PROGRAM STUDI KIMIA

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

UJIAN BIOKIMIA DASAR II (KI-3261)

9 Maret 2010 BUKU TERBUKA 100 Menit

NAMA : ________________ Tanda Tangan

NIM : ________________

KERJAKAN DI BAGIAN KOSONG PADA LEMBAR INI JUGA.

JANGAN LUPA TULISKAN NIM ANDA DI TIAP HALAMAN.

Metabolisme umum
1. Beberapa reaksi metabolisme dan proses-proses lainnya di dalam sel berlangsung
secara endergonik, sehingga tidak mungkin berlangsung tanpa bantuan energi
bebas dari proses/sumber lainnya. Berikan dua sumber energi bebas beserta
contohnya untuk mendorong reaksi atau proses-proses di dalam sel yang
endergonik.

Glikolisis dan siklus asam sitrat

2. (a). Dalam suatu percobaan digunakan eritrosit (sel darah merah) yang sedang
melakukan glikolisis. Ke dalam tabung, ditambahkan fosfat anorganik bertanda
(mengandung atom 32P). Menurut saudara, akankah atom 32P ini ditemukan
pada senyawa-senyawa intermediet pada jalur glikolisis? Lengkapi jawaban
saudara dengan menunjukkan reaksi yang sesuai.

(b). Perubahan energi bebas standar reaksi yang dikatalisis oleh fosfofruktoki-
nase-1 diketahui ∆G0’=-14,2 kJ/mol. Tetapi dalam percobaan dengan eritrosit
itu teramati ∆G0’=-4,8 kJ/mol.
- Tentukan angka banding konsentrasi [ADP]/[ATP] jika diketahui [F-1,6-BP]/
[F-6P] adalah lima.
- Seandainya [ADP]=0,2 mM, tentukan [ATP].
- Pada kondisi ini, beri ulasan saudara terhadap aktivitas enzim ini.

1 NIM:_________________
 (c). Pada kondisi (b) di atas, adakah pengaruhnya terhadap siklus TCA (petunjuk:
perhatikan enzim kunci/pengendali pada TCA)

Rantai respirasi
3. (a). Gambarkan secara skematis proses transfer elektron dari NADH ke oksigen, dan
tunjukkan di mana terjadi aliran pompa proton!

(b). Asam bongkrek merupakan senyawa uncoupling yang mampu melewatkan

proton tanpa melalui ATP sintase. Hitung ATP yang dihasilkan dari pembakaran
1 mol glukosa pada pasien yang keracunan asam bongkrek.

(c). Hitung pula ATP yang dihasilkan dari pembakaran 1 mol asam heksanoat pada
pasien yang keracunan asam bongkrek.

Degradasi asam lemak

4. (a). Asam stearat (lemak jenuh C18:0) dan asam oleat (asam lemak tak jenuh C18:1
(∆9)) merupakan komponen asam lemak yang ditemui dalam minyak sawit.
Jelaskan dari sudut pendekatan struktur molekul, asam lemak mana dari
kedua jenis asam lemak tersebut yang berenergi lebih tinggi.

(b). Jelaskan proses transpor tristearin (tristearil gliserol) dari usus ke jaringan
adipose!

(c). Dalam hal katabolisme tristearin, reaksi kimia apa yang berlangsung di
sitoplasma?

(d). Hitung jumlah ATP total yang dihasilkan dari oksidasi sempurna 1 mol asam
stearat menjadi karbondioksida dan air di jantung?

Fotosintesis
5. (a). Pada proses fotosintesis di kloroplas daun, jelaskan apa yang terjadi pada
reaksi terang dan apa pula yang berlangsung pada reaksi gelap!

(b). Jelaskan kemiripan proses transfer elektron yang berlangsung pada rantai
respirasi dengan yang terjadi pada reaksi terang!

2 NIM:_________________
6. Jika udara panas dan kering, tanaman harus menjaga agar sesedikit mungkin
terjadi bukaan stomata untuk mencegah penguapan, akibatnya, kadar CO2 di
dalam sel yang dekat dengan udara turun di bawah nilai Km ribulosa 1,5-bisfosfat
karboksilase terhadap CO2.

(a) Apa implikasi dari fenomena ini?

(b) Adaptasi khusus apa yang dilakukan tanaman agar dapat mengikat CO2 pada
kondisi tersebut?

3 NIM:_________________
 PROGRAM STUDI KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

UJIAN BIOKIMIA DASAR II (KI-3261)

9 Maret 2010 BUKU TERBUKA 100 Menit

NAMA : ________________ Tanda Tangan

NIM : ________________

KERJAKAN DI BAGIAN KOSONG PADA LEMBAR INI JUGA.

JANGAN LUPA TULISKAN NIM ANDA DI TIAP HALAMAN.

Metabolisme umum
1. Beberapa reaksi metabolisme dan proses-proses lainnya di dalam sel berlangsung
secara endergonik, sehingga tidak mungkin berlangsung tanpa bantuan energi
bebas dari proses/sumber lainnya. Berikan dua sumber energi bebas beserta
contohnya untuk mendorong reaksi atau proses-proses di dalam sel yang
endergonik.

Jawab:
Sumber energi bebas untuk mendorong proses-proses endergonik antara lain:
(a) Dari hidrolsisi biomolekul berenergi tinggi. Misalnya hidrolisis ATP menjadi ADP dan Pi
yang dapat menyediakan energi bebas sekitar 31 kJ/mol dalam keadaan standar.
(b) Dari transport pasif. Misalnya pada sintesis ATP oleh enzim ATP sintase, sumber energi
bebas yang digunakan oleh enzim ATP sintase berasal dari transport pasif proton dari
ruang antar membran ke dalam matriks mitokondria.
(c) Radiasi elekromagnetik. Misalnya pada proses transfer elektron yang berlangsung di
dalam fotosistem II dan fotosistem I pada proses fotosintesis. Eksitasi menyebabkan
transfer elektron dapat berlangsung meskipun aceptor elektron memiliki potensial reduksi
lebih rendah.

1 NIM:_________________
Glikolisis dan siklus asam sitrat
2. (a). Dalam suatu percobaan digunakan eritrosit (sel darah merah) yang sedang
melakukan glikolisis. Ke dalam tabung, ditambahkan fosfat anorganik bertanda
(mengandung atom 32P). Menurut saudara, akankah atom 32P ini ditemukan
pada senyawa-senyawa intermediet pada jalur glikolisis? Lengkapi jawaban
saudara dengan menunjukkan reaksi yang sesuai.

Jawab:

2 NIM:_________________
(b). Perubahan energi bebas standar reaksi yang dikatalisis oleh fosfofruktoki-
nase-1 diketahui ∆G0’=-14,2 kJ/mol. Tetapi dalam percobaan dengan eritrosit
itu teramati ∆G0’=-4,8 kJ/mol.
- Tentukan angka banding konsentrasi [ADP]/[ATP] jika diketahui [F-1,6-BP]/
[F-6P] adalah lima.
- Seandainya [ADP]=0,2 mM, tentukan [ATP].
- Pada kondisi ini, beri ulasan saudara terhadap aktivitas enzim ini.

Jawab:
- Jika [F-1,6-BP]/[F-6P] = 5 maka [ADP]/[ATP] = 8,9
- Jika [ADP]=0,2 mM maka [ATP] = 0,2/8,9 mM = 0,02 mM
- Karena konsentrasi ADP > ATP maka reaksi pembentukan F-1,6-BP berlangsung cepat
sehingga pada gilirannya konsentrasi piruvat meningkat (artinya glikolisis meningkat).

(c). Pada kondisi (b) di atas, adakah pengaruhnya terhadap siklus TCA (petunjuk:
perhatikan enzim kunci/pengendali pada TCA)

Jawab:
Bila aktivtias glikolisis meningkan (terlebih konsentrasi ADP > konsentrasi ATP) maka ini
akan meningkatkan proses dapa siklus Krebs.

3 NIM:_________________
Rantai respirasi
3. (a). Gambarkan secara skematis proses transfer elektron dari NADH ke oksigen, dan
tunjukkan di mana terjadi aliran pompa proton!

Jawab:

(b). Asam bongkrek merupakan senyawa uncoupling yang mampu melewatkan

proton tanpa melalui ATP sintase. Hitung ATP yang dihasilkan dari pembakaran
1 mol glukosa pada pasien yang keracunan asam bongkrek.

Jawab:
4 mol ATP

(c). Hitung pula ATP yang dihasilkan dari pembakaran 1 mol asam heksanoat pada
pasien yang keracunan asam bongkrek.

Jawab:
1 mol ATP

Degradasi asam lemak

4. (a). Asam stearat (lemak jenuh C18:0) dan asam oleat (asam lemak tak jenuh C18:1
(∆9)) merupakan komponen asam lemak yang ditemui dalam minyak sawit.
Jelaskan dari sudut pendekatan struktur molekul, asam lemak mana dari
kedua jenis asam lemak tersebut yang berenergi lebih tinggi.

Jawab:
Berdasarkan struktur molekul, bahan bakar (yang memiliki ekivalen pereduksi tinggi atau
perbandingan CO2/O2 rendah) akan memiliki energi tinggi misalnya energi bebas CH 4 >
energi bebas C02 atau energi bebas H3C–CH3 > energi bebas H2C=CH2. Atas dasar karakteristik
ini maka energi asam stearat > energi asam oleat.

4 NIM:_________________
 (b). Jelaskan proses transpor tristearin (tristearil gliserol) dari usus ke jaringan
adipose!

Jawab:
Di usus, tristearin dihidrolisis oleh lipase menjadi asam stearat dan produk lain yang
kemudian diangkut menembus membran usus. Asam stearat dikonversi kembali menjadi
tristearin dan digabungkan dengan kolesterol dan apolipoprotein menjadi kilomikron.
Akhirnya, kilomikron bergerak menuju jaringan adiposa melalui aliran darah.

(c). Dalam hal katabolisme tristearin, reaksi kimia apa yang berlangsung di
sitoplasma?

Jawab:
Hidrolisis tristearin menjadi asam stearat dan gliserol; konversi gliserol menjadi
gliseraldehid-3-fosfat dan diteruskan menjadi piruvat; dan aktivasi asam stearat menjadi
stearil-CoA.

(d). Hitung jumlah ATP total yang dihasilkan dari oksidasi sempurna 1 mol asam
stearat menjadi karbondioksida dan air di jantung?
Jawab:
120 mol ATP

Fotosintesis
5. (a). Pada proses fotosintesis di kloroplas daun, jelaskan apa yang terjadi pada
reaksi terang dan apa pula yang berlangsung pada reaksi gelap!

Jawab:
Pada reaksi terang berlangsung penangkapan foton; oksidasi air menjadi oksigen;
pembentukan ATP; dan reduksi NADP+ menjadi NADPH. Pada reaksi gelap berlangsung
asimilasi/fiksasi karbondioksida menjadi gula dengan menggunakan energi ATP dan
NADPH yang dihasilkan dai reaksi terang.

5 NIM:_________________
 (b). Jelaskan kemiripan proses transfer elektron yang berlangsung pada rantai
respirasi dengan yang terjadi pada reaksi terang!

Jawab:
Aliran elektron terjadi dari zat berenergi tinggi (NADH→O2 akibat perbedaan potensial kimia
atau H2O→NADPH yang digerakkan oleh foton); terjadi sintesis ATP akibat dari timbulnya
gradien proton.

6. Jika udara panas dan kering, tanaman harus menjaga agar sesedikit mungkin
terjadi bukaan stomata untuk mencegah penguapan, akibatnya, kadar CO2 di
dalam sel yang dekat dengan udara turun di bawah nilai Km ribulosa 1,5-bisfosfat
karboksilase terhadap CO2.

(a) Apa implikasi dari fenomena ini?

Jawab:
If the level of CO2 falls below the Km of ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase, photorespiration, in
which ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase utilizes O2 rather than CO2 as a substrate, is favored
over carbon fixation. Photorespiration is a wasteful process that consumes ATP.

(b) Adaptasi khusus apa yang dilakukan tanaman agar dapat mengikat CO2 pada
kondisi tersebut?

Jawab:
To avoid this problem, plants such as corn, cane sugar, and crabgrass, termed C 4 plants, have
developed a two-step mechanism of CO2 fixation in which the initial assimilation of CO2 can
occur in a relatively low CO2, high O2 environment. The leaves of C4 plants possess two types of
chloroplast-containing cells: mesophyll cells, which are directly exposed to air, and bundle sheath
cells, which underlie the mesophyll cells. (The leaves of other plants, termed C 3 plants, possess
chloroplast-containing mesophyll cells but lack bundle sheath cells.) In C4 plants, the bundle
sheath cells generally contain more chloroplasts (and hence Calvin cycle enzymes) than the
mesophyll cells. In the mesophyll cells, CO2 reacts with phosphoenolpyruvate to produce the
four-carbon compound oxaloacetate, which is reduced to malate. The enzyme catalyzing this
reaction is active even at low CO2 levels. Malate is shuttled to the bundle sheath cells, where it is
decarboxylated, releasing CO2 and thereby producing a relatively high CO2, low O2 environment.
Under these conditions, ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase operates to fix CO2 and the Calvin
cycle can operate as usual.

6 NIM:_________________
 UJIAN METABOLISME DAN INFORMASI GENETIKA (KI-3261)

19 Mei 2011 BUKU TERTUTUP 60 Menit

NAMA : _____________________________ Tanda Tangan

NIM : _________________
KELAS :_________________

1. Biosintesis asam lemak diawali oleh prekursor asetil-KoA

dan perpanjangan rantai karbon menggunakan malonil-
KoA. Semua reaksi dilakukan oleh satu enzim yaitu asam
lemak sintase (FAS) yang terdiri dari enam domain dan
masing-masing domain memiliki fungsi masing-masing
seperti pada gambar di samping.

a. Jelaskan fungsi masing-masing domain yang terdapat

dalam FAS.

b. Berdasarkan fungsi domain di atas, tuliskan urutan

reaksi kimia pemanjangan rantai asetil-KoA dengan
unit malonil-KoA menjadi butiril-KoA yang berlangsung
pada FAS.

2. Vitamin asam folat sangat diperlukan tubuh untuk membantu biosintesis glisin dari prekursor 2-
fosfogliserat. Selanjutnya, rantai glisin dan rantai suksinil-KoA digunakan bersama untuk membangun
molekul δ-aminolevulinat yang merupakan unit pembentuk cincin porfirin. Jelaskan apa kaitan antara
penyakit anemia dan defisiensi asam folat.
 UJIAN PERTAMA METABOLISME DAN INFORMASI GENETIKA (KI-3261)

Selasa, 28 Februari 2012 BUKU TERTUTUP 07.00-09.00

1. ATP adalah energi kimia dalam sel hidup yang mendukung semua aktivitas kehidupan.
a. Apa perbedaan utama jalur katabolisme dibanding jalur anabolisme dalam kaitannya dengan ATP?
Kaitkan penjelasan Anda dengan konsep endergonik dan eksergonik. (5)
b. Lukiskan struktur molekul ATP dan tunjukkan posisi gugus fungsi yang paling berperan dalam
fungsi ATP. (5)
c. Bagaimana ATP dapat membantu reaksi kimia yang tidak spontan secara termodinamika hingga
menjadi reaksi yang mudah terjadi di dalam sel hidup? (5)
d. Mengapa otot perlu menghasilkan ATP pada kondisi aerob dan anaerob? (10)

2. Glikolisis merupakan tahap awal metabolisme glukosa untuk menghasilkan ATP.

a. Tuliskan dua reaksi dalam glikolisis yang menghasilkan ATP. Lengkapi reaksi tersebut dengan
memberikan nama pada pereaksi dan produk reaksi. (10)
b. Sebutkan nama kedua enzim yang mengkatalisis reaksi tersebut. (5)
c. Bagaimana pengaruh asam sitrat pada laju glikolisis? (5)
d. Bagaimana Anda dapat menjelaskan bahwa glukoneogenesis merupakan proses yang lebih mahal
dibanding glikolisis? (5)

3. Siklus asam sitrat merupakan metabolisme sentral dalam makhluk hidup.

a. Tuliskan reaksi total dalam siklus asam sitrat. (5)
b. Tentukan jumlah ekivalen molekul ATP atau GTP yang dihasilkan dari satu putaran siklus asam
sitrat. (5)
c. Apa yang dimaksud dengan jalur anaplerotik dalam siklus asam sitrat? Jelaskan dengan contoh. (5)
d. Mengapa siklus asam sitrat digolongkan sebagai amfibolik? (5)
e. Bagaimana keterkaitan siklus glioksilat dengan siklus asam sitrat? (5)

4. Fosforilasi oksidatif merupakan tahap penting dalam metabolisme produksi ATP.

a. Berikan gambaran skematis tentang proses transfer elektron dari NADH dan FADH 2 ke O2 dalam
fosforilasi oksidatif. (10)
b. Tunjukkan molekul kompleks yang berkontribusi pada proses pemompaan proton dan jelaskan
kompartemen mitokondria yang terlibat dalam proses ini. (5)
c. Sebutkan nama enzim yang mengkatalisis reduksi O2 dalam fosforilasi oksidatif. (5)
d. Jelaskan tentang energi yang digunakan oleh ATP sintase untuk mengubah ADP dan Pi menjadi
ATP. (5)
 UJIAN I METABOLISME DAN INFORMASI GENETIKA (KI-3261)

8 Maret 2013 BUKU TERTUTUP 100 Menit

NAMA : _____________________________ Tanda Tangan

NIM : _________________
KELAS :_________________

Metabolisme: Konsep Dasar dan Rancangan

1. Sumber energi universal yang terdapat dalam makhluk hidup adalah ATP. Pada kondisi fisiologi (pH 7,
suhu 37oC), reaksi hidrolisis ATP menjadi ADP dinyatakan sebagai berikut:
ATP + H2O ⇌ ADP + H2PO42- ∆Go = -30,5 kJ/mol
a. Tentukan nilai tetapan kesetimbangan K pada kondisi fisiologi di atas. (R = 8,31 J mol-1 K-1) (5)

b. Bila pada kondisi istirahat konsentrasi ATP sebanyak 5 mM, tentukan konsentrasi ADP. (5)

c. Saat sel bekerja, suasana sitosol sel menjadi lebih asam dengan pH mencapai 6,5. Pada kondisi ini,
apakah ATP lebih mudah terhidrolisis atau justru terbentuk? Jelaskan alasannya. (5)
(data asam fosfat: pKa1 = 2,12, pKa2 = 7,21, pKa3 = 12,67)
2. Piruvat + NADH + H+ ⇌ laktat + NAD+

a. Tuliskan kedua pasangan asam dan basa konjugasinya dari reaksi di atas. (4)

b. Pada kondisi standar (pH 7 dan 25oC), potensial reduksi piruvat menjadi laktat adalah -0,185 V, dan
potensial reduksi NAD+ menjadi NADH adalah -0,320 V. Pada kondisi ini, manakah yang memiliki
kadar yang lebih tinggi? Piruvat atau laktat? Jelaskan alasannya. (6)

Glikolisis dan Glukoneogenesis

3. Tuliskan reaksi kimia kerja heksokinase. (5)

4. Tuliskan reaksi kimia kerja gliseraldehid-3-fosfat dehidrogenase. (3)

5. Tuliskan reaksi kimia kerja fruktosa-1,6-bifosfatase. (5)

Metabolisme Lemak

6. Gambarkan struktur asam lemak (C16:1,cis-∆9). (5)

7. Bandingkan energi yang terlibat pada β-oksidasi asam butirat menjadi asetil-KoA dengan pembentukan
asam butirat dari asetil-KoA. Jelaskan makna dari perbedaan tersebut. Gunakan kesetaraan 1 NADH ≈
2,5 ATP, 1 NADPH ≈ 2,5 ATP, dan 1 FADH2 ≈ 1,5 ATP. (5)

8. Tuliskan dua tahap reaksi pengaktifan asam lemak secara umum. (5)

Siklus Asam Sitrat

9. Tuliskan reaksi kimia dari kerja malat dehidrogenase. (5)

10. Tuliskan reaksi kimia dari kerja akonitase. (5)

11. Tuliskan reaksi kimia dari kerja α-ketoglutarat dehidrogenase. (5)

12. Tuliskan reaksi kimia dari kerja suksinat dehidrogenase. (5)

Fosforilasi Oksidatif

13. Tentukan jumlah mol ATP yang dihasilkan dari katabolisme sempurna molekul berikut:

a. Satu mol glukosa dalam suasana aerob di otak. (5)

b. Satu mol fruktosa dalam suasana anaerob di otot. (5)

c. Satu mol asam laurat (12:0) dalam suasana aerob di jantung. (5)

d. Satu mol asam laurat (12:0) dalam suasana aerob di jantung yang keracunan senyawa uncoupler
asam bongkrek. (5)

e. Satu mol glukosa dalam suasana aerob di otot paru-paru saat keracunan gas karbonmonoksida
(gas ini menghambat kerja kompleks IV). (5)
 PROGRAM STUDI KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

UJIAN METABOLISME DAN INFORMASI GENETIKA (KI-3261)

8 Maret 2013 BUKU TERTUTUP 100 Menit

NAMA : ________________ Tanda Tangan

NIM : ________________

KERJAKAN DI BAGIAN KOSONG PADA LEMBAR INI JUGA.

Metabolisme: konsep dasar dan rancangan

1. Sumber energi universal yang terdapat dalam mahluk hidup adalah ATP. Pada kondisi fisiologi
(pH 7 dan 37oC), reaksi hidrolisis ATP menjadi ADP dinyatakan sebagai berikut:
ATP + H2O ⇌ ADP + H2PO4– ΔGo’ = –30,5 kJ/mol
a. Tentukan nilai tetapan kesetimbangan K pada kondisi fisiologi di atas, dengan
R = 8,31 J mol–1 K–1 (Nilai-5)

∆Go’= – RT ln K
K = exp (– ∆Go’/RT) = exp (30.500/8,31•310) = 1,39 × 105

b. Bila pada kondisi istirahat konsentrasi ATP sebanyak 5 mM, tentukan konsentrasi ADP
(Nilai-5)

K = [ADP][H2PO4–]/[ATP] = [ADP]2/[ATP]
[ADP] = (K∙[ATP])½ = (1,39 × 105× 5) ½ mM = 833 mM = 0,833 M

c. Saat sel bekerja, suasana sitosol sel menjadi lebih asam dengan pH mencapai 6,5. Pada
kondisi ini apakah ATP lebih mudah terhidrolisis atau justru terbentuk, jelaskan alasannya.
(Data asam fosfat: pKa1 = 2,12, pKa2 = 7,21, dan pKa3 = 12,67 (Nilai-5)

Kondisi lebih asam (pH turun 0,5) membuat konsentrasi [H2PO4–]

bertambah sehingga reaksi bergeser ke arah pembentukan ATP.

2. Reaksi: Piruvat + NADH + H+ ⇌ Laktat + NAD+

a. Tuliskan kedua pasangan asam dan basa konjugat dari reaksi di atas (Nilai-4)

Pasangan asam dan basa konjugat adalah NADH/NAD + dan

Laktat/Piruvat
1 NIM:_________________
 b. Pada kondisi standar (pH 7 dan 25oC), potensial reduksi piruvat menjadi laktat adalah
–0,185 V, dan potensial reduksi NAD+ menjadi NADH adalah –0,320 V. Kondisi ini, manakah
yang memiliki kadar tinggi? Apakah piruvat atau laktat? jelaskan alasannya. (Nilai-6)

Eo = Eokatoda – Eoanoda = –0,185 V – (–0,320 V) = +0,135 V

∆Go’ = –n F Eo, artinya jika Eo positif berarti reaksi ke kanan
berlangsung spontan sehingga kadar piruvat akan lebih rendah dari
kadar laktat

Glikolisis dan glukoneogenesis

3. Tuliskan reaksi kimia kerja heksokinase (Nilai-5)

4. Tuliskan reaksi kimia kerja gliseraldehid-3-fosfat dehidrogenase (Nilai-5)

5. Tuliskan reaksi kimia kerja fruktosa 1,6-bifosfatase (Nilai-5)

2 NIM:_________________
Metabolisme asam lemak
6. Tuliskan struktur asam palmitoleat (C16:1,cis-Δ9) (Nilai-5)
O
1 3 5 7 9
C
HO
11

13

15

7. Bandingkan energi yang terlibat pada β-oksidasi asam butirat menjadi asetil-CoA dengan
pembentukan asam butirat dari asetil-CoA. Jelaskan makna dari perbedaan tersebut. Gunakan
kesetaraan 1 NADH ≈ 2,5 ATP, 1 NADPH ≈ 2,5 ATP, dan 1 FADH2 ≈ 1,5 ATP (Nilai-5)

β-Oksidasi asam butirat menjadi 2 asetil-CoA menghasilkan 2 ATP,

sementara itu pembentukan asam butirat dari 2 asetil-CoA
memerlukan 6 ATP. Ini menunjukkan bahwa anabolisme secara
energi umumnya lebih mahal dari pada katabolisme.

8. Tuliskan 2 tahap reaksi pengaktifan asam lemak secara umum (Nilai-5)

Siklus asam sitrat

9. Tuliskan reaksi kimia kerja malat dehidrogenase (Nilai-5)

3 NIM:_________________
10. Tuliskan reaksi kimia dari kerja akonitase (Nilai-5)

11. Tuliskan reaksi kimia kerja α–ketoglutarat dehidrogenase (Nilai-5)

12. Tuliskan reaksi kimia dari kerja suksinat dehidrogenase (Nilai-5)

Fosforilasi oksidatif
13. Tentukan jumlah mol ATP yang dihasilkan dari katabolisme sempurna molekul berikut:
a. 1 mol glukosa dalam suasana aerob di otak (Nilai-5)
30 ATP
b. 1 mol fruktosa dalam suasana anaerob di otot (Nilai-5)
2 ATP
c. 1 mol asam laurat (12:0) dalam suasana aerob di jantung (Nilai-5)
78 mol ATP
d. 1 mol asam laurat (12:0) dalam suasana aerob di jantung yang keracunan senyawa
uncoupler asam bongkrek (Nilai-5)
4 mol ATP
e. 1 mol glukosa dalam suasana aerob di otot paru-paru saat keracunan gas karbonmonoksida
(di mana gas ini menghambat kerja kompleks IV) (Nilai-5)
26 mol ATP
4 NIM:_________________
 PROGRAM STUDI KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

UJIAN METABOLISME DAN INFORMASI GENETIKA (KI-3261)

7 Maret 2014 BUKU TERTUTUP 100 Menit

NAMA : ________________ Tanda Tangan

NIM : ________________

KERJAKAN DI BAGIAN KOSONG PADA LEMBAR INI JUGA.

Metabolisme: konsep dasar dan rancangan

Suatu mekanisme reaksi enzimatis ditunjukkan sebagai berikut:

1. Tuliskan gugus fungsi pada residu katalitik yang bertindak sebagai nukleofil (Nilai 2)

2. Tuliskan gugus fungsi pada residu katalitik yang bertindak sebagai elektrofil (Nilai 2)

3. Tuliskan dua contoh residu asam amino (lebih ditekankan pada gugus fungsi rantai
sampingnya) yang bertindak sebagai elektrofil (Nilai 4)

4. Tuliskan dua contoh residu asam amino (lebih ditekankan pada gugus fungsi rantai
sampingnya) yang bertindak sebagai nukleofil (Nilai 4)

1 NIM:_________________
5. Reaksi-reaksi dalam metabolisme dapat berlangsung dalam bentuk kerja efektif (energi
bebas), bukan karena aliran kalor. Jelaskan dua jenis gradien kimia yang dapat menghasilkan
kerja efektif. (Nilai 6)

6. Pada reaksi berikut:

Tandai molekul yang bertindak sebagai antioksidan (Nilai 2)

Tandai pula molekul yang bertindak sebagai antireduktan (Nilai 2)

Glikolisis dan glukoneogenesis

7. Tuliskan tiga reaksi kimia (lengkap dengan enzim yang terlibat) yang membedakan glikolisis
dan glukoneogenesis (Nilai 15)

2 NIM:_________________
Siklus asam sitrat
8. Tuliskan tiga reaksi kimia dalam siklus asam sitrat yang menghasilkan NADH (Nilai 15)

9. Mengapa siklus asam sitrat dikelompokkan sebagai jalur amfibolisme? (Nilai 4)

10. Terkait dengan siklus asam sitrat, apa yang dimaksud dengan jalur anaplerotik (Nilai 4)

Metabolisme asam lemak

11. Tuliskan struktur asam dekanoat (C10:0) dan asam deka-5,8-dienoat (C10:2) (Nilai 6)

3 NIM:_________________
12. Tuliskan struktur triasilgliserol: dekanoat-dekanoat-dekanoat (Nilai 4)

13. Hitung jumlah ATP yang dihasilkan dari katabolisme asam dekanoat menjadi karbondioksida
(Nilai 5)

14. Hitung jumlah ATP yang dihasilkan dari katabolisme asam deka-5,8-dienoat menjadi
karbondioksida (Nilai 5)

15. Selain enzim-enzim yang terlibat dalam oksidasi-β, tuliskan enzim-enzim tambahan yang
terlibat dalam katabolisme asam deka-5,8-dienoat (Nilai 4)

Fosforilasi oksidatif
16. Gambarkan sketsa proses transfer elektron dari NADH ke oksigen(Nilai 4)

17. Jelaskan fungsi F0 (fraksi yang terbenam pada membran dalam mitokhondria) pada molekul
komplek ATP sintase (Nilai 4)

18. Mengapa nilai energi NADH sitosol tidak selalu identik dengan nilai energi NADH mitokondria,
sebaliknya nilai energi ATP di sitosol dan di mitokhondria selalu sama? (Nilai 4)

19. Jelaskan efek racun sianida pada rantai respirasi (Nilai 4)

4 NIM:_________________
 PROGRAM STUDI KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

UJIAN METABOLISME DAN INFORMASI GENETIKA (KI-3261)

7 Maret 2014 BUKU TERTUTUP 100 Menit

NAMA : ________________ Tanda Tangan

NIM : ________________

KERJAKAN DI BAGIAN KOSONG PADA LEMBAR INI JUGA.

Metabolisme: konsep dasar dan rancangan

Suatu mekanisme reaksi enzimatis ditunjukkan sebagai berikut:

1. Tuliskan gugus fungsi pada residu katalitik yang bertindak sebagai nukleofil (Nilai 2)
B1:
2. Tuliskan gugus fungsi pada residu katalitik yang bertindak sebagai elektrofil (Nilai 2)
H–B2
3. Tuliskan dua contoh residu asam amino (lebih ditekankan pada gugus fungsi rantai
sampingnya) yang bertindak sebagai elektrofil (Nilai 4)
Asp dan Glu (Rantai samping –COOH); His, Arg, dan Lys (Rantai samping –NH3+); Ser, Thr,
dan Tyr (Rantai samping –OH); dan Cys (Rantai samping –SH)
4. Tuliskan dua contoh residu asam amino (lebih ditekankan pada gugus fungsi rantai
sampingnya) yang bertindak sebagai nukleofil (Nilai 4)
Asp dan Glu (Rantai samping –COO–); His, Arg, dan Lys (Rantai samping –NH2); Ser, Thr, dan
Tyr (Rantai samping –O–); dan Cys (Rantai samping –S–)
5. Reaksi-reaksi dalam metabolisme dapat berlangsung dalam bentuk kerja efektif (energi
bebas), bukan karena aliran kalor. Jelaskan dua jenis gradien kimia yang dapat menghasilkan
kerja efektif. (Nilai 6)
Gradien konsentrasi dan gradien muatan listrik, atau keduanya dikenal sebagai gradien
kemiosmotik
1 NIM:_________________
6. Pada reaksi berikut:

Antioksidan Antireduktan Antireduktan Antioksidan

(untuk reaksi ke kanan) (untuk reaksi ke kiri)

Tandai molekul yang bertindak sebagai antioksidan (Nilai 2)

Tandai pula molekul yang bertindak sebagai antireduktan (Nilai 2)

Glikolisis dan glukoneogenesis

7. Tuliskan tiga reaksi kimia (lengkap dengan enzim yang terlibat) yang membedakan glikolisis
dan glukoneogenesis (Nilai 15)

Siklus asam sitrat

8. Tuliskan tiga reaksi kimia dalam siklus asam sitrat yang menghasilkan NADH (Nilai 15)

2 NIM:_________________
9. Mengapa siklus asam sitrat dikelompokkan sebagai jalur amfibolisme? (Nilai 4)
Siklus asam sitrat dikelompokkan sebagai jalur amfibolisme sebab siklus ini dapat berfungsi
sebagai anabolisme dan katabolisme sekaligus
10. Terkait dengan siklus asam sitrat, apa yang dimaksud dengan jalur anaplerotik (Nilai 4)
Jalur anaplerotik adalah jalur penyelamat siklus asam sitrat

Metabolisme asam lemak

11. Tuliskan struktur asam dekanoat (C10:0) dan asam deka-5,8-dienoat (C10:2) (Nilai 6)
O

C
HO asam dekanoat (C10:0)

C
HO asam deka-5,8-dienoat (C10:2)

12. Tuliskan struktur triasilgliserol: dekanoat-dekanoat-dekanoat (Nilai 4)

O

C
O
O

C
O
O

C
O

13. Hitung jumlah ATP yang dihasilkan dari katabolisme asam dekanoat menjadi karbondioksida
(Nilai 5)
64 ATP

14. Hitung jumlah ATP yang dihasilkan dari katabolisme asam deka-5,8-dienoat menjadi
karbondioksida (Nilai 5)
60 ATP
3 NIM:_________________
15. Selain enzim-enzim yang terlibat dalam oksidasi-β, tuliskan enzim-enzim tambahan yang
terlibat dalam katabolisme asam deka-5,8-dienoat (Nilai 4)
Enoil-KoA isomerase dan Dienoil-CoA reduktase

Fosforilasi oksidatif
16. Gambarkan sketsa proses transfer elektron dari NADH ke oksigen(Nilai 4)

17. Jelaskan fungsi F0 (fraksi yang terbenam pada membran dalam mitokhondria) pada molekul
komplek ATP sintase (Nilai 4)
Fungsi F0 pada molekul kompleks ATP sintase adalah untuk memompa balik H+ dari ruang
antar membran mitokhondria ke dalam matriks mitokhondria

18. Mengapa nilai energi NADH sitosol tidak selalu identik dengan nilai energi NADH mitokondria,
sebaliknya nilai energi ATP di sitosol dan di mitokhondria selalu sama? (Nilai 4)
Nilai energi NADH sitosol tidak selalu identik dengan nilai energi NADH mitokondria karena
sangat bergantung pada sistem pengantarannya yang mengubahnya menjadi FADH2 atau
tetap sebagai NADH. Sebaliknya, nilai energi ATP di sitosol dan di mitokhondria selalu sama
karena memiliki sistem pengantaran yang tidak memerlukan energi.

19. Jelaskan efek racun sianida pada rantai respirasi (Nilai 4)

Racun sianida menghambat kompleks IV pada rantai respirasi sehingga mengakibatkan
pemompaan proton ke luar matriks mitokhondria berkurang. Hal ini mengakibatkan sel
kekurangan energi (ATP).

4 NIM:_________________