Professional Documents
Culture Documents
תקציר
במעבדה זו ,נלמד על העקרונות הבסיסים של קינטיקה אנזימטית דרך אפיון האנזים בוטיריל-כולין-אסטרז ) ,(BChEאשר
מתנהג לפי חוק מיכאליס -מנטן .במהלך המעבדה נמדוד את פעילות האנזים בריכוזים שונים של סובסטראט ,בנוכחות ובהיעד
מעכב .מהנתונים האלה נחשב פרמטרים שונים כגון Vmax, Km, Ki, turnover number :ונלמד להבין את משמעותם
המעשית .נעקוב אחרי פעילות האנזים בעזרת ריאקציה ספונטנית שנייה ,המתרחשת עם תוצר פעילות האנזים (הראקציה
הראשונה) ,ומשחררת חומר שבולע באורך גל הנראה .ריאקצית צבע זו מאפשרת מדידה קלה בספקטרופוטומרטר והערכה
כמותית של פעילות האנזים.
רקע ביולוגי
ידועים שני סוגים של כולין אסטראזות )1 :אצטילכולין אסטראז ) (AChEשתפקידו הפיזיולוגי הוא פירוק האצטילכולין במרווח
הסינפטי )2 ,בוטירילכולין אסטראז ( )BChEשנמצא גם בסרום וברקמות ,ועוזר לגוף לפרק חומרים רעילים ,לפני שהם מגיעים
למערכת העצבים .ל BChEאין סובסטראט טבעי בגוף ,ולכן תפקידו בגוף עדיין לא מובן עד הסוף .עם זאת ,מחקרים מצביעים
על שורה ארוכה של השפעות תאיות.
שני האנזימים AChE ,ו ,BChE-שייכים לקבוצת "אנזימי-סרין" ,המאופיינים בשלישיה קטליטית בתוך האתר הפעיל :שייר
סרין [ ,]Serשייר Hisפעיל וגלוטמאט ]( ]Gluאיור מס' .)1אצטיל כולין אסטראז מפרק ביעילות אצטיל כולין וכמעט שאינו
מפרק בוטיריל כולין ,ואילו BChEפועל ביעילות דומה על שניהם .אנזימי-סרין אלה נבדלים גם בתלות הפעילות בריכוז
הסובסטרט AChE .מעוכב בעודף אצטיל כולין (עודף סובסטרט) ,בעוד ש BChE-פועל לפי קינטיקה קלאסית של
Michaelis-Mentenואינו מעוכב ע"י עודף סובסטרט.
איור מס' :1פעילות של כולין אסתראז והאתר הפעיל של (A) :BChEהידרוליזה של )B( AChמנגנון
ההידרוליזה (C) .האתר הפעיל :שלישיה קטליטית המורכבת משלוש ח''א .Ser [S], His [H], Glu [E]:קבוצת
האציל של הסובסטרט (כאן )AChתואמת לכיס האציל [ ]Aכאשר חנקן רבעוני בא באינטראקציה עם אתר חומצי של
] .Trp [Wהסובסטרט מועבר לתעלת ( )gorgeהאתר הפעיל ע''י אינטראקציה עם השיירים ] Asp [DוTyr [Y]-
(.(peripheral binding site
C
ידועה חשיבות קלינית לקביעת הרמה ופעילות האנזימטית של BChEבסרום )1:בתחום ההרדמה ,פעילות BChEקובעת את
קצב הפירוק של ) ,succinylcholine (SChחומר המשמש כמרפה שרירים ( )myorelaxantבזמן ההרדמה; רמה נמוכה מדי
של פעילות BChEלא מאפשרת פירוק מספיק מהר של ,SChעלולה להביא לסכנת מוות בעת התאוששות מהרדמה בעקבות
חוסר יכולת של שרירי הנשימה להתכווץ )2 .תרכובות אורגנו-זרחניות ( )Organophosphatesמעכבות אנזימי-סרין
ומשמשות כחומרי לוחמה כימית וכקוטלי חרקים .מדידת רמת העיכוב של בוטיריל כולין אסטראז בסרום משמשת כאמצעי עזר
לדיאגנוזה של הרעלה ברעל עצבים .בנוסף ,חומרים מקבוצת glycoalcaloidsאשר מצויים במאכלים צמחיים ממשפחת
Solanaceaeכגון תפוחי אדמה ועגבניות ,מעכבים גם הם את פעילות ה.BChE-
Substrates
Reversible inhibitors
)(Alzheimer’s therapies
Irreversible inhibitors
(Organophosphates-
)nerve gases
במעבדה הראשונה ,אנחנו נקבע את Kmו Vmax -של בוטיריל כולין אסטראז מנוקה ואת קבוע העיכוב ) (Kiשל
Galantmineאו .Donepezil
פעילות האנזים נמדדת בעזרת בוטירילתיאוכולין ( )BTCכסובסטרט .תוצר הפירוק הוא תיאוכולין .התיאול מחזר 5, 5’ Dithiobis-
.(DTNB( 2-nitrobenzoic acidתוצר החיזור ,TNB ,בולע אור ב .414 nm -מקדם הבליעה המולארי הוא 13,660 M-1 cm-1
מדידת פעילות האנזים נעשית ב microplate reader -שהוא ספקטרופוטומטר ממוחשב היכול לעקוב בו זמנית אחרי 96
ריאקציות .במעבדה נמדוד את הקצב של 8ריאקציות (ריכוזי סובסטרט שונים) ,כל אחת ב 4-חזרות (קווארדופליקאטים).
התוכנה מעבדת את ערכי הבליעה ומחשבת את קצב עלייתה ,והפלט נותן את קצב הריאקציה הממוצע ) )A414/minשהיה בזמן
המדידה ,בכל בארית .הנתונים מועברים לתוכנת EXCELלשם עיבוד נוסף.
מהלך הניסוי
טבלה :1מיהול של הסובסטראט [יש למלא את הטבלה במסגרת הדוח המכין למעבדה]
Sample ID 1 2 3 4 5 6 7 8
)BTC concentration (μM 250 500 750 1,000 2,500 3,500 5,000 7,500
הגדרות:
יחידת אנזים :כמות האנזים המפרק 1 molשל סובסטרט בדקה.
פעילות ספציפית :מספר יחידות האנזים במג' חלבון.
:TURNOVER NUMBERמספר מולים של הסובסטרט שמפורקים בדקה ע"י מול אחד של אנזים.
המסה המולקולארית של בוטירילכולין אסטראז היא .440 kDa
הפעילות הספציפית של האנזים המסחרי היא .13 Units/mg protein
עיבוד נתונים
העבירו את הפלט ל EXCEL -והפכו את ערכי הבליעה ל .nmols -שימו לב כי בפלטת ,ELISAהאור עובר דרך 0.5ס"מ
ולא 1ס"מ כמקובל.
.1מלאו את טבלאות 2ו 3 -והציגו אותן בדו"ח .אין צורך להציג את העמודות המציינות את הנפחים של החומרים שהוכנסו
לבארות.
.2חשבו את מהירות הריאקציה ) (nmol/minעבור כל ריכוז .הוסיפו דוגמאת חישוב מפורטת.
.3ציירו בעזרת EXCELגרף 1המראה את התלות של Vב ]S[ -בהעדר מעכבב ובנוכחותו .העריכו את Vmaxעבור האנזים
ואת Kmללא ובנוכחות מעכב
.4הציגו טבלה 4של 1/Vהממוצע ו 1/[S] -עם וללא מעכב ,וגרף 2המראה את התלות של 1/Vב 1/[S] -בהעדר מעכב
ובנוכחותו .הכריחו את הגרף לחתוך באותה נקודה בציר ,Yועשו אקסטרפולציה לקבלת נקודת חיתוך גם בציר .Xהציגו
משוואת קו ישר ו.R2 -
.5לפי התוצאות בהעדר מעכב ,קבעו את מספר יחידות האנזים ,את הפעילות הספציפית (השוו לאנזים המסחרי) ואת ה-
.Turnover numberקבעו את Vmax, Vmax apparent, Km apparent, Km, Kiלפי גרף .2
.6יש להציג את כל דוגמאות החישוב הרלוונטיות.
.
דיון :יש להתייחס בדיון לטיב התוצאות ,בהשוואה לצפוי באופן תיאורטי ובהשוואה למקור ספרותי .יש לציין את המקורות בהם
נעזרתם (דוגמאות לצורת הצגת מקורות נכונהת ניתן למצוא בחוברת מעבדה .)0יש להתייחס לכל התוצאות ולתת הסברים
מנומקים.
A
ללא מעכב
B
C
D
E
G
H