Professional Documents
Culture Documents
Činjenica što držite ovu skriptu u rukama, svrstava vas u probranu grupu studenata koja se može
pohvaliti položenom fizikom. Nakon tog velebnog uspjeha stigla je i vaša najveća nagrada: mogućnost
upisa fizikalne kemije II. Zbog vrsnog poznavanja električnih strujnih krugova i ponašanja
transverzalnih valova već se smatrate magistrima farmacije i medicinske biokemije. Ipak, i fizikalnu II
valja položiti, a na tom putu stoji Veliki Viktor.
Unatoč buđenjima u cik zore četvrtkom, naporima koje je valjalo uložiti radi pronalaska slobodnog
mjesta u prepunoj predavaoni, te vrijednom i pedantnom praćenju nastave, EPR spektri i enzimska
inhibicija za vas su i dalje nepoznanica? Smatrate se studentom pseudo-drugog reda? Pitanja sa
Merlina vam tjeraju suze na oči? Tu mi stupamo na scenu!
Vrijedni sastavljači detaljno su odgovorili na svih 50 pitanja, te skriptu podijelili na dvije funkcionalne
cijeline. Prvih 32 pitanja ulaze u gradivo primjene spektroskopije, dok se posljednih 18 odnosi na srž
kemijske kinetike i koloidne kemije.
Autorski duo, jedan vođen profesionalnim ambicijama, a drugi dosadom, pripremio vam je pravu
intelektualnu poslasticu. U svega nekoliko dana strah od Velikog Viktora će se raspršiti kao Raman
zračenje na uzorku, a ocijena u indeksu pojavit će se kao apsorpcijske linije u spektru.
Autorski dvojac
1
1. Interakcija EM zračenja s materijom, apsorpcija i emisija zračenja, spektar EM zračenja
Spektroskopija proučava interakciju elektromagnetskog zračenja s materijom u procesima apsorpcije
i emisije. EM zračenje dualne je prirode – možemo ga opisati kao tok čestica fotona, ali i kao
transverzalan val sastavljen od električnog i magnetskog polja koja titraju međusobno okomito te
okomito i na sam smjer širenja vala. U interakciji mogu sudjelovati:
električno polje EM vala i električni dipolni momenti tvari – UV, Vis, IR spektroskopija
magnetsko polje EM vala i magnetski dipolni momenti tvari – NMR, ESR spektroskopija
Prema kvantnoj teoriji energija molekula je kvantizirana, tj. molekula može zauzeti samo neka
energetska stanja točno određenog iznosa (nisu joj dostupna sva stanja, već samo ona čija je energija
određena valnim funkcijama – orbitalama te molekule). Interakcijom tvari s fotonima EM zračenjem
omogućuju se prijelazi između tih energetskih stanja: prijelaz iz nižeg u više energetsko stanje
nazivamo apsorpcijom, dok se suprotan proces zove emisija. Svaka molekula može apsorbirati ili
emitirati samo onaj foton čiji je iznos energije točno jednak razlici energija između dva stanja koju ta
molekula može zauzeti. Bohr je ovu tvrdnju izrekao u svom postulatu: energija emitiranog ili
apsorbiranog fotona jednaka je razlici energija između konačnog i početnog stanja molekule.
Navedeni uvjet nužan je, ali nedovoljan, uvjet svake apsorpcije ili emisije te postoji niz dodatnih
izbornih pravila koja određuju dozvoljene (moguće) prijelaze. Kao rezultat interakcije zračenja i tvari
dobivamo apsorpcijske/emisijske spektre koji prikazuju ovisnost intenziteta EM zračenja o energiji
samog zračenja. Intenzitet najčešće prikazujemo preko apsorbancije koja je logaritam omjera
dolaznog i propuštenog intenziteta zračenja, dok energiju prikazujemo frekvencijom ( najčešće za
radio valove), valnom duljinom (za ultraljubičasto i vidljivo zračenje - UV/Vis) ili pak valnim brojem
(broj valova po određenoj duljini – za infracrveno IR zračenje). Sve se ove veličine mogu jednostavno
međusovno preračunavati.
izvora zračenja – deuterijska lampa (UV), halogena ili volframova lampa (Vis)
monokromatora – prizma ili optička rešetka koja razlaže bijelu svjetlost na pojedinačne
valne duljine kako bi dobili monokromatsku svjetlost
pukotine – omogućuje prolaz samo snopa zračenja uskog raspona valnih duljina
kivete – nosača uzorka načinjen od kvarcnog stakla propusnog za UV/Vis zračenje
sustav zrcala - zračenje razdvaja u dvije zrake od kojih jedna prolazi kroz referentnu, a
druga kroz ispitivanu otopinu
detektora – fotomultiplikator ili fotodioda
sustav elektronike - prikaz signala
Mjerno područje spektrometra je raspon frekvencija i izmjerenih intenziteta unutar kojeg je moguće
mjeriti spektar. Osjetljivost sperktrometra je najmanji intenzitet koji se može razlikovati od šuma, dok
je njegova rezolucija najmanja udaljenost između dvije linije u spektru koje još vidimo zasebno.
2
3. Apsorpcija elektromagnetskog zračenja, nužni uvjeti, Beer-Lambertov zakon
Prijelaz iz temeljnog u pobuđeno energetsko stanje nazivamo apsorpcijom, a da bi došlo do takvog
prijelaza molekula mora apsorbirati foton čija je energija jednaka razlici energija između pobuđenog
i temeljnog stanja molekule. Ovo je nužan uvjet svake apsorpcije i nazivamo ga Bohrovim
postulatom. Postoje i dodatni uvjeti za prijelaze koje nazivamo izbornim pravilima, a razlikuju se
ovisno o vrsti spektroskopije kojom se bavimo (rotacijska, vibracijska ili elektronska). Beer –
Lambertov zakon pokazuje da je odnos između apsorbancije i koncentracije tvari u otopini linearan
što pokazuje formula A c l , gdje je molarni koeficijent apsorpcije te je približni pokazatelj
intenziteta apsorpcije, l duljina puta zračenja kroz uzorak. Izmjerenoj absorbanciji na određenoj
valnoj duljini doprinosi svaka tvar koja apsorbira na toj valnoj duljini. Iz tog se razloga mjerenjem
apsorbancije može npr. odrediti koncentracija otopine čistog proteina, a ne smjese proteina (proteini
se međusobno razlikuju po Ɛ).
3
VELIK INTENZITET MALI INTENZITET
Velika razlika u broju čestica pobuđenog i temeljnog stanja omogućuje osjetljivo mjerenje (UV, Vis, IR
spektroskopija – većina čestica nalazi se u temeljnom stanju). Ako se i u pobuđenom stanju nalazi
mnogo čestica osjetljivost je slaba (NMR, EPR). Spektralne linije imaju određenu širinu koja je
posljedica Dopplerovog i kvantno mehaničkog efekta. Molekule plina i tekućine vrlo se brzo gibaju u
raznim smjerovima, a zbog tog gibanja izvora (čestice) u odnosu na promatrača (spektrometar) dolazi
do pomaka frekvencije apsorbiranog/emitiranog zračenja – Dopplerov efekt. Linija stoga predstavlja
superpoziciju (rezultantu) niza tako pomaknutih frekvencija. Kvantno mehanički efekt povezan je s
Heisenbergovim principom neodređenosti prema kojem je nemoguće sa sigurnošću istovremeno
odrediti položaj i brzinu neke čestice (širina linije određuje našu nesigurnost točnog položaja čestice).
4
6. Električni dipol i dipolni moment molekule
U električna svojstva molekule ubrajamo dipolne momente, polarizabilnost te indeks loma. Ona
opisuju sposobnost jezgri atoma da kontroliraju (drže na okupu) elektrone kada se molekula nađe u
vanjskom električnom polju. Električni dipol su dva točkasta naboja suprotnog predznaka udaljena za
neki l . Polarne su molekule sastavljene od atoma različite elektronegativnosti koji nejednako
privlače elektrone pa su njihovi krajevi blago pozitivno odnosno negativno nabijeni. Stoga sve polarne
molekule možemo shvatiti kao dva naboja suprotnog predznaka vezana na maloj udaljenosti, pa one
predstavljaju dipole. Kod takvih molekula elektronski omotač nije simetrično raspoređen oko jezgara
pa središta pozitivnog i negativnog naboja nisu na istom mjestu. Vektor koji ide iz težišta negativnog
prema težištu pozitivnog naboja nazivamo dipolnim momentom, a njegov iznos računamo po formuli
q l te izražavamo u jedinicama Debye, 1D 3,336 1030 Cm . Kod nepolarnih molekula stalni
dipolni moment molekule možemo zanemariti.
5
Prilikom prijelaza EM zračenja iz jednog sredstva u drugo dolazi do loma što je posljedica različite
brzine rasprostiranja zračenja u sredstvima različite optičke gustoće (gušće sredstvo čini val sporijim).
Prolaskom zračenja kroz neku tvar dolazi do induciranja dipolnog momenta molekula te tvari koje će
oscilirati istom frekvencijom kao i zračenje. No proces induciranja nije trenutan već traje određen
vremenski interval pa dolazi do pomaka u fazi oscilacija što dovodi do promjene pravca širenja vala, a
samim time i brzine vala. Indeks loma definiran je kao omjer brzine svjetlosti u vakuumu i u sredstvu,
a mjeri se refraktometrom iz graničnog kuta totalne refleksije.
Rotacijska energija kvantizirana je kutnom količinom gibanja što je opisano rotacijskim kvantnim
brojem J koji može poprimiti bilo koju cjelobrojnu pozitivnu vrijednost. Rotacijska energija stoga
iznosi E J ( J 1)hcB , gdje je B rotacijska konstanta. Da bi molekula apsorbirala EM zračenje i
prešla iz jednog rotacijskog energetskog stanja u drugo nužno je da ona ima stalni dipolni moment.
Nepolarne molekule stoga ne možemo proučavati uz pomoć rotacijske spektroskopije. Apsorpcija
zračenja uvijek se događa u mikrovalnom te rjeđe u infracrvenom području (IR spektar). Još jedan
uvjet za rotacijski prijelaz je tzv. izborno pravilo prema kojem su dozvoljeni samo oni prijelazi za koje
vrijedi J 1 . Prijelaz je dakle moguć samo u prvo susjedno energetsko stanje, bilo ono veće ili
manje energije od trenutnog. Dakle, uvjeti za rotacijsku spektroskopiju su:
6
10. Vibracijska spektroskopija, temeljne vibracije molekule i vibracijska energija, izborna pravila
Vibracijska energija potječe od deformacije kemijskih veza između atoma koje promatramo kao
harmonijske oscilatore. Sve atomske jezgre u molekuli titraju istom frekvencijom oko svojih
ravnotežnih položaja dok centar mase molekule ostaje nepromijenjen, a to titranje jezgara nazivamo
temeljnim vibracijama. Već je prije pokazano da je za opis temeljnih vibracija molekule potrebno
3N – 6 koordinata (za linearne molekule 3N - 5). Energija sadržana u vibracijama kvantizirana je
vibracijskim kvantnim brojem koji može poprimiti bilo koju pozitivnu cjelobrojnu vrijednost. Ona
iznosi E h ( 1 / 2) . Da bi molekula apsorbirala EM zračenje i prešla iz jednog vibracijskog
energetskog stanja u drugo nužno je da njezine vibracije uzrokuju promjenu dipolnog momenta (za
razliku od rotacijskog prijelaza kod kojeg je potreban stalni dipolni moment). Apsorpcija zračenja
uvijek se događa u infracrvenom području, a prema izbornom pravilu mogući su samo prijelazi za koje
je 1 (prva susjedna energetska stanja). Dakle, uvjeti za vibracijsku spektroskopiju su:
molekule moraju imati promjenjivi dipolni moment
1
12. IR i FTIR spektrometri osnovni principi rada, konstrukcija, mogućnosti mjerenja uzoraka
Uređaji kojima mjerimo IR spektar nazivaju se IR spektrometri, a prema konstrukciji ih možemo
podijeliti na konvencionalne instrumente s dvije zrake i FTIR spektrometre. FTIR spektrometar temelji
se na Fourierovoj transformaciji koja funkciju intenziteta signala o vremenu pretvara u funkciju
intenziteta o frekvenciji (spektar). Ovo nam omogućuje dobivanje konačnog signala superpozicijom
nekoliko mjerenja što za posljedicu ima veću osjetljivost i bolji odnos signala i šuma u finalnom
spektru. Svaki IR spektrometar sastoji se od:
izvora zračenja infracrvenog područja – Nernstov štapić (oksidi cirkonija, cerija ili itrija) i
GLOBAR (silicijev karbid na 1500 K)
monokromatora – omogućuje odabir samo određenih valnih duljina – optička rešetka kod
konvencionalnog, odnosno Michelsonov interferometar kod FTIR spektrometra (sustav
pokretnog i polupropusnog zrcala)
nosača uzorka (ovisno o agregatnom stanju uzorka) – najčešće kivete od KBr ili NaCl
ispunjene otapalom Nujolom koji je propustan za infracrveno zračenje (za plinovite uzorke u
kiveti dolazi do višestruke refleksije jer bi u protivnom njena duljina trebala biti preko 100 m)
detektora – mjeri intenzitet zračenja – najčešći su:
fotomultiplikator – temelji se na fotoelektričnom efektu, velika osjetljivost
fotodioda – jeftini poluvodiči od silicija ili germanija slabe osjetljivosti
termopar – temelji se na Seebeckovom efektu – između dva različita metala koji se
izlože temperaturnom gradijentu dolazi do pojave napona, vrlo slaba osjetljivost
7
13. IR spektri, interpretacija izmjerenog IR spektra
IR spektre čine apsorpcijske linije koje prikazuju vibracijske prijelaze molekule, a već smo prije pokazali
da su uvjeti za apsorpciju zračenja u IR području postojanje promjenjivog dipolnog momenta te da su
dozvoljeni samo prijelazi za koje je 1 . Pojedine funkcionalne skupine mogu ostvariti vibracijski
prijelaz neovisno o ostatku molekule što znači da apsorpcijske linije ne moraju nužno pripadati
vibracijskom prijelazu čitave molekule, već i prijelazu pojedine funkcionalne skupini.
Izostanak apsorpcijske vrpce na tipičnom mjestu neke funkcionalne skupine nužno znači da te skupine
nema u molekuli. Prisustvo apsorpcijske vrpce na mjestu tipičnom za određenu skupinu ne mora nužno
značiti da je ta skupina uistinu prisutna. Tek provjerom svih drugih potencijalnih funkcionalnih skupina
koje bi mogle zauzimati to mjesto možemo utvrditi o kojoj se skupini doista radi. IR spektroskopija
često se koristi prilikom određivanja strukture molekule (određivanje duljine, kuteva i jakosti veze).
15. Raman spektrometar, osnovni principi rada, konstrukcija, mogućnosti mjerenja uzoraka
Raman spektrometri sastavljeni su slično kao i IR spektrometri te se sastoje od od
izvora zračenja (LASER određene frekvencije), nosača uzorka (kivete), monokromatora (optička rešetka
ili Michaelisonov interferometar) i detektora. No, dok IR spektrometri mjere intenzitet apsorbiranog
zračenja, Raman spektrometri mjere intenzitet raspršenog zračenja. IR i Raman spektroskopije su
komplementarne što znači da se prijelazi koji se mogu detektirati u IR spektru ne mogu detektirati u
Raman spektru i obrnuto. Kod molekula s polarnim vezama vibracije će uzrokovati snažnu promjenu
dipolnog momenta molekule koja će rezultirati intenzivnom apsorpcijskom linijom u IR spektru.
Promjena polarizabilnosti kod takvih molekula tijekom vibracije je zanemariva pa je vibracijski prijelaz
u Raman spektru nezamjetan. Kod nepolarnih molekula se događa suprotno: vibracija gotovo uopće ne
mijenja dipolni moment, dok se polarizabilnost mnogostruko promijeni pa je u ovom slučaju IR spektar
neupotrebljiv.
8
16. Raman spektri, interpretacija izmjerenog Raman spektra
Raman spektroskopija se prvenstveno koristi prilikom određivanja strukture i svojstava spojeva, a od
iznimne su važnosti optički mikroskopi kombinirani s IR i Raman spektrometrima. Ovim uređajima
mogu se dobiti IR i Raman spektri s vrlo malih uzoraka (npr. dijelovi stanica) i detektirati spojevi u vrlo
malim koncentracijama i na vrlo malim površinama. Uvjeti za Raman spektroskopiju su:
9
Kao posljedica utjecaja konjugacije i otapala na kromoforne skupine javlja se:
19. UV-Vis spektrofotometar, osnovni princip rada, konstrukcija, mogućnosti mjerenja uzoraka
Mjerenje UV/Vis spektara omogućuju spektrofotometri koji se sastoje od:
izvora zračenja – deuterijska (UV), halogena ili volframova (Vis) ili Xenon lampa (UV/Vis)
monokromatora – prizma ili optička rešetka koja razlaže bijelu svjetlost na valne duljine
pukotine koja omogućuje prolaz samo snopa zračenja uskog raspona valnih duljina
kivete – nosač uzorka načinjen od kvarcnog stakla propusnog za UV/Vis zračenje
sustav zrcala - zračenje razdvaja u dvije zrake od kojih jedna prolazi kroz referentnu, a druga
kroz ispitivanu otopinu
detektora – fotomultiplikator ili fotodioda
sustav elektronike - prikaz signala
Spektrofotometar s jednom zrakom ne sadrži sustav zrcala već se jedan detektor nalazi prije same
kivete, dok spektrofotometar s dvije zrake sadrži sustav zrcala i jedan detektor smješten iza kiveta.
Kvalitativna primjena UV-VIS spektroskopije je detekcija poznatih i nepoznatih spojeva te određivanje
njihove strukture. Kvantitativna primjena spektroskopije je određivanje koncentracije poznatih
spojeva iz izmjerenih spektara korištenjem Beer - Lambertovog zakona.
10
20. Relaksacija molekule iz pobuđenog elektronskog i vibracijskog stanja, fosforescencija i
fluorescencija
Relaksacija je proces prelaska molekule iz pobuđenog elektronskog i vibracijskog stanja natrag u
temeljno stanje, a odvija se u dva stupnja – termičkoj degradaciji i spontanoj emisiji (fluorescenciji).
Prvo se odvija termička degradacija (pretvorba) kojom se energija molekule u pobuđenom
vibracijskom stanju prenosi na okolne molekule otapala. Okolne molekule ne mogu prihvatiti ogroman
iznos energije potreban za prijelaz iz pobuđenog u temeljno elektronsko stanje, nego prihvaćaju samo
energiju vibracijskih prijelaza dok se molekula ne nađe u temeljnom vibracijskom stanju pobuđenog
elektronskog stanja. Zatim dolazi do spontane emisije fotona iz najnižeg vibracijskog stanja pobuđenog
elektronskog stanja u temeljno elektronsko stanje sa svim njegovim vibracijskim stanjima. Ovaj proces
nazivamo fluorescencija i traje svega 109 s. Dio energije apsorbiranog fotona već se oslobodio
termičkom degradacijom, pa je energija emitiranog zračenja manja od one apsorbiranog zračenja. Zato
će i flourescencijski spektar biti pomaknut prema većim valnim duljinama od apsorpcijskog spektra.
Do fosforescencije dolazi kada se internom pretvorbom promijeni multiplicitet, tj. spin elektrona.
U jednoj se orbitali tada nalaze dva elektrona istog spina te je ukupno spinsko stanje jednako jedinici
(½ + ½), dok se inače u orbitali nalaze dva elektrona suprotnog spina pa je spinsko stanje jednako nuli
(½ – ½). Sustav sa spinskim stanjem 1 nazivamo tripletom, dok onaj čije je spinsko stanje 0 nazivamo
singletom. Pobuđena tripletna stanja imaju znatno manju energiju od pobuđenih singletnih stanja pa
će do fosforescencijskog prijelaza (iz pobuđenog tripletnog u temeljno singletno stanje) dolaziti
mnogo sporije nego do fluorescencijskog (iz pobuđenog singletnog u temeljno singletno stanje). Tako
fosforescencija može trajati i preko 1000 s, dok je fluorescencija znatno kraća te se prijelaz odvija za
109 s. Kako pobuđena tripletna stanja imaju znatno manju energiju od pobuđenih singletnih stanja,
fosforescencijski spektar pomaknut je prema većim valnim duljinama.
11
21. Fluorescencijski spektrometar, mogućnosti mjerenja i interpretacija fluorescencijskog spektra
Fluorescenciju i fosforescenciju mjerimo fluorescencijskim spektrometrom, a kako je intenzitet
fluorescencije relativna veličina on se razlikuje za različite instrumente. Zato mjerenje fluorescencije
zahtijeva kalibraciju instrumenta - proces korekcije mjernog instrumenta kojim se smanjuju
sistematske pogreške (mjere se veličine čije su vrijednosti već poznate i tako korigira instrument).
Prednosti fluorescencijske spektroskopije su velika osjetljivost i specifičnost, no mjerenje je često vrlo
složeno. Također, fluorescenciju pokazuje mali broj molekula i to najčešće planarni sustavi
aromatskih struktura s puno konjugiranih veza. Kod proteina fluorescencija uglavnom dolazi od
aromatske strukture triptofana, dok se fluorescencija nukleinskih kiseline ne može detektirati.
23. LASER, osnovni princip rada, svojstva laserskog zračenja, primjena LASERa u spektroskopiji
Laseri (light amplification by stimulated emission of radiation) su uređaji kod kojih dolazi do
stimulirane emisije monokromatskog, usmjerenog i koherentnog (u fazi) zračenja vrlo velikog
intenziteta. Osnovni je uvjet za stimuliranu emisiju da se većina molekula nalazi u metastabilnom
stanju, tj. pobuđenom stanju u kojem se molekula može nalaziti relativno dugo. Ako se samo dio
molekula nalazi u pobuđenom stanju dolazit će do spontane emisije čije zračenje neće biti
monokromatsko nego će biti sastavljeno od niza različitih valnih duljina. Do stimulirane emisije dolazi
inverzijom populacije koju postižemo dovođenjem energije - veći broj molekula mora se nalaziti u
pobuđenom, a ne u temeljnom stanju. Osnovni dijelovi lasera su laserski medij, rezonantna šupljina
te sustav za dovođenje energije laserskom mediju (lampe, drugi laseri i slično). Laserski medij je tvar
čije molekule pobuđujemo da bi kasnije emitirale zračenje u obliku kontinuiranog snopa fotona.
Može biti u sva tri agregatna stanja:
12
Rezonantna šupljina je prostor između dva zrcala unutar kojeg dolazi do višestruke refleksije i
interferencije fotona nastalih spontanom emisijom iz laserskog medija. Naime, nakon što laserskom
mediju dovedemo energiju za pobudu njegovih molekula u pobuđeno stanje dolazit će do spontane
emisije fotona raznih valnih duljina. Samo za fotone točno određene valne duljine višestrukom
refleksijom između zrcala rezonantne šupljine dolazit će do konstruktivne interferencije i formiranja
stojnog vala. Fotoni svih ostalih valnih duljina će destruktivno interferirati te ih možemo zanemariti.
Valne duljine fotona kod kojih dolazi do konstruktivne interferencije nazivamo rezonantni modovi
lasera, a one su određene udaljenosti između zrcala (jednadžba stojnog vala). Upravo će ti fotoni
višestrukom refleksijom između zrcala stimulirati prijelaz iz metastablinog u temeljno stanje, tj.
izazvat će stimuliranu emisiju. Jedno od zrcala nije sto posto reflektirajuće već propušta određen dio
zračenja što omogućuje izlazak fotona iz rezonantne šupljine. Upravo rezonantna šupljina omogućuje
da se stimuliraju fotoni točno određene valne duljine (rezonantni modovi lasera), smjera
rasprostiranja (okomito na zrcalo) i polarizacije. Lasersko je zračenje:
13
24. Optička aktivnost, polarizirano EM zračenje, optička rotacija, cirkularni dvolom, polarimetrija
Optička aktivnost je sposobnost tvari da promijeni svojstva propuštenog EM zračenja. Kod malih
molekula ona je posljedica asimetrije, dok je kod makromolekula ona posljedica sekundarne
strukture. Optička aktivnost povezana je s polarizabilnosti tvari (mjera deformiranja elektronskog
oblaka pod djelovanjem vanjskog električnog polja koje inducira dipolni moment). Elektromagnetsko
zračenje sastoji se od električnog i magnetskog polja koja titraju međusobno okomito te okomito na
smjer rasprostiranja vala. Ako ravnina titranja vektora električnog polja nije točno određena, tj.
ukoliko su sve prostorne orijentacije ravnine titranja jednako vjerojatne kažemo da je zračenje
nepolarizirano. Ako postoji točno određena ravnina titranja vektora električnog polja govorimo o
polariziranom zračenju. Kod takvog zračenja mijenja se samo njegov iznos, ali ne i ravnina titranja
vektora (moguća su dva smjera vektora u jednoj ravnini). Vrste polarizacije EM zračenja:
linearna – ravnina oscilacije vektora električnog polja je konstantna
cirkularna – ravnina oscilacije rotira u vremenu (moguće su D i L rotacija)
Optički aktivan uzorak koji ima različite indekse loma za D i L komponente cirkularno polariziranog
zračenja pokazuje cirkularni dvolom – lom svjetlosti na dvije zrake različite polarizacije. Do pomaka u
fazi dolazi kao posljedica različitih brzina rasprostiranja D i L komponenti polariziranog zračenja
(različiti indeksi loma uzorka za te komponente). Cirkularni dvolom izražava se u stupnjevima te ovisi
180 l (n L n D )
o razlici indeksa loma za D i L komponente: .
14
25. CD i ORD spektri, mogućnosti mjerenja i interpretacija CD i ORD spektara
ORD spektar prikazuje ovisnost optičke rotacije ili kuta optičkog zakretanja o valnoj duljini EM
zračenja. Optički aktivan uzorak koji apsorbira zračenje ima različite molarne koeficijente apsorpcije
za D i L komponente cirkularno polariziranog zračenja pokazuje cirkularni dikroizam kojeg definiramo
180( L D )
jednadžbom e . CD spektar prikazuje ovisnosti eliptičnosti ili cirkularnog
4
dikroizma o valnoj duljini EM zračenja. Prvo se mjeri apsorbancija uzorka s L, a onda s D zračenjem te
se prikazuje razlika u apsorbanciji.
Izmjereni CD spektar odražava sumu doprinosa pojedinih konformacijskih područja u proteinima, pa
se oni od velikog značenja u određivanju sekundarne strukture makromolekula. Ova je metoda vrlo
osjetljiva pa su CD spektri vrlo pouzdani za praćenje promjena konformacije proteina, npr. tijekom
vezanja liganda na protein, denaturaciji, promjeni otapala.
Vidimo da spin nemaju samo jezgre parnog broja protona i neutrona pa njih ne možemo koristiti u
NMR spektroskopiji (npr. 12C). Jezgra koja ima spinski kvantni broj I može u prostoru zauzeti 2I + 1
različitih orijentacija magnetskog momenta molekule, odnosno toliko različitih spinova. 1 H i 13C
jezgre imaju spinski kvantni broj ½ što znači da mogu zauzeti 2*½+1 odnosno dvije različite
orijentacije u prostoru. Magnetski moment jezgre je vektor koji pokazuje iznos i smjer „magneta“
jezgre (svaku jezgru sa spinom možemo magnetizirati). Prema Heisenbergovom principu
neodređenosti za poznati iznos momenta ne mogu se točno znati njegove koordinate pa vektor
prikazujemo kako leži negdje na stošcu. Kad nema vanjskog magnetskog polja jezgre su
nemagnetizirane pa su sve orijentacije magnetskog momenta jednako vjerojatne (jezgre se u
prostoru nalaze proizvoljno orijentirane). Ako jezgre stavimo u vanjsko magnetsko polje dolazi do
magnetizacije uzorka pa postoje samo 2I + 1 mogućih orijentacija (za 1H i 13C imamo dvije
orijentacije). Magnetski momenti tada su orijentirani u smjeru ili suprotno od smjera vanjskog
magnetskog polja, a ove dvije različite orijentacije imaju i različitu energiju – β spin veće energije i α
spin manje energije. Moguće je inducirati prijelaze između spinskih stanja dovođenjem EM zračenja
energije jednake razlici u energijama višeg i nižeg spinskog stanja. Taj prijelaz iz spinskog stanja niže u
stanje veće energije nazivamo rezonantnom apsorpcijom zračenja, a ona se događa samo ako je
frekvencija EM zračenja jednaka tzv. Larmorovoj frekvenciji – frekvenciji prijelaza između spinskih
B0
stanja koju opisuje jednadžba: L .
2
15
Vidimo da snažnije vanjsko magnetsko polje povećava Larmorovu frekvenciju pa nam je potrebno
zračenje veće energije. U magnetiziranom uzorku α i β spinovi rotiraju oko stošcu Larmorovom
frekvencijom, a upravo ta rotacija vektora magnetskog momenta inducira u detektorskoj zavojnici
unutar NMR spektrometra signal koji mjerimo.
27. 1H NMR spektar, kemijski pomak, konstanta zasjenjenja, interpretacija 1H i 13C NMR spektra
Vanjsko magnetsko polje ne djeluje jednakim iznosom na sve atome u molekuli već postoje različita
lokalna magnetska polja koja djeluje na pojedini atom. Ona su posljedica induciranja kružne struje
elektrona od vanjskog magnetskog polja, a ta struja stvara dodatni doprinos ukupnom magnetskom
polju koje djeluje na jezgru. Magnetsko polje koje stvaraju elektroni uvijek je suprotnog smjera od
onog vanjskog pa će efektivno magnetsko polje koje djeluje na jezgru uvijek biti manje od onog
primijenjenog. Efektivan iznos magnetskog polja koji djeluje na jezgru zato uvelike ovisi o
elektronskoj strukturi u neposrednoj okolini jezgre, a tu elektronsku okolinu oko jezgre opisujemo
konstantom zasjenjenja. Ona sadrži doprinose zasjenjenju od elektrona oko jezgre, ali i doprinose
susjednih funkcionalnih skupina te molekula otapala. Doprinosi od elektrona oko jezgre mogu biti:
diamagnetski: potječe od elektrona iz unutrašnjih orbitala molekule
paramagnetski: elektroni vanjskih ljusaka, kružni tok struje stvaraju koristeći prazne orbitale
Jezgre oko kojih se nalazi mnogo elektrona i elektron-donorskih funkcionalnih skupina bit će jako
zasjenjene te će inducirano magnetsko polje znatno smanjiti iznos primijenjenog vanjskog polja što
rezultira relativno slabim efektivnim magnetskim poljem. Kako je Larmorova frekvencija
proporcionalna efektivnom magnetskom polju, jako zasjenjene jezgre imat će malen iznos Larmorove
frekvencije. Ona se najčešće prikazuje kemijskim pomakom prema jednadžbi L 0 L 106 .
0
L
L0 je Larmorova frekvencija referentne jezgre, tj. standarda (najčešće se koristi tetrametilsilan).
Vidimo da je kemijski pomak proporcionalan Larmorovoj frekvenciji, a kako je ona proporcionalna
efektivnom magnetskom polju veći će kemijski pomak imati manje zasjenjene jezgre. NMR spektar
zapravo predstavlja ovisnost intenziteta rezonancijske apsorpcije upravo o kemijskom pomaku.
16
28. NMR spektrometar, osnovni principi rada i konstrukcija pulsnog NMR spektrometra, Fourierova
transformacija, FID
Moderni NMR spektrometar je pulsni spektrometar koji nizom vrlo kratkih i kontroliranih pulseva EM
zračenja radiovalnog područja omogućuje rezonantnu apsorpciju odgovarajućih frekvencija što
dovodi do reorijentacije spinskih stanja atomskih jezgara. Udio jezgri u pojedinim spinskim stanjima
E
N
možemo izračunati iz Boltzmannove razdiobe 1 e kT , a omjer populacija uglavnom je približno
N2
jednak jedinici. NMR spektrometar temelji se na Fourierovoj transformaciji koja funkciju intenziteta
signala o vremenu pretvara u funkciju intenziteta o frekvenciji (spektar). Spektar zadovoljavajućeg
odnosa intenziteta signala u odnosu na šum dobije se superpozicijom većeg broja mjerenja.
29. Fina struktura NMR spektra, spinsko sprezanje, kemijska i magnetska ekvivalencija
Fina struktura spektra je naziv za razdvajanje pojedinih rezonancijskih linija na više k u NMR spektru
što je rezulat međusobnog sprezanja atomskih jezgri. Do spinskog sprezanja dolazi uslijed
međusobne magnetske interakcije prostorno bliskih atomskih jezgri, a jakost interakcije izražavamo
eksperimentalnom konstantom spinskog sprezanja koja je neovisna o vanjskom magnetskom polju.
Porastom udaljenosti među atomima konstanta spinskog sprezanja se smanjuje. Kod molekule AXN,
ako obje jegre atoma A i X imaju spin I = 1/2 , dolazi do sprezanja jezgre A sa svakom od N jezgri X, a
raspodjela intenziteta slijedit će binomnu razdiobu, tj. Pascalov trokut (svaki signal se cijepa na dva
dijela). Tada umjesto jedne linije u NMR spektru dobijemo dvije linije dvostruke manjeg intenziteta
razdvojene za iznos konstante spinskog sprezanja J i centrirane oko vrijednosti pripadajućeg
kemijskog pomaka δ. Ukoliko je spin atoma I = 1, tada će se svaki signal cijepati na tri dijela prema
jednadžbi 2I + 1 koja predstavlja broj mogućih orijentacija atoma u prostoru.
17
Spinsko sprezanje može se spriječiti drugim snažnim pulsom na rezonantnoj frekvenciji jezgre čiji se
utjecaj na spinsko sprezanje želi smanjiti. Time se postiže da na mjerenu jezgru djeluje prosjek
utjecaja svih ostalih jezgri, a ne svaka od tih jezgri pojedinačno. Na ovaj se način dobivaju raspregnuti
NMR spektri. Za grupe atomskih jezgri iste simetrije i istog kemijskog pomaka kažemo da su kemijski
ekvivalentne. Ako te atomske jezgre imaju jednake i konstante sprezanja sa svim drugim jezgrama
one su i magnetski ekvivalentne. Na primjer: kod CH2F2 1H jezgre su kemijski i magnetski
ekvivalentne, dok su kod C2H2F2 1H jezgre kemijski, ali ne i magnetski ekvivalentne (jedna 1H jezgra
ima cis a druga trans interakciju s istim 19F). Kod molekule etanola pak imamo tri signala s tim da
CH3 protoni nisu magnetski ekvivalentni. Ipak, zbog brze rotacije oko C – C veze ralike u spinskom
sprezanju protona praktički je zanemarivo, pa ih mi ipak promatramo kao magnetski ekvivalentne.
30. Pulsne tehnike NMR mjerenja, spinska relaksacija, korelacijska spektroskopija, MRI
NMR spektroskopija temelji se na stimuliranju apsorpcijske rezonancije (prijelaz iz α u β spin)
atomskih jezgara nizom pulseva. Magnetske momente prikazujemo vektorima na stošcu, a kod
nemagnetiziranih uzoraka ti vektori imaju nasumičnu orijentaciju pa ne izazivaju nikakav signal.
Dovođenjem pulsa EM zračenja Larmorove frekvencije dolazi do rotacije vektora u xy ravnini što u
detektorskoj zavojnici inducira signal iz kojeg dobivamo NMR spektar. Dovođenjem pulsa povećava
se broj atoma s β spinom veće energije, no njegovim završetkom dolazi do relaksacije spina –
sponatanog prelaska iz β u α spin bez emisije zračenja (otpuštena energija predaje se okolini). Brzina
uspostave ravnoteže između spinskih stanja izražava se:
spinsko-okolinskim relaksacijskim vremenom T1 – vrijeme potrebno za uspostavu ravnoteže
između α i β populacija, odnosno za prijelaz iz β u α spina sve do ravnoteže populacija
spinsko-spinskim relaksacijskim vremenom T2 – vrijeme potrebno za uspostavu nasumične
orijentacije spinova, bez promjene α i β populacija
18
Spinska relaksacijska vremena T1 i T2 ovise o udaljenosti između pojedinih atomskih jezgri u molekuli
pa se na taj način mjere udaljenosti između atoma u molekuli. Korelacijska NMR spektroskopija je
dvodimenzionalna tehnika kod koje se spektar prikazuje pomoću dvije osi frekvencije i jednom osi
intenziteta signala. Najčešće korištena je tzv. COSY spektroskopija (COrrelation SpectroscopY) kojom
se određuju spinska sprezanja istih atoma u molekuli, dok se HETCOR spektroskopijom
(Heteronuclear CORrelation) utvrđuju konstante sprezanja različitih atoma. Ponekad kontinuiranim
EM zračenjem na rezonantnoj frekvenciji jedne jezgre može doći do promjene spinskih populacija i
promjene rezonancije susjedne jezgre, a ovu pojavu nazivamo nuklearni Overhauser efekt.
Magnetska rezonancija (MRI) je od iznimne važnosti u suvremenoj medicini jer omogućuje direktno
promatranje mekog tkiva in vivo. MRI se temelji na mjerenju intenziteta odabranog signala (najčešće
1H vode) uzorka smještenog u vanjsko magnetsko polje linearnog gradijenta jakosti. Puls je svaki
puta na drugoj frekvenciji pa se mjerenjem utvrdi niz intenziteta na različitim frekvencijama. Iz
intenziteta signala u x, y i z smjerovima rekonstrukcijom se dobije 3D slika objekta.
19
32. Hiperfina struktura ESR spektra, konstanta hiperfinog sprezanja, ESR spektar, spinske probe i
spinske stupice
Kao i kod NMR spektra, i kod ESR spektra prisutna je hiperfina struktura – razdvajanje apsopcijske
linije na više komponenti (linija). Ona je posljedica magnetske interakcije između spina elektrona i
magnetskog momenta atomskih jezgri atoma u molekuli. Umjesto jedne linije u ESR spektru dobiju se
dvije linije dvostruko manjeg intenziteta razdvojene za iznos hiperfine konstante sprezanja a i
centrirane oko g-vrijednosti radikala (vidi NMR hiperfina struktura). Konstanta hiperfinog sprezanja
ovisi o raspodjeli nesparenog elektrona oko jezgre.
Većina organskih radikala vrlo su nestabilni te ne traju dulje od nekoliko stotinki ili kraće. Iznimka su
derivati nitroksida koji pokazuju iznimnu stabilnost na sobnoj temperaturi te traju i dulje od 104 s.
Nitroksidi se koriste kao spinske stupice: radikal koji želimo mjeriti u otopini reagira s derivatom
nitroksida stvarajući nitroksid radikal koji je stabilno dovoljno dugo da se može detektirati ESR
spektrometrom. Spinska proba je stabilni radikal koji je kovalentno vezan za biomolekulu, pa njegov
ESR spektar odražava i svojstva biomolekule.
20
33. Brzina kemijske reakcije, mjerenje brzine kemijske reakcije, reakcijski mehanizam,
molekularnost
Određivanje koncentracija reaktanata ili produkata možemo vršiti dok se reakcije odvija,
ili pak naknadno, nakon što smo reakciju zaustavili u nekom trenutku t
Za određivanje mehanizma reakcije, bitan je pojam molekularnosti; molekularnost
predstavlja broj molekula koje sudjeluju u elementaronoj reakciji – tako reakcije mogu
biti unimolekularne, bimolekularne, trimolekularne,...
34. Zakon za brzinu kemijske reakcije, red reakcije, konstanta brzine kemijske reakcije, vrijeme
polureakcije
Definiramo doseg reakcije kao ukupnu promjenu množine određene specije podijeljenu s njenim
stehiometrijskim koeficijentom:
𝑛𝚥 − 𝑛𝚥ₒ
=
𝑣𝚥
Slijedi:
1 𝑑
𝑣=
𝑉 𝑑𝑡
Odnosno:
1 𝑑[𝐽]
𝑣=
𝑣𝚥 𝑑𝑡
21
Npr. za prije navedenu jednadžbu:
𝑣 = 𝑘[𝐴][𝐵]²
Red reakcije je jednak sumi eksponenata iznad koncetracija reaktanata u zakonu za brzinu
reakcije; on ne mora nužno odgovarati stehiometrijskim koeficijentima, niti mora biti cijeli broj
Brzine nekih reakcije potpuno su neovisne o koncentracijama reaktanata – to su reakcije
nultoga reda
Ako zakon za brzinu neke kemijske reakcije nije u svom standardnom obliku, 𝑣 =
𝑘[𝐴]ᵃ[𝐵]ᵇ... reakcija nema svoj ukupni red
Najčešći načini određivanja zakona za brzinu kemijske reakcije jesu metoda izolacije i
metoda početnih brzina
U metodi izolacije, koncentracije svih reaktanata osim jednog držimo u velikom suvišku,
pa njihovu promjenu tijekom reakcije zanemarujemo, odnosno koncetracije smatramo
konstantnima
Npr. A + 2B + 3C ...
Time reakciju svodimo na pseudo n-ti red (u ovom slučaju prvi), i možemo odrediti red reakcije
s obzirom na reaktanta A; postupak ponovimo za svaki od reaktanata i dolazimo do konačnog
zakona
U metodi početnih brzina, mjerimo samo početne brzine reakcija za nekoliko različitih
koncentracija mjerodavnog reaktanta, no koristeći ostale reaktante u suvišku, kao i kod
metode izolacije
Grafički prikaz gornje jednadžbe bit će pravac, koji pokazuje ovisnost logaritma početne brzine o
logaritmu početne koncentracije; odsječak na y-osi predstavlja logaritam pseudo-konstante, dok
nagib pravca predstavlja red reakcije s obzirom na mjerodavni reaktant
22
Kako je zakon za brzinu reakcije diferencijalna jednadžba,
Npr. A + 2B C
𝑑[𝐶]
𝑣= = 𝑘[𝐴][𝐵]²
𝑑𝑡
integriranjem istog možemo dobiti koncentracije reaktanata i produkata kao funkcije proteklog
vremena
Zakon glasi:
𝑑[𝐴]
𝑣=− =𝑘
𝑑𝑡
Integriranjem dobivamo:
[𝐴] 𝑡
𝑑[𝐴] = −𝑘𝑑𝑡 ∫[𝐴]ₒ 𝑑[𝐴] = −𝑘 ∫0 𝑑𝑡 [𝐴] = [𝐴]ₒ − 𝑘𝑡
Zakon glasi:
𝑑[𝐴]
𝑣=− = 𝑘[𝐴]
𝑑𝑡
Integriranjem dobivamo:
𝑑[𝐴] [𝐴] 𝑑[𝐴] 𝑡 [𝐴]
[𝐴]
= −𝑘𝑑𝑡 ∫[𝐴]ₒ [𝐴] = −𝑘 ∫0 𝑑𝑡 ln [𝐴]ₒ = −𝑘𝑡 [𝐴] = [𝐴]ₒ ∗ 𝑒 −𝑘𝑡
Zakon glasi:
𝑑[𝐴]
𝑣=− = 𝑘[𝐴]²
𝑑𝑡
Integriranjem dobivamo:
𝑑[𝐴] [𝐴] 𝑑[𝐴] 𝑡 1 1 [𝐴]ₒ
= −𝑘𝑑𝑡 ∫[𝐴]ₒ = −𝑘 ∫0 𝑑𝑡 − [𝐴]ₒ = 𝑘𝑡 [𝐴] =
[𝐴]² [𝐴]² [𝐴] 1+𝑘𝑡[𝐴]ₒ
U reakcijama drugog reda pad brzine je još jače naglašen nego kod prvog, te su i reakcije samim
time sporije, iako je inicijalna brzina puno veća
23
Vrijeme polureakcije za drugi red ovisno je o početnoj koncentraciji; zbog toga neke specije
niskih koncentracija mogu ostati nerazgrađene u prirodi kroz dugi niz godina, ukoliko se
raspadaju po zakonu drugoga reda
U nekim slučajevima reaktanti mogu dati više različitih produkata, kao npr. toulen, koji
nitriranjem može dati orto, meta ili para nitrotoluen
Takve reakcije nazivamo usporednim:
B ← A C
I tu je brzina reakcije:
𝑣 = 𝑘[𝐴] i 𝑣 = 𝑘 ′ [𝐵]
Koncentracija reaktanta A se istovremeno smanjuje i povećava:
𝑑[𝐴]
= −𝑘[𝐴] + 𝑘 ′ [𝐵]
𝑑𝑡
24
Konstante brzine za polaznu i povratnu reakciju su različite; u jednom trenutku,
koncentracije tvari A i tvari B su upravo tolike da kad svaku pomnožimo s k, odnosno k',
umnožak je isti; tada su brzine jednake, a reakcije je u ravnoteži
Koncentracija međuprodukta:
𝑑[𝐼]
= 𝑘₁[𝐴]ₒ ∗ 𝑒 −𝑘₁𝑡 − 𝑘₂[𝐼]
𝑑𝑡
Namještanjem na [I]ₒ=0 i integriranjem dobivamo:
𝑘₁
[𝐼] = (𝑒 −𝑘₁𝑡 − 𝑒 −𝑘₂𝑡 )[𝐴]ₒ
𝑘₂ − 𝑘₁
38. Korak koji određuje brzinu kemijske reakcije, reakcije iz predravnoteže, ustaljeno stanje,
relaksacijske metode
Ukoliko se kemijska reakcija sastoji od više koraka, možemo postaviti pitanje koji od njih
određuje brzinu reakcije
To je uvijek onaj najsporiji korak
Npr. A I P
Ukoliko je situacija obratna, odnosno k₂ >> k₁, tada nastupa tzv. ustaljeno stanje
Kod obične uzastopne reakcije kod koje je korak formacije produkta iz međuprodukta
sporiji od koraka pretvorbe reaktanta u međuprodukt, koncentracija međuprodukta
raste, doseže neki maksimum, a zatim opada kako se pretvara u produkt
Ukoliko je konstanta brzine k₂ >> k₁, tada međuprodukt čim nastane prelazi u produktm
a transformacija reaktanta u međuprodukt je najsporiji korak
U tom je slučaju koncentracija međuprodukta tijekom reakcija stalna i niska, nema njene
promjene:
𝑑[𝐼]
=𝑂
𝑑𝑡
25
Neke reakcije pokazuju i predravnotežu, ravnotežno stanje između reaktanata i
međuprodukta:
Npr. A + B ↔ I P
Predravnoteža može biti uspisatvljena samo ako je k₁' >> k₂, jer se inaće međuprodukt gubi;
aproksimacija kaže da je I P korak prespor da bi se utjecalo na predravnotežu
I sada vrijedi:
𝑑[𝑃] 𝑘₁
= 𝑘₂[𝐼] = 𝑘₂𝐾[𝐴][𝐵] = 𝑘[𝐴][𝐵], pri čemu je 𝑘 = 𝐾
𝑑𝑡 𝑘₁′
Promjena koncentracija specija tijekom relaksacije također je eksponencijalna; ako je k < k', x je
pozitivan pa dolazi do povećanja koncentracije reaktanta i smanjenja koncetracije produkta u
reakcijskoj, što je u skladu s očekivanjima
Teorija sudara objašnjava brzinu kemijske reakcijske mikroskopskim prikazom prirode jedne
bimolekularne A + B P reakcije:
Teorija kaže da je za uspješan, pretvorbeni sudar, najprije potrebna dovoljna količina
energije, odnosno energija aktivacije; time je konsantna proporcionalna udjelu čestica s
energijom većom ili jednakom od energije aktivacije:
𝐸ₐ
𝑘 ∝ 𝑒 −𝑅𝑇
Nadalje, brzine čestica su bitne, pa je konstanta brzine proporcionalna i izrazu za srednju
relativnu brzinu:
8𝑘𝑇
𝑘 ∝ √ 𝜋𝜇 , pri čemu je 𝜇 reducirana masa
Na kraju, konstanta je proporcionalnosti proporcionalna sudarnom presjeku:
𝑘 ∝ 𝜎 , pri čemu je 𝜎 = 𝜋𝑑2 = 𝜋(𝑟₁ + 𝑟₂)²
Brzina je proporcionalna koncentraciji reaktanata, jer veća koncentracija reaktanata znači veći
broj mogućih uspješnih sudara; konstanta je brzine neovisna o koncentracijama.
Eksperimentalni su rezultati pokazali nepoklapanje s teorijskim rezultatima, pa je uveden i
sterički faktor P koji će svoditi teorijske rezultate na eksperimentalne; on se objašnjava time da
se molekule zaista moraju sudariti uz povoljnu orijentaciju, a nijedna gore navedena veličina ne
uzima u obzir pojam orijentaciije; faktor P to je manji što je mehanizam reakcije složeniji.
Konačno dobivamo:
8𝑘𝑇 𝐸ₐ
𝑘 = 𝑃𝜎√ 𝑁ₐ𝑒 −𝑅𝑇
𝜋𝜇
Ponekad je P > 1 što nije u skladu s očekivanjima, jer je orijentacija u biti ta koja reducira
broj uspješnih sudara
27
Međutim, takva se situacija događa u reakcijama alkalnih elemenata, kada zbog njihovog
gubitka elektrona na velikog udaljenosti od drugog, jako elektronegativnog reaktanta,
dolazi do prividnog povećanja sudarnog presjeka; to nazivamo mehanizmom
harpuniranja
Drugi pristup tumačenju brzine kemijske reakcije zove se teorija prijelaznog stanja
Polazište te teorije jest da molekule reaktanata prelaze u produkte preko aktiviranog
kompleksa
Npr. A + B P
Prepostavljeni mehanizam je:
A + B C
C A + B
C P
Ravnotežna reakcija aktivacije jest prva reakcija, čija je konstanta:
[𝐶]
𝐾ₐ =
[𝐴][𝐵]
Posljednji je korak najsporiji i on određuje ukupnu brzinu kemijske reakcije; koncentracija
aktiviranog kompleksa određena je konstantom ravnoteže reakcije aktivacije:
𝑣 = 𝑘ₐ[𝐶]
Brzina prolaska kompleksa kroz prijelazno stanje proporcionalna je njegovoj vibracijskoj
frekvenciji, zato jer se kompleks raspada u produkt u trenutku kada se jedna od njegovih
oscilacija pretvori u translaciju:
𝑘ₐ = 𝜅𝜈 , pri čemu je κ transmisijski faktor
Energija vibracije, ε:
𝜀 = ℎ𝜈 = 𝑘𝑇
Pa vrijedi:
𝑘𝑇
𝜈 =
ℎ
To je jednadžba učestalosti raspada kompleksa na produkte, a k je Boltzmannov koeficijent
I sada vrijedi:
𝑑[𝐴]
− = 𝑘[𝐴][𝐵] = 𝑘ₐ[𝐶] = 𝑘ₐ𝐾ₐ[𝐴][𝐵]
𝑑𝑡
Odnosno:
𝑘𝑇
𝑘 = 𝑘ₐ𝐾ₐ , a kako je 𝑘ₐ = 𝜅 ℎ
Dobivamo Eyringovu jednadžbu:
𝑘𝑇
𝑘=𝜅 𝐾ₐ
ℎ
Prema Eyringu, brzina bilo koje reakcije određena je brojnošću aktiviranih kompleksa koji
prijeđu u jednoj sekundi preko barijere potencijalne energije; ta je brzina proporcionalna
koncentraciji kompleksa (sadržano u Kₐ) i prosječnoj brzini prijelaza kompleksa preko
energetske barijere (sadržano u ν, odnosno Kt/h)
Cilj je, koristeći se teorijom prijelaznog stanja, izraziti proces aktivacije pomoću
termodinamičkih funkcija:
Vrijede jednadžbe:
ₐ𝐺 𝑘𝑇
− = ln 𝐾ₐ ; 𝑘 = 𝜅 𝐾ₐ
𝑅𝑇 ℎ
Kombiniranjem tih dviju jednaždbi dobivamo:
𝑘𝑇 −ₐ𝐺
𝑘=𝜅 ∗ 𝑒 𝑅𝑇
ℎ
28
Ovo je Eyringova jednažba izražena pomoću termodinamičkih funkcija
Ovu relaciju nazivamo kinetičkim solnim efektom, on opisuje promjenu konstante brzine
reakcije u ovisnosti o promjeni ionske jakosti otopine, dok je k° vrijednost konstante brzine
reakcije za I=0
Tri su koraka reakcije; difuzija D i A kroz otopinu i sudar, uz nastajanje DA kompleksa, zatim
razmjena elektrona, te na kraju raspad kompleksa i difuzija iona u otapalo:
D + A ↔ DA kₐ, kₐ'
DA ↔ D+A- ke, ke'
D+A- D+ + A- kd
29
Jednadžba za brzinu ove kemijske reakcije je:
1 1 𝑘ₐ′ 𝑘ₑ′
= + (1 + )
𝑘 𝑘ₐ kₐkₑ 𝑘𝑑
Ovdje vrijedi aproksimacija ustaljenog stanja, jer je kd >> ke' pa možemo pisati:
1 1 𝑘ₐ′
= (1 + )
𝑘 𝑘ₐ 𝑘ₑ
Kinetički izotponi efekt predstavlja promjenu brzine kemijske reakcije kad je jedan ili
više atoma u reaktantu zamijenjen s nekim od svojih izotopoa
To je zapravo omjer konstanta brzina za reakciju s lakšim (l) i težim (h) izotopom:
𝑘(𝑙)
𝐾𝐼𝐸 =
𝑘(ℎ)
Npr., procij i deuterij:
D-H + A D + H-A
D-D + A D + D-A
𝑘(𝐻)
𝐾𝐼𝐸 =
𝐾(𝐷)
Primarni KIE javlja se kad dolazi do cijepanja ili stvaranja veze s izotopom (kao u procij-
deuterij primjeru)
Sekundarni KIE javlja se kad je izotop cijelo vrijeme vezan za molekulu jednog reaktanta
Sekundarni KIE su mnogo manji od primarnih! Ipak, jako su korisni u određivanju kojeg
je tipa nukleofilna supstitucija, jer kod SN1 reakcije oni iznose oko 1, a kod SN2 reakcije im
je vrijednost približno jednaka 0
30
44. Homogena kataliza, enzimska kataliza, Michaelis-Mentenov mehanizam, mjerenje početne
(inicijalne) brzine
Katalizatori su tvari koje ubrzavaju kemijsku reakciju nudeći alternativni energetski put
reakciji i time snižavajući potrebnu energiju aktivacije
Homogena kataliza je ona kataliza u kojoj je katalizator u istoj fati kao i reakcijska smjesa
Uzmimo za prijmjer reakciju raspada vodikovog peroskida, koja je bez katalize spora:
2 H2O2(aq) 2H2O(l) + O2(g)
U katalizi jodid ionima događaju se ovi koraci:
[H₃O₂⁺]
H3O+ + H2O2 ↔ H3O2+ + H2O 𝐾 = [H₂O₂][H₃O⁺]
H3O2+ + I⁻ HOI + H2O 𝑣 = 𝑘ₐ[ H₃O+ ][I − ]
HOI + H2O2 H3O⁺ + O2 + I⁻ brza reakcija
Drugi korak je najsporiji i određuje brzinu reakcije:
𝑑[𝑂₂]
𝑣= = 𝑘ₐ[𝐻₃𝑂⁺][𝐼⁻]
𝑑𝑡
Kombinirajući gornju relaciju s izrazom za konstantu ravnoteže prvog koraka dobivamo:
𝑑[𝑂₂]
𝑑𝑡
= 𝑘ₐ𝐾[𝐻₃𝑂⁺][𝐼⁻][𝐻₂𝑂₂], i odredimo 𝑘 = 𝑘ₐ𝐾
Konstanta brzine katalizirane reakcije bit će kₐK i povezana s nižom aktivacijskom energijom
preko konstante K
Što je Michaelisova konstanta manja, to je veći broj sudara, i enzimska je reakcija brža; vrijedi
relacija [E]ₒ=[E]+[ES], a kako je obično supstrat u velikom suvišku, vrijedi i [S]≈[S]ₒ, pa pišemo:
[𝐸]ₒ
[𝐸𝑆] =
𝐾𝑚
1+
[𝑆]ₒ
31
Kako je brzina enzimske reakcije:
𝑣 = 𝑘𝑏[𝐸𝑆]
Dobivamo Michaelis-Mentenovu jednadžbu:
𝑘𝑏[𝐸]ₒ
𝑣=
𝐾𝑚
1+
[𝑆]ₒ
Ako je [S]ₒ << Km:
𝑘𝑏
𝑣= [𝐸]ₒ[𝑆]ₒ
𝐾𝑚
Brzina enzimske reakcije ovisi isključivo o koncentraciji enzima. Gornji je izraz ujedno i vmax.
Kako je situacija najčešće takva, da je brzina neovisna o koncentraciji enzima, možemo preinačiti
jednadžbu:
𝑣𝑚𝑎𝑥
𝑣=
𝐾𝑚
1+
[𝑆]ₒ
Tada vrijedi:
𝑣𝑚𝑎𝑥
𝑣=
𝐾𝑚
1+
[𝑆]ₒ
A reorganizacijom dobivamo Lineweaver-Burk jednadžbu:
1 1 𝐾𝑚 1
= +( )
𝑣 𝑣𝑚𝑎𝑥 𝑣𝑚𝑎𝑥 [𝑆]ₒ
Katalitička efikasnost enzima je maksimalna kada je kb>>ka', tada je η=ka, pa je time maksimalna
efikasnost određena isključivo brzinom difuzije enzima prema supstratu u otopini, odnosno
raspadanje ES kompleksa natrag u enzim i supstrat je mnogo sporije od prelaska istog u enzim i
32
produkte; aproksimiramo da je ponovni nastanak enzima i supstrata nepostojan, i da svaki sudar
enzima i supstrata te tvorba ES kompleksa na kraju dovodi do stvaranja produkta
1. ukoliko je α>1, a α'=1, nastaje EI kompleks, dok se ESI ne javlja; inhibitor se veže samo za
goli enzim i sprječava njegovo vezanje za supstrat, ne veže se za već oformljeni kompleks
kompetitivna inhibicija
Nagib pravca ovisnosti recipročne vrijednosti brzine o recipročnoj vrijednosti
početne koncentracije supstrata strmiji je u inhibiranoj enzimskoj reakciji nego u
neinhibiranoj; razlog tomu je taj što zbog inhibicije koncentracija supstrata sporije
opada; umjesto da se supstrat troši vezanjem za enzim, on ostaje u otopini a na
enzim se veže inhibitor
33
Maksimalna vrijednost brzine je ista kao i kod neinhibirane enzimske reakcije, što je i
očekivano jer ES kompleks neometano prelazi u E i P konstantnom brzine kb
(inhibitor se u kompetitivnoj inhibiciji ne veže za kompleks)
2. ukoliko je α'>1, a α=1, nastaje ESI kompleks, dok se EI ne javlja; inhibitor se veže samo na
oformljeni ES kompleks i sprječava njegov prelazak u produkt, ne veže se za goli enzim
akompetitivna inhibicija
Nagib pravca ovisnosti recipročne vrijednosti brzine o recipročnoj vrijednosti
početne koncentracije supstrata ostaje isti kao i kod neinhibirane reakcije, zato jer
nikakav inhibitor ne ometa brzinu gubljenja supstrata; difuzija enzima i supstrata
kroz otopinu, njihov sudar i nastanak ES kompleksa odvija se neometano, inhibitor
se veže za samo kompleks i ometa prelazak u produkte, no supstrat je u tom trenutku
već potrošen
Maksimalna je vrijednost brzine je manja nego u neinhibirane reakcije; razlog tomu
je što ES kompleks ne prelazi neometano u E i P
3. ukoliko je i α>1 i α'>1 inhibitor se veže kako za goli enzim, tako i za ES kompleks
nekomepetitivna inhibicija
Smanjen je i nagib pravca (sporiji pad koncentracije supstrata zbog vezanja
inhibitora na goli enzim) i maksimalna brzina (ES kompleks ne prelazi neometano u
produkte, već ga napada inhibitor i sprječava dovršetak katalitičkog kruga)
Vrijednosti α, α', KI i KI' određujemo eksperimentalno; najprije izmjerimo KM i vmax za enzim bez
inhibicije, a nakon toga, dodavši poznatu koncentraciju inhibitora, iz oblika pravca odredimo α i
α', a potom računski i KI te KI'
Svaka čvrsta površina se može ponašati kao adsorbens, tvar koja adsorbira na sebe
druge kompenente, koje tada nazivamo adsorbendima
Koliko je neka tvar dobar adsorbens ovisi o svojstvima površine; površinu ispitujemo
fotoemisijskom spektroskopijom
34
Temeljne pretpostavke su:
1) Adsorbira se jedan sloj
2) Površina je uniformna
3) Sva su adsorpcijska mjesta ekvivalentna
4) Adsorpcijska moć jednog mjesta ne ovisi o zauzetosti susjednih mjesta, odnosno nema
interakcija između adsorbiranih molekula
Ravnoteža jest:
A(g) + M(s) ↔ AM
ka, brzina adsorpcije i ka', brzina desorpcije
𝑘ₐ
𝐾=
𝑘ₐ′
Ova formula vrijedi za ne-disocijativnu adsorpciju, odnosno adsorpciju pri kojoj molekula, nakon
što biva adsorbirana, ostane nepromijenjena; postoji i disocijativna adsorpcija, kada se molekula
prilikom adsorpcije razdvoji na atome, a tada je brzina adsorpcije, ali i desorpcije,
proporcionalna kvadratu slobodnih odnosno zauzetih adsorpcijskih mjesta, pa je konačna
formula:
√𝐾𝑝
𝜃=
1 + √𝐾𝑝
Tada zauzetost površine slabije ovisi o tlaku; iz obiju je formula vidljivo da porastom tlaka raste
prekrivenost površine, a to naglije raste što je K veći, odnosno što je brzina adsorpcije veća od
brzine desorpcije
Postoje slučajevi u kojima se ne adsorbira samo jedan sloj, već adsorbirana površina služi kao
adsorbens za idući sloj adsorbenda i tako dalje; takvu vrstu adsorpcije opisuje BET izoterma:
𝑉 𝑐𝑧
=
𝑉𝑚𝑜𝑛𝑜 (1 − 𝑧)[1 − (1 − 𝑐)𝑧]
Z=p/p*, pri čemu je p* tlak iznad sloja adsorbenda na adsorbensu, Vmono je volumen koji
odgovara jednoslojnoj površini, dok je c konstanta ovisna o termodinamičkim funkcijama
desorpcije i vaporizacije tekućeg adsorbenda:
𝛥𝑑𝑒𝑠𝐻°− 𝛥𝑣𝑎𝑝𝐻°
𝑐=𝑒 𝑅𝑇
36
Ion-dipolne interakcije nastupaju između iona i polarnih molekula sa stalnim dipolnim
momentom, te su jače od dipol-dipolnih zbog toga što samo jedna od dvije čestice može
pokazivati nepovoljnu orijentaciju
Inducirani dipol-dipol je tip interakcije koja nastupa kada jedna čestica sa stalnim
dipolnim momentom inducira dipol u drugoj čestici, koja je po prirodi neutralna, ali
polarizabilna
Ovakve interakcije još nazivamo i van der Waals-Debye interakcijama; one su neovisne o
temperaturi, a slabije su od dviju prethodno navedenih
Sve vrste van der Waalsovih interakcija neovisne su o identitetima molekula koje
sudjeluju u njima
Međutim, vodikova je veza karakteristična za A-H···B sistem, u kojemu su A i B jako
elektronegativni elementi sa slobodnim elektronskim parom, najčešće dušik, kisik ili
flour
Ovu vezu objašnjavamo molekulno orbitalnom teorijom, a ona kaže da u ovakvoj
interakciji nastaju tri delokalizirane orbitale, pri čemu svaki atom „donira“ po jednu
orbitalu
Te tri orbitale imaju pohraniti 4 elektrona: 2 elektrona iz A-H veze, te dva iz slobodnog
elektronkog para atoma B
Ti elektorni stalno skaču iz orbitale i orbitalu, te efektom delokalizacije sinuziju energiju
navedenog A-H···B sistema, čineći vodikovu vezu vrlo jakom
Π-interakcije još su jedan tip interakcija karakterističan za točno određen tip molekula
koje u istima sudjeluju
Kako i samo ime kaže, u njima sudjeluju molekule koje sadrže intramolekulske π-veze;
često su to aromatski sustavi
U takvim interakcijama, planarni π-sustavi leže jedan na drugom u paralelnom položaju
37
49. Koloidni sustavi, električni dvosloj, koagulacija i flokulacija koloidnih suspenzija, micele i
biološke membrane
Ukoliko je debljina električnog dvosloja manja od promjera kolodine čestice, rD < a, vrijedi:
𝐵 𝐴 ∗ 𝑎 ∗ 𝜁2 𝑠
𝑈=− + ln(1 + 𝑒 −𝑟𝐷 )
𝑠 2
A ukoliko je rD > a:
𝐵 𝐴 ∗ 𝑎2 ∗ 𝜁 2 𝑠
𝑈=− + ∗ 𝑒 −𝑟𝐷
𝑠 𝑅
Iz formula vidimo da što je udaljenost između površina dviju koloidnih čestica (s) manja,
to je i potencijalna energija manja; tako se prvi minumum potencijalne energije nalazi na
jako maloj razdaljini između dviju koloidnih čestica; čestice podliježu agregaciji i
taloženju, zvanom koagulacija
U slučaju kad je debljina električnog dvosloja vrlo mala u odnosu na promjer koloidne
čestice, minimum potencijalne energije može biti i na većim udaljenostima; tada se
stvaraju rahle nakupine, a proces nazivamo flokulacijom
Flokulacija je reverzibilna jer se flokulirani materijal vrlo lako redispergira; kod
koagulacije to nije slučaj
38
Hidrofilni krajevi su orijentirani prema polarnim molekulama otapala i time štite
hidrofobne repove u unutrašnjosti; u nepolarnim je otapalima situacija obratna pa
nastaju inverzne micele
39