Professional Documents
Culture Documents
الفئة المستهدفة :السنة 3عت المجال التعلمي :2التخصص الوظيفي للبروتينات ثانوية :عبد الحق بن حمودة -سيرات
نوع الحصة :نظري الوحدة التعلمية :2العالقة بين بنية ووظيفة البروتين األستاذ :عدة بن عطية صالح الدين
الحجم الساعي 7 :ساعة الحصة التعلمية :2العالقة بين البنية والتخصص الوظيفي للبروتين السنة الدراسية0200 -0202 :
الكفاءة القاعدية :يقدم بناءا على أسس علمية إرشادات ملشكل إختالل وظيفي عضوي ،وذلك بتجنيد املعارف املتعلقة باإلتصال على مستوى اجلزيئات احلاملة
للمعلومة.
education-onec-dz.blogspot.com
الهدف التعلمي :إجياد العالقة بني البنية والتخصص الوظيفي للربوتني.
المعارف المبنية:
تظهر الربوتينات ببنيات فراغية خمتلفة ،حمددة بعدد وطبيعة وتتايل األمحاض األمنية اليت تدخل يف بنائها.
تتكون جزيئات األمحاض األمينية من وظيفة أمينية قاعدية ) )NH2ووظيفة محضية كربوكسيلية ) )COOHمرتبطتان بـالكربون αومها مصدرا اخلاصية
األمفوتريية.
يوجد عشرون نوعا من األمحاض األمينية تدخل يف بنية الربوتينات الطبيعية ختتلف فيما بينها يف السلسلة اجلانبية (وجود وظائف قابلة للتأين).
تصنف األمحاض األمينية حسب السلسلة اجلانبية إىل:
أمحاض أمينية قاعدية (ليزين ،أرجنني ،هيستدين).
أمحاض أمينية محضية (محض غلوتاميك ،محض أسبارتيك).
أمحاض أمينية متعادلة (سريين ،الغليسني.(... ،
تسلك األمحاض األمينية سلوك األمحاض (تفقد بروتونات) وسلوك القواعد (تكتسب بروتونات) وذلك تبعا لدرجة محوضة الوسط لذلك تسمى مبركبات
أمفوتريية (محقلية).
ترتبط األمحاض األمينية املتتالية يف سلسلة بيبتيدية بروابط تكافؤية تدعى الرابطة البيبتيدية ).(CONH
ختتلف البيبتيدات عن بعضها بالقدرة على التفكك الشاردي لسالسلها اجلانبية اليت حتدد طبيعتها األمفوتريية وخصائصها الكهربائية.
تتوقف البنية الفراغية وبالتايل التخصص الوظيفي للربوتني ،على الروابط اليت تنشأ بني أمحاض أمينية حمددة (جسور ثنائية الكربيت ،شاردية ،)...،ومتموضعة
بطريقة دقيقة يف السلسلة البيبتيدية حسب الرسالة الوراثية.
األهداف المنهجية :جتنيد املكتسبات القبلية -إستقصاء املعلومات -طرح فرضيات والتحقق منها -إجياد عالقة منطقية بني املعطيات.
الوسائل المستعملة :السبورة ،وثائق ،الكتاب املدرسي.
تنظيم سير الدرس
وضعية اإلنطالق:
تقوم الربوتينات بالعديد من الوظائف احليوية املتنوعة فهي تدخل كمادة بنائية جلسم الكائن احلي ،كما تعمل كمادة متخصصة وظيفيا كتنشيط التفاعالت
احليوية (اإلنزميات) وتنظيم العمليات احليوية يف اخللية واجلسم (اهلرمونات) وكوسائل دفاعية (األجسام املضادة) ،ويعود هذا التخصص الوظيفي للربوتينات إىل البنية
الفراغية اليت تتميز هبا هذه اجلزيئات.
المشكلة :ما هي العالقة بين بنية البروتين وتخصصه الوظيفي؟
الفرضيات:
ف :2بنية الربوتني حتدد ختصصه الوظيفي.
ف :0البنية الفراغية للربوتني ضرورية كي يصبح الربوتني وظيفيا.
ف :3تعود البنية الفراغية للربوتني إىل عدد ونوع وترتيب األمحاض األمينية اليت تدخل يف بناءه.
ف :4تأخذ الربوتينات بنية فراغية معينة تبعا لتسلسل األمحاض األمينية ونوع الروابط الكيميائية وبالتايل ختصصه الوظيفي.
التقصي:
.2البنية الفراغية للبروتين:
أ.مستويات البنية الفراغية:
ميكن تقسيم املستويات البنيوية للربوتينات حسب درجة التعقيد إىل 4مستويات كما هو موضح يف الوثائق ( )3( ،)0( ،)2و(.)4
مميزات كل مستوى مستويات البنية الفراغية للبروتينات
البنية األولية :هي تتابع األمحاض األمينية املرتبطة فيما بينها بروابط بيبتيدية
(تكافؤية قوية) فقط لتكوين سلسلة بيبتيدية.
البنية الثانوية :هي إلتفاف (إنطواء) السلسلة البيبتيدية ذات البنية األولية يف
مناطق حمددة وذلك بتشكيل روابط هيدروجينية (ال تكافؤية ضعيفة) بني
) -COو ،(-NHمنيز يف هذه البنية نوعني:
-البنية الثانوية الحلزونية :αإلتفاف السلسلة البيبتيدية يف شكل حلزوين.
-البنية الثانوية الورقية :βإنطواء السلسلة البيبتيدية على شكل وريقات
مطوية.
البنية الثالثية :هي إنطواء السلسلة البيبتيدية ذات البنية الثانوية (احللزونية α
فقط أو الورقية βفقط أو كليهما) على مستوى املناطق البينية هلذا تدعى هذه
األخرية بمناطق اإلنعطاف ،حتافظ البنية الثالثية على إستقرارها بوجود أربعة أنواع
من الروابط وهي:
-الروابط الهيدروجينية (ال تكافؤية ضعيفة) :تنشأ بني الوظائف الكيميائية
جلذور األمحاض األمينية.
-الروابط الشاردية (ال تكافؤية ضعيفة) :تنشأ بني اجملموعات الكيميائية
السالبة واملوجبة يف اجلذور األمحاض األمينية املتأينة.
-الروابط الكارهة للماء (ال تكافؤية ضعيفة) :تنشأ بني اجلذور الكارهة
للماء لألمحاض األمينية.
-الروابط (الجسور) ثنائية الكبريت (تكافؤية قوية) :تنشأ بني جذرين
حلمضني أمينيني من نوع سيستيئني (.)Cys
البنية الرابعية :هي تجمع لسلسلتين بيبتيديتين أو أكثر لكل منها بنية ثالثية
وتسمى كل سلسلة ببتيدية بتحت وحدة ،ترتبط حتت الوحدات فيما بينها
بروابط ضعيفة عادة (مثل الروابط اهليدروجينية ،الشاردية والكارهة للماء) تنشأ
بني جذور األمحاض األمينية للسالسل البيبتيدية.
بإستعمال برنامج راستوب ( )Rastopقمنا بتمثيل البنية الفراغية لبعض الربوتينات الوظيفية كما هو موضح يف الوثيقة (.)5
التعليمات:
.2باإلعتماد على الوثائق ( )3( ،)2( ،)1و( )4إستخرج مميزات كل مستوى من مستويات البنية الفراغية للربوتينات.
.0قارن بني البنيات الفراغية للربوتينات املوضحة يف الوثيقة (.)5
اإلجابة:
.2إستخراج مميزات كل مستوى من مستويات البنية الفراغية للبروتينات:
.0المقارنة بين البنيات الفراغية للبروتينات الموضحة في الوثيقة (:)5
الهيموغلوبين الليزوزيم الميوغلوبين األنسولين
تتكون من سالسل بيبتيدية.
حتتوي على مناطق اإلنعطاف . أوجه التشابه
يضمن إستقرار هذه البنيات (الثالثية والرابعية) أربع أنواع من الروابط.
معقدة متوسطة متوسطة بسيطة درجة التعقيد
4 1 1 2 عدد السالسل البيبتيدية أوجه
رابعية ثالثية ثالثية ثالثية مستوى البنية الفراغية اإلختالف
حوايل 32احللزونية α 01- 8احللزونية α 01- 8احللزونية α 3احللزونية α عدد ونوع البنيات الثانوية
2الورقية β
تظهر الربوتينات ببنيات مختلفة ،حمددة بعدد وطبيعة وتتالي األمحاض األمنية اليت تدخل يف بنائها. اإلستنتاج
ب.تصنيف األحماض األمينية:
متثل الوثيقة ( )6الصيغ املفصلة لألمحاض األمينية العشرون.
التعليمة:
-ح ّدد الوظائف املميزة واملشرتكة بني األمحاض األمينية واجلزء املتغري (اجلذر ،)Rمث صنّف األمحاض األمينية حسب وجود يف اجلذر وظائف قاعدية أو
محضية القابلة للتأين.
اإلجابة:
تحديد الوظائف المميزة والمشتركة بين األحماض األمينية والجزء المتغير (الجذر :)R
تتكون األمحاض األمينية مجيعها من جزئني:
جزء ثابت :تشرتك فيه مجيع األمحاض األمينية يشمل وظيفة قاعدية أمينية ) )NH2ووظيفة حمضية كربوكسيلية ) )COOHمرتبطتان بـالكربون .α
جزء متغير :يتغري من محض أميين إىل آخر يدعى الجذر األلكيلي أو سلسلة جانبية ويرمز له بالرمز .R
تصنيف األحماض األمينية حسب وجود في الجذر وظائف قاعدية أو حمضية القابلة للتأين:
تصنف األمحاض األمينية حسب السلسلة اجلانبية (اجلذر )Rإىل:
أحماض أمينية قاعدية :وفيها حيتوي اجلذر Rعلى وظيفة قاعدية وهي :ليزين ،Lysأرجينين Argوهيستدين .His
أحماض أمينية حمضية :وفيها حيتوي اجلذر Rعلى وظيفة محضية وهي :حمض غلوتاميك Gluوحمض أسبارتيك .Asp
أحماض أمينية متعادلة :وفيها ال حيتوي اجلذر Rعلى وظيفة محضية أو قاعدية وهي :بقية األحماض األمينية (عددها .)25
ج.الخاصية األمفوتيرية (الحمقلية):
تجربة :لغرض حتديد شحنة احلمض األميين أالنين Alaمت وضع قطرة من حملول احلمض األميين يف منتصف شريط ورق الرتشيح يف جهاز الهجرة الكهربائية
(الرحالن الكهربائي) عند ،pH=2عند pH=12مث عند ،pH=6النتائج موضحة يف الوثيقة ).(7
التعليمات:
فسر نتائج اهلجرة الكهربائية للحمض األميين Alaمدعما ذلك بالصيغة الكيميائية للحمض األميين يف كل حالة ،مث إستنتج سلوك األمحاض األمينية يف
ّ .2
أوساط خمتلفة .pH
.0إستخرج قاعدة تسمح بتحديد شحنة احلمض األميين مبقارنة قيمة pHالوسط مع قيمة .pHi
اإلجابة:
.2تفسير نتائج الهجرة الكهربائية للحمض األميني :Ala
عند :pH=2نفسر هجرة احلمض األميين Alaإىل القطب السالب بتأين (تشرد) الوظيفة األمينية ) )NH3+ألن الوسط حامضي (مشبع بـ )H+
حيث أصبح احلمض األميين حيمل شحنة كهربائية موجبة ألنه سلك سلوك قاعدة فإكتسب بروتونا وفق املعادلة التالة:
عند :pH=12نفسر هجرة احلمض األميين Alaإىل القطب املوجب بتأين الوظيفة الكربوكسيلية ) )COO-ألن الوسط قاعدي (مشبع بـ (OH-
فحرر بروتونا وفق املعادلة التالة:
حيث أصبح احلمض األميين حيمل شحنة كهربائية سالبة ألنه سلك سلوك حمض ّ
عند :pH=6نفسر عدم هجرة احلمض األميين Alaإىل أي قطب (يرتسب يف منتصف الشريط) بتأين الوظيفتين حيث حتمل الوظيفة األمينية شحنة
كهربائية موجبة ) )NH3+والوظيفة الكربوكسيلية شحنة كهربائية سالبة ) )COO-أي أن مجموع الشحنات الكهربائية للحمض األميني تساوي
الصفر (الحمض األميني متعادل كهربائيا) ،يف هذه احلالة يكون pHالوسط = pHiالحمض األميني ،وفق املعادلة التالة:
اإلستنتاج :تسلك األمحاض األمينية سلوك األحماض (تفقد بروتونات) وسلوك القواعد (تكتسب بروتونات) وذلك تبعا لدرجة محوضة الوسط لذلك تسمى
بمركبات أمفوتيرية (حمقلية).
مالحظة :يرمز لنقطة التعادل الكهربائي للحمض األميين بـ pHiوهي ختتلف من محض أميين إىل آخر ،نقطة التعادل الكهربائي لـ Alaهي . pHi=6
.0القاعدة هي:
pHالوسط أقل من :pHiشحنة احلمض األميين تكون موجبة ( )+فيهاجر نحو القطب السالب.
pHالوسط أكبر من :pHiشحنة احلمض األميين تكون سالبة ( )-فيهاجر نحو القطب الموجب.
pHالوسط يساوي :pHiحمصلة شحنات احلمض األميين تساوي الصفر ( )2فال يهاجر ويترسب.
د.الرابطة البيبتيدية:
تتحد األمحاض األمينية مع بعضها البعض مشكلة سالسل بيبتيدية تعطي يف جمموعها الربوتينات ،للتعرف على كيفية إرتباط األمحاض األمينية مع بعضها البعض نقرتح
عليك الوثيقة (.)8
التعليمات:
.2ح ّدد عدد األمحاض األمينية يف كل من ثنائي البيبتيد وثالثي البيبتيد مث إستخرج كيفية تشكيل الرابطة البيتيدية بني محضني أمينيني مدعما ذلك مبعادلة
كيميائية.
.0أحسب عدد الروابط البيبتيدية وجزيئات املاء املتحررة يف السلسلة البيبتيدية (بإعتبار nعدد األمحاض األمينية الداخلة يف تركيب السلسلة البيبتيدية).
اإلجابة:
.2تحديد عدد األحماض األمينية:
في ثنائي البيبتيد :محضان أمينيان.
في ثالثي البيبتيد 3 :أمحاض أمينية.
إستخراج كيفية تشكيل الرابطة البيتيدية بين حمضين أمينيين:
ترتبط األمحاض األمينية املتتالية يف سلسلة بيبتيدية بروابط تكافؤية تدعى الرابطة البيبتيدية ) (CONHواليت تتشكل نتيجة إرتباط الوظيفة
الكربوكسيلية ( )-COOHللحمض األميين األول مع الوظيفة األمينية ( )-NH2للحمض األميين املوايل مع إنطالق جزيئة ماء.
.2حساب عدد الروابط البيبتيدية وجزيئات الماء المتحررة في السلسلة البيبتيدية:
عدد الروابط البيبتيدية وجزيئات املاء املتحررة يف السلسلة البيبتيدية يكون دائما ( ،(n-1حيث nعدد األمحاض األمينية الداخلة يف تركيب السلسلة
البيبتيدية.
مالحظة :عدد الوظائف الكربوكسيلية واألمينية احلرة ال يتأثر بطول السلسلة البيبتيدية.
.0العالقة بين بنية ووظيفة البروتين:
تجربة :Anfinsenأجرى العالم Anfinsenجتربته على إنزمي تفكيك ( ARNريبونيكلياز = )Ribonucléaseبإستعمال مادتني مها:
مركب -βمركبتوإيثانول (يعمل على تكسري اجلسور ثنائية الكربيت) واليوريا (تعمل على إعاقة اإلنطواء الطبيعي للربوتني) ،مراحل التجربة ونتائجها موضحة يف
الوثيقة (:)9
التعليمات:
صف بنية إنزمي الريبونيكلياز.
ّ .2
.0قارن بني النتائج التجريبية لتجربة .Anfinsen
اإلجابة:
.2وصف بنية إنزيم الريبونيكلياز:
إنزمي الريبونيكلياز يتكون من سلسلة بيبتيدية واحدة هبا 124محض أميين ،تأخذ البنية الثالثية ،حيتوي على 4جسور ثنائية الكربيت بني أمحاض أمينية حمددة
من نوع سيستيئني ( )Cysوذلك يف املواضع ( )114-54( ،)55-44( ،)44-22و(.)22-25
.0المقارنة بين نتائج تجربة :Anfinsen
متثل الوثيقة ( )9مراحل ونتائج جتربة ،Anfinsenحيث نالحظ:
المرحلة :2معاملة إنزمي الريبونيكلياز مبركب - βمركبتوإيثانول واليوريا تؤدي إىل فقدان بنيته الفراغية (ختريب) ويصبح إنزمي غري فعال ،وهذا يدل على تكسري
اجلسور ثنائية الكربيت األربعة (ملعاملته مبركب - βمركبتوإيثانول) كما ال ميكنه إستعادة إنطوائه الطبيعي (ملعاملته باليوريا).
المرحلة :0إزالة اليوريا ومركب - βمركبتوإيثانول تؤدي إىل إستعادة البنية الفراغية الطبيعية للربوتني فيصبح اإلنزمي فعال ،وهذا يدل على عودة تشكل اجلسور
ثنائية الكربيت يف مواضعها الصحيحة.
ومن مقارنة نتائج المرحلة 0بنتائج المرحلة :2يتبني أن وجود روابط (جسور ثنائية الكربيت) بني أمحاض أمينية حمددة (من نوع ( ))Cysويف أماكن حمددة ضرورية
للحفاظ على البنية الفراغية للربوتني وبالتايل ختصصه الوظيفي.
المرحلة :3معاملة اإلنزمي خمرب (فاقد لبنيته الفراغية) مبركب اليوريا تؤدي إىل تشكل بنية فراغية غري طبيعية للربوتني فيصبح اإلنزمي غري فعال ،وهذا يدل على
تشكل اجلسور ثنائية الكربيت يف غري مواضعها الصحيحة.
ومن مقارنة نتائج المرحلة 3بنتائج المرحلة :0يتبني أن تشكل الروابط (اجلسور ثنائية الكربيت) يف مواضعها الصحيحة (إنطواء الربوتني بشكل طبيعي) يكسب
الربوتني بنيته الفراغية الطبيعية وبالتايل ختصصه الوظيفي.
اإلستنتاج :تتوقف البنية الفراغية وبالتايل التخصص الوظيفي للربوتني ،على الروابط اليت تنشأ بين أحماض أمينية مح ّددة (جسور ثنائية الكبريت ،شاردية،)...،
ومتموضعة بطريقة دقيقة يف السلسلة البيبتيدية حسب الرسالة الوراثية.
الخالصة:
تظهر الربوتينات ببنيات فراغية خمتلفة ،حمددة بعدد وطبيعة وتتالي األمحاض األمنية اليت تدخل يف بنائها.
تتكون جزيئات األمحاض األمينية من وظيفة أمينية قاعدية ) )NH2ووظيفة حمضية كربوكسيلية ) )COOHمرتبطتان بـالكربون αومها مصدرا
الخاصية األمفوتيرية.
يوجد عشرون نوعا من األمحاض األمينية تدخل يف بنية الربوتينات الطبيعية ختتلف فيما بينها يف السلسلة الجانبية (وجود وظائف قابلة للتأين).
تصنف األمحاض األمينية حسب السلسلة الجانبية إىل:
أحماض أمينية قاعدية (ليزين ،أرجنني ،هستدين).
تسلك األمحاض األمينية سلوك األحماض (تفقد بروتونات) وسلوك القواعد (تكتسب بروتونات) وذلك تبعا لدرجة محوضة الوسط لذلك تسمى بمركبات
أمفوتيرية (حمقلية).
ترتبط األمحاض األمينية املتتالية يف سلسلة بيبتيدية بروابط تكافؤية تدعى الرابطة البيبتيدية ).(CONH
ختتلف البيبتيدات عن بعضها بالقدرة على التفكك الشاردي لسالسلها الجانبية اليت حتدد طبيعتها األمفوتريية وخصائصها الكهربائية.
تتوقف البنية الفراغية وبالتايل التخصص الوظيفي للربوتني ،على الروابط اليت تنشأ بين أحماض أمينية محددة (جسور ثنائية الكبريت ،شاردية،)...،
ومتموضعة بطريقة دقيقة يف السلسلة البيبتيدية حسب الرسالة الوراثية.
التقويم:
التطبيق األول:
.2ش ّكل رباعي البيبتيد مكون من األمحاض األمينية التالية.Ala ،Gly ،Lys ، Glu :
.0أوجد شحنة رباعي البيبتيد املتشكل عند pH=1مث عند ،pH=13ماذا تستنتج؟
.3ماهو عدد أنواع رباعي البيبتيد املختلفة املمكن تشكيلها بدون تكرار وبالتكرار؟
تعطى:
R1 (Ala)= CH3
R2 (Gly)= H
R3 (Lys)= (CH2)4-NH2 education-onec-dz.blogspot.com
R4 (Glu)= (CH2)2-COOH
اإلجابة:
.1تشكيل رباعي البيبتيد:
.2شحنة رباعي البيبتيد عند :pH=1هي +0وذلك لوجود وظيفة أمينية يف جذر احلمض األميين Lysباإلضافة إىل الوظيفة األمينية احلرة.
شحنة رباعي البيبتيد عند :pH=13هي -2وذلك لوجود وظيفة كربوكسيلية يف جذر احلمض األميين Gluباإلضافة إىل الوظيفة الكربوكسيلية احلرة.
اإلستنتاج :ختتلف البيبتيدات عن بعضها بالقدرة على التفكك الشاردي لسالسلها الجانبية اليت حتدد طبيعتها األمفوتيرية وخصائصها الكهربائية.
.3عدد أنواع رباعي البيبتيد المختلفة الممكن تشكيلها:
بدون تكرار n( :حيث nهو عدد األمحاض األمينية املختلفة املستعملة) 04 = 1x2x3x4 = 4رباعي بيبتيد مختلف.
بالتكرار Ab( :حيث Aهو عدد األمحاض األمينية املختلفة املستعملة و bعدد األمحاض األمينية اليت يتكون منها البيبتيد) 056 = 44رباعي بيبتيد
مختلف.
التطبيق الثاني:
-بيّن يف نص علمي كيف تتحكم املورثة يف حتديد البنية الفراعية للربوتني؟
اإلجابة:
ختتلف الربوتينات فيما بينها يف عدد ونوع وترتيب األمحاض األمنية املشكلة هلا ،يضمن هذا اإلختالف تتابع نكليوتيدات املورثة املشرفة على تركيب كل نوع من
الربوتينات ،كما تتميز ببنيات فراغية متنوعة تسمح هلا بأداء وظائف متنوعة.
ما العالقة بين بنية ووظيفة البروتين ؟ وكيف تتحكم المورثة في تحديد هذه العالقة ؟
حتدد بنية الربوتني من خالل نوع وعدد وترتيب األمحاض األمنية املشكلة له واليت تنشأ بني جذورىها روابط كيميائية ) روابط ثنائية الكربيت ،روابط هيدروجيية،
روابط شاردية وروابط كارهة للماء) متوضعة بطريقة دقيقة يف أماكنها الصحيحة يف السلسلة الببتيدية حسب الرسالة الوراثية ،حمافظة على البنية الفراغية مما يكسب
الربوتني ختصصا وظيفيا.
أي خلل على مستوى املورثة يؤدي اىل تغيري تسلسل األمحاض األمنية املشكلة للربوتني وبالتايل تفكيك الروابط أو تشكلها يف أماكن غري
صحيحة فتتغري البنية الفراغية ويفقد الربوتني ختصصه الوظيفي.
حتدد املورثة تتابع األمحاض األمنية املشكلة للربوتني ،وبالتايل يكتسب بنية فراغية حتدد ختصصه الوظيفي.
المصطلحات العلمية:
برنامج راستوب ( :)Rastopبرنامج كمبيوتر متخصص يف البنية الفراغية للجزيئات وخاصة الربوتينات يسمح بـ:
تغيري منوذج العرض بسهولة ،واإلستفادة من مميزات كل منوذج.
معرفة عدد وتتابع األمحاض األمينية اليت تدخل يف تركيب الربوتني.
حتديد البنيات الثانوية ومناطق اإلنعطاف وعددها يف الربوتني.
تعيني وإبراز اجلذور اجلانبية لألمحاض األمينية يف السالسل الربوتينية.
حتديد املوقع الفعال وطريقة إرتباط الربوتني مبادة التفاعل.
تدوير اجلزيئة يف كل اإلجتاهات وتغيري اللون.
نقطة التعادل الكهربائي ( :(pH isoélectrique) )pHiهي قيمة pHاليت يكون فيها جمموع شحنات احلمض األميين تساوي الصفر ،فلكل محض
أميين نقطة تعادل كهربائي خاصة به يرمز هلا pHiفهي ختتلف من محض أميين ألخر.
جهاز الهجرة الكهربائية أو الرحالن الكهربائي ( :)Electrophorèseجهاز يسمح بفصل المركبات المشحونة (أحماض أمينية أو بروتينات مثال)
وفق شحنتها ،حيث يتم وضع خليط من األمحاض األمينية على شريط الفصل (ورق ترشيح أو مادة هالمية) املتصل حبجرتني حتتوي كل منهما على
حملول منظم ذو pHحمدد ،كما حتتوي كل حجرة على قطب كهربائي سالب أو موجب متصلني مبولد كهربائي.
األحماض :هي تلك املركبات اليت هلا القدرة على حترير بروتونات.H+
القواعد :هي تلك املركبات اليت هلا القدرة على إكتساب بروتونات.H+
يوم......................... : المجال التعلمي ......................................... :2 اإلسم واللقب................................ :
.............................. الوحدة التعلمية ......................................... :2 القسم........................................:
.............................. الحصة التعلمية ......................................... :2 الفوج.........................................:
وضعية اإلنطالق:
تقوم الربوتينات بالعديد من الوظائف احليوية املتنوعة فهي تدخل كمادة بنائية جلسم الكائن احلي ،كما تعمل كمادة متخصصة وظيفيا كتنشيط التفاعالت
احليوية (اإلنزميات) وتنظيم العمليات احليوية يف اخللية واجلسم (اهلرمونات) وكوسائل دفاعية (األجسام املضادة) ،ويعود هذا التخصص الوظيفي للربوتينات إىل البنية
الفراغية اليت تتميز هبا هذه اجلزيئات.
المشكلة........................................................................................................................................... :
الفرضيات:
ف................................................................................................................................... :2
ف................................................................................................................................... :0
ف................................................................................................................................... :3
ف................................................................................................................................... :4
التقصي:
.2البنية الفراغية للبروتين:
أ.مستويات البنية الفراغية:
ميكن تقسيم املستويات البنيوية للربوتينات حسب درجة التعقيد إىل 4مستويات كما هو موضح يف الوثائق ( )3( ،)0( ،)2و(.)4
مميزات كل مستوى مستويات البنية الفراغية للبروتينات
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
........................................................................
بإستعمال برنامج راستوب ( )Rastopقمنا بتمثيل البنية الفراغية لبعض الربوتينات الوظيفية كما هو موضح يف الوثيقة (.)5
التعليمات:
.2باإلعتماد على الوثائق ( )3( ،)2( ،)1و( )4إستخرج مميزات كل مستوى من مستويات البنية الفراغية للربوتينات.
.0قارن بني البنيات الفراغية للربوتينات املوضحة يف الوثيقة (.)5
اإلجابة:
.2إستخراج مميزات كل مستوى من مستويات البنية الفراغية للبروتينات:
.0المقارنة بين البنيات الفراغية للبروتينات الموضحة في الوثيقة (:)5
الهيموغلوبين الليزوزيم الميوغلوبين األنسولين
.....................................................................................................
..................................................................................................... أوجه التشابه
.....................................................................................................
........................ ..................... .................... ........................ درجة التعقيد
........................ ..................... .................... ........................ عدد السالسل البيبتيدية أوجه
........................ ..................... .................... ........................ مستوى البنية الفراغية اإلختالف
........................ ..................... .................... ........................ عدد ونوع البنيات الثانوية
........................ ..................... .................... ........................
..................................................................................................... اإلستنتاج
.....................................................................................................
ب.تصنيف األحماض األمينية:
متثل الوثيقة ( )6الصيغ املفصلة لألمحاض األمينية العشرون.
التعليمة:
-ح ّدد الوظائف املميزة واملشرتكة بني األمحاض األمينية واجلزء املتغري (اجلذر ،)Rمث صنّف األمحاض األمينية حسب وجود يف اجلذر وظائف قاعدية أو
محضية القابلة للتأين.
اإلجابة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
ج.الخاصية األمفوتيرية (الحمقلية):
تجربة :لغرض حتديد شحنة احلمض األميين أالنين Alaمت وضع قطرة من حملول احلمض األميين يف منتصف شريط ورق الرتشيح يف جهاز الهجرة الكهربائية
(الرحالن الكهربائي) عند ،pH=2عند pH=12مث عند ،pH=6النتائج موضحة يف الوثيقة ).(7
التعليمات:
فسر نتائج اهلجرة الكهربائية للحمض األميين Alaمدعما ذلك بالصيغة الكيميائية للحمض األميين يف كل حالة ،مث إستنتج سلوك األمحاض األمينية
ّ .2
يف أوساط خمتلفة .pH
.0إستخرج قاعدة تسمح بتحديد شحنة احلمض األميين مبقارنة قيمة pHالوسط مع قيمة .pHi
اإلجابة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
د.الرابطة البيبتيدية:
تتحد األمحاض األمينية مع بعضها البعض مشكلة سالسل بيبتيدية تعطي يف جمموعها الربوتينات ،للتعرف على كيفية إرتباط األمحاض األمينية مع بعضها البعض نقرتح
عليك الوثيقة (.)8
التعليمات:
.2ح ّدد عدد األمحاض األمينية يف كل من ثنائي البيبتيد وثالثي البيبتيد مث إستخرج كيفية تشكيل الرابطة البيتيدية بني محضني أمينيني مدعما ذلك مبعادلة
كيميائية.
.0أحسب عدد الروابط البيبتيدية وجزيئات املاء املتحررة يف السلسلة البيبتيدية (بإعتبار nعدد األمحاض األمينية الداخلة يف تركيب السلسلة البيبتيدية).
اإلجابة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
.0العالقة بين بنية ووظيفة البروتين:
تجربة :Anfinsenأجرى العالم Anfinsenجتربته على إنزمي تفكيك ( ARNريبونيكلياز = )Ribonucléaseبإستعمال مادتني مها:
مركب -βمركبتوإيثانول (يعمل على تكسري اجلسور ثنائية الكربيت) واليوريا (تعمل على إعاقة اإلنطواء الطبيعي للربوتني) ،مراحل التجربة ونتائجها موضحة يف
الوثيقة (:)9
التعليمات:
صف بنية إنزمي الريبونيكلياز.
ّ .2
.0قارن بني النتائج التجريبية لتجربة .Anfinsen
اإلجابة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
الخالصة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
التقويم:
التطبيق األول:
.2ش ّكل رباعي البيبتيد مكون من األمحاض األمينية التالية.Ala ،Gly ،Lys ، Glu :
.0أوجد شحنة رباعي البيبتيد املتشكل عند pH=1مث عند ،pH=13ماذا تستنتج؟
.3ماهو عدد أنواع رباعي البيبتيد املختلفة املمكن تشكيلها بدون تكرار وبالتكرار؟
تعطى:
R1 (Ala)= CH3
R2 (Gly)= H
R3 (Lys)= (CH2)4-NH2
R4 (Glu)= (CH2)2-COOH
اإلجابة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
التطبيق الثاني:
-بيّن يف نص علمي كيف تتحكم املورثة يف حتديد البنية الفراعية للربوتني؟
اإلجابة:
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
......................................................................................................................................................
المصطلحات العلمية:
برنامج راستوب ( :)Rastopبرنامج كمبيوتر متخصص يف البنية الفراغية للجزيئات وخاصة الربوتينات يسمح بـ:
تغيري منوذج العرض بسهولة ،واإلستفادة من مميزات كل منوذج.
معرفة عدد وتتابع األمحاض األمينية اليت تدخل يف تركيب الربوتني.
حتديد البنيات الثانوية ومناطق اإلنعطاف وعددها يف الربوتني.
تعيني وإبراز اجلذور اجلانبية لألمحاض األمينية يف السالسل الربوتينية.
حتديد املوقع الفعال وطريقة إرتباط الربوتني مبادة التفاعل.
تدوير اجلزيئة يف كل اإلجتاهات وتغيري اللون.
نقطة التعادل الكهربائي ( :(pH isoélectrique) )pHiهي قيمة pHاليت يكون فيها جمموع شحنات احلمض األميين تساوي الصفر ،فلكل محض أميين نقطة
تعادل كهربائي خاصة به يرمز هلا pHiفهي ختتلف من محض أميين ألخر.
جهاز الهجرة الكهربائية أو الرحالن الكهربائي ( :)Electrophorèseجهاز يسمح بفصل المركبات المشحونة (أحماض أمينية أو بروتينات مثال) وفق شحنتها،
حيث يتم وضع خليط من األمحاض األمينية على شريط الفصل (ورق ترشيح أو مادة هالمية) املتصل حبجرتني حتتوي كل منهما على حملول منظم ذو pHحمدد ،كما حتتوي
كل حجرة على قطب كهربائي سالب أو موجب متصلني مبولد كهربائي.
األحماض :هي تلك املركبات اليت هلا القدرة على حترير بروتونات.H+
القواعد :هي تلك املركبات اليت هلا القدرة على إكتساب بروتونات.H+
education-onec-dz.blogspot.com