Professional Documents
Culture Documents
net/publication/322393472
CITATIONS READS
0 367
3 authors, including:
Lalu Zulkifli
University of Mataram
41 PUBLICATIONS 204 CITATIONS
SEE PROFILE
Some of the authors of this publication are also working on these related projects:
MOLECULAR, BIOCHEMICAL AND BIOLOGICAL CHARATERIZATION OF RED AND BROWN MACRO ALGA IN WEST NUSA TENGGARA FOR ANTI-CANCER PROPERTIES View project
All content following this page was uploaded by Lalu Zulkifli on 10 April 2018.
52
JPPIPA: 3(2), Juli 2017
53
JPPIPA: 3(2), Juli 2017
55
JPPIPA: 3(2), Juli 2017
endospora
Analisis molekuler isolat bakteri endofit rRNA dengan ukuran ± 1324 bp setelah
Hasil penelitian memperlihatkan dibandingkan dengan DNA marker (100
adanya pita DNA penyandi gen 16S bp DNA ladder) (Gambar 2).
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9
1500 bp
1324 bp
1000 bp
700 bp
500 bp
Gambar 2. Hasil elektroforesis dari amplifikasi 16S rRNA isolat bakteri endofit kulit batang (KC)
tanaman cengkeh dengan ukuran pita DNA ± 1324 bp. M (DNA marker), 1 (KC1), 2
(KC2), 3 (KC3), 4 (KC5), 5 (KC6), 6 (KC7), 7 (KC8), 8 (KC9), 9 (KC10).
56
JPPIPA: 3(2), Juli 2017
Isolat_KC7
100
Isolat_KC8
100
Isolat_KC9
39
Isolat_KC3
Isolat_KC1
Isolat_KC10
49
24 Isolat_KC2
99 Isolat_KC5
NR_117946.1_Bacillus_amyloliquefaciens_strain_MPA_1034
98 NR_075005.1_Bacillus_amyloliquefaciens_subsp._plantarum_strain_FZB42
KP635214.1_Bacillus_subtilis_PanD37
NR_116022.1_Bacillus_amyloliquefaciens_BCRC_11601
99
NR_116017.1_Bacillus_subtilis_BCRC_10255
DQ993674.1_Bacillus_subtilis_BCRC_10058
EF433410.1_Bacillus_licheniformis_BCRC_11702
99
96 DQ993676.1_Bacillus_licheniformis_BCRC_15413
Isolat_KC6
93 FJ859700.1_Bacillus_pseudomycoides_BIHB_360
100 AY373357.1_Bacillus_mycoides_c2
99
EU871042.1_Bacillus_cereus_JL
68 EU513393.1_Bacillus_cereus_TMPSB-M20
56 KF010791.1_Bacillus_mycoides_B38V
L14016.1_Bacillus_sphaericus
Y15986.1_Clostridium_sp._RCel1
U81871.1_Pseudomonas_sp._BI*8
100 LC069032.1_Escherichia_coli_JCM_1649
100 KX500307.1_Klebsiella_sp._KSC_16S
0.05
Gambar 3. Pohon filogenetik berdasarkan sekuen gen 16S rRNA dari isolat- isolat bakteri
endofit kulit batang tanaman cengkeh.
Berdasarkan jarak genetik dan pohon penemuan sumber-sumber senyawa
filogenetik isolat bakteri endofit tanaman bioaktif yang dalam perkembangan lebih
cengkeh secara molekuler menunjukkan lanjut dapat dijadikan sebagai sumber
isolat bakteri endofit yang diperoleh penemuan obat untuk berbagai macam
termasuk genus Bacillus. Isolat bakteri penyakit. Menurut Ganiswara (2003), zat
endofit dari kulit batang tanaman cengkeh antimikroba harus mempunyai sifat
(Tabel 5), memiliki kekerabatan dengan B. toksisitas tinggi tetapi tidak untuk hospes.
amyloliquefaciens (isolat KC1, KC2, Menurut Djatmika (2007), bakteri
KC3, KC5, KC7, KC8, KC9, KC10) dan endofit efektif mengendalikan beberapa
Bacillus cereus JL (isolat KC6). patogen karena mempunyai kemampuan
Hasil penelitian menunjukkan isolat hidup pada permukaan dan masuk jaringan
bakteri endofit dari tanaman cengkeh daun sesudah jaringan inang, serta
mampunyai kemampuan untuk mendegradasi komponen dinding sel
menghambat bakteri isolat klinik yaitu S. dengan enzim hidrolitik (selulase,
mutan dan S. aureus. Kemampuannya pektinase, dan xilanase).
untuk menghambat karena adanya Penelitian Suryadi et al., (2015)
senyawa metabolit yang dimiliki isolat menunjukkan bahwa B. cereus 11UJ
bakteri endofit. Hal ini sesuai dengan menghasilkan 3 senyawa utama, yaitu
pernyataan Backman dan Sikora (2008), cyclolanostan, cyclohexyliden, dan
yaitu senyawa yang dikeluarkan mikroba stigmast. Metabolit sekunder yang
endofit berupa senyawa metabolit dihasilkan dari ekstrak bakteri B. cereus
sekunder yang merupakan senyawa 11UJ dapat menghambat pertumbuhan
bioaktif dan dapat berfungsi untuk cendawan R. solani dan P. oryzae.
membunuh patogen. Mikroba endofit B. amyloliquefaciens strain FZB42
memiliki prospek yang baik dalam diketahui mampu mensekresikan senyawa
57
JPPIPA: 3(2), Juli 2017
58
JPPIPA: 3(2), Juli 2017
59