Professional Documents
Culture Documents
2. Exprep Plasmid SV (Ver.5.0) .한국어
2. Exprep Plasmid SV (Ver.5.0) .한국어
com
버전 5.0 HB1010
핸드북
DNA 정제 핸드북
추가 질문이 있으시면 언제든지 문의해 주십시오.
귀하의 의견과 조언에 감사드립니다.
연락처 정보
하이브리드-QTM, 특급TM, ExfectionTM, 익스핀TM, 엑스진TM, 제넥스TM, DirExTM, 하이브리드-RTM, 리보엑스TM, 리보스핀TM,
생명공학(주)
소개 07
방법론
진올®특급TM플라스미드 키트 절차 일반 고려 08
사항 09
출발 물질
알칼리 용해 12
EzClear로 용해물 여과TM필터 컬럼 세척 13
용출 14
Midi 키트 프로토콜의 원심 분리기 15
..에 대한 프로토콜
특급TM플라스미드 SV 미니 16
ExprepTM플라스미드 SV 미디 21
문제 해결 가이드 27
간단한 프로토콜 30
주문 정보 31
전부내용물
특급TM플라스미드 SV 미니
고양이. 아니요. 101-150 101-102
크기 미니 미니
준비 번호 50 200
진올®SV 컬럼 유형 Q(포집 튜브 포함) 버퍼 S1 50 200
20ml 60ml
버퍼 S2 20ml 60ml
버퍼 S3 25ml 90ml
버퍼 AW(농축액) * 버퍼 19ml 69ml
PW(농축액) *† 12ml 50ml
버퍼 EB ** 15ml 30ml
RNase A(20mg/ml) 100ul 300ul
프로토콜 핸드북 1 1
특급TM플라스미드 SV 미디
고양이. 아니요. 101-226 101-250 101-201
크기 미디 미디 미디
준비 번호 26
진올®SV 컬럼 유형 Q(적색 링)(포집 튜브
26
포함)
이지클리어TM필터 컬럼(파란색 링)
26
(수집 튜브 포함)
수집관 26 101-226 101-226
버퍼 S1 80ml ×2 ×4
버퍼 S2 80ml
버퍼 S3 110ml
버퍼 AW(농축액) * 버퍼 94ml x 2
PW(농축액) *† 50ml x 2
버퍼 EB ** 120ml
RNase A(20mg/ml) 400ul
프로토콜 핸드북 1
* 처음 사용하기 전에 병에 표시된 대로 AW 및 PW 버퍼에 무수 에탄올(ACS 등급 이상)을 첨가하십시오.
†방부제로 아지드화나트륨을 함유
* * 10mM TrisCl, pH 8.5
4 진올®특급TM프로토콜 핸드북
품질 관리
보관 조건
화학적 위험
진올®특급TM프로토콜 핸드북 5
제품 명세서
특급TM 피라즈미드 SV
미니 미디*
체재 스핀/진공 스핀/진공
권장 시료량 최대 시료량 5ml 50ml
10ml 100ml
용해물의 제거 원심분리기 이지클리어TM
준비 시간 <23분 <50분
최대 적재량 800ul 15ml
바인딩 용량 30ug 300ug
회수율 85~95% 85~95%
최소 용출량 40ul 400ul
6 진올®특급TM프로토콜 핸드북
진올®EXPREPTM
플라스미드 정제 키트
소개
진올®특급TMPlasmid SV 키트는 세균 세포에서 중소 규모의 플라스미드 DNA를 쉽
고 빠르게 준비할 수 있는 방법을 제공합니다. 이 키트는 모든 플라스미드를 분리하고
정제하는 데 사용할 수 있지만 플라스미드 크기가 20kb 미만일 때 가장 효율적으로
작동합니다.
순수한 플라스미드 DNA를 준비하기 위한 모든 과정은 약 25분 정도 소요되며 여러
시료의 동시 처리가 용이합니다. GeneAll을 사용하여 최대 30ug의 순수 플라스미드
를 정제할 수 있습니다.®특급TM플라스미드 SV 미니 키트와 이 순수 플라스미드 DNA
는 추가 조작 없이 PCR, 클로닝, 형광 시퀀싱, 표지된 혼성화 프로브의 합성, 세포 형
질감염, 전기천공 및 효소 제한 분석에 사용할 수 있습니다.
방법론
진올®특급TMPlasmid SV kit는 수정된 알칼리 용해 방법에 기반한 유리 극세사 멤브
레인을 사용합니다. 알칼리 용해는 박테리아 세포에서 플라스미드 DNA를 방출하고
RNA를 분해하며, RNase는 용해물에서 살아남은 RNA를 제거합니다. 세포 파편 및
염 침전물은 미니 키트용 원심분리 및 EzClear로 제거됩니다.TMMidi 키트용 필터 컬
럼.
높은 염이 존재하는 경우 제거된 용해물의 플라스미드 DNA는 GeneAll의 유리 극세
사 막에 선택적으로 결합합니다.®특급TM플라스미드 SV 컬럼. 결합된 플라스미드 DNA
는 다른 세균 성분의 오염을 제거하기 위해 일련의 세척 단계에서 정제됩니다. 마지막
으로 저염 완충액 또는 탈이온수에 의한 용출은 유리 극세사 막에서 플라스미드 DNA
를 방출합니다. 이 간단한 방법은 유기 용매 추출 및 알코올 침전이 필요하지 않습니
다.
진올®특급TM프로토콜 핸드북 7
진올®특급TM 플라스미드 SV 키트 절차
플라스미드 SV 미니 플라스미드 SV 미디
8 진올®특급TM프로토콜 핸드북
진올®특급TM
플라스미드 정제 키트
일반 고려 사항
출발 물질
플라스미드 DNA의 수율과 품질은 플라스미드 카피 수, 박테리아 균주, 항생제, 접종 및
배양 배지 유형과 같은 여러 요인에 따라 달라집니다. 가능한 한 플라스미드는 한천 플레
이트에서 뽑은 단일 형질전환 콜로니로 접종된 세균 배양에서 정제되어야 합니다.
진올®특급TM프로토콜 핸드북 9
진올®특급TM플라스미드 SV 키트 절차는 고카피수 플라스미드에 최적화되어 있으므로 카
피수가 적은 플라스미드를 사용하는 경우 더 큰 시작 샘플이 필요할 수 있습니다.
10진올®특급TM프로토콜 핸드북
진올®특급TM시리즈는 균의 번식을 위해 가장 널리 사용되는 배지인 Luria-Bertani(LB)
broth에 최적화되어 있습니다.대장균. Terrific Broth(TB) 또는 2xYT와 같은 다른 풍
부한 국물을 사용하면 세포 밀도가 매우 높아집니다. 이러한 배지를 사용하는 경우
GeneAll에 과부하가 걸리지 않도록 시작 샘플 볼륨을 줄여야 합니다.®
특급TM플라스미드 SV 컬럼 및 버퍼 시스템. 그렇지 않으면 효율적인 용해를 위해 버퍼
S1, S2 및 S3의 부피를 늘려야 합니다. TB 또는 2xYT에서 하룻밤 배양하면 LB broth에
서 배양할 때보다 세포수가 2~5배 증가할 수 있습니다. TB 또는 2xYT는 낮은 copy 수의
플라스미드의 경우 더 많은 수율의 플라스미드 DNA를 얻기 위해 사용될 수 있습니다.
진올®특급TM프로토콜 핸드북11
알칼리 용해
수확된 세균 배양은 RNase의 존재 하에 버퍼 S1에 의해 재현탁됩니다.
A. 박테리아 현탁액을 높은 pH(버퍼 S2, SDS/NaOH)에서 강한 음이온성 세제에 노출
시키면 세포벽이 열리고 염색체 DNA와 단백질이 변성되며 플라스미드 DNA가 상층액
으로 방출됩니다. 염기성 용액인 버퍼 S2는 염기쌍 형성을 완전히 방해하지만 닫힌 원형
플라스미드 DNA 가닥은 위상학적으로 얽혀 있기 때문에 서로 분리할 수 없습니다.
12진올®특급TM프로토콜 핸드북
EzClear로 용해물 여과TM필터 열
버퍼 S3와 혼합한 후 세포 파편과 침전물을 완전히 제거하여 GeneAll이 막히지 않도록
해야 합니다.®특급TM후속 결합에서 플라스미드 SV 컬럼. 새로운 특허 EzClearTM필터 컬
럼은 전통적인 방법에서 널리 사용되는 지루한 원심분리 대신 여과를 통해 용해물의 제
거를 용이하게 합니다.
세탁
작업할 때끝A+저장 또는 효소 반응 중에 플라스미드 DNA가 분해되지 않도록 보장하기
위해 버퍼 AW를 사용한 선택적 세척 단계를 통해 엔도뉴클레아제를 효율적으로 제거할
수 있습니다.
Buffer AW는 잔류 단백질을 제거하여 플라스미드 DNA의 품질을 향상시키기 때문에
일반적으로 더 큰 배양 부피에서 사용되는 저카피 플라스미드로 작업할 때도 필요합니
다. Buffer PW는 컬럼 멤브레인에 비특이적으로 결합된 염 및 기타 세포 성분을 제거합
니다.
표 2.다양한 유전자형대장균균주
EndA+균주 EndA-균주
BL21(DE3), CJ236, HB101, JM83, JM101, DH1, DH20, DH21, DH5α, JM103,
JM110, LE392, MC1061, NM 시리즈, P2392 JM105, JM106, JM107, JM108,
PR 시리즈, RR1, TB1, TG1, BMH71-18, JM109, MM294, SK1590, SRB, XL1-블
ES1301, 야생형 등 루, XLO 등
진올®특급TM프로토콜 핸드북13
용출
정제된 DNA는 다운스트림 응용 분야의 필요에 따라 저염 완충액 또는 탈이온수에서 용출될
수 있습니다. 버퍼 EB에는 10mM TrisCl, pH 8.5가 포함되어 있습니다. 용리액으로 물을 사
용하는 경우 pH 값이 7.0과 8.5 사이인지 확인하십시오.
물에 있는 플라스미드는 가수분해되기 쉽고 완충제가 부족하므로 -20˚C 이하에서 보관
하는 것이 좋습니다. Elution volume은 필요에 따라 조절할 수 있으나 SV column
membrane을 완전히 담가두기 위해서는 최소한의 요구량 이상이어야 합니다. DNA 농
도를 높이려면 용출 버퍼의 양을 줄입니다. 수율을 높이려면 용출 버퍼의 양을 늘리고 용
출 단계를 다시 한 번 반복하십시오. 용출 부피로서의 농도 및 수율은 아래와 같습니다.
플라스미드 SV 미니 플라스미드 SV 미디
DNA 농도 (ug/ml)
총 DNA 수율(ug)
총 DNA 수율(ug)
0 0 0 0
20 30 50 80 100 120 200 500 800 1000 1500 2000년
14진올®특급TM프로토콜 핸드북
Midi 키트 프로토콜의 원심 분리기
GeneAl l®특급TMPlasmid SV Midi 절차에는 스윙 버킷 로터와 4,000~5,000 x g의 능
력을 갖춘 기존의 원심분리기가 필요합니다.
고정각 로터를 사용하면 SV 컬럼 멤브레인이 샘플 혼합물 및 완충액과 일관되지 않게
접촉하여 만족스럽지 못한 결과를 초래할 수 있습니다.
g-force가 낮으면 에탄올이 불완전하게 제거될 뿐만 아니라 SV 컬럼의 멤브레인에서 DNA
가 용출되지 않을 수도 있습니다. 사용 가능한 원심 분리기 및 로터는 아래에 나열되어 있지만
이에 상응하는 모든 것을 사용할 수 있습니다.
회사 원심분리기 축차
Beckman Coulter Inc. 알레그라 X-15R Sx4750
(미국 캘리포니아) 알레그라 25R Sx4750A
TS-5.1-500
진올®특급TM프로토콜 핸드북15
진올®특급TM플라스미드 SV 미니
실험 전*처음 사용하기 전에 무수 에탄올(ACS 등급 이상)을 첨가하십시오.
병에 표시된 대로 버퍼 AW 및 PW에 넣습니다.
* 다른 적응증이 없는 한, 모든 원심분리 단계는 상온의 마이크로 원심분
리기에서 최대 속도(>10,000 xg 또는 10,000~14,000 rpm)로 수행해
야 합니다.
* 처음 사용하기 전에 모든 RNase A를 버퍼 S1에 추가하십시오.
투명 용해물의 준비
16진올®특급TM프로토콜 핸드북
삼.버퍼 S2 250ul를 추가하고 튜브를 4번 뒤집어 혼합합니다(와동하지 마십시
오).
세포 현탁액이 투명하고 점성이 될 때까지 배양하되 5분 이상 배양하지 마십시오.
탁한 덩어리 없이 lysate가 투명해지면 즉시 다음 단계로 진행하는 것이 중요합니
다.
사용 전 버퍼 S2에 침전된 물질이 형성되면 37˚C에서 가열하여 용해합니다. 침전된
버퍼 S2는 DNA 복구 수율을 크게 감소시킬 수 있습니다.
미니
진올®특급TM프로토콜 핸드북17
플라스미드 DNA의 분리 및 정제
이 키트를 사용할 때 두 가지 방법 중 하나를 선택하여 plasmid DNA를 정제할 수 있습
니다. 플라스미드 DNA는 SV 컬럼을 통해 제거된 용해물을 끌어당기기 위해 원심분리를
사용하여 정제할 수 있습니다. 또는 진공을 사용하여 SV 컬럼을 통해 제거된 용해물을
강제로 통과시킬 수 있습니다(20페이지).
ㅏ 원심분리 프로토콜
18진올®특급TM프로토콜 핸드북
4.잔류 세척 버퍼를 제거하기 위해 추가로 1분 동안 원심분리기를 사용합니다. SV 컬럼
을 새 1.5ml 마이크로 원심분리기 튜브(제공되지 않음)로 옮깁니다.
미니
진올®특급TM프로토콜 핸드북19
비 진공 프로토콜
압력 범위
15~18수은
진공 압력은 이 목록의 범위에 있어야 합니다. 낮은 진공
285~345mmHg
은 DNA 수율과 순도를 감소시킬 수 있으며 너무 높은 진
380~460밀리바
공 압력은 컬럼 멤브레인을 파열시킬 수 있습니다.
5.5~6.5psi
진공을 해제합니다.
20진올®특급TM프로토콜 핸드북
진올®특급TM플라스미드 SV 미디
실험 전*처음 사용하기 전에 무수 에탄올(ACS 등급 이상)을 첨가하십시오.
병에 표시된 대로 버퍼 AW 및 PW에 넣습니다.
* 별도의 지시가 없는 한, 모든 원심분리 단계는 스윙 버켓 로터가 있는
4,000~5,000 xg 용량의 원심분리기에서 실온에서 수행해야 합니다(15
페이지 참조).
투명 용해물의 준비
진올®특급TM프로토콜 핸드북21
삼.2.5ml의 버퍼 S2를 추가하고 튜브를 4번 뒤집어 혼합합니다(와동하지 마십시오).
22진올®특급TM프로토콜 핸드북
플라스미드 DNA의 분리 및 정제
이 키트를 사용할 때 두 가지 방법 중 하나를 선택하여 plasmid DNA를 정제할 수 있습
니다. 플라스미드 DNA는 SV 컬럼을 통해 제거된 용해물을 끌어당기기 위해 원심분리를
사용하여 정제할 수 있습니다. 또는 진공을 사용하여 SV 컬럼을 통해 제거된 용해물을
강제로 통과시킬 수 있습니다(26페이지).
진올®특급TM프로토콜 핸드북23
5.4,500 xg(5,000 rpm)에서 15분 동안 3 ml의 버퍼 PW 및 원심분리기를 적용합니
다. SV 컬럼을 새 50ml 코니컬 튜브(제공되지 않음)로 옮깁니다.
7.(선택 과목:)
A. 보다 높은 용출액 농도를 위해; 6단계의 용출액을 SV 컬럼 멤브레인에 다시 로드
하고 캡을 닫고 실온에서 5분 동안 배양하고 4,500 xg(5,000 rpm)에서 5분 동안
원심분리합니다.
리한다.
24진올®특급TM프로토콜 핸드북
V
비비 음
ㅏV씨ㅏ유씨유유중
홍보피영형아르 자형티영형영형티씨영형영형씨엘올
압력 범위
23~26 HG
진공 압력은 이 목록의 범위에 있어야 합니다. 낮은 진공
580~660mmHg
압력은 DNA 수율과 순도를 감소시킬 수 있으며 너무 높
77~880밀리바
은 진공 압력은 컬럼 멤브레인을 파열시킬 수 있습니다.
11~12.5psi
진올®특급TM프로토콜 핸드북25
5.버퍼 PW 14ml를 적용하고 진공 소스를 켭니다. 모든 액체가 SV Midi 컬럼을 통과
하면 천천히 진공을 해제합니다.
26진올®특급TM프로토콜 핸드북
문제 해결 가이드
사리 가능한 원인들 제안
낮음 또는 아니오 샘플에 너무 많은 세 배양액은 항생제가 포함된 적절한 배지에서
수율 포 16~21시간 동안 배양해야 합니다. 샘플의 양
플라스미드 DNA 을 줄입니다. Terrific Broth(TB) 또는 2xYT
와 같은 진한 국물을 사용하는 경우 이러한 배
지는 세포 밀도가 매우 높기 때문에(LB의 2~5
배) 시작 샘플 부피를 줄여야 합니다.
진올®특급TM프로토콜 핸드북27
문제 해결 가이드
사리 가능한 원인들 제안
부적절한 원심분리기 스윙 버켓 로터(4,000~5,000 xg 가능)를 사용
(미디) 해야 합니다. 고정각 로터를 사용하면 용해물
과 컬럼 멤브레인 사이의 적절한 접촉이 실패
하여 DNA 수율이 낮고 일관되지 않을 수 있습
니다.
lysate로 벽을 덮는 단순한 반전 및 회전 튜브
는 혼합에 충분합니다.
28진올®특급TM프로토콜 핸드북
문제 해결 가이드
사리 가능한 원인들 제안
RNA 오염- RNase A 생략 또는 이 RNase A는 처음 사용하기 전에 버퍼 S1에 추
국가 전 가해야 합니다. RNase A가 포함된 버퍼 S1이
1년 이상 된 경우 RNase A의 활성이 감소할
수 있습니다. 추가 RNase A를 추가합니다(작
업 농도=100 ug/ml). RNase A가 포함된 버
퍼 S1은 4˚C에서 보관해야 합니다.
진올®특급TM프로토콜 핸드북29
간략한 프로토콜
진올®특급TM플라스미드 SV 미니
1.원심 분리에 의한 펠렛 세포
2.다음에 다시 일시 중단250ul버퍼의S1
삼.추가하다250ul버퍼의S2반전하여 혼합
4.추가하다350ul버퍼의S3반전하여 혼합
5.원심 분리기10 분
6.제거된 용해물을 SV 컬럼으로 옮기고 원심분리기에30초
7.(선택 과목:)추가하다500ul버퍼의AW및 원심분리기30초
8.추가하다700ul버퍼의PW및 원심분리기30초
9.추가 원심분리기1 분
10.적용하다50ul버퍼의EB및 원심분리기1 분
진올®특급TM플라스미드 SV 미디
1.원심 분리에 의한 펠렛 세포
2.다음에 다시 일시 중단2.5ml버퍼의S1
삼.추가하다2.5ml버퍼의S2반전하여 혼합
4.추가하다3.5ml버퍼의S3반전하여 혼합
5.(선택 과목:)4,500 xg(5,000 rpm)에서 20분 동안 원심분리기
6.용해물(4단계) 또는 제거된 용해물(5단계)을 EzClear로 옮깁니다.TM필터 컬럼(파란색
링),2분및 원심분리기3분~에1,000xg(2,200rpm)
7.pass-through를 SV Midi 컬럼(빨간색 링)으로 옮기고 원심분리기에3분~에
1,000xg(2,200rpm)
8.추가하다9ml버퍼의AW및 원심분리기3분~에1,000xg
9.추가하다12ml버퍼의PW및 원심분리기3분~에1,000xg
10.추가하다3ml버퍼의PW및 원심분리기15 분~에4,500xg
11.적용하다600ul버퍼의EB, 서 보자5 분및 원심분리기5 분~에4,500xg
30진올®특급TM프로토콜 핸드북
주문 정보
50 102-150 스핀 / 26 117-226 스핀 /
미니 미디
진공
플랜트에스브이
젤에스브이
200 102-102 진공 100 117-201
50 103-150 스핀 / 10 117-310 스핀 /
PCR SV 미니 맥시
200 103-102 진공 26 117-326 진공
50 토양 DNA 미니 미니 50 114-150 회전
113-150 스핀 /
클린업 SV 미니 스툴 DNA 미니 미니 50 115-150 회전
200 113-102 진공
바이러스 DNA/RNA 미니 50 128-150 회전
50 112-150 스핀 /
콤보 GP 미니 50 138-150
200 112-102 진공 FFPE 조직 DNA 미니 회전
250 138-152
진올®특급TM프로토콜 핸드북31
제품 규모 크기 고양이. 아니요. 유형 제품 규모 크기 고양이. 아니요. 유형
올스핀TM 미니 50 306-150 회전
리보세이버TM 미니 100 351-001 해결책
32진올®특급TM프로토콜 핸드북
제품 규모 크기 고양이. 아니요. 유형 제품 크기 고양이. 아니요.
24 악기 GST024 체계
하이퍼스크립트TM역전사용
게놈 DNA 세포/조직 96 401-104 전부
역전사 효소 10,000유 601-100 해결책
RT 마스터 믹스 0.5ml × 2 튜브 601-710 해결책 게놈 DNA 혈액 96 402-105 전부
원스텝 RT-PCR
0.5ml × 2 튜브 602-110 해결책
마스터 믹스
원스텝 RT-PCR
96 튜브, 20㎕ 602-102 해결책
프리믹스
첫 번째 가닥
50 반응 605-005 해결책
합성 키트
ZymAllTM
10,000유 605-010 해결책
RNase 억제제
ZymAllTM
4,000유 605-004 해결책
RNase 억제제
RealAmpTMqPCR 증폭용
SYBR qPCR 마스터 200 rxn 20㎕ 801-020
해결책
혼합(2X, 낮은 ROX) 500 rxn 20㎕ 801-050
진올®특급TM프로토콜 핸드북33
메모 .
34진올®특급TM프로토콜 핸드북
메모 .
진올®특급TM프로토콜 핸드북35
www.geneall.com
138-859 서울특별시 송파구 동남로 303-7 진올
빌딩
이메일 : sales@geneall.com
전화 : 02-407-0096
팩스 : 02-407-0779
ⓒ2018 GeneAll 생명공학, All right reserved 2018.06