GEOL 

5310 Advanced Igneous and Metamorphic Petrology ‐ Fall 09 
Igneous Lab 2: Geochemical Plots of Igneous Rocks 
 
 
Objective:  In  this  lab,  we  will  become  familiar  with  geochemical  databases  associated  with  various 
tectonic  environments  and  how  to  portray  that  data  on  various  geochemical  plots  using  IGPET  
2001 software. 
 
Procedure:  Using  geochemical  databases  from  the  web  and  those  provided,  you  will  be  asked  to 
evaluate the data by making a variety of geochemical plots commonly applied to igneous rocks.  
 
Part 1 ‐  Working with Data from Specific Tectonic Environment  
1) Acquiring a Geochemical Database.  
There  are  a  number  of  website  that  have  been  developed  recently  that  seek  to  compile 
geochemical data for igneous rocks in a variety of tectonomagmatic environments.   One of the 
best  of  these  is  the  GEOROC  website  maintained  by  Max  Plank  Institute  in  Mainz,  Germany 
(http://georoc.mpch‐mainz.gwdg.de/georoc/Entry.html). 
 
a) Click on the link to Geologic Settings  
b) Choose one of the eleven geologic settings and then select a specific geological location.   
c)  You  will  then  be  asked  to  further  specify  the  what  type  of  data  you  are  seeking  with  your 
choices depending on the breadth of the database; continue on parsing your selection 
until requested to make a sample selection criteria 
d) Choose rock type and then select volcanic rocks 
e)  When  prompted  to  select  chemical  criteria,  click  the  “All”  box  for  major  elements,  trace 
elements, and REE 
f) At the metadata prompt, select “standard output” and download 
g) On the next page, click on “Download the Table for Excel” 
h) Open the downloaded .cvs file in Excel and save as an Excel workbook file.  
 
2) Preparing a Data Table for Plotting in IGPET.  
IGPET has some basic requirements of data tables in order to plot geochem data.  We will work 
with the data you downloaded from the GEOROC website to prepare it for plotting in IGPET. 
 
a)  There  are  lots  of  ancillary  information  associated  with  each  GEOROC  analysis  that  is 
unnecessary  for  our  purposes.    Of  the  27  or  so  attribute  columns  leading  to  the  actual 
analyses, delete everything but the sample name and the rock name.  For the data, delete all 
columns indicating analytical methods.   
b) There are also lots of data that are incomplete analyses.  As a first pass, delete all analyses  
that  do  not  have  REE  data;  as  a  second  pass,  delete  all  analyses  that  do  not  have  major 
element analyses.    If you have more than 50 analyses after these two filters, you can delete 
more  analyses  until  you  whittle  the  total  down  to  50,  but  be  sure  to  keep  a  good  mix  of 
different “rock names”.    
c) Resave your Excel spreadsheet.  
d)  IGPET  requires  that  the  first  four  columns  be  1)  Sample,  2)  Jcode,  3)  Kcode,  and  4)  Lcode.   
Basically  delete  the  work  “Name”  in    the  first  cell  in  your  spreadsheet  so  it  just  reads 
“Sample”  .    Then  insert  3  columns  after  the  sample  columns  and  label  the  first  row  cells 
1
 Fall 2009

Jcode, Kcode, and Lcode.  The code columns provide the opportunity to sort data by up to 
three  criteria.      We  will  sort  the  data  by  rock  name  using  the  Kcode.    Asign  a  different 
number for each rock name (e.g., 1‐basalt, 2‐basaltic andesite, 3‐andesite…).  
e) IGPET also is looking for standard oxides and elements in the first row.  This requires that you 
delete any “wt%”, “ppm”, or similar tags on the composition headings.  You will also need to 
convert all of your Fe analyses to FeO(total); to convert Fe2O3 to FeO, multiply by 0.8998.    
f) After the major element data, insert two columns.  For these calculate the mg# and An% (both 
in mol%) from your major element data.  Remember mg# = MgO/(FeOt+MgO)*100 and An% 
=CaO/(CaO+Na2O+K2O)*100.    (Don’t  forget  to  divide  your  wt%  values  by  the  molecular 
weights of each oxide to get results that are in mol%) 
g) When you table is “cleaned‐up”, you should save it in Excel, then save it again as a Unicode 
text file, which is compatible with IGPET.  
 
3) Making X‐Y (Harker) Plots in IGPET.  
We will now load our table into IGPET and make a variety of petrologically useful plots from this 
data.  We will start with simple X‐Y Harker plots. 
a) Open IGPET 
b) Pull down the”File” menu and select “Open File”; find the text file you saved of your GEOROC 
data and open it.  
c)  To  check  on  the  data  file,  select  “File  Operation”  from  the  File  menu  and  click  on  “Modify 
Data”.  The first four columns should again be 1) Sample, 2) Jcode, 3) Kcode, and 4) Lcode 
with your rock type attributes distinguished in the K code column. If OK, cancel.  If not OK, 
go back to your Excel table and modify.  
d)  From  the  “Plot”menu  select  XY.  You  will  then  be  prompted  to  select  among  various 
compositional  parameters  for  the  X  axis.      We  will  use  the  standard  parameter  of  SiO2.   
Then you will be prompted to select a Y axis parameter.  Initially choose MgO.  An SiO2‐Mgo 
diagram  should  appear.    (If  the  diagram  doesn’t show the lower part of the diagram, click 
“Position” from the “Edit” menu and choose “Lndscp‐UR”).   
e)  To  discriminate  the  different  rock  types,  select  “Symbols”  from  the  “Edit”  menu.    In  the 
window, select the Kcode in the upper left.  You may also need to “refresh” the symbols to 
see the types.   If you want to reduce their size, click on “New Size” and reduce the default 
size  (0.7)  to  a  lower  value.    Close  the  window  and  different  symbols  should  appear 
corresponding to your Kcode selections  
e) Save this plot as a Word Metafile (.wmf) by selecting “Save diagram to wmf file” – diagram 
from the “File” menu (it will place it in the same folder as the data).  Give it a name like “Si‐
Mg”.  
f) Make more Harker diagrams for SiO2 vs. FeOt*, Al2O3, CaO, TiO2, K2O, and P2O5 and save 
them  as  WMF  files.    (*You  want  to  plot  total  Fe,  which  may  be  as  Fe2O3t  or  FeO+Fe2O3 
which you can make as a new parameter when the menu in d) appears ). 
Assignment:  
• Compile your data into a series of stacked Harker plots in either Word or Illustrator. 
• Draw regression lines showing the main trends of the data 
• Comment on whether your data define a reasonable magma series as discussed in the 
lecture on Monday.    
• If  any  inflections  appear  in  your  data  trends,  can  you  speculate  as  to  a  possible 
explanation (e.g. a change in the fractionating mineral assemblage)?   
• If your data show significant scatter, can you proffer any explanations for that? 
 
 
2
 Fall 2009

4) Making AFM Plots in IGPET.  
IGPET  has  a  number  of  “canned”  discrimination  plots  of  well  accepted  petrologic  significance. 
First you will determine whether you data are alkaline or subalkaline using an SiO2‐Alkali plot. 
Then  for  the  subalkaline  data,  you  will  use  an  Alkali‐Iron‐Magnesium  (AFM)  ternary  plot  to 
discriminate tholeiitic from calc‐alkaline magma series based on the work of Irvine and Baragar 
(1970).  
a) With your GEOROC data table loaded, select “Diagrams” from the “Plot” menu.  
b) This will open a window asking you to find a “.dgm” file.  You will need to browse to the IGPET 
2001 folder.  Opening this, you will see several .dgm files; select the “Irvbar.dgm” file.  
c)  A  “select  diagram”  menu  will  pop  up;  select  “SiO2‐alk  alk  vs  subalk”;  a  ternary  plot  of  your 
data should appear.  Again, you may need to adjust the diagram position to see it entirely. 
d) Save this diagram as a wmf file. 
e) ID the samples that plot in the alkaline field; reopen your text file in Excel and assign those 
data plotting in the alkaline field an Lcode of 0; assign the subalkaline rocks an Lcode of 1. 
f) Select the Irvbar.dgm file again and this time select “AFM thol vs. calc‐alk”; a ternary plot of 
your data should appear.  From the “edit” menu, select “symbols” and have data sorted by 
the L code (you may also want to reduce the size of the symbols).   This will then show the 
data that are subalkaline as large symbols and the alkaline data as small symbols.     
d) Save this diagram as a wmf file. 
 
Assignment:  
• Place all your figures in a word document and answer the questions below. 
• Is  your  subalkaline  data  mostly  tholeiitic  or  calc‐alkaline?      Does  this  make  sense  knowing  the 
tectonic environment of your data set? 
• If  you  replot  your  data  on the AFM diagram and discriminate by rock type (Kcode), do certain 
rock  types  tend  to  plot  in  one  field  or  the  other?    Add  a  plot  of  this  diagram  to  your  Word 
document.  
 
5) Tectonic Discrimination Diagrams in IGPET. 
  IGPET  also  has  various  tectonic  discrimination  diagrams  based  on  various  trace  element 
abundances and ratios.  
a) With your GEOROC data table loaded, again select “Diagrams” from the “Plot” menu; browse 
for the IGPET 2001 folder and this time select “discrim.dgm” 
b) This will open a “select diagram” window of displaying various discrimination diagrams.  
c) Plot your data on at least three different diagrams and save each as a wmf file.  
 
Assignment:  
• Place  all  your  figures  in  a  word  document  and  comment  on  whether  the  indicated  tectonic 
environments are consistent with the known tectonic environment of your data.  
 
 
Part 2 ‐  Comparing Data from Different Tectonomagmatic Environments with Spidergrams  
1) Download Database 
From the class website, download the text file “BSLT‐ANDST”. This lists average compositions of 
primitive  basalt  compositions  from  various  island  arc  (IAB)  and  continental  arc  (CAB)  settings 
complied  by  Keleman et al. (2004).  It also lists their average compositions for MORB, oceanic 
basalt  (OIB),  continental  basalt  (CFB),  oceanic  andesite  (OA),  continental  andesites  (CA)  and 
oceanic bonninite (OBn).   The text table is already formatted for being read into IGPET.  
3
 Fall 2009

 
2) Make REE plots 
IGPET has several normalization data sets to create REE spider diagrams for you data.  We will 
use the plots normalized to chondrites as determined by Sun and McDonough (1989).   
a) Open the BSLT‐ANDST text file in IGPET, then select “Spider” from the “Plot” menu; choose 
the first plot “REEs Sun and McD chondrites” 
b) The next window will ask you select specific samples to be plotted (double click to select).      
Assignment 
• You should plot (and save as wmf files) the following data pairs: 
A) MORB, Avg Oceanic Basalt (OIB) 
B) Avg Oceanic Basalt (OIB), Avg Continental Basalt (CFB) 
C) Avg Oceanic Basalt (OIB), Avg Oceanic Andesite 
D) Avg Cont Basalt, Avg Aleutian Andesite 
E) Suite of Island Arc Basalts (IAB), Suite of Continental Arc Basalts (CAB) 
F) Avg Aleutian Andesite, Avg Boninite Andesite 
• Paste the six plots into Word and comment on;  
1)  how the REE patterns differ from each other in terms of shape and enrichment relative to 
bulk earth (chondrite) composition, and  
2) what minerals might be involved in the generation of the magmas either through partial 
melting  or  fractional  crystallization.    Realize  that  all  of  the  basalt  compositions  are 
relatively  primitive,  such  that  their  signatures  may  be  most  representative  of  partial 
melting processes, whereas andesitic compositions were like generated by fractionation 
of  basalts.    The  figure  on  the  next  page  may  be  helpful  in  this  evaluation.    Also,  you 
should look into the origin of boninitic magma to evaluate Data Pair F.  
 
3) Make Spidergram plots 
To  compare  a  broader  range  of  incompatible  trace  elements,  we  will  plot  spidergrams  using 
Thompson (1982) element suite normalized to chondrite.    
a)  Using  the  BSLT‐ANDST  text  file,  select  the  “Thompson,  R.N.,  1982‐double  chondrite”  Spider 
diagram.   
Assignment 
• Again, make, save, and paste into Word, plots of the same six data pairs as for the REE  
• Comment on the contrasting patterns and degrees of enrichment 
• Point out  any positive or negative anomalies 

4
Fall 2009

 
From Rollinson (1996)