Bohaterowie Akademii Pana Kleksa:

Tytułowy Ambroży Kleks 

Główny Ambroży Kleks 

Pierwszoplanowy:

Ambroży Kleks (bohater główny i tytułowy) – profesor Akademii, posiadający niezywkłe umiejętności

Adaś Niezgódka – 12-letni chłopiec,  narrator powieści, jeden z najpilniejszych uczniów Akademii,

Drugoplanowy

• szpak Mateusz – książę zamieniony w ptaka, którego pan Kleks kupił na targu; uczony szpak ; umiał
mówić, ale wymawiał tylko końcówki wyrazów,  nie zwracając uwagi na ich początek, doskonale
rozumiany przez pana Kleksa
• Alojzy Kukuryk – lalka skonstruowana przez golarza Filipa, niezwykle złośliwa; ożywiona przez pana
Kleksa zachowywała się tak, jak człowiek: chodziła, mówiła, dokuczała chłopcom i nie była posłuszna
profesorowi, ponieważ nie miała serca

Epizodyczny

• Anatol Kukuryk – uprzejmy, grzeczny chłopiec, przybył do Akademii razem z Alojzym

• Filip – fryzjer pana Kleksa, zaopatrujący go w piegi, twórca Alojzego – mechanicznej lalki przyjętej
na uczniaAkademii
• inni uczniowie Akademii – chłopcy, których imiona zaczynały się na literę „A” ; w Akademii było 
czterech Adamów, pięciu Aleksandrów, trzech Andrzejów, trzech Alfredów, sześciu Antonich, jeden
Artur, jeden Albert i jeden Anastazy, czyli ogółem dwudziestu czterech uczniów,