Professional Documents
Culture Documents
Kimia Komputasi Proses Yoeh
Kimia Komputasi Proses Yoeh
KIMIA
• Wellson Andreas K. (1506738454)
KOMPUTASI
OUTLINE
Penyajian Data
Penjelasan Materi
Kesimpulan
Daftar Pustaka
TABEL S1
log(1/EC50M) (C1/∑C)× (C2/∑C)× log(1/EC50M) SPSS
Jenis Bakteri SAs SAPs TU (mol/L)
(mol/L)
(kcal/mol) (kcal/mol)
TMP SD 0.55 4.84 -0.23 -30.55 5.77296
TMP SMM 0.42 5.56 -0.94 -37.62 5.898
TMP SMP 0.52 5.43 -0.88 -38.7 5.92266
TMP SMX 0.54 5.43 -0.9 -33.82 5.81952
TMP SMZ 0.53 5.02 -0.35 -27.66 5.70831
TMP SM 0.8 4.75 -0.28 -27.04 5.6976
DVD SMM 0.35 5.62 -2.06 -36.46 5.83668
DVD SMP 0.4 5.54 -1.93 -37.59 5.8647
DVD SMZ 0.43 5.11 -0.77 -27.34 5.68773
DVD SIX 0.43 5.28 -1.16 -38.01 5.89893
DVD SM 0.4 5.05 -0.63 -26.79 5.6808
V. fischeri
OMP SMM 0.32 5.68 -0.84 -37.66 5.90214
OMP SMP 0.36 5.6 -0.78 -38.74 5.9268
OMP SMZ 0.41 5.13 -0.31 -27.67 5.70984
OMP SIX 0.41 5.31 -0.47 -38.7 5.93619
OMP SM 0.4 5.06 -0.25 -27.05 5.6988
PTM SMM 0.54 5.23 -12.78 -22.58 5.19144
PTM SMP 0.71 5.09 -12.26 -23.85 5.23527
PTM SMX 0.59 5.18 -12.43 -20.66 5.16267
PTM SMZ 0.53 4.93 -6.3 -22.2 5.3973
PTM SIX 0.55 5.05 -8.63 -28.23 5.44704
PTM SM 0.57 4.82 -5.33 -22.53 5.43624
TMP SDX 0.29 6.18 -0.34 -39.56 6.15714
TMP SMP 0.23 6.24 -0.31 -32.89 6.28336
TMP SMX 0.37 6.51 -0.96 -25.34 6.43786
TMP SM 0.32 6.22 -0.42 -31.52 6.31126
DVD SDX 0.25 6.21 -3.3 -36.68 6.26218
DVD SD 0.23 6.44 -5.2 -32.93 6.36573
E. coli
DVD SMM 0.33 6.43 -7.25 -27.29 6.50774
DVD SMX 0.19 6.72 -8.11 -20.79 6.64586
DVD SIX 0.23 6.36 -4.33 -27.12 6.46133
OMP SMM 0.34 6.46 -3.37 -30.58 6.37927
OMP SMP 0.16 6.38 -1.31 -32.13 6.3148
TABEL S1
log(1/EC50M)
log(1/EC50M) (C1/∑C)× (C2/∑C)×
SPSS
Jenis Bakteri SAs SAPs TU
(mol/L) (mol/L)
(kcal/mol) (kcal/mol)
TMP SDX 0.26 5.88 -6.72 -29.19 5.87989
TMP SD 0.26 5.91 -7.25 -31.74 5.92914
TMP SMM 0.34 6.08 -13.95 -20.33 6.07163
TMP SMP 0.19 5.73 -3.51 -27.84 5.73664
B. subtilis
TMP SIX 0.22 5.74 -4.15 -25.22 5.73342
DVD SDX 0.29 5.87 -2.81 -32.2 5.7566
DVD SD 0.37 5.8 -3.06 -35.31 5.80081
OMP SM 0.24 5.63 -0.99 -32.39 5.68589
TABEL S2
log(1/EC50M)
log(1/EC50M) (C1/∑C)× (C2/∑C)×
SPSS
Nama Bakteri TCs SAs TU
(mol/L) (mol/L)
(kcal/mol) (kcal/mol)
TH SMM 1.4 4.07 -30.14 -4.05 4.00663
TH SMP 1.45 4.05 -29.92 -4.43 3.99823
TH SMX 1.27 4.11 -29.99 -3.79 4.0253
TH SMZ 1.36 4.01 -25.45 -6.82 4.07811
TH SIX 1.55 3.99 -27.75 -6.91 3.97498
TH SM 1.42 3.96 -24.09 -7.76 4.09241
CH SDX 1.53 4 -10.95 -22.75 3.9529
CH SD 1.87 4.07 -15.74 -17.83 3.97817
CH SM 2.21 4.04 -17.44 -14.56 4.05876
V. fischeri OH SMM 1.72 3.75 -37.77 -2.39 3.75656
OH SMP 1.85 3.71 -37.61 -2.62 3.75263
OH SMX 1.95 3.69 -37.66 -2.24 3.76834
OH SMZ 1.33 3.81 -34.07 -4.3 3.82589
OH SIX 1.46 3.8 -35.95 -4.21 3.74928
OH SM 1.37 3.79 -32.9 -4.98 3.84424
DH SDX 1.82 3.92 -10.57 -22.6 3.97629
DH SD 2.55 3.93 -15.15 -17.65 4.012
DH SMZ 2.25 4.08 -18.62 -13.31 4.06677
DH SM 1.91 4.1 -16.77 -14.4 4.09509
TABEL S2 log(1/EC50M) (C1/∑C)× (C2/∑C)× log(1/EC50M) SPSS
Nama Bakteri TCs SAs TU (mol/L) (mol/L)
(kcal/mol) (kcal/mol)
TH SDX 1.5 5.46 -0.37 -39.44 5.4672
TH SD 1.32 5.73 -0.6 -37.02 5.5587
TH SMP 1.39 5.45 -0.33 -32.79 5.55735
TH SMX 1.27 5.97 -1.01 -25.11 5.83575
TH SMZ 1.31 5.41 -0.28 -39.01 5.45205
TH SIX 1.44 5.61 -0.49 -29.87 5.63955
TH SM 1.49 5.55 -0.45 -31.4 5.607
CH SDX 1.73 5.4 -0.16 -39.7 5.4129
CH SD 1.74 5.62 -0.26 -37.43 5.47095
CH SMM 2.08 5.71 -0.39 -32.78 5.5719
CH SMP 1.38 5.46 -0.15 -32.99 5.51115
CH SMZ 1.22 5.44 -0.12 -39.21 5.41065
E. coli CH SIX 1.43 5.61 -0.21 -30.14 5.5683
CH SM 1.52 5.55 -0.2 -31.65 5.54325
OH SDX 1.56 5.44 -0.57 -39.3 5.5173
OH SD 1.33 5.73 -0.94 -36.81 5.64345
OH SMM 1.45 5.85 -1.38 -31.99 5.82135
OH SMP 1.21 5.51 -0.52 -32.69 5.60445
OH SMX 1.48 5.9 -1.58 -24.88 5.976
OH SIX 1.47 5.6 -0.77 -29.73 5.70885
DH SDX 1.68 5.41 -0.12 -39.74 5.4027
DH SMP 1.5 5.42 -0.11 -33.02 5.5011
DH SMZ 1.47 5.36 -0.09 -39.24 5.403
DH SIX 1.27 5.67 -0.16 -30.18 5.5557
DH SM 1.32 5.61 -0.14 -31.69 5.52825
TABEL S2
Keterangan:
Y : −lgEC50M x1 : (C1/ ∑ C ) × Ebind1 x2 : (C2/ ∑ C) × Ebind2
BAKTERI E. COLI
• Perhitungan: • Paper:
• Tabel S1 (SAs & SAPs) : • Tabel S1 (SAs & SAPs) :
• Y = 0.019x2 - 0,017x1 + 6.903 • Y = −0.006x1+ 0.021x2 + 7.041
• Tabel S2 (TCs & SAs) : • Tabel S2 (TCs & SAs) :
• Y = 0.015x2 + 0,24x1 + 5,97 • Y = 5.419 + 0.012x2−0.260x1
• Tabel S3 (TCs & SAPs) :
• Y = 0,044x2 + 0,013x1 + 8.228 • Tabel S3 (TCs & SAPs) :
• Y = 8.812 + 0.028x1+ 0.057x2
Keterangan:
Y : −lgEC50M x1 : (C1/ ∑ C ) × Ebind1 x2 : (C2/ ∑ C) × Ebind2
BAKTERI B. SUBTILIS
• Perhitungan: • Paper:
• Tabel S1 (SAs & SAPs) : • Tabel S1 (SAs & SAPs) :
• Y = -0.011x2 - 0,046x1 + 5.29 • Y = −0.039x1−0.008 x2 + 5.365
• Tabel S2 (TCs & SAs) : • Tabel S2 (TCs & SAs) :
• Y = -0.007x2 + 0,003x1 + 4.811 • Y = 4.548 −0.015x2−0.004x1
• Tabel S3 (TCs & SAPs) : • Tabel S3 (TCs & SAPs) :
• Y = 0.167x2 + 0,215x1 + 13.104 • Y = 13.351 + 0.223x1+ 0.173x2
Keterangan:
Y : −lgEC50M x1 : (C1/ ∑ C ) × Ebind1 x2 : (C2/ ∑ C) × Ebind2
MEKANISME TOKSISITAS ANTIBIOTIC
BINER
• SA+DHPS dapat menghambat sintesis Asam Folat, maka menghambat bakteri tumbuh
• SAPs bereaksi pada jalur metabolism Asam Folat dan berikatan dengan DHFR
• TCs dapat menghambat produksi sel dan menggangu sintesis protein
TOKSISITAS CAMPURAN BINER PADA
KETIGA BAKTERI UJI
• SA-SAP : efek sinergis
• SA-TC : antagonis (V.fischeri dan E.Coli ) dan additive : B.Subtilis
karena assosiasi N10-leucovorin dalam dua jalan.
• SAP-TC : efek antagonis
• DHPS-SA : antagonis untuk ketiga bakteri uji
• TC-SA-SAP : efek additive karena tidak saling bergantung satu sama
lain
HASIL DAN PEMBAHASAN
“TOKSISITAS CAMPURAN BINARI”
• Pada bakteri V. vischeri, kombinasi biner antibiotik yang bekerja secara sinergis adalah SA-SAP, dengan
OMP-SMM (TU = 0,32; log(1/EC50 = 5,68) yang memberikan efek paling sinergis ketimbang
kombinasi SA-SAP lainnya. Sementara, kombinasi biner antibiotik yang bekerja secara antagonis
adalah adalah TC-SA dan TC-SAP dengan DH-SD (TU= 2,55; log(1/EC50 = 3,93) yang memberikan
efek paling antagonis ketimbang kombinasi TC-SA dan TC-SAP lainnya.
• Pada bakteri E.coli kombinasi biner antibiotik yang bekerja secara sinergis adalah SA-SAP, dengan
OMP-SMP (TU = 0,16; log(1/EC50 = 6,38) yang memberikan efek paling sinergis ketimbang
kombinasi SA-SAP lainnya. Sementara, kombinasi biner antibiotik yang bekerja secara antagonis
adalah adalah TC-SA dan TC-SAP dengan CH-SMM (TU= 2,08; log(1/EC50 = 5,71) yang
memberikan efek paling antagonis ketimbang kombinasi TC-SA dan TC-SAP lainnya.
HASIL DAN PEMBAHASAN
“TOKSISITAS CAMPURAN BINARI”
• Pada bakteri B.substilis kombinasi biner antibiotik yang bekerja secara sinergis adalah SA-SAP,
dengan TMP-SMP (TU = 0,19; log(1/EC50 = 5,73)) yang memberikan efek paling sinergis
ketimbang kombinasi SA-SAP lainnya. Sementara, kombinasi biner antibiotik yang bekerja secara
antagonis adalah adalah TC-SA dan TC-SAP dengan TH-DVD (TU= 2,16; log(1/EC50 = 5,28)
yang memberikan efek paling antagonis ketimbang kombinasi TC-SA dan TC-SAP lainnya.
• Dapat disimpulkan, bahwa protein DHPS dan DHFR merupakan protein yang vital pada ketiga
bakteri. Gangguan pada protein DHPS dan DHFR meningkatkan letalitas pada ketiga bakteri.
KESIMPULAN
• Pada bakteri V. vischeri, kombinasi antibiotik yang bekerja sinergis adalah SA-SAP, dengan OMP-
SMM sementara yang bekerja antagonis adalah SA-TC dan SAP-TC dengan DH-SD
• Pada bakteri E.coli kombinasi antibiotik yang bekerja sinergis adalah SA-SAP dengan OMP-SMP
sementara yang bekerja antagonis adalah SA-TC dan SAP-TC dengan CH-SMM
• Pada bakteri B.substilis kombinasi antibiotik yang bekerja sinergis adalah SA-SAP dengan TMP-
SMP sementara yang bekerja antagonis adalah SA-TC dan SAP-TC dengan DH-SD
• Protein DHPS dan DHFR merupakan protein yang vital pada ketiga bakteri. Gangguan pada
protein DHPS dan DHFR meningkatkan letalitas pada ketiga bakteri.