Статура важка. Зовні капібара нагадує велетенську морську свинку.

Голова велика,
масивна, з широкою, тупою мордою. Верхня губа товста. Вуха короткі, округлі. Ніздрі
широко розставлені. Очі маленькі, розташовані високо на голові і віднесені трохи
назад. Хвіст рудиментарний. Кінцівки досить короткі; передні — 4-палі (третій
палець найдовший), задні — 3-палі. Пальці сполучені невеликими плавальними
перетинками і забезпечені короткими сильними кігтями. Тіло вкрите довгим (30–120
мм) жорстким волоссям; підшерсток відсутній. Забарвлення верхньої сторони тіла від
рудувато-бурого або сіруватого, черева, як правило, жовтувато-буре. Молодняк
забарвлений світліше. У статевозрілих самців на верхній частині морди розташована
ділянка шкіри з численними крупними сальними залозами. У самок 6 пар черевних
сосків.

Череп масивний, з широкими і сильними виличними дугами. Зубів 20. Щокові зуби без
коріння, ростуть протягом всього життя тварини. Різці широкі, мають подовжню
борозенку на зовнішній поверхні[1]. Мала і велика гомілкові кістки частково
зростаються між собою. Ключиці немає.

Хромосом у диплоїдному наборі 66.