Professional Documents
Culture Documents
SVUILITA U ZAGREBU
Magistarski rad
Zagreb, 2004.
1. UVOD
Hrvatska je u svjetskim ihtiolokim krugovima poznata po postojanju
brojnih endemskih vrsta i podvrsta riba (Economidis i Banarescu, 1991).
Razlog izuzetne specijacije slatkovodne ihtiofaune je postojanje dva velika
rijena sliva, dunavskog i jadranskog na relativno malom podruju, koji su u
Sloveniji meusobno odijeljeni Alpama, a u Hrvatskoj Dinaridima. Jadranski
sliv, sa pripadajuom povrinom od 23800 km2 ubraja se meu najmanja
ihtiofaunska podruja ovog dijela Europe. Rijeke toga sliva znatno se
meusobno razlikuju po duini toka i mjestu poniranja, (jezero, more ili krake
rupe), a ako ih usporedimo s rijekama Dunavskoga sliva, uoavamo da su
izrazito kratke i izolirane (Mrakovi i sur., 1995). Procesom specijacije u
njima su se razvile endemske riblje vrste i podvrste (ponajprije iz porodice
pastrva, Salmonidae te aranki, Cyprinidae, ali i druge). Gotovo svaka rijeka
tog podruja ima bar jednu endemsku vrstu. Iako su posljednjih godina vrena
su brojna istraivanja ihtiofaune (Popovi, 1985; Bianco i Kneevi, 1987;
Mrakovi i Mieti, 1989), postoji ipak odreeni broj nedovoljno opisanih
vrsta, pa premda se brojni istraivai slau da se radi o vrlo interesantnom
podruju (Lelek, 1989), mali se broj istraivaa bavio ekologijom, biologijom,
taksonomijom i meuvrsnim odnosima riba. Za razliku od tropskog pojasa,
danas je rijetkost u Europi nai neku nepoznatu vrstu kraljenjaka. Pa ipak je
u Hrvatskoj jo prije nekoliko godina otkrivena nova vrsta glavoa
Knipowitichia mrakovcici (Mrakovi i Kreovec, 1997).
1990;
Snoj,
2001),
endemi
jadranskog
sliva
podreda
Osmeroidi
razvrstane
su
est
porodica,
Prema
postojeoj
klasifikaciji,
podporodica
Salmoninae,
uz
jo
pod
znakom
pitanja
(npr.
Platysalmo,
Acantholingua,
velika usta
ribolovno su interesantne
11
atlantska linija
sredozemna linija
jadranska linija
marmoratus linija
Bernatchez i suradnici (1992) pokuavajui utvrditi sloene filogenetske
12
u ledenom dobu) formirale su se jo dvije nove grupe: dunavska i jadranskomediteranska. Kasnije, radi burnih geomorfolokih zbivanja u ledenom dobu,
nastale su jo tri linije: mediteranska, jadranska i linija marmoratus. Predvia
se, da je stanita jadranskog sliva prvo naselila jadranska linija potone
pastrve, a kasnije se na tom podruju pojavila i glavatica, odnosno linija
marmoratus. U vrijeme hladnijih intervala ledenog doba, radi nastanka velikih
koliina leda, nivo mora spustio se ak za vie od 150 metara. Posljedica
snienja nivoa mora bilo je i povezivanje rijeka, koje su se ranije izlijevale
direktno u more. Upravo je to omoguilo ribama, da nesmetano migriraju iz
jedne rijeke u drugu (Bianco, 1990; Bernatchez, 2001).
Svaka linija ima neka zajednika morfoloka obiljeja. Za atlantsku
liniju karakteristina je crna pigmentacija, koja znatno prevladava nad
crvenom, i nalazi se preteno na prsnom dijelu (Giuffra i sur., 1996).
Dunavska linija ima jednoliko zastupljene crne i crvene toke, koje su
jednakomjerno rasporeene po cijelom tijelu. Karakteristine osobine
vanjskog izgleda jadransko-mediteranske linije su etiri ira tamna pojasa u
obliku obrua oko tijela. Jedan se pojas nalazi na glavi, dva na trupu i jedan
na repu. Kod nekih primjeraka pojasi su jae izraeni, a kod nekih slabije. Za
jadransko-mediteransku liniju pastrva karakteristina je jo i sitna, crno crvena pigmentacija. Linija marmoratus odnosi se na glavaticu, koja naseljava
isto podruje kao i linija jadranskih pastrva.
14
malene ljuske
kratke eljusti
sitni zubi
proljetni mrijest
Djelomino slabiji rast u rijeci Jadro objanjavaju time to je Jadro znatno vie
pod utjecajem ovjeka, od vodnih regulacija do izuzetne naseljenosti uz rijeku.
Osim toga u rijeci Jadro postoji mnogo vea vrsna kompeticija.
16
17
18
(1908)
prvi
ujedinjuje
mekousne
pastve
jedan
rod
20
Salmonidae
podijeljena
je
tri
podporodice:
Salmoninae,
Salmo,
Salvelinus
Hucho)
zahvaljujui
ponajprije
22
Sekvencioniranjem
hormona
rasta
(GH2C),
te
dijela
23
rodova
Salmothymus,
Acantholingua
Salmo,
na
osnovu
smjeteni
su
zasebnu
skupinu,
poput
rodova
Salvelinus,
24
Salvelinus fontinalis
Oncorhynchus mykiss
Salmo salar
SaSalmo
lmothyobtusirostris
mus obtusirostris
100
100
Acantholingua ohridana
100
Da
At
94
Ma
81
0.01
Ad
25
ekonomski
znaaj.
Morfometrija
je
podruje
istraivanja
gdje
se
26
27
1.1.2.2.1. Aloenzimi
28
nasljeivanje
mtDNA
nije
iskljuivo,
tako
sluajevima
koriste
se
tehnikom
rezanja
mtDNA
restrikcijskim
31
1.1.2.2.3.1. Mikrosateliti
32
Najee se izoliraju iz krvi i tkiva riba, ali ih je mogue izolirati i iz dlake, sline
ili izmeta (Constable i sur., 1995). Takoer se uspjeno izoliraju iz suhih ljuski
(Miller i Kapuscinski 1996), i iz otolita (Hutchinson i sur. 1999), te iz vrlo malih
koliina biolokog materijala, kao to je arheoloki materijal, koji moe
sadravati gotovo razgraenu DNA (Bruford i sur., 1998). Mogunost izolacije
mikrosatelita iz vrlo malih dijelova biolokog materijala uinio ih je korisnima
pri istraivanju rijetkih i ugroenih vrsta (Queller i sur., 1993).
jednostupanjski
mutacijski
model,
ali
doputa
mutacije
33
34
36
akvakultura
introdukcija
vanjska oplodnja
37
38
populacija,
stupnju
populacijske
strukture
stupnju
hibridizaciju
izmeu
promijene okolia.
4. Hibridizacija
bez
introgresije
Obuhvaa
takoer
bavi
istraivanjima
bliskom
srodstvu,
uspjenou
43
44
pastrva),
kada
dolazi
do
direktne
kompeticije
protok
dovodi
do
nestanka
brzica
slapova
gdje
46
p = (2 (AA) + (Aa)) / 2n
i<j
47
mogu ili ostati prikrivene ili uzrokovati vidljive promjene fenotipa, odnosno
organizma. S obzirom na obujam genoma zahvaenog promjenom, mutacije
mogu biti genske, kromosomske i genomske.
Mutacije mogu uzrokovati razliite promijene:
supstitucije
zamjene
jednog
nukleotida
drugim.
Zamjene
se
smatra
zamjena
pirimidinske
baze
drugom
49
50
51
Vrsta
Lokalitet
Morfometrijska
mjerenja
mtDNA/MS
mtDNA
MS
Ukupno
Salmo trutta
Krka
13
19
13
45
Zrmanja
12
19
19
19
60
rnovnica
19
29
19
67
Neretva
21
63
76
63
Salmothymus
obtusirostris
Jadro
Ukupno
2. 1. MORFOMETRIJSKE ANALIZE
Prilikom istraivanja na rijeci Jadro, jedan primjerak mekousne pastrve je
uginuo, a dvije mekousne pastrve su naene uginule u donjim tokovima
rijeke. Na tim uzorcima obavljene su sljedee morfometrijske analize:
to
a1
antenalno rastojanje
52
antedorzalno rastojanje
anteventralno rastojanje
o1
o2
y1
o0
o01
a0
ch2
ch1
sp.br.
53
Vert. S.
Caud. V.
App. pyl.
54
55
Trea metoda izolacije DNA molekule koju smo koristili, bila je prema
protokolu White i Densmore (1992). Mali dio tkiva stavili smo preko noi u 200
l Lysis pufera (1M Tris-HCl, 2M MgCl2, 1M KCl, pH 8,3) i 4 l Proteinaze K
na 370C. Nakon inkubacije dodali smo jednak volumen fenol/koloroforma u
digestoru, nakon ega je uzorak centrifugiran (14 500 x g/12 min). Gornju
frakciju, u kojoj se nalazi otopljena DNA, smo otpipetirali, pri emu smo pazili
da ne uzmemo dio bijelog taloga u kojem su se nalazili proteini. U
odpipetiranu frakciju dodali smo jednak volumen koloroforma i ponovili
postupak. Uslijedila je precipitacija sa 2,5 volumena 96% etanola ohlaenog
na -200C, te smo uzorke ostavili pola sata na -200C. Nakon precipitacije
uzorke smo centrifugirali (10 000 x g 10 min), odstranjen je etanol i
precipitacija ponovljena sa 500 l 70% etanola. Nakon centrifugiranja (10 000
x g 7 min) odstranili smo etanol, a sadraj posuili do voskaste konzistencije
(do ishlapljenja etanola). Posuenim uzorcima dodali smo 30 l Milli Q vode,
pri emu smo otopili DNA. Uzorke smo do analize pohranili na 40C.
56
57
Ime lokusa
Ponavljajui
Broj
motiv
alela
Veliina
alela
(bp)
(TG)13(AG)4(TG)2(1)
BFRO 001
CATGTGCGAC-
22
200-256
116-124
(TG)12
5 ATGTTTTTGACTGCACTATGTATT 3
5 CTTACAGCCACCTTTATGCG 3
5 ATGTTTTTGACTGCACTATGTATT 3
BFRO 002(2)
(TG)14
5GGAGATAAGAGTCAACGAGGC 3
Ssa 197(3)
(GTGA)+(GT)
18
107-177
Strutta 58(4)
GT
38
102-190
CT
22
146-198
GT
20
171-237
(5)
Strutta 24(6)
5 GGGTTGAGTAGGGAGGCTTA 3
5 TGGCAGGGATTTGACATAAC 3
5 AACAATGACTTTCTCTGAC 3
5 AAGGACTTGAAGGACGAC 3
5 CTGGTGGCAGGATTTGA 3
5 CACTGTCTTTCGTTCTT 3
5 ATGTTTTTGACTGCACTATGTATT 3
5GGAGATAAGAGTCAACGAGGC 3
OmyFgt1TUF(7)
GT
27
187-263
SsoSL438(8)
GT
103-115
5'-AGATTTACCCAGCCAGGTAG-3'
5'-CATAGTCTGAACAGGGACAG-3'
5 GACAACACACAACCAAGGCAC 3
5 TTATGCTAGGTCTTTATGCATTGT 3
58
Fluorescentno
oznaene
zaetne
nukleotide
upotrijebili
smo
za
TM
310
Pri
sniavanju
temperature
zaetni
nukleotidi
su
prilegli
uz
50 ng genomske DNA
0,5 M svakog zaetnog nukleotida od para
0,2 mM dNTP-a (smjesa etiri nukleotida)
1,5 mM MgCl2
20 mM Tris-HCl
50 mM KCl
0,5 U/l Taq DNA polimeraze (Perkin Elmer)
Reakcija je provedena u termostatu PTC-100TM Programmable
Thermal Contoller (MJ Research, Inc.). Nakon 3 minute poetne denaturacije
pri 95C slijedilo je 30 ciklusa jednog od dvaju temperaturnih profila:
59
520C, 15 sekunda
600C, 25 sekunda
60
61
smo
frekvencije
alela
udio
heterozigotnosti.
62
ukazuje
na
to
da
je
populaciji
stvarna
63
Inc.)
po
sljedeem
vremensko-temperaturnom
okviru:
30
64
65
HN20
1993)
66
67
fluorescentno
oznaene
dideoksinukleotide
zaetne
68
3. REZULTATI
3.1. MORFOLOKA OBILJEJA MEKOUSNE PASTRVE (S. o.
salonitana)
Vrijednosti morfolokih osobina mekousne pastrve iz rijeke Jadro
prikazane su u tablici 3. Za obraunavanje dobivenih morfometrijskih
vrijednosti upotrebljena je varijaciono-statistika metoda sa sljedeim
elementima: srednja vrijednost i standardna devijacija. Morfoloka obiljeja
prikazali smo kao proporciju s duinom vilice i duinom glave (Jankovi,
1961).
Tablica
3.
Morfometrijska
meristika
obiljeja
mekousne
pastrve
Oznake
proporcija
xsd
obiljeja
a1/a
91,290,93
u/a
69,440,7
m/a
42,410,43
r/a
48,230,47
q/a
27,480,29
t/a
25,190,34
p/a
15,250,13
s/a
12,640,12
n/a
12,040,12
o1/a
14,950,13
o2/a
6,870,07
v/a
12,50,17
x/a
12,640,18
69
z/a
19,640,24
y/a
10,990,12
y1/a
32,980,37
H/a
22.580,33
/a
8,840,08
o0/a
16,760,16
o01/a
17,40,17
a0/a
8,240,09
b/a
21,530,19
f/a
11,260,1
c/a
4,260,01
h/a
8,70,08
i/a
7,140,06
k/a
10,990,06
g/a
6,230,01
ch2/a
19,940,16
ch1/a
12,360,11
/b
41,060,45
a0/b
38,930,46
f/b
52,340,54
c/b
14,980,09
h/b
17,020,43
i/b
33,190,31
k/b
33,930,33
g/b
26,80,06
ch2/b
78,720,11
ch1/b
57,440,59
sp. br.
23,660,57
ll
106,666,65
130
70
12,661,15
90
121
Vert. S.
570
Caud. V.
230
App. pyl.
707
S. o. salonitana
S. o. oxyrhynchus
21-24%
18-24%
8%
36-39%
5-11%
24-36%
7-8%
2-4%
34-36%
11-20%
7-11%
7-15%
36-45%
41-64%
4-8%
4-9%
18-32%
21-46%
71
11-12%
8-16%
50-52%
43-66%
40-42%
38-49%
11-12%
9-14%
5-14%
5-9%
15-17%
15-20%
13%
12-15%
21-23%
18-24%
9%
7-10%
A II(I)-10(11)
A IV-9
101-104
102-123
23-24
16-31
57
53-70
22-23
21-34
72
Udio
standardne
duine
gornje
vilice
Platysalmo
S. o. salonitana
Salmo trutta
86,910,09
89,460,95
83,830,93
8,280,08
11,150,15
11,110,11
17,020,34
7,980,05
platycephalus
46,710,32
11,580,16
21,50,23
20,930,23
14,520,13
15,70,05
12,030,12
12,480,03
11,460,12
11,290,19
11,90,17
8,720,13
20,490,19
23,780,34
23,660,57
23,330,57
106,666,65
109,660,57
17,331,52
17,660,57
172,64
28,330,57
57
581
57
15,660,5
osnove
podrepne
73
74
75
Slika 19: Restrikcija kontrolne regije mtDNA restrikcijskim enzimom Eco 130 I.
Linije 1 su uzorci mekousne pastrve iz rijeke Jadro, linije 2 su uzorci
mekousne pastrve iz rijeke rnovnice, linije 3 su uzorci potone pastrve iz
rijeke Krke, linije 4 su uzorci potone pastrve iz rijeke Zrmanje, linije 5 su
uzorci mekousne pastrve iz rijeke Neretve i linije pod brojem 6 su fragmenti
DNA poznatih veliina (1 kb DNA ladder, Gibco BRL).
76
Vrsta/populacija
Gen za citokrom b
AF488536
AAF25872
U12143
X76253
AF488535
AF488534
Dunavska (Da1)
AY260524S1
X7625
Dunavska (Da2)
AY185570
Dunavska (Dal1)
AY185569
Mediteranska (Me1)
AF2347
(Bell)
Salmo salar
Salmothymus
obtusirostris (soxy)
Salmo trutta
Mediteranska (Me2)
STMTCTB1
STU63890
Atlantska (At)
AF498757
X76254
Jadranska (Ad1)
AF498756
X76251
Jadranska (Ad3)
AY260518S1
STMTCYB4
Jadranska (Ad4)
AY260520
X76251
77
TTTTTCAGCTATGTACAATAACAACTGTTGTACCTTGCTAACCCAATGTTATACTACATC
TTTTTCAGCTATGTACAATAACAACTGTTGTACCTTGCTAACCCAATGTTATACTACATC
TTTTTCAGCTATGTACAATAACAATTGTTGTACCTTGCTAACCCAATGTTATACTACATC
TTTTTCAGCTATGTACAATAACAACTGTTGTACCTTGCTAACCCAATGTTATACTACATC
TTTTTCAGCTATGTACAATAACAACTGTTGTACCTTGCTAACCCAATGTTATACTACATC
************************ ***********************************
ZRMl
ZRM2AD4
Krka
RN
Soxy
2
3
TATGTATAATATTACATACTATGTATTTACCCATATATATAATATAGCATG-TGAGTAGT
TATGTATAATATTACATATTATGTATTTACCCATATATATAATATAGCATG-TGAGTAGT
TATGTATAATATTACATATTATGTATTTACCCATATATATAATATAGCATG-TGAGTAGT
TATGTATAATATTACATATTATGTATTTACCCATATATATAATATAGCATG-TGAGTAGT
TATGTATAATATTACATATTATGTATTTACCCATATATATAATATGGCATG-TGAGTAGT
****************** ************************** **************
ZRMl
ZRM2AD4
Krka
RN
Soxy
4
ACATCATATGTATTATCAACATTAGTGAATTTAACCCCTCATACATCAGCACTAACTCAA
ACATCATATGTATTATCAACATTAGTGAATTTAACCCCTCATACATCAGCACTAACTCAA
ACATCATATGTATTATCAACATTAGTGAATTTAACCCCTCATACATCAGCACTAACTCAA
ACATCATATGTATTATCAACATTAGTGAATTTAACCCCTCATACATCAGCACTAACCCAA
ACATCATATGTATTATCAACATTAGTGAATTTAACCCCTCATACATCAGCACTAACTCAA
********************************************************.***
ZRMl
ZRM2AD4
Krka
RN
Soxy
GGTTTACATAAAGCAAAACACGTGATAATAACCAACTAAGTTGTCTTAACCCGATTAATT
GGTTTACATAAAGCAAAACACGTGATAATAACCAACTAAGTTGTCTTAACCCGATTAATT
GGTTTACATAAAGCAAAACACGTGATAATAACCAACTAAGTTGTCTTAACCCGATTAATT
GGTTTACATAAAGCAAAACACGTGATAATAACCAACTAAGTTGTCTTAACCCGATTAATT
GGTTTACATAAAGCAAAACACGTGATAATAACCAACTAAGTTGTCTTAACCCGATTAATT
************************************************************
ZRMl
ZRM2AD4
Krka
RN
Soxy
5
6 7 8
GTTATATCAATAAAACTCCACCCAACACGGGCTCCGTCTTTACCCACCAACT-TTCAGCA
GTTATATCAATAAAACTCCACCCAACACGGGCTCCGTCTTTACCCACCAACT-TTCAGCA
GTTATATCAATAAAACTCCACCTAACACGGGCTCCGTCTTTACCCACCAACT-TTCAGCA
GTTATATCAATAAAACTCCATCTAACACGGGCTCCGTCTTTACCCACCAACT-TTCAGCA
GTTATATCAATAAACCTCGAGCTAACACGGGCTCCGTCTTTACCCACCAACT-TTCAGCA
************** *** * * *************************************
ZRMl
ZRM2AD4
Krka
RN
Soxy
9
TCAGTCCTGCTTAATGTAGTAAGAACCGACCAACGATATATCAGTAGGCATACTCTTATT
TCAGTCCTGCTTAATGTAGTAAGAACCGACCAACGATATATCAGTAGGCATACTCTTATT
TCAGTCCTGCTTAATGTAGTAAGAACCGACCAACGATATATCAGTAGGCATACTCTTATT
TCAGTCCTGCTTAATGTAGTAAGAACCGACCAACGATATATCAGTAGGCATACTCTTATT
TCAGTCCTGCTTAATGTAGTAAGAACCGACCAACGATTTATCAGTAGGCATACTCTTATT
************************************* **********************
ZRMl
ZRM2AD4
Krka
RN
Soxy
10 11 12 13
GATGGTCAGGGACAGATATCGTATTAGGTCGCATCTCGTGAACTATTCCTGG
GATGGTCAGGGACAGATATCGTATTAGGTCGCATCTCGTGAACTATTCCTGG
GATGGTCAGGGACAGATATCGTATTAGGTCGCATCTCGTGAACTATTCCTGG
GATGGTCAGGGACAGATATCGTATTAGGTCGCATCTCGTGAACTATTCCTGG
GATGGTCAGGGACAGATATCGTATTA-GCTGCATCTAGTGAACTATTCCTGG
************************** * ****** ***************
78
Tablica 7: Polimorfna mjesta na 5' kraju kontrolne regije mtDNA, koja se odnose na
sekvencionirane uzorke. Brojevi oznaavaju mjesta u nukleotidnoj sekvenci koja se
odnose na Sliku 20, sa crvenom bojom su oznaene transverzije.
varijabilna mjesta
ZRM1
10
11
12
13
ZRM2AD4
Krka
T
T
ZRN
Soxy
T
C
G
Da1
Da1
Da2
0,2
Dall
0,2
Da2
Dall
soxy
Bell
At1
ZRM1
ZRM2AD4
Ad3
Ad1
Krka
Ma1
ZRN
Me1
S.salar
10
27
12
28
10
26
10
12
13
10
10
10
11
10
30
28
27
29
29
28
27
27
28
26
0,5
soxy
2,7
3,0
3,0
Bell
1,7
2,0
1,5
1,7
At1
1,2
1,5
1,5
1,7
1,5
ZRM1
1,7
2,0
2,0
2,5
1,7
1,7
ZRM2AD4
1,5
1,7
1,7
2,2
1,5
1,5
0,2
Ad3
1,5
1,7
1,7
2,2
1,5
1,5
0,7
0,5
Ad1
1,2
1,5
1,5
2,0
1,2
1,2
0,5
0,2
0,2
Krka
1,2
1,5
1,5
2,2
1,0
1,0
0,7
0,5
0,5
0,2
Ma1
1,2
1,5
1,5
2,0
1,2
1,2
0,7
0,5
0,5
0,2
0,5
ZRN
1,5
1,7
1,7
2,2
1,5
1,5
1,0
0,7
0,7
0,5
0,7
0,5
Me1
1,7
2,0
2,0
2,0
1,7
1,7
1,5
1,2
1,2
1,0
1,2
1,0
1,2
S. salar
6,7
7,0
6,4
7,2
6,4
7,0
7,2
7,0
7,0
6,7
6,7
6,4
6,4
30
7,5
79
2
ATGTACAATA
3 4
5
ACAACTGTTG
6
7
TACCTTGCTA
8
ACCCAATGTT
ATACTACATC
60
9
10
TATGTATAAT ATTACATATT
ATGTATTTAC
CCATATATAT
11
AATATAGCAT
12
G-TGAGTAGT
120
13
ACATCATATG
TATTATCAAC
14 15 16
ATTAGTGAAT
TTAACCCCTC
ATACATCAGC
17
ACTAACCCAA
180
GGTTTACATA
18
AAGCAAAACA
CGTGATAATA
ACCAACTAAG
19
TTGTCTTAAC
20
CCGATTAATT
240
21
GTTATATCAA
22
23 24
TAAAACTCCA TCTAACACGG
GCTCCGTCTT
TACCCACCAA
25 26
CT-TTCAGCA
300
TTTTTCAGCT
27
28
TCAGTCCTGC TTAATGTAGT
AAGAACCGAC
29
CAACGATATA
30
TCAGTAGGCA
TACTCTTATT
360
GATGGTCAGG
31 32
33
GTATTAGGTC GCATCTCGTG
34
AACTATTCCT
GG
412
GACAGATATC
filogenetskog
drva
"Neighbour-Joining"
(NJ)
temelji
se
na
80
ZRMl
70
ZRM2AD4
53
Ad3
49
Adl
39
Krka
Ma1
40
ZRN
20
16
Me1
Soxy
30
Atl
31
bell
Dall
84
77
Dal
Da2
S.salar
0.005
81
1
2
3
CTTTGGCTCACTCTTAGGCTTGTGTTTAGCCACCCAAATTCTTACCGGGCTCTTCCTAGC
CTTTGGCTCACTCTTAGGCTTGTGTCTAGCCACCCAAATTCTTACCGGACTCTTCCTAGC
CTTTGGCTCACTCTTAGGCTTATGTCTAGCCACCCAAATTCTTACCGGACTCTTCCTAGC
********************* *** ********************** ***********
Soxy
zrn
Ad1
4
5
CATACACTACACCTCCGACATCTCAACAGCCTTTTCCTCTGTCTGCCACATTTGCCGAGA
CATACACTACACCTCCGATATCTCAACAGCCTTTTCCTCTGTTTGCCACATTTGCCGAGA
CATACACTACACCTCCGATATCTCAACAGCCTTTTCCTCTGTTTGCCACATTTGCCGAGA
****************** *********************** *****************
Soxy
zrn
Ad1
6
TGTTAGCTACGGCTGACTCATCCGAAACATTCACGCTAACGGAGCATCTTTCTTCTTTAT
CGTTAGCTACGGCTGACTCATCCGAAACATTCACGCTAACGGAGCATCTTTCTTCTTTAT
CGTTAGCTACGGCTGACTCATCCGAAACATTCACGCTAACGGAGCATCTTTCTTCTTTAT
***********************************************************
Soxy
zrn
Ad1
CTGTATTTATATACATATCGCCCGAGGACTCTACTATGGTTCCTACCTATATAAAGAAAC
CTGTATTTATATACATATCGCCCGAGGACTCTACTATGGTTCCTACCTATATAAAGAAAC
CTGTATTTATATACATATCGCCCGAGGACTCTACTATGGTTCCTACCTATATAAAGAAAC
************************************************************
7
8
CTGAAACATCGGAGTCGTACTACTACTTCTCACTAT
CTGAAATATCGGAGTCGTACTGCTACTTCTCACTAT
CTGAAATATCGGAGTCGTACTGCTACTTCTCACTAT
****** ************** **************
Soxy
zrn
Ad1
Soxy
ZRN
Ad1
82
Soxy
Bel
Da1,
Da
ZRN
Me2
Me1
Ad34Ma
Ad1
At
Ssa
17
11
11
10
11
10
10
19
15
15
14
13
14
13
13
Da2
Soxy
Bel
0,7
Da1,Da2
3,4
4,1
Da
3,4
4,1
0,0
ZRN
2,6
3,4
0,7
0,7
Me2
3,0
3,7
1,1
1,1
0,4
Me1
3,4
4,1
1,5
1,5
0,7
0,4
Ad34Ma
3,0
3,7
1,1
1,1
0,4
0,7
1,1
Ad1
3,0
3,7
1,1
1,1
0,4
0,7
1,1
0,0
At
2,6
3,4
1,5
1,5
0,7
1,1
1,5
0,4
0,4
Ssa
6,5
7,3
6,1
6,1
5,7
5,3
5,7
5,3
5,3
12
4,9
1
CTTTGGCTCA
2
CTCTTAGGCT
3
4
TGTGTCTAGC
5
CACCCAAATT
6
CTTACCGGAC
TCTTCCTAGC
60
7
8
9
CATACACTAC ACCTCCGATA
10
11
TCTCAACAGC CTTTTCCTCT
12
GTTTGCCACA
TTTGCCGAGA
120
13
14
15
CGTTAGCTAC GGCTGACTCA
16
TCCGAAACAT
TCACGCTAAC
GGAGCATCTT
TCTTCTTTAT
180
CTGTATTTAT
17
ATACATATCG
CCCGAGGACT
18 19
CTACTATGGT
20
TCCTACCTAT
ATAAAGAAAC
240
21
CTGAAATATC
22
GGAGTCGTAC
23
TGCTACTTCT
CACTAT
276
83
89 Da1, Da2
41
48
Da
zrn
Me2
45
73
Me1
Ad34Ma
53
56 Ad1
At
Soxy
Bel
99
Ssa
0.005
68
ZRM2AD4
73
ad3
80
Ad1
44
59
Ma1
zRN
52
Me1
Da1
70
99
Da2
At1
Soxy
98
bel1
Salmo
0.005
84
85
Slika 27: Alelni polimorfizam na lokusima BFRO 001, Str 591 INRA, Strutta 58
i OmyFgt1TUF.
Plavi vrhovi prikazuju alele karakteristine za lokus BFRO 001, zeleni vrhovi
prikazuju alele karakteristine za lokus Str 591 INRA, crni vrhovi prikazuju
alele karakteristine za lokuse Strutta58 i OmyFgt1TUF kod jedinki iz rijeke
Jadro (J15) i rijeke Krke (K8), dok crveni vrhovi prikazuju fragmente DNA
poznate veliine (Tamra 350, Perkin Elmer).
86
Jadro
rnovnica
Neretva
Krka
Zrmanja
mekousna
mekousna
mekousna
potona
potona
198
0,9211
1,00
202
0,0526
206
1,00
214
0,0263
0,0455
222
0,3182
226
0,3000
230
0,2000
238
0,0909
242
0,3636
0,3000
244
0,0455
246
0,1364
256
0,1000
258
0,1000
BFRO001
87
Broj alela
1,307
1,000
1,000
2,848
3,133
H exp.
0,1482
0,7355
0,7600
H n. b.
0,1522
0,7706
0,8444
H obs.
0,1579
0,8182
0,8000
Fis
-0,0429
-0,0381
-0,0488
-0,0155
-0,0627
116
1,0000
1,0000
125
0,0588
131
0,2143
133
0,2143
135
0,4286
137
0,1429
140
0,8824
1,0000
145
0,0588
Broj alela
1.449
1,000
2,776
1,000
1,000
H exp.
0,2145
0,7041
H n. b.
0,2210
0,7582
H obs.
0,1176
0,4286
Fis
0,43284
0,45950
0,48289
0,45223
0,44823
132
0,526
0,2917
136
0,0833
137
0,2000
141
0,3947
0,4211
145
0,5263
0,5789
0,0714
150
0,0417
154
0,3750
155
0,0714
0,0417
158
0,0417
159
0,0714
0,3000
163
0,3000
167
0,1000
171
0,0714
0,1000
175
0,2857
179
0,2857
Faktor
bogatstva alela
BFRO002
Faktor
bogatstva alela
Ssa197
88
183
0,1429
211
0,0833
215
0,0417
Broj alela
2.146
1,876
3,229
2,937
3,133
H exp.
0,5637
0,4875
0,7959
0,7535
0,7600
H n. b.
0,5789
0,5007
0,8571
0,7862
0,8444
H obs.
0,6316
0,5263
1,0000
0,9167
1,0000
Fis
-0,14494
-0,15451
-0,12098
-0,11774
-0,12084
102
0,0263
172
0,0714
176
0,6429
178
0,2143
180
0,0833
192
0,0263
196
0,0714
200
0,7500
202
0,8684
0,9474
206
0,0789
0,0526
0,0417
208
0,0417
212
0,1250
214
0,1667
0,2500
218
0,0417
220
0,0833
222
0,0417
224
0,3750
Broj alela
1.501
1,202
2,237
3,142
1,786
H exp.
0,2382
0,0997
0,5306
0,7951
0,3750
H n. b.
0,2447
0,1024
0,5714
0,8297
0,4286
H obs.
0,1579
0,1053
0,2857
0,5833
0,5000
Fis
0,26633
0,31957
0,23496
0,26648
0,32150
91
0,1667
93
0,7500
95
0,0833
Faktor
bogatstva alela
Strutta24
Faktor
bogatstva alela
Strutta58
89
104
0,1364
145
0,0455
146
0,0455
147
0,9474
1,0000
150
0,0455
151
0,0263
158
0,1364
165
0,0455
166
0,3636
168
0,0455
170
0,0909
175
0,0263
0,0455
181
0,5000
187
0,5000
Broj alela
10
1.211
1,000
1,909
3,232
2,000
H exp.
0,1011
0,4028
0,8099
0,5000
H n. b.
0,1038
0,4394
0,8485
0,6667
H obs.
0,1053
0,3333
0,9091
Fis
0,08186
0,07281
0,02647
0,29274
-0,01916
149
0,0556
0,0417
159
0,1429
0,6250
169
0,0278
171
0,7778
0,8889
0,7857
0,0833
173
0,1389
0,1111
0,0714
183
0,2083
189
1,0000
193
0,0417
Broj alela
1.788
1,390
1,791
2,268
1,000
H exp.
0,3719
0,1975
0,3571
0,5556
H n. b.
0,3825
0,2032
0,3846
0,5797
H obs.
0,4444
0,2222
0,4286
0,5833
Fis
-0,05069
-0,08543
-0,08434
-0,13402
-0,09579
Faktor
bogatstva alela
Str591INRA
Faktor
bogatstva alela
OmyFgt1TUF
204
90
206
1,0000
1,0000
1,0000
0,1250
218
226
0,2500
241
0,6000
245
0,4000
246
0,1250
Broj alela
1.000
1,000
1,000
2,590
1,924
H exp.
0,6563
0,4800
H n. b.
0,7000
0,5333
H obs.
0,2500
0,4000
Fis
0,51892
0,52009
0,50868
0,20863
0,64360
96
0,0455
98
0,0455
104
0,1818
0,1,0000
106
0,5000
109
0,0333
110
0,0909
111
0,0333
0,4000
0,0833
114
0,1364
115
0,1667
116
0,2500
117
0,0833
118
0,0833
120
0,3333
123
0,6667
0,3667
125
0,2667
0,2333
Broj alela
1.992
2,424
3,180
2,780
1,000
H exp.
0,4822
0,6511
0,7778
0,6860
H n. b.
0,4989
0,6736
0,8485
0,7186
H obs.
0,3333
0,6000
1,0000
0,9091
Fis
-0,08095
-0,02291
0,06761
0,12770
0,01749
1.992
2,424
3,180
2,780
1,000
Faktor
bogatstva alela
SsoSL438
Faktor
bogatstva alela
Faktor
bogatstva alela
StMSLDH4
91
237
0,9375
1,0000
0,5833
245
0,4167
247
0,1250
0,6000
253
0,5833
264
0,0417
265
0,2500
0,4000
276
0,0625
Broj alela
1.238
1,000
1,919
2,296
1,924
H exp.
0,1172
0,4861
0,5799
0,4800
H n. b.
0,1210
0,5303
0,6051
0,5333
H obs.
0,1250
0,5000
0,7500
0,8000
Fis
-0,25737
-0,22129
-0,29933
-0,20838
-0,15343
0,2486
0,1595
0,4505
0,6191
0,3728
0,2295
0,16454
0,4877
0,6487
0,4279
0,2303
0,1615
0,4418
0,6355
0,3889
0,10296
0,01846
0,10118
0,02296
0,15493
1,5
3,4
5,8
2,3
Faktor
bogatstva alela
Ukupna H
exp.
Ukupna H n.
b.
Ukupna H
obs.
Ukupna F is
Prosjean br.
alela po
populaciji
92
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
25
8
24
6
24
2
23
0
22
2
21
2
Neretva mekousna
20
2
19
8
udio u populaciji
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
veliina alela
udio u populaciji
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
Neretva mekousna
116
125
131
133
135
137
140
145
veliina alela
93
udio u populaciji
0,6
0,5
Jadro mekousna
0,4
rnovnica mekousna
0,3
Krka potona
Zrmanja potona
0,2
Neretva mekousna
0,1
215
183
175
167
159
156
154
145
137
132
0
veliina alela
Na lokusu Strutta24 otkrili smo 15 razliitih alela (Graf 4). Alel 202
znaajan je za populacije mekousne pastrve u Jadru i rnovnici. Kod tri
uzorka u rijeci Jadro pojavili su se aleli 192 (J15) i 206 (J12, J15 i J17). Kod
populacije potone pastrve u rijeci Krki, lokus Strutta24 pokazao se vrlo
varijabilnim, s veim brojem razliitih alela (180, 206, 208, 212. 214, 218,
220), a s neto veim postotkom bio je prisutan alel 224). U populaciji potone
pastrve u Zrmanji, znaajni su aleli 200 i 214, dok su za mekousnu pastrvu u
Neretvi, karakteristini aleli 172, 178, 180 i 196.
94
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
22
2
21
8
21
2
20
6
20
0
19
2
Neretva mekousna
17
8
17
2
udio u populaciji
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
veliina alela
Na lokusu Strutta58 otkrili smo 17 razliitih alela (Graf 5). Alel 147
znaajan je za populacije mekousne pastrve u Jadru i rnovnici. Aleli 151
(J15) i 175 (J17) su se pojavili u dva uzorka u rijeci Jadro. Kod populacije
potone pastrve u rijeci Krki lokus Strutta58 pokazao se vrlo varijabilnim, s
veim brojem razliitih alela: 104, 147, 158, 166, 168 i 170. U populaciji
potone pastrve u Zrmanji znaajni su aleli 181 i 187, dok su za mekousnu
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
18
1
17
0
16
6
15
8
15
0
14
5
Neretva mekousna
95
91
udio u populaciji
veliina alela
95
Na lokusu Str591INRA otkrili smo 8 razliitih alela (Graf 6). Alel 171
znaajan je za populacije mekousne pastrve u Jadru, rnovnici te u Neretvi,
gdje se uz njega pojavljuju i aleli 190 i 173. Alel 149 se pojavio u dva uzorka
kod mekousne pastrve u rijeci Jadro (J13 i J15). Za potonu pastrvu u Krki
udio u populaciji
znaajni su aleli 149, 171, 183 i 193, a za potonu pastrvu u Zrmanji alel 189.
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
Neretva mekousna
149
159
169
171
173
183
189
193
veliina alela
Na lokusu OmyFgt1TUF otkrili smo 7 razliitih alela (Graf 7). Alel 206
znaajan je za populacije mekousne pastrve u Jadru, rnovnici te u Neretvi.
Za potonu pastrvu u Krki znaajni su aleli 204, 218, 226 i 245, a za potonu
pastrvu u Zrmanji aleli 241 i 245. Kod mekousne pastrve se ne pojavljuju aleli
dui od 206.
96
udio u populaciji
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
Neretva mekousna
204
206
218
226
241
245
246
veliina alela
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
12
5
12
0
11
7
11
5
11
1
10
9
Neretva mekousna
10
4
96
udio u populaciji
veliina alela
97
Na lokusu StMSLDH4 otkrili smo 7 razliitih alela (Graf 9). Alel 237
znaajan je za populacije mekousne pastrve u rijekama Jadro, rnovnica i
Neretve, gdje je jo prisutan i alel 245. Za potonu pastrvu u rijeci Zrmanji
znaajni su aleli 247 i 265. Ti aleli su znaajni i za potonu pastrvu u rijeci Krki
gdje se uz njih, u veem postotku jo pojavljuje i alel 253. Alel 276 pojavljuje
udio u populaciji
se samo kod uzoraka J13 i J15 u populaciji mekousne pastrve u rijeci Jadro.
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
Zrmanja potona
Neretva mekousna
237
245
247
253
264
265
276
veliina alela
98
odreivanju
odstupanja
stvarnih
od
oekivanih
frekvencija
99
100
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Krka potona
0,0263
0,0455
0,526
0,2917
0,0789
0,0526
0,0417
0,0263
0,0455
0,0556
0,0417
0,7778
0,8889
0,0833
1,0000
1,0000
0,1250
OmyFgt1TUF alel
206
Jadro mekousna
rnovnica mekousna
Neretva mekousna
0,5263
0,5789
0,0714
0,7778
0,8889
0,7857
0,1389
0,1111
0,0714
1,0000
1,0000
1,0000
0,0333
0,4000
0,0833
0,9375
1,0000
0,5833
OmyFgt1TUF alel
206
101
0,04626
rnovnica
mekousna
Zrmanja
Neretva
potona
mekousna
0,58461
0,71070
0,55623
0,63975
0,77979
0,62983
0,32426
0,41067
Krka potona
Krka potona
Zrmanja
0,53516
potona
0,04364
Zrmanja
Neretva
potona
mekousna
0,61893
0,76681
0,61218
0,63975
0,77979
0,62983
0,33023
0,41370
Krka potona
0,53516
102
TGTTACCACGACGATACGAGAGTTCGCCGTCACAGAGTAGTCTGACCGTGGGAGAACAAT
TGTTACCACGACGATACGAGAGTTCGCCGTCACAGAGTAGTCTGACCGTGGGAGAACAAT
TGTTACCACGACGATACGAGAGTTCGCCGTCACAGAGTAGTCTGACCGTGGGAGAACAAT
************************************************************
Jadro me_
Neret me_
jadranska_
CAATCAATGAGAGTACTGTGTATCATTTGTGTCTAGTATTTCTTCAGTAATTTGTCATAT
CAATCAATGAGAGTACTGTGTATCATTTGTGTCTAGTATTTCTTCAGTAATTTGTCATAT
CAATCAATGAGAGTACTGTGTATCATTTGTGTCTAGTATTTCTTCAGTAATTTGTCATAT
************************************************************
Jadro me_
Neret me_
jadranska_
CATTAATAGATCTAATGGCAGGACTATTACATGTCAAAGTAGGATTTCAGAAATTGCTTT
CATTAATAGATCTAATGGCAGGACTATTACATGTCAAAGTAGGATTTCAGAAATTGCTTT
CATTAATAGATCTAATGGCAGGACTATTACATGTCAAAGTGGGATTTCAGAAATTGCTTT
**************************************** *******************
Jadro me_
Neret me_
jadranska_
GAGAAACTTCATTCATACATTTCCCTTTCACCCTTTTCCCCCCCATCTCCCTTTCATACA
GAGAAACTTCATTCATACATTTCCCTTTCACCCTTTTCCCCCCCATCTCCCTTTCATACA
GAGAAACTTCATTCATACATTTCCCTTTCACCC------CCCCCATCTCCCTTTCATACA
*********************************
*********************
Jadro me_
Neret me_
jadranska_
CTTCCCCTCTCAGAGAGACTACTTCATTTAACACACAGACATTTGACATGCAGATGGTGT
CTTCCCCTCTCAGAGAGACTACTTCATTTAACACACAGACATTTGACATGCAGATGGTGT
CTTCCCCTCTCAGAGAGAGTACTTCATTTAACACACAGACATTTGACATGCAGATGGTGT
****************** *****************************************
Jadro me_
Neret me_
jadranska_
CCATCTTGGTTTTCTGGTTTCCTGGTGCCCAATTGCTACACACTCACCTTTGCTGGCGAC
CCATCTTGGTTTTCTGGTTTCCTGGTGCCCAATTGCTACACACTCACCTTTGCTGGCGAC
CCATCTTGGTTTTCTGGTTTCCTGGTGCCCAATTGCTACACACTCACCTTTGCTGGCGAC
************************************************************
Jadro me_
Neret me_
jadranska_
TATCTTGGGCGTTTTGAGGAA
TATCTTGGGCGTTTTGAGGAA
TATCTTGGGCGTTTTGAGGAA
*********************
103
104
4. RASPRAVA
U podruju Mediterana obitava veliki broj endemskih slatkovodnih ribljih
vrsta. U zapadnoj Europi riblje populacije su vrlo dobro istraene to nije
sluaj u ovom dijelu Europe. Ovdje nalazimo brojne riblje vrste koje su slabo
opisane, sa sistematikom koja je nedovoljno definirana, a i njihova distribucije
nije sasvim poznata. Stoga je potrebno je napraviti reviziju sistematike brojnih
vrsta i podvrsta riba.
U rijekama jadranskog sliva obitavaju etiri izdvojene populacije
mekousne pastrve, koje se meusobno morfoloki razlikuju. Predmet naeg
istraivanja bila je podvrsta mekousne pastrve koja obitava u rijekama Jadru i
rnovnici (S. o. salonitana). Opisali smo je i usporedili s podvrstama
mekousne pastrve iz rijeke Neretve (S. o. oxyrhynchus), kao i potonim
pastrvama (Salmo trutta) iz rijeka Krke i Zrmanje.
Osnovni cilj naeg rada je pronai i opisati genetske razlike izmeu
mekousnih pastrva S. o. salonitana i S. o. oxyrhynchus i potone pastrve
(Salmo trutta). Stoga smo prikupili uzorke od tri populacije mekousne pastrve
koje obitavaju u rijekama jadranskog sliva, te od dvije populacije potone
pastrve, koje pripadaju jadranskim linijama pastrva (Bernatchez, 2001). U
ovom radu eljeli smo napraviti i usporedbu s podvrstom mekousne pastrve iz
rijeke Krke (S. o. krkensis), ali prilikom uzorkovanja nismo uoili niti jedan
primjerak.
Sadanje populacije mekousnih pastrva su vrlo male i neprestano
bivaju ugroene s mnogo imbenika stoga je analiziran mali broj uzoraka.
Svjesni smo da zakljuci izvedeni nakon analize malog broja uzoraka nisu
statistiki opravdani, no unato tome, oni su zanimljivi i temelj su novim
raspravama i istraivanjima. Dobivene rezultate stavili smo u odnos s ranije
istraenim linijama i vrstama pastrva, u oblik filogenetskog stabla.
105
106
glave, duina donje vilice, uzduni dijametar oka, duina osnove leene i
podrepne peraje, duina prsne i trbune peraje, zatim najvea i najmanja
visina tijela. Izuzetnu slinost u nekim morfolokim osobinama objanjavamo
slinim uvjetima stanita u kojima obitavaju obje podvrste, stoga se i
parametri u kojima su S. o. salonitana i S. o. oxyrhynchus bliske odnose na
one osobine na koje najvei utjecaj ima njihov nain ivota (obje vrste
obitavaju u brzim tekuicama).
Meutim u nekim morfometijskim oznakama postoje signifikantne
razlike izmeu dviju promatranih podvrsta, a to su ponajprije duina i irina
gornje vilice. Gornja vilica koja prelazi preko donje je karakteristika podvrste
mekousne pastrve S. o. oxyrhynchus, dok su jako zaobljene vilice znaajka
mekousne pastrve S. o. salonitana. Mnogo vea razlika kod promatranih
podvrsta uoena je pregledom meristikih osobina. Meristike osobine se
znatno slabije mijenjaju u nekoj populaciji pod utjecajem razliitih ekolokih
uvjeta, odnosno posjeduju vei heritabilitet (Treer i sur., 1995). Na promjenu
meristikih osobina utjecaj ima genetski faktor. Bitnu razliku izmeu S. o.
salonitana i S. o. oxyrhynchus uoili smo u broju bica u perajama, broju ljuski
u bonoj liniji, broju branhiospina na prvom krnom luku te broju kaudalnih
kraljeaka. Stoga moemo pretpostaviti da su ove dvije podvrste nekada bile
u
znatno
bliem
srodstvu,
no
uslijed
duge
geografske
izolacije
107
dugotrajne
izoliranosti
razliitim
stanitima,
procesom
108
smo
varijabilnost
dviju
regija
mitohondrijske
DNA,
populacija
mekousne
potone
pastrve.
Analizom
sa
109
110
Kontrolna
regija
je
vrlo
varijabilna
kod
pastrvskih
populacija.
greki
koje
nastaju
prilikom
pogrenog
sparivanja
nukleotida,
regija
DNA
tranzicijske
supstitucije
prevladavaju
nad
viekratnoj,
usporednoj,
istovremenoj,
konvergentnoj
ili
112
okruenju,
procesu
selekcije,
dolo
do
favoriziranja
115
ukazuju
na
upotrebljivost
mikrosatelitskih
lokusa
pri
analizi
118
5. ZAKLJUCI
Osnovne zakljuke naeg rada iznosimo u nekoliko glavnih toaka.
119
120
Analizirajui
podvrstu
S.
o.
salonitana,
rezultati
bazirani
na
nuklearne
DNA,
sekvencioniranjem
gena
laktat
121
6. LITERATURA
1.
2.
3.
variation
in
polytypic
species:
the
cutthroat
trout.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
122
12.
13.
14.
15.
Belkhir, K., Borsa, P., Goudet, J., Chikhi, L., Bonhomme, F. (1998):
GENETIX, logiciel sous Wimdows TM pour la genetique des
populations. Laboratoire Genome et Populations, CNRS UPR 9060,
University Montpellier II.
16.
Samoniden,
insvesondere
die
Gattung
Thymallus.
18.
19.
20.
21.
and
fixation
of
arctic
char
(Salvelinus
alpinus)
123
23.
24.
25.
26.
27.
Bonacci, O., Kerovec, M., Roje Bonacci, T., Mrakovi, M., Plenkovi
Moraj, A. (1998): Ecologically acceptable flows definition for the
rnovnica river (Croatia). Regulated Rivers - Research & Management,
14: 245-356.
28.
29.
30.
124
31.
32.
33.
34.
35.
36.
37.
38.
39.
Crivelli A., Poizat G., Berrebi P., Jesensek D., Rubin J. F. (2000).
Conservation biology applied to fish: The example of a project for
rehabilitating the marble trout (Salmo marmoratus) in Slovenia.
Cybium. 24(3): 211-230.
40.
41.
125
42.
43.
Dirienzo, A., Peterson, A. C., Garza, J. C., Valdes, A. M., Slatkin, M.,
Freimer, N. B. (1994): Mutational processes of simple-sequence repeat
loci in human populations. Proceedings of the National Academy of
Sciences of the United States of America. 91(8): 3166-3170.
44.
45.
46.
47.
48.
49.
Estoup A., Presa P., Krieg F., Vaiman D., Guyomard R. (1993). (CT)n
and (GT)n microsatellites: a new class of genetic markers for Salmo
trutta L. (brown trout). Heredity. 71: 488 - 496.
50.
51.
Gavin P., Taggart J., Ferguson A., OFarrell M., Cross T. (1996).
Population genetics of Atalntic salmon (Salmo salar) in the River
Shannon system in Ireland. Canadian Jounal of Fisheries Sciences.
53: 1933-1942.
126
52.
G. (1996): Phylogenetic
54.
55.
56.
57.
58.
59.
60.
Heckel,
J.,
Kner,
R.
(1857):
Die
Ssswasserfische
der
62.
63.
127
64.
65.
66.
67.
68.
69.
Karaman,
M.
(1966):
Beitrag
zur
Kenntnis
der
Salmoniden
71.
72.
73.
74.
75.
76.
DNA
and
microsatellite
introgresive
hybridization
128
between
lineages
of
lake
whitefish
(Coregonus
clupeaformis);
78.
79.
80.
81.
Mari,
S.
(2002):
Morfoloki
varijabiliteti
pastrmki
(subfamilija
83.
84.
McMillan, M., Wilcove, D. (1994): Gone but not forgotten: Why have
species protected by Endangered Species Act become extinct?
Endangered Species Update, 11: 5-6.
85.
86.
129
87.
88.
89.
90.
91.
92.
93.
94.
95.
96.
97.
98.
99.
130
101.
102.
103.
104.
105.
106.
107.
108.
109.
110.
131
112.
113.
114.
115.
116.
Pov, M., Jesenek, D., Berrebi, P., Crivelli, A. J. (1996): Soka pastrv
Salmo trutta marmoratus, Cuvier 1817, v poreju Soe v Sloveniji.
Zatitni nacrt.
117.
118.
119.
Razpet, A., Jug, T., Sunik, S., Dov, P., Snoj, A. (2003): Molecular
evidence of natural hybridisation between Salmo obtusirostirs and
Salmo trutta in the river Neretva. 3rd congress of the genetic society of
Slovenia, Bled, 31. svibanj 4. lipanj, 2003, Zbornik saetaka: 54-55.
120.
121.
122.
123.
Sakamoto, T., Okamoto, N., Ikeda, Y., Nakamura, Y., Sato, T. (1994):
Dinucleotide-repeat polymorphism in DNA of rainbow trout and its
application in fisheries science. Journal of Fish Biology, 44: 1093-1096.
124.
125.
126.
127.
128.
129.
130.
Shaposhnikova,
G.
C.
(1975):
Systematics
relation
of
some
132.
133.
134.
133
135.
136.
137.
138.
139.
140.
Snoj, A., Mareta, B., Sunik ,S., Melki, E., Megli, V., Dov, P.
(2002a): The taxonomic status of the sea trout from the north Adriatic
Sea, as revealed by mitochondrial and nuclear DNA analysis. Journal
of Biogeography, 29: 1179-1185.
141.
Snoj, A., Melki, E., Sunik, S., Muhamedagi, S., Dov, P. (2002b):
DNA phylogeny supports revised classification of Salmothymus
obtusirostris. Biological Journal of the Linnean Society, 77: 399 411.
142.
Snoj, A., Pohar, J., Dov, P. (1996): A set of new microstellite DNA
markers for Salmo marmoratus (Cuvire, 1817). Procedding of the 3rd
International Conference, Life Sciences 1996, Slovenija: 93-94.
143.
Snoj, A., Pohar, J., Dov, P. (1997): The first microsattelite DNA
marker for marble trout, BFRO001. Journal of Animal Sciences, 75:
1983.
144.
145.
Stankovi, S. (1960): The Balkan lake Ohrid and its living world.
Monographiae biologicaea, 9, Den Haag.
134
146.
147.
148.
149.
150.
151.
152.
153.
154.
Sunik, S., Snoj, A., Pohar, J., Dov, P. (1997): The microsatellite
marker (BFRO002) characteristic for different geographically remote
brown trout, Salmo trutta L., populations. Animal Genetics, 28: 370383.
155.
156.
157.
158.
135
159.
160.
161.
Tave D. (1993): Genetics for Fish Hatchery Managers. AVI Book, New
York, str.: 415.
162.
163.
Treer, T., Anii, I., Safner, R., Odak, T., Piria, M. (2003a): Note on the
growth of endemic soft-muzzled trout Salmothymus obtusirostris
translocated into a Dalmatian river. Biologia, Bratislava, Section
Zoology, 58 (5): 999-1001.
164.
Treer, T., Anii, I., Safner, R., Odak, T., Piria, M. (2003b): Growth and
condition of endemic trout Salmothymus obutusirostris in a Dalmatian
river Jadro. 4th World Fisheries Conference, Vancouver.
165.
Treer, T., Safner, R., Anii, I., Kolak, A., Drai, M. (2000):
Morphological variation among four strains of common carp Cyprinus
carpio in Croatia. Folia Zoologica 49 (1): 69 74.
166.
167.
168.
169.
170.
171.
172.
173.
174.
175.
176.
177.
178.
137
7. SAETAK
Mekousna pastrva (Salmothymus obtusirostris salonitana) je endemska
pastrva sa izvornim stanitem u rijeci Jadro, pokraj Splita. Dio populacije
naknadno je prebaen i u rijeku rnovnicu, gdje i danas obitava. Pripada u
porodicu Salmonidae. Kao i ostale podvrste roda Salmothymus, ograniena je
na usko podruje rasprostranjenja, te i najmanji utjecaji na njeno stanite
imaju veliko djelovanje na malu populaciju.
138
genetske
varijabilnosti
provedeno
je
na
nivou
podvrstu
S.
o.
salonitana,
rezultati
bazirani
na
139
140
8. SUMMARY
Endemic soft-muzzled trout (Salmothymus obtusirostris salonitana) inhabit
the Jadro River, near Split. Part of the population has been translocated to the
rnovnica River and belongs to the Salmonidae family, genus Salmothymus.
It has a very restricted distribution, so any interference with its habitat has a
negative influence on this small population.
The objective of our work was to find and describe genetic differences
between soft-muzzled trout (S. o. salonitana and S. o. oxyrhynchus) and
brown trout (Salmo trutta). Therefore, we collected samples of three
populations of soft-muzzled trout that inhabit the Adriatic rivers (Jadro,
rnovnica and Neretva), and two populations of brown trout (Krka and
Zrmanja).
Because the populations of soft-muzzled trout are very small and are
endangered by many factors, we were able to analyze only a small number of
samples. Hence, we are aware that our conclusions are not statistically
significant, but despite that, the results are interesting and may serve as a
base for new discussions and research. We have compared our results with
literature data from other authors in the phylogenetic tree form.
Hybrids are common in the area where brown and soft-muzzled trout
live together. It is very difficult to recognize them, so in addition to
morphological methods we have also used molecular methods to distinguish
populations.
In comparing morphological characteristics of soft-muzzled trout from
the Jadro River and soft-muzzled trout from the Neretva River (S. o.
oxyrhynchus), we have found many similarities but also many differences.
This is the result of their mutual relationship and also the result of the area
they cover in terms of space and ecological isolation.
We used genetic markers and statistical analysis to define the
population structure of soft-muzzled trout (S. o. salonitana) found in the Jadro
and rnovnica Rivers.
Distinction of genetic variability has been done at the DNA level. We
have used two different genetic systems: mitochondrial DNA (one of the most
141
143
9. IVOTOPIS
Tea Odak roena je 28. 12. 1974. godine u Splitu, gdje je zavrila osnovnu
i srednju kolu. Godine 1993. upisala se na Agronomski fakultet u Zagrebu,
gdje je 2000. obranila diplomski rad.
Od 2000. stalno je zaposlena na Zavodu za ribarstvo, pelarstvo i
specijalnu zoologiju pri Agronomskom fakultetu, gdje upisuje i poslijediplomski
studij iz Ribarstva.
Kao asistent aktivno sudjeluje u nastavi na predmetima zoologije,
hidroekologije, ihtiologije, ribarstva i lovstva.
Posjetila je mnoge znanstvene institucije u ekoj, Maarskoj, Poljskoj,
Sloveniji i Kini, sudjelovala je na strunim i znanstvenim skupovima.
144
Popis radova:
Odak, T., Treer, T. (2000): Pregled istraivanja vodenih makrofita u
Hrvatskoj. Ribarstvo, 58 (3), 101-109.
Safner R., Treer T., Anii M., Piria M., Odak T. (2001): Ribolovnogospodarska osnova RU ZRD Zagreb. Agronomski fakultet, Zagreb, 38.
Piria, M., Treer, T., Safner, R., Anii, I. & Odak, T. (2001): Metodika
istraivanja prirodne prehrane slatkovodnih riba. 37. znanstveni skup
Hrvatskih agronoma. Opatija, 19.-23. veljae, 2001. Zbornik saetaka.
Piria, M., Treer, T., Safner, R., Anii, I. & Odak, T. (2001): Metodika
istraivanja prirodne prehrane slatkovodnih riba. Ribarstvo, 59 (1), 9-23.
Treer, T., Odak, T., Safner, R., Anii, I., Piria, M. & Kolak, A. (2001):
Bioloka raznolikost u hrvatskom slatkovodnom ribarstvu. HAZU, Bioloka
raznolikost u stoarstvu republike Hrvatske, 18.-19. rujna, Zbornik radova,
131-139.
Odak, T., Treer, T., Anii, I., Safner, R. & Piria, M. (2002): The use of
molecular methods in fisheries. I. Hrvatski kongres za molekularne
bioznanosti uz meunarodno sudjelovanje, 9.-13 June, Opatija, Zbornik
saetaka.
Odak, T., Treer, T., Anii, I., Safner, R., Piria, M. (2002): Primjena
molekularnih metoda u ribarstvu. Ribarstvo, 60 (3), 116-126.
Treer, T., Safner, R., Anii, I., Piria, M. & Odak, T. (2002): The introduction
of the fish from the Danube area into the Mediterranean Vransko lake,
Croatia. EIFAC, Symposium on inland fisheries management and the
aquatic environment The Effect of Fisheries Management on Freshwater
Ecosystems. Windermere, United Kingdom, 12-15 June.
Debeljak, Lj., Faai, K., Odak, T. (2002): Djelovanje vodnih makrofita na
proizvodnju arana. III. Nacionalno znanstveno-struno savjetovanje s
meunarodnim sudjelovanjem, 20.-21. lipnja, 2002., Bizovac, Zbornik
saetaka.
145
Snoj, A., Sunik, S., Odak, T., Safner, R., Dov, P. (2003): Phylogenetic
relationship between two subspecies of soft-mouth trout: Salmothymus
obtusirostris oxyrhynchus and S. obtusirostris salonitana. Plant and
genomes XI conference, 11.-15. Sijeanj, 2003., San Diego, CA, Zbornik
saetaka.
Odak, T., Treer, T., Safner, R., Anii, I., Piria, M. (2003): Mekousna pastrva
(Salmothymus obtusirostris salonitana) u rijeci rnovnici. 38. znanstveni
skup Hrvatskih agronoma. Opatija, 19.-21. veljae, 2001., Zbornik
saetaka.
Treer, T., Varga, B., Safner, R., Anii, I., Piria, M., Odak, T. (2003): Growth
of the common carp (Cyprinus carpio) introduced into the Mediterranean
Vransko Lake. J. Appl. Ichthyol., 19, 1-5.
Debeljak, Lj., Faai. K., Odak, T. (2003): Relations between the
developmnet of submersed macrophytes and carp production in fishponds.
Bulletin VURH Vodnany, 4, 175-180.
Bakota, R., Treer, T., Odak, T., Mrakovi, M., aleta, M. (2003): Struktura i
kondicija ihtiofaune Lonjskog polja. Ribarstvo, 61 (1), 17-26.
Treer T., Anii I., Safner R., Odak T., Piria M. (2003): Note on the growth of
endemic soft-muzzled trout Salmothymus obtusirostris translocated into a
Dalmatian river. Biologia, Bratislava, Section Zoology, 58 (5): 999-1001.
Treer, T., Anii, I., Safner, R., Odak, T., Piria, M. (2003): Growth and
condition of endemic trout Salmothymus obutusirostris in a Dalmatian river
Jadro. 4th World Fisheries Conference, Vancouver.
Treer, T., Opaak, A., Anii, I., Safner, R., Piria, M., Odak, T. (2003): Growth
of bream, Abramis brama, in the Croatian section of the Danube. Czech J.
Anim. Sci., 48 (6), 251-256.
146
10.
PRILOG
BFRO001
Ssa197
Strutta24
Str591INRA
Strutta58
OmyFgt1TUF
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
145/145
140/140
140/140
140/140
125/140
140/140
140/140
140/140
125/140
140/140
141/145
141/141
141/141
141/145
141/145
145/145
145/145
141/145
141/145
141/145
145/145
141/145
145/145
132/145
145/145
132/145
141/145
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/206
202/202
202/202
192/206
202/202
202/206
202/202
169/171
171/171
171/171
171/173
171/171
171/173
171/171
171/171
171/171
171/173
171/173
149/171
149/171
171/171
171/171
171/171
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/151
147/147
147/175
147/147
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
198/198
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
140/140
141/145
141/145
141/145
141/145
141/145
141/145
141/141
141/145
145/145
145/145
145/145
145/145
145/145
141/145
141/145
145/145
141/141
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/202
202/206
202/202
202/206
202/202
171/171
171/171
171/173
171/173
171/173
171/171
171/173
171/171
171/171
171/171
171/171
171/171
171/171
171/171
171/171
171/171
171/171
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
147/147
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
111/123
123/123
123/123
111/123
123/125
111/123
111/111
111/125
123/123
111/125
111/125
111/125
125/125
111/123
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
214/244
116/116
132/132
180/212
159/159
158/166
226/245
104/106
253/265
Jadro mekousna
J2
198/198
J3*
198/198
J4
198/198
J5
198/198
J6
198/198
J7*
198/198
J8
198/198
J9
198/198
J10
198/198
J11*
198/198
J12
198/198
J13
198/214
J14
198/198
J15
198/202
J16
198/198
J17
198/202
J18
198/198
rnovnica
mekousna
1
4
5
6
7
9
11
12
13
14
15
17
19
20
21
22
23
Krka
potona
K1
SsoSL438
StMSLDH4
BFRO002
123/125
123/125
123/123
123/123
125/125
123/125
123/123
123/123
109/125
125/125
123/123
111/123
123/123
123/123
111/111
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/237
237/276
237/237
237/276
237/237
237/237
237/237
147
K2
K3
K4
K5
K6
K7
K8
K11
Krkic 2
Krkic 3
238/242
222/246
222/242
222/238
242/242
222/242
222/246
242/242
222/242
222/246
116/116
116/116
116/116
116/116
116/116
116/116
116/116
116/116
116/116
132/154
137/154
132/154
150/154
154/159
132/154
154/211
137/154
132/156
132/215
208/224
224/224
212/218
212/224
224/224
180/224
220/220
206/214
214/222
214/214
159/171
159/159
159/183
159/159
171/183
159/159
183/193
159/183
149/159
159/183
166/168
166/170
158/166
104/170
166/166
104/158
145/166
151/166
145/175
104/166
Zrmanja
potona
Zrm1
Zrm2
Zrm4
Zrm6
226/256
230/258
226/230
226/242
Neretva
mekousna
MP3
MP6
MP8
MP9
MP12
MP13
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
218/218
106/114
106/109
106/106
104/114
98/106
253/253
247/253
253/253
253/265
247/253
247/265
253/265
253/265
253/253
253/265
116/116
116/116
116/116
116/116
137/163
159/171
159/167
159/163
200/214
200/214
200/200
200/200
189/189
189/189
189/189
189/189
187/187
181/181
241/241
241/241
245/245
241/245
104/104
104/104
104/104
104/104
247/265
247/265
247/265
247/265
131/131
135/135
133/137
133/137
131/133
135/135
155/175
175/179
159/179
145/175
175/183
179/183
176/176
176/176
176/196
176/176
176/176
172/178
171/171
159/171
171/173
159/171
171/171
171/171
93/93
91/95
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
206/206
116/120
116/120
118/120
116/120
237/237
237/245
245/245
237/245
237/237
237/245
91/93
93/93
93/93
218/226
226/226
226/226
204/204
218/226
226/226
104/106
106/109
96/106
106/114
111/116
148