Professional Documents
Culture Documents
Biyosensörler Ve Tıpta Kullanım Alanları PDF
Biyosensörler Ve Tıpta Kullanım Alanları PDF
ABSTRACT Biosensors are sensor systems that are combined with biological systems. They consist of two main parts; one of them is biological recognition element and the other one is physicochemical transducer. Biological recognition element can be biocatalysts (enzyme, microorganism, tissue materials) or bioligands (antibodies, nucleic acids, lectins) that interact selectively with the target analyte. Transducer converts the physical response resulting from the interaction between the target analyte and biological recognition element into a measurable signal. Biosensors which provide monitoring biological and synthetic processes can be used besides medical measuring and analyzing, for environmental observations and controls, defense industry, agriculture, food and pharmaceutical industry. Thus, they have an important role in daily life. In this review, characteristics of biosensors that are used in medical measuring and analyzing have been determined and classications of biosensors according different features that are found in literature are presented. Key words: Biosensor, medical measurement, biomaterial, biomedical application. ZET Biyosensrler biyolojik sistemler ile kombine edilmi sensr sistemleridir. Temel olarak ikiksmdan olumaktadrlar; bunlardan birincisi biyolojik alglayc, dieri ise zikokimyasal dntrcdr. Biyolojik alglayc eleman hedef analit ile seici olarak etkileimde bulunan biyokatalizrler (enzim, mikroorganizma, doku malzemeleri) veya biyoligandlar (antikor, nkleik asit, lektin) olabilmektedir. Dntrc ise hedef analit ile biyolojik alglayc arasndaki etkileime bal olarak ortaya kan ziksel cevab llebilir bir sinyale dntrmektedir. Biyolojik ve sentetik srelerin izlenebilme ve anlalabilme olana salayan biyosensrler, tbbi lm ve analizlerin yannda, evresel gzlem ve kontrollerde, savunma sanayinde, tarm, gda ve ila endstrilerindeki kullanm alanlaryla hayatta
Ariv Kaynak Tarama Dergisi . Archives Medical Review Journal 2013; 22(4):499-513
500
Biyosensrler
nemli bir role sahip olmaktadrlar. Bu derleme makalede tbbi lm ve analizlerde kullanlan biyosensrlerin karakteristikleri tanmlanm ve literatrde yer alan deiik snandrmalara yer verilmitir. Anahtar kelimeler: Biyosensr, tbbi lm, biyomalzeme, biyomedikal uygulamalar.
Giri
Biyosensrler fizikokimyasal analiz sistemleri ile biyolojik materyallerin birletirilmesi ile oluan analitik sistemlerdir. Biyosensrlerde biyolojik sistemin yksek zgll ile fiziksel analiz sisteminin tayin duyarll biletirilmitir. ok sayda biyoorganik molekl ve baz inorganik molekllerin analizinde kullanmak amac ile pek ok biyosensr gelitirilmitir. Gnmzde biyosensrler, zellikle salk alan bata olmak zere; evresel analizlerde, askeri sahada, gda, farmastik ve kimya endstrilerinde kullanlmaktadr1. Bu derlemede gnmzde kullanlan geleneksel tbbi lm yntemlerin yannda, yeni bir yntem olarak biyosensrlerin alma prensibinin anlatm amalanm olup, geleneksel tbbi lm yntemlerinden stnlkleri tartlacaktr.
Genel Bak
Biyosensrler temel olarak; analiz edilecek maddenin biyosensr yzeyindeki biyobileen (biyolojik tanma blgesi) ile etkileime girmesi sonucu transduser (dntrc) yzeyinde
Kkba ve ark.
501
analit miktaryla orantl bir sinyalin oluumu ve bu sinyalin lm cihazna iletilmesi ilkesine dayanr1. Biyosensrlerde biyobileen olarak enzimler, mikroorganizmalar, bitkisel ve hayvansal dokular, reseptrler, antikorlar ve nkleik asitler kullanlabilir. Analiz edilecek molekle uygun olarak bir biyobileen ve analitin dnm sonucunda oluan elektrokimyasal, optik ya da gravimetrik sinyali elektriksel sinyale eviren uygun bir transduser seilmelidir. Transduser ve biyobileen birbirine uygun fiziksel ya da kimyasal yntemle balanabilir.2 ekil.1de bir biyosensr sisteminin birimleri ematik olarak gsterilmitir. Gnmzde biyosensrler; biyobileen ve transduser olarak pek ok farkl maddeyi ve sistemi iermektedir. Bunlarn en nemli olanlar Tablo.1de verilmitir
Tablo.1. Biyosensr Bileenlerinin erii2. Analit Biyobileen Metaller Hormonlar Enzimler Enzim Antikorlar Koenzimler Hcre Substrat Doku kesitleri Aktivatr Reseptrler nhibitr Mikrorganizmalar Antikor-Antijen Nkleik asitler Nkleik asit Lipidler Mikrorganizmalar Hcre organelleri Sinyal letici Sistem Elektrokimyasal Esasl Elektrokimyasal Esasl Yar iletken esasl Optik esasl Fotometri esasl Florometri esasl Florometri esasl Piyezoelektrik Kuartz kristal mikrobalans (QCM) Mikrokantileverlar
Biyosensrlerin Snflandrlmas
Analiz edilecek madde-biyoaktif bileen ilikisine gre
Biyosensrler farkl bir bak asyla analiz edilecek madde- biyoaktif bileen ilikisine gre biyokatalitik esasl ve biyoafinite esasl olmak zere ikiye ayrlr3. a. Biyokatalitik esasl biyosensrler (mikroorganizma ve enzimlerin kullanld biyosensrler)
502
Biyosensrler
Organ (rnein; koku alma organ) Doku Tm Hcre Hcre Organeli (rnein; mitokondri) Biyomembran (rnein; reseptr) Lipozom Enzim Antikor yonofor ekil.2. Biyosensr teknolojisinde kullanlan biyoaktif materyal hiyerarisinde enzimlerin yeri4
Kkba ve ark.
503
4. Antikor/Antijen temelli (immnobiyosensrler) 5. Mikrobiyal kkenli 1. Enzim temelli biyosensrler Biyosensr teknolojisinin tarihsel gemiine bakldnda bu alandaki ilk almalarn enzim sensrleriyle balad grlmektedir. 1962de Clark ve Lyons ve 1967de Updike ve Hick tarafndan rapor edilen glukoz tayinine ynelik glukoz oksidaz enzim elektrotlar bu konudaki ilk rnekleri oluturmaktadr4. Biyosensr teknolojisindeki ilk rnekler zellikle amperometrik ve potansiyometrik temelli enzim elektrotlar seklinde ortaya kmlardr. Bu durumun en nemli nedeni o tarihteki bilgi ve teknolojik birikimin sz konusu almalar iin yeterli dzeye ulamam olmasdr. Biyosensr teknolojisinde kullanlan biyolojik materyaller artan karamaklk niteliklerine gre sralandklarnda; iyonoforlar, antikorlar, enzimler, lipozomlar, biyomembran paralar (rnein; reseptr), hcre organelleri (rnein: mitokondri) doku veya tm hcreler ve organlar (rnein; grme ve koklama ekil.2) eklinde snflandrlabilirler. En genel anlamda bakldnda dier biyosensrlerde olduu gibi enzim sensrleri de biyoaktif tabaka, iletici ve lm sisteminden oluur.2 Dier biyosensrlerden tek fark biyoaktif tabakada biyomolekl olarak enzimlerin yer almasdr. Buna karlk dier biyosensrlerde olduu gibi biyoaktif tabakann i ve d yzeylerinde membranlar, iletici ile lm dzenei arasnda sinyal ykselticiler, mikroilemciler veya lm dzeneiyle balantl kaydedici veya bilgisayar sistemleri, gereksinimlerine gre eklenen unsurlardr5. 2. Doku Temelli Biyosensrler Hayvansal ve bitkisel baz dokularn ve organellerin kimi enzimlerce zengin olduu bilinmektedir. te bu enzimlerin izole edilmi preparatlar yerine dorudan youn bulunduklar bu doku paralar da biyobileen olarak kullanlmaktadrlar3,7. zellikle uzun ve masrafl enzim saflatrma zorluundan kurtard iin ve hedef analitin ok basamakl dnmnde farkl enzimlerin bir arada kullanlmas yerine bu enzimleri ieren dokunun kullanm ve ilgilenilen enzim ticari olarak bulunmuyorsa doku paralarnn biyobileen olarak kullanm avantajldr. Dokularn komplekslikleri sebebiyle her yeni tip elektrot iin cevap karakterleri farkl olduundan her biyosensr iin optimizasyon gereklidir.
504
Biyosensrler
Biyosensrlerin bu trnde enzimler doal ortamlarnda bulunacaklarndan katalitik sabitlik asndan ok avantajldr. Ancak substratn enzime ulamas iin amas gereken difzyon bariyerinin artmasndan dolay cevap sresi uzar7. Bu dezavantaj ksmen de olsa azaltabilmek iin dokular homojenize edilerek kullanlr. Bunun yannda dokular pek ok enzimi bnyelerinde ierdiklerinden analitin istenilen enzim dndaki dier enzimlerle dntrlmesi ile oluacak hatalar engellemek iin dier enzim sistemlerini inhibe edecek maddeler ve koullar biyosensr hazrlanrken kullanlabilir6.
3. DNA Temelli Biyosensrler Biyobileen olarak tek zincirli DNA oligomerlerinin kullanld biyosensr sistemleridir. DNA yapsnn ortaya kmas, hibridizasyon, amplifikasyon ve rekombinant DNA teknolojilerinin geliimi DNA sensrlerinin gelitirilmesine nclk etmitir. Genellikle DNA sensrleri transduser yzeyine sabit haldeki tek zincirli DNA oligomeri (DNA probu) ile belli bir hastal, kaltsal bir karakteri ya da bir bakteri veya virsn patojenitesini simgeleyen bir tek zincirli
Ariv Kaynak Tarama Dergisi . Archives Medical Review Journal
Kkba ve ark.
505
DNA parasnn hibridizasyonu prensibine dayanr1,8. Bu hibridizasyonla oluan ift zincirli DNA sayesinde bir elektrokimyasal ya da optik sinyal oluur ve optik, piyezoelektrik, elektrokimyasal bir transduser ile sinyal okunabilir hale getirilir. Kullanlan DNA problar genellikle 20-30 bazlk ksa tek zincirli DNAlardr9.
4. Antikor/Antijen(mmno Sensrler) Temelli Biyosensrler Biyobileen olarak antikorlarn kullanld biyosensrler antikor temelli biyosensrler ya da immnosensrler olarak adlandrlrlar. Vcuda giren yabanc organizmalara (virs, bakteri ve protozoa) veya onlarn protein rnlerine kar baklk sistemi hcreleri tarafndan retilen protein yapl maddelere antikor denir. Antikorlar ve antijenler arasnda zgl etkileim olduundan immnosensrler ile son derece zgl ve duyarl analizler yaplabilir. Antikorlar uygun transduserler ile eletirilerek hormon, ila, virs, bakteri ve evresel kirletici olan dier molekllerin, pestisitlerin, biyomedikal maddelerin tayini iin immnosensrler gelitirilebilir16. 5. Mikrobiyal Biyosensrler
506
Biyosensrler
Bir mikrobiyal biyosensr bir transduser ile canl veya canl olmayan mikrobiyal hcrelerin sabitlenerek (immobilize edilerek) birlemesi ile oluur10. Biyosensrlerin yapmnda kullanlan mikroorganizmalar bir takm avantajlara sahiptir. Mikroorganizmalar geni bir aralktaki kimyasal bileikleri metabolize edebilir. Mikroorganizmalar olumsuz artlara uyma konusunda byk bir kapasiteye sahiptirler ve yeteneklerini gelitirerek zamanla yeni molekller oluturabilirler. Mikroorganizmalar ayn zamanda mutasyonla veya rekombinant DNA teknolojisi ile oluan genetik modifikasyonlar iin de ekonomik hcre ii enzim kaynadr11.
(A: Substrat, B: Kosubstrat veya Koenzim, C ve F: rnler, : lm zeltisi iindeki, t: biyoaktif tabakadaki ve y: elektrot yzeyindeki deriimler. D.T: Difzyon tabakas, ..: lm zeltisi, B.T.: Biyoaktif tabaka, : letici)
Enzim tabanl sensrlerle karlatrldnda hcre kullanmann ana snrlandrc faktrlerinden biri substrat ve rnlerin hcre zarndan difzyonunun daha yava bir cevap salamasdr. Bu problemin stesinden gelmenin bir yolu hcre geirgenliini arttrmaktr. Hcrelerin geirgenlii fiziksel (dondurma-zme), kimyasal (organik zcler/deterjanlar)
Ariv Kaynak Tarama Dergisi . Archives Medical Review Journal
Kkba ve ark.
507
ve enzimatik (lizozim, papain) ilemlerle arttrlabilir. Bu konuda en ok kullanlan yntem toluen, kloroform, etanol ve butanol gibi organik zcler ve N-asetil-N,N,N-trimetil amonyum bromit (CTAB), Na-deoksikolat ve dijitonin gibi deterjanlarn kullanld kimyasal yntemlerdir12. Bu tr kimyasal ilemler hcre membranndaki baz lipitlerin ayrlmasna neden olarak kk molekl arlkl substratlarn ve rnlerin membrandan difzyonunu, enzim gibi makromoleklleri hcre iinde tutarak, kolaylatrr. Geirgenlik sreci hcrelerin lmne neden olsa da hcre ii enzimlerin ekonomik bir ekilde kullanlmasn salar. Bu yntem kofaktr rejenerasyonu veya metabolik solunum gerektirmeyen basit biyosensr yapmlarnda kullanlr.
Tablo.2. Biyosensr Gruplar ve Kapsadklar Analiz Alanlar Biyosensr Grubu Analiz Tr Enzim sensrleri Kk molekll organik ve anorganik maddeler( ilalar, gda maddeleri, vitaminler, antibiyotikler.) Mikrobiyal sensrler Enzim sensrlerin kapsad alanlar +BOD, Toksisite, Mutajenite DNA Sensrleri Virsler, patojen mikroorganizmalar mmnosensrler Virsler, patojen mikroorganizmalar, zenobiyotikler
Saf enzimlerle karlatrldnda hcre tabanl biyosensrlerin dk zgl aktiviteleri hcre kullanmn snrlandran bir dier faktrdr13. Bu genel olarak hcredeki dier enzimlerce katalizlenen istenmeyen yan reaksiyonlarn meydana gelmesine neden olur. zgl olmayan tepkimeleri en aza indirmek iin birtakm yaklamlar aratrlmaktadr. Hcre geirgenliinin arttrlmas istenmeyen yan reaksiyonlara neden olan kk molekl arlkl kofaktrler salnmn salar. Bunun sonucunda rnein laktozu etanol ve CO2ye dntren hcre ii galaktozidaz enzimini ieren maya hcresi geirgenlik ilemine tabi tutulduunda birok kofaktr kaybettiinden laktozu ancak glukoz ve galaktoza dntrebilir. Cansz hcrelerde hcre iindeki dier enzimlerce gerekleen yan reaksiyonlar o enzimin fiziksel (stmayla) ya da kimyasal olarak inaktive edilmesiyle de en aza indirilebilir.
508
Biyosensrler
a. b. c. d. e.
Sabitletirme iin kullanlan temel yntemler: Adsorpsiyon (kovalent olmayan balama) Kovalent Balama Tutuklama apraz Balama
Bu sabitleme yntemleri ematik olarak ekil 4 de gsterilmitir. Biyosensrn mr sabitleme ilemiyle biyobileenin transduser yzeyinde ne kadar sre tutulabildiine bal olduundan, biyobileenin uzun sre yzeyden ayrlmasn engellemelidir. Enzimlerin sabitlenmesinde enzim aktif merkezi sabitleme esnasnda zarar grmemeli ya da enzim aktivitesinde sterik engel nedeniyle d olmamasna dikkat edilmelidir13.
Kkba ve ark.
509
h. Kararllk: Belirli bir sre iinde cihazn duyarllndaki deiimleri dikkate alan bir kalite lm deeridir.
510
Biyosensrler
Kkba ve ark.
511
Protezlere yerletirilen biyosensrler sayesinde, protez yzeyinde reyen bakterilerin trleri tespit edilir ve protez iinde bulunan antibakteriyel maddeler salglanp ve enfeksiyon engellenir19. Son yllarda dnyada ip zerinde Laboratuvar (Lab-on-Chip) teknolojisi olarak adlandrlan mikrosistemler zerinde allmaktadr. Bu yeni teknolojiyle; tek bir ipte tm genomun izlenmesi ve binlerce gen arasndaki etkilemenin ayn zamanda belirlenmesi salanabilir. Bu teknolojinin esas biyosensrlere dayanmaktadr ve bu ipler kltlm DNA biyosensrleridir22,23.
Biyosensrlerin, karmak maddelerin rasyonel ve ucuz olarak tayininde kullanm ekonomik ve toplumsal arlk kazanmalarn salamtr. Biyoip teknolojisindeki gelimelere bal olarak biyosensrlerin nemi ve arl gittike artacaktr25,26. zellikle youn bakm nitelerinde, ameliyatlarda ve implantasyon amac ile kullanlacak biyosensrlerde minyatrizasyon ok nemlidir. 21. yzyln anahtar teknolojilerinden biri olan nanoteknoloji biyosensrlerin ufkunu ok aacak ve ekonomi ve gnlk yasamdaki arln daha da artracaktr27. Bu erevede lkemizde Ulusal Biyosensr Aratrma Gelitirme Merkezinin en ksa zamanda kurulmasnda byk yarar vardr28.
Kaynaklar
1. 2. Dinkaya E, Enzim sensrleri. In Biyosensrler, Biyokimya Yaz Okulu Kitab, (Ed. A Telefoncu):81142. zmir, Ege niversitesi Basmevi, 1999. Akbayirli, P, Akyilmaz, E. Activation-based catalase enzyme electrode and its usage for glucose determination. Analytical Letters 2007; 40:3360-72.
512
Biyosensrler
3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23.
Akyilmaz E, Baysal SH, Dinkay, E. Investigation of metal activation of a partially purified polyphenol oxidase enzyme electrode. Int J Environ Anal Chem. 2007; 87:755-61. Akyilmaz E, Yorganci E. A novel biosensor based on activation effect of thiamine on the activity of pyruvate oxidase. Biosens Bioelectron. 2008; 23:1874-7. Bartlett PN. Biosensors, (Cass, A.E.G. ed.): 42. Oxford, Oxford University Press, 2008. Beilen JB., Li Z.: Enzyme technology: an overview. Curr. Opin. Biotech. 2002; 13:338-44. Garipcan B, Andac M, Uzun L, Denizli A., Methacryloylamidocysteine functionalized poly(2hydroxyethyl methacrylate) beads and its design as a metal-chelate affinity support for human serum albumin adsorption. React Func Polym. 2004; 59:119-28. Budavari S. The Merck Index, 12th ed., Whitehouse Station, NJ, Merck Co., 1996. Camps M, Katakis I. DNA biochip arraying, detection and amplification strategies. Trend Anal Chem. 2004; 23:49-62. Hemachandera C., Bosea N, Puvanakrishnan R. Whole cell immobilization of Ralstonia pickettii for lipase production. Process Biochem. 2001; 629:633-7. Chemical Information Services. Directory of World Chemical Producers. Dallas, ChemicalInfo, 1994. Guilbault GG, Kauffmann J. Enzyme-based electrodes as analytical tools. Biotech Appl Biochem. 1987; 9:95-113. Cooper JC, Hall EA. The nature of biosensor technology. J Biomed Eng. 1988; 10:210-9. Coulet PR, Bardeletti G. Biosensor-based instrumentation. Biochem Soc Trans. 1991; 19:1-4. Dinkaya E. Biyosensrler. zmir, Ege niversitesi Fen Fakltesi Bask Atlyesi, 1999. Dong S, Chen X. Some new aspects in biosensors. J Biotechnol. 2002; 82:303-23. DSouza SF. Immobilized cells: techniques and applications. Indian J. Microbiol. 1989; 29:83-117. DSouza SF. Immobilized enzymes in bioprocess. Curr Sci. 1999; 77:69-79. DSouza SF. Immobilization and stabilization of biomaterials for biosensor applications. Appl Biochem Biotech. 2001; 96:225-38. Rainina EI, Efremenco EN, Varfolomeyev SD, Simonian AL. The development of a new biosensor based on recombinant E. coli for the direct detection of organophosphorus neurotoxins. Biosens Bioelectron. 1996; 11:991-1000. McGlennen RC. Miniaturization technologies for molecular diagnostics. Clin Chem. 2001; 47:393402. Ratner BD, Hoffman AS, Schoen FJ, Lemons JE. Biomaterials Science. San Diego, CA, Academic Press, 1996. Sharma SK, Sehgal N, Kumar A. Biomolecules for development of biosensor and their applications. Curr Appl Phys. 2003; 3:307-16.
Kkba ve ark.
513
24. Nordstrm M. Biosensors and BioMEMS - applications and implications. Paper presented at Sm Detektiver, Aarhus, Denmark, 2005. 25. Bhushan B. Nanotribology and nanomechanics of MEMS/NEMS and BioMEMS/BioNEMS materials and devices. Microelectron Eng. 2007; 84:387-412. 26. Okandan M, Galambos P, Mani S, Jakubczak J. Development of surface micromachining technologies for microuidics and BioMEMS. Presented at SPIE Micromachining and Microfabrication Conference, San Francisco, CA, October 2001. 27. Jianrong C, Yuqing M, Nongyue H, Xiaohua W, Sijiao L. Nanotechnology and biosensors, Biotechnology Advance. 2004; 22: 505-18. 28. Akkaya A. Pazarcoglu N. 21.Yzyln Anahtar Teknolojisi: Beyaz Biyoteknoloji. zmir, Ege niversitesi Fen Fakltesi Basmevi, 2004. Correspondence Address / Yazma Adresi Umut Kkba ukurova niv. Tp Fak. Tbbi Biyokimya ABD Adana, Turkey E-mail: ukokbas@cu.edu.tr