Professional Documents
Culture Documents
Razlikovanje Evolutivnih Linija Potocne Pastrmke
Razlikovanje Evolutivnih Linija Potocne Pastrmke
Bioloki fakultet
mr Saa P. Mari
Doktorska disertacija
Beograd, 2005.
Univerzitet u Beogradu
Bioloki fakultet
mr Saa P. Mari
Datum odbrane:
Doktorska disertacija
Beograd, 2005.
III
Zahvalnica
Zahvalnica
IV
Izvod
Izvod
Za rasvetljavanje filogeografije populacija potone pastrmke (Salmo trutta) na
podruju Republike Srbije, sekvencioniran je 5' kraj kontrolnog regiona mtDNA u duini
od 561 bp i dobijene sekvence uporeene su sa poznatim sekvencama iz prethodnih
istraivanja na drugim teritorijama. U analizu je ukljuena 101 jedinka poreklom iz
gornjih tokova reka crnomorskog, egejskog i jadranskog sliva. Sekvencioniranjem je
identifikovano petnaest haplotipova, od kojih se etrnaest smatra autohtonim i oni
pripadaju dunavskoj i jadranskoj liniji, dok samo jedan haplotip (ATcs1), pronaen kod
dve jedinke poreklom iz dve poribljavane reke, pripada atlantskoj liniji koja je
komercijalizovana i najee koriena za poribljavanje. Autohtoni haplotipovi odlikuju
se izrazitom geografskom distribucijom: dunavski haplotipovi su strogo ogranieni na
reke dunavskog sliva, dok jadranski haplotipovi dominiraju u rekama egejskog i
jadranskog sliva; najvei deo ukupne molekularne varijanse (69%) pripisan je upravo
razlikama izmeu slivova. Filogenetskom rekonstrukcijom, koja je dopunjena sa est
novih haplotipova, po prvi put opisanih u ovom radu, podrano je stanovite o
ancestralnoj poziciji dunavske linije unutar kompleksa potone pastrmke, kao i naglaeno
postojanje posebne farioides (Ad+) klade otkrivene unutar jadransko-mediteranskemarmoratus filogenetske grupe. Dobijeni rezultati potvrdili su naa oekivanja o
postojanju visokog genetikog diverziteta balkanskih populacija potone pastrmke, to
zahteva dalja istraivanja koja bi trebala da obuhvate pastrmske populacije iz celog
regiona.
VI
Sadraj
Sadraj
Zahvalnica................................................................................................. III
Izvod ......................................................................................................... IV
Abstract .......................................................................................................V
Sadraj....................................................................................................... VI
Skraenice i simboli................................................................................VIII
1.
UVOD ......................................................................................................... 1
1.1.
1.2.
1.2.1.
1.2.2.
1.2.3.
1.2.4.
1.2.5.
1.2.5.1.
1.2.5.2.
1.2.5.2.1.
1.2.5.2.2.
1.2.5.2.2.1.
1.2.5.2.2.1.1.
1.2.5.2.2.2.
1.2.5.2.2.2.1.
1.2.5.2.2.2.2.
1.2.5.2.2.2.3.
1.2.6.
1.3.
2.
MATERIAL I METODE.......................................................................... 39
2.1.
2.1.1.
2.1.2.
2.1.3.
2.1.3.1.
2.1.3.2.
2.1.3.3.
2.1.3.4.
2.1.3.5.
2.1.4.
2.2.
2.2.1.
2.2.1.1.
2.2.1.2.
2.2.1.3.
Materijal.................................................................................................... 39
Prikupljanje i uvanje uzoraka.................................................................. 39
Raspored lokaliteta i brojnost analiziranih uzoraka.................................. 40
Hemikalije................................................................................................. 42
Priprenljeni setovi hemikalija ................................................................... 42
Enzimi ....................................................................................................... 42
Poetni oligonuklotidi (prajmeri).............................................................. 43
Markeri...................................................................................................... 43
Puferi......................................................................................................... 43
Laboratorijska oprema .............................................................................. 43
Metode ...................................................................................................... 44
Izolacija DNA ........................................................................................... 44
Fenolna ekstrakcija ................................................................................... 44
Wizard Genomic DNA Purification Kit ................................................. 45
Jet quick tissue DNA spin kit/250 ............................................................ 45
VII
Sadraj
2.2.2.
2.2.3.
2.2.4.
2.2.5.
2.2.5.1.
2.2.5.2.
2.2.5.3.
2.2.5.4.
2.2.6.
3.
REZULTATI............................................................................................. 53
3.1.
3.2.
3.2.1.
4.
DISKUSIJA .............................................................................................. 71
4.1.
4.2.
4.3.
4.3.1.
4.3.2.
4.3.3.
4.3.4.
4.3.5.
5.
ZAKLJUCI........................................................................................... 107
6.
SUMMARY............................................................................................ 111
7.
VIII
Skraenice i simboli
Skraenice i simboli
A
adenin
ATP
adenozin trifosfat
bp
bazni par
citozin
ddNTP
2, 3 dideoksinukleozid 5trifosfat
DNA
dezoksiribonukleinska kislina
dNTP
2 deoksinukleozid 5 trifosfat
EDTA
eng.
engleski
guanin
kbp
mtDNA
mitohondrijska DNA
PCR
pH
RFLP
RNA
ribonukleinska kislina
rRNA
ribozomalna RNA
SDS
timin
TAE
Taq DNApolimeraza
TBE
TEN
Tris
tRNA
transportna RNA
TSR
Uvod
1. UVOD
1.1. UVODNE NAPOMENE
Povoljni prirodni uslovi omoguuju postojanje vie hiljada vodotokova na
teritoriji Srbije. Njihova ukupna duina iznosi 65980 km ili proseno 747 m/km2. U Srbiji
ima samo 11 reka ija duina iznosi preko 200 km, to znai da preovlauju male i
srednje reke duine ispod 100 km (Gavrilovi i Duki, 2002).
Reke Srbije otiu u tri mora, tako da se moe rei da Srbija predstavlja
hidrografski vor Balkana. Najvea povrina teritorije odvodnjava se prema Crnom
(92,46%), a znatno manja povrina ka Jadranskom (5,36%) i Egejskom moru (2,18%).
Morski slivovi Srbije razlikuju se ne samo po veliini nego i hidroloki, to je uzrokovano
specifinim klimatskim prilikama, uslovima oticanja padavina i geolokim sastavom
terena.
Hidroloka raznovrsnost na podruju Srbije u pogledu broja, veliine, geografskog
poloaja i oticanja reka uslovila je i raznovrsnost ivog sveta koji je vezan za vodena
stanita. U planinskim vodama koje preovlauju po broju u odnosu na ravniarske
nalazimo idealne uslove za ivot pastrmskih vrsta riba. Prirodna nepovezanost morskih
slivova i geotektonski dogaaji uslovili su da danas na podruju Srbije ive izolovane,
lokalno specifine populacije potone pastrmke (Salmo trutta).
U poslednjih 20 godina mnogo je raeno na utvrivanju genetikog identiteta
populacija potone pastrmke na podruju Evrope (Ferguson i Fleming, 1983; Krieg i
Guyomard, 1985; Ferguson, 1989; Karakousis i Triantaphyllidis 1990; Phillips i Pleyte,
1991; Bernatchez i sar., 1992; Bernatchez, 1995; 2001; Giuffra i sar., 1994; 1996;
Bernatchez i Osinov, 1995; Riffel i sar., 1995; Apostolidis i sar., 1996; 1996a; 1997;
Garcia-Marin i sar., 1996; 1999; McKay i sar., 1996; Shed'ko i sar., 1996; Oleynik, 1997;
Phillips i Oakley, 1997; Weiss i sar., 2000; 2001; Cortey i Garca-Marn, 2002; Cortey i
sar., 2004). Na osnovu ve poznatih rezultata, predpostavili smo da i populacije na
podruju Srbije zbog duge izolovanosti i specifinosti stanita predstavljaju posebne
evolutivne grane.
Snaan razvoj sportskog ribolova, kao i veoma zastupljen krivolov uz naruavanje
prirodnih uslova stanita doveli su do znaajnog smanjenja brojnosti populacija potone
pastrmke, a pojedine populacije su postale ugroene sa stanovita opstanka. Kao
Uvod
Uvod
Uvod
Uvod
telesne teine) salmonidnih vrsta riba relativno je mala i kree se od oko 1500 jaja - ikre
(kod potone pastrmke) do oko 12000 jaja (kod mladice) u odnosu na 1 kg telesne teine.
Veliina riba iz familije Salmonidae je neujednaena. Dok vrste iz roda Salmo,
Salvelinus i Salmothymus u potocima i manjim reicama narastu otprilike do 30 ili 40 cm
totalne duine i izmeu 0,30 kg i 1 kg mase tela (nekada i neto vie), one iz veih, dubljih
reka ili jezera narastu znatno vie, ak i preko 22 kg, a mladica i preko 50 kg (Aganovi,
1979).
Superordo: Protacanthopterygii
Ordo: Salmoniformes
Familia: Salmonidae
Subfamilia: Corregoninae (ozimice)
Subfamilia: Thymalinae (lipljani)
Subfamilia: Salmoninae
Genus: Brachymystax, (lenok)
Genus: Hucho, (mladica)
Genus: Oncorhynchus, (pacifiki lososi i pacifike pastrmke)
Genus: Parahucho
Genus: Salmo, (atlantski losos i pastrmka)
Genus: Salvelinus, (zlatovice)
Genus: Salvethymus
Uvod
Mnogo vea neslaganja meu autorima moemo sresti pri klasifikaciji rodova
unutar podporodice Salmoninae.
Autori se uglavnom slau oko filogenetskog statusa najbolje prouenih rodova
(Hucho, Salvelinus, Salmo, Oncorhynchus), za koje se smatra da predstavljaju naprednije
salmonide. To se posebno odnosi na rodove Oncorhynchus i Salmo. Ostali rodovi:
Brachymystax, Salmothymus, Acantholingua i Platysalmo, koji su slabije proueni,
smatraju se morfoloki primitivnijim i njihovo filogenetsko mesto jo uvek je potpuno
nejasno (Stearley i Smith, 1993; Osinov, 1999; Phillips i Oakley, 1997).
Uvod
Slika 3.Prikaz etiri filogenetske hipoteze date na osnovu morfolokih analiza od strane
razliitih autora (za odnose izmeu rodova Brachymystax, Hucho i Salvelinus) (1) Norden
(1961), (2) Kendall i Behnke (1984), (3) Dorofeeva (1989) i (4) Stearley i Smith (1993).
(1)
Thymallus
(2)
Thymallus
Brachymystax
Brachymystax
Hucho
Hucho
Salvleinus
Salvelinus
Salmo
Salmo
Oncorhynchus
Oncorhynchus
(3)
Thymullus
(4)
Thymallus
Brachymystax
Brachymystax
Hucho
Acantholingua
Parahucho
Salmothymus
Salvelinus
Hucho
Salmothymus
Salmo
Salvelinus
Oncorhynchus
Oncorhynchus
Salmo
Prema prvoj hipotezi, Norden (1961) smatra da svaki od rodova ima monofiletsko
poreklo (Slika 3-1). Kendall i Behnke (1984), prema drugoj hipotezi, smatraju da rodovi
Brachymystax, Hucho i Salvelinus vode poreklo od zajednike monofiletske grupe (Slika
3-2). Dorofeyeva (1989), prema treoj hipotezi, smatra da rodovi Brachymystax, Hucho i
Parahucho vode poreklo od jedne zajednike monofiletske grupe, a Salvelinus od druge
(Slika 3-3). Stearley i Smith (1993), prema etvrtoj hipotezi, smatraju da rodovi Hucho i
Salvelinus vode poreklo od jedne monofiletske grupe, Salmothymus i Acantholingua od
druge, a Brachymystax od tree (Slika 3-4).
Intergeneriki odnosi u podporodici Salmoninae znatno su izmenjeni nakon
uvoenja molekularnih tehnika (Slika 4). Dobijanjem novih rezultata koji su bili razliiti
u odnosu na rezultate dobijene morfolokim analizama, bilo je neophodno izvriti
reklasifikaciju rodova u okviru podporodice. Dobijeni rezultati bili su pre svega znaajni
za
utvrivanje
taksonomske
pozicije
problematinih
rodova
(Brachymystax,
Uvod
Thymallus
Thymallus
Brachymystax
Salmothymus
Acantholingua
Hucho
Salmothymus
Brachymystax
Hucho
Salvelinus
Salvelinus
Acantholingua
Salmo
Salmo
Oncorhynchus
Oncorhynchus
Sistematsko mesto roda Salmothymus takoe je bilo diskutabilno dok nisu uraene
analize nuklearne DNA i sekvencioniranja kontrolnog regiona i citohroma b
mitohondrijalne DNA (Slika 5). Na osnovu dobijenih rezultata, rod Salmothymus, isto kao
i rod Acantholingua, filogenetski je najblii rodu Salmo (Snoj i sar., 2002).
Uvod
Coregonus lavaretus
Coregonus albula
Thymallus thymallus
Thymallus arcticus
Salvelinus alpinus
Brachymystax lenok
Salvelinus fontinalis
Oncorhynchus keta
Salmo trutta
Acantholingua
ohridana
Salmothymus
obtusirostris
Salmo
salar
Oncorhynchus mykiss
0.1
Uvod
Salvelinus fontinalis
Oncorhynchus mykiss
Salmo salar
Salmo obtusirostris
100
Acantholingua ohridana
100
Da
94
At
Ma
81
Ad
0.01
Na osnovu dobijenih rezultata (Snoj i sar., 2002; Snoj, 2003), autori su zakljuili
da unutar grupe Salmo postoje tri podgrupe: Salmo salar, Salmo trutta kompleks koji
ukljuuje i Salmo marmoratus i trea podgrupa koju ine Acantholingua ohridana i
Salmothymus obtusirostris. Autori takoe smatraju da su vrste iz tree podgrupe
sestrinske i da predstavljaju evolutivni prelaz izmeu Salmo salar i Salmo trutta
kompleksa, pri emu su znatno blie kompleksu Salmo trutta.
Autori su na osnovu dobijenih rezultata predloili reklasifikaciju roda
Salmothymus kao zasebnog roda, i predlau svrstavanje vrsta istog unutar roda Salmo.
Sunik i sar. (2004) na osnovu rezultata sekvencioniranja mtDNA zakljuuju da
vrste Salmo marmoratus i Salmo (Platysalmo) platycephalus ulaze u sastav filogenetskog
kompleksa Salmo trutta (Slika 7).
10
Uvod
Slika 7. Filogenetski odnosi unutar grupe Salmo, sa posebnim akcentom na poloaj vrste
Salmo platycephalus, dobijeni na osnovu sekvencioniranja ITS1 gena nuklearne DNA,
kontrolnog regiona i citohroma b mtDNA (Sunik i sar., 2004). Ma marmoratus, Me
mediteranska, Ad jadranska, At atlantska i Da dunavska linija.
11
Uvod
12
Uvod
vertikalnih mrlja na bokovima tela. Sa porastom mlai nestaju ova obeleja. Totalna
duina dvogodinjih jedinki moe dostii 20 do 25 cm, a teina 150 do 200 g (Jevti,
1989). Rastu dosta sporo. U akumulacionom jezeru Lokvara (blizu Delnica), koje pripada
dunavskom slivu, ulovljena je 1968. godine potona pastrmka duine 124 cm i teine od
25.5 kg, stara 15 ili 16 godina (Paur, 1969).
Potona pastrmka se hrani razliitim organizmima: ribama, larvama vodenih
insekata, ikrom drugih riba, insektima koji lete nad povrinom vode i padaju na vodu,
raiima i drugim beskimenjacima (Aganovi, 1979).
Od uvoenja binomijalne nomenklature do danas, opisana je, na osnovu
morfologije, 1931 vrsta evropskih salmonida. Ovako veliki broj vrsta javlja se kao
posledica nedovoljnog poznavanja pravila nomenklature i morfologije riba, kao i primene
razliitih koncepata vrste. U poslednjih dvesta godina dato je 57 naunih imena za
potonu pastrmku Salmo trutta sensu stricto (Kottelat, 1997).
Pastrmka je izuzetno prilagodljiva razliitim uslovima stanita spram kojih
pokazuje visok nivo fenotipske plastinosti. Zbog toga danas postoji veliki broj
geografski specifinih populacija, sa karakteristinim morfolokim odlikama, i to je
glavni razlog zato je za jednu vrstu dato toliko naunih imena.
Postoje tri razliita ekoloka oblika koje potona pastrmka razvija u zavisnosti od
uslova stanita:
Salmo trutta forma fario reni oblik (Slike 10, 11, 12 i 13)
Salmo trutta forma lacustris jezerski oblik (Slika 8)
Salmo trutta forma trutta morski oblik (Slika 9)
Morski i jezerski oblik predstavljaju migratorne populacije, dok reni oblik uvek
naseljava reno stanite u okviru koga moe preduzimati manje ili vee migratorne
pokrete. Morska forma ivi i hrani se u moru, kada postane polno zrela migrira u reke na
mrest, a nakon mresta mladi se vraaju u more. Jezerska forma naseljava jezera, a na
mrest, kao i morska forma, migrira u reke, ili pak u plie delove jezera (Elliott, 1994).
Migratorne i stalne populacije mogu istovremeno naseljavati neku reku i pojedine studije
pokazuju da se mogu nesmetano ukrtati (Hindar i sar., 1991), mada mehanizam
nasleivanja migratornosti/stacionarnosti jo uvek nije poznat.
13
Uvod
Morska forma je veoma slina atlantskom lososu. Po bokovima tela ima veliki
broj crnih piknji nepravilnog oblika. Prvi o njoj je pisao Chiereghini (1818) i dao joj ime
Salmo cenerinus, a posle njega Kolombatovi (1890) koji ju je preimenovao u Trutta
adriatica. Snoj i sar. (2002) su, na osnovu rezultata dobijenih sekvencioniranjem mtDNA,
utvrdili da morska forma pripada atlantskoj liniji, pri emu se smatra da su analizirani
uzorci iz severnog Jadrana alohtonog (ribnjakog) porekla.
14
Uvod
Na
osnovu
genetikih
analiza
(RFLP
(Restriction
Fragment
Length
15
Uvod
16
Uvod
17
Uvod
Poto je atlantski basen najdue bio izloen uticaju ledenog doba smatra se da je
atlantska linija imala najskoriju demografsku ekspanziju koja se dogodila pre 26000
13000 godina, to se poklapa sa poetkom kraja poslednje glacijacije (pre oko 18000
godina). Dunavska linija imala je stariju najznaajniju demografsku ekspanziju mnogo
pre At linije, poto na nju ledena doba nisu posebno uticala i to pre 300000 150000
godina, to se poklapa sa najznaajnjim interkonekcijama (Crno more, Kaspijsko i
Aralsko jezero) i irenjem mora (pre oko 28000 godina). Vreme demografske ekspanzije
unutar jadranske linije najverovatnije se desilo izmeu At i Da linije, pre 77000 135000.
Smatra se da ledeno doba nije imalo uticaja na mediteransku i marmoratus liniju
(Bernatchez i sar., 1992; Bernatchez, 2001).
Slika 15. Geografska distribucija pet glavnih mtDNA evolutivnih linija potone pastrmke
u Evropi (Bernatchez, 2001).
- atlantska linija,
- dunavska linija,
- mediteranska linija
- jadranska linija
- marmoratus linija
18
Uvod
Pet filogenetskih linija koje je opisao Bernatchez i sar. (1992), grupa naunika koja
je udruena u konzorcijum TROUTCONCERN (Laikre i sar., 1999) objedinila je u tri
grupe:
19
Uvod
linija znaajno preovlauje, dok je svega nekoliko jedinki odreeno kao pripadnici
atlantske linije. Autori smatraju da nije mogue sa sigurnou zakljuiti da li je prisustvo
atlantske linije posledica prirodne kolonizacije ili introdukcije (Osinov i Bernatchez,
1996).
Na bazi morfolokih i ekolokih razlika, populacije crnomorskog, kaspijskog i
aralskog basena bile su klasifikovane u posebne taksone (Berg, 1948). Populacije
crnomorskog basena su prepoznate kao Salmo trutta labrax, kaspijskog basena kao Salmo
trutta caspius, a populacije aralskog basena kao Salmo trutta oxianus. Posebna
ekofenotipska forma iz jezera Sevan (kaspijski basen) prepoznata je kao posebna podvrsta
Salmo trutta ischchan. Kombinacijom dobijenih rezultata analize alozima i mtDNA,
Bernatchez i Osinov (1995) i Osinov i Bernatchez (1996), smatraju da se ne moe dati
podrka za predhodno iznetu taksonomsku originalnost.
Iako je obraeno vrlo malo uzoraka dunavske linije iz crnomorskog, kaspijskog i
aralskog basena, utvren je visok nivo genetike diferencijacije populacija (Bernatchez i
Osinov, 1995; Osinov i Bernatchez, 1996).
Atlantska filogeografska linija naseljava reke atlantskog basena od Islanda i
Norveke na severu do Iberijskog poluostrva i Atlas planine u Maroku na jugu, takoe
naseljava reke sliva Baltikog i Severnog mora. Na osnovu genetikih rezultata dolo se
do zakljuaka da su populacije atlantske linije prilino homogene i da je nivo genetike
diferencijacije manji u odnosu na mediteranske i dunavske populacije. Utvrene su
znaajne razlike na osnovu analize nuklearne i mtDNA izmeu junih iberijskih i
severnih populacija (Moran i sar., 1995; Antunes i sar., 1999; Bouza i sar., 1999; GarcaMarn i sar., 1999; Weiss i sar., 2000). Utvrene razlike smatraju se posledicom
neistovremenog naseljavanja severnih delova atlantskog basena nakon poslednje
glacijacije. Na bazi diskontinuiteta u uestalosti alela LDH-C1*(=LDH-5*)100 i *90
Ferguson i Fleming (1983) smatraju da su Velika Britanija i Irska rekolonizovane u
postglacijalnom periodu sa dve grupe potone pastrmke. Prva rekolonizaciona grupa
nazvana je ancestralna i odlikovala se prisustvom LDH-C1*100 alela, dok je druga
rekolonizaciona grupa nazvana moderna i odlikovala se prisustvom alela LDH-C*90.
Hamilton i sar. (1989), na osnovu dopunskih analiza, proiruju hipotezu o dve nezavisne
rekolonizacije na preostali deo severo-zapadne Evrope potonom pastrmkom. Filogenija
mtDNA haplotipova i njihov geografski raspored sugeriu da je postglacijalna
rekolonizacija severo-zapadne Evrope bila znatno sloenija; pretpostavlja se da je bilo
20
Uvod
vie od dve rekolonizacije, kako je prethodno predloeno (Hynes i sar., 1996; GarcaMarn i sar., 1999). Atlantska linija je pronaena i u dunavskom slivu, ali nema podataka
da li se radi o prirodnom ili vetakom procesu (Duftner i sar., 2003). Bernatchez i sar.
(1992), smatraju da je mogue da se radi o prirodnoj kolonizaciji, koja se mogla desiti u
periodu interglacijacija. Osim u dunavskom, atlantska linija je pronaena u
mediteranskom basenu, to se smatralo posledicom ovekove aktivnosti (Poteaux i sar.,
1998). Meutim, na Siciliji su nedavno pronaene autohtone populacije atlantske linije
koje najverovatnije vode poreklo iz severne Afrike (usmeno saoptenje Ale Snoj).
21
Uvod
osteoloka, esto su izvor podataka za analizu filogenetskih odnosa pojedinih vrsta riba
(Klykanov, 1975; Shaposhnikova, 1975), bez obzira na nivo klasifikacije. Zadatak takvih
istraivanja je utvrivanje stanja karakteristika i njihove uestalosti u istraivanim
taksonima. Time se utvruje status pojedinih stanja karakteristika u filogenetskom smislu,
tj. jesu li stanja predaka (pleziomorfna) ili izvedena (apomorfna) (Hennig, 1966), a i
rekonstruiu filogenetski odnosi na osnovu ocene stanja tih karakteristika.
Meristike osobine imaju jednostavniju naslednu osnovu u odnosu na
morfometrijske, pa su stoga lake za analizu ribljih populacija. Meristiki karakteri su
diskretni ili brojivi i u meristikim analizama ribljih populacija najee se koriste
karakteri kao to su: broj bica (tvrdih i mekih) u perajima, broj krljuti u bonoj liniji,
broj pilorinih nastavaka, broj kimenih prljenova, broj branhiospina i dr. (Alegria Hernandez, 1985)
22
Uvod
1.2.5.2.1. Alozimi
Do pred kraj prologa veka iroko primenjivana metoda za utvrivanje genetike
raznovrsnosti u molekularnoj genetici bila je elektroforeza alelskih varijanti proteina
(alozima) (Aebersold i sar., 1987; Utter i sar., 1987; Morizot i Schmidt, 1990; May,
1992). Upotreba alozima omoguava utvrivanje alelskih varijanti, to se moe iskoristiti
za ocenjivanje genetike varijabilnosti prirodnih populacija, praenje protoka gena,
reavanje problema hibridizacije, kao i za utvrivanje filogenetskih odnosa (Ferguson i
Masson, 1981; Murphy i sar., 1996). Mada su danas razvijene mnoge savremenije
tehnike, alozimska elektroforeza je jo uvek cenjena i vrlo korisna metoda za utvrivanje
znaajnog nivoa genetike varijabilnosti na populacijama potone pastrmke, pre svega
zbog svoje niske cene u poreenju sa drugim savremenim molekularnim metodama i zbog
relativno lake upotrebe(Ferguson, 1989). Posebna prednost je u tome to postoji veliki
broj dostupnih podataka o alozimskoj varijabilnosti, to omoguava uporeivanje uzoraka
iz populacija koje poseduju znaajnu vremensku i prostornu udaljenost. Osim prednosti
koje ima upotreba alozimskih markera, postoje i odreene mane na koje ukazuju
Gyllensten i Wilson (1987) i Billington i Hebert (1991). Smatra se da su alozimski
markeri pod uticajem selekcije, da zbog degeneracije genetikog koda ne pokazuju realni
nivo polimorfizma, esto se nalaze na vrlo malom kodirajuem delu genoma tako da ih je
vrlo teko detektovati elektroforezom i razliite genetike varijante mogu imati istu
mobilnost na gelu. Lewontin (1974), smatra da je elektroforezom mogue utvrditi samo
treinu svih aminokiselinskih supstitucija, koje u stvari predstavljaju refleksiju
nukleotidnih supstitucija. Iz svega reenog zakljuuje se da na osnovu rezultata
elektroforetske analize nije uvek pouzdano donositi zakljuke o genotipskoj
varijabilnosti. U dananje vreme ovoj metodi pripisuju jo jednu veliku zamerku, a to je
rtvovanje ivotinja koje je neophodno da bi se dolo do vee koliine tkiva koju ova
metoda zahteva.
23
Uvod
24
Uvod
1.2.5.2.2.1.1. Mikrosateliti
Mikrosateliti su otkriveni kod svih do sada prouavanih eukariota, kod kojih su
ravnomerno rasporeeni po celom genomu, ali su uglavnom ogranieni na euhromatin.
Pronaeni su kako u kodirajuim tako i u nekodirajuim regionima, manji broj ih se
nalazi na telomernim i centromernim regijama (Tautz i sar., 1986; Tautz, 1993).
Uestalost pojave mikrosatelita je najmanje jednom na svakih 10 kb. Pronaeni su takoe
kod pojedinih eubakterija i prokariota, ali sa manjom uestalou (Tautz, 1989).
Mikrosateliti predstavljaju jednostavne nukleotidne nizove koji se sastoje iz ponovljenih
osnovnih motiva, dugih od 1 6 baznih parova (bp), koji se unutar lokusa ponavljaju od 5
pa do preko 100 puta (Stallings i sar., 1991). Mikrosateliti kimenjaka najee se javljaju
kao di-, tri- , i tetranukleotidne replike, sastavljene iz svih moguih kombinacija
nukleotida u osnovnom motivu (Tautz, 1989). Najee ponavljajui motiv je CA, a posle
njega AG, AAC, AAG i AAT (Glenn, 1995). Mikrosateliti sadre veliki broj replika
osnovnog motiva i veoma su podloni mutacijama (10-3 do 10-4 po lokusu u generaciji
kod dinukleotidnih mikrosatelita) koje se javljaju zbog greaka pri replikaciji DNA, to se
izuzetno odraava u duinskom polimorfizmu (Amos i sar., 1993). Stopa mutacija
mikrosatelita razlikuje se izmeu replika sa razliitim osnovnim motivom, izmeu
razliitih lokusa sa replikama istog motiva i izmeu alela istog lokusa (Schltterer, 1998).
Stopa polimorfizma je uglavnom srazmerna broju replika osnovnog motiva. Kod
25
Uvod
korienja mikrosatelita kao markera kod kojih razlikujemo alele na osnovu razliitog
broja ponavljanja osnovnog motiva moe se javiti problem u neslaganju duine
mikrosatelitskih fragmenata i njihovog nukleotidnog redosleda. Angeres i sar. (1995) su
analizirali nukleotidni redosled mikrosatelitnih alela jednoga lokusa kod dvanaest
salmonidnih vrsta i zakljuili su da pojedini mikrosatelitni aleli kod razliitih vrsta mogu
imati jednaku duinu, ali razliit nukleotidni redosled. Autori upozoravaju da se zakljuci
o evolutivnim odnosima ne mogu izvoditi iskljuivo na osnovu duine mikrosatelitnih
alela, jer razliite mutacije vrlo lako mogu rezultirati jednakom konanom duinom alela.
Za mikrosatelite se jo uvek ne zna nain nastanka, odnosno njihova evolucija, zbog ega
se i ne mogu koristiti kao filogenetski markeri.
Mikrosateliti su veoma informativni kao genetiki markeri iz vie razloga: zbog
visoke stope genetike varijabilnosti, jednostavnog kodominantnog mendelistikog
nasleivanja, sauvanosti mikrosatelitskih lokusa meu srodnim vrstama. Spadaju u grupu
neutralnih genetikih markera jer nisu podloni jakom selekcionom pritisku (Queller i sar.,
1993; Dowling i sar., 1996; Goldstein i Pollock, 1997). Jednostavno se mogu izolovati iz
materijala koji ne zahteva rtvovanje ivotinja (krvi, dlake, slina, izmeta (Constable i sar.,
1995), krljuti (Miller i Kapuscinski, 1996), i arheolokog materijala (Bruford i sar., 1998).
Pri analizama moemo upotrebiti veliki broj lokusa, a jednostavna optimizacija lanane
reakcije polimeraze omoguava amplifikaciju vie razliitih lokusa u jednoj reakciji (Jug,
2002).
Zbog svih predhodno nabrojanih osobina mikrosateliti imaju veoma iroku
upotrebu. Koriste se za utvrivanje genetike varijabilnosti i populacione strukture u
okviru mnogo kraih geografskih udaljenosti nego to je to ranije bilo mogue (Estoup i
sar., 1998). Koriste se pri utvrivanju porekla i srodnikih odnosa izmeu jedinki
(Marshall i sar., 1998; Queller i sar., 1993; Hansen i sar., 1997; Fontaine i Dodson, 1999),
koriste ih pri kartiranju gena (Weissenbach i sar., 1992; Hearne i sar., 1992), kao i pri
proceni efektivne veliine populacije (Edwards i sar., 1992). Veoma znaajnu ulogu
mikrosateliti imaju pri analizama muzejskog materijala (krljuti), jer na taj nain moemo
dobiti podatke o genetikoj strukturi populacije za dugi vremenski period (Nielsen i sar.,
1997; 1999a; b; Miller i Kapuscinski, 1997; Tessier i Bernatchez, 1999).
Mikrosatelitski markeri poinju intezivnije da se koriste u izuavanju salmonidnih
populacija poetkom devedesetih godina prologa veka. Ovi markeri su se pokazali kao
znatno uspeniji u odnosu na alozimske. Alozimski markeri se mogu koristiti za
razlikovanje populacija izmeu basena (dunavski, mediteranski, atlantski), dok se
26
Uvod
27
Uvod
28
Uvod
Molekuli mtDNA su prisutni sa oko 1000 kopija u somatskim elijama, zrele jajne
elije poseduju oko milion a spermatozoidi oko 50 kopija. Mitohondrijska DNA se kod
najveeg broja ivotinja nasleuje po materinskoj liniji, mada ima nekih primera
biparentalnog nasleivanja kod beskimenjaka (Hoeh i sar., 1991). Kod materinskog
nasleivanja samo enski deo populacije prenosi mtDNA na potomstvo, zbog toga to pri
oploenju jajne elije obino dolazi do razgradnje mitohondrija prispelih iz spermatozoida
(Harrison, 1989). Zbog haploidnosti mitohondrijalnog genoma efektivna veliina
populacije za mtDNA iznosi samo jednu etvrtinu jedarne DNA (Birky, 1983). Poto se
mtDNA jednostrano nasleuje, izmeu molekula obino ne dolazi do rekombinacija, kao
to je sluaj sa jedarnom DNA, to znai da se mtDNA nepromenjena prenosi sa roditelja
na potomstvo. Pojava kada potomstvo u svim svojim elijama ima isti haplotip mtDNA
naziva se homoplazmija, meutim moe se dogoditi da u jednom organizmu postoje
razliiti haplotipovi mtDNA, gde se ovakva pojava naziva heteroplazmija, vrlo je retka i
prisutna samo u nekim generacijama (Avise, 2000). Heteroplazmija do sada nije zabeleena
kod salmonida, ali kod nekih drugih vrsta riba jeste, i javlja se kao posledica biparentalnog
nasleivanja ili pak mutacionih promena na delu molekula mtDNA u organizmu
(Lightowlers i sar., 1997).
29
Uvod
30
Uvod
31
Uvod
Pored svih pozitivnih osobina koje poseduje mtDNA kao genetiki marker,
postoje i neke negativne. Maternalno nasleivanje mtDNA onemoguava korienje ovog
markera pri razlikovanju hibrida u populacijama gde je eventualno dolo do introdukcije.
U tim sluajevima se preporuuje korienje informativnijih markera preko kojih
moemo pratiti i maternalno i paternalno nasleivanje. Takoe, pri analizama vrlo
srodnih jedinki, upotreba mtDNA kao genetikog markera se ne preporuuje zbog njene
premale varijabilnosti za tu vrstu studija.
Kako se mtDNA nasleuje kao jedan gen, treba biti posebno oprezan pri
donoenju zakljuaka na nivou itave populacije, jer se evolucija pojedinanog gena
moe razlikovati od evolutivnog proseka celog genoma. Upotreba iskljuivo mtDNA kao
genetskog markera nosi sa sobom rizik od netane rekonstrukcije filogenije (Zhang i
Hewitt, 2003).
Veina autora se slae da je za utvrivanje to tanijih filogenetskih odnosa
izmeu taksona potrebno ukljuiti to vie genetikih sistema, i dobijene rezultate
uporediti sa rezultatima morfolokih analiza.
32
Uvod
Uvod
34
Uvod
35
Uvod
Uvod
37
Uvod
38
Materijal i metode
2. MATERIJAL I METODE
2.1. MATERIJAL
2.1.1. PRIKUPLJANJE I UVANJE UZORAKA
Uzorci potone pastrmke koji su analizirani u ovom radu sakupljeni su u periodu
od juna 1997. do juna 2004. godine. Sakupljanje materijala je vreno na 35 lokaliteta u
okviru sva tri morska sliva (crnomorskog, egejskog i jadranskog) na teritoriji Republike
Srbije. Najvei broj analiziranih jedinki prikupljen je elektroribolovom koji se obavljao
uz pomo elektroagregata marke Suzuki Bosch, snage 2100W, izlazne struje 220V DC,
frekvencije 40 Hz i jaine u zavisnosti od osobina vode, maksimalno 8.5 A. Manji broj
analiziranih jedinki prikupljen je udiarskim alatom koji se koristi u rekreativnom
ribolovu.
Nakon izlova, jedinkama je odseen deo analnog peraja (oko 0.5 cm2) koje ima
mogunost regeneracije, i sauvan u 96% etanolu, a jedinke su vraene nazad u vodu.
Svaki uzorak je sauvan u posebnoj epruveti sa obeleenim rednim brojem i nazivom
lokaliteta. Deli uzorkovanog peraja dalje je korien za molekularne analize.
Slika 17. Nain uzimanja uzoraka (odsecanje analnog peraja i odlaganje u etanol).
39
Materijal i metode
Ukupno
N
3
3
6
7
3
3
3
3
3
3
2
6
7
3
3
3
2
3
4
2
1
3
3
79
6
2
8
2
7
5
7
7
44
11
13
3
3
30
153
40
Materijal i metode
Slika 18. Prostorni raspored analiziranih lokaliteta na teritoriji Republike Srbije (broj i
naziv lokaliteta iz tabele odgovara broju i poloaju lokaliteta na karti).
41
Materijal i metode
2.1.3. HEMIKALIJE
agaroza
amonijum acetat
borna kiselina
EDTA
etidijum bromid
etanol 96% i 70%
fenol
formamid
hlorovodonina kiselina
izoamil-alkohol
kalijum acetat
kalijum hlorid
siretna kiselina
magnezijum sulfat
mineralno ulje
natrijum acetat
natrijum hlorid
Na-dodecil sulfat (SDS)
natrijum hidroksid
magnezijum hlorid
Tris-baza
TSR
voda za elijske kulture
FMC
Sigma
Sigma
Sigma
Sigma
Merck
Fluka
Applied Biosystems
Merck
Merck - Alkaloid
Kemika
Kemika
Merck- Alkaloid
Merck
Sigma
Merck - Alkaloid
Merck
Merck
Merck
Merck - Alkaloid
GATC
Applied Biosystems
Sigma
Perkin Elmer
Perkin Elmer
Genomed
2.1.3.2. Enzimi
endonukleaze AluI
rekombinantna Taq DNA-polimeraza
proteinaza-K
RNA-za
Fermentas
Fermentas
Life Technologies
Fermentas
42
Materijal i metode
Nukleotidni redosled
CACCCTTAACTCCCAAAGCTAAG
GTGTTATGCTTTAGTTAAGC
Referenca
Snoj i sar., 2000.
Bernatchez i
Danzmann, 1993.
2.1.3.4. Markeri
100 bp
Fermentas
1 kbp
Fermentas
2.1.3.5. Puferi
amplifikacijski pufer
50 x pufer TAE
10 x pufer TBE
pufer TEN
Perkin Elmer
Perkin Elmer
Gilson
Eppendorf
Eppendorf
BioRad
Tehtnica, Eppendorf
Pharmacia
Retsch
Tehtnica
MJ Research
Camag
43
Materijal i metode
2.2. METODE
2.2.1. IZOLACIJA DNA
DNA je izolovana iz tkiva analnog peraja na tri razliita naina. Bez obzira na koji
je nain vrena izolacija, prvo je odseeni deo tkiva analnog peraja (oko 2mm2), opran
destilovanom vodom od alkohola i nakon toga je prenet u posudicu (eppendorf) od 1,5
ml.
44
Materijal i metode
45
Materijal i metode
vode (Sigma)
10 x pufera PCR (Fermentas)
2 mM smee dNTP (dATP, dCTP, dGTP, dTTP)
25 mM MgCl2
10 pmol/l poetnog oligonukleotida (28Riba)
10 pmol/l poetnog oligonukleotida (cytR)
Taq DNA polimeraze 5 U/l
uzorake DNA
20 l
46
Materijal i metode
Denaturacija
28RCYTR
95oC, 45 s
Vezivanje poetnih
oligonukleotida
52oC, 45 s
Sinteza komplementarnog
lanca
72oC, 45 s
Broj ciklusa
32
47
Materijal i metode
48
Materijal i metode
izolacije
fragmenata
iz
agaroznog
gela
moe
se
proveriti
spektrofotometrijski ili na 1,5 % agaroznom gelu u 0,5 x TBE puferu. (Priprema gela je
ista kao u poglavlju 2.2.2.).
Slika 21. Provera izolacije DNA fragmenata iz agaroznog gela
Nukleotidni redosled
CACCCTTAACTCCCAAAGCTAAG
TCCGTCTTTACCCACCAACT
AAGCCGGGCGTTCTCTTATATGC
Referenca
Snoj i sar., 2000.
Snoj i sar., 2002.
Snoj i sar., 2002.
49
Materijal i metode
Pripremljena sekvencijska reakcija stavljena je u PCR mainu MJ Research PTC 100 (mikroprocesorsko vodeni termostat) na temperaturno - vremenski program HEL2
koji poinje denaturacijskim korakom (5 min na 96oC).
Tabela 6. Opis temperaturno vremenskog programa HEL2
Ime programa
Denaturacija
HEL2
95oC, 30 s
Vezivanje poetnih
oligonukleotida
50oC, 15 s
Sinteza komplementarnog
lanca
60oC, 4 min
Broj ciklusa
35
Materijal i metode
51
Materijal i metode
52
Rezultati
3. REZULTATI
3.1. ANALIZA KONTROLNOG REGIONA mtDNA UPOTREBOM RFLP
TEHNIKE (Restriction Fragment Length Polimorphism)
Upotrebom RFLP tehnike odnosno restrikcionog enzima Alu I dobijeni su
preliminarni rezultati zastupljenosti osnovnih mtDNA linija potone pastrmke unutar sva
tri sliva na teritoriji Srbije. Restrikcioni enzim Alu I rezao je kontrolni region mtDNA
duine oko 1100 bp na fragmente karakteristine duine za dva razliita restrikciona
profila.
Kontrolni region uzoraka iz crnomorskog sliva restrikcioni enzim Alu I je rezao na
etiri mesta formirajui pet fragmenata duine 464, 311, 252, 37 i 4 bp (Slika 22a), dok je
uzorke iz egejskog i jadranskog sliva isti enzim rezao na tri mesta formirajui etiri
fragmenta duine 563, 464, 37 i 4 bp (Slika 22b). Fragmenti od 4 i 37 bp vrlo su kratki i
ne mogu se uoiti na gelu.
b)
53
Rezultati
3.2.
uzorku iz sva tri sliva, pri emu je iz crnomorskg sliva sekvencioniran 61 uzorak, a iz
egejskog i jadranskog sliva po 20 uzoraka (Tabela 1). Sekvencioniranjem je utvren
nukleotidni redosled kontrolnog regiona mtDNA u duini od 561 bp, poevi od 5 kraja
do mesta poli T koje se nalazi oko polovine ukupne duine kontrolnog regiona.
Na osnovu dobijenih rezultata sekvencioniranja identifikovano je ukupno 18
polimorfnih mesta (Tabela 10) na osnovu kojih je u sva tri sliva pronaeno 15 razliitih
haplotipova koji pripadaju Da dunavskoj (8 haplotipova), junoj1 (6 haplotipova) i At
atlantskoj filogenetskoj grupi (1 haplotip) (Tabela 9). Od 15 pronaenih haplotipova 6
je novih za nauku, i to 3 dunavska i 3 jadranska (dva iz egejskog i jedan iz jadranskog
sliva). Haplotip Ad+Prz koji je pronaen u Prizrenskoj Bistrici kao autohtoni, zajedno sa
naknadno analiziranim haplotipovima iz Rijeke Crnojevia Ad+RC i iz Neretve Ad+N
formira potpuno novu, do sada nepoznatu liniju, kojoj je dodeljena oznaka Ad+ i ime
farioides. Novo otkrivena linija je geografski ograniena na reke jadranskog sliva jugozapadnog Balkana.
Pronaeni dunavski (Da) i juni jadransko egejski (Ad i Ad+) haplotipovi
pokazuju izrazitu geografsku pravilnost u distribuciji. Da haplotipovi bili su striktno
ogranieni na dunavski sliv, dok su juni haplotipovi bili dominantni u jadransko
egejskom slivu, sa izuzetkom pet jedinki koje su bile pronaene u dunavskom slivu (4
jedinke su pronaene u Jermi i 1 u Vrli, i sve pripadaju haplotipu ADcs1). Genetika
segmentacija primeena je i izmeu junih haplotipova. Prostorni raspored 5 od 6
pronaenih haplotipova bio je striktno povezan sa jadranskim ili egejskim slivom, samo
je haplotip Ad+Prz bio ravnomerno rasporeen u oba sliva (Tabela 9).
Radi kompletnije i preciznije slike o evolutivnoj istoriji 15 pronaenih
haplotipova potone pastrmke na teritoriji Srbije, analizirano je jo 8 haplotipova, pre
svega iz linija koje nisu autohtone za istraivano podruje (At, Ma, Me po dva haplotipa
za svaku liniju), kao i dva Ad+ haplotipa (Crna Gora i Bosna i Hercegovina) (Tabela 13).
Juna grupa obuhvata haplotipove 1Ad i novo opisane 2Ad+ linije (1, 2 pronaeni su na analiziranom
podruju), kao i haplotpove koji su naknadno ukljueni u analizu iz Ma i Me linije.
54
Rezultati
Tabela 9. Prikaz pronaenih haplotipova po lokalitetima i njihova frekvenca. Haplotipovi koji su obeleeni zvezdicom (*) pronaeni su po prvi put, dok haplotip
obeleen znakom + pripada novo opisanoj Ad+ (farioides) liniji.
Dunavski haplotipovi
Juni haplotipovi (Ad i Ad+)
Atlantski haplotip
Lokaliteti
N
Da1 Da2 Da23b Da*Vl Da*D Da22 Da-s6 Da*Vr ADcs1 ADcs11 Ad*Pe Ad*Ti Ad*Bo Ad+Prz
Dunavski sliv
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
17.
18.
19.
20.
21.
22.
23.
Zmajevac
Gradac
Godljevaa
Crni potok
Trudovaka reka
Bresnika reka
Brevina
Joanica
Prolomska reka
Reka
Vratna
Resava
Buk
Radovanjska reka
Golema reka
Studenaka reka
Dojkinaka reka
Rosomaka reka
Jerma
Vlasina
Depska reka
Vrla
Jelanika reka
% hapl. unutar sliva
Egejski sliv
24.
25.
26.
27.
28.
29.
30.
31.
Dejanov potok
Lisina
Boica
Ljubata
Brankovaka reka
Tripunica
Tisova reka
erenaka reka
% hapl. unutar sliva
Jadranski sliv
32.
33.
34.
35.
61
3
3
2
2
3
3
3
3
3
3
2
2
2
3
3
3
2
3
4
2
1
3
3
1
1
2
2
3
3
3
3
3
2
2
1
2
2
1
1
2
1
1
3
3
2
2
1
4
2
1
3
59
20
3
2
2
2
2
5
2
2
1
1
2
1
2
2
1
5
2
2
20
15
20
6
8
3
3
Prizrenska Bistrica
Peka Bistrica
Bogska reka
Alagina reka
% hapl. unutar sliva
Ukupno
101
% hapl. u ukupnom uzorku
At1
35
25
36
35
5
5
5
5
2
2
1
1
1
1
3
3
2
2
8
8
4
3
3
50
10
10
4
20
4
4
4
4
7
7
30
11
11
2
2
55
Rezultati
5, 8%
Da1
Da2
Da*Vr
Da*Vl
Da*D
5, 8%
3, 5%
1, 2%
1, 2%
1, 2%
2, 3%
2, 3%
5, 8%
36, 59%
Da22
Da-s6
Da23b
ADcs1
At1
56
Rezultati
1, 5%
3, 15%
7, 35%
5, 25%
4, 20%
ADcs1
Ad+Prz
Ad*Ti
Ad*Bo
At1
Ad*Pe
6, 30%
57
Rezultati
haplotip Ad+Prz koji je pronaen u Prizrenskoj Bistrici sa 30% u ukupnom broju svih
haplotipova na slivnom podruju.
2, 2%
Da23b
4, 4%
Da*Vl
Da*D
7, 7%
4, 4%
36, 35%
Da22
Da-s6
Da*Vr
11, 11%
ADcs1
10, 10%
5, 5%
8, 8%
5, 5%
2, 2%
3, 3%
2, 2%
1, 1%
ADcs11
Ad+Prz
Ad*Ti
Ad*Bo
Ad*Pe
At1
1, 1%
58
Rezultati
Slika 27. Sekvenca 5 kraja kontrolnog regiona mtDNA (561bp), najbrojnijeg haplotipa Da1 na analiziranom podruju. Broj i zvezdica (*) iznad
sekvence pokazuju varijabilna nukleotidna mesta izmeu analiziranih haplotipova (pronaenih i naknadno ukljuenih) iz svih pet glavnih linija
(Bernatchez i sar., 1992).
2
26
61
80
*
*
*
*
ACTTTTCAGC TATGTACAAT AACAAATGTT GTACCTTGCT AACCCAATGT TATACTACAT CTATGTATAA TATTACATAT
80
113
126
146
*
*
*
TATGTATTTA CCCATATATA TAATATAGCA TG-TGAGTAG TACATCATAT GTATTATCAA CATTAGTGAA TTTAACCCCT
160
178
196
228
235 236
*
*
*
**
CATACATCAG CACTAACTCA AGGTTTACAT AAAGCAAAAC ACGTGATAAT AACCAACTAA GTTGTCTTAA CCCGAGTAAT
240
243
262 263
*
**
TGTTATATCA ATAAAACTCC AGCTAACACG GGCTCCGTCT TTACCCACCA ACTTTCAGCA TCAGTCCTGC TTAATGTAGT
320
400
403
*
AATTATTCCT GGCATTTGGT TCCTATATCA AGGGCTATCC TTAAGAAACC ACCCCCTGAA AGCCGAATGT AAAGCATCTG
480
484
530
542 543 548
*
*
**
*
GTTAATGGTG TCAATCTTAT TGCCCGTTAC CCACCAAGCC GGGCGTTCTC TTATATGCAT AACGTTCTCT TTTTTTTTTT
560
TT
59
Rezultati
2
T
C
C
C
C
C
C
C
C
-
Polimorfna mesta
26 61 80 126 146 228 235 236 262 387 389 390 403 530 542 543 548
T C T C
G
T
A
T
G
G
C
T
T
T
G
G
C
A G
G
T
C
C
A
C
T
A A
G
G
T
C
C
A
C
T
A G
G
T
C
A
C
T
A T
G
T
C
C
A
C
T
A G
T
C
C
A
C
T
G G
T
C
C
A
C
T
A T G
T
C
C
A G
G
T
C
C C
T
C
C
C - C
C
T
C
C
C C
A
T
C
C
C C
T
C
C
C
C
T
C
C
C T
T
T
C
C
-
60
Rezultati
Srodniki
odnosi
izmeu
pojedinih
1,05
1,05
1,23
1,23
1,23
1,05
1,23
ADcs1
10
11
11
10
9
9
7
6
5
0,88
1,05
1,05
1,05
0,70
1,05
parova
0,18
0,18
0,18
0,18
0,35
11
12
12
11
10
10
8
7
6
1
11
12
12
11
10
10
8
7
6
1
2
9
10
10
9
8
8
6
7
6
1
2
2
0,35
0,35
0,35
0,53
haplotipova
0,35
0,35
0,53
0,35
0,53
odreivani
Ad+Prz
0,53
1,23
1,23
1,41
1,41
1,05
1,23
1,41
10
11
9
10
9
9
7
6
Ad*Bo
0,88
1,05
1,59
1,59
1,76
1,76
1,41
1,59
1,76
At1
6
7
7
6
5
6
3
Ad*Ti
0,18
0,70
0,88
1,59
1,59
1,76
1,76
1,41
1,59
1,76
5
6
6
5
4
5
Ad*Pe
0,18
0,35
0,88
1,05
1,76
1,76
1,94
1,94
1,59
1,76
1,94
2
3
3
2
1
ADcs11
1
2
2
1
Da*Vr
0,35
0,35
0,53
1,05
1,23
1,59
1,94
2,12
2,12
1,76
1,94
2,12
1
2
2
Da*D
0,35
0,35
0,35
0,53
1,05
1,23
1,94
1,94
2,12
2,12
1,76
1,94
2,12
Da1
1
2
Da22
Da-s6
0,18
0,18
0,18
0,18
0,35
0,88
1,05
1,76
1,76
1,94
1,94
1,59
1,76
1,94
Da*Vl
Da2
Da23b
Da*Vl
Da22
Da1
Da-s6
Da*D
Da*Vr
At1
ADcs1
ADcs11
Ad*Pe
Ad*Ti
Ad*Bo
Ad+Prz
Da23b
Haplotipovi
Da2
10
11
11
10
9
9
7
6
4
1
2
2
2
11
12
12
11
10
10
8
7
6
2
3
3
3
3
0,53
su
SD
Sume
kvadrata
165.779
Komponente
varijanse
2.80100
Procenat
varijabilnosti
68.80
0.72965 (sc)
32
93.851
0.92690
22.77
0.91565 (st)
66
100
22.667
282.297
0.34343
4.07133
8.43
100
0.68798 (ct)
df
- statistika
Rezultati
62
Rezultati
63
Rezultati
Tabela 13. Polimorfna mesta na 5 kraju kontrolnog regiona mtDNA za 15 pronaenih haplotipova na teritoriji Srbije (levo ravnanje), kojima je
prikljueno jo 8 haplotipova iz atlantske, farioides, marmoratus i mediteranske linije (desno ravnanje). Polimorfna mesta analiziranih haplotipova
predstavljena su u odnosu na haplotip At1, gde crtica ( - ) predstavlja ponovljeni nukleotid iz pvog reda a kosa crta ( / ) deleciju. Nomenklatura
haplotipova data je po (Bernatchez, 2001), (Duftner i sar., 2003), (Cortey i sar., 2004) i (Razpet i sar., u tampi).
Imena haplotipova
u Srbiji
van Srbije
At1
At11a
At10
Da2
Da23b
Da*Vl
Da22
Da1
Da-s6
Da*D
Da*Vr
ADcs1
ADcs11
Ad*Pe
Ad*Ti
Ad*Bo
Ad+Prz
Ad+N
Ad+RC
MAcs1
Ma-s2
MEcs1
MEcs7
64
2
T
C
C
C
C
C
C
C
C
-
26
T
A
A
A
A
A
G
A
A
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
61
C
T
-
80 113 126
T /
C
/
/
/
/
/
/
/
/
/
/
/
C /
/
/
/
/
T
/
T
/
T
- A
- A
/
/
-
Polimorfna mesta
146 178 196 228 235 236 243 262 263 387 389
G T A T A T T G C G C
C
A
G G
T
A
G G
T
G G
T
T G
T
G
T
G
T
G
T
G
G
T
C
T
C
T
C
A T
C
T
C
T
T
T
C T
T
T
T
A
T
A T
T
A
C
T
A
C
T
390
T
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
542
G
A
A
A
A
A
A
-
543 548
G C
C T
C T
C T
C T
C T
C T
C
C
-
Rezultati
65
Rezultati
66
Rezultati
67
Rezultati
Stablo koje je dobijeno metodom "MP Majority rule consensus 50%", vrlo je
slino stablima koja su dobijena korienjem metoda MP i NJ u programu "PAUP 4"
zato je upotrebljeno jedno stablo da se prikau rezultati za sve tri metode. Dobijeno
stablo, prema poloaju haplotipova i rasporedu u filogenetske linije, veoma je slino
stablu dobijenom u programu "MEGA 3" metodom "Neighbour-Joining" (NJ) (slika 29).
Konsensus stablo takoe prikazuje jasno razdvajanje dve glavne klade (Da i At klada plus
juno evropska klada). Ukljuivanjem dva "outgroup" haplotipa Salmo ohridanus i
Salmo salar omogueno je utvrivanje statistike znaajnosti prvog grananja koje se
pokazalo kao vrlo znaajno. Unutranja topologija u okviru dve glavne grupe (Da i At
plus juno evropska) bila je podrana neto niim "bootstrap" vrednostima, to
posebno vai za haplotip Ad*Bo, koji na ovom stablu zauzima ancestralni poloaj u
odnosu na ostale juno evropske haplotipove, ali bez podrke za MP analizu i sa
niskom "bootstrap"vrednou za NJ analizu. Grupisanje u okviru juno evropske
grupe haplotipova u Ad, Ma i Me i dopunsku Ad+ grupu (Ad+Prz, Ad+N i Ad+RC) isto
je kao i pri NJ analizi u programu "MEGA 3" (Slika, 29). Haplotipovi Da*D i Da*Vr
zauzimaju na svim filogenetskim stablima bazalni poloaj unutar Da linije, to je i
statistiki podrano.
68
Rezultati
na
teritoriji
Srbije
odgovara
njihovoj
69
Rezultati
70
Diskusija
4. DISKUSIJA
Bernatchez i sar. (1992) smatraju da, bez obzira na izuzetno veliki broj rezultata
koji su dobijeni u poslednjih 20 godina, za rasvetljavanje filogeografske strukture
populacija potone pastrmke jo uvek nedostaju rezultati sa vrlo znaajnih geografskih
podruja kao to su severna Afrika i istona Evropa. Kottelat (1997) naglaava da je
veliki problem u reavanju taksonomije pastrmskih populacija Balkanskog poluostrva
upravo nedostatak informacija sa podruja republika bive Jugoslavije. Poseban znaaj u
izuavanju balkanskih pastrmskih populacija je upravo u tome to se smatra da je
Balkansko poluostrvo, pored Apeninskog i Iberijskog, bilo refugijalni centar, a samim tim
i centar diverziteta za vreme glacijacija (Hewitt, 1996; 1999).
U najblioj okolini Srbije samo na teritoriji Austrije, Slovenije i Grke utvrena je
genetika diferenciranost pastrmskh populacija (Duftner i sar., 2003; Snoj i sar., 2004;
Apostolidis i sar., 1996; 1996a; 1997). Poslednjih godina sakupljan je materijal iz Bosne i
Hercegovine, Hrvatske i Crne Gore, ali rezultati jo nisu objavljeni.
Ako se uporede rezultati istraivanja sa pomenutih teritorija, kao i rezultati koje je
objavio Bernatchez (1992), sa rezultatima koji su dobijeni na teritoriji Srbije (101
jedinka/15 haplotipova), uoava se vrlo slian diverzitet haplotipova. Bernatchez i sar.
(1992) pronali su, analizom 310 bp kontrolnog regiona mtDNA, 12 haplotipova na 154
analizirane jedinke iz 24 populacije zapadne Evrope. Duftner i sar. (2003) su na teritoriji
Austrije opisali 16 haplotipova iz uzorka od 123 jedinke sa 20 lokaliteta (crnomorski
sliv), analizom kompletnog kontrolnog regiona mtDNA, gde 7 haplotipova pripada
atlantskoj liniji, iju autohtonost na analiziranom podruju tek treba utvrditi. Apostolidis i
sar. (1997) su za teritoriju Grke opisali 10 haplotipova iz uzorka od 76 jedinki sa 12
lokaliteta (egejski, jonski i jadranski sliv), analizom kontrolnog regiona mtDNA u duini
od 310 bp. Snoj i sar. (2004) su na teritoriji Slovenije opisali 12 haplotipova iz uzorka od
364 jedinke sa 20 lokaliteta (crnomorski i jadranski sliv), analizom kontrolnog regiona
mtDNA u duini od 420 bp.
Analizom celog kontrolnog regiona mtDNA i obradom veeg broja uzoraka sa
lokaliteta na teritoriji Kosova i Metohije (razvoe slivova), verovatno bi genetiki
diverzitet pastrmskih populacija na teritoriji Srbije bio vei od prikazanog.
71
Diskusija
4.1.
72
Diskusija
(Reka, Vratna i Radovanjska reka - pritoka Timoka), a to su reke koje imaju neposrednu
komunikaciju sa Dunavom. Isti haplotip pronaen je u Austriji na lokalitetu Lohnbach
koji je takoe u neposrednoj vezi sa Dunavom.
Od haplotipova koji su pronaeni nizvodno i istonije (basen Crnog mora,
Kaspijskog i Aralskog jezera), sa visokom uestalou se takoe javlja haplotip Da1,
neto ree Da2, i Da-s6 (jedini Da haplotip koji na poziciji 26 poseduje tranziciju AG).
Da-s6 haplotip je veoma redak i pripada posebnim ekofenotipskim formama iz jezera
Sevan (Jermenija, sliv - Kaspijskog jezera), prepoznatim kao posebna vrsta Salmo
ischchan. Behnke (1986) je dao hipotezu da se radi o pastrmci izvedenoj od primitivnog
pretka svih ostalih populacija potone pastrmke. Bernatchez i Osinov (1995) i Osinov i
Bernatchez (1996) odbacuju pomenutu hipotezu na osnovu kombinovanih rezultata
alozima i mitohondrijalnih markera i zakljuuju da Salmo ischchan predstavlja
morfoloki i ekoloki jedinstvenu formu pastrmki koja se razvila relativno skoro i pripada
istoj evolutivnoj liniji kao i ostale pastrmke iz basena Crnog mora, Kaspijskog i Aralskog
jezera. Pronalazak haplotipa Da-s6 na teritoriji Srbije u Studenakoj reci (sliv Visoice i
Niave) predstavlja prvi nalaz ovog haplotipa van jezera Sevan, to daje potvrdu gore
izneenim tvrdnjama Bernatchez i Osinov (1995) i Osinov i Bernatchez (1996).
Slika 32. Pastrmke kod kojih je pronaen haplotip Da-s6.
73
Diskusija
Diskusija
Diskusija
drugi je iz Rijeke Crnojevia (Ad+RC) (usmeno saoptenje Ale Snoj). Haplotip AdN
jedino poseduje C na poziciji 243, dok AdRC haplotip poseduje T na poziciji 26, i to su
dva mesta po kojima se ovi haplotipovi razlikuju od Ad+Prz.
Zbog specifinih sinapomorfizama (pozicije 126 i 262), haplotipovi Ad+Prz,
Ad+N i Ad+RC formiraju posebnu grupu sa visokom bootstrap potporom za sve tri
uraene analize. Ova grupa je pozicionirana kao sestrinska u odnosu na ostale jadranske,
mediteranske i marmoratus haplotipove (Slika 30), pa je zato i oznaena kao nova Ad+
linija. Poto sva tri haplotipa naseljavaju reke u slivu junog Jadrana, i jasno se grupiu
kao i ostale linije sa visokim bootstrap vrednostima, moda moemo predpostaviti da se
radi o Salmo fariodes (Karaman, 1937), za koju je opisano da naseljava pritoke srednjeg i
junog Jadrana (Krka, Neretva, Beli Drim, pritoke Ohridskog i Skadarskog jezera).
Meutim, nalaz istog haplotipa u slivu Vardara (Tripunica) izvan je areala u kome je
opisan, to je najverovatnije posledica poribljavanja.
U Ponto Egejskoj zoni na teritoriji Srbije analizirali smo izvorine delove reka u
slivovima Vardara i Strume.
Na analiziranim lokalitetima pronaeno je pet haplotipa, od kojih su dva nova
(Ad*Ti i Ad*Bo), a tri su ve bila poznata (ADcs1, Ad+Prz i At1) (Slika 1; Tabela 10).
Na lokalitetima Tisova i erenaka reka (br. lok. 30 i 31/desne pritoka Vardara),
pronaen je novi haplotip Ad*Ti koji se za samo jednu transverziju (GC) na poziciji
543 razlikuje od haplotipa ADcs1. U okviru iste zone, samo u levoj pritoci Vardara
(Tripunica) ponaen je haplotip Ad+Prz koji je predhodno pomenut u jadranskom slivu.
Prisustvo Ad+Prz haplotipa u Tripunici najverovatnije je posledica poribljavanja koje je
izvedeno 1978. godine putem mlai koja je nabavljena u Konjicu (Neretva jadranski
sliv). Poto je haplotip Ad+Prz pronaen u slivu Belog Drima i Skadarskog jezera,
najverovatnije ga ima i u slivu Neretve, odakle je prenet u Tripunicu, u kojoj do tada
pastrmke nije bilo (usmeno saoptenje Ribolovako drutvo Trgovite).
U slivu Strume identifikovan je ranije pomenuti haplotip ADcs1 (Cortey i sar.,
2004) ili AD-s1 po Bernatchezu (2001), koji je ve pronaen na vie lokaliteta u okviru
egejskog sliva u Grkoj (Apostolidis i sar., 1997), ali i u slivovima Jadranskog, Jonskog i
Sredozemnog mora, kao i Atlantskog okeana (Bernatchez, 2001). Za ADcs1 haplotip
moe se rei da je jedan od Ad haplotipa sa najirim rasprostranjenjem, to se moe
objasniti njegovom izuzetnom sposobnou kolonizacije. U istom slivu pronaen je novi
haplotip Ad*Bo koji na pozicijama 26 ima timin kao i haplotipovi ADcs16 i Ad+RC, ali
se od prvog razlikuje po citozinu na poziciji 262, a od drugog po citozinu na poziciji 126 i
76
Diskusija
262. Poto se u istom slivu nalaze haplotipovi ADcs1 i Ad*Bo, najverovatnije su oni
naseljeni tokom dve nezavisne kolonizacije, pri emu je haplotip Ad*Bo verovatno
stariji, pre svega zbog njegove topologije na filogenetskom stablu (Slika 30). Prema
neobjavljenim rezultatima najskorijih ispitivanja kraih sekvenci (390 bp) kontrolnog
regiona mtDNA uzoraka iz Rilske reke (sliv Strume) i Arde (sliv Marice), utvreno je
prisustvo haplotipa koji do 390 bp odgovara haplotipu Ad*Bo. Ako ostatak sekvence
bude identian kao kod haplotipa Ad*Bo, ovaj haplotip bie karakteristian za egejski
sliv. Meutim, ista sekvenca kao za Rilsku reku i Ardu pronaena je analizom uzoraka iz
Krke (jadranski sliv), koja je verovatno razliit haplotip od Ad*Bo, to e se,
predpostavljamo, utvrditi buduim sekvencioniranjem jo nedostajuih 170 bp do poli T
bloka. Podudarnost izmeu sekvenci egejskog i jadranskog sliva verovatno je posledica
paralelizma (paralelne sluajne mutacije) na poziciji 26 (Tabela 10) po kojoj se ovaj
haplotip i razlikuje od najrasprostranjenijeg haplotipa jadranske linije ADcs1 (usmeno
saoptenje Ale Snoj).
Ad*Bo haplotip zauzima ancestralni poloaj u odnosu na sve ostale haplotipove
junih mediteranskih linija (Ad, Ad+ (farioides), Me, i Ma) (Slika 30). Haplotip
Ad*Bo se razlikuje od haplotipova Me linije po etiri mutacije, od farioides i Ma
haplotipova po tri, i od svih Ad haplotipova po dve mutacije, izuzev od ADcs1 od koga se
razlikuje po samo jednoj mutaciji (Slika 31). Ancestralni poloaj haplotipa Ad*Bo treba
dokazati i rezultatima drugih DNA analza, ali i analizom drugih tipova kararaktera
(morfoloki), zbog nedetektabilno niskih bootstraping verovatnoa za NJ i MP analize,
i zbog toga to postoje tri druga haplotipa (ADcs11, AD*Pe and Ad*Ti) koja su barem
podjednako udaljena od Ma, Me i drugih Ad haplotipova po broju mutacija (Slika 31).
Vrlo je teko dodeliti taksonomski status nekom od pronaenih egejskih
haplotipova. Karaman (1924) je opisao samo jednu vrstu, Salmo macedonicus, u reci
Treski (sliv Vardara), ije ime je kasnije primenjeno i na potonu pastrmku iz reke
Strume. Posebnu potekou pri reavanju taksonomskih problema predstavlja postojanje
dva haplotipa u slivu Strume (ADcs1 i Ad*Bo) koji se fenotipski razlikuju, to pravi
dodatnu nomenklaturnu komplikaciju.
U slivu Strume na lokalitetu Brankovaka reka (br. 28) pronaen je haplotip At
linije (At1), isti kao i na lokalitetu Gradac u crnomorskom slivu. Haplotipovi At linije
nisu autohtoni za egejski sliv i njihovo prisustvo u Brankovakoj reci najverovatnije je
posledica poribljavanja Dragovitice u delu toka kroz Bugarsku, mada se ne iskljuuju i
77
Diskusija
rezultatima
dobijenim
upotrebom
savremenih
molekularnih
tehnika
formiranje posebne farioides (Ad+) grupe (linije), koja ima potpuno istu znaajnost
kao i grupe ostalih juno evropskih linija
78
Diskusija
Diskusija
80
Diskusija
4.2.
81
Diskusija
82
Diskusija
Krajem miocena (6,1 do 5,1 miliona godina), u tzv. mesinskom periodu, desila su
se dva veoma vana geoloka dogaaja:
Za vreme mesinskog perioda Paratetis je bio boatna ili slatkovodna sredina, iji
se nivo vode poveavao posebno u vlanim periodima, to je uzrokovalo povremeno
povezivanje evropskih renih sistema, a samim tim i mogunost za irenje ili pak
izolaciju slatkovodnih riba.
83
Diskusija
Slika 35. Mesinska kriza saliniteta, uzrok isuivanja Mediterana. (Hs, 1978).
Period Lago Mare nesumnjivo je odigrao veoma vanu ulogu u ranom prolasku
primarno slatkovodne faune riba iz Paratetisa u Mediteran, kao i u disrtibuciji pomenute
faune u peri-mediteranske rene sisteme. Potvrdu ovakvom scenariju daju brojni fosilni
ostaci koji potiu iz mesinskog perioda.
84
Diskusija
Diskusija
predaki za atlantskog lososa (Salmo salar), dok je populacija koja je ostala u Paratetisu i
njegovim pritokama bila predaka za evropske pastrmke. Nakon davanja predake osnove
za dve grupe roda Salmo (losos i pastrmka), Salmo immigratus izumire.
Atlantski losos danas naseljava iskljuivo severna mora i obale istonog
Atlantika, i uopte ga nema u dananjim basenima biveg Paratetisa (Crno more,
Kaspijsko i Aralsko jezero), to ukazuje na nastanak lososa upravo u morima severne i
zapadne Evrope. injenice da je Patatetis u Saramatskom katu bio ispunjen uglavnom
boatnom vodom koja po svojim osobinama jako nalikuje vodi dananjih severnih
mora, kao i da su ga naseljavale ribe sa jako irokom ekolokom valencom u odnosu
na salinitet (Anelkovi, 1989), uz pojavu anadromije (zaviajno ponaanje) koja je
karakteristina za lososa, mogu predstavljati dodatne argumente koji idu u prilog
iznetoj hipotezi da je predak lososa (Salmo immigratus) iveo u Paratetisu odakle je
migrirao ka severnim morima za koja predpostavljamo da su i bila mesto njegovog
nastanka, nakon prekida veze preko basena Rone i/ili Rajne sa basenom Atlantika i
njegovih priobalnih mora.
Najstariji fosilni ostaci potone pastrmke pronaeni su na Kavkazu, datiraju sa
poetka pleistocena i procenjuje se da su stari oko 2 miliona godina (Osinov i
Bernatchez, 1996), s tim to se smatra da je potona pastrmka kao vrsta znatno starija.
Poto se radi o fosilnom nalazu iz basena biveg Paratetisa, moe se predpostaviti da
pastrmka vodi poreklo od Salmo immigratus kao jedine vrste roda Salmo koja je
naseljavala Paratetis u doba srednjeg i donjeg miocena. Derzhavin (1934) i Vladimirov
(1944; 1948) smatraju upravo populacije potone pastrmke sa podruja Kavkaza
najprimitivnijim formama, od kojih su irenjem svoga areala nastale sve ostale
populacije pastrmki koje naseljavaju juna mora. Antunes i sar. (2002) analizom
geneologije gena za transferin dolaze do zakljuka da najancestralnije populacije
potone pastrmke naseljavaju pritoke Crnog mora, Kaspijskog i Aralskog jezera. Cortey
i sar. (2004) navode da korienjem filogenetskih metoda NJ i MP, haplotipovi
dunavske linije zauzimaju ancestralni poloaj u odnosu na haplotipove ostalih linija. Iz
svega navedenog moe se uvideti da postoje argumenti koji idu u prilog napred iznetoj
hipotezi o poreklu evropskih pastrmki od pretka koji je naseljavao Paratetis i njegove
pritoke u doba miocena.
Tokom pliocena (5 - 1.8 miliona godina), Paratetis prolazi kroz fazu redukcije svoje
veliine, prvo raspadom na manje pojedinane meusobno povezane basene, da bi kasnije
86
Diskusija
87
Diskusija
Diskusija
smatra se da nije vrena (linija IV) (Garca - Marn i sar., 1999), (Slika 38). Linije I, II i III
odlikuju se razliitim kombinacijama fiksiranih genotipova na lokusima LDH-C* i CK-A1,
koji su danas prisutni u pastrmskim populacijama deglacijalnih podruja, dok linija IV
poseduje alel LDH - A2*100QL, koji odsustvuje kod populacija iz postglacijalno
kolonizovanih regiona. Sadanje populacije koje naseljavaju deglacijalna podruja, smatra
se da predstavljaju meovite ili iste potomke navedene tri migratorne grupe.
Slika 38. Distribucija predpostavljenih glavnih linija (I, II, III i IV) i pravci migracija
populacija potone pastrmke za vreme postglacijalne rekolonizacije za linije I, II i III.
Isprekidana linija predstavlja granicu leda za vreme poslednje glacijacije (pre oko 13 000
godina), (Garca - Marn i sar., 1999 - modifikovano).
Diskusija
Diskusija
U regionu 1 (Slika 39), kao posledica povlaenja nivoa mora, dolazi do znaajnog
proirenja reke Po, u regionu 2 dolazi do uspostavljanja veza izmeu dalmatinskih reka, u
regionu 3 dolazi do uspostavljanja transjadranske komunikacije (opadanjem nivoa mora
od najmanje 160 m), u regionu 4 dolazi do uspostavljanja veza izmeu albanskih reka
(Drim Vjose), u regionu 5 dolazi do uspostavljanja veza izmeu reka jonskog sliva
(Taimis Aheron), u regionu 6 dolazi do uspostavljanja veza izmeu reka sa suprotnih
strana Patras - korintskog zaliva, i u regionu 7 dolazi do uspostavljanja slatkovodne veze
izmeu gornjeg dela Egejskog i Crnog mora.
Osim brojnih renih veza koje su se uspostavile opadanjem nivoa mora za vreme
glacijacija i koje su omoguile migriranje pastrmskih populacija, treba pomenuti i brojne
meurene veze, ledene ustave i slatkovodna jezera koje su uspostavljene u doba
interglacijacija otapanjem ledenog pokrivaa u zapadnom Sibiru i istonoj Evropi. Kao
posledica otapanja lednika dolazi do akumulacije i prelivanja vode iz jednog u drugi
91
Diskusija
basen biveg Paratetisa (Aralsko Kaspijsko jezero Crno more), koji je preko Crnog
mora komunicirao sa gornjim delom Egejskog mora. Ceo pomenuti sistem, ukljuujui i
gornji deo Egejskog mora, najverovatnije je posle svake glacijacije interglacijacije
posedovao slatku ili boatnu vodu (Slika 39), (Thunell i Williams, 1983). Kao potvrdu
veze izmeu ponto kaspijskog i mediteranskog basena, imamo nalaz Da haplotipova, za
koje se smatra da su autohtonog porekla u egejskom slivu Grke (Apostolidis i sar.,
1997), i Turske (Bernatchez, 2001). Takoe je postojala komunikacija izmeu ponto
kaspijskog basena i basena Tigrisa i Eufrata (Persijski zaliv), to potvruje pronalazak
dunavskog haplotipa Da25 (Sunik i sar., 2005). Osim pomenutih veza izmeu ponto
kaspijskog basena sa mediteranskim i basenom Indijskog okeana (Persijski zaliv),
postojala je, za vreme razliitih faza glacijacija, veza ponto kaspijskog i atlantskog
basena (Bernatchez, 2001). Veze Kaspijsko jezero Baltik i Kaspijsko jezero Arktik
(Ekman, 1957), kao i veza izmeu gornjeg Dunava i gornje Rajne (Balon, 1968;
Englbrecht i sar., 2000) potvrena je i prisustvom At haplotipova u slivu gornjeg Dunava,
za koje se sumnja da su autohtonog porekla (Weiss i sar., 2001), kao i nalaz jedne
populacije potone pastrmke u pritoci gornje Volge (kaspijski basen), (Osinov i
Bernatchez, 1996). Dananje filogeografske studije (Durand i sar., 1999; Nesbo i sar.,
1999), kao i tradicionalne biogeografske studije (Banarescu, 1990) potvruju ponto
kaspijsko poreklo drugih slatkovodnih riba u atlantskom basenu koje su tu dospele za
vreme pleistocenskih glacijalnih dogaaja.
Kako su postojale pleistocenske veze izmeu basena Crnog mora, Kaspijskog i
Aralskog jezera sa Atlantikom na jednoj i sa Mediteranom i Indijskim okeanom na drugoj
i treoj strani, naa predpostavka da su populacije potone pastrmke iz basena biveg
Paratetisa ancestralne za sve ostale populacije koje naseljavaju severna i juna mora
postaje realna. Realnost ove hipoteze ogleda se u postojanju haplotipova Da*Vr i Da*D
koji su pronaeni u slivu June Morave (Dunav Crno more), koji zauzimaju
ancestralni poloaj u okviru Da klade na filogenetskim stablima (Slika 29 i 30), kao i
haplotipa Da24 koji je pronaen u reci Waldaist u Austriji (dunavski sliv), (Duftner i sar.,
2003). Haplotipovi Da*Vr, Da*D i Da24 imaju poslednja etiri polimorfna mesta 530,
542, 543 i 548 do poly T regiona sinapomorfna sa haplotipovima iz Ad, Ad+ At, Ma i
Ma linije. Kao posledica pomenutih sinapomorfizama, haplotipovi Da*Vr, Da*D
zauzimaju centralni poloaj na kladogramu mrei (Slika 31), (posebno haplotip Da*Vr)
u odnosu na sve haplotipove iz ostalih linija. Haplotip Da*Vr zauzima centralni poloaj i
po procentualnim vrednostima divergencije izmeu haplotipova razliitih linija (Tabela
92
Diskusija
11). Izmeu haplotipa Da*Vr i najbliih haplotipova june i At linije distance se kreu
od 1,05 do 1,23%, dok je vrednost distanci izmeu Da*Vr i Da haplotipova izmeu 0,88 i
1,23%, izuzev haplotipa Da*D koji mu je najblii i distanca izmeu njih je 0,53%. Na
osnovu iznetih injenica moe se zakljuiti da haplotip Da*Vr (kao i njemu najblii
haplotipovi Da24 i Da*D) spadaju u grupu ancestralnih haplotipova ne samo za ostale
Da haplotipove, ve i za haplotipove ostalih linija.
Unutar Da linije prikazana je duboka genetika divergencija, koja prema
genetikoj distanci skoro tri puta pravazilazi genetiku divergenciju izmeu
haplotipova Ad, Me i Ma linija. Duboka divergencija unutar Da linije (Tabela 11), kao
i njena bazalna pozicija na filogenetskom stablu (Cortey i sar., 2004) i na kladogramu
(mrei) haplotipova (Slika 31), sugeriu da Da populacije predstavljaju najstarije
odvojenu liniju iz Salmo trutta kompleksa, a samim tim i ancestralnu za druge
haplotipove (linije) unutar kompleksa.
Haplotipovi koji su pronaeni u slivu Neretve i Skadarskog jezera (Ad+N i
Ad+RC), a koji zajedno sa Ad+Prz formiraju jugo-zapadno balkansku farioides (Ad+)
liniju, verovatno predstavljaju ostatke ancestralnog polimorfizma june klade.
Nakon prihvatanja stanovita o postojanju pet glavnih evolutivnih linija (Da, At,
Ad, Me i Ma) potone pastrmke (Bernatchez i sar., 1992), sumnjalo se u mogunost
postojanja novih linija sline dubine divergencije, jer je smatrano da je distribuciono
podruje Salmo trutta kompleksa bar u pogledu pronalaska novih linija adekvatno
istraeno (Bernatchez, 2001). Meutim, ispostavilo se da pojedini regioni nisu dovoljno
istraeni, i da jo uvek ne postoje podaci za pojedina podruja u okviru prirodnog areala
potone pastrmke. Najnovija detaljna istraivanja populacija potone pastrmke na
Iberijskom poluostrvu otkrila su postojanje bitnih polimorfizama unutar At klade (Surez
i sar., 2001; Weiss i sar., 2000) na osnovu kojih je predloeno opisivanje nove evolutivne
linije Duero (Surez i sar., 2001; Cortey i Garcia-Marin, 2002). Poto Balkansko
poluostrvo, kao i Iberijsko, predstavlja vruu taku biodiverziteta (Krytufek i sar.,
2004), veoma bitnu za post-glacijalnu evoluciju faune i kolonizaciju Evrope, a pri tome je
slabo istraeno, pronalazak Salmo farioides (Ad+) linije u rekama jadranskog sliva jugozapadnog Balkana, s obzirom na sve okolnosti podruja i nedostatka informacija, postaje
sasvim realan.
Dobijeni rezultati nukleotidnih divergencija na kontrolnom regionu mtDNA od
0,18% do 2,12% (Tabela 11), uglavnom se slau sa ocenom Gyllestena i Wilsona (1988)
da je intraspecijska nukleotidna divergencija mtDNA kod Salmonida izmeu 0.1% i 2 %.
93
Diskusija
Diskusija
95
Diskusija
Ribolov
Poribljavanje
Degradacija
stanita
Izumiranje
Hibridizacija
X
X
X
X
(X)
Gubitak
varijabilnosti
unutar
populacija
X
X
X
96
Diskusija
97
Diskusija
98
Diskusija
aspektu
biolokog
diverziteta
koji
predstavlja
genetika
varijabilnost unutar vrste. Zatita iskljuivo vrste nije dovoljna, ve se mora obratiti
panja na postojanje razlika na genetikom nivou unutar i izmeu lokalnih populacija,
koje takoe moraju biti konzervirane. Opti cilj konzervacije biolokog diverziteta na
svim nivoima, od gena do ekosistema, ustanovljen je internacionalno i primenjuje se u
svim dravama (meu kojima je i SCG) koje imaju ratifikovanu Konvenciju o
Biolokom Diverzitetu (Rio de Janeiro 1992). Meutim, pomenute obaveze zatite na
genetikom nivou u najveem broju zemalja jo nisu transformisane u adekvatne
akcije. Prepoznavanje vanosti konzervacije genetikog diverziteta je posebno vano
za vrste kao to je potona pastrmka, koje se karakteriu velikom genetikom
diferenciranou lokalnih populacija. Gubitak lokalnih populacija potone pastrmke
moe rezultirati u iskorenjivanju relativno velikog dela genetike varijabilnosti unutar
vrste (Laikre i sar., 1999).
99
Diskusija
Degradacija stanita
Ribolov
Poribljavanje
Putanje
irenje
Brane
Regulacija
reka
Zagaenje
bolesti
Prekomeran
ribolov
domestifikovanih
Lovokraa
autohtonih
parazita
populacija
Danska
Estonija
Finska
Francuska
Nemaka
Grka
Republika
Irska
Norveka
Portugal
Rusija
panija
vedska
vajcarska
Velika
Britanija
i/ili ne
X
X
X
X
X
X
X
X
X
Diskusija
Diskusija
102
Diskusija
mere su veoma dobre, ali one do sada nisu dale pozitivne rezultate u zatiti, pre svega
zbog njihovog nepotpunog sprovoenja.
Za potpunu zatitu pastrmskih populacija neophodno je primeniti sledee
preporuke:
1. Utvrivanje stanja populacije
2. Utvrivanje i otklanjanje ugroavajuih faktora koji su doveli do smanjenja
brojnosti populacije
3. Utvrivanje genetike strukture populacije
4. U sluaju pronalaska novih genetikih varijanti izvriti dodelu konzervacionog
statusa populaciji i stanitu
Na osnovu dobijenih rezultata svi lokaliteti na kojima su pronaeni novi
haplotipovi, kao i lokaliteti na kojima su pronaeni vrlo retki haplotipovi (Tabela
9), trebalo bi da dobiju poseban konzervacioni status kao stanite (odreenu
kategoriju i stepen zatite), uz dodelu konzervacionog statusa na nacionalnom
nivou haplotipovima koji su na datim lokalitetima pronaeni. Iako potona
pastrmka nije uvrtena na Crvenu Listu (IUCN) ugroenih ivotinja na
internacionalnom nivou, pojedine drave su joj dodelile status ugroenih vrsta na
nacionalnom nivou (Grka - Endangered, panija Vulnerable i vedska - Lower
risk, near threatened). Poto su ugroavajui faktori u Grkoj i kod nas vrlo slini,
logino bi bilo da i mi sledimo primer Grke i da bar naim jedinstvenim
populacijama (teritorija ue Srbije) dodelimo istu kategoriju ugroenosti. Pri
dodeljivanju nacionalnog konzervacionog statusa moramo uzeti u obzir i ribolovnu
atraktivnost pomenutih voda, kao i njihov potencijalni socio-ekonomski znaaj.
Vodama koje nisu posebno ribolovno atraktivne u izvorinim delovima (Vrla,
Vlasina i Depska), a koje predstavljaju stanita jedinstvenih genetikih formi
(Da*Vr, Da*Vl i Da*D), treba kao stanitu dodeliti I stepen zatite (od izvorita u
duini od 4 km), a haplotipovima status ugroenosti (Endangered). Reke u slivu
Dragovitice u kojima je pronaen haplotip Ad*Bo (Lisina, Boica, Ljubata i
Brankovaka reka (potencijalno)) koje su ribolovno atraktivne, a samim tim mogu
imati i ekonomski znaaj, moraju dobiti specijalni reim zatite koji bi omoguio
ouvanje genetike jedinstvenosti pastrmskih populacija, kao i odrivi ribolov kao
jedan od izvora prihoda lokalnoj zajednici. Pastrmske populacije koje naseljavaju
103
Diskusija
pomenute reke sliva Dragovitice dobile bi konzervacioni status Lower risk, near
threatened. Izvorini delovi navedenih reka u duini od 4 km morali bi dobiti kao
stanite I stepen zatite, dok bi ostali deo toka pomenutih reka do ua u
Dragoviticu, kao i sama Dragovitica, bio pod II stepenom zatite. Dodela
navedenog konzervacionog statusa uz primenu strogih mera kontrole i upravljanja
(lov po pravilu uhvati-i-pusti uz mogunost noenja jedne ribe preko 40 cm)
obezbedio bi stalnost korienja, posebno ukoliko bi se adekvatnim poribljavanjem
kroz neki period restaurirala genetika struktura populacije priblina originalnoj.
Perspektive haplotipa Ad*Bo u pogledu opstanka bie vrlo optimistine, naroito
ako se obistine sumnje da je areal ovog haplotipa vezan i za ostale reke egejskog
sliva, to e pokazati rezultati buduih istraivanja (Diskusija str. 79).
Rekreativni (sportski) ribolov, koji se u velikom delu areala pastrmke
smatra najelitnijim vidom rekreativnog ribolova, upranjava se intenzivno. Intenzitet
ribolova (a kod nas se pod ovim mora obuhvatiti i krivolov) je veliki, jer je cena
takvog ribolova znatna i donosi upravljaima ili vlasnicima ribolovnih voda na
kojima se vri velike prihode u svetu, a ponegde i kod nas. Ovaj ribarstveno
komercijalni pritisak je pod uslovima kada nije bilo mogue zaokrueno odrediti i
sprovoditi adekvatne konzervacione mere u veem delu areala pastrmke, a posebno
kod nas i u bliem okruenju, snaan ugroavajui faktor po pastrmski (geno)fond.
Kao posledica velikog ribolovnog pritiska, najee se pribegava poribljavanju kao
meri upravljanja pastrmskim fondom, to je uglavnom kontraproduktivno po
originalnost pastrmskih populacija. Kod nas se poribljavanje najee vrilo i vri
onim materijalom koji je u datom trenutku dostupan, bez obzira na injenicu koliko
je odgovarajui, bez skoro bilo kakvih ogranienja i kontrole. Za podruje stare
SFRJ (izuzev Slovenije), a posebno za Srbiju, ne postoji precizno voena evidencija
o poribljavanju pastrmskih reka, osim u nekoliko pojedinanih sluajeva. Zna se da
je materijal za poribljavanje nabavljan iz mrestilita u Ivanjici, Konjicu, Vrelu Bune
i Blagaju, kao i iz Slovenije i sa Ohrida, i da su poribljavanja vrena irom Srbije.
Sreom po pastrmski fond kod nas, ta poribljavanja su uglavnom vrena na
ribolovno atraktivnim vodama: Mlavi, Krupaji, Gradcu, Moravici, Drini i ponegde
drugde, ali su jo preostale vode (koje su bile u fokusu uzorkovanja ove teze) koje
su i / ili ribolovno neatraktivne, i / ili fizikim preprekama odvojene od delova,
obino nizvodnih, koji su ribolovno atraktivni svojom lakom dostupnou ili
veliinom pastrmke u njima (Mari, 2002). Prepoznavanje genetikog identiteta
104
Diskusija
kontrolora
implementatora
zakona)
najrazliitijeg
opsega
Diskusija
posmatrano) angauju. Pri tome, uzimajui u obzir broj pastrmskih voda i ribolovni
prtisak, sasvim je izvesno da bi se konzervacione aktivnosti vezane za pastrmski
fond u Srbiji odvijale niskim intenzitetom, ali obavezno konstantno, to bi trebalo
da bude finansijski odriva aktivnost u sklopu ribarstveno-finansijskog obima, dok
bi ribarstvene aktivnosti, pre svega one vezane za zatitu ribljeg fonda u ribarstvu,
trebalo da budu viestruko intenzivirane u praksi. Ovo je pre svega znaajno stoga
sto bi pozitivne efekte ovako ureene odrive ribarstvene i konzervacione prakse
osetili stanovnici ruralnih, trenutno slabo razvijenih i raznovrsnou delatnosti
ogranienih podruja Srbije i to bi, u sklopu ostalih vidova konzervaciono zavisnih
aktivnosti, to moglo predstavljati zamajac njihovom odrivom privrednom razvoju
u celini.
106
Zakljuci
5. ZAKLJUCI
Na osnovu rezultata ove studije utvreno je postojanje tri glavne
filogeografske grupe potone pastrmke na teritoriji Srbije: dunavske (Da),
june (Ad; Ad+) i atlantske (At). U okviru sve tri grupe identifikovano je,
na osnovu 18 polimorfnih mesta, ukupno 15 haplotipova, od kojih je est po
prvi put opisano untar areala vrste. Od est novo opisanih haplotipova, tri su
iz dunavske linije i pronaena su u slivu June Morave (Da*Vl (Vlasina),
Da*Vr (Vrla) i Da*D (Depska reka)), dok su dva od preostala tri koja
pripadaju Ad liniji, pronaena u egejskom slivu (Ad*Bo (sliv Dragovitice) i
Ad*Ti (sliv Lepenca), a jedan je pronaen u jadranskom slivu Ad*Pe (Peka
Bistrica).
Rekonstrukcijom filogenije NJ i MP metodama dobijena je vrlo slina
topologija stabla, pri kojoj haplotipovi pokazuju pripadnost filogenetskim
linijama potone pastrmke. Majority role consensus 50% tree otkriva jasno
razdvajanje sa visokom potporom na dve glavne klade (Da i At klada + juna
klada (Ad, Ad+, Ma i Me)). U junoj kladi haplotip Ad*Bo zauzima
ancestralnu poziciju (Slika 30), ali zbog niskih bootstraping verovatnoa za
NJ i MP analize njegovu ancestralnost tek treba dokazati rezultatima drugih
DNA analiza, ali i analiziranjem drugih tipova kararaktera (morfolokih). U
junoj kladi, pored Ad haplotipova (ADcs1, ADcs11, Ad*Pe i Ad*Ti) koji
nisu jasno grupisani u kladu, javljaju se dve ve poznate podgrupe
(mediteranska i marmoratus) i trea, dopunska, koja je prvi put identifikovana
(Ad+). lanovi Me, Ma i Ad+ klade karakteriu se istim brojem intra- kladnih
sinapomorfizama (pozicije 113 i 262 za Ma, 146 i 196 za Me, 126 i 262 za
Ad+; Tabela 13) to sugerie isti nivo divergencije ovih klada. Novu (Ad+)
kladu ine haplotipovi Ad+Prz, Ad+N i Ad+RC, i ona je statistiki poduprta
istim nivoom verovatnoe kao i ve ustanovljene podgrupe (klade Me i Ma).
Haplotip Ad+Prz pronaen je u Prizrenskoj Bistrici, Mrtvici i Tripunici (u
koju je, kako pretpostavljamo, introdukovan iz Neretve), Ad+N je pronaen u
Neretvi, a Ad+RC u Rijeci Crnojevia. Geografska distribucija pomenutih
haplotipova vezana je za reke jadranskog sliva jugo-zapadnog Balkana i
107
Zakljuci
poklapa se sa distribucijom vrste Salmo farioides (Karaman, 1937), to i
navodi na zakljuak da Ad+ klada ustvari predstavlja Salmo farioides.
Unutar Da klade uoen je veliki nivo genetike divergencije (Tabela
11). Ovaj podatak,
Zakljuci
unutar
dunavskih
populacija
na
teritoriji
Srbije,
kao
Makedonija,
Albanija,
Bosna
Hercegovina,
Bugarska).
Poto
nivou,
dodeliti
odgovarajue
konzervacione
statuse.
109
Zakljuci
Oba aspekta konzervacionih i ribarstvenih aktivnosti na populacijama
potone pastrmke zahtevaju vrlo brze i korenite promene, kako u zakonskom
smislu, tako i u doslednoj primeni u buduoj konzervacionoj i ribarstvenoj
praksi.
110
Summary
6. SUMMARY
Upon results of this study, the occurrence of three main phylogeographic groups of the brown
trout was confirmed at the territory of Serbia: Danube (Da), southern (Ad; Ad+) and Atlantic (At).
Within all groups, 15 haplotypes based on 18 polymorphic places were identified; six of them were
recorded for the first time. Three new haplotypes belong to Danube group and were found in Juna Morava
drainage (Da*Vl (Vlasina), Da*Vr (Vrla) i Da*D (Depska River)), while within three others, belonging
to Ad group, two were found in Aegean Sea basin (Ad*Bo (Dragovitica River drainage) and Ad*Ti
(Lepenac River drainage); one was found in Adriatic Sea basin Ad*Pe (Peka Bistrica River).
Phylogeny reconstruction based on NJ and MP showed very similar tree topology. 50%
Majority role consensus tree revealed clear division of three main clades with high support level (Da and
At clade + southern clade (Ad, Ad+, Ma and Me). Haplotype Ad*Bo have the ancestral position in the
southern clade (Fig 30), but because of the low bootstrapping probabilities for NJ i MP analyses, this
ancestral state should be additionaly proved with other DNA analyses and analyses of morphologic
characters. Within southern clade, in addition to Ad haplotypes (ADcs1, ADcs11, Ad*Pe i Ad*Ti) that
were not apparently grouped together, the presence of two well known subdivisions was confirmed
(Mediterranean and marmoratus); the third additional subdivision Ad+ was identified for the first time. The
members of the Me, Ma i Ad+ clades are characterized with the same numbers of intra-clade
synapomorphies (positions 113 and 262 for Ma, 146 and 196 for Me, 126 and 262 for Ad+; Table 13); this
suggest the same level of divergence of these clades. The new clade (Ad+) includes haplotypes Ad+Prz,
Ad+N and Ad+RC, and has the same level of support as other (previously known) subdivisions (clades Me
and Ma). Haplotype Ad+Prz was found in Prizrenska Bistrica River, Mrtvica River and Tripunica River
(we think that this haplotype was introduced from the Neretva River into Tripunica River); Ad+N was
found in Neretva River and Ad+RC in Rijeka Crnojevia River. Geographic distribution of those
haplotypes is connected with the rivers of the Adriatic basin of the south-western Balkan peninsula and
corresponds with the distribution of Salmo farioides (Karaman, 1937); this suggests that Ad+ clade
represents Salmo farioides, and could belong to the new line within the southern group.
Strong genetic divergence was found within the Da clade, that was based on the genetic distances
(Table 11). Strong divergence, synapomorphic positions (Table 13) of the most basal haplotypes belonging
to Da clade (Da*Vr and Da*D) (Fig 30), as well as position of the haplotypes of all other lineages, suggest
that Danube populations represent the oldest fragmental line of Salmo trutta complex. Ancestral position of
Da line was also shown by sequencing of the whole mtDNA control region (Cortey at al., 2004;
Templeton, 2004). These results suggest that brown trout originated from the Parathetis and spred from the
111
Summary
Paratethis through the Pleistocene connections from the Black See basin, Caspian and Aral lakes toward the
Atlantic Ocean and Mediterranean See. Extremely divergent haplotypes like Da*Vr and Da*D have
intermediate positions in the network (Fig 31) between Da, At and southern group (Ad, Ad+, Ma i Me)
of haplotypes. That specially accounts for the Da*Vr haplotype, that holds central position judging from its
genetic distances to the rest of haplotypes. All these facts confirm the long term presence and ancestral
origin of Da lineage in evolution of the brown trout.
In spite of expectation that only wild haplotypes of Ad and Da lineages occur in Serbia, the
analyses confirmed presence of haplotype At1 which belongs to Atlantic line. The finding of this haplotype
in two localities, Gradac River and Brankovaka River, is a fisheries-related impact that predomintes in
hatcheries production of brown trout fry for stocking. The occurrence of haplotype ADcs1 of the Ad
lineage in two localities in the Danube River basin (Jerma and Vrla Rivers) could be a consequence of
sotcking and transfer of water from the Dragovistica River drainage, respectively. The clear genetic
dispersion of haplotypes was recorded between basins of Aegean and Adriatic Seas. It was disturbed only
by Ad+Prz haplotype, which occured in Tripusnica River (Aegean Sea basin) after the stocking from the
Neretva River drainage.
Since the territory of Serbia represents only the small part of the Balkan Peninsula, the higher lever
of genetic polymorphism of the brown trout from the whole region of the Balkans (Montenegro,
Macedonia, Albania, Bosnia and Herzegovina, Bulgaria) could be expected, considering the recorded high
level of genetic diversity, finding of new polymorphic places within different lines of the brown trout,
strong divergence within Danube populations in the territory of Serbia, as well as suspected presence of
evolutionary divergent line (Ad+; Salmo farioides) in the Adriatic basin.
This study showed that aboriginal, i.e., populations still exist in Serbia, at least in spring sections of
streams and rivers. This is very important for the conservation of autochthonous genetic diversity of the
brown trout in Serbia. The efficient conservation of existing genetic variability, i.e., diversity, is to be taken
into account in the strategy of fisheries management (Ryman, 1991).
Since the new haplotypes are not very frequent in Serbia and are under the constant threat, proper
conservation status in national legislation is needed. The conservation status of three new haplotypes from
Da group (Da*Vr, Da*Vl and Da*D) in the headwaters of Vrla, Vlasina and Depska Rivers should be
set as EN, whereas for AD*Bo haplotype it should be set as LRnt in particular waters of the Dragovistica
River drainage where some brown trout, attractive for fishing, occur. That would enable both maintenance
of existing genetic uniqueness and sustainable fisheries utilization. However, the first four kilometers of
each of those rivers should be assigned in the highest protection category. Both conservational and fisheries
practice concerning the brown trout are in strong and urgent necessity for changes in legislation, as well as
in consistent and harmonized application.
112
Literatura
7. LITERATURA
Aebersold, P. B., Winans, G. A., Teel, D. J., Milner, G. B., Utter, F. M. 1987. Manual for
starch gel electrophoresis: a method for the detection of genetic variation. NOAA
Technical Report NMFS 61, U.S. Department of Commerce, National Oceanic
and Atmospheric Administration, National Marine Fisheries Service, U.S.A.
Aganovi, M. 1979. Salmonidne vrste riba i njihov izgoj. IGKRO "Svijetlost", Sarajevo.
Alberts, B., Bray, D., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Watson, J. D. 1994. DNA repair.
V: Molecular biology of the cell. New York, Gerland Publishing, pp. 242-251.
Alegria Hernandez V. 1985. A contribution to the study of heterogeneity of the Adriatic
sardine (Sardina pilchardus Walb.) population. Acta Adriatica, 26: 109-122.
Allendorf, F. W. 1988. Conservation biology of fishes. Conservation Biology, 2: 145-148.
Allendorf, F. W., Leary, R. F. 1988. Conservation and distribution of genetic variation in
a polytypic species, the cutthroat trout. Conservation Biology, 2: 170-184.
Allendorf, F. W., Ryman, N., Stennek, A., Sthl, G. 1976. Genetic variation in
Scandinavian brown trout (Salmo trutta L.): evidence of distinct sympatric
populations. Hereditas, 83: 73-82.
Allendorf, F. W., Waples, R. S. 1996. Conservation and Genetics of Salmonid Fishes. In:
Avise, J. C. & Hamrick, J. L. (eds.) Conservation Genetics. Case Stories from
Nature, Chapman & Hall, New York, pp. 238-280.
Amos, B., Schlterer, C., Tautz, D. 1993. Social structure of pilot whales revealed by
analytical DNA profiling. Science, 260: 670-672.
Anderson, B. G., Borns, H. W. Jr. 1994. The Ice Age world. Scandinavian Univ. Press,
Oslo, Norway.
Anelkovi, S. J. 1989. Tercijarne ribe Jugoslavije stratigrafsko paleontoloko
paleoekoloka studija. Paleontologica Jugoslavica. Jugoslovenska Akademija
Znanosti i Umjetnosti Zagreb, 38: 1-121.
Angeres, B., Bernatchez, L., Angers, A., Desgroseillers, L. 1995. Specific microsatellite
loci for brook charr reveal strong population subdivision on a micrographic scale.
Journal of Fish Biology, 47 (Suppl. A): 177-185.
Anonimni autori. 1994. Zakon o ribarstvu. Slubeni glasnik Republike Srbije, 35, pp.
2342-2346.
Anonimni autori. 2004. Zakon o zatiti ivotne sredine. Slubeni glasnik Republike
Srbije, 135, pp. 29-43.
113
Literatura
114
Literatura
115
Literatura
Bernatchez, L., Guyomard, R., Bonhomme, F. 1992. DNA sequence variation of the
mitochondrial control region among geographically and morphologically remote
European brown trout Salmo trutta populations. Molecular Ecology, 1: 161-173.
Bernatchez, L., Osinov, A. G. 1995. Genetic diversity of trout (genus Salmo) from its
most eastern native range based on mitochondrial DNA and nuclear gene
variation. Molecular Ecology, 4: 285-297.
Bernatchez, L., Wilson, C. C. 1998. Comparative phylogeography of Nearctic and
Palearctic fishes. Molecular Ecology, 7: 431-452.
Berrebi, P., Pov, M., Jesenek, D., Cattaneo Berrebi, G., Crivelli, A. J. 2000. The
genetic diversity of native, stocked, and hybrid populations of marble trout in
Soa river, Slovenia. Heredity, 85 (3): 277-287.
Bianco, P. G. 1990. Potential role of paleohistory of the Mediterranean and Parathetys
basins on the early dispersal of Euro-Mediterranean freshwater fishes.
Ichthyological Exploration of Freshwaters, 1: 167-184.
Billington, B., Herbert, P. D. N. 1991. Mitochondrial DNA diversity in fishes and its
implications for introductions. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic
Sciences, 48: 80-94.
Birky, C. W. 1983. Relaxed cellular controls and organelle heredity. Science, 222: 468475.
Bookstein, F. L., Chernoff, B. L., Humphries, J. M., Smith, G. R., Strauss, E. R. 1985.
Morphometrics in evolutionary biology. The Academy of Natural Sciences of
Philadelphia, Special Publication, 15 pp. 277.
Borst, P., Grivell, L. A. 1981. Small is beautiful-porterait of a mitochondrial genome.
Nature, 290: 443-444.
Bouza, C., Arias, J., Castro, J., Snchez, L., Martnez, P. 1999. Genetic structure of
brown trout, Salmo trutta L., at the southern limit of the distribution range of the
anadromous form. Molecular Ecology, 8: 1991-2002.
Brown, W. M., George, M., Wilson, A. C. 1979. Rapid evolution of animal mitochondrial
DNA. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 76: 1967-1971.
Brown, J. H., Gibson, A. C. 1983. Biogeography. Mosby, St Louis, Toronto & London,
643 pp.
Brown, W. M., Prager, E. M., Wang, A., Wilson, A. C. 1982. Mitochondrial DNA
sequences of primates: tempo and mode of evolution. Journal of Molecular
Evolution, 18: 225-239.
Bruford, M. W., Ciofi, C., Funk, S. M. 1998. Characteristics of Microsatellites. U:
Molecular Tools for Screening Biodiversity. Chapman & Hall, New York, pp.
202-205.
116
Literatura
Literatura
Derzhavin, A. N. 1934. Freshwater fishes from the south coast of the caspian.
Transactions Azerb. Otd. Zakavkaz. Filiala AN SSR, 7: 91-126.
Dodson, J. J., Gibson, R. J., Cunjak, R. A., Friedland, K. D., Garcia de Leaniz, C., Gross,
M. R., Newburym, R., Nielsen, J. L., Power, M. E., Roy, S. 1998. Elements in the
development of conservation plans for Atlantic salmon (Salmo salar). Canadian
Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 55: 312-323.
Dorofeeva, E. A. 1989. The basic principles of classification and phylogeny of the
salmonid fishes (Salmoniformes, Salmonoidei, Salmonidae). Biology and
Phylogeny of Fishes, (Korovina, V. M., ed.). St. Petersburg: Proceedings of
Zoologikal Institute, USSR Academy of Sciences (in Russian), pp. 5-16.
Dorofeeva, E. D. 1998. Systematics and distribution history of European Salmonid fishes
of the genus Salmo. Journal of Ichthyology, 38: 419-429.
Dowling, T. E., Moritz, C., Palmer, J. D., Riesberg, L. H. 1996. Nucleic AcidsIII:
Analysis of fragments and restriction sites. V. Molecular systematics. Sunderland,
Sinauer, pp. 249-320.
Duftner, N., Weiss, S., Medgyesy, N., Sturmbauer, C. 2003. Enhanced phylogeographic
information about Austrian brown trout populations derived from complete
mitochondrial control region secuences. Journal of Fish Biology, 62: 427-435.
Durand, J. D., Bianco, P. G., Laroche, J., Gilles, A. 2003. Insight into the origin of
endemic Mediterranean ichthyofauna: Phylogeography of Chondrostoma Genus
(Teleostei: Cyprinidae). The Journal of Heredity, 94: 315-328.
Durand, J. J., Persat, H., Bouvet, Y. 1999. Phylogeography and postglacial dispersion of
the chub (Leuciscus cephalus) in Europe. Molecular Ecology., 8: 989-998.
Economidis, P. S., Banarescu, P. M. 1991. The distribution and origins of freshwater
fishes in the Balkan peninsula, especially in Greece. Internationale revue der
gesamten hydrobiologie, 76: 257-283.
Edwards, A., Hammond, H. A., Jin, L., Caskey, C. T., Chakraborty, R. 1992. Genetic
variation at five trimeric and tetrameric tandem repeat loci in four human
population groups. Genomics, 12: 241-253.
Ekman, S. 1957. Zoogeography of the sea. Sidgwic & Jackson, London, pp. 417.
Elliott, J. M. 1994. Quantitative ecology and the brown trout. Oxford Series in Ecology
and Evolution, Oxford University Press, Oxford, Great Britain, 286 pp.
Englbrecht, C. C., Freyhof, J., Nolte, A., Rassmann, K., Schliewen, U., Tautz, D. 2000.
Phylogeography of the bullhead Cottus gobio (Pisces: Teleostei: Cottidae)
suggests a pre-Pleistocene origin of the major central European populations.
Molecular Ecology, 9: 709-722.
118
Literatura
Estoup, A., Angers, B. 1998. Microsatellites and minisatellites for molecular ecology:
Theoretical and empirical considerations. In Carvalho, G.R. (ed.). Advances in
Molecular Ecology. IOS Press, Amsterdam, pp. 55-86.
Estoup, A., Presa, P., Krieg, F., Vaiman, D., Guyomard, R. 1993. (CT)n and (GT)n
microsatellite: a new class of genetic markers for Salmo trutta L. (brown trout).
Heredity, 71: 488-496.
Estoup, A., Rousset, F., Michalakis, Y., Cornuet, J.-M., Adriamanga, M., Guyomard, R.
1998. Comparative analysis of microsatellite and allozyme markers: a case study
investigating microgeographic differentiation in brown trout (Salmo trutta).
Molecular Ecology, 7: 339-353.
Ferguson, A. 1989. Genetic differences among brown trout, Salmo trutta L., stocks and
their importance for the conservation and menagment of the species. Freshwater
Biology, 21: 35 - 46.
Ferguson, A., Fleming, C. C. 1983. Evolutionary and taxonomic significance of protein
variation in the brown trout (Salmo trutta L.) and other salmonid fishes. In Protein
Polymorphism: Adaptive and Taxonomic Significance, Vol. 24 (Oxvord, G. S. &
Rollinson, D., eds) London: Academic Press, pp. 84-99.
Ferguson, A., Mason F. M. 1981. Allozyme evidence for reproductively isolated
sympatric populations of brown trout Salmo trutta L. in Lough Melvin, Ireland.
Journal of Fish Biology, 18: 629-642.
Ferris, S. D., Berg, W. J. 1988. The utility of mitochondrial DNA in fish genetics and
fishery managment. V: Population genetics and fishery management. Seattle,
Washington press, pp. 277-299.
Fontaine, P. M., Dodson, J. J. 1999. An analysis of the distribution of juvenile Atlantic
salmon (Salmo salar) in nature as a function of relatedness using microsatellites.
Molecular Ecology, 8: 189-198.
Ford-Lloyd, G. 1996. Measuring genetic variation using molecular markers. University of
Brimingham, Kevin Painting, IPGRI, Rome.
Frankel, O. H. 1970. Sir William Macleay memorial lecture 1970. Variation - the essence
of life. Proceedings of the Linneana Society of New South Wales 95: 158-169.
Frankel, O. H. 1974. Genetic conservation: our evolutionary responsibility. Genetics, 78:
53-65.
Frankel, O. H., Soul, M. E. 1981. Conservation and evolution. Cambridge University
Press, Cambridge, pp. 327.
Garcia-Marin, J. L., Jorde, P. E., Ryman, N., Utter, F., Pla, C. 1991. Management
implications of genetic differentiation between native and hatchery populations of
brown trout (Salmo trutta) in Spain. Aquaculture, 95: 235-249.
119
Literatura
Garcia-Marin, J. L., Pla C. 1996. Origins and relationships of native populations of brown
trout (Salmo trutta) in Spain. Heredity, 76: 313-323.
Garcia-Marin, J. L., Utter, F. M., Pla, C. 1999. Postglacial colonization of brown trout in
Europe based on distribution of allozyme variants. Heredity, 82: 46-56.
Gavrilovi, LJ., Duki, D. 2002. Reke Srbije. Zavod za ubenike i nastavna sredstva.
Beograd.
Gillham, W. N. 1994. Organelle genome organization and gene content. V: Organelle
genes and genomes. New York, Oxford University Press: 50-91.
Giuffra, E., Bernatchez, L., Guyomard, R. 1994. Mitochondrial control region and protein
coding genes sequence variation among phenotypic forms of brown trout Salmo
trutta from Northern Italy. Molecular Ecology, 3: 161-172.
Giuffra, E., Guyomard, R., Forneris, G. 1996. Phylogenetic relationships and
introgression patterns between incipient parapatric species of Italian brown trout
(Salmo trutta L. complex). Molecular Ecology, 5: 207-220.
Glenn, T. C. 1995. Microsatellite manual, Version 6, Unpubished manuscript, FTP:
onyx.si.edu/protocols/msatmanV#rtf
Goldstein, D. B., Pollock, D. D. 1997. Launching microsatellites: A review of mutation
processes and methods of phylogenetic inference. The Journal of Heredity, 88:
335-342.
Goldstein, D. B., Schltterer, C. 1998. Microsatellites. Evolution and Applications.
Oxford University Press, Oxford, pp. 352.
Gorjanovi Kramberger, D. 1891. Paleoihtioloki pilozi III. Rad Jugoslovenske
Akademije Znanosti i Umjetnosti, Zagreb, 106: 59-129.
Grozdanovi - Radovanovi, J. 2000. Citologija. Zavod za udbenike i nastavna sredstva,
Beograd.
Guyomard, R., Krieg, F. 1983. Electrophoretic variation in six populations of brown trout
(Salmo trutta L.). Canadian Journal of Genetics and Cytology, 25: 403-413.
Gyllensten, U., Wilson, A. C. 1988. Mitochondrial DNA of salmonids. V: Population
genetics and fishery management. Seattle, Washington press, pp. 301-317.
Hamilton, K. E., Ferguson, A., Taggart, J. B., Tomasson, T., Walker, A., Fahy, E. 1989.
Post-glacial colonization of brown trout, Salmo trutta L.: Ldh-5 as a
phylogeographical marker locus. Journal of Fish Biology, 35: 651-664.
Hansen, M. M., Loeschcke, V. 1994. Effects of releasing hatchery-reared brown trout to
wild trout populations. In Loeschcke, V., Tomiuk, J. & Jain, S. K. (eds.).
Conservation Genetics. Birkhuser Verlag, Basel. pp. 273-289
120
Literatura
Literatura
Hynes, R. A., Ferguson, A., McCann, M. A. 1996. Variation in mitochondrial DNA and
post-glacial colonisation of north-west Europe by brown trout (Salmo trutta L.).
Journal of Fish Biology, 48: 4-67.
ITIS, 2004. Integrated taxonomic information system. Smithsonian Institution,
Washington D. C. www.itis.usda.gov
Jevti, J. 1989. Ribarstvo. Praktikum. Nauna knjiga, Beograd.
Johnson, G. D. C., & Patterson, C. 1996. Relationshipses of lower euteleostean fishes. In:
Interrelations of Fishes. Stiassny , M. L. J., L. R. Parenti, G. D. Johnson (eds.).
Academic Press, San Diego pp. 251-332.
Jug, T. 2002. Genetska raznolikost soke postrvi (Salmo marmoratus) v Sloveniji.
Magistarsko delo, Medicinska fakulteta, Univerza v Ljubljani.
Karakousis, Y., Triantaphyllidis, C. 1990. Genetic structure and differentiation among
Greek brown trout (Salmo trutta L.) populations. Heredity, 64: 297-304.
Karaman, S. 1924. Pisces Macedoniae. Derzeit am institut Z. Erforschung und
Beksampfung D. Malaria, Trogir (Dalmatien) Split.
Karaman, S. 1937. Beitrag zur Kenntnis der Ssswasserfische Jugoslaviens. Glasnik
Skopskog naunog drutva, 18: 131-139.
Keith, P. 1998. Evolution des peuplements ichtyologiques de France et stratgies de
conservation. Ph. D. diss., Universit de Rennes I, France.
Kendall, A. W., Behnke, R. J. 1984. Salmonidae: developments and relationships. In
Ontogeny and Systematics of Fishes (Moser, H. G., ed.) American Society of
Ichthiologysts and Herpetologists Spetial Publikation, 1: 142-149.
Klykanov, V. A. 1975. Systematic interrelations of the smelts of genera Osmerus
Hypomesus of family Osmeridae. Ichthyologia, 7 (I): 31-40.
Kolombatovi, G. 1890. Notizie ittiologiche. Glasnik prirodnjakog drutva, Zagreb.
Kottelat, M. 1997. European freshwater fishes. An heuristic checklist of the freshwater
fishes of Europe (exclusive of former USSR), with an introduction for nonsystematists and comments on nomenclature and conservation. Biologia, Section
Zoology 52 Suppl. 5: 1-271.
Krieg, F., Guyomard, R. 1985. Population genetics of French brown trout (Salmo trutta
L.): large geographical differentiation of wild populations and high similarity of
domesticated stocks. Gntique, Slection et Evolution, 17: 225-242.
Krytufek B., Reed J. M. 2004. Pattern andProcess in Balakn Biodiversity - an Overview,
in:. Griffiths H.I., Krytufek B., Reed J.M. (Ed), Balkan Biodiversity, Pattern and
Process in the European Hotspot, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, pp.
203-217.
122
Literatura
123
Literatura
124
Literatura
125
Literatura
Nielsen, J. L. (ed.). 1995. Evolution and the aquatic ecosystem: defining unique units in
population conservation. American Fisheries Society Symposium 17, pp. 435.
Nilsson, J., Gross, R., Asplund, T., Dove, O., Jansson, H., Kelloniemi, J., Kohlmann, K.,
Lytynoja, A., Nielsen, E. E., Paaver, T., Primmer, C. R. Titov, S., Vasemgi, A.,
Veselov, A., st, T., Lumme, J. 2001. Matrilinear phylogeography of atlantic
salmon (Salmo salar L.) in Europe and postglacial colonization of Baltic sea area.
Molecular Ecology, 10: 89-102.
Norden, C. R. 1961. Comparative osteology of representative salmonide fish with
particular reference to the grayling (Thymallus arcticus) and phylogeny. Journal
of the Fisheries Research Board of Canada, 18: 679-791.
Oakley, T. H., Phillips, R. B. 1999. Phylogeny of salmonine fishes based on growth
hormone inrons: Atlantic (Salmo) and Pacific (Oncorhynchus) salmon are not
sister taxa. Molecular Phylogenetics and Evolution, 11: 381-393.
Ocokolji, M. 1987. Visinsko zoniraje voda u slivu Velike Morave i neki aspekti njihove
zatite. Posebna izdanja Srpskog geografskog drutva. Sveska 64, Beograd.
Odak, T. 2004. Molekularno bioloka obiljeja endemske mekousn pastrve
(Salmothymus obtusirostris salontiana). Magistarski rad, Agronomski fakultet,
Sveuilita u Zagrebu.
Oleynik, A. G. 1997 Molecular phylogeny of salmonid fishes: concordance of results
from nuclear and mitohondrial DNA analyses. Genetika, 33: 229-234 (in Russian).
Osinov, A. 1984. Zoogeographical origins of brown trout , Salmo trutta (Salmonidae):
data from biochemical genetic markers. Journal of Ichtyology., 24: 10-23.
Osinov, A. 1989. Brown trout (Salmo trutta L., Salmonidae) in basins of the Black and
Caspian Seas: A population genetic analysis. Genetika, 24: 1523-1534.
Osinov, A. G. 1999. Salmonid fishes of the genera Salmo, Parasalmo, and
Oncorhynchus: genetic divergence, phylogeny, and classification. Journal of
Ichtyology, 39: 571-578.
Osinov, A., Bernatchez, L. 1996. Atlantic and Danubean phylogenetic groupings of
brown trout (Salmo trutta L.) complex: genetic divergence, evolution, and
conservation. Journal of Ichthyology, 36: 762-786.
Oxnard, C. E. 1978. One biologists view of morphometrics. Annual Review of Ecology
and Systematics, 9: 219-241.
Patarnello, T., Bargelloni, L., Caldara, F., Colombo, L. 1994. Cytohrome b and 16 rRNA
sequence variation in the Salmo trutta (Salmonidae, Teleostei) species coplex.
Molecular Phylogenetics and Evolution, 3: 69-74.
Paur, K. 1969. Divovske pastrve u jezeru Lokvare. Ribarstvo Jugoslavije, God. XXIV, 2,
Zagreb.
126
Literatura
Phillips, R. B., Matsuoka, M. P., Konon, I., Reed, K. M. 2000. Phylogenetic analysis of
mitochondrial and nuclear sequences supports inclusion of Acantholingua
ochridana in the genus Salmo. Copeia, 2: 546-550.
Phillips, R. B., Oakley, T. H. 1997. Phylogenetics relationships among the Salmoninae
based on nuklear and mitochondrial DNA sequences. In Molecular Systemaatics
of Fishes (Kocher, T. D. & Stepien, C. A.; eds), Academic Prees, San Diego pp.
145-162.
Phillips, R. B., Plate, K. A. 1991. Nuklear DNA and salmonid phylogenetics. Journal of
Fish Biology, 39 (Suppl. A): 259-275.
Pielou, E. C. 1979. Biogeography. Wiley, New York, pp. 351.
Poteaux, C., Beaudou, D., Berrebi, P. 1998. Temporal variations of genetic introgression
in stocked brown trout populations. Journal of Fish Biology 53: 701-713.
Poteaux, C., Bonhomme, F., Berrebi, P. 1999. Microsatellite polymorphism and genetic
impact of restocking in Mediterranean brown trout (Salmo trutta L.). Heredity, 82:
645-653.
Pov, M., Jesenek, D., Berrebi, P., Crivelli, A. J. 1996. Soka postrv Salmo trutta
marmoratus, Cuvier 1817, v poreju Soe v Sloveniji. Arles, Tour du Valat, pp.
65.
Pov, M., Sket, B. 1990. Nae sladkovodne ribe. Mladinska knjiga, Ljubljana, pp 85-86.
Queller, D. C., Strassmann, J. E., Hughes, C. R. 1993. Microsatellites and kinship. Trends
in Ecology and Evolution., 8: 258-288.
Rabrenovi, D., Kneevi, S., Rundi, Lj. 2003. Istorijska geologija. Rudarsko Geoloki
fakultet Univerziteta u Beogradu, Beograd.
Rage, J. C. 1997. Palaeobiological and palaeogeographical background of the European
herpetofauna. In: Atlas of Amphibians and Reptiles in Europe. Gasc, J. - P.,
Cabela, A., Crnobrnja - Isailovi, J., Dolmen, D., Grossenbacher, K., Haffner, P.,
Lescure, J., Martens, H., Martinez Rica, J. P., Maurin, H., Oliveira, M. E.,
Sofianidou, T. S., Veith, M. & Zuiderwijk, A. (Eds.). Paris: Societas Europaea
Herpetologica and Museum National d'Histoire Naturelle, pp. 23-27.
Rage, J. C., Roek, Z. 2003. Evolution of Anuran assemblages in the Tertiary and
Quaternary of Europe, in the context of palaeoclimate and palaeogeography.
Amphibia-Reptilia, 24: 133-167.
Riffel, M., Storch, V., Schreiber, A. 1995. Allozyme variability of brown trout (Salmo
trutta L.) populations across the Rhenanian-Danubian watershed in southwest
Germany. Heredity, 74: 241-249.
127
Literatura
Rgl, F., Steininger, F. F. 1983. Vom Zerfall der Tethys zu Mediterran und Paratethys. Die
neogene Palogeographie und Palinspastik der zirkum - mediterranen Raumes.
Annalen des Naturhistorischen Museum Wien A 85, 135-163.
Roy, K., Valentine, J. W., Jablonski, D., Kidwell, S. M. 1996. Scales of climatic
variability and time averaging in Pleistocene biotas: implications for ecology and
evolution. Trends in Ecology and Evolution, 11: 458-453.
Ryder, O. A. 1986. Species conservation and systematics: the dilemma of subspecies.
Trends in Ecology and Evolution, 1: 9-10.
Ryman, N. 1983. Patterns of distribution of biochemical genetic variation in salmonids:
differences between species. Aquaculture, 33: 1-21.
Ryman, N. 1991. Conservation genetics considerations in fishery management. Journal of
Fish Biology, 39 (Supplement A): 211 - 224.
Ryman, N., Allendorf, F. W., Sthl, G. 1979. Reproductive isolation with little genetic
divergence in sympatric populations of brown trout (Salmo trutta). Genetics, 92:
247-262.
Ryman, N., Jorde, P. E., Laikre, L. 1995. Supportive breeding and variance effective
population size. Conservation Biology, 9: 1619-1628.
Ryman, N., Sthl, G. 1980. Genetic changes in hatchery stocks of brown trout (Salmo
trutta). Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 37: 82-87.
Ryman, N., Utter, F. (eds.). 1987. Population Genetics and Fishery Management.
Washington Sea Grant Publications/University of Washington Press, Seattle and
London, pp. 420.
Ryman, N., Utter, F., Laikre, L. 1995a. Protection of intraspecific biodiversity of
exploited fishes. Reviews in Fish Biology and Fisheries, 5: 417-446.
Saiki, R., Scharf, S., Faloona, F., Mullis, K. B., Horn, G. T., Erlich, H. A., Arnheim, N.
1988. Enzymatic amplification of b globin genomic sequences and restriction
site analysa for diagnosis of sickle cell anemia. Science, 4: 1350-1354.
Saunders, R. L., Schom, C. B. 1985. Importance of the variation in the life history
parameters of atlantic salmon (Salmo salar). Canadian Journal of Fisheries and
Aquatic Sciencis, 42: 625-618.
Schltterer, C. 1998. Genome evolution: Are microsatellites really simple sequences?.
Current Biology, 8: 132-134
Schmidt, D. Y. 1947. Migrations of Fishes. USSR Academy of Sciences, Leningrad.
Schneider, S. Roessli, D. Excoffier, L. 2000. Arlequin: A software for population genetics
data analysis. Ver 2.000. Genetics and Biometry Lab, Dept. of Anthropology,
University of Geneva.
128
Literatura
129
Literatura
130
Literatura
Thompson, J. D., Gibson, T. J., Plewniak, F., Jeanmougin, F., Higgins, D. G. 1997. The
Clustal_X windows interface: flexibile strategies for multiple sequence aligment
aided by quality analysis tools. Nucleic Acid Research, 25, 24: 4876-4882.
Thunell, R. C., Williams, D. F. 1983. Paleotemperature and paleosalinity history of the
eastern Mediterranean during the Late Quaternary. Palaeogeography,
Palaeoclimatology, Palaeoecology, 44: 23-39.
Tomkinson, A. E., Linn, S. 1986. Purification and properties of a strand specific
endonuclease from mouse cell mitochondria. Nucleic Acid Research, 14: 95799593.
Utter, F. M. 1981. Biological criteria for definition of species and distinct intraspecific
populations and salmonids under the U.S. Endangered Species Act of 1973.
Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 38: 1626-1635.
Utter, F., Aebersold, P., Winans, G. 1987. Interpreting genetic variation detected by
electrophoresis. In Ryman, N. and Utter, F. (eds.) Population Genetics and Fishery
Management. Washington Sea Grant Program/University of Washington Press,
Seattle, USA.
Villinger, E. 1986. Untersuchungen zur Flussgeschichte von Aare-Donau/Alpenrhein und
zur Entwicklung des Malm-Karts in Sudwestdeutschland. Germany.
Vladimirov, V. I. 1944. Brook from of Sevan trout: Salmo ischchan Kessler morpha
alabalach nova. Izv Akademy Nauk Arm. SSR, 3: 61-72.
Vladimirov, V. I. 1948. Brook trout in Armenia and its relationship to other
representatives of the Salmo genus. Transactions sevan Gigrobiology Stantsii., 10:
87-178.
Vladykov, V. D. 1963. A review of salmonid genera and their broad geographical
distribution. Transaction of the Royal Society of Canada, Series IV, Section III, 1:
459-504.
Vollestad, L. A., Hindar, K. 1997. Developmental stability and environmental stress in
Salmo salar (Atlantic salmon). Heredity, 78: 215-222.
Vukovi, T., Ivanovi, B. 1971. Slatkovodne ribe Jugoslavije. Zemaljski muzej BIH,
Sarajevo.
Waples, R. S. 1991. Genetic interactions between hatchery and wild salmonids - lessons
from the Pacific Northwest. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences,
48 (Suppl. 1): 124-133.
Waples, R. S. 1991a. Pacific salmon, Oncorhynchus spp., and the definition of "species"
under the Endangered species Act. US National Marien Fisheries Service, Marine
Fisheries Review, 53: 11-22.
Waples, R. S. 1995. Evolutionary significant units and the conservation of biological
diversity under the endangered species act. American Fisheries Society
Symposium, 17: 8-27.
131
Literatura
Weiss, S., Antunes, A., Schltterer, C., Alexandrino, P. 2000. Mitochondrial haplotype
diversity among Portuguese brown trout Salmo trutta L. populations: relevance to
the post-Pleistocene recolonization of northern Europe. Molecular Ecology, 9:
691-698.
Weiss, S., Schltterer, C., Waidbacher, H., Jungwirth, M. 2001. Haplotype (mtDNA)
diversity of brown trout Salmo trutta in tributaries of the Austrian Danube:
massive introgresion of Atlantic basin fish by man or nature. Molecular
Ecology, 10: 1241-1246.
Weissenbach, J., Gypapy, G., Dib, C., Vignal, A., Morissette, J., Millasseau, P., Vaysseix,
G., Lathrop, M. 1992. A second-generation linkage map of the human genome.
Nature, 359: 794-801.
Wheeler, A. 1992. Freshwater fishes of Britain and Europe. Rainbow Books, London, pp.
54-55.
Zhang, D.-X., Hewitt, G. M. 2003. Nuclear DNA analyses in genetic studies of
populations: practice, problems and prospects. Molecular Ecology, 12: 563-584.
132