2. Dzieje szpaka Mateusza. 3. „Osobliwości” i tajemnice profesora. 4. Przygoda Adasia Niezgódki - wizyta w psim raju. 5. Lekcje w Akademii. 6. Obowiązki i zabawy uczniów. 7. Wycieczka do fabryki dziur i dziurek. 8. Sen Adasia o siedmiu szklankach. 9. Przybycie dwóch nowych uczniów: Anatola i Alojzego. 10.Ożywienie Alojzego przez pana Kleksa. 11.Uroczystość w Akademii: relacja pana Kleksa o życiu na Księżycu. 12.Niegrzeczne zachowanie Alojzego. Zniszczenie sekretów pana Kleksa. 13.Koniec działalności Akademii.
Szczegółowy plan wydarzeń
1. Adaś Niezgódka opisuje Akademię pana Kleksa 2. Wizyta Adasia w bajce o dziewczynce z zapałkami 3. Pomoc postaci w bajki o śpiącej królewnie i siedmiu braciach 4. Przyjaźń z Mateuszem 5. Historia Mateusza 6. Postanowienie Adasie – pomoc w znalezieniu guzika 7. Naprawa zepsutego tramwaju 8. Pan Kleks wysyła swoje oko na księżyc 9. Nauka w akademii 10. Pan Kleks gotuje obiad 11. Zabawa w poszukiwanie skarbów 12. Adaś opowiada o swojej wizycie w psim raju 13. Wyprawa do fabryki dziur i dziurek 14. Walka z muchami 15. Kłótnia Pana Kleksa z Filipem 16. Pierwsze zmiany w Akademii 17. Osuszenie stawu przez pana Kleksa 18. Powrót oka pana Kleksa z kosmosu 19. Pan kleks odczytuje sen Adasia o siedmiu szklankach 20. Nocna wizyta Filipa 21. Dwóch nowych uczniów 22. Prawda o Alojzym 23. Wielka uroczystość w Akademii pana Kleksa 24. Opowieść o księżycowych ludziach 25. Alojzy przepędza gości 26. Pożegnalna kolacja 27. Alojzy niszczy sekrety Pana Kleksa 28. Zemsta Filipa 29. Pożegnanie z Akademią pana Kleksa.