Professional Documents
Culture Documents
Mikrobologija s parazitologijom
Ana Schneider,
Valerija Vuga,
Marija Boc, studentice 1.godine izvanrednog preddiplomskog studija
sestrinstvo
1.Uvod
Posljednjih godina raste interes za istraživanje i razvoj novih
antimikrobnih sredstava iz različitih izvora za borbu protiv otpornosti
mikroba. Stoga je sve veća pažnja posvećena metodama probira i
evaluacije antimikrobne aktivnosti. Nekoliko bioloških testova kao što su
difuzija diskom, difuzija u jažici i razrjeđivanje bujonom ili agarom
dobro su poznati i često se koriste, ali drugi kao što su protočne
citofluorometrijske i bioluminiscentne metode nisu naširoko korišteni jer
zahtijevaju posebnu opremu i daljnju procjenu ponovljivosti i
standardizacije, čak i ako mogu pružiti brze rezultate učinaka
antimikrobnih sredstava i bolje razumijevanje njihovog utjecaja na
vitalnost i oštećenja stanica nanesena testiranom mikroorganizmu. U
ovom seminaru obraduje se metoda testiranja antimikrobne osjetljivosti i
detaljne informacije o njihovim prednostima i ograničenjima.
1.2. Razradba
Nakon revolucije u “zlatnoj eri”, kada su otkrivene gotovo sve grupe
važnih antibiotika (tetraciklini, cefalosporini, aminoglikozidi i makrolidi)
i kada su glavni problemi kemoterapije riješeni šezdesetih godina
prošlog stoljeća, povijest se danas ponavlja i ovi uzbudljivi spojevi su u
opasnosti od gubitka učinkovitosti zbog porasta rezistencije mikroba.
Trenutačno je njegov utjecaj značajan zbog neuspjeha liječenja povezanih
s bakterijama rezistentnim na više lijekova. Iz tog razloga, otkriće novih
antibiotika je isključivo važan cilj. Prirodni proizvodi i danas su jedan od
glavnih izvora novih vrsta lijekova. Potječu iz prokariotskih bakterija,
eukariotskih mikroorganizama, biljaka i raznih životinjskih organizama.
Mikrobni i biljni proizvodi zauzimaju najveći dio do sada otkrivenih
antimikrobnih spojeva. Biljke i drugi prirodni izvori mogu osigurati
širok raspon složenih i strukturno raznolikih spojeva. Nedavno su se
mnogi istraživači usredotočili na istraživanje biljnih i mikrobnih
ekstrakata, eteričnih ulja, čistih sekundarnih metabolita i novih
sintetiziranih molekula kao potencijalnih antimikrobnih sredstava.
Međutim, kada smo pregledali objavljene članke o antimikrobnom
učinku ovih prirodnih proizvoda, usporedba između rezultata često je
teška.
2. Procjena antimikrobne aktivnosti
Za procjenu ili provjeru in vitro antimikrobne aktivnosti ekstrakta ili
čistog spoja mogu se koristiti različite laboratorijske metode.
Najpoznatije i osnovne metode su difuzija diskom i metode razrjeđivanja
bujonom ili agarom. Druge metode se koriste posebno za antifungalna
ispitivanja. Za daljnje dubinsko proučavanje antimikrobnog učinka
agensa, preporučuju se time-kill test i metode protočne citofluorometrije,
koje daju informacije o prirodi inhibitornog učinka (baktericidnog ili
bakteriostatskog) (ovisnog o vremenu ili koncentraciji) i stanici oštećenje
naneseno ispitivanom mikroorganizmu. Zbog nove privlačnosti
svojstava novih antimikrobnih proizvoda kao što je suzbijanje bakterija
otpornih na više lijekova, važno je razviti bolje razumijevanje trenutačno
dostupnih metoda za probir i/ili kvantificiranje antimikrobnog učinka
ekstrakta ili čistog spoja za njegovu primjene u ljudskom zdravlju,
poljoprivredi i okolišu. Stoga su u ovom pregledu detaljno razmotrene
tehnike za procjenu in vitro antimikrobne aktivnosti.
3. Agar
Ispitivanje difuzijom diska u agaru razvijeno 1940. godine i službena je
metoda koja se koristi u mnogim kliničkim mikrobiološkim
laboratorijima za rutinsko testiranje osjetljivosti na antimikrobne tvari.
Danas Institut za kliničke i laboratorijske standarde objavljuje mnoge
prihvaćene i odobrene standarde za ispitivanje bakterija i kvasaca. Iako
se sve izbirljive bakterije ne mogu točno testirati ovom metodom,
standardizacija je napravljena za testiranje određenih izbirljivih
bakterijskih patogena kao što su streptokoki, Haemophilus influenzae,
Haemophilus parainfluenzae, Neisseria gonorrhoeae i Neisseria
meningitidis. U ovom postupku, agar ploče se inokuliraju
standardiziranim inokulumom ispitivanog mikroorganizma. Zatim se
diskovi filter papira (promjera oko 6 mm) stave na površinu agara.
Petrijeve zdjelice se inkubiraju pod odgovarajućim uvjetima. Općenito,
antimikrobno sredstvo difundira u agar i inhibira klijanje i rast
ispitivanog mikroorganizma, a zatim se mjere promjeri zona inhibicije
rasta. Rezistencije testiranog mikrobnog soja, njegovi rezultati također
vode kliničare u odgovarajućem odabiru početnih empirijskih tretmana i
antibiotika koji se koriste za pojedinačne pacijente u određenim
situacijama. Štoviše, metoda difuzije na agar disku nije prikladna za
određivanje minimalne inhibitorne koncentracije (MIC), budući da je
nemoguće kvantificirati količinu antimikrobnog sredstva difundiranog u
agar medij. Ipak, može se izračunati približni MIC za neke
mikroorganizme i antibiotike usporedbom zona inhibicije s pohranjenim
algoritmima.
4. Disk-difuzijski test
Unatoč tome, disk-difuzijski test nudi mnoge prednosti u odnosu na
druge metode: jednostavnost, nisku cijenu, mogućnost testiranja
ogromnog broja mikroorganizama i antimikrobnih sredstava. Štoviše,
nekoliko studija pokazalo je veliki interes kod pacijenata koji boluju od
bakterijske infekcije za antibioterapiju temeljenu na antibiogramu
uzročnika. Ta je činjenica posljedica dobre korelacije između in vitro
podataka i in vivo evolucije. Prije standardizacije, metoda disk-difuzije
već je korištena za testiranje posakonazola na filamentozne gljive i
mikafungina. Trenutno se koristi standardizirani antifungalni disk-
difuzijski pristup za testiranje nedermatofitnih filamentoznih gljiva.
Gore navedene prednosti ove metode, uglavnom jednostavnost i niska
cijena, pridonijele su njezinoj uobičajenoj upotrebi za antimikrobni
pregled biljnih ekstrakata, eteričnih ulja i drugih lijekova. Nekoliko
prethodnih studija pokazalo je dobru korelaciju između vrijednosti MIC-
a određenih Etestom i onih dobivenih metodom razrjeđivanja bujonom
ili metodom razrjeđivanja agara. Ova se tehnika također može provesti
za istraživanje antimikrobne interakcije između dvaju lijekova. Za
proučavanje kombiniranog učinka dvaju antibiotika, Etest traka,
impregnirana prvim antibiotikom, stavlja se na prethodno inokuliranu
površinu agar ploče. Nakon jednog sata, traka se uklanja i zamjenjuje
drugom natopljenom drugim antibiotikom. Sinergija se otkriva
smanjenjem MIK kombinacije za najmanje dva razrjeđenja u usporedbi s
onom najaktivnijeg antibiotika testiranog pojedinačno. Također za istu
svrhu, trake Etest mogu se položiti na agar medij u obliku križa pod
kutom od 90° na sjecištu između ljuskica na odgovarajućim MIC-ovima
za testirani mikroorganizam. Zatim, nakon inkubacije, indeks frakcijske
inhibitorne koncentracije (FICI) može se izračunati pomoću sljedeće
formule:
∑ FICI = FIC(A) + FIC(B)
5.Difuzija u jažici
Metoda difuzije u jažici u agaru široko se koristi za procjenu
antimikrobne aktivnosti biljaka ili mikrobnih ekstrakata. Slično postupku
koji se koristi u metodi disk-difuzije, površina ploče agara inokulira se
širenjem količine mikrobnog inokuluma po cijeloj površini agara. Zatim
se aseptično sterilnom bušilicom ili vrhom probuši rupa promjera 6 do 8
mm i u jažicu se unese volumen antimikrobnog sredstva ili otopine
ekstrakta željene koncentracije. Zatim se ploče s agarom inkubiraju pod
odgovarajućim uvjetima ovisno o ispitivanom mikroorganizmu.
Antimikrobno sredstvo difundira u agar mediju i inhibira rast testiranog
mikrobnog soja.
9. Agar difuzija
Također poznata kao metoda kontakta s agarom, to je tehnika koja se
najmanje koristi. Uključuje prijenos difuzijom antimikrobnog agensa s
kromatograma na agar ploču prethodno inokuliranu testiranim
mikroorganizmom. Nakon nekoliko minuta ili sati kako bi se omogućila
difuzija, kromatogram se uklanja i agar ploča se inkubira. Zone inhibicije
rasta pojavljuju se na mjestima gdje antimikrobni spojevi dolaze u
kontakt sa slojem agara. Izravna bioautografija je najprimjenjivanija
metoda među ove tri metode. Razvijena TLC ploča se uranja u mikrobnu
suspenziju ili se raspršuje njome. Zatim se bioautogram inkubira na 25
°C tijekom 48 sati u vlažnim uvjetima. Za vizualizaciju rasta mikroba
često se koriste tetrazolijeve soli. Ove soli podvrgavaju se pretvorbi u
odgovarajući intenzivno obojeni formazan pomoću dehidrogenaza živih
stanica. P-Iodonitrotetrazolium violet je najprikladniji reagens za
detekciju. Te se soli raspršuju na bioautogram koji se ponovno inkubira
na 25 °C tijekom 24 sata ili na 37 °C tijekom 3-4 sata. Mueller Hinton
bujon s dodatkom agara preporučuje se da podlozi dobije dovoljno
tekućine da omogući najbolje prianjanje na TLC ploču i održava
odgovarajuću vlažnost za rast bakterija.
10. Bioautoografija
Izravna bioautoografija može se koristiti s gljivicama ili bakterijama. To
je najlakša tehnika za detekciju antifungalnih tvari, a također daje
dosljedne rezultate za gljivice koje proizvode spore kao što su
Aspergillus, Penicillium i Cladosporium. Za bakterije, sojevi Bacillus
subtilis, Staphylococcus aureus i Escherichia coli često se koriste za
identifikaciju antibakterijskih spojeva. Također poznata kao imerzijska
bioautoografija, hibrid je obje prethodne metode. TLC ploča je
prekrivena rastaljenim zasijanim agar medijem. Kako bi se omogućila
dobra difuzija testiranih spojeva u agar medij, ploče se mogu staviti na
nisku temperaturu nekoliko sati prije inkubacije. Nakon inkubacije pod
odgovarajućim uvjetima, ovisno o ispitivanom mikroorganizmu, može
se izvršiti bojanje tetrazolijevom bojom. Kao i izravna bioautoografija,
ova se metoda može primijeniti na sve mikroorganizme. Sve u svemu,
TLC-bioautografija je jednostavna, učinkovita i jeftina tehnika za
razdvajanje složene smjese, au isto vrijeme lokalizira aktivne sastojke na
TLC ploči. Stoga se može izvoditi iu sofisticiranim laboratorijima iu
malim laboratorijima koji imaju pristup samo minimalnoj opremi. Iako
ima sofisticiranu on-line tekućinsku kromatografiju visoke učinkovitosti
povezanu bioanalizu, koja postaje sve popularnija kao metoda izbora za
konačno čišćenje ekstrakcijskih frakcija za dobivanje čistih spojeva, TLC-
bioautoografija nudi brzu tehniku za probir velik broj uzoraka za
bioaktivnost i u frakcioniranju prema bioaktivnosti. Može se koristiti za
detekciju antimikrobnih sredstava u uzorcima okoliša i hrane, kao i za
traženje novih antimikrobnih lijekova. Metode razrjeđivanja
najprikladnije su za određivanje MIK vrijednosti jer daju mogućnost
procjene koncentracije ispitivanog antimikrobnog sredstva u agaru ili
bujon mediju. Za kvantitativno mjerenje in vitro antimikrobne aktivnosti
protiv bakterija i gljivica može se koristiti metoda razrjeđivanja bujona ili
agara. Zabilježena vrijednost MIC definirana je kao najniža koncentracija
ispitivanog antimikrobnog sredstva koja inhibira vidljivi rast testiranog
mikroorganizma. Postoje mnoge odobrene smjernice za ispitivanje
osjetljivosti na antimikrobna sredstva razrjeđivanja izbirljivih i
neizbirljivih bakterija, kvasaca i filamentoznih gljivica. Najpriznatije
standarde daju CLSI i Europsko povjerenstvo za ispitivanje osjetljivosti
na antimikrobne lijekove (EUCAST). Kao što je savjetovano, ove
smjernice pružaju jedinstveni postupak za testiranje koji je praktičan za
izvođenje u većini kliničkih mikrobioloških laboratorija. Razvoj takvih
metodoloških standarda ne jamči kliničku važnost takvog testiranja.
Unatoč tome, omogućuje provođenje biološke analize u
standardiziranom pristupu kako bi se procijenila klinička važnost
rezultata.
16. Literatura