Professional Documents
Culture Documents
מתאן מהידראטים
עבודה מסכמת בקורס 'גיאומיקרוביולוגיה'
תומר גדול
תוכן עניינים
מבוא 1............................................................................................................................................
תוצאות המחקרים 3.........................................................................................................................
מתאנוגנים 3.................................................................................................................................
מתאנוטרופים 5............................................................................................................................
דיון 6..............................................................................................................................................
ביבליוגרפיה 8..................................................................................................................................
מבוא
מתאן ( )CH4פועל כגז חממה ומחמם את האטמוספירה כפי 25יותר מאשר פחמן דו
חמצני .המתאן נשאר באטמוספירה כ 15-שנים ולאחר מכן עובר תגובת חמצון
לפחמן דו חמצני וממשיך לחמם את האטמוספירה עוד מאות שנים .2כאשר
מולקולות מתאן נמצאות בסביבה מימית תחת תנאי לחץ גבוה וטמפרטורה נמוכה
(איור ,)1בעיקר במדף היבשת (איור ,)3הן נקשרות למולקולות המים ויוצרות מבנה
יציב ומוצק הנקרא מתאן הידראט .3במבנה זה ,מספר מולקולות מים "כולאות"
בתוכן מולקולת מתאן אחת (איור .)2תרכובות מוצקות אלה נשארות לרוב
בקרקעית האוקיינוס אך עלולות להשתחרר בעקבות התחממות הסדימנט או מי
איור :1דיאגרמת פאזות עבור מתאן ומים הים .כמות הפחמן במאגרי מתאן הידראט אינה ידועה אך מחקרים מעריכים כי ישנם
כ Gt 3000-פחמן בתרכובות מתאן הידראטי וכ Gt 2000-נוספים בבועות מתאן .4זוהי
כמות פחמן הזה לכמות הפחמן המצוי בכלל דלקי המאובנים בעולם ,ופי
3000מכמות המתאן הקיים באטמוספירה .נתון זה חשוב במיוחד משום
ששחרור של מצבור פחמן שכזה יכול להוביל לשינויי אקלים משמעותיים
איור :2מבנה מתאן הידראט
במיוחד .משערים כי תרכובות מתאן הידראט היו מקור הפחמן המשמעותי
שהוביל לאחד מאירועי ההתחממות הקיצוניים ביותר בכדור הארץ Paleocene-Eocene Thermal
.Maximum 5אירוע PETMהיה אירוע התחממות קיצוני אשר התרחש לפני כ 56 -מיליון שנים והוביל
לשינויים קיצוניים בתנאי החיים ולחי ולצומח על גבי כדור הארץ ,הכוללים הכחדה של אורגניזמים ימיים
רבים.6
איור :3מפת רוויה של מתאן הידראט בנקבי הסדימנט כפרקציה של נפח הנקבים
1
אופן ההיווצרות של גז המתאן במעמקי האוקיינוסים ממשיך להיחקר אך חוקרים מסכימים כי ישנן 2
דרכים עיקריות בהן הוא נוצר .מתאן תרמוגני – נוצר על ידי מחדר מגמתי החודר לסדימנטים אוקייניים
עשירים בחומר אורגני ,ומתאן מיקרוביאלי – מתאן הנוצר על ידי מיקרואורגניזמים אנארוביים
אובליגטוריים הנמצאים בסדימנט בתהליך הנקרא מתאנוגנזה .בתהליך מתאנוגנזה משתמשים
מיקרואורגניזמים בפחמן דו-חמצני כקבל אלקטרונים לצורך ביצוע מטבוליזם .כלומר פחמן דו חמצני
מחוזר לגז מתאן.CO2 + 4H2 → 2H2O + CH47 :
ניתן להסיק את מקור המתאן באמצעות בדיקת איזוטופים שונים כגון 13Cו( 2H-דאוטריום)
= δ sample
{ R sample
R standard}וחישוב ערכי דלתא שלהם כאשר ערך דלתא מחושב באמצעות הנוסחה−1 ∗1000 ‰ :
,
abundance of rare isotope
= . Rכלומר Rמייצג את יחסי האיזוטופים בדוגמה ואילו δ כאשר:
abundance of abundant isotope
מייצג את ההבדל בין הדוגמה לסטנדרט מוסכם .דוגמאות המכילות יותר 13Cמאשר הסטנדרט ,ובעלות
ערך δחיובי ,נחשבות "כבדות" ואילו דוגמאות המכילות פחות 13Cמאשר הסטנדרט ,בעלות ערך δשלילי,
נחשבות "קלות" או "מדולדלות" .מתאן ביוגני ממקור מיקרוביאלי נוטה להיות בעל ערך δ13Cנמוך מ -
50‰ואילו מתאן תרמוגני א-ביוטי נוטה להיות בעל ערך δ13Cגדול מ .8 50‰-ניתוחי איזוטופים ממתאן
הידראטים הניבו ערכי 13Cהנעים בין 57‰-עד 73‰9-ולכן ניתן להסיק כי מקור המתאן הכלוא
בהידראטים הוא מתאנוגנזה מיקרוביאלית.
ידוע כי מתאן הידראטים מהווים מאגר מתאן עצום בגודלו בעל פוטנציאל משמעותי לפליטות
מתאן אך המספרים המדויקים אינם ידועים .ידוע גם כי חמצון מתאן מיקרוביאלי הינו בעל השפעה רבה,
אם כי לא ברור עד כמה ,על מאזן המתאן העולמי .4הבנה זו הגיעה מחישובי מאזן המתאן העולמי
והשוואה של ייצור מתאן אל מול כמות המתאן הנפלט אל האטמוספירה בפועל ,והבנה כי ההפרש בין
השניים נובע מצריכת מתאן עוד טרם שחרורו לאטמוספירה .מחקרים רבים עסקו בפליטות מתאן נטו
ולכן הנתונים על ייצור וצריכת מתאן הינם משוערים בלבד.
בעבודה זו אעסוק במחקרים אשר בדקו את השפעתם האקולוגית של מיקרואורגניזמים על
פליטות מתאן ועל צריכת מתאן ,ספציפית מהידראטים הנמצאים בסדימנט אוקייני ,במטרה לענות על
השאלות הבאות :מהם התנאים הדרושים למיקרואורגניזמים על מנת לבצע חמצון מתאן? באילו סביבות
אקולוגיות פועלים מתאנוטרופים? מהן האינטראקציות בין מיקרואורגניזמים מתאנוגנים לבין
מתאנוטרופים?
ההיפותזה המנחה הראשונה היא שישנה חפיפה בין בתי גידול של מתאנוגנים ומתאנוטרופים וכי
מתקיימת סינטרופיה ביניהם .ההיפותזה השנייה היא שמיקרואורגניזמים ככלל הינם בעלי השפעה
חיובית נטו על פליטות מתאן כלומר פעילותם הכוללת מפחיתה את כמות המתאן החופשי באטמוספירה.
תוצאות המחקרים
מתאנוגנים
2
לא מספיק שיתקיימו תנאי היציבות המתאימים על מנת שייווצרו מתאן הידראטים ,יש צורך
בריכוז מתאן מעל סף המסיסות של מתאן במים .כלומר צריכה להיות אספקה חיצונית של מתאן,
המופקת על ידי ארכיאות מתאנוגניות .אספקה מתחדשת שכזו הוצעה כמודל להצטברות מתאן
הידראטים בסדימנט האוקייני – 10מתאן הידראטים מצטברים באזור היציבות של גז הידראט ,אזור
היציבות משתנה בסדימנט בהתאם לשינויים בתנאי הסביבה ,הידראטים שיצאו מאזור היציבות
מתפרקים לבועות ונודדים עלפי מעלה בסדימנט ,כאשר אותן בועות מגיעות לאזור היציבות החדש הן שוב
איור :4סכמת הצטברות גבישי מתאן הידראט בסדימנט אוקייני בעקבות שינויים באזור היציבות
יוצרות הידראטים .זאת בנוסף להידראטים שנוצרו בעקבות אספקה מתחדשת של מתאן
(ראה איור .)4
מתאנוגנזה היא תהליך הפירוק האחרון של חומר אורגני המבוצע באופן בלעדי על ידי
ארכיאות אנארוביות המשתייכות למערכה .Euryarchaeota 11תהליך זה מתרחש
בתנאים אנוקסים בעומק הסדימנט כאשר אין מולקולות אחרות יכולות לשמש כקבל
אלקטרונים ,משום שהן נוצלו על ידי מיקרואורגניזמים אחרים בסדימנט( 12ראה איור
.)5
מספר מחקרים 13,14בחנו את אוכלוסיית הארכיאות באזור Nankai Troughאשר נמצא
על גבי גבול התכנסות בו לוח הים הפיליפיני מופחת מתחת ללוח האירו-אסייתי (ראה
איור .)6אזור זה מאופיין בהופעה נרחבת של ),Bottom Simulating Reflectors (BSRs
פרופיל רפלקציה סייסמי ,אשר נחשב כאינדיקטור לנוכחות של הידראטים .מאזור זה
הוצאו מספר קידוחים ,הן על ידי ) Ocean Drilling Program (ODPוהן במימון משרד
הכלכלה ,המסחר והתעשייה היפני ( )METIבעומקי ים של כ 950-מטר .על הדוגמאות מקידוחים אלו
בוצעו אנליזות כימיות ובדיקת הרכב איזוטופי של מי החללים בסדימנט.
ערך δ13Cשל המתאן חושב כנמוך מ 90‰-ועל כן המסקנה כי הוא ממקור ביוגני .בסדימנט זה
נמצא גם DNAאשר עבר מיצוי ,הגברה וריצוף של גן .16S rDNAתוצאות ריצוף אלו הניבו מספר מינים
בלתי-מתורבתים ,אשר שויכו ל 2קבוצות עיקריות – Euryarchaeotaו .Crenarchaeota -המין המתורבת
הדומה ביותר לארכיאות מקבוצת Euryarchaeotaהוא מתאנוגן ואילו המין המתורבת הדומה ביותר
לקבוצת Crenarchaeotaאיננו מתאנוגן .במחקר מוקדם יותר 15בודד ותורבת מתאנוגן נוסף מסדימנט
עשיר בהידראטים מעומק סדימנט של כ 250-מטר .Methanoculleus submarinus -במטרה לבחון את
העמידות הטרמלית של אותם מתאנוגנים ,הודגרו דגימות סדימנט מעל ,מתחת ומעומק ההדיראטים
בטמפ' שונות החל מטמפ' הקרובה לטמפ' בשטח (℃ )10ובטמפ' גבוהות יותר ( 21 ,15ו )35℃-יחד עם
חומצה אצטית ( ) CH3COOHאו פחמן דו חמצני ומימן .מתאן יוצר בכל הטמפ' שנבדקו יחד עם שני
תורמי האלקטרונים הזמינים .עובדה זו מעידה על וורסטיליות המתאנגונים בסדימנט .לא רק
שמתאנוגנים אלו עמידים לטמפ' הגבוהות בכ 25℃-מהטפ' הטבעית שנמדדה (℃ ,)4-12אלא ייצור המתאן
היה גבוה יותר באופן עקבי בדוגמאות שהודגרו בטמפ' ℃ .35יתרה מכך ,המתאנוגן M. submarinusבעל
טמפ' גידול מיטבית של ℃ . 45בביקורות שאליהן לא הוסף קבל אלקטרונים חיצוני ,בטמפ' של ℃ 21נמדד
קצב ייצור מתאן ממוצע של 9.3ngמתאן ל 1g-סדימנט ביום .סביר שנתון זה הנמדד במעבדה גדול פי כמה
סדרי גודל מקצב הייצור הטבעי בקרקעית האוקיינוס בגלל הבדלי טמפרטורה ולחץ ,הפרעה וערבוב של
הסדימנט ולכן קשה להסיק מנתון מעבדה זה נתון ריאלי לקצב ייצור המתאן בבית הגידול הטבעי של
מתאנוגנים אלו .במחקר משנת 202214נעשה שימוש בסמן רדיואקטיבי – 14Cעל מנת למדוד את קצב ייצור
4
המתאן ,בטמפרטורה של ℃ ,9בטווח של .pmol cm-3 day -1 0.3-170אם נניח כי ס"מ מעוקב של סדימנט
אוקייני שוקל בממוצע 1.7גרם ,16וכי המשקל המולקולרי של מתאן שווה בקירוב ל .g/mol 16 -ניתן לחשב
קצב ייצור מתאן של 0.003-1.6ngמתאן ל 1g-סדימנט ביום .נתון זה אכן נמצא בטווח של כמה סדרי גודל
פחות מהקצב הנ"ל וסביר כי נתון זה קרוב יותר לקצה הייצור האמיתי בסביבה הטבעית .מוערך כי בכל
שנה נפלטים בין 5-10טונות של מתאן מהידראטים כאשר הייצור עומד על 75-320טונות ,כלומר רוב
המתאן עובר חמצון לפי שהוא משתחרר לאטמוספירה.17
מתאנוטרופים
חמצון מתאן לפחמן דו חמצני יכול להתקיים בסיבות אנוקסיות וגם בסביבות ארוביות .חמצון
אירובי מתבצע על ידי בקטריות בעוד שחמצון אנארובי מבוצע לרוב על ידי ארכיאות באופן מצומד
לבקטריות המחזרות סולפט (.1)-SO42
על פי מחקר שבוצע באזור גבול ההתכנסות Cascadiaהנמצא מול חופי אורגון שבמערב ארצות
הברית , 18בו הלוח הפסיפי מופחת אל מתחת הלוח הצפון-אמריקאי ,בסדימנט אוקייני חמצון המתאן
מתבצע באינטראקציה סינטורפית הכוללת ארכיאות מתאנוטרופיות (ANaerobic Methanotrophic
)Archaea - ANMEובקטריות המחזרות סולפט ( )Sulfate Reducing Bacteria - SRBאסוציאציה שכזו
נקראת .ANME-SRB consortiumהארכיאות המשתתפות בתהליך זה הן למעשה מתאנוגנים אשר
מבצעים מתאנוגנזה הפוכה – ,Reverse Methanogenesisכך שמתאן מחומצן לפחמן דו חמצי ומימן.
אותו מימן משמש את ה SRB-לטובת חיזור הסולפט לסולפיד כך שמתקבלת התגובה המצומדת הבאה:
.CH4 + SO42- → CO2 + HS- + 2H2Oבמחקר זה נעשה שימוש בצביעת FISH – Fluorescence In Situ
Hybridizationכלומר היברידיזצייה של רצפים פלורסנטיים הספציפיים לגן 16S rRNAשל ארכיאות או
בקטריות .על ידי שימוש בצביעה זו נצפתה אסוציאציה ברורה בה אגרגטים של ANMEנמצאו מוקפים
איור :7תמונות האגרגטים בצביעה פשוטה ולאחר היברידיזציה .a/b, c/d, e/fארכיאות צבועות באדום ,בקטריות צבועות בירוק - g .קנה מידה 5μm
5
כלומר כאשר ANMEו SRB-נמצאים יחדיו באסוציאציה הם מבטאים חלבונים אשר יתווכו מעבר
אלקטרונים לצורך חמצון מתאן מצומד לחיזור סולפט.
מחקר שנערך במפרץ מקסיקו 20מצא כי ANMEו SRB-נמצאים באסוציאציה לא רק
בינים לבין עצמם אלא גם בתוך ההידראטים ,כלומר מחמצנים מתאן נדיף או נוזלי מתוך מבנה הגביש.
ניתן לזהות בקלות יחסית בקטריות מתאנוטרופיות ( )Methanotrophic Bacteriaבאמצעות רצף
ספציפי ב DNA-החיידקי הנקרא .pmoAגן זה מקודד לחלבון – particulate methane monooxygenase
חלבון ממברנאלי המזרז את פירוק המתאן .1במחקר זה 1נעשה שימוש במאגר המידע Earth Microbiome
Projectעל מנת לאפיין בקטריות מתאנוטרופיות בבתי גידול שונים .על אף שחיידקים אלו נפוצים יותר
בסביבות ימיות ,נצפתה הטרוגניות רבה יותר בסביבה היבשתית ,ככל הנראה מכיוון שסביבו זו מציגה
תנאי גידול מגוונים יותר .למרות ריכוזי החמצן הנמוכים בעומק הים ,נמצאים חיידקים מהסדרה
Methylococcalesונראה כי הם מיישבים סדימנט עשיר מתאן במהירות גבוה יותר מאשר AMNE
מכיוון שהתפוקה האנרגטית שלהם גבוהה יותר ומאפשרת קצב גידול מהיר יותר .21חיידקים אלו יכולים
להימצא באזורי מינימום חמצן – ,Minimum Oxygen Zonesאזורים באוקיינוס ובים בהם ריכוז
החמצן צונח לרמות נאנו ופיקומולר.
נמצא גם כי חיידקם מתאנוטרופים נמצאים ביחסי סימביוזה עם צדפות וסרטנים החיים בקרבת
נביעות הידרותרמיות וכן סימביוזה עם ספוגים בעומק הים.1
מספר מחקרים בוצעו במטרה למדוד את קצב חמצון המתאן של מתאנוטרופים בסביבה הימית,
מחקר שבוצע בים סין הדרומי 22השווה את המדידות השונות וחלקן מוצגות בטבלה .1
דיון
הרבה מחקרים נעשו על מאזן המתאן העולמי במטרה לבצע אינטגרציה של קצבי ייצור וצריכה
של מתאן ,אל חישובים מסוג זה הם מסובכים ודורשים התחשבות במספר רב של משתנים .לכן במחקרים
אלו נמצא טווח שגיאה גדול יחסית עבור כל תהליך ,בין אם פליטה ממאגר ובין אם צריכה ביולוגית ,טווח
זה גדל עוד יותר כאשר מנסים לסכום את כלל התהליכים .על אף שמתאן הידראטים מהווים מאגר מתאן
גדול במיוחד ,בהקשר של קצבי פליטה וקליטה הם דווקא אחוז קטן במאזן העולמי .עם זאת ,הם מהווים
מוקד מחקר אטרקטיבי ,בין היתר מכיוון שניתן לצפות את מיקומם ולזהות אותם בסדימנט.
חשיבותם של מתאן אוקייני ככלל ומתאן הידראטים בפרט נובעת מרגישותם הגבוה לשינויי
אקלים .התחממות גלובלית עלולה להביא ללולאת משוב חיובי של פליטות מתאן – כאשר האוקיינוס
מתחמם ,מתאן הידראטים נעשים פחות יציבים ובנוסף גובר קצב פעילותן של ארכיאות מתאנוגניות ,גידול
בפליטות המתאן יגביר את אפקט החממה ויביא להתחממות נוספת שרק תמשיך את הלולאה.
6
בנוסף ,עלייה בריכוז המתאן בעמודת המים יגרום לעלייה בקצב חמצון המתאן האירובי כך
שייצרך יותר חמצן מעמודת המים .ירידה באחוז החמצן המומס במים ,יחד עם ירידה במסיסות עקב
עליית טמפרטורה ,עלולה להביא להיפוקסיה בעמודת המים – מצב עקה עקב מחסור בחמצן .הפעילות
המוגברת של מתאנוטרופים אירוביים תגרום לעלייה בריכוז הפחמן הדו-חמצני בעמודת המים .מעבר
להשפעותיו של פחמן דו חמצני כגז חממה הוא גם מגיב עם המים ליצירת חומצה קרבונית ,כלומר הוא גם
יעלה את רמת החומציות באוקיינוס המשפיע על רוב האורגניזמים משקיעי השלד .תוצאות אלו של פליטת
מתאן מהידראטים הינן משמעותיות בהחלט אך הן אינן צפויות להשפיע בעשרות שנים הבאות אל בטווח
של מאות עד אלפי שנים.
אם נסתכל על מתאן בלבד ,ללא השפעותיו ותוצרי הפירוק שלו ,בסביבה הימית
למיקרואורגניזמים ישנה השפעה חיובית נטו על פליטות המתאן – רובו המוחלט של המתאן המשתחרר
בסדימנט ,בין אם מפירוק של הידראטים ובין אם כתוצאה מפעילות עכשווית של מתאנוגנים ,מחומצן עוד
בסדימנט באופן אנארובי ובעמודת המים באופן אירובי .אחוז קטן עושה את דרכו אל האטמוספירה ,אחוז
גדול אם כך מפורק לפחמן דו חמצני שריכוזיו באטמוספירה הם הגבוהים ביותר במיליוני השנים
האחרונות וממשיכים לעלות.
בעבודה זו לא עסקתי בפליטות וקליטות מתאן וההשפעה המיקרוביאלית על מחזור המתאן
בסביבה היבשתית ,בקרקעות קפואות עד ובסביבות של מים מתוקים – שם פליטות המתאן משמעותיות
יותר מאשר בסביבה הימית .זאת ככל הנראה עקב זמינות נמוכה יותר של סולפט המאפשרת ליותר חומר
אורגני "לדלג" על שלב חיזור הסולפט ולהגיע לשלב המתאנוגנזה.
מנגנוני המטבוליזם האחראיים על תהליכי יצירה ופירוק של מתאן אינם מובנים לחלוטין והם
ממשיכים להיחקר .מחקרים עתידיים אשר יפענחו את מנגנוני חמצון המתאן ייתכן ויאפשרו יישומים
סביבתיים של הפחת ריכוז המתאן באטמוספירה .צימוד סימביוטי של צמחים עם חיידקים מתאנוטרופים
יאפשר חמצון מתאן לפחמן דו חמצני שיצרך מיד לתהליך הפוטוסינתזה ,כלומר קיבוע של פחמן ישירות
ממתאן אטמוספירי.
סביבת חיים ברת קיימא למאות השנים הבאות היא יעד שאפתי אך ריאלי ,אחד הכלים לטובת
טיפול בבעיות סביבתיות בכלל ובהתחממות הגלובלית בפרט הוא רתימה של תהליכים ביולוגים שכאלו.
7
ביבליוגרפיה
1. Bodelier, P. L. E., Pérez, G., Veraart, A. J. & Krause, S. M. B. Methanotroph Ecology,
Biotechnological Applications (ed. Lee, E. Y.) 1–38 (Springer International Publishing, 2019).
doi:10.1007/978-3-030-23261-0_1.
5. Gu, G. et al. Abundant early Palaeogene marine gas hydrates despite warm deep-ocean
Carbon Cycle, Climate, and Biosphere with Implications for the Future.
(2018).
8. Claypool, G. E. & Kaplan, I. R. The Origin and Distribution of Methane in Marine Sediments. in
Natural Gases in Marine Sediments (ed. Kaplan, I. R.) 99–139 (Springer US, 1974). doi:10.1007/978-
1-4684-2757-8_8.
11. Liu, Y. & Whitman, W. B. Metabolic, Phylogenetic, and Ecological Diversity of the Methanogenic
Archaea. Annals of the New York Academy of Sciences 1125, 171–189 (2008).
12. Whitman, W. B., Bowen, T. L. & Boone, D. R. The Methanogenic Bacteria. in The Prokaryotes:
Volume 3: Archaea. Bacteria: Firmicutes, Actinomycetes (eds. Dworkin, M., Falkow, S.,
Rosenberg, E., Schleifer, K.-H. & Stackebrandt, E.) 165–207 (Springer, 2006). doi:10.1007/0-387-
30743-5_9.
13. Colwell, F., Matsumoto, R. & Reed, D. A review of the gas hydrates, geology, and biology of the
8
14. Katayama, T. et al. Cultivation and biogeochemical analyses reveal insights into methanogenesis
in deep subseafloor sediment at a biogenic gas hydrate site. ISME J 16, 1464–1472 (2022).
15. Mikucki, J. A., Liu, Y., Delwiche, M., Colwell, F. S. & Boone, D. R. Isolation of a Methanogen
from Deep Marine Sediments That Contain Methane Hydrates, and Description of Methanoculleus
16. Tenzer, R. & Gladkikh, V. Assessment of Density Variations of Marine Sediments with Ocean and
18. Boetius, A. et al. A marine microbial consortium apparently mediating anaerobic oxidation of
19. Krukenberg, V. et al. Gene expression and ultrastructure of meso- and thermophilic
20. Lanoil, B. D., Sassen, R., La Duc, M. T., Sweet, S. T. & Nealson, K. H. Bacteria and Archaea
Physically Associated with Gulf of Mexico Gas Hydrates. Appl Environ Microbiol 67, 5143–5153
(2001).
potential in sediments from the Shenhu Area, South China Sea. China Geology 5, 285–292 (2022).