Jurnal HPT Volume 2 Nomor 1

Pebruari 2014
ISSN : 2338 - 4336

KEANEKARAGAMAN JAMUR ENDOFIT AKAR KANGKUNG DARAT

(Ipomoea reptans Poir.) PADA LAHAN PERTANIAN ORGANIK DAN
KONVENSIONAL

Rezyta Tri Yuli Hapsari, Syamsuddin Djauhari, dan Abdul Cholil

Jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan, Fakultas Pertanian, Universitas Brawijaya,

Jl. Veteran, Malang 65145.

ABSTRACT

The research aimed to know diversity of endophytic fungi on kale root (Ipomoea
reptans Poir.) in organic and conventional farming system. The research was conducted
from February to August 2013. Sampling kale root was organic and conventional field
in Cemorokandang village, Kedungkandang sub district, Malang. The isolation
endophytic fungi of kale root in Laboratory of Phytopathology part Micology,
Department of Plant Pest and Disease, Faculty of Agriculture Brawijaya University,
Malang. The research was carried out by using exploration and compared between
organic and conventional field. The result showed that the endophytic fungi on kale root
from organic (45 isolates) level more than conventional field (41 isolates). Endophytic
fungi from organic and conventional field consist of 18 genus i.e. Acremonium sp.,
Aspergillus sp., Botryotrichum sp., Botrytis sp., Cephalosporium sp., Colletotrichum
sp., Curvularia sp., Cylindrocephalum sp., Fusarium sp., Helicosporium sp.,
Hyalodendron sp., Mastigosporium sp., Mycotypha sp., Nigrospora sp., Paecilomyces
sp., Passalora sp., Torula sp., Trichoderma sp. Diversity index of endophytic fungi on
kale root from organic (3,807) and conventional field (3,122) were grouped to high
diversity. Uniformmity index of endophytic fungi from organic and conventional field
were grouped to high uniformmity (1,089 and 0,947) showed that stability of
community was good. Domination index of endophytic fungi from organic and
conventional field were grouped to low domination (0,044 and 0,055). Fusarium sp. and
Cephalosporium sp. were found in both of farming system.

Keywords: Diversity, endophytic fungi, root, kale, organic farming system

ABSTRAK

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan keanekaragaman jamur endofit

akar kangkung darat (Ipomoea reptans Poir.) yang dibudidayakan dengan sistem
pertanian organik dan konvensional. Penelitian dilaksanakan pada bulan Februari-
Agustus 2013. Pengambilan contoh akar kangkung darat pada lahan pertanian organik
dan konvensional di Kelurahan Cemorokandang, Kecamatan Kedungkandang, Malang.
Isolasi jamur endofit akar kangkung darat dilaksanakan di Laboratorium Penyakit
Tanaman bagian Mikologi, Jurusan HPT FP-UB, Malang. Metode yang digunakan
dalam penelitian ini yakni metode eksplorasi dan komparasi antara lahan pertanian
organik dengan konvensional. Hasil penelitian dapat diketahui bahwa jamur endofit
yang ditemukan pada akar kangkung darat dari lahan pertanian organik (45 isolat) lebih
banyak daripada lahan konvensional (41 isolat). Jamur endofit yang diperoleh dari lahan
pertanian organik dan konvensional sebanyak 18 genus antara lain Acremonium sp.,
Aspergillus sp., Bo-tryotrichum sp., Botrytis sp., Cephalosporium sp., Colletotrichum

1
 Hapsari et al, Keanekaragaman Jamur Endofit Kangkung…

sp., Curvularia sp., Cylindrocephalum sp., Fusarium sp., Helicosporium sp.,

Hyalodendron sp., Mastigosporium sp., Mycotypha sp., Nigrospora sp., Paecilomyces
sp., Passalora sp., Torula sp., Trichoderma sp. Nilai indeks keanekaragaman jamur
endofit akar kangkung darat pada lahan pertanian organik (3,807) dan konvensional
(3,122) yang termasuk dalam kriteria keanekaragaman tinggi. Indeks keseragaman
jamur endofit akar pada lahan pertanian organik (1,089) dan konvensional (0,947)
termasuk dalam keseragaman tinggi. Nilai indeks dominansi jamur endofit akar pada
lahan pertanian organik dan konvensional < 0,5 sebesar 0,044 dan 0,055 termasuk
dalam kriteria rendah. Genus jamur endofit dominan yang terletak pada lahan pertanian
organik dan lahan konvensional yaitu genus Fusarium sp. dan Cephalosporium sp.

Kata kunci: Keanekaragaman, jamur endofit, akar, kangkung darat, pertanian organik

PENDAHULUAN meningkatkan kesehatan tanah dan

Kangkung darat (Ipomoea reptans
Poir.) termasuk jenis sayuran yang umum
dibudidayakan oleh masyarakat secara
komersial. Di Indonesia kangkung dapat
dibudidayakan dengan sistem pertanian
organik maupun konvensional. Menurut
Purwantisari et al. (2009) pertanian
organik merupakan sistem manajemen
produksi terpadu yang menghindari
penggunaan pupuk buatan, pestisida dan
hasil rekayasa genetik yang dapat
menekan pencemaran tanah, air dan udara
yang dapat membahayakan bagi makhluk
hidup. Sedangkan ciri pertanian
konvensional menurut Wijayanti (2009)
yaitu dengan menambahkan bahan
anorganik dalam proses budidaya,
sehingga dampak terhadap pencemaran
lingkungan semakin besar. Terjadinya
kerusakan dan pencemaran lingkungan
menyebabkan tanaman rentan akan
penyakit.
Penggunaan sistem pertanian organik
dan konvensional akan berpengaruh pada
komponen ekosistem, misalnya
keberadaan jamur yang terdapat di
jaringan perakaran tanaman (jamur
endofit) (Hartanto, 2008). Berkurangnya
keragaman organisme akan berdampak
pada ketidakseimbangan dalam ekosistem.
Menurut Norris et al. (2003) keragaman
organisme dalam ekosistem bermanfaat
dalam menentukan stabilitas ekosistem,
produktivitas tanaman. Keanekaragaman
mikroorganisme sangat penting untuk
dikaji lebih dalam, salah satunya keaneka-
ragaman jamur endofit pada akar tanaman
kangkung darat. Menurut Prihatiningtias
et al. (2006) jamur endofit merupakan
mikroorganisme yang tumbuh dalam
jaringan tanaman. Jamur endofit memiliki
hubungan simbiosis mutualisme antara
jamur endofit dengan tanaman inang.
Jamur endofit dapat melindungi tanaman
inang dari serangan pathogen dengan
senyawa yang dikeluarkan oleh jamur
endofit. Senyawa yang dikeluarkan berupa
senyawa metabolit sekunder yang
merupakan senyawa bioaktif dan dapat
berfungsi untuk membunuh pathogen.
Sedangkan tanaman inang menyediakan
nutrisi yang dibutuhkan oleh jamur
endofit untuk melengkapi siklus hidupnya.
Menurut Prihatiningtias et al. (2006)
jamur endofit terdapat pada bagian akar.
Pada morfologi tanaman, akar merupakan
organ penting tanaman yang memiliki
kemampuan dalam menopang tubuh
tanaman agar tetap kokoh. Apabila akar
tanaman mengalami gangguan maka akan
mempengaruhi kondisi bagian tubuh
tanaman yang lain sehingga tanaman tidak
tumbuh secara normal. Oleh karena itu,
untuk mengetahui keane-karagaman jamur
endofit pada akar kangkung darat di lahan
pertanian organik dan konvensional perlu
dilakukan penelitian. Sehingga dapat

2
 Jurnal HPT Volume 2 Nomor 1
memberikan informasi mengenai per-
bedaan keanekaragaman jamur endofit
yang terdapat di akar tanaman kang-kung
darat di lahan pertanian organik dan
konvensional.
BAHAN DAN METODE
Waktu dan Tempat
Waktu pelaksanaan penelitian pada
bulan Februari sampai Agustus 2013.
Penelitian dilaksanakan di Laborato-rium
Penyakit Tanaman bagian Mikologi,
Jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan,
Fakultas Pertanian UB, Malang. Tempat
pengambilan sampel akar kangkung darat
dilakukan di Kel. Cemorokandang,
Kec.Kedungkandang, Kota Malang.
Metode Penelitian
Penelitian menggunakan metode
eksplorasi dan komparasi. Eksplorasi
jamur endofit diambil dari akar kangkung
darat sehat pada lahan sistem pertanian
organik dan konvensional. Hasil
eksplorasi dibandingkan dengan
menggunakan metode komparasi untuk
mengetahui perbedaan keanekaragaman
jamur endofit akar kangkung darat dengan
sistem pertanian organik dan
konvensional.
Eksplorasi Jamur Endofit
Pengambilan sampel akar kangkung
Pengambilan sampel akar sehat
dilakukan 2 minggu sekali (14, 28, 42 hst)
pada lahan dengan sistem pertanian
organik dan konvensional menggunakan
metode sistematis (Systematic sampling),
yaitu pada garis diagonal tanaman,
sehingga diperoleh 5 tanaman sampel
(Gambar 1).
Gambar 1. Ilustrasi petak pengambilan contoh
tanaman; : tempat pengambilan
contoh.
3
Pebruari 2014
Isolasi Jamur Endofit
Kontaminasi dari jamur luar
diharapkan tidak terjadi pada saat isolasi.
Hal ini dikarenakan isolasi jamur endofit
merupakan isolasi jamur yang berasal dari
dalam sistem jaringan tumbuhan (Septia,
2012). Metode yang digunakan yaitu
metode pencucian, mencuci bagian
permukaan sampel akar tanaman
kangkung darat agar steril, sehingga
diharapkan jamur yang tumbuh
merupakan jamur yang hanya berasal dari
dalam jaringan akar.
Tahap isolasi dilakukan di laminar
air flow cabinet. Tahapan awal isolasi
yaitu menyiapkan sampel akar tanaman
kangkung darat yang sehat dan di lakukan
pencucian dengan air mengalir hingga
bersih dari tanah, kemudian di keringkan
diatas tissue. Setiap sampel tanaman sehat
dilakukan pengambilan sampel akar
dengan memotong akar pada pangkal
batang menggunakan gunting (Gambar 2).
Kemudian potong an akar pada pangkal
batang diambil dengan pinset yang sudah
disterilkan menggunakan bunsen dan
dilakukan perendaman kedalam larutan
NaOCL 5% (1 menit), alkohol 70% (1
menit). Setelah itu dibilas 2 kali dengan
aquadest steril (1 menit) lalu akar
dikeringkan diatas tissue steril.
Setiap akar tanaman dipotong ± 1 cm
dengan kondisi aseptis, kemudian hasil
potongan diambil secara acak dan ditanam
pada cawan petri berisi media PDA (d=9
cm). Selanjutnya dibungkus dengan
plastik wrapping dan dilakukan
pengamatan selama 7 hari. Kemudian
pada aquadest bilasan terakhir di ambil 1
ml dan diisolasikan pada media PDA baru
lainnya, perlakuan ini digunakan sebagai
kontrol. Kontrol digunakan sebagai
penentu dan memastikan jamur yang
tumbuh dari sampel akar yang telah dicuci
berasal dari jamur endofit atau bukan,
sehingga hasil yang dicapai mendekati
kebenaran.
 Hapsari et al, Keanekaragaman Jamur Endofit Kangkung…

Indeks keanekaragaman dihitung

dengan kriteria menurut Brower dan Zar
(1977) sebagai berikut (Tabel 1):

Tabel 1. Kriteria indeks keanekaragaman

Gambar 2. Pemotongan akar pada Shannon
pangkal batang (Sumber: Nilai
Kriteria
dokumentasi peneliti) Indeks
keanekaragaman rendah,
Pengamatan dan Identifikasi <1 penyebaran jumlah individu
Pengamatan dilakukan secara tiap jenis rendah
makroskopis dan mikroskopis terhadap keanekaragaman sedang,
isolat jamur endofit yang telah dipuri- 1-3 penyebaran jumlah individu
fikasi atau pemurnian kemudian hasilnya tiap jenis sedang
digunakan untuk identifikasi. Pengamatan keanekaragaman tinggi,
makroskopis meliputi warna, bentuk, >3 penyebaran jumlah individu
pertumbuhan dan tekstur koloni (cm/hari). tiap jenis tinggi
Pengamatan makroskopis dilakukan
selama 7 hari. Sedangkan pengamatan Indeks Keseragaman (E) (Ludwig and
mikroskopis dilakukan pada pengamatan Reynold, 1988)
akhir (5-7 hari) menggunakan mikroskop Indeks keseragaman digunakan untuk
meliputi hifa bersekat atau tidak, warna mengukur keseimbangan komu-nitas. Hal
dan pertumbuhan hifa, ada tidaknya ini didasarkan pada ukuran kesamaan
konidia, warna dan bentuk konidia. jumlah individu antar spesies dalam suatu
Kemudian hasil pengamatan di iden- komunitas. Rumus indeks keseragaman
tifikasi berdasarkan ciri makroskopis sebagai berikut:
(bentuk, warna, perkembangan koloni)
dan mikroskopis (konidiofor, bentuk
misselium, bentuk spora). Identifikasi Ket.: E = indeks keseragaman, H’ = indeks
dilakukan menggunakan buku identi- keanekaragaman Shannon, s = jumlah
fikasi yaitu Ilustrated Genera of Imperfect genus/spesies
Fungi (Barnett and Hunter, 1960).
Nilai indeks keseragaman berkisar
Analisa Data antara 0-1 dengan kriteria menurut
Indeks Keanekaragaman (H’) Shannon Brower dan Zar (1977) sebagai berikut
(Odum, 1993) (Tabel 2):
Indeks keanekaragaman digunakan
Tabel 2. Kriteria Indeks Keseragaman
untuk menghitung keanekaragaman jamur
endofit akar kangkung darat pada lahan Nilai indeks Kondisi Komunitas
pertanian organik dan konvensional. 0,00<E< 0,50 keseragaman kecil,
Rumus indeks keaneka-ragaman sebagai komunitas tertekan
berikut: 0,50<E< 0,75 keseragaman sedang,
komunitas labil
0,75<E< 1,00 keseragaman tinggi,
Ket.: H’= indeks keanekaragaman, S= jumlah komunitas stabil
spesies, ni = jumlah individu jenis ke i, N = Indeks dominansi (C) (Odum, 1993)
jumlah total individu Indeks dominasi jenis digunakan
untuk mengetahui adanya dominasi jenis

4
 Jurnal HPT Volume 2 Nomor 1 Pebruari 2014

jamur endofit pada suatu komunitas. diperoleh tingkat keane-karagaman

Indeks dominasi dihitung dengan
menggunakan rumus sebagai berikut:
Ket.: C = indeks dominasi Simpson, ni = jumlah
individu jenis ke i, N = jumlah total
individu
Nilai indeks keseragaman berkisar
antara 0-1 dengan kriteria menurut
Hamsiah (2006) sebagai berikut (Tabel 3):
Tabel 3. Kriteria Indeks Dominansi
Nilai indeks Kriteria
0,00 < C ≤ 0,50 rendah
0,50 < C ≤ 0,75 sedang
0,75 < C ≤ 1,00 tinggi
HASIL DAN PEMBAHASAN
Keanekaragaman Jamur Endofit Akar
Kangkung Darat pada Lahan Pertanian
Organik dan Konven-sional
Berdasarkan hasil isolasi dan
identifikasi jamur endofit pada akar
kangkung darat (Ipomoea reptans Poir.) di
lahan pertanian organik dan konvensional
organik yang berbeda dengan total
keseluruhan 86 isolat. Keanekaragaman
jamur endofit akar kangkung darat pada
lahan pertanian organik lebih tinggi
daripada lahan konvensional (Tabel 4).
Analisis Data
Untuk mengetahui perbandingan
perbedaan keanekaragaman jamur endofit
akar kangkung darat pada lahan pertanian
organik dan konvensional yakni
menggunakan metode perhitung-an
keanekaragaman, keseragaman dan
dominasi.
Penggunaan cara pengelolaan lahan
yang berbeda akan mem-pengaruhi tingkat
keanekaragaman jamur endofit. Suganda
et al. (2007) menyebutkan bahwa
keberadaan jamur endofit serta variasi
jenis isolatnya dipengaruhi oleh jenis
tanaman inang, bagian tanaman dan
lokasi. Ber-dasarkan hasil isolasi dan
identifikasi diperoleh data perhitungan
dengan menggunakan indeks
keanekaragaman (H’) Shannon,
keseragaman (E), dan dominasi (D). Hasil
perhitungan disajikan pada Tabel 5.

Tabel 4. Keanekaragaman Jamur Endofit Akar Kangkung Darat pada Lahan Pertanian
Organik dan Konvensional
∑ Spesies ∑ Spesies
No. Genus No. Genus
K O K O
1 Acremonium sp. 1 2 11 Hyalodendron sp. 0 1
2 Aspergillus sp. 1 2 12 Mastigosporium sp. 1 0
3 Botryotrichum sp. 1 0 13 Mycotypha sp. 2 0
4 Botrytis sp. 1 0 14 Nigrospora sp. 2 1
5 Cephalosporium sp. 6 5 15 Paecilomyces sp. 1 0
6 Colletotrichum sp. 2 1 16 Passalora sp. 1 0
7 Curvularia sp. 0 1 17 Torula sp. 0 2
8 Cylindrocephalum sp. 0 1 18 Trichoderma sp. 1 0
9 Fusarium sp. 3 12 19 Tidak teridentifikasi 4 4
10 Helicosporium sp. 0 1
∑ Koloni 27 33
∑ Genus 14 12
Keterangan: K = konvensional, O = organik (Sumber: hasil penelitian)
Tabel 5. Analisis Data Jamur Endofit Akar Kangkung Darat

5
 Hapsari et al, Keanekaragaman Jamur Endofit Kangkung…
Nilai Indeks
No. Lahan
H'
Pertanian
1 3.807
Organik
2 Konvensional 3.122
Total 6.929
Rerata 3.465
Ket.: H' = indeks keanekaragaman E = indeks keseragaman, C = indeks dominansi (Sumber:
hasil penelitian)
Indeks Keanekaragaman (H’) Jamur
Endofit Akar Kangkung Darat pada
Lahan Pertanian Organik dan Kon-
vensional
Hasil perhitungan indeks keaneka-
ragaman jamur endofit akar kangkung
darat pada lahan pertanian organik dan
konvensional dapat di lihat pada Tabel 5.
Berdasarkan hasil perhitungan indeks
keanekaragaman jamur endofit akar
kangkung pada lahan pertanian organik
dan konvensional dapat diketahui bahwa
tingkat keaneka-ragaman jamur endofit
lebih besar pada lahan pertanian organik
dibandingkan dengan lahan konvensional.
Nilai indeks keanekaragaman jamur
endofit akar kangkung pada lahan
pertanian organik (3,807) dan
konvensional (3,122) termasuk dalam
kriteria keane-karagaman tinggi dengan
penyebaran jumlah individu tiap jenis
tinggi. Hal ini sesuai dengan Brower dan
Zar (1977) yang menyebutkan bahwa nilai
indeks < 1 termasuk dalam kriteria ke-
anekaragaman rendah dengan penye-baran
jumlah individu tiap jenis rendah. Nilai
indeks 1-3 termasuk dalam kriteria
keanekaragaman sedang de-ngan
penyebaran jumlah individu tiap jenis
sedang. Nilai indeks > 3 termasuk dalam
kriteria keanekaragaman tinggi dengan
penyebaran jumlah individu tiap jenis
tinggi.
Tingkat keanekaragaman jamur
endofit akar kangkung darat pada lahan
pertanian organik lebih besar daripada
lahan konvensional, hal ini diduga karena
pengaruh penerapan aspek budidaya yang
berbeda sehingga menimbulkan pengaruh
∑ ∑ ∑
E C Genus Spesies Koloni
1.089 0.044 12 33 45
0.947 0.055 14 27 41
2.036 0.099 26 60 86
1.018 0.050 13 30 43
terhadap kebe-radaan jamur endofit antara
lahan pertanian organik dan konvensional.
Tingkat keanekaragaman jamur endofit
dipengaruhi oleh beberapa faktor.
Suganda et al. (2007) menyebutkan bahwa
jenis tanaman inang, lokasi dan bagian
tanaman dapat mempengaruhi keberadaan
jamur endofit.
Salah satu faktor yang dapat
mempengaruhi keberadaan jamur endofit
yakni aspek budidaya yang merupakan
proses dalam meningkatkan produksi
suatu tanaman misalnya penggunaan
pupuk dan pestisida. Pada lahan
konvensional penerapan pupuk dan
penyemprotan pestisida sintetis sebagai
pengendalian organisme pengganggu
tanaman lebih intensif dibandingkan pada
lahan pertanian organik. Pada saat
pengolahan lahan di lahan pertanian
organik dan konven-sional menggunakan
pupuk kandang, namun untuk pemupukan
selanjutnya berbeda. Pada lahan pertanian
organik pemupukan (pupuk kandang)
diberikan pada saat pengolahan lahan saja
kemudian 2 minggu setelah tanam
menggunakan pupuk hayati, sedangkan
pada lahan konvensional pemupukan
mengguna-kan pupuk urea dilakukan 3
kali yakni pada saat umur 7, 21 dan 35 hst
(hari setelah tanam). Pemupukan dan
penyemprotan pestisida merupakan usaha
yang dapat mempengaruhi pertumbuhan
tanaman dan keberadaan jamur endofit
pada tanaman. Irmawan (2007)
menyebutkan bahwa ber-dasarkan hasil
survei petani yang tidak melakukan
penyemprotan pestisida ternyata
keragaman dan kelimpahan cendawan
6
 Jurnal HPT Volume 2 Nomor 1
endofit sangat tinggi. Kandungan zat
kimia pada pupuk maupun pestisida
berpengaruh terhadap metabolisme
tanaman. Irmawan (2007) menyebutkan
bahwa jamur endofit merupakan jamur
yang hidup dalam jaringan tanaman,
sehingga tidak terlepas dari pengaruh
metabolisme inang tanaman. Hal ini dapat
terlihat jelas pada histogram (Gambar 3).
Gambar 3. Indeks Keanekaragaman
Jamur Endofit Akar Kangkung
Darat (Sumber: hasil penelitian)
Indeks Keseragaman (E) Jamur
Endofit Akar Kangkung Darat pada
Lahan Pertanian Organik dan
Konvensional
Hasil perhitungan indeks kesera-
gaman jamur endofit akar kangkung darat
pada lahan pertanian organik dan
konvensional dapat di lihat pada Tabel 5.
Berdasarkan hasil perhitungan pada Tabel
5, menunjukkan bahwa tingkat
keseragaman jamur endofit pada lahan
pertanian organik lebih tinggi diban-
dingkan dengan konvensional. Hal ini
berdasarkan perhitungan diperoleh total
indeks keseragaman jamur endofit pada
lahan pertanian organik sebesar 1,089,
sedangkan indeks keseragaman jamur
endofit pada lahan konvensional diperoleh
sebesar 0,947. Hal ini dapat terlihat jelas
pada histogram (Gambar 4).
7
Pebruari 2014
Gambar 4. Indeks Keseragaman Jamur
Endofit Akar Kangkung Darat
(Sumber: hasil penelitian)
Berdasarkan histogram pada Gambar
4, penerapan budidaya kang-kung darat
dengan sistem pertanian organik (1,089)
dan konvensional (0,947) termasuk dalam
kriteria keseragaman tinggi dengan
komunitas stabil. Hal ini sesuai dengan
Brower dan Zar (1977) yang menyebutkan
bahwa apabila nilai indeks keseraga-man
berkisar antara 0,00-0,50 termasuk dalam
kriteria keseragaman rendah dengan
komunitas tertekan. Nilai indeks
keseragaman diantara 0,50-0,75 termasuk
dalam kriteria keseragaman sedang
dengan komunitas labil. Nilai indeks
keseragaman diantara 0,75-1,00 termasuk
dalam kriteia keseragaman tinggi dengan
komunitas stabil.
Indeks Dominansi (C) Jamur Endofit
Akar Kangkung Darat pada Lahan
Pertanian Organik danKonvensional
Hasil perhitungan indeks dominasi
jamur endofit akar kangkung darat pada
lahan pertanian organik dan konvensional
dapat di lihat pada Tabel 5. Berdasarkan
Tabel 5 menunjukkan bahwa tingkat
dominansi jamur endofit pada lahan
pertanian konvensional lebih besar dari
pada tingkat dominansi jamur endofit
pada lahan pertanian organik. Hasil
perhitungan indeks dominansi didapatkan
pada lahan pertanian organik (0,044) dan
konvensional (0,055). Hal ini dapat
terlihat jelas pada histogram (Gambar 5).
 Hapsari et al, Keanekaragaman Jamur Endofit Kangkung…
Gambar 5. Indeks Dominansi Jamur
Endofit Akar Kangkung Darat
(Sumber: hasil penelitian)
Nilai indeks dominasi pada lahan
pertanian organik dan konvensional dapat
dimasukkan kedalam kriteria dominasi
rendah karena nilai indeks dominasi jamur
endofit akar kangkung darat < 0,5
(Hamsiah, 2006). Hal ini sesuai dengan
Hamsiah (2006) yang menyebutkan
bahwa apabila nilai indeks dominansi
diantara 0,00-0,50 termasuk dalam kriteria
rendah, diantara 0,50-0,75 termasuk
dalam kriteria sedang, dan diantara 0,75-
1,00 termasuk dalam kriteria tinggi. Hal
ini dapat dilihat pada Gambar 6.
Hasil isolasi dan identifikasi jamur
endoft akar kangkung darat yang
ditemukan pada lahan pertanian organik
dan konvensional diperoleh genus yang
Gambar 6. Indeks Dominansi Genus Jamur Endofit Akar Kangkung Darat
(Sumber: hasil penelitian)
8
dominan. Berdasarkan Gambar 6 terlihat
bahwa jamur endofit akar kangkung darat
yang dominan yakni genus Fusarium sp.
dan Cephalosporium sp. Jamur endofit
tersebut diduga memiliki kemampuan
dalam beradaptasi dengan kondisi
tanaman inangnya (Larran et al, 2002).
Bills (1996) menyebutkan bahwa genus
Fusarium merupakan jamur endofit yang
memiliki kemampuan dalam tumbuh cepat
maupun menyebar secara sistemik dalam
suatu jaringan tanaman.
Istikorini (2005) menyebutkan bahwa
jamur mampu menjadi agens antagonis
yang baik untuk pengendalian hayati
apabila jamur tersebut memiliki
kemampuan dalam mengkolonisasi
jaringan tanaman dan berkompetisi
dengan mikroorganisme lain. Irmawan
(2007) menyebutkan bahwa jamur
Cephalosporium menghasilkan antibiotik
sefalosporium yang dapat menghambat
pertumbuhan mikro-organisme dengan
cara menghambat sintesis dinding sel.
Sehingga genus Fusarium sp. dan
Cephalosporium sp. yang dominan pada
lahan pertanian organik diduga mampu
berperan dalam penekanan penyakit.
 Jurnal HPT Volume 2 Nomor 1
KESIMPULAN
1. Keanekaragaman jamur endofit akar
kangkung darat pada lahan pertanian
organik lebih tinggi daripada lahan
konvensional. Jamur endofit akar
kangkung yang ditemukan pada lahan
pertanian organik dan konvensional
se-banyak 18 genus antara lain
Acremonium sp., Aspergillus sp.,
Botryotrichum sp., Botrytis sp.,
Cephalosporium sp., Colletotri-chum
sp., Curvularia sp., Cylin-
drocephalum sp., Fusarium sp.,
Helicosporium sp., Hyalodendron
sp.,Mastigosporium sp.,Mycotypha
sp., Nigrospora sp., Paecilomyces sp.,
Passalora sp., Torula sp., dan
Trichoderma sp.
2. Jamur endofit akar kangkung yang
hanya ditemukan pada lahan
pertanian organik sebanyak 5 genus
antara lain Curvularia sp.,
Cylindrocephalum sp., Helicos-
porium sp., Hyalodendron sp., Torula
sp. Sedangkan jamur endofit yang
hanya ditemukan pada lahan
konvensional sebanyak 7 genus antara
lain Botryotrichum sp., Botrytis sp.,
Mastigosporium sp., Mycotypha sp.,
Paecilomyces sp., Passalora sp.,
Trichoderma sp.
3. Nilai indeks keanekaragaman ja-mur
endofit akar kangkung darat pada
lahan pertanian organik (3,807) dan
konvensional (3,122) yang termasuk
dalam kriteria keanekaragaman
tinggi. Indeks keseragaman jamur
endofit akar pada lahan pertanian
organik dan konvensional termasuk
dalam keseragaman tinggi yakni
1,089 dan 0,947.
4. Nilai indeks dominansi jamur endofit
akar pada lahan pertanian organik
(0,044) dan konvensional (0,055)
termasuk kriteria rendah. Genus
jamur endofit dominan yang terletak
pada lahan pertanian organik dan
9
Pebruari 2014
lahan konvensional yaitu genus
Fusarium sp. dan Cephalosporium sp.
DAFTAR PUSTAKA
Badan Pusat Statistik. 2012. Produksi
Sayuran di Indonesia.
http://www.bps.go.id/tab_
sub/view.php. Di-akses tanggal 6
Februari 2013.
Bills, G. F. 1996. Isolation and Analysis
of Endhophitic Fungal Communies
from Woody Plants. Di dalam: Reslin
SC, Carris LM (eds.). Endophytic
Fungi in Grasses and Woody Plant:
Systematic, ecology and Evolution.
APS Press. p: 31-66
Brower, J. E., and J. H. Zar. 1977. Field
and Laboratory Methods for General
Ecology. WM. J. Brown Company
Publisher. Dubuque. Iowa. p: 94.
Hamsiah, 2006. Potensi Jenis Kekerangan
Yang Berasosiasi Dengan Padang
Lamun di Pulau Pannikiang
Kabupaten Barru. Fakultas Perikanan
dan Ilmu Kelautan UMI. Jurnal
Protein. Makasar. Vol.13 No.2
Hartanto, E. 2008. Keragaman Jamur
Endofit Jaringan Akar Tanaman Apel
(Malas sylvestris Mill.) pada lahan
budidaya secara PHT dan
konvensional Di Poncokususmo,
Malang. Fakultas Pertanian UB.
Malang.
Irmawan, D. E. 2007. Kelimpahan
Keragaman Cendawan Endofit Pada
Beberapa Varietas Padi Di Kuningan,
Tasikmalaya dan Subang, Jawa Barat.
Fakultas Pertanian, IPB. Bogor.
Istikorini, Y. 2005. Eksplorasi Cendawan
Endofit dari Tanaman Cabai
(Capsicum annum L.) dan Teki
(Cyperus rotundus). IPB. Bogor
Larran S, Rollan C, Angeles HB, Alippi
HE, and Urrutia MI. 2002. Nota
 Hapsari et al, Keanekaragaman Jamur Endofit Kangkung…

Corta: Endophytic fungi in healty Septia, E. D. 2012. Potensi Antagonis

soybean leaves. Prod. Prot. Veg 17.
p: 173-178
Ludwig, J. A., and J. F. Reynolds. 1988.
Statistical Ecology: A Primer on
Methods and Computing. John wiley
and sons. Inc. Canada
Jamur Endofit dalam Jaringan Akar,
Batang, dan Buah pada Dua Varietas
Tanaman Managga terhadap Jamur
Patogen Colletotricum
gleosporioides. Fakultas Pertanian
UB. Malang.

Norris, R., C.E Caswell and M. Kogan. Suganda, Tarkus, N. Istifadah dan
2003. Concept in integrated pest Hersanti. 2007. Jamur Endofit:
management. Prentice Hall. New Keanekaragaman, Kolonisasi dan
Jersey. p: 586 Peranannya terhadap Berbagai
Tanaman Sayuran dan Pangan.
Odum, P. E. 1993. Dasar-Dasar Ekologi. Laporan Penelitian. Fakultas
Edisi Ketiga. Gadjah Mada University Pertanian Universitas Padjajaran.
Press. Yogyakarta. p: 179.
Tjitrosoepomo, G. 2007. Morfologi
Prihatiningtias, W. dan M. S. H. Tumbuhan. Gadjah Mada University
Wahyuningsih. 2006. Prospek Press. Yogyakarta.
Mikroba Endofit Sebagai Sumber
Wijayanti, R. 2009. Strategi
Senyawa Bioaktif. Fakultas Farmasi
Pengembangan Usaha Sayuran
UGM, Yogyakarta. Fakultas
Organik (Studi Kasus: Kelompok
Kedokteran UGM, Yogyakarta.
Tani Putera Alam Desa Sukagalih,
Purwantisari, S. dan R. B. Hastuti. 2009. Kecamatan Megamendung,
Isolasi dan Identifikasi Jamur Kabupaten Bogor). Skripsi.
Indigenous Rhizozfer Tanamam Departemen Agribisnis, Fakultas
Kentang dari Lahan Pertanian Ekonomi dan Manajemen, IPB.
Kentang Organik di Desa Pakis, Bogor.
Magelang. BIOMA. Vol. 11 No. 2 p:
45-53.

10