Rasmus Holmboe Dahl 15.

januar 2015
Enzymers regulering, VDB

Enzymers regulering lavet ud fra 2. udgave af ”Biokemi” af Vibeke Diness Borup. Pensum for 4. semester biokemi.

Forkortelser Kommentar
A Aktivering Benyttes under allosterisk, kovalent og øvrig regulering
I Inhibion, hæmning
IE Inducerbart enzym Via øget syntese
KI Kompetitiv inhibion
Komp Inhibition via kompartmentisering Eksempelvis i mitochondriet eller cytosol
PI Produktinhibion
S Støkiometrisk kontrol
SA Substrat aktivering eller produkt disinhibion
Ø Øvrig

Glykolyse og Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer

pentosephosphatvejen,
kap 10
Glukosetransportere
GLUT4, myocytter,
adipocytter
Glykolysen
Glukokinase (hexokinase
IV), hepatocytter, 𝛽-celler,
enterocytter og
hypothalamus
Glukokinase regulatorisk
protein (GKRP)
Hexokinase I-III,
ekstrahepatiske væv
PFK1, lever og muskel
FBPase1
ØA: insulin, AMP via AMPK GLUT4 rekrutteres til membranen.
I: fedt-acylCoA Komp: GKRP - GK-GKRP-komplekset holder glukokinasen på
IE: Syntese via insulin. en inaktiv form inde i cellekernen.
A: F6P ØI: Glukose, F1P - Se uddybning 13.5, s. 240.
- F6P øger GKRPs affinitet for glukokinasen.
PI: G6P
I: ATP, citrat, 𝐻 + IE: Syntese via insulin. - Committed step
A: AMP, F2,6BP - ATP/AMP-ration = energi i cellen
- ↑citrat = fedtsyresyntese (s. 252)
- 𝐻 + fra anaerob glykolyse
- F2,6BP ophæver ATPs hæmmende virkning.
I: AMP, F2,6BP IE: Syntese via glukagon - Reciprok regulering med PFK1 (𝐻 + undtaget)

1 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
A: ATP, citrat
PFK2 KI: Adrenalin, glukagon OBS: i myocytter vil kun adrenalin have
KA: Insulin betydning.
FBPase2 KI: Insulin - Samlet i et fælles PFK2/FBPase2-kompleks →
KA: Adrenalin, glukagon reciprok hormonel regulering → danner F2,6BP.
- PFK2 aktiv ved dephosphorylering.
- FBPase2 aktiv ved phosphorylering.
Pyruvatkinasen, lever I: ATP, alanin I: Phosphorylering via IE: Syntese via insulin. - Alanin fra glukose/alanin-cyklus.
A: F1,6BP, F1P glukagon - ATP fra 𝛽-oxidation.
A: Dephosphorylering - F1,6BP feed forward pga. DHAP og G3P
via insulin (PP1) nedbrydes til methylglyoxal.
- F1P se s. 171, ekstra 10.8.
Pyruvatkinasen, muskel I: ATP
2,3BPG i erytrocytter
Hæmoglobinets ØI: ↑ 𝑝𝑎𝐶𝑂2 , ↑ 𝑇𝑒𝑚𝑝, ↑2,3BPG - Se s. 168.
iltbindingskurve ØA: ↑pH - Ved hæmning menes her højreforskydning og
vice versa.
Galaktose
Galaktokinase PI: Galaktose1P Se galaktosæmi I
Pentosephosphatvejen
Glukose-6-phosphat PI: NADPH - Pentosephosphatvejen kører under kolesterol-
dehydrogenase IE: Syntese via insulin. og fedtsyre-syntese.
Citratcyklus, kap 11 Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer

Omdannelse af pyruvat
PDH KI: Phosphorylering PI: AcetylCoA, 𝑁𝐴𝐷𝐻 + 𝐻 + - Committed step
via PDH-kinase SA: CoASH, 𝑁𝐴𝐷 + - Husk: PI og SA.
KA: - PDH og PC er reciprokt reguleret af acetylCoA
Dephosphorylering via → styrer forholdet imellem oxaloacetat og
PDH-fosfatase acetylCoA i TCA .
PDH-kinase I: Pyruvat, ADP
A: AcetylCoA, NADH,
ATP
PDH- phosphatase ØA: Insulin, 𝐶𝑎2+
Pyruvatcarboxylase A: AcetylCoA - 𝛽-oxidation (faste): ↑acetylCoA → oxaloacetat
til glukoneogenese, acetylCoA til ketonstof.
- I arbejdende muskel

2 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
Citronsyrecyklus Ingen kovalente!
Citratsyntase PI: citrat - Citrat er kompetetiv hæmmer af citratsyntasen.
SA: oxaloacetat Forløber derfor kun ved høj oxaloacetat/citrat-
ratio.
Isocitrat DH I: ATP, NADH -Vigtigste kontrolpunkt, hastighedsbegrænsende.
A: ADP, 𝑁𝐴𝐷 + , 𝐶𝑎+ - 𝐶𝑎2+ pga. arbejdende muskler.
- ATP/ADP og 𝑁𝐴𝐷𝐻/𝑁𝐴𝐷 + = energi i cellen.
- Energioverskud → øget citrat → citrat ud i
cytosol → fedtsyresyntese
𝛼-ketoglutarat DH A: 𝐶𝑎+ , ADP PI: Succinyl-CoA, NADH, GTP, - Samme type enzym som PDH → PI
ATP - 𝐶𝑎2+ pga. arbejdende muskler.
- Energiforhold: ATP/ADP
Malat DH S: 𝑁𝐴𝐷 + /𝑁𝐴𝐷𝐻-ratio - Kører modsat ved alkoholindtag.
IE: Syntese via insulin.
Oxidativ fosforylering, Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
kap 12
Oxidativ fosforylering
Kompleks I: NADH:Q- ØI: rotenon (insektmiddel), amytal - Blokerer alle 𝐹𝑒𝑆 → 𝑄.
oxidoreduktase (anæstesi), piericidin A - Respirationskæden kan stadige køre ved
(antibiotikum) tilsætning af succinat via kompleks II
(succinat:Q-oxidoreduktase)
Kompleks III: ØI: antimycin A (antibiotikum) - Vitamin C som modgift.
𝑄𝐻2:cytokrom c-
oxidoreduktase
Kompleks IV: cytokrom c- Hæmmere: cyanid, azid, - Binder til hæm a i cyt a (2 elektronbærer i
oxidase kulmonooxid. komplekset)
- Cyanid og kulmonoxid binder også til hæm b i
hæmoglobin.
- Methylenblåt som modgift.
Kompleks V: 𝐹𝑜 𝐹1 - Respiratorisk kontrol: 𝐹𝑜 er kun - Reguleres ved respiratorisk kontrol
ATPase, ATP-syntase åben for protontransport, når 𝛼𝛽- - Respirationskæden reguleres ved ATP/ADP-
dimerens L-konformationer binder rationen (energiforhold), der desuden regulerer
𝐴𝐷𝑃 + 𝑃𝑖 . mange andre enzymers aktivitet.
Afkoblingsenzymer: UCP1-5, - Afkoblingsenzymer hæmmer indirekte ved at
UCP1-5, ↑bilirubin, ↑salicylsyre, sænke protongradienten over den indre
2,4-dinitrophenol, pentaklorofenol membran.
Hæmmere: oligomycin blokerer

3 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
𝐹𝑜 , arsenat indbygges til ustabilt
produkt i stedet for 𝑃𝑖 .
ATP:ADP-translokase ØI: Atractylosid, bongkreksyre
Glykogenese, Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
glukogenolyse og
glukoneogenese, kap 13
Glukogenese og - UDP-G-PP ureguleret (ikke committed step)
glukogenolyse
Glykogensyntase (GS), b-form: A: G6P I: Phosphorylering via IE: Syntese via insulin OBS: den muskulære regulering fås ved at se
lever og muskel PKA, GSK3, PKC, bort fra glukagon.
CaMK
A: Dephosphorylering - GS: aktiv dephosphoryleret a-form og inaktiv
via PP1 phosphoryleret b-form.
PKA, GSK3, PKC, CaMK ØI: Insulin - GS indeholder 9 seriner til phosphorylering.
ØA: Glukagon, adrenalin - Inhibitor-1 aktiveres af kinaserne.
PP1 I: glukogen- ØI: Glukagon, adrenalin - Glukogenphosphorylasen binder og inaktiverer
phosphorylase, inhibitor-1 ØA: Insulin PP1, men giver denne fri ved binding af glukose.
A: G6P
Glykogenphosphorylase, Lever a-form: I: Dephosphorylering OBS: den kovalente muskulære regulering
lever og muskel I: Glukose via PP1 fås ved at se bort fra glukagon.
A: Phosphorylering
Muskel b-form: via - AMP-dannes af myokinasen i myocytter:
I: AMP (aktiverer b-form) phosphorylasekinase 𝐴𝑀𝑃 + 𝐴𝑇𝑃 ⇌ 2𝐴𝐷𝑃
A: ATP, G6P
Phosphorylasekinase ØA: Glukagon, adrenalin, 𝐶𝑎2+ - Adrenalin i hepatocytten → 𝐶𝑎2+ -frigivelse →
aktivering af CaMK.
Glukoneogenese S: 𝑁𝐴𝐷 + /𝑁𝐴𝐷𝐻-ratio - Kører modsat ved alkoholindtag.
Pyruvat carboxylase Se under citratcyklus
Malat DH Se under citratcyklus
PEPCK IE: Syntese via glukagon, kortisol
FBPase1 Se under glykolyse
G6Pase IE: Syntese via glukagon, kortisol
Alanintransportere ØA: Glukagon - Aktivering af alanintransportere til alanin-
glukose-cyklus.
Aminotransferaser og IE: Syntese via kortisol - Under faste vil øget optagelse af aminosyrer
ureacyklusenzymer fra nedbrudt muskelprotein føre til øget
nitrogenudskillelse.

4 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl
Syntese af fedtsyrer og
triacylglycerol, kap 14
Syntese af fedtsyrer
ATP-citrat lyase
AcetylCoA carboxylase
(ACC)
Fosfataser til ACC
(primært PP2)
Kinaser til ACC
(primært AMPK)
Fedtsyresyntasen
Oxidation af fedtsyrer og
metabolisme af
ketonstoffer, kap 15
Lipolyse i fedvæv
Adipose triglyceride lipase
(ATGL)
Hormon sensitiv lipase
(HSL)
Constitutive gene
identification 58 (CGI-58)
Perilipin
Fedtsyrexoidation
Carnitin-palmitoyl
15. januar 2015
Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
- ↑Glukose → ↑ChREBP (carbohydrate response
element binding protein)
IE: Syntese via insulin. - Spalter cytosolært citrat fra malat/citrat-
antiporteren til acetylCoA i fedtsyresyntesen.
I: Langkædede I: Phosphorylering via IE: Glukagon/insulin-ratio: - Hæmning fra palmitoylCoA kan ses som en
aktiverede fedtsyrer kinaser Kulhydratrig kost (insulin) → produktinhibition for hele fedtsyresyntesen.
(palmitoylCoA) A: Dephosphorylering opregulering, fedtrig kost → - Polymerform → øget aktivitet.
A: Citrat via fosfatase nedregulering - Citrat og palmitoylCoA hhv. fremmer og
(adaptorisk regulering) hæmmer polymerisering.
ØA: Insulin
ØA: Glukagon, adrenalin, AMP
IE: Syntese via insulin.
Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
- se s. 272
A: CGI-58 IE: Syntesen øges af kortisol, især - Noradrenalin + adrenalin → phosphorylering af
perifert fedtvæv → Cushing syndrom HSL og perilipin → HSL-P til membran + CGI-
A: Phosphoryleret I: Dephosphorylering 58 frit → aktiv ATGL + HSL.
perilipin via insulin - MGL er ikke hastighedsbestemmende
A: Phosphorylering
via adrenalin og
noradrenalin
ØI: Perilipin binder CGI-58 - Bundet til uphosphoryleret perilipin, frigives
fra phosphoryleret perilipin.
- Dephosphorylering IE: Syntesen hæmmes af 𝑇𝑁𝐹𝛼 - 𝑇𝑁𝐹𝛼 fører til øget basal (ustimuleret)
via insulin lipolyse.
- Phosphorylering via
adrenalin og
noradrenalin
I: malonylCoA - Committed step
5 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
transferase I (CPTI) - MalonylCoA benyttes i fedtsyresyntesen.
- HSL og ATGL i adipocytter er begrænsende
for fedtsyreforbrændingen.
- Muskler har ACC2, men ikke fedtsyresyntese
→ malonylCoA er allosterisk inhibitor → i
muskler foretrækkes glukose som brændstof.
Lipoproteinpartikler, kap Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
17
Kolesterolmetabolisme
HMG-CoA reduktase ØI: AMP, glukagon, kortisol, - HMG-CoA reduktasen er committed step i
statiner, frit kolesterol kolesterolsyntesen.
ØA: Lavt kolesterol,
thyroideahormon
IE: Syntese via insulin
Syntese af LDL-receptoren ØI: Frit kolesterol fører til nedsat - Står for cellens kolesteroloptag via
transkription af LDL-genet. receptormedieret endocytose.
AcylCoA:cholesterol- ØA: Frit kolesterol - Øget frit kolesterol fører til øget forestering af
acyltransferase (ACAT) kolesterol.
- ACAT har kun umættede fedtsyrer som
substrat; fedtrig kost → ↓kolesterolester, ↓LDL-
receptorer. Uheldigt ved aterosklerose!
Lipoproteinpartikler
Lipoproteinlipasen (LPL) ØA: ApoCII aktiverer LPL. - LPL omdanner VLDL → IDL og kylomikron
IE: Insulin øger syntesen af LPL i → kylomikronrest.
fedtvæv, men ikke i muskelvæv. - Den hepatiske lipase (HL) er aktiv uden
apoCII.
- Myocytters LPL har højere affinitet for TAG
end adipocytters → fordeling TAG korrekt under
faste eller arbejde.
Metabolisme af Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
aminosyrernes
nitrogengrupper/
ureacyklus, kap 18
Ureacyklus
Carbamoylphosphatsyntase A: N-acetylglutamat - Feed forward mekanisme → ophobet nitrogen
I (CPSI) (NAG) er giftigt (ammoniak s. 340)
- Energioverskud og ophobning af glutamat →

6 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
NAG → ureacyklus
NAG-syntase ØA: Arginin 𝑁𝐴𝐺 𝑠𝑦𝑛𝑡𝑎𝑠𝑒
- 𝐴𝑐𝑒𝑡𝑦𝑙𝐶𝑜𝐴 + 𝑔𝑙𝑢𝑡𝑎𝑚𝑎𝑡 → 𝑁𝐴𝐺
- ↑Arginin → ↑CPSI, da arginin spaltes til
ornitin, der skal kobles med et nyt carbamoylP.
Metabolisme af Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
aminosyrernes
carbonskelet, kap 19
Andet
Tyrosinase ØI: Ophobet phenylalanin OBS: Dette gælder for Følings sygdom
(phenylketonuri)
- Defekt phenylalanin monooxygenase →
↓tyrosin + ↓tyrosinase aktivitet → ↓melanin →
lav pigmentering
Metabolisme af Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
nukleotider, kap 20
Purinsyntese
PRPP-syntasen I: ADP, GDP ØA: Enzymet kræver tilstedeværelse - PRPP benyttes i salvage reaktioner, syntese af
af 𝑃𝑖 . pyrimidinnukleotider og i syntese af 𝑁𝐴𝐷 + →
KI: ADP ikke committed step.
Amidophosphoribosyl- I: AMP, GMP - Committed step
transferase PI: IMP - Koncentrationerne af især IMP, men også
SA: PRPP AMP og GMP er så lave, at de har lille
betydning.
- Da den fysiologiske 𝐶𝑃𝑅𝑃𝑃 < 𝐾𝑚 er enzymet
ikke mættet og derfor under støkiometrisk
kontrol.
Adenylosuccinat syntetease I: AMP Se kommentar til GMP-syntetasen - Hæmmes af det senere produkt.
IMP DH I: GMP
GMP-syntetase - Reciprok brug af nukleotider til
syntese af AMP og GMP (GTP i
adenylosuccinat syntetase og ATP i
GMP-syntetasen) sikrer en ligelig
syntese af disse.
Pyrimidinsyntese
CPSII I: UTP
A: PRPP, ATP

7 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
Orotidylat decarboxylase KI: UMP
CTP-syntetase ØI: CTP
Genbrug puriner Hæmmes blot af deres produkt
Hypoxantin-guanin- I: IMP, GMP
phosphoribosyltransferase
(HGPRTase)
Adenin-phosphoribosyl- I: AMP -Adenin er ikke et nedbrydningsprodukt fra
transferase (APRTase) purin (da purinnukleosidphosphorylasen er ikke
er specifik for adenosin), men dannes i
forbindelse med syntese af polyaminer.
Adenosinkinase I: AMP
Deoxyguaninkinase I: dGMP
Deoxyribonukleotid
syntese
Ribonukleotidreduktase Overordnet bindingssted - Kun allosterisk regulering
I: dATP - Ribonukleotidreduktasen reguleres af to vigtige
A: ATP allosteriske bindingssteder.

Substratspecifik regulering (start med ATP, derefter CUGA)

𝐴𝑇𝑃: 𝐶𝐷𝑃 → 𝑑𝐶𝐷𝑃 → 𝑑𝐶𝑇𝑃
𝐴𝑇𝑃: 𝑈𝐷𝑃 → 𝑑𝑈𝐷𝑃 → 𝑑𝑈𝑇𝑃 → 𝑑𝑈𝑀𝑃 → 𝑑𝑇𝑀𝑃 → 𝑑𝑇𝑇𝑃
𝑑𝑇𝑇𝑃: 𝐺𝐷𝑃 → 𝑑𝐺𝐷𝑃 → 𝑑𝐺𝑇𝑃
𝑑𝐺𝑇𝑃: 𝐴𝐷𝑃 → 𝑑𝐴𝐷𝑃 → 𝑑𝐴𝑇𝑃

8 af 9
 Rasmus Holmboe Dahl 15. januar 2015
Leverens Allosterisk regulering Kovalent regulering Anden regulering Kommentarer
afgiftningssystem og
ethanolomsætning, kap
20
Ethanolomsætning - Ethanol omsætning fører til ↑𝑁𝐴𝐷𝐻 og ↓𝑁𝐴𝐷 + .
- Hastigheden reguleres kun af 𝑁𝐴𝐷 + til rådighed, da 𝑁𝐴𝐷𝐻 + 𝐻 + dannelsen overstiger respirationskædens kapacitet.
- 0.1g ethanol/kg vægt/time. Altså 6g/time for en 60kg person svarende til 1/2 genstand.
- Er ikke reguleret af negativt feedback som de øvrige metaboliske reaktioner → hæmmet stofskifte.
ADH, mikrosomalt ØA: Ved langvarig ethanolindtagelse - Fører til effektiv ADH omsætning i
ethanoloxiderende system opreguleres MEOS grundet en alkoholikere → ↑acetaldehyd → ↑ROS,
(MEOS), CYP2E1, uspecifik ethanolstimuleret udvidelse ↑interkation med fosfolipider og proteiner,
CYP3A4, CYP1A2. af sER. ↓VLDL-dannelse (↓apoB100), ↑fibrose
(↑kollagensyntese).
- Har lavere affinitet end ADH ovenfor og virker
derfor kun ved høje mængder ethanol.
Hæmmede reaktionsveje Glykolyse: Glyceraldehyd 3P DH, glycerol 3P DH
Pyruvat: PDH, laktat DH
𝛽-oxidation: CPTI, Hydroxyacyl-CoA DH
Citratcyklus: Malat DH, isocitrat DH
TAG-transport: ApoB100-syntese
Stimulerede reaktionsveje Pyruvat: laktat DH
Citratcyklus: Malat DH
TAG-syntese: glycerol 3P DH
Ketonstoffer: ↑ketonstoffer pga. ↓TCA, ↑𝛽-oxidation og ↓omdannelse i ekstrahepatiske væv grundet ↑acetat.

9 af 9