Professional Documents
Culture Documents
קינטיקה אינזימטית
האנזים אינברטז מפרק סוכרוז למרכיביו -גלוקוז ופרוקטוז -ע"י זירוז ההידרוליזה של הקשר הגליקוזידי.
החד-סוכרים המתקבלים הם סוכרים מחזרים ,בניגוד לסוכרוז הבלתי מחזר .במעבדה זו יימדד פירוק הסוכרוז
ע"י מדידת ריכוז הסוכרים המחזרים בשיטת .Sumner
שיטת Sumnerמבוססת על חמצון הסוכר המחזר בסביבה בסיסית ע"י חומצה די-ניטרו סליצילית ( )DNS
הגורם להופעת צבע כתום-אדמדם אחרי חימום .ריכוז הצבע הנוצר פרופורציוני לריכוז הסוכר המחזר וניתן
למדידה באמצעות ספקטרופוטומטר באורך גל של .nm 540
אנזימים הם חלבונים אשר מזרזים תגובות כימיות מבלי לעבור שינויים כימיים קבועים בעצמם .האנזימים
פועלים על מולקולות אחרות שמהוות את המצע שלהם -הסובסטרט .מולקולות הסובסטרט נקשרות אל
האנזים בחלק הנקרא האתר הפעיל של האנזים ,ונהפכות לתוצר במספר שלבים במנגנון האנזימטי .ישנם
אנזימים אשר קושרים סובסטרט יחיד וישנם אנזימים אשר קושרים סובסטרטים רבים.
חשוב להבין שהאנזימים אינם משנים את שיווי המשקל בין התוצרים והמגיבים ,הם מזרזים את קצב התגובה.
תחום המחקר עוסק בתגובות הכימיות המזורזות ע"י אנזימים מכונה קינטיקה אנזימטית.
→ S + E P + E תגובה אנזימטית פשוטה ניתנת לתיאור ע"י הנוסחה:
- Eהאנזים – S ,הסובסטרט - P ,התוצר.
-pH .3אנזימים מושפעים משינויים ב .pH -ערך ה pH -שבו פעילות האנזים היא מרבית נקרא הpH -
האופטימאלי .ערכי pHקיצוניים גורמים בד"כ לאבוד מוחלט של פעילות האנזים .ה pH -האופטימאלי שונה
באנזימים שונים.
.4ריכוז סובסטרט -במערכת בעלת ריכוז אנזים קבוע ,מהירות התגובה האנזימטת (∆ )P/∆Tתעלה כאשר
יעלה ריכוז הסובסטרט ,עד למצב רוויה ,שבו כל האתרים הקטליטיים באנזימים יהיו תפוסים על ידי סובסטרט.
הוספת סובסטרט נוסף לא תשפיע על העלייה במהירות התגובה .מהירות תגובה אנזימטית בתנאים אלו
נקראת המהירות המקסימאלית .Vmax
תקציר :בדקנו את פעילות האנזים אינבראז כתלות בפונקציות שונות – בליעה אופטית של האנזים כתלות
בכמות סוכר מחזר – באמצעות ספקטרופוטומר ,בחנו ריכוז תוצרים שלהם נלקחו זמנים שונים ,בחנו פעילות
אינברטז כתלות בחומציות ,הכנסנו את המבחנות השונות לאמבטיות טמפרטורה כדי לבדוק כיצד היא משפיעה
.על הפעילות ,בעזרת התוצאות השונות יכולנו לקבוע את קבוע מיכאליס מנטן ואת עקומת לינואר ברק
:מטרות המעבדה
בחינות פעילות האנזים אינברטז כתלות בפונקציות שונות1 .
הכרת כלי שימושי למציאת ריכוז סוכר מחזר – תגובת סאמנר2.
מבוא :האנזימים הם חלבונים חשובים שהפעילות שלהם מושפעת מתנאי סביבה שונים כמו הטמפרטורה או
ריכוז הסובסטרט וזמן באינקובציה ודרגת חומציות ולכן בניסוי שלנו ביצענו בדיקות עבור כל התנאים הללו -איך
.הם משפיעים על פעילות האנזים
המעבדה התבוססה על אנזים אינברטאז שתפקידו לפרק את הדו סוכר סוכרוז (הסוכרוז הוא סוכר שלא מחזר
ולכן לא נקשר לאינדקטור הצבען) הסוכרוז מתפרק לשני חד סוכרים :גלוקוז ופרוקטוז ששניהם מחזרים וגם
.נקשרים אל האינדקטור הצבען ( ,אינוורטאז מפרק את הכשר הגליקוזידי בין שתי תת היחידות של הסוכרוז)
תוצאות
טבלה 1עקומת כיול של גלוקוז לפי תוצאות אישיות וכיתתיות
0.4 0.8 1.2 1.6 2.0 - פרוקטוז mM +גלוקוז 1.34
)מ"ל( 1.34mM
תיאור טבלה : 1טבלה זו מציגה בליעה אופטית שנמדדה באמצעות מכשיר ספקטרופוטומטר שכויל לאורך גל
של . nm 540בטבלה זו הבליעה מוצגת כתלות בכמות הסוכר המחזר שהוכנס בריכוזים שונים כפי שמתואר
בשורה מספר , 1ולאחר מכן נמהלו במים עד לנפח סופי של . ml 2לאחר מכן הוסף ריאגנט סאמנר כפי
שמתואר בשורה 3בריכוז ידוע מראש על מנת לחמצן את הסוכר וגם להעניק לו צבע אדמדם כתום שמתקבל
לאחר חימום .לאחר קבלת הצבע מדדנו ODשלנו וגם בדקנו את ממוצע ה ODהכיתתי.
5.1
1
mn 045 D.O
5.0
0
2.0 4.0 6.0 8.0 1 2.1 4.1
ריכוז
[]C סוכר מחזר
mM
תיאור גרף :1הגרף מתאר את הבליעה האופטית כתלות בריכוז סוכר מחזר שהתחמצן ונצבע בצבעי אדום
כתום לאחר תגובת . sumnerלמעשה מה שהיה מצופה שיקרה הוא שככל שיהיה ריכוז גבוה יותר של סוכר
מחזר ככה קריאת הבליעה תהיה גבוהה יותר ואכן ניתן לראות מגמת עלייה ,כמו כן ערך השונות המוסברת
שקיבלנו הינו 0.990מה שמעיד על קשר חיובי וחזק – כלומר ככל שריכוז הסוכר המחזר גבוה יותר – כך
הבליעה תהיה גבוהה יותר.
דוגמה לחישוב ריכוז תוצר אישי למבחנה 14חישוב זה נכלל בכל הטבלאות והבדיקות לפי משוואת הישר של
גרף הכיול:
Xהריכוז
)mM
ריכוז תוצרים (פעילות אינברטז 21
01
8
6
4
2
0
0 5.0 1 5.1 2 5.2 3
()nim
זמן
תיאור גרף : 2הגרף מציג את תחום הפעילות הלינארית של האנזים אינברטז ,התחום מוצג כאן כתלוי בזמן,
ככל שהמבחנות שהו זמן ממושך יותר ,כלומר ככל שהריאקציה התרחשה יותר זמן באינקובציה ,כך ריכוז
התוצרים ב Mmהיה גדול יותר ,למעט במבחנה אחת שלנו שבא ישנה ירידה וקטיעה של הרצף הלינארי העולה
– הסבר אפשרי לזה יכול להיות בגלל שנשפך לנו קצת מתוכן המבחנה הזו ,אבל בכל אופן עדיין אחוז השונות
המוסברת גבוה 0.8032מה שמעיד על קורלציה חזקה.
סטיית תקן של OD ריכוז תוצר קבוצתי OD 540 nm pH
mM
קבוצתי
תיאור טבלה :3טבלה זו מציגה תוצאות כיתתיות שמבטאות את פעילות האנזים אינברטז כתלות בערכי , pH
הריכוזים חושבו על ידי משוואת עקום הכיול הכיתתי (גרף )1התוצאות הכיתתיות נדגמו כממוצע של שלוש
קבוצות ( )N=3כאשר כל קבוצה קיבלה ערכי ODשאחרי ממוצע הצבנו במשוואה כאמור ,והוספנו גם סטיות
לבליעה אופטית של תוצאות כיתתיות.
פעילות אינברטז כתלות ב
( Hp )ע"פ תוצאות כיתתיות
3.0
52.0
2.0
371379803687912.0 + x 91095202107286700.0 − = )x(f
7820326750304960.0
51.0 = ²R
mM
ריכוז ב
1.0
50.0
0
2 3 4 5 6 7 8 9
Hp
תיאור גרף :3הגרף מציג את פעילותו אשר מוצגת כריכוז של האנזים אינברטז כתלות ברמות pHשונות ,ניתן
לראות שאין מגמה ברורה של עלייה או ירידה ..אחוז השונות המוסברת נמוך מאוד וקרוב ל )0.0694( 0מה
שמעיד על כך שלא ניתן לנבא על ריכוז גבוה או נמוך כתלות ב pHגבוה או נמוך.
טבלה 4פעילות אינברטז כתלות בטמפ' שונות לפי תוצאות אישיות וכיתתיות
סטיית תקן של תוצר ריכוז תוצר ריכוז OD nm OD nm טמפ'
OD קבוצתי אישי
קבוצתי אישי
mM mM
תיאור טבלה : 4טבלה זו מציגה פעילות אינברטז כתלות בטמפרטורות שונות ,הערכים המוצגים הם ערכי OD
כיתתיים שאותם המרנו לריכוזי תוצר ב( Mmממוצע )N=3והסטיות תקן של בליעה אופטיות של תוצאות
קבוצתיות.
פעילות אינברטז כתלות בטמפרטורה (ע"פ תוצאות
אישיות)
21.0
1.0
320668669631301.0 + x 250131419085992000.0 − = )x(f
715688686100268.0 = ²R
80.0
60.0
mM
ריכוז ב
40.0
20.0
0
0 02 04 06 08 001 021
טמפרטורה
((C
תיאור גרף : 4הגרף מציג את פעילות האינברטז כתלות בטמפרטורה על פי תוצאות אישיות ,מהגרף ניתן
להסיק מה הטמפרטורה האידיאלית וכמו כן ישנו קשר חיובי חזק .0.862
דיון ומסקנות :מעבדה זו עסקה ברובה בפעילות האנזים אינברטז ובחלקה ההתחלתי עסקה בשיטת סאמנר.
כימות פירוק הסוכר על ידי מדידת הסוכרים המחזרים באמצעות שיטת סאמנר :בחלק זה בנינו )1
עקומת כיול על פי ריכוז גלוקוז ופרוקטוז ידועים מראש ,היו לנו שישה מבחנות ממוספרות A-Fכאשר
Fשימשה כבלאנק והשאר הכילו ריכוזים שונים של סוכרים ובהתאם לריכוז הסוכרים הוספנו מים עד
לנפח סופי של 2מ"ל .בדקנו כל מבחנה בספקטרופוטומטר ועל פי הערך שהתקבל ,יכולנו לבנות
עקומת כיול (גרף )1המסקנה הברורה מניסוי זה היא – שככל שריכוז הסוכרים המחזרים היה גבוה
יותר – המבחנה הייתה בצבע כהה יותר – מה שהתבטא בערך ODגבוה יותר – וככה למעשה
המחשנו את יעילותה הרבה של שיטת סאמנר .
בחלק זה התחלנו בסדרה של בדיקות של פעילות האנזים אינברטז כתלות בפונקציות שונות , )2
מבחנות הוכנסו לאינקטובטור( ) C 37ולמעשה בדקנו כיצד משפיעה שהות בזמנים שונים באינקובטור
על פעילות האנזים אינברטז – ניתן לראות שככל שהשהות ארוכה יותר יש יותר תוצרים ,קרי
הפעילות ענפה יותר(גרף .)2
בחלק זה בדקנו את פעילות האנזים כתלות ב pHניתן לראות על פי הגרף שאחוז השונות המוסברת )3
קטן מה שמרמז על כך שאי אפשר לסמוך על משוואת הניבוי ,ניתן לראות שבערכי pHהנעים בין 3-
5קיבלנו את הריכוזים הכי גבוהים מה שמרמז על כך שה pHהאופטימלי לפעילותו של האנזים נמצא
בטווח הזה.
בחלק זה בדקנו את פעילות האנזים כתלות בטמפרטורות שונות ,הכנו 15מבחנות ובדקנו את )4
השפעת הטמפרטורה בזמן קצוב ,כל מבחן הוכנסה לאמבט טמפרטורה אחר ,ולאחר מכן הוספנו
סאמנר ובדקנו קריאות – ODובהתאם לכך חישבנו ריכוזים .על פי התוצאות הכיתתיות שהתקבלו
ניתן לראות שהריכוז הגבוה ביותר היה בטווח של 50-60מה שמנבא על כך שבטווח זה נמצאת
הטמפרטורה האופטימלית לפעילותו של האנזים.
שאלות מהדוח
נבחר ריכוז האנזים לניסוי זה משום שיש צורך לבדוק את הטווח מינימלי ומקסימלי בריכוז זה לקבלת )1
ערך הבליעה האופטית ,וכדי שנעבוד עם בליעה של OD 1
הגרפים נבנים בהתייחסות לריכוז מולרי של חומר ולא לריכוז משקלי משום שבמעבדה זו אנחנו רוצים )2
תוצר פירוק של אינברטז שנמדד במולר האנזים יודע לפרק סוכרוז ונרצה לדעת משם כמה מולים הוא
פירק לתוצר.
עלייה בערך KMמגדילה את המכנה וגורמת למספר כולל קטן יותר ,כלומר למהירות קטנה יותר (על )3
פי הנוסחה למטה) מה שמרמז על כך שחומר Aהוא חומר מעכב שמתחרה עם האנזים על
הסובסטרט.
[ s ]∗v max
v=
[ s ]+ km