروتني الهميوغلوبني يتكون من 4سالسل بيبتيدية تضمنت بنيات اثنوية حلزونية (α
) 32ومناطق إنعطاف ،فهو ذو بنية رابعية.
اإل ستنتاج :تظهر الربوتينات بـبنيات خمتلفة ،حمّد دة بعدد وطبيعة وتتايل األحامض األمنية اليت
تدخل يف بناهئا.
تساؤل :ما اذلي يتحمك يف حتديد البنية ثالثية األبعاد (البنية الفراغية) للربوتينات؟
فرضية :تدخل األحامض األمينية املشلكة للربوتينــات بعــددها ،ترتيهبا ونوعهــا يف إكتســاب هــذه
البنية الفراغية النوعية.
هممة :02حتديد خصائص الاحامض الامنية
ُتعترب األحامض األمينية الوحدات البنائية للربوتني ،ملعرفة بعض خصائص األحامض األمينية
ُتقرتح عليك ادلراسات التالية:
ُيمثل الشلك (أ) من الوثيقة ( )3الصيغة الكمييائية العامة لأل حامض األمينية ،بيامن الشلك (ب)
من نفس الوثيقة فُيمثل الصيغ املفصةل لأل حامض األمينية العرشين.
4
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
ومن هجة أخرى الحظ العلامء أن إحتواء األحامض األمينية عىل وظيفيتني قاعدية ))NH2
ومحضية ُ ))COOHم تأينتنيُ ،تمكهنا من تغيري سلوكها حسب تغريات درجة محوضة الوسط
( pHالوسط) ،لغرض حتديد سلوك األحامض األمينية يف أوساط متغرية الـ pHمت وضع قطرة
من حملول امحلض األميين أالنني Alaيف منتصف رشيط ورق الرتشيح يف هجاز الهجرة
5
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
الكهرابئية (الرحالن الكهرابيئ) عند ،pH=2عند pH=12مث عند ،pH=6النتاجئ ُم ّو حضة يف
الوثيقة (.)4
التعلمية:
ابستغالكل للواثئق 3و 4ارشح خصائص الربوتينات
:الاجابة
إستغالل الوثيقة ( :)3متثل الوثيقة ( )3الصيغة الكمييائية العامة لأل حامض األمينية (الشلك (أ)
إىل جانب الصيغ املفصةل لأل حامض األمينية العرشين (الشلك (ب) ،حيث نالحظ:
أن األحامض األمينية تتكون من:
جزء اثبت تشرتك فيه مجيع األحامض األمينية ،يشمل مجموعة وظيفية أمينية قاعدية
))NH2ومجموعة وظيفية كربوكسيلية محضية ُ ))COOHم رتبطتان
بــالكربون .α
جزء متغري من محض أميين إىل آخرُ ،يدعى بـالسلسةل اجلانبية أو بـاجلذر األلكييل
(اجلذر .)R
ُتصنف األحامض األمينية حسب السلسةل اجلانبية (اجلذر )Rإىل:
أحامض أمينية قاعدية :تمتزي بوجود وظيفة قاعدية إضافية يف السلسةل اجلانبية،
6
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
أحامض أمينية محضية :تمتزي بوجود وظيفة محضية إضافية يف السلسةل اجلانبية،
عند pHالوسط = 12:جهرة امحلض األميين Alaإىل القطب املوجب دليل عىل أنه حيمل
حشنة سالبة لوجوده يف الوسط القاعدي (املشبع بـ( -OHوذكل بتأين الوظيفة امحلضية
بفقدها لربوتون (امحلض األميين سكل سلوك محض).
عند pHالوسط = 6:عدم جهرة امحلض األميين Alaإىل أي قطب (يرتسب يف منتصف
الرشيط) دليل عىل أنه ُم تعادل كهرابئًيا (مجموع الشحنات امحلض األميين تساوي الصفر)
وذكل بتأين الوظيفة القاعدية والوظيفة امحلضية معًا ،يف هذه احلاةل يكون pHالوسط =
pHiامحلض األميين.
اإل ستنتاج :تسكل األحامض األمينية سلوك األحامض (تفقد بروتوانت) وسلوك القواعد
(تكتسب بروتوانت) وذكل تبًع ا دلرجة محوضة الوسط ذلكل ُتسمى بـمركبات أمفوتريية
(محقلية).
7
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
الربط:
تمتثل بعض خصائص األحامض األمينية يف:
القطب السالب.
pHالوسط أكرب من pHi:حشنة امحلض األميين تكون سالبة ( )-فهياجر حنو القطب
املوجب.
pHالوسط يساوي pHi:حمصةل حشنات امحلض األميين تساوي الصفر ( )0فال
هياجر ويرتسب.
هممة :02حتديد كيفية تشلك الرابطة البيبتيدية
:السند
8
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
التعلمية:
-حّد د كيفية تشكيل الرابطة البيبتيدية بني محضني أمينيني ُم تتاليني ُم دًمع ا إجابتك مبعادةل
كمييائية إنطالًقا من معطيات الوثيقة (.)5
:الاجابة
حتديد كيفية تشكيل الرابطة البيتيدية بني محضني أمينيني متتاليني:
ترتبط األحامض األمينية املتتالية يف سلسةل بيبتيدية بروابط تاكفؤية تدعى الرابطة
البيبتيدية ( )CONHواليت تتشلك نتیجة إرتباط اجملموعة الكربوكسیلیة (-
)COOHللحمض األمیين األول مع اجملموعة األمینیة ( )NH2-للحمض األمیين املوايل مع
حترير جزيئة ماء.
املعادةل الكمييائية:
مالحظة:
عدد الروابط البيبتيدية وجزيئات املاء املتحررة يف السلسةل البيبتيدية يكون داًمئا ((،n-1
حيث nعدد األحامض األمينية ادلاخةل يف تركيب السلسةل البيبتيدية.
عدد الوظائف الكربوكسيلية واألمينية احلّر ة ال يتأثر بطول السلسةل البيبتيدية.
هممة :03حتديد العالقة بني بنية الربوتني و ختصصه الوظيفي
السند:
9
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
التعلمية:
-صاِد ق عىل حِص ة الفرضية املقرتحة سابًقا وذكل إبستغالكل لنتاجئ جتربة
Anfinsenاملوحضة يف الوثيقة (.)6
اإلجابة:
.2املصادقة عىل حِص ة الفرضية املقرتحة:
إستغالل الوثيقة ( :)6متثل الوثيقة ( )6مراحل ونتاجئ جتربة ،Anfinsenحيث نالحظ:
يف املرحةل :1معامةل إنزمي الريبونيلكياز مبركب β -مركبتوإ يثانول واليوراي أدت إىل فقدان
بنيته الفراغية (ختريب) بعد تكسري اجلسور ثنائية الكربيت فأصبح اإلنزمي غري فعال.
يف املرحةل :2إزاةل اليوراي ومركب β -مركبتوإ يثانول أدت إىل إستعادة البنية الفراغية
الطبيعية للربوتني بعد إعادة تشلك اجلسور ثنائية الكربيت يف األماكن الصحيحة فأصبح
اإلنزمي فعال.
يف املرحةل :3معامةل إنزمي الريبونيلكياز خمرب (فاقد لبنيته الفراغية) ابليوراي أدت إىل
تشلك بنية فراغية غري طبيعية للربوتني بعد تشلك اجلسور ثنائية الكربيت يف غري
مواضعها الصحيحة فأصبح اإلنزمي غري فعال.
اإل ستنتاج :يتوقف التخصص الوظيفي للربوتني عىل بنيته الفراغية واليت حُي ّد دها عدد ،نوع
وترتيب األحامض األمينية ادلاخةل يف تركيب السلسةل الببتيدية ،وكذا الروابط الكمييائية (جسور
ثنائية الكربيت ،روابط شاردية ،هيدروجينية ،اكرهة للامء) الناشئة بني السالسل اجلانبية
ألحامض أمينية حمددة وممتوضعة بطريقة دقيقة يف السلسةل أو السالسل الببتيدية حسب
.الرساةل الوراثية
:الربط
هذه النتاجئ تسمح ابملصادقة عىل حِص ة الفرضية املقرتحة سابًقا (تدخل األحامض األمينية املشلكة
.للربوتينات بعددها ،ترتيهبا ونوعها يف إكتساب هذه البنية الفراغية النوعية)
10
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
تظهر الربوتينات ببنيات فراغية خمتلفة ،حمددة بعدد وطبيعة وتتايل األحامض األمنية اليت اخلالصة
تدخل يف بناهئا.
تتكون جزيئات األحامض األمينية من مجموعة وظيفية أمينية قاعدية ))NH2ومجموعة
وظيفية كربوكسيلية محضية ))COOHمرتبطتان
بـالكربون αوهام مصدرا اخلاصية األمفوتريية.
يوجد عرشون نوًعا من األحامض األمينية تدخل يف بنية الربوتينات الطبيعية ختتلف فامي بيهنا
يف السلسةل اجلانبية (وجود وظائف قابةل للتأين).
ُتصنف األحامض األمينية حسب السلسةل اجلانبية إىل:
أحامض أمينية قاعدية (لزيين ،أرجنني ،هيستدين).
تسكل األحامض األمينية سلوك األحامض (تفقد بروتوانت) وسلوك القواعد (تكتسب
بروتوانت) وذكل تبًع ا دلرجة محوضة الوسط ذلكل تسمى بـمركبات أمفوتريية (محقلية) ،كام
ختتلف البيبتيدات عن بعضها بـالقدرة عىل التفكك الشاردي لسالسلها اجلانبية اليت حتدد
طبيعهتا األمفوتريية وخصائصها الكهرابئية.
ترتبط األحامض األمينية املتتالية يف سلسةل بيبتيدية بروابط تاكفؤية تدعى الرابطة البيبتيدية
)CONH(.
تتوقف البنية الفراغية وابلتايل التخصص الوظيفي للربوتني ،عىل الروابط اليت تنشأ بني أحامض
أمينية حمددة (جسور ثنائية الكربيت ،شاردية ،)...،وممتوضعة بطريقة دقيقة يف السلسةل أو
.السالسل البيبتيدية حسب الرساةل الوراثية
التقومي .1شلّك رابعي البيبتيد ُم كون من األحامض األمينية التاليةGlu، Lys، Gly، .Ala :
.2حّد د حشنة رابعي البيبتيد املتشلك عند pH=1مث عند .pH=13
.3أحسب عدد أنواع رابعي البيبتيد اخملتلفة املمكن تشكيلها بدون تكرار.
ُتعطى:
R1 (Ala)= CH3 R2 (Gly)= H R3 (Lys)= (CH2)4-NH2
R4 (Glu)= (CH2)2-COOH
اإلجابة:
11
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
.2حتديد حشنة رابعي البيبتيد عند pH=1:يه +2وذكل لوجود وظيفة أمينية يف جذر امحلض
األميين Lysابإلضافة إىل الوظيفة األمينية احلرة.
حشنة رابعي البيبتيد عند pH=13:يه -2وذكل لوجود وظيفة كربوكسيلية يف جذر امحلض
األميين Gluابإلضافة إىل الوظيفة الكربوكسيلية احلرة.
.3حساب عدد أنواع رابعي البيبتيد اخملتلفة املمكن تشكيلها بدون تكرار:
ممزيات لك منوذج.
معرفة عدد وتتابع األحامض األمينية اليت تدخل
وعددها يف الربوتني.
تعيني وإ براز اجلذور اجلانبية لأل حامض األمينية
مبادة التفاعل.
تدوير اجلزيئة يف لك اإلجتاهات وتغيري اللون.
هرمون األنسولني :يكون يف البداية ُم شلك من سلسةل بيبتيدية واحدة بأكرث من 51محض
أميين (أنسولني غري انجض) مث يمت حذف العديد من األحامض األمينية لُيصبح هذا الهرمون
ُم شلك من سلسلتسني بيبتيديتني ُم رتبطتني جبرسين ثنائيي الكربيت (أنسولني انجض ُم شلك
من 51محض أميين).
نقطة التعادل الكهرابيئ ( )pH isoélectrique(: )pHiيه قمية pHاليت يكون فهيا مجموع
حشنات امحلض األميين تساوي الصفر ،فللك محض أميين نقطة تعادل كهرابيئ خاصة به،
ُيرمز لها بـ pHiفهي ختتلف من محض أميين ألخر.
هجاز الهجرة الكهرابئية أو الرحالن الكهرابيئ ( :)Electrophorèseهجاز يسمح بفصل املركبات
املشحونة (أحامض أمينية أو بروتينات مثًال) وفق حشنهتا ،حيث يمت وضع خليط من
األحامض األمينية عىل رشيط الفصل (ورق ترشيح أو مادة هالمية) املتصل حبجرتني
حتتوي لك مهنام عىل حملول منظم ذو pHحمّد د ،كام حتتوي لك جحرة عىل قطب كهرابيئ
سالب أو موجب متصلني مبودل كهرابيئ.
+
األحامض :يه تكل املركبات اليت لها القدرة عىل حترير بروتوانت H.
13
[ 2022 اعداد االستاذة أوبيري سناء ]
14