INTRODUKTION TILL

MIKROBIOLOGI
Bilder
Karin Carlson  Claës Linder
Klas Flärdh  Stefan Bertilsson
Magnus Lundgren  Staffan Svärd

Nästa bild – Enter

Avsluta Esc
 1
Vad är mikrobiologi?
 Bacteria Archaea Eukarya

Figur 1.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 2
Mikrobiologisk
arbetsmetodik
 11
A

bakteriehalt (log celler/mL)

9

7
C B
5

3
D
1

-1 0 5 10 15 20

tid
-3

Figur 2.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 1,6

1,4

log D (log min) 1,2

0,8

0,6

0,4

0,2

0
105 110 115 120 125
temp (°C)

Figur 2.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 Tid (genera+oner)

Döda/inak+va celler

Exponen+ell +llväxt Förbrukat

medium

Figur 2.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 1 2 3 4

Figur 2.4

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 2.5

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 3
Bakterieceller
 B
C

D
E

Figur 3.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 β(1,4)glykosid-
bindning, känslig
för lysozym

NAG NAM
CH2OH CH2OH
O O
O O O
OH

NH NH
N-acetyl-
C=O C=O
grupp
L-Ala
CH3 CH3
D-Glu
tetrapeptid-
kedja diaminosyra

D-Ala

Figur 3.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A
väggteikoinsyra
väggprotein lipoteikoinsyra

N-acetyl-
muraminsyra

peptidoglykan

N-acetyl-
glukosamin

cellmembran

membranprotein

B C
H H
O-
H H H H H O-
HO C C C OO -
O P O C C C C C O P O
R1 R2
O H H O
D-glukos
D-alanin
D-alanin

Figur 3.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A porin lipopolysackarid

lipid A
protein

yttermembran
NAM lipoprotein

peptidoglykan periplasmatiskt
utrymme
NAG
cellmembran

membranprotein

B
KDO P
P
NAG Gal Hep KDO NAG
P

Glu Gal Glu Hep Hep KDO

NAG
P
n P

O-sackarid kärnsackarid lipid A

Figur 3.4A–B

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 L

Mot
MS

Fli

Figur 3.7Figur 3.5

Introduktion
Introduktion till mikrobiologi
till mikrobiologi © K. Carlson
© Karin Carlson, m.fl. och
Claës Linder ochStudentlitteratur
Studentlitteratur2017
2008
 B

Figur 3.6

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A B C D

PG

YM
PG
CM

CM

Figur 3.7A–D

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A B C effektorer
effektorer

euk. CM

YM
YM
PG
PG
CM bakt. CM
NH2 ADP + Pi
ADP + Pi ADP + Pi
ATP ADP + Pi
COOH ATP
effektorer ATP effektorer ATP
Sec MTB

Figur 3.8

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 vegetativ cell
VII
germinering
spor

sporkappa

cortex

II IV-VI

spormodercell

förspor
inre spormembran

III

cellmembran

yttre spormembran

Figur 3.9

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 4
Metabolism
och tillväxt
 KATABOLISM ANABOLISM
byggstenar, energi, biosyntes
reduktionskraft
Biopolymerer
Näringskälla
ATP
Monomerer

ADP Prekursorer

Restprodukt Externa byggstenar

Byggstenar, reduktionskraft via exempelvis NADH

Figur 4.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 4.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 Substrat + oxiderad elektronbärare ger
reducerad elektronbärare + produkt Tillgänglig energi

-0,6 E0’ (V)

-0,5 e- Exempel: aerob
Glukos èCO2 (24 e-) glukosoxidaPon
-0,4
H2 èH+ (2 e-)
-0,3
CH4 èCO2 (8 e-) CO2 (8 e-) èCH4
-0,2 ΔE0’ = 0.82 – (-0.43)
SO42- (8 e-) èH2S
-0,1 ΔE0’= 1.25 V
Fe2+ èFe3+ (1 e-) 0 Fe3+ (1 e-) èFe2+
0,1 Gibbs fria energi
0,2 ΔG0’= -nFΔE0’

0,3 n = antal elektroner
0,4 NO3- (2 e-) è NO2- F = Faradays konstant
0,5
0,6 ΔG0’= -2,9 megajoule
0,7 per mol glukos
0,8 O2 (2 e-) èH2O
0,9 e -

Substrat + reducerad elektronbärare ger

oxiderad elektronbärare + produkt

Figur 4.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A
1/2 glukos
ADP NAD

ATP NADH
pyruvat laktat

yttermembran
cellmembran
peptidoglykan

NAD HA
ADP ATP
NADH
A-
A
e-

ATPas
elektronbärare H+ H+
H+ H+

Figur 4.4

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 2,3-butylenglykol: 1/2 glukos
Enterobacter, en del Bacillus
1/2 ATP

acetoin nNAD 1/2 glukos-6-fosfat

NAD 1/2 ATP
NADH
laktat:
nH2, nCO2 2 ATP NAD
Streptococcus,
NADH NADH
Lactobacillus
CO2 (homofermentation)
ättiksyra,
propionsyra:
Propionobacterium
pyruvat NADH NAD
nNAD, nATP nNADH, nPi CO2
etanol:
CoA
jäst
nNADH
nNAD+CoA NADH
acetyl-CoA
Pi 2 NADH
+ NAD
myrsyra
ATP (HCOOH)
smörsyra, butanol, 2 NAD
Pi
aceton, isopropanol, CO2: CoA
surt pH, ATP
Clostridium hydrogen
lyas
ättiksyra,
H2, CO2 etanol laktat

blandad syrajäsning: enterobakterier, en del Bacillus

(också succinat från fosfoenolpyruvat via oxalacetat)

Figur 4.5

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 CH4 CO2
NH3 NO2-
Fe2+ Fe3+
S2- SO42-
SO42-
2H S2-
H2 utsida
nH+ nH+ nH+
Ndh
c1 c
e- e- e-
Q b cellmembran

Sdh
o, d eller a+a3
reduktas
H+ + NADH NAD+
4H+ +O2 insida
succinat fumarat NO3- H 2O
NO2-
Fe3+
Fe2+
-320 0 +820

redoxpotential (mV)

Figur 4.6

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 + + +
H H H
utsida

insida

ADP + Pi

ATP

3A- 3HA
Figur 4.5

Figur 4.7 till mikrobiologi

Introduktion © Karin Carlson, Claës Linder och Studentlitteratur 2008

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

978-91-44-04846-8_OHPRES.indd 13 2008-04-17 13:06:27
 RC-bakterioklorofyll SO42- foton
S2- utsida
exciterat nH+

c e-
e- c1
B Mk, Q
b cellmembran
e-

excitering
RC-bakterioklorofyll
nH+
relaxerat insida

-1000 -300 0 +300

redoxpotential (mV)

Figur 4.8

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 SO42-
NH3 fetter
glukos-6-fosfat övriga grund-
fruktos-6-fosfat ämnen fettsyror (≈8) lipopolysackarid
PO43- pentos-5-fosfat
Energikälla erytros-4-fosfat
socker (≈25)
triosfosfat glykogen
kolkälla
3-fosfoglycerat
källa till reduktionskraft fosfoenolpyruvat
aminosyror (≈ 25)
pyruvat
peptidoglykan
nukleotider (≈8)
acetyl-CoA
α-ketoglutarat protein
succinyl-CoA
oxaloacetat RNA

DNA

Figur 4.9

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 fruktos-6-P
insida

UDP-NAG fettsyror

UDP-NAM UDP-NAG(diFS)

UDP-NAG(diFS)+ UDP-NAG(diFS)
ATP
UDP-NAM + UDP-NAG UDP+UMP+ADP
+ aminosyror
P-NAG(diFS)-NAG(diFS)-P
C55-P
CMP-KDO, fettsyror
UMP
KDO-lipidA
socker
C55PP-NAM(pep)5-NAG

kärnsackarid-KDO-lipidA cellmembran
C55PP-NAM(pep)5-NAG
transglykosylering
C55-PP-O-sackarid
C55-PP
C55PP-NAM(pep)5-NAG-NAM(pep)5-NAG
C55-PP
transpeptidering utsida

peptidoglykan lipopolysackarid

Figur 4.10

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 tillväxthastighet
termofil
psykrofil mesofil
hypertermofil

-10 10 30 50 70 90 110
temperatur (°C)
psykrotrof

Figur 4.11

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 radiovågor
gamma röntgen ultraviolett synligt infrarött mikrovågor

1 x 10–12 5 x 10–8 2 x 10–7 3,9 x 10–7 7,6 x 10–7 1 x 10–3

våglängd (m, logaritmisk skala)

Figur 4.12

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A 1400 B 3,3

3,1
1200

2,9

log cellmassa (log µg/mL)

1000
cellmassa (µg/mL)

2,7

800
2,5

600 2,3

2,1
400

1,9
200
1,7

0
0 50 100 150 200 250 1,5
0 50 100 150 200 250
tid (min)
tid (min)

Figur 4.13

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 3
8

4
6 2

4
1

0,5 1 3 6 9 12

tid (dagar)

Figur 4.14

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 biofilm
planktoniska
celler
kanal
extracellulära
polymerer
adhesion utsöndras
till yta

Figur 4.15

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 5
Genetik
 Val Leu Ala Gly Trp Pro Arg
...GTGCTGGCTGGCTGGCCCCGAT...
C
A
Val Leu Ala Ser Trp Pro Arg
B ...GTGCTGGCTAGCTGGCCCCGAT...

Val Leu Ala Gly stopp

...GTGCTGGCTGGCTGACCCCGAT...
Val Leu Ala Gly Trp Pro Arg
...GTGCTGGCCGGCTGGCCCCGAT...

Figur 5.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 Val Leu Ala Gly Trp Pro Arg Leu
...GTGCTGGCTGGCTGGCCCCGATTAT...
1 2 3

Val Leu Ala Gly Pro Asp Tyr

...GTGCTGGCTGGCCCCGATTAT...
1 2

Figur 5.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 5' 3'
3' 5'
A 3' 3'
5' 5'

5' 3' 5' 3'

3' 5' 3' 5'

B E
3' 5' 3' 5'
5' 3' 5' 3'

5' 3' 5' 3'

3' 5' 3' 5'
F
C 3' 5' 3' 5'
5' 3' 5' 3'

5' 3' 5' 3'

3' 5' 3' 5'
D 3' 5' G
5' 3' 3' 5'
5' 3'

5' 3' 5' 3'

3' 5' 3' 5'
H I
3' 5' 3' 5'
5' 3' 5' 3'

Figur 5.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 a b c d e

a e

B
a b c d b c d e

Figur 5.4

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 IS IS
{

{
omvänd upprepning andra gener transposas

Figur 5.5

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 B
infektion
A
induktion

C
lytisk växt

ny infektion

maturering

lys

Figur 5.6

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 5.7

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 5.8

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 konjugativ temperat
plasmid fag

transposon

genomö

mobiliserbar transposon

konjugativ genomö

integrativ konjugativ plasmid

konjugativ transposon

rekombinas överförings- diverse gener

funktioner

replikationsorigo överföringsorigo

omvänd upprepning integrationsställe

Figur 5.9

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A PR OP L
operon

strukturgen 1 strukturgen 2 strukturgen 3

repressor
B

RNA-polymeras
transkriptionsriktning
C

mRNA
D

Figur 5.10

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A
RBS RBS

rpo
B pep
rib DNA

UGGUGG UGA
mRNA

C
UGGUGG
3
12
med acylerad
tRNATrp 4
D UGA

3 4
UGGUGG UGA stopp

E ingen acylerad
tRNATrp

2 3

UGGUGG UGA

Figur 5.11

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 signal
utsida membransensor

cellmembran

ATP P
insida
ADP cytoplasmatisk
regulator

Figur 5.12

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 aktivering eller
repression av genaktivitet

Figur 5.13

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 7
Arkéer
 Figur 7.2
Ba
kt
er

Introduktion till mikrobiologi

ie
DP r
AN
N
Eu
r ya
r ké
er
Eu
k ar
yo
Lo te
k r
ia
rk
ée
Ko r
ra
r ké
er
Kr
en
ar
ké
Ba er
ty
ar
ké
Ai er
ga
rk
ée
Ta r
um
ar
ké
er
© K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017
 8
Eukaryota
mikroorganismer
 Bacteria
Archaea

Opisthokonta djur
grönalger
Unikonta
landväxter Plantae svampar
rödalger Amoebozoa mikrosporidier
Excavata
euglenioder
(Euglena) Chromoalveolata slemsvampar
Alveolata Entamoeba
flagellater
Rhizaria
(Trypanosoma)
pansaralger
Stramenopila ciliater
Apicomplexa (spordjur)
diplomonader
(Giardia) radiolarier
foraminiferer kiselalger, brunalger,
guldalger
oomyceter

Figur 8.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 meios germinering
sporulering

a
mitos
D H H
a α
mitos
α

a
fusion
α

Figur 8.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 kärnor

Figur 8.5

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 9
Virus
 MS2 Φ6 ΦX174
fd, M13

λ
T7
100 nm
T4

Figur 9.1
13.1

Introduktion
Introduktion till
till mikrobiologi
mikrobiologi © K. Carlson
© Karin Carlson,m.fl.
Claës och Studentlitteratur
Linder 2017
och Studentlitteratur 2008
 infektion

DNA-penetration

lys

tidigt genuttryck

maturering

sent genuttryck fag-DNA-replikation

Figur 9.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 infektion

DNA-penetration
etablering av
lysogeni

lytisk växt
profag-DNA

bakterietillväxt

induktion

lys

Figur 9.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A

ABV STIV2

ATV

100 nm

SIRV2

200 nm

Figur 9.4

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A
Parvo-
virus
Adenovirus
Herpesvirus

Papova- Hepadna-
virus virus 100 nm
Poxvirus

B
Picorna-
Rhabdovirus Togavirus
virus
Retrovirus

Arenavirus
Reovirus

100 nm Coronavirus
Ortomyxovirus Paramyxovirus

Figur 13.4A–13.4B

Figur 9.5till mikrobiologi

Introduktion © Karin Carlson, Claës Linder och Studentlitteratur 2008

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

-91-44-04846-8_OHPRES.indd 38 2008-04-17 13
 virion

8 1 cell

7
cellkärna

Figur 9.6

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 enkeltrådigt DNA

syntes av den
komplementära tråden

dubbeltrådigt DNA dubbeltrådig DNA-intermediat

omvänd transkription
transkription
enkeltrådigt RNA (+)
mRNA (+) hos retrovirus

kan användas syntes av +tråd

direkt

syntes av +tråd
enkeltrådigt RNA (+) dubbdeltrådigt RNA

enkeltrådigt RNA (-)

Figur 9.7

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 10
Mikrobiel ekologi
Figur 10.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 10.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 10.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 KLASSISK NÄRINGSKEDJA MIKROBIELLA LOOPEN

Större predatorer Ciliater

Flagellater
Små predatorer

Heterotrofa
bakterier
Primärproducenter
Organiska
näringsämnen

Figur 10.4

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 assimilering
(CH2O)n CO2

luft
(CH2O)n

(CH2O)n assimilering mark

respiration
aerobt
respiration CO2
kolhydrater, peptider mm
metanoxidation
fermentering
anaerobt

organiska syror, metanogenes

alkoholer, H2, CO2 CH4

ej fermenterat organiskt material

Figur 10.5

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 proteiner
N2

luft
proteiner

N2 mark

nedbrytning fixering
aerobt
NH3 nitrosofiering
NO2- nitrifiering

comammox
NO3-

N2
nitrat-
respiration NO3-
denitrifiering
anaerobt

anammox

Figur 10.6

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 11
Människans
mikrobiota
 tunntarm
ATP
CFTR
cAMP PKA
ADP

CFTR-P

Cl-
Na+

HCO3-

H 2O

diarré

Figur 11.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 A

Figur 11.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 12
Antibiotika
 vankomycin tetracyklin
β-laktamer aminoglykosider

makrolider
kloramfenikol

THF DHF PABA

kinoloner rifampicin trimetoprim sulfa

Figur 12.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 β-laktamring
H COOH
H2N O
S
CH 3 O N CH 3
N CH 3
N S CH 3
O
COOH H

Figur 12.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 COOH
COOH
COOH
COOH O O
O O O O N N CH CH
O O N N CH CH 3 3
3 3
O O Cl Cl N N S CH
S 3 CH 3
N N S CH
S 3 CH3
N N H H
H H O OCH CH
3 3

Figur 12.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 COOH
COOH COOH
COOH
O O HO HO O O
O O N N CH CH O O N N CH CH
3 3 3 3
N N S CH
S 3 CH 3 N N S CH
S 3 CH 3
H H
NH2 NH H H
2 NH2 NH 2

Figur 12.4

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 COOH
O
N
O OH

Figur 12.5

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 COOH
O CH3
O N

N S
NH2 H

Figur 12.6

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 COOH
O
H N
HO S

H 3C H H CH3
O
N
H
N
H 3C CH3

Figur 12.7

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

 13
Sjukdomar orsakade av
eukaryoter och virus
 F
E

A
B

Figur 13.1

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 13.2

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017

Figur 13.3

Introduktion till mikrobiologi © K. Carlson m.fl. och Studentlitteratur 2017