1 

um

Prokaryotes
Reading Assignment: pg. 16­20

Name:___________________________
SEM and TEM microscopes
Electron Microscope ­ Butterfly Wing
Prokaryotes
Transmission  Scanning 
Electron Microscope Electron Microscope

TEM image of E. coli bacteria

SEM image of a house ant
Transmission 
Electron Microscope
Electrons are sent through a thin 
slice of the specimen (hence 
transmission), creating an image 
that appears 'flat' and shows inner  TEM image of E. coli bacteria
details.
E. coli bacteria
DNA Plasmid
(from a bacteria)
mitochondria (and other cell parts)
Sinbis Virus
 Transmission  Scanning 
Electron Microscope Electron Microscope
Electrons are bounced off of the 
Electrons are sent through a thin  surface of a specimen (hence 
slice of the specimen (hence  scanning) that has been covered 
transmission), creating an image  in a gold/metal mist. This creates 
that appears 'flat' and shows inner  an image that appears '3D' and 
details. shows surface details.

SEM image of a house ant

TEM image of E. coli bacteria
Common 
House Ant
Snowflake
Fish Gills
Eye of a housefly
dust mite
(false color)
spider glands 
making silk
(false color)
hydrothermal
worm ­ marine
bluebottle fly
maggot
(false color)
 Transmission  Scanning 
Electron Microscope Electron Microscope
Electrons are bounced off of the 
Electrons are sent through a thin  surface of a specimen (hence 
slice of the specimen (hence  scanning) that has been covered 
transmission), creating an image  in a gold/metal mist. This creates 
that appears 'flat' and shows inner  an image that appears '3D' and 
details. shows surface details.

TEM image of E. coli bacteria
SEM image of a house ant
 Transmission  Scanning 
Electron Microscope Electron Microscope
Electrons are bounced off of the 
Electrons are sent through a thin  surface of a specimen (hence 
slice of the specimen (hence  scanning) that has been covered 
transmission), creating an image  in a gold/metal mist. This creates 
that appears 'flat' and shows inner  an image that appears '3D' and 
Light microscopes use light waves (400­700 nm in 
details. shows surface details.
size) to produce an image, meaning even the best 
light microscopes can only distinguish objects 
about 200 nm in size.
Electron microscopes use electrons (much smaller 
than wavelength of light) to produce an image, 
giving them a much better resolution and much 
higher magnification.
TEM image of E. coli bacteria
SEM image of a house ant
Resolution
shortest distance between two points on a specimen that 
can still be distinguished by the observer or camera system
Millimeters Micrometers Nanometers
(mm) (um) (nm)

Unaided Eyes 0.1 mm 100 um 100,000 nm

Light Microscope 0.0002 mm 0.2 um 200 nm

Electron Microscope 0.000001 mm 0.001 um 1 nm

Resolution
shortest distance between two points on a specimen that 
can still be distinguished by the observer or camera system
Millimeters Micrometers Nanometers
(mm) (um) (nm)

Unaided Eyes 0.1 mm 100 um 100,000 nm

Light Microscope 0.0002 mm 0.2 um 200 nm

Electron Microscope 0.000001 mm 0.001 um 1 nm

Magnification
the degree to which an object appears enlarged. Shown as 
"X", as in "10X", as there is no unit of magnification.

magnification =  measured length
actual length
The Invention of the Electron Microscope
Developments in scientific research follow improvements in apparatus ­ electron 
microscopes made a greater understanding of cell structure possible.
The second half of the 19th century improved light microscopes, allowing 
the discovery of single­celled organisms and bacteria. Chromosomes, 
mitosis, and gamete (sex cell ­ sperm/egg) formation were observed. 
Larger organelles, such as mitochondria, chloroplasts and the nucleus 
were discovered as well. Light microscopes cannot produce images 
smaller than 0.2 um, meaning many biological structures remained 
elusive.

The electron microscope was developed in Germany during the 1930's 
and was used in research in the 40's and 50's, allowing images of 
objects as small as 0.001 um (200x smaller). Biologists were surprised by 
the unexpected intricacies of the cell, and many previous ideas were 
proven to be wrong ­ the true structure of mitochondria is an example. 
Thus, the ultrastructure of cells was revealed to scientists, including 
ribosomes, lysosomes, and the endoplasmic reticulum.
 There are two types of cells:

prokaryotes eukaryotes
1­3 um um = micrometers 10­100 um
 There are two types of cells:

But actually, taking size into account,
they should look like...

prokaryotes eukaryotes
1­3 um um = micrometers 10­100 um
 this.

prokaryotes
1­3 um

prokaryotes
1­3 um
um = micrometers

eukaryotes
10­100 um
we are going to start 
by studying this one

prokaryotes
1­3 um

um = micrometers

eukaryotes
10­100 um
Prokaryotes
Prokaryotes
'before' 'nucleus'
 • they are smaller and simpler than eukaryotes
Prokaryotes • typically 1­3 um in size
'before' 'nucleus' • have no organelles ­ membrane­bound internal cell structures
• can only be unicellular (a single cell)
• divide by binary fission (splitting of cell)
• evolved first
• found almost everywhere (soil, water, air, skin, intestines, volcanic 
water pools)

TEM
SEM
membrane!!!

prokaryotes
1­3 um

um = micrometers

eukaryotes
10­100 um
 no membrane 
bound organelles

prokaryotes
1­3 um

prokaryotes
1­3 um
eukaryotes
um = micrometers
10­100 um
 • they are smaller and simpler than eukaryotes
Prokaryotes • typically 1­3 um in size
'before' 'nucleus'
• have no organelles ­ membrane­bound internal cell structures
• can only be unicellular (a single cell)
• divide by binary fission (splitting of cell)
• evolved first
• found almost everywhere (soil, water, air, skin, intestines, volcanic 
Examples Include: water pools)

This scanning electron  TEM
archaea bacteria micrograph (SEM) 
shows E. coli, a 
common type of 
bacteria.

SEM

 (pronounced Are­Kay­Ah)
 (pronounced Are­Kay­Ah)
Draw the 
ultrastructure of
E.coli  as an example 
prokaryote
E. coli is the classic 'model' microbe, 
used in many kinds of pathogenic and 
genetic research

1 um
Draw the 
ultrastructure of
E.coli  as an example 
prokaryote
E. coli is the classic 'model' microbe, 
used in many kinds of pathogenic and 
genetic research

1 um
The ultrastructure of E. coli 
as an example prokaryote flagellum
movement
E. coli is the classic 'model' microbe,  flagella plural
used in many kinds of pathogenic and 
genetic research 1 um
cytoplasm
liquid that holds all internal cell 
parts. contains ribosomes and 
other enzymes for metabolism

70s ribosomes
1 um
protein synthesis (creation)

plasmid
small, circular naked DNA segments containing a 
small number of useful, but not essential genes

pili
attachment to other surfaces, 
DNA transfer
nucleoid region
cell/plasma membrane area containing a single 
controls entry and exit  circular chromosome of 
of substances to cell naked, closed­loop DNA 
cell wall
protective coating, can be 
Gram­positive or Gram­negative
Which structures can you identify in this electron micrograph?

(b) A thin section through E. coli (TEM)
Which structures can you identify in this electron micrograph?

pili

nucleoid

cytoplasm
70s ribosomes
(b) A thin section 
cell/plasma  through E. coli (TEM)
membrane

cell wall

(a) A typical rod­shaped 
bacterium
 "all cells come from other cells"
Prokaryotes reproduce by binary fission
'two' 'splitting'
'before' 'nucleus'

Bacterial cells divide/clone themselves at 
a constant rate, resulting in exponential 
population growth. This is much simpler 
than mitosis in Eukaryotes.

Eventually resources become limited, 
resulting in the stationary phase. 
Antibiotics (penicillin) or lack of resources 
result in death and population decline. 

Can you explain why the line is straight 
even though the growth is exponential?
Draw and Annotate a Diagram of

Binary Fission
chromosomes are pulled to 
opposite sides of the dividing cell

cell grows and 
chromosome replicates 
semiconservatively into 
bacterium has
two identical copies
single closed­loop 
naked DNA 
chromosome

Division of the cytoplasm follows. Each new 
cell, called a daughter cell, contains one 
copy of the chromosome.

They are clones because they contain 
identical sets of DNA (genetically identical). 

This is asexual reproduction.