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DNA Molecular Identification of Human Phenotypic Characteristics New Progress Over The Past Five Years
DNA Molecular Identification of Human Phenotypic Characteristics New Progress Over The Past Five Years
·综 述· ·人体表征分子鉴识专题·
人体表型特征的 DNA 分子鉴识——5 年新进展
孟昊天 1,兰琼 2,朱波峰 1,2
(1. 西安交通大学口腔医院 陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室,陕西 西安 710004; 2. 南方医科大
学法医学院,广东 广州 510515)
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81525015)
作者简介:孟昊天(1989—),女,博士,助理研究员,主要从事法医物证学研究;E-mail: menghaotian0803@126.com
通信作者:朱波峰,男,教授,主要从事法医物证学研究;E-mail:
zhubofeng7372@126.com
法 医 学 杂 志 2019 年 10 月 第 35 卷 第5期 · 513 ·
获得的结果基本一致。2018 年,
SPÓLNICKA 等[41]在早 准 确 性 的 进 一 步 提 高 ,有 赖 于 基 因 分 型 技 术 和 分 析
发、晚发型阿尔茨海默病及格雷夫斯病患者中进行甲 方法的改进,以及对人体身高调节机制认识的进一步
基化测序,利用来自 ELOVL2、C1orf132、KLF14、FHL2 深入。
和 TRIM59 这 5 个基因的 CpG 位点进行年龄推断,发
5 容 貌
现 ELOVL2 和 C1orf132 基因相关标记推断准确性不受
上 述 疾 病 影 响 ,实 用 性 较 高 。 同 年 ,ALIFERI 等 [42] 基 面 部 容 貌 是 识 别 个 体 最 重 要 的 EVC ,从 DNA 中
于 12 个 DNA 甲基化位点的高通量测序数据综合评估 推断个体特异性面部容貌对案件调查有很大的帮
了均方根误差和具有多项式函数模型的支持向量机 助。基于 DNA 进行面部容貌推断的研究起步相对较
模型在年龄推断中的效能,发现支持向量机模型对年 晚,直到 2014 年才出现了利用 DNA 进行人脸推断的
龄 推 断 适 用 性 更 高 。 FREIRE-ARADAS 等 利 用 甲 [43]
系统研究[50-51]。
基化芯片数据在 2~18 岁儿童及青少年中研究 DNA 甲 2016 年,ADHIKARI 等 [52] 利用 GWAS 评估了 14 种
基化水平与年龄的相关性,发现 KCNAB3 基因与儿童 面部特征,发现 4 个基因组区域的 SNP 位点与 3 种鼻部
及青少年期 DNA 甲基化水平高度相关,为上述年龄 特征显著相关:鼻小柱倾斜(4q31),鼻梁宽度(6p21),
段个体年龄推断的潜在标志物。 以及鼻翼宽度(7p13 和 20p11)。同时还发现,2q12 区
此外,国内也有诸多研究人员展开了相关研究并 域的 SNP 位点与颏突形态相关,PAX3 基因中 SNP 位
取得了重要成果。2018 年,
FENG 等 基于 EpiTYPER [44]
点与鼻根位置的相关性与既往研究报道一致。同年,
系统(美国 Agena Bioscience 公司),在中国汉族男性 SHAFFER 等 [53] 通过全基因组关联荟萃分析及三维面
群体中筛选出 9 个 CpG 位点构建年龄推断模型,模型 部 图 像 标 志 点 测 量 发 现 与 颅 面 基 本 宽 度(14q21.1、
的 MAD 为 2.89 岁(决定系数 R2 值达到 0.92)。2019 年, 20q12)、眼间距(1p13.3、Xq13.2)、鼻宽(20p11.22)、鼻
李 姗 飞 等 [45] 基 于 EpiTYPER 系 统 检 测 21 个 年 龄 相 关 翼长度(14q11.2)等面部形态相关的基因区域,进一步
CpG 位点,应用其中 8 个高度相关位点构建年龄推断 证明颅面功能相关基因区域内的常见变异与人类生理
模型,在北方汉族男性群体中 MAD 为 2.69 岁。 性面部形态差异相关。 2017 年,LEE 等 [54] 通过 GWAS
4
发现与三处面部区域形态相关的基因区域,其中包括
身 高 两 个 新 发 现 的 与 中 面 部 高 度(PARK2)、上 唇 中 高 度
身高是人类个体间最明显的差异之一。研究结 (FREM1)相 关 的 基 因 区 域 。 2018 年 ,CHA 等 [55] 基 于
果表明,身高受到遗传、环境等多种因素的影响,其中 GWAS 分 析 筛 选 得 到 了 5 个 与 面 部 形 态 显 著 相 关
遗传因素所占的比例最大 。然而,目前基于 DNA 进 [46]
的新位点[OSR1-WDR35(rs7567283)、HOXD1-MTX2
(rs970797)、WDR27(rs3736712)、SOX9(rs2193054)和
[47]
行身高推断的研究进展并不理想 。由于身高是一
个复杂性状,在受到多个基因调控的同时,还受到环 DHX35(rs2206437)],涉及的面部形态主要包括面部
境因素的影响。单个基因或变异对身高的影响很小, 前额轮廓、鼻子形状以及眼睛形状。同年,QIAO 等 [56]
但这些基因或变异的集合对身高影响较大,目前的基 基于 GWAS 分析研究了我国新疆维吾尔族群体与汉
因分型技术和分析方法很难完全捕获他们。2017 年, 族群体的面部形态特征差异,发现 6 个与面部容貌遗
UEKI 等 利用实时定量 PCR 技术(quantitative real-
[48]
传差异显著相关的 SNP 位点(rs1868752、
rs118078182、
time PCR ,qPCR)对 LTBP1 以 及 ETV6 基 因 区 域 的 身 rs60159418、rs17868256、rs3920540 和 rs61672954),
高相关的拷贝数变异(copy number variations ,CNV) 并基于 277 个 SNP 位点构建了容貌推断模型。
进行研究,证实 qPCR 技术可用于筛选 EVC 相关 CNV 目前 ,通过 DNA 推断的面部容貌准确性还不足
标记。 2018 年,焦会永等 基于 547 个身高相关 SNP
[49]
以满足法医常规工作的需要,但随着对人类面部形态
位点,结合山东汉族男性样本 SNP 芯片检测及全基因 遗 传 机 制 的 深 入 探 索 和 推 断 模 型 的 不 断 完 善 ,通 过
组 测 序 数 据 进 行 分 析 ,并 构 建 身 高 推 断 模 型 ,最 终 DNA 推断出的容貌特征将会越来越接近其本人的容
AUC 值为 0.67。由于中国汉族人群身高相关 SNP 位 貌特征。
6
点报道有限,该研究使用既往报道的与欧洲高加索人
群身高高度相关的 SNP 位点构建推断模型,这些 SNP
其 他
位点与中国人群身高的相关性尚需进一步验证,基于 除 了 上 述 研 究 较 为 广 泛 的 EVC 之 外 ,其 他 具 有
我国群体筛选身高相关特异性 SNP 位点有望提高我 显著遗传相关性的表型特征还包括雀斑、眼睑、内眦
国个体身高推断的准确性。总体而言,成人身高推断 赘皮、耳垂等,但目前尚未受到法医学研究者的广泛
· 516 · Journal of Forensic Medicine, October 2019, Vol.35, No.5
EPAS1 haplotype among East Asian populations[J]. tial effects of population stratification in Han Chi-
Int J Legal Med,2018,132(6):1527-1535. nese[J]. Eur J Hum Genet,2014,22(2):248-253.
[45] KONG Q P,YAO Y G,LIU M,et al. Mitochon- [52] YUASA I,UMETSU K,ADACHI N,et al. Inves-
drial DNA sequence polymorphisms of five ethnic tigation of Japanese- specific alleles: Most are of
populations from northern China[J]. Hum Genet, Jomon lineage[J]. Leg Med(Tokyo),2015,17(1):52-
2003,113(5):391-405. 55.
[46] 陆艳 . 中国西部人群的遗传混合[D]. 上海:复旦大学, [53] WRIGHT S. The genetical structure of populations[J].
2011. Ann Eugen,1951,15(4):323-354.
[47] NAKAGOME S,SATO T,ISHIDA H,et al. Model- [54] ROSENBERG N A,LI L M,WARD R,et al. Infor-
based verification of hypotheses on the origin of mativeness of genetic markers for inference of an-
modern Japanese revisited by Bayesian inference cestry[J]. Am J Hum Genet,2003,73(6):1402-1422.
based on genome-wide SNP data[J]. Mol Biol Evol, [55] PRITCHARD J K,STEPHENS M, DONNELLY P.
2015,32(6):1533-1543. Inference of population structure using multilocus
[48] JINAM T A,KANZAWA-KIRIYAMA H,INOUE I, genotype data[J]. Genetics,2000,155(2):945-959.
et al. Unique characteristics of the Ainu population [56] 刘京,李盛,江丽,等 . 对于未知来源个体进行族群推
in northern Japan[J]. J Hum Genet,2015,60(10): 断的自动分析系统[J]. 生命科学研究,2018,22(1):3-
565-571. 7,41.
[49] WANG Y,LU D,CHUNG Y J,et al. Genetic struc- [57] RAJEEVAN H, SOUNDARARAJAN U, PAKSTIS
A J,et al. Introducing the forensic research/reference
ture, divergence and admixture of Han Chinese,
on genetics knowledge base, FROG- kb[J]. Investig
Japanese and Korean populations[J]. Hereditas,2018,
Genet,2012,3(1):18.
155:19.
[58] SUN Q,JIANG L,ZHANG G,et al. Twenty-seven
[50] LI C X, PAKSTIS A J,JIANG L, et al. A panel
continental ancestry- informative SNP analysis of bone
of 74 AISNPs: Improved ancestry inference within
remains to resolve a forensic case[J]. Forensic Sci
eastern Asia[J]. Forensic Sci Int Genet,2016,23:101-
Res,2017. doi:10.1080/20961790.2017.1306431.
110.
[51] QIN P,LI Z,JIN W,et al. A panel of ancestry (收稿日期:2019-04-04)
informative markers to estimate and correct poten- (本文编辑:边英男)