Professional Documents
Culture Documents
FARMACEUTSKI FAKULTET
Ena Muhamedović
DIPLOMSKI RAD
Široka pojava bakterija otpornih na antibiotike i usporavanje otkrivanja novih klasa antibiotika
smatra se ozbiljnim javnozdravstvenim problemima. Prekomjerna upotreba antibiotika tokom
dugog razdoblja omogućila je zaraznim organizmima da se prilagode antibioticima i zauzvrat,
smanji njihovu efikasnost.
Naknadno širenje otpornih sojeva bakterija od osobe do osobe ili sa animalnih izvora u okolišu,
kao što su stoka ili hrana za životinje tretirana antibioticima sličnim onima korištenih za liječenje
ljudskih infekcija, bio je glavni faktor u proširenju rezistencije na antibiotike (Ansari 2015; CDC
2018).
Zbog gubitka efikasnosti mnogih antibiotika, istraživači su pod pritiskom da identificiraju nove
vrste terapijskih molekula i strategije. Iz perspektive kvalitete i sigurnosti hrane, pojava novih
patogena, diverzifikacija izvora opskrbe i novije prehrambene navike potrošača koji se sve više
odlučuju za svježije i 'prirodnije' prehrambene proizvode, bez konzervansa i soli, jesu globalni
izazovi (Farber 2016).
The widespread emergence of antibiotic-resistant bacteria and the slowdown in the discovery of
new classes of antibiotics are considered serious public health problems. Excessive use of
antibiotics over a long period of time has allowed infectious organisms to adapt to antibiotics
and, in turn, reduce their effectiveness.
Subsequent spread of resistant strains of bacteria from person to person or from animal sources
in the environment, such as livestock or animal feed treated with antibiotics similar to those used
to treat human infections, has been a major factor in expanding antibiotic resistance (Ansari
2015; CDC 2018) .
Due to the loss of efficacy of many antibiotics, researchers are under pressure to identify new
types of therapeutic molecules and strategies. From the perspective of food quality and safety,
the emergence of new pathogens, diversification of supply sources and new eating habits of
consumers who are increasingly opting for fresher and more ‘natural’ food products, without
preservatives and salt, are global challenges (Farber 2016).
Therefore, in order to ensure the quality and safety of food products, maintain competition
between farms, and limit the use of antibiotics and the spread of gene resistance, it is necessary
to find substitutes for chemical additives, salt and antibiotics. Advances in bacteriocin
identification and characterization have sparked interest in the use of these molecules as novel
food additives or as therapeutic agents.
Sadržaj
1.UVOD .....................................................................................................................................6
4.3.1 Bakteriocini bakterija mliječne kiseline u liječenju humanih urinarnih infekcija ....... 27
ZAKLJUČAK ........................................................................................................................... 35
Literatura .................................................................................................................................. 36
1.UVOD
Bakteriocini su prvi put otkriveni prije gotovo 100 godina i otkriveno je da ih proizvode mnoge
vrste bakterija i archaea (Baquero F. Moreno F. 1984.). Sastoje se od heterogene obitelji malih
ribosoma, sintetizirane proteinske molekule s jakim antimikrobnim djelovanjem. Ove molekule
se uglavnom sintetiziraju kao nebiološki aktivni prekursori peptida koji sadrže N-terminalnu
vodeću sekvencu.
Ovi antimikrobni peptidi imaju bakteriostatski ili baktericidni spektar djelovanja koji je
uglavnom usmjeren protiv bakterija vezanih uz proizvodni soj i u rjeđim slučajevima protiv šireg
spektra nepovezanih skupina bakterije. Ćelije koje proizvode bakteriocin obično postavljaju
mehanizme odbrane kako bi spriječili da budu ubijeni vlastitim bakteriocinima, bilo
sintetiziranjem samoimuniteta proteina ili korištenjem efluks pumpi, ili korištenjem oba sistema.
(Baquero F. Moreno F. 1984.)
Termin bakteriocini prvi put je predložen od strane Tagg i sar. (1976), i definisani su kao
proteinska jedinjenja sposobna da inhibiraju rast bliskih bakterija, ili bakterija iste ekološke niše.
Prvi podaci o bakteriocinima zabilježeni su u radu sa Gram-negativnim bakterijama, tačnije sa
Eshcerichia coli i nazvani su kolicini. (Cotter, P. D., Ross, R. P., & Hill, C. 2013.)
Slika 1: Struktura membranski vezanog kolicina u otvorenom (gore) I zatvorenom (dole) peptidnom
lancu. Crvene tačke označavaju histidin
6
Osnovna razlika bakteriocina Gram-pozitivnih bakterija i Gram-negativnih bakterija je u
mehanizmu transporta bakteriocina iz bakterijske ćelije. Takođe, u Gram-pozitivnim bakterijama
sinteza i ekspresija bakteriocina je pod regulacijom specifičnih gena, dok su bakteriocini Gram-
negativnih bakterija pod uticajem ćelije domaćina. (Cotter, P. D., Ross, R. P., & Hill, C. 2013.)
Do danas, bakteriocini su pronađeni skoro u svakoj bakterijskoj vrsti.„Gotovo 99% svih bakterija
mogu sintetisati makar jedan bakteriocin, jedini razlog zašto ga nismo našli je zato što ga nismo
ni tražili“ (Klaenhammer, 1988). Diverzitet i broj bakteriocina ukazuju na njihovu ozbiljnu ulogu
kao antimikrobnih jedinjenja.
Bakteriocini se sve češće pominju kao zamjena za antibiotike ili dopuna antibiotskoj terapiji.
Antibiotici i bakteriocini se razlikuju u tri ključne karakteristike:
7
2. OPŠTE KARAKTERISTIKE BAKTERIOCINA
2.1 Bakteriocini
Iako bakteriocini imaju antibiotska svojstva, oni se ne klasificiraju kao antibiotici, od kojih su
različiti po brojnim karakteristikama. Bakteriocini su mali peptidi koji se sintetiziraju na
ribosomima tijekom lag faze rasta, dok su antibiotici sekundarni metaboliti. Budući da je
biosinteza bakteriocina relativno jednostavna, putem bioinženjeringa lako se može pojačati
njihova aktivnost ili djelovanje na određenu bakteriju.
Aktivnost bakteriocina jeste uži spektra, odnosno bakteriocini određene vrste bakterija aktivni su
protiv sojeva iste vrste ili srodnih vrsta, dok antibiotici imaju široki spektar djelovanja.
Bakteriocini djeluju na način da formiraju pore ili inhibiraju biosintezu ćelijske membrane, dok
antibiotici djeluju na ćelijskoj membrani ili unutarćelijskim ciljevima. (Klaenhammer, 1988)
Dok su bakteriocini sigurni za konzumaciju zahvaljujući tome što ih proteolitički enzimi lako
razgrađuju, antibiotici imaju nisku razgradivost. Osim toga, bakteriocini uglavnom nisu toksični
za eukariotske ćelije, dok antibiotici jesu. Ciljne ćelije mogu razviti rezistentnost na bakteriocine
ili antibiotike. Rezistentnost na bakteriocine ostvaruje se prilagodbom putem promjena u sastavu
ćelijske membrane, dok se rezistentnost na antibiotike ostvaruje genetskim promjenama kojima
se inaktivira aktivna komponenta. (Klaenhammer, 1988)
8
Podaci u nastavku rezimiraju razliku između bakteriocina i antibiotika. (tab. 1 )
Bakteriocini koje sintetiziraju gram-pozitivne bakterije djeluju prvenstveno na širi i/ili uži
spektar drugih gram-pozitivnih bakterija, a djelovanje im može biti baktericidno sa ili bez lize
stanice, ili bakteriostatsko (Silva i sur., 2018).
Za mnoge bakteriocine (lantibiotici tipa A i bakteriocini razreda II) glavno mjesto djelovanja je
citoplazmatska membrana bakterija, odnosno primarni receptori su anionski lipidi citoplazmatske
membrane (McAuliffe i sur., 2001; Zacharof i Lovitt, 2012). Bakteriocini na njoj formiraju pore,
čime izazivaju raspršivanje, to jest gubitak protonske motorne sile, koju čine pH gradijent i
membranski potencijal, a koja služi za sintezu ATP-a i akumulaciju metabolita putem
transportnih sistema u membrani. Na taj način ćelij gubi osnovni izvor energije, što dovodi do
njene smrti. (sl.2)
9
Slika 2: Prikaz inhibicije sinteze ćelijskog zida (a) i formacije pore (b).Oba mehanizma započinju
vezivanjem molekule nizina za lipid II koji je ujedno i glavni transporter peptidoglikanskih jedinica-
gradivnih komponenata membrane
Lantibioticima tipa A za djelovanje nije potreban proteinski receptor, no aktivnost nizina ovisi o
koncentraciji lipida II, koji je prekursor u sintezi peptidoglikana, odnosno neophodan je za
sintezu ćelijske membrane. Interakcijom s lipidom II povećava se sposobnost nizina da se veže
za membranu, ošteti lipidni dvosloj i formira pore, što znači da osjetljivost pojedinih vrsta
bakterija na nizin ovisi o sastavu njihove citoplazmatske membrane. Nizin formira stabilne pore
koje imaju promjer od približno 1 nm. Za formiranje i otvaranje pora od strane nizina, važno je
energetsko stanje bakterijske ćelije, to jest električni transmembranski potencijal. Nizin, kao i
neki drugi lantibiotici i bakteriocini razreda II, također može djelovati na način da cilja lipid II i
inhibira sintezu ćelijske membrane, ali u usporedbi sa formiranjem pora to je sporiji proces
(McAuliffe i sur., 2001).
Lantibiotici tipa B mogu djelovati na način da remete osnovne enzimske aktivnosti te mogu
inhibirati sintezu peptidoglikana, povećati permeabilnost membrane, formirati komplekse sa
lipidom II ili inhibirati bakterijsku fosfolipazu A2.
Bakteriocini razreda IIa djeluju na način da uzrokuju gubitak protonske motorne sile ili formiraju
sitne pore. Budući da se bakteriocini razreda IIb sastoje od dva peptida, oba su potrebna za
formiranje hidrofilnih pora i povećanje permeabilnosti membrane. U razredu IIc nalaze se
strukturno različiti bakteriocini sa različitim djelovanjem, poput permeabilizacije membrane,
inhibicije stvaranja septuma i aktivnosti feromona. Lakticin Q ubraja se u razred IId i on se,
primjerice, veže s vanjske strane lipidnog dvosloja te formira velike pore prosječnog promjera
većeg od 4,6 nm, a za njegovo djelovanje nije potreban lipid II (sl.3). Bakteriocini razreda III
10
kataliziraju hidrolizu ćelijske membrane, odnosno autolizu bakterijske ćelije (Paiva i Breukink,
2013).
Kod bakteriocina razreda II imunosni protein se uglavnom većim dijelom nalazi u citoplazmi, a
samo mali dio je povezan sa membranom. Ta interakcija imunosnog proteina sa
citoplazmatskom membranom štiti bakterijsku ćeliju od djelovanja bakteriocina. Imunosni
protein može varirati u veličini te se može sastojati od 51 do 254 aminokiseline (Paiva i
Breukink, 2013).
11
2.3 Bakterijska rezistentnost na bakteriocine
Otpornost na neki bakteriocin može biti stečena i pojaviti se kod bakterija koje su prethodno na
njega bile osjetljive ili može biti urođena. Nekoliko genskih lokusa povezuje se sa otpornošću na
bakteriocine. Ako mutacije na određenom genu uzrokuju osjetljivost na bakteriocin, tada je taj
gen odgovoran za urođenu otpornost.
S druge strane, ako mutacije na genu dovedu do razvoja otpornosti, tada ga se povezuje sa
stečenom otpornošću. Mehanizmi putem kojih se ostvaruje otpornost obično su povezani sa
promjenama u ćelijskom omotaču bakterija. Te promjene mogu uzrokovati smanjeno vezivanje
ili umetanje bakteriocina, odstranjivanje bakteriocina, izbacivanje bakteriocina putem efluks
pumpi i razgradnju bakteriocina (Bastos i sur., 2015).
Najviše istraživanja provedeno je u vezi sa otpornošću bakterija na nizin, pediocin i lakticin 3147
(Bastos i sur., 2015). Gravesen i sur. (2002) proveli su istraživanje o razvoju otpornosti kod
bakterije Listeria monocytogenes na pediocin PA-1 i nizin A. Naglasak je bio na 6 razlika
između različitih sojeva i utjecaju okolišnih uvjeta (pH, NaCl, temperatura).
Razvoj otpornosti na nizin A utvrđen je za 14 sojeva. Četiri soja imala su srednje pojačanu
otpornost na nizin, dok je ostalih deset sojeva bilo osjetljivo na nizin. Okolišni uvjeti, odnosno
snižena temperatura (10°C u odnosu na 30°C), pH vrijednost (5,5 u odnosu na 6,5) i dodatak
NaCl (6,5%), nisu imali utjecaj na frekvenciju otpornosti na pediocin PA-1, ali je otpornost na
nizin A u takvim uvjetima značajno smanjena. Jydegaard i sur. (2000) istraživali su mehanizam
inaktivacije bakterije Listeria monocytogenes 412 nizinom i pediocinom te su utvrdili kako ona
ovisi o bakterijskoj fazi rasta.
Ćelije su u stacionarnoj fazi rasta bile otpornije na oba bakteriocina nego u eksponencijalnoj fazi
rasta. Također je utvrđeno da dodatak natrijevog klorida (6,5%) ili snižena temperatura (5°C)
pojačavaju toleranciju bakterije na pediocin. Bastos i sur. (2015) navode istraživanje koje su
proveli autori Rasch i Knøchel, a u kojem je proučavana otpornost Listeria monocytogenes na
nizin i pediocin.
12
Korišten je 381 soj, od kojih niti jedan nije bio prirodno otporan na nizin, a samo dva soja imala
su pojačanu toleranciju na nizin. Nadalje, 20 sojeva je bilo otporno na pediocin, dok su 34 soja
imala pojačanu toleranciju na pediocin.
Bakteriocini mogu biti sastojak antimikrobnih filmova i premaza koji služe kao barijera između
određene namirnice i okoliša, a koji su sastavljeni od tankih slojeva biopolimera u koje se
bakteriocini mogu inkorporirati. Takvi filmovi i premazi koriste se za poboljšanje sigurnosti i
kvalitete namirnica pri tom ne mijenjajući njihova senzorska i nutritivna svojstva.
Tako se u proizvodnji sireva najčešće koriste biopolimeri poput proteina i polisaharida, koji su
pogodni za inkorporaciju bakteriocina ili bakterija koje ih sintetiziraju. Njihovom upotrebom
može se inhibirati rast patogenih bakterija i bakterija uzročnika kvarenja, spriječiti naknadna
kontaminacija, poboljšati stabilnost i sigurnost te produžiti rok trajnosti mliječnih proizvoda
(Valdés i sur., 2017; Silva i sur., 2018).
Antimikrobni filmovi mogu se koristiti i kao dio ambalaže sireva kako bi se spriječio rast
patogenih bakterija na njihovoj površini. Film mora biti u direktnom doticaju sa površinom sira
kako bi se bakteriocini po njoj mogli raširiti i učinkovito djelovati (Nandane i sur., 2007).
Bakteriocini se mogu koristiti u kombinaciji sa hemijskim aditivima, ili sa drugim postupcima
koji mogu uključivati primjenu visokih temperatura, visokog pritiska ili pulsirajućeg električnog
polja.
13
Osim u proizvodnji mliječnih proizvoda, bakteriocini, a posebno lantibiotici, imaju veliki
potencijal za primjenu kao sredstvo u borbi protiv formiranja biofilmova. Biofilmovi su
zajednice jedne ili više vrsta mikroorganizama koje mogu nastaniti različite biotičke i abiotičke
površine te predstavljaju velik izazov u prehrambenoj industriji, kao i u bolničkom okruženju.
Bakterije koje se nalaze u biofilmu često su otporne na antibiotike i fizikalni i hemijski stres te
mogu preživjeti u iznimno nepovoljnim uvjetima.
14
3. KLASIFIKACIJA BAKTERIOCINA
Danas je opšte prihvaćena definicija bakteriocina BMK koja glasi: “Bakteriocini su mali,
ribozomalno sintetisani peptidi ili proteini koji imaju relativno uzak spektar antimikrobne
aktivnosti koja je ograničena na blisko srodne vrste i prema kojoj soj proizvođač ima mehanizam
specifične samozaštite“.
15
Shema 1: Prikaz predložene univerzalne klasifikacije koja bi obuhvatila sve do sada
okarakterisane bakteriocine
Generalno, Klasi I bakteriocina pripadaju svi bakteriocini koji prolaze kroz posttranslacione
modifikacije. Prvom klasifikacijom, svi bakteriocini ove klase su podijeljeni na Tip A i Tip B.
Međutim, kako ova klasifikacija nije bila održiva, ona je modifikovana i predloženo je da se Tip
A lantibiotika podijeli na dvije podgrupe (AI i AII). Takođe, ovom klasifikacijom, uvedena je još
jedna posebna grupa lantibiotika, a to su dvo-peptidni lantibiotici.
Kako se broj lantibiotika tokom vremena povećavao, predložene su nove klasifikacije, međutim,
ni jednom od predloženih klasifikacijama nisu mogli da se obuhvate svi bakteriocini ove grupe
sve do prijedloga koji su dali su (Rea et al. (2011), gdje predlažu da se ova klasa bakteriocina
podeli na podklase Ia (lantibiotici), Ib (labirintopeptini) i Ic (saktibiotici).
16
Neke od modifikacija se dogadjaju usljed kondezacije serina i treonina sa cisteinom, pri čemu se
formiraju lantionin i metil-lantionin. Lantibiotici su prvi put podeljeni u dve subklase: tip A i tip
B (Breukink et al., 1999).
Tip A lantibiotika, u koji spada i nizin, su dugački, pozitivno naelektrisani peptidi (do 34
aminokiselina), koji djeluju na ciljnu ćeliju tako što vrše depolarizaciju membrane izazivajući
curenje malih molekula, što dovodi do eventualne smrti ćelije. Struktura metillantionin mostova
je slična među svim lantibioticima ove grupe. Tip B lantibiotici su kraći (do 19 aminokiselina),
imaju globularnu strukturu i neki djeluju na ciljnu ćeliju tako što inhibiraju enzim koji ima ulogu
u sintezi ćelijskog zida. Međutim, na primjeru djelovanja nizina, koji pored toga što formira pore
na ćelijskoj membrani senzitivne ćelije, što ga svrstava u tip A, on inhibira i sintezu
peptidoglukana vezujući se za prekursor peptidoglukana lipid II što ga klasifikuje kao tip B
(Breukink et al., 1999).
Postojala je težnja da se ova klasa podijeli na četiri podklase, na osnovu načina dobijanja zrelog
peptida, kao i na osnovu odsustva/prisustva antimikrobne aktivnosti.
Podklasa I – linearni peptidi kod kojih je pre-peptid modifikovan djelovanjem dva enzima LanB
i LanC. Najbolje okarakterisan bakteriocin ove grupe je nizin.
Podklasa III – peptidi koji su slični lantibioticima na osnovu srodnosti modifikacionih enzima,
ali za koje nije pokazano da imaju antimikrobno djelovanje. Tri okarakterisana predstavnika ove
podklase su SapB, AmfS i SapT, a uključeni su u formiranje vazdušnog micelijuma kod
Streptomyces sp. (Klaenhammer, 1993).
Podklasa IV – bakteriocini ove podklase su grupisani na osnovu još jedne nove klase lantionin
sintetaze, LanL. Bakteriocini ove i podklase III mogu se svrstati u “lantipeptide”, koji opisuju
jedinjenja koja po strukturi pokazuju povezanost sa lantibioticima, a koji ne ispoljavaju
antimikrobno djelovanje.
17
Klasa Ic – Saktibiotici su ciklični bakteriocini koji trpe neobične posttranslacione modifikacije
sa formiranim vezama između sumpora iz tri cisteinska ostatka i α-ugljenika iz dva fenilalanina i
jednog trenonina . Predstavnik ove grupe je Subtilozin A.(sl.5)
Lantibiotik, nizin A, djeluje na senzitivnu ćeliju korištenjem oba mehanizma i time predstavlja
jedan od najpotentnijih bakteriocina. Neki lantibiotici, kao što su nukacin ISK-1 i lakticin 481,
koriste lipid kao ciljni molekul za vezivanje za ćeliju, ali mehanizam delovanja na senzitivnu
ćeliju im se zasniva samo u inhbiranju sinteze ćelijskog zida.
Ipak, bakteriocini ove podgrupe se međusobno razlikuju u tome što se neki vezuju za
cviterjonske lipide, a neki za anjonske lipide, po čemu su dosta slični nizinu. Neki bakteriocini,
kao što je mutacin II, energetski potpuno osiromašuju ćelije. Sam mehanizam delovanja ovog
bakteriocina nije u potpunosti shvaćen, ali pretpostavlja se da na neki način inhibira metaboličke
procese proizvodnje energije u ćeliji (Baquero F. Moreno F. 1984).
18
Primjećeno je da ovaj bakteriocin ne formira stabilne pore na ćelijskoj membrani, ali je nejasno
kako i da li formira privremene pore. U slučaju dvopeptidnih lantibiotika (lakticin 3147), prvi
peptid, LtnA1 komponenta, vezuje se za lipid II, a drugi peptid, LtnA2 komponentu, vezuje se za
kompleks LtnA1/lipid II, gde nastanak trokomponentnog kompleksa dovodi do formiranja pora u
membrani ćelije.
Bakteriocini ove grupe su uglavnom mali, termostabilni, katjonski i hidrofobni peptidi. Klasa II
bakteriocina predstavlja veliku i raznovrsnu grupu antimikrobnih peptida koji su podijeljeni u
nekoliko podgrupa, a dalje na podklase: IIa – „pediocinlike“ bakteriocini; IIb – dvopeptidni
bakteriocini; IIc – cirkularni bateriocini; IId – bakteriocini bez lider peptida. Zajednička osobina
bakteriocina klase II je mehanizam njihovog djelovanja na senzitivne ćelije. Na osnovu većeg
broja studija, pokazano je da bakteriocini ove klase djeluju tako što permeabilizuju ćelijske
membrane, nakon čega dolazi do curenja malih molekula iz ćelije, što izaziva smrt ćelije.
Međutim, pored toga što je mehanizam njihovog djelovanja isti, receptori na senzitivnim
ćelijama za koje se vezuju bakteriocini se mogu razlikovati.
Podklasu IIa čine bakteriocini koji su slični pediocinu, „pediocin-like“. Oni vrlo često imaju
uzak spektar delovanja, ali su jako značajni jer inhibiraju rast Listeria monocytogenes. Oni se
vezuju za senzitivnu ćeliju koristeći komponente manozafosfotransferaznog sistema (man-PTS),
svoju antimikrobnu aktivnost ostvaruju, kao što je već pomenuto, narušavanjem membranskog
potencijala senzitivne ćelije (Diep et al., 2007; Kjos et al., 2010). Ono što je karakteristično za
bakteriocine ove podklase je da imaju konzerviranu N-terminalnu sekvencu
YGNGVXCXXXXVXV (gde je X bilo koja aminokiselina) i formiraju jedan ili dva disulfidna
mosta u N-terminalnom delu peptida. U ćeliji se sintetišu sa lider peptidom koji se, prije
izbacivanja bakteriocina iz ćelije, isijeca proteolitičkim enzimima.
Obično se isijecanje odvija posle dva glicina (GG).
19
Podklasu IIb čine bakteriocini koji su sastavljeni od dva nemodifikovana peptida. Jedinstvenost
ovih bakteriocina predstavlja to što je optimalna antimikrobna aktivnosti uslovljena delovanjem
oba peptida, koji se nalaze u međusobnom odnosu 1:1. U nekim slučajevima, pojedinačni peptidi
mogu ispoljavati antimikrobnu aktivnost, ali je ta aktivnost dosta slabija od one kad oba peptida
deluju. Međutim, u slučaju bakteriocina laktokokcin G (Baquero F. Moreno F. 1984) i lakticin
705 potvrđeno je da pojedinačni peptidi nemaju antimikrobnu aktivnost.
Svi dvopeptidni bakteriocini poseduju lider peptid koji se iseca posle dva glicina (GG-) i
eksportuju se van ćelije koristeći ABC-transporte. Do sada je okarakterisano 15 bakteriocina koji
pripadaju ovoj podklasi. Laktokocin G je prvi i najbolje okarakterisan bakteriocin ove grupe i
njegova aktivnost zavisi od oba peptida, odnosno komponenata α i β, koji su prisutni u odnosu
1:1. Receptor za vezivanje laktokcina G za senzitivnu ćeliju je undekaprenil pirofosfatna
fosfataza (Upp protein), koja je uključena u sintezu peptidoglukana . Sam mehanizam djelovanja
ova dva peptida na senzitivnu ćeliju nije do kraja objašnjen, ali vjerovatno dolazi do vezivanja
oba peptida za površinu ćelijske membrane, čime menja njen potencijal, što dovodi do curenja
jona i smanjenja koncentracije ATP-a u ćeliji, a rezultat je smrt ćelije (Garneau et al., 2002).
Podklasu IIc čine bakteriocini kod kojih su terminalni C i N krajevi kovalentno povezani, što
rezultira cirkularnoj formi ovih bakteriocina (Maqueda et al., 2004). Dugi niz godina, enterocin
AS-48 je bio jedini poznati cirkularni bakteriocin, ali danas je poznato još nekoliko bakteriocina
ove podklase: gasericin A i cirkularin, karnociklin A, subtilozin, uberolizin, leukocilizin i
laktociklicin Q. Strukturu ovih cirkularnih peptida čini 58-70 aminokiselina, koje su katjonske i
sadrže veliki broj hidrofobnih aminokiselina (Maqueda et al., 2008). Oni pokazuju izuzetnu
stabilnost na različitim temperaturama i širokom pH opsegu. Takođe, bakteriocini ove podklase
su otporni na delovanje pronaze ali su osetljivi na delovanje endoproteaza.
Ono što je karakteristično za bakteriocine ove grupe kao što su enterocin AS-48, gasericin A,
subtilozin A i karnocilin A jeste da mogu ispoljiti svoju aktivnost bez prisustva bilo kakvog
receptora. Enterocin AS-48 formira ne-selektivne pore, što uzrokuje curenje malih molekula, dok
karnocilin A formira anjon-selektivne pore što izaziva depolarizaciju membrane
20
IId podklasu bakteriocina čine neklasifikovani, jednopeptidni bakteriocini koji se razlikuju od
pediocina. Među bakteriocinima podklase IId mogu se razlikovati: 1. sec- zavisni bakteriocini; 2.
bakteriocini bez lider peptida ("leaderless bacteriocins") i 3. ostali bakteriocini klase IId.
Bakteriocine bez lider peptida uglavnom sintetišu bakterije koje nisu BMK, stafilokoke i
bakterije propionske kiseline (Maqueda et al., 2008).
Prvi bakteriocini ovog tipa su bakteriocini L50 i enterocin Q izolovani iz BMK, Enterococcus
faecalis i Enterococcus faecium. Bakteriocini ove podklase svoju antimikrobnu aktivnost
ostvaruju permeabilizacijom membrane, a potom curenjem ćelijskog sadržaja dolazi do smrti
ćelije. Pojedini bakteriocini ove podklase (laktokokcin A i B), kao i bakteriocini podklase IIa,
koriste man-PTS komponente kao receptore za vezivanje za senzitivnu ćeliju. Pored ovih
sličnosti, bakteriocini ove podklase ne pokazuju nikakvu homologiju sa bakteriocinima podklase
IIa.
3.3 Bakteriolizini
21
4. BAKTERIOCINI – NOVA GENERACIJA ANTIBIOTIKA
Bakteriocini su proteini ili mali peptidi, a ono što im je zajedničko to je da su najčešće pozitivno
naelektrisani. Zbog svih ovih karakteristika bakteriocina, genetička karaktetrizacija bakteriocina
je nadmašila biohemijski pristup proučavanja njihovih karakteristika. Poslednjih nekoliko
godina, kako dolazi do razvijanja biohemijskih metoda i upoznavanja karakteristika bakteriocina,
biohemijski pristup karakterizacije bakteriocina je u porastu. Metode za izolaciju bakteriocina se
mogu podijeliti u tri grupe (Maqueda et al., 2008).
Druga grupa predstavlja modifikaciju prve, metoda se zasniva na taloženju proteina amonijum-
sulfatom, a zatim slijedi ekstrakcija proteina hloformom ili metanolom i na kraju, kao dodatno
prečišćavanje, koristi se HPLC.
Posljednji način na koji se mogu izolovati bakteriocini, koji se u današnje vrijeme najrjeđe
koristi, zasniva se na podešavanju pH vrednosti medijuma u kojem je rasla bakterijska kultura, a
koncetracija bakteriocina se dovodi do maksimuma, a nakon toga se koristi hidrofobna
hromatogrfija. (Maqueda et al., 2008).
Zbog prethodno navedenih problema koji se mogu javiti, prije procesa izolacije i prečišćavanja
bakteriocina, potrebno je ustanoviti optimalne uslove za produkciju maksimalne koncetracije
bakteriocina (vremenski period rasta bakterijske kulture, medijum).
22
Biohemijski put dobijanja čistih bakteriocina sve češće se koristi u utvrđivanju njihove
potencijalne primene u konzervisanju hrane. Upotreba nizina i pediocina, kao konzervanasa
hrane, dovela je do potrebe da se razviju brze metode za izolaciju dovoljne količine čistih
bakteriocina.
Iako istraživanja na antimikrobnim jedinjenjima datiraju još od 1877 godine, kada su Paster i
Joubert primijetili da neke bakterije mogu sprečavati rast Bacillus anthracis, interesovanje za
ovu oblast je i dalje veliko. Od tada se ulažu konstantni napori da se pronađu nepatogene
bakterije koje će sprečavati rast drugih bakterija. Takođe, poslednjih decenija, usled intezivne
upotrebe antibiotika, došlo je do porasta broja rezistentnih bakterija na antibiotike. Među
bakterijama koje nose rezistencije na antibiotike, najrasprostranjenije i najveće probleme
izazivaju sojevi rezistentni na metacilin vrste Staphylococcus aureus (MRSA) i vankomicin
rezistentne enterokoke (VRE) koje izazivaju sistemske infekcije u bolnicama (Cotter et al.,
2005).
Prvi veliki pomak u istraživanju, kao odgovor problemu bakterijskih rezistencija, bilo je
otkrivanje nizina. Nizin svoju antimikrobnu aktivnost ostvaruje vezivanjem za molekul lipida II,
koji je inače i ciljni molekul za djelovanje antibiotika vankomicina. Na osnovu ovog mehanizma
djelovanja nizina, mogu se napraviti novi antibiotici koji će se vezivati za ciljni molekul i
ispoljavati svoju antimikrobnu aktivnost (Sit i Vederas, 2008).
Pored toga što su mehanizmi djelovanja bakteriocina iskorišteni za pravljenje novih antibiotika,
bakteriocini se mogu koristiti i kao alternativa za antibiotike. Iako bakteriocini posjeduju
antibiotske karakteristike, oni se ne nazivaju antibioticima.
Razlozi su, sa jedne strane da bi se izbjegla konfuzija, a sa druge zato što imaju uzak
spektar djelovanja, za razliku od antibiotika (Maqueda et al., 2008). I pored toga,
činjenica da mogu djelovati na specifične patogene vrste, kao i da se mogu naći svuda u prirodi,
čini ih dobrim kandidatima za alternativu ili dopunu antibioticima.
23
Do sada je ispitivano djelovanje nizina i lakticina 3147 na patogene bakerije koje nose
rezistencije na antibiotike. Nizin je pokazao izuzetne rezultate na vankomicin i oksacilin
rezistentne Helicobacter pylori i Neisseria sp., dok je lakticin 3147 u in vitro uslovima pokazao
aktivnost protiv Staphylococcus aureus (uključujući MRSA), enterokoka (uključujući i VRE) i
streptokoka.
24
4.3 Djelovanje bakteriocina na humani organizam
Bakteriocini bi u probavnom sistemu mogli djelovati na više načina. Jedan je da djeluju kao
kolonizirajući peptidi. U probavnom sistemu ćelije su gusto naseljene, odnosno ćelije istih ili
različitih bakterijskih vrsta dolaze u bliski kontakt. Bakterije koje sintetiziraju bakteriocine stoga
mogu biti u prednosti budući da oni mogu djelovati na susjedne osjetljive bakterije.
Primjena bakterija koje sintetiziraju bakteriocine i mogu preživjeti u probavnom sistemu stoga
može biti bolja opcija od izravne primjene bakteriocina, s obzirom da se na taj način izbjegava
proteoliza tijekom prolaska kroz želudac. U jednom istraživanju provedenom na štakorima
proučavan je učinak primjene pročišćenog nizina i soja Lactococcus lactis CHCC 5826 koji
sintetizira nizin, na sastav crijevne mikroflore.
25
Nizin i lakticin 3147 učinkoviti su protiv sojeva bakterije Clostridium difficile, no rezultati
pojedinih istraživanja pokazuju da ti bakteriocini ipak nisu najbolji izbor u liječenju crijevnih
infekcija. (sl.6)
Bakteriocin koji bi se koristio u tu svrhu trebao bi imati uzak spektar aktivnosti, odnosno ciljno
inhibitorno djelovanje na određeni patogen, a poznato je da nizin i lakticin 3147 imaju široki
spektar djelovanja usmjeren u najvećoj mjeri prema gram-pozitivnim bakterijama.
Stoga osim na patogenu bakteriju također imaju štetno djelovanje i na normalnu crijevnu
mikrofloru (Rea i sur., 2013). Rea i sur. (2011) istražili su djelovanje antibiotika vankomicina i
metronidazola te bakteriocina lakticina 3147 na bakteriju Clostridium difficile, kao i njihov
utjecaj na mikrofloru debelog crijeva. Primjenom svake od triju antimikrobnih supstanci
značajno se smanjio broj stanica Clostridium difficile, no također je došlo i do većih promjena u
sastavu crijevne mikroflore, odnosno manje raznovrsnosti zbog velikog povećanja broja
enterobakterija te smanjenja broja bakteroida.
Ne zna se da li je lakticin 3147 imao izravan utjecaj na bakteroide ili su nastale promjene
povezane sa njegovim djelovanjem na druge bakterije. Lakticin 3147 također negativno utječe na
26
laktobacile i bifidobakterije. Autori navode bakteriocin turicin CD kao bolji izbor u liječenju
infekcija izazvanih Clostridium difficile.
To je bakteriocin kojeg sintetizira bakterija Bacillus thuringiensis, a ima uzak spektar aktivnosti i
ciljno djelovanje protiv Clostridium difficile, koje je jednako učinkovito kao i ono lakticina 3147.
Nadalje, turicin CD ne uzrokuje značajne promjene u sastavu crijevne mikroflore te nakon
nekoliko sati nestaje iz crijeva čime se smanjuje mogućnost da patogen na njega razvije
otpornost.
Otprilike 20- 50% svih prepisanih antibiotika u američkim bolnicama povezanih s akutnim
oboljenjima prepisani su nepotrebno ili neadekvatno (CDC, 2013.). Isto tako loša kvaliteta
lijekova u kojima se često nalaze preniske koncentracije aktivne tvari pospješuju sticanje
rezistentnosti (Smelov i sur., 2016.). Iz 28 097 uzoraka urina izvanbolničkih pacijenata izolovano
je uropatogene E. coli u koncentraciji od 46,5%.
Kod tih 46,5% uzoraka u kojima je bila prisutna E. coli određivali su rezistentnost na antibiotike.
E. coli pokazala se visokorezistentnom prema amoksicilinu (57,8%), sulfometoksazol-
trimetoprimu (33,8%) i cefaleksinu (10,8%). Kinoloni antibiotici koji inače pokazuju dobru
eradikciju prema uropatogenima nisu se pokazali učinkoviti te je E. coli bila rezistentna u 16%
uzoraka(tab. 2) ( Pastuović i sur,2007).
27
Tabela 2 : Prikazuje rezistentnost E. coli na sve korištene antibiotike u istraživanju.
28
Slika 7: Netretirane (A) I tretirane (B) ćelije Staphylococcus aureus bakteriocinom kojeg
sintetizira Lactobacillus plantarum SJ33 promatrane pod elektronskim mikroskopom.
Naučnici su izolirali bakteriocin DT24 kojeg proizvodi Lactobacillus brevis DT24 i ispitali
njegovu učinkovitost protiv uropatogene E. coli i ostalih uropatogena. Na temelju dobivenih
rezultata zaključili su da bakteriocin DT24 ima širok spektar djelovanja. Bakteriocin DT24
pokazao je visoka antimikrobna svojstva prema uropatogenima E. coli, S. aureus, E. faecalis i E.
faecium ali loša antimikrobna svojstva prema P. aeruginosa.
29
4.3.2 Bakteriocini u prevenciji i liječenju mastitisa
Rezidualni antibiotici osim što su opasni za ljudsko zdravlje, mogu uzrokovati probleme u
preradi mlijeka u fermentiranju mliječnih proizvoda poput jogurta, sira i sladoleda. Upravo se iz
tog razloga kao i zbog pojave otpornosti bakterija na antibiotike javila potreba za otkrivanjem
alternativnih metoda u prevenciji i liječenju mastitisa. Tako Nascimento i sur. (2004.) kao jednu
od potencijalnih alternativnih antimikrobnih tvari navode korištenje bakteriocina.(sl.8)
Sve više se počelo koristiti germicidne formulacije za sprječavanje mastitisa kod mliječne stoke.
Sredstva za sanitaciju sisa se rutinski koriste prije i poslije mužnje krava kako bi se spriječio
prodor patogena u sisni kanal, uzročnika intramamarnih infekcija( Sears i sur,1992). U studiji su
uspoređivali formulaciju na bazi nizina (Ambicin N®) s konvencionalnim hemijskim tretmanima
kao što su jodofor i kloroheksidin.
Inicijalni podatci pokazali su znatno smanjenje patogena na površini tretiranog dijela sisa nakon
jedne minute izlaganja germicidnoj formulaciji (tab. 3). Pored toga, germicidna je formulacija
pokazala mali potencijal za iritaciju kože sisa nakon ponavljanog izlaganja u usporedbi s 1%-
tnim jodoforom i 5%-tnim kloroheksidin diglukonatom. (Hammami R. i sur. 2013.)
30
Tabela 3: Podaci performansa za germicidno sredstvo za sanitaciju sisa na bazi nizina
S.aureus 61,8 %
S.agalactiae 98,6 %
E.coli 85,5 %
S.uberis 67,1 %
K.pneumonia 76,5 %
U drugom slučaju, azurin, bakteriocin koji se proizvodi sojem P. aeruginosa, proučavan je kao
potencijalni lijek protiv raka zbog njegovog selektivnog vezanja na ljudske ćelije raka, i
rezultirajući citotoksični i apoptotički učinak, bez uticaja na normalne ćelije(Yamada i sur.
2004).
31
Slika 9 : Apoptoza
Nisin, subtilosin, fermenticin (Kaur i sur. 2013.) i lakticin 3147 pokazalo se da pokazuju
spermicidno svojstvo uzrokujući smanjenje ili promjenu pokretljivosti ljudskih spermatozoida,
dakle ističući njihov potencijal kao kontracepcijskih sredstava za kontrolu rađanja (Dicks et al.
2018).
U provedenoj studiji, intravaginalna primjena nizina u kunića tokom dvije sedmice spriječila je
začeće bez izazivanja upale ili oštećenja vaginalnog epitela. Međutim, ako su koncentracije
nizina korištene u testovima kontrole rađanja pomoću životinjskih modela ekstrapolirano za
ljudsku upotrebu, vjerojatno bi uključeni nivoi ozbiljno uticali na zdravu ljudsku vaginalnu
mikrobiotu (Dicks et al. 2018) i stoga se ovaj faktor mora uzeti u obzir pri daljnjem razvoju
bakteriocina, posebno bakteriocina širokog spektra, kao potencijalnog sredstva za kontrolu
rađanja.
32
4.3.5 Antilisterijski efekat bakteriocina
Pripada grupi patogenih bakterija koja napada imunokompromitovane osobe, djecu, stare i
trudnice. Izaziva akutnu bolest, listeriozu, jednu od najtežih bolesti zastupljenih u industrijski
razvijenim zemljama (Schlech, 2000) sa smrtnim ishodom u preko 20-25% slučajeva. S obzirom
na sveprisutnost L. monocytogenes, u mnogim zemljama Evropske Unije (EU), u posljednjih 15
godina je zabilježen veliki broj slučajeva listerioze (Tab. 4)
Perzistentni sojevi L. monocytogenes, detektovani su, kako u malim, tako i velikim pogonima za
proizvodnju mlečnih proizvoda, zatim u pogonima za proizvodnju lososa i u pogonima za
proizvodnju mesa takođe i u pogonima za proizvodnju živinskog mesa (Farber i Peterkin, 1991).
33
Generalno, mliječni proizvodi predstavljaju veoma pogodnu sredinu za rast i razmnožavanje L.
monocytogenes. Najčešće se može naći na površini sireva sa dugim zrenjem, kod kojih se na
površini pH vrednost povećava tokom zrenja, što pruža mnogo povoljnije uslove za rast L.
moncytogenes. Pored ovih sireva, L. Monocytogenes je detektovana u sirevima tipa „cottage“,
mekim sirevima, zatim kamemberu (Back et al., 1993).
Zbog ovih karakteristika L. monocytogenes, usljed obima proizvodnje, industrija mlijeka, kao i
ostatak prehrambene industrije, se susreće sa stalnim problemima. Iz tog razloga, porasla je
potreba za ispitivanjem novih načina za kontrolu L. Monocytogenes u gotovom proizvodu. Jedan
od načina, koji se u poslednjih deset godina izuzetno ispituje, je korišćenje bakteriocin
proizvođača BMK kao starter kultura ili korišćenje samog izolovanog i prešišćenog bakteriocina
u kontroli L. monocytogenes.
Mnogo bolji rezultati kontrole L. monocytogenes u siru, dobijeni su prilikom kombinacije nizina
sa još jednim bakteriocinom zatim kombinacijom nizina i organske kiselina, ili kombinacijom
visokog pritiska i nizina (Arques et al., 2005). Pored nizina, kao biokonzervansi hrane u kontroli
L. monocytogenes, ispitivani su i mnogi drugi bakteriocini, ali se izdvajaju pediocin AcH/PA-1 i
lakticin 3147, koji su pokazali najbolje rezultate.
I pored intezivnog izučavanja bakteriocina kao biokonzervansa hrane, samo se nizin i pediocin
AcH/PA1 koriste komercijalno kao prirodni konzervansi hrane u preko 50 zemalja širom svijeta.
Razlozi za to su različiti, a neki od njih su relativno uski spektri djelovanja mnogih bakteriocina
ili stalne promjene zakonskih regulativa za korišćenje dodataka u prehrambenoj industriji. Pored
toga, potencijalni problem predstavlja brza adaptacija patogenih bakterija na bakteriocine koji se
dodaju.
34
ZAKLJUČAK
Bakteriocini imaju svojstva zbog kojih se mogu koristiti u širokom rasponu prehrambenih i
medicinskih primjena. Dakle, sigurnost bakteriocina zahtijeva mnogo pažnje. Antimikrobno
djelovanje bakteriocina je naširoko proučavan fenomen; međutim, postoji nedostatak dostupnih
in vitro i in vivo podataka o sigurnosti i toksičnosti bakteriocina.
Propisi koje je predložila FDA treba strogo slijediti kako bi se postiglo zakonsko odobrenje
bakteriocina kao sigurnih i pouzdanih konzervanasa za hranu ili terapeutskih agenasa.
35
Literatura
5. McAuliffe O., Ross R. P., Hill C. (2001). Lantibiotics: structure, biosynthesis and mode of
action. FEMS Microbiology Reviews. 25: 285-308.
8. Rea M. C., Dobson A., O’Sullivan O., Crispie F., Fouhy F., Cotter P. D., Shanahan F.,
Kiely B., Hill C., Ross R. P. (2011). Effect of broad- and narrow-spectrum antimicrobials on
Clostridium difficile and microbial diversity in a model of the distal colon. Proceedings of the
National Academy of Sciences of the United States of America. 108(1): 4639-4644.
9. Maqueda, M., Sanchez-Hidalgo, M., Fernandez, M., Montalban-Lopez, M., Valdivia, E.,
Martinez-Bueno, M. (2008): Genetic features of circular bacteriocins produced by Gram-
positive bacteria FEMS Microbiology Reviews 32:2–22.
10. Arqués J. L., Rodríguez E., Langa S., Landete J. M., Margarita Medina M. (2015).
Antimicrobial Activity of Lactic Acid Bacteria in Dairy Products and Gut: Effect on pathogens.
BioMed Research International
12. Kaur S, Kaur S. 2015. Bacteriocins as potential anticancer agents. Front Pharmacol 6:272
36
13. Yamada T, Hiraoka Y, Ikehata M et al. 2004. Apoptosis or growth arrest: modulation of
tumor suppressor p53’s specificity by bacterial redox protein azurin. Proc Natl Acad Sci
USA;101:4770–5.
14. Farber, J.M., Peterkin, P.I. (1991): Listeria monocytogenes, a food-borne pathogen.
Microbiological Reviews 55: 476-511.
37