VALKUDE EHITUS

Koostas Kersti Veskimets

 Valkude töös seisneb elu!
• Erinevaid valke on
looduses lõpmata (?)
palju, inimese rakkudes on
500 000 (?)
• Igal valgul (molekulil) on
ainult üks kindel ülesanne.

http://www.bb.ustc.edu.cn/ocw/NR/rdonlyres/Global/2/2BB385E4-3C3D-40F4-A360-364
D48E01297/0/chp_pdbid_1FJ4.jpg
 Valgud, ehk proteiinid on polümeerid, mille
koostisosadeks on aminohappejäägid.

Aminohapped

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c1/Protein-primary-structure.png
 Erinevaid aminohappeid on 20
• Miks saab olla nii palju erinevaid valke?
• Sest aminohapped on erinevas järjestuses
ja neid on ka erinev arv valgumolekulis.
• Mis määrab valgu ülesande (töö)?
• Aminohappeline järjestus määrab valgu
ülesande.
• Mis määrab aminohappelise järjestuse?
• DNA
 Aminohappe üldvalem

Erinevaid radikaale ( R ) on 20.

H
O
H
N C C
H
OH
R
Aminorühm Karboksüülrühm
Mõned aminohapped
Aminohapete
ühinemisel
R R
tekib
peptiidside ja
eraldub vesi: Side tekib siia
Tekib vesi

Animatsioon peptiidsideme tekkest

 Aminohapete R
R
ühinemisel
tekib Kahe
peptiidside ja aminohappe
eraldub vesi: ühinemise
R
tulemus Ron
Side tekib siia
dipeptiid, eraldub
vesi: vesi tekib

R R

http://click4biology.info/c4b/3/images/3.2/dipeptide.gif Peptiidside
 Polüpeptiid
• Peptiidside on tugev side!
• Laguneb ainult hapetes keetmisel.

http://www.chembio.uoguelph.ca/educmat/phy456/gif/peptide2.gif
 Valkude struktuurid
Esimest järku struktuur on
valgu aminohappeline järjestus,
Seda hoiavad peptiidsidemed.

Teist järku struktuur on keerdumine

või voltumine (nõrgad sidemed).

Kolmandat järku struktuur

on gloobul (nõrgad sidemed).
Kui ühinevad mitu polüpeptiidi, siis on
tegemist neljandat järku struktuuriga.
http://www.biochem.arizona.edu/classes/bioc462/462bh2008/462bhonorsprojects/462bhonors2006/quachg/Images/
proteinStructure.gif
 primaarstruktuur

sekundaarstruktuur

tertsiaarstruktuur

kvaternaarstruktuur

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/
commons/thumb/c/c9/Main_protein
_structure_levels_en.svg/343px-
 Kvaternaarstruktuur ehk 4. järgu struktuur ei
ole kõigil valgumolekulidel.

Hemoglobiini
molekul
koosneb neljast
polüpeptiididst.

http://chsweb.lr.k12.nj.us/mstanley/outlines/organicAP/image221.gif
 Valgustruktuuride muutumisest
Valkude denaturatsioon – valkude kõrgemat
järku struktuuride lagunemine (kuumutamisel,
tehnilisel töötlemisel)
Valkude renaturatsioon – kõrgemat järku
struktuuride taastumine
Valkude hüdrolüüs – peptiidsidemete lõhkumine
ehk primaarstruktuuri lagunemine (hapetes
keetmisel). Inimese maos toimub pepsiini
abil HCl keskkonnas.
Aluselises keskkonnas toimub ka hüdrolüüs, kui ei teki vabu aminohappeid
vaid aminohapete soolad.
 Mille kaudu on määratud valgu
ülesanne?
Tema kõrgemat järku struktuuridega
▲
Aminohappelise järjestusega
(primaarstruktuuriga)
▲
DNA
Täpsemalt DNA nukleotiidjärjestusega
(primaarstruktuuriga)