/
Najwyższy punkt w strukturze katalogów nosi nazwę katalogu głównego ( root
directory), jego symbolem jest :    /
/bin
Ten katalog Linux zawiera polecenia, które są używane przez superużytkownika i
zwykłych użytkowników.
/dev
Katalog ten zawiera pliki urządzeń i inne pliki specjalne
/boot
Katalog ten zawiera większość programów wymaganych podczas rozruchu systemu
Linux.
/etc
Katalog ten zawiera pliki konfiguracyjne, które są niezbędne zarówno do uruchomienia
systemu Linux, jak i zapewnienia jego poprawnej pracy.
/home
W katalogu tym występują podkatalogi przeznaczone dla poszczególnych użytkowników
korzystających z systemu. 
/lib
katalog ten zawiera pliki bibliotek wymaganych dla programów przechowywanych w
katalogach  /bin  i  /sbin.
/srv
folder linux zawierający dane o usługach (HTTP, FTP itp.) oferowanych przez system.
/mnt
Katalog ten jest używany do tymczasowego montowania systemów plików w Linuxie. 
/opt
Katalog ten może być, ale nie musi, używany w konkretnej dystrybucji Linuxa. Jest
przewidziany jako miejsce na aplikacje innych firm, lecz w praktyce większość tych
aplikacji, albo instaluje się w katalogu /usr/local, albo – jeżeli są zarządzane  jako
pakiety – w jakimś innym miejscu. Mimo to może okazać się, że aplikacja, z której
będziemy chcieli korzystać, utworzy lub wypełni katalog/opt i jego podkatalogi.
/proc
Katalog  /proc  jest używany do przesyłania danych do jądra Linuxa. W katalogu tym
występuje kilka plików tekstowych, które można przeglądać w celu uzyskania informacji
o systemie, takich jak wersja jądra czy dane o procesorze i objętości pamięci.
/root
Katalog  /root jest zazwyczaj wykorzystywany jako katalog domowy superużytkownika.
/sbin
W katalogu tym spoczywają kluczowe polecenia Linuxa służące do administrowania
systemem, mogą one być używane tylko przez użytkownika „root”. 
/tmp
W katalogu tym jest udostępnione miejsce dla systemu na przechowywanie plików
tymczasowych.
/usr
Katalog /usr zawiera pliki i programy używane przez wszystkie osoby pracujące w
systemie.
/usr/local
Podkatalog /usr/local (katalogu /usr) stanowi wyjątek od zasady, że nie dokonuje się
zmian w katalogu  /usr . Należy pamiętać, że w Linuxie system plików może być
montowany pod  dowolną nazwą katalogu. W rzeczywistości niektóre osoby przypisują
podkatalog  /usr/local do partycji innej niż używana przez katalog /usr . Wynika to z
faktu, że w wielu instalacjach Linuxa w podkatalogu  /usr/local jest instalowana
większość aplikacji innych firm. Oznacza to, że podkatalog  /usr/local może na początku
być pusty, a my wypełniamy go programami ściągniętymi z Internetu, kupionymi lub
otrzymanymi od kolegów.
/usr/src
W podkatalogu  /usr/src znajduje się zawsze kod źródłowy Linuxa.
/var
Katalog  /var to repozytorium (magazyn) Linuxa przeznaczone na dane zmienne.

/media
Katalog /media zawiera wszystkie nośniki wymienne

/sys
specjalny katalog, w którym przechowywane są informacje o urządzeniach widoczne z
jądra Linuksa.