Professional Documents
Culture Documents
Citogenetika 2
Citogenetika 2
Hromozomske mutacije
U
nekim
udbenicima
su
hromozomske
mutacije
nazvane
makromutacijama (a genske mikromutacijama), a to nije korektna podela. (ova
podela je gledana samo sa jednog aspekta; hromozomske mutacije zaista obuhvataju vie
delova genoma nego neka takasta mutacija i na taj nain one mogu da se posmatraju kao
mikro i makro; meutim, hromozomska mutacija nekada moe da ne ostavi posledicu, a
takasta mutacija moe biti pogubna i biti okida za mnoge probleme; prema tome nije
adekvatna podela na mikro i makro mutacije). Hromozomske mutacije se odnose na
ili A3). Meutim, jajne elije mogu da imaju kombinacije, ili da budu sa po jednim
hromozomom, ili da budu u kombinacijama A1A2,A1A3 ili A2A3. Sada, u
kombinaciji sa mukim gametima mogu da nastanu normalni diploidi ili nastaju
razliiti trizomici. Jedina posledica toga je razliita morfologija aura.
Meutim, kod viih sisara to nije tako. Ono to se donekle tolerie u
humanom razviu su aneuploidije autozoma 21, 18 i 13. Ovo su jedine tri
aneuploidije autozoma koje preivljavaju roenje. Pri tome osobe sa Daunovim
sindromom (trizomija-21) najbolje preivljavaju, ali imaju sniene odreene
funkcionalne i mentalne kapacitete. Meutim, Edvardsov sindrom (trizomija-18) i
Patau sindrom (trizomija-13) su na vrlo kratkom vremenu preivljavanja od roenja.
To ne znai da drugi automzomi oveka nisu zahvaeni aneuploidijama, ve
se eliminiu vrlo rano, poto su oteenja toliko teka da osobe ne mogu da
preive ni ovoliko koliko preivljavaju oni sa Edvardsovim i Patau sindromom.
Dakle, fenotipske posledice zavise od toga koji deo genoma je zahvaen.
Videemo posle da pri nekim malim strukturnim promenama fizike posledice
mogu da budu vrlo velike itd. Razvie je posledica balansiranih dogaaja. I u
sluaju ovih strukturnih promena na 21,18,13 hromozomu to je donekle dozvoljeno.
to se tie trizomije 21, videemo i jedan sluaj naslednog Daunovog sindroma
koji je mnogo rei. Ovaj sluaj aneuploidije, nastao nerazdvajanjem hromozoma u
mejozi, je povezan sa starou majke. Starost i starenje tog pula enskih gameta i
izloenost odreenim mutagenima doprinosi tome da postoji pozitivna korelacija
godina enskog roditelja i uestalosti nastanka Daunovog sindroma. To ne znai
da e svaka ena sa 45 godina roditi dete sa Daunovim sindromom, a da nijedna
sa 18 nee. Radi se o statistikoj korelaciji, tj. verovatnoi da e se desiti mutacija.
U somatskim elijama takoe
moe da se zapazi aneploidija.
Interesantan je sluaj u humanoj
blastocisti. Dakle, ljudi mogu da budu
mozaici, kada se pogledaju somatske
elije. Mogu da budu, ne po kariotipu
prosto nasledno, nego mozaici npr. za
XY hromozom (pa kaemo polni
mozaik). Nastanak takvog polnog
mozaika: gde imamo neke elije koje
sadre samo X hromozom a neke i X i
Y; posle oploenja imamo nepravilno
razdvajanje hromozoma pri emu jedna
linija elija dobija Y hromozom, a druga
linija ga gubi. Neki od primera su i na
Drosophila, zato to, u zavisnosti od
toga da se na nekom hromozomu
nalazi neka mutacija ili ne, oni e se u tim elijama gde je taj hromozom doao
normalno ispoljiti, a u drugim ne. To je nekada zbunjivali genetika savetovalita.
Drugi tip numerikih hromozomskih aberacija, onih koji zahvataju promene u
broju celih setova hromozoma, su euploidije. Prvi tip ovih aberacija je svoenje
kompletnog diploidnog hromozomskog seta na pola (to podsea na haploidnost,
ali ovi pojmovi se razlikuju jer haploidnost nastaje normalnim razviem) i to su
monoploidije (N). Dakle, kada postoji samo jedan set hromozoma. Osim njih
postoje i poliploidije, kada se kompletan hromozomski set nalazi u viku, u
neparnom (3N) ili parnom stanju (4N).
Monoploidije
Ima ih manje u populaciji. One su karakteristike nekih vrsta, kao npr. pela,
trutova i nekih mravi. Monoploidije su doivele pravi procvat u hortikulturi. Dakle,
takva manipulacija genoma gde se on svede na svoju polovinu je izuzetno
pogodna u hortikulturi. Tako moemo da pravimo monoploide i da ih kombinujemo
sa nekim drugim, itd. Dakle, osnova hortikulture je upravo stvaranje monoploidnih
biljaka iz kulture tkiva. Jedan od naina je da dobijemo minoploidne biljke od
polena. Tako to haploidni polen zasejemo na agaru sa hormonima rasta, i
dobijeni monoploidni embrion se razvija u biljku. Jo jedan od naina da se dobije
monoploidna elija je normalno, od jednog monoploida koji mejozom daje dve
monoploidne elije. Da bi duplirali taj genom, elijska deoba se ne puta do kraja
ve se zaustavlja, i onda elija ima oba seta hromozoma zajedno. To je pravljenje
diploida od monoploida, zahvaljujui kohlicinu. Kolhicin se dodaje u elije u
metafazi ili anafazi pa tako inhibira stvaranje deobnog vretena, i hromatide ostaju
zajedno u jednoj eliji.
Poliploidije
E sada se tu mogu praviti kombinacije. Mogu se udvajati setovi genoma iste
vrste i to je autopoliploidija. Od jednog diploida moe nastati triploid ili tetraploid.
Ono to je ree i tee za odravanje je kombinacija setova genoma razliitih vrsta,
alopoliploidija. Meutim, takva vrsta hibridizacije se u evoluciji deava. Od dva
diploida nastaje tetraploid. Poliploidije mogu biti neparne ili parne.
Generalno, nastanak autopoliploida je usled nerazdvajanja hromozoma u
mejozi ili usled oploenja sa dva spermatozoida. Pogledajte kako nastaje triploidni
zigot. Spajanjem diploidnog i monoploidnog gameta imamo utrostrueni svaki par
hromozoma i to je triploidni zigot. Ono to je bitno jeste zato su poliploidi veinom
sterilni, u ovom sluaju autopoliploidni triploidi. To je zato to, kada triploidna
jedinka ue u mejozu, dolazi do stvaranja nebalansiranih gameta, odnosno mala
je verovatnoa da e lepo na isti pol otii ovi univalentni i da e se sklpoiti
kompletna ta hromozomska struktura onog triploida od koga su nastali. Meuti, u
komercijalne svrhe je jako lepo to su oni sterilni tako da imamo razliite vrste voa
i povra koje nemaju semenke, i one imaju neku vrstu komercijalne vrednosti
(banane, jabuke, ljiljani itd.).
Neparna ploidija stvara veu sterilnost. Prana ploidija stvara jo vie
hromozomskih setova (tetraploidi, oktaploidi), i kod njih tokom mejoze bivalenti
daju kompletne gamete, jer to su balansirani parni genotipovi. Postoje tri naina
kako hromozomi odlaze na razliite polove i samim tim daju gamete koji su
blansirani. Prema tome mogu da se lake odravaju i imaju visoku komercijalnu
prednost. Na slajdu su prikazani vea oktaploidna i manja tetraploidna jagoda. To
je karakteristino za poliploidije; vie hromozoma, vie produkata odgovarajuih
gena i bie vei plod.
Alopoliploidi nastaju ukrtanjem srodnih vrsta i udvajanjem broja
hromozoma kod hibrida. Ako su vrste srodnije ukrtanje e biti uspeinije. Oni su
retko fertilni, jer nastaju nebalansirani gameti. ak kaemo da hromozomski setovi
koji potiu od razliitih vrsta nisu homologi ve su homeologi. Ono to je mogue
uraditi jeste vetaki izazvati fuziju diploidnih genoma, zaustavljajui elijsku deobu
kohlicinom (to se koristi u hortikulturi). U ovoj alopoploidiji, koja stvara retke hibride,
ono to je ee je amfidiploidija, gde postoje dva diploidna roditelja od kojih
nastaje jedan tetraploid. Amfidiploidi mogu stvarati fertilne gamete, pa je tako
potpuno prirodno nastala Nicotiana tabacum, sadanja vrsta duvana. Ona je
jedan od primera brzog nastanka nove vrste iz dve vrste, ima 48 hromozoma i
predstavlja amfidiploid.
Na slajdu je dato hipotetiki kako moe da se odrava ta novonastala
hibridna sorta. Imamo vrstu 1 i vrstu 2, i posmatramo da su to setovi hromozoma a
(a1a1,a2a2,a3a3) i b (b1b1,b2b2). Oni formiraju odgovarajue gamete i dolazi do
stvaranja sterilnog hibrida jer su mu gameti nebalansirani. Ono to moe da se
dogodi, u evoluciji jako retko ali moe u kulturi, je da se duplira ovakav hibridni
hromozomski set i dalje je onda mogue dobijati balansirane gamete. I to je
amfidiploidija ili poliplidija parnog tipa. Primer je recimo kultivisani ameriki pamuk
koji ima 26 pari hromozoma koje je vrlo lako razlikovati, poto je 13 je velikih a 13
malih hromozoma. On je nastao fuzijom genoma vrste iz starog sveta (13 velikih
hromozoma) i amerike divlje vrste (13 malih hromozoma).
Bili bismo vrlo gladni da nema amfidiploidije roda Brassica. I na slici jedan
trougao gde strelice trougla oznaavaju broj haploidnih hromozoma koji je uao u
kombinaciju da bi se stvorile neke sorte. Tako su visinska slaica, uljana repica,
rotkva nastale kobinacijom genoma ovih drugih zelenia (kupus, keleraba, kelj,
brokoli).
Da li sada moemo tako da se igramo i da predvidimo kakav e biti fenotip iz
dva genoma? Ne, ne moemo predvideti da li e da se zadri kompletna fenotipska
karakteristika jedne vrste i kompletna fenotipska karakteristika druge vrste. Dakle,
kombinacija tih genoma je podlona kombinaciji razliite genske ekspresije, onda i
Delecije
Predstavljaju gubitak dela hromozoma koji moe da zahvati manje ili vee
delove hromozoma. One mogu da budu terminalne, ukoliko zahvataju krajeve
hromozoma (primer sa hromozom 5 humanog kariotipa kome nedostaje gornji
deo, i intersticijalne, kada nedostaje deo unutar hromozoma (primer na
hromozomu 11). Razliitim metodama obeleavanja moe da se vidi koji deo
nedostaje, tako to se daj deo oznai i onda se vidi da li je prisutan ili ne.
Korelacija izmeu toga da li delecija moe da izazove veliku promenu ili ne nije
direktna. Nekada mogu da nedostaju heterohromatinski delovi i da to nema neke
velike posledice. Meutim, postoje neke pravilnosti. Vii organizmi, naroito sisari
sa komplikovanijim razviem, tee podnose gubitak genetike informacije u nekim
delovima genoma, a s druge strane, neki nii organizmi podnose lake. To je neka
vrsta pravila.
Delecije, na citogenetikom nivou, mogu da se prepoznaju pomou petlji
(pomou politenih hromozoma) mejotikih hromozoma. Znate da u mejozi
homologi hromozomi moraju doi jedan naspram drugog, i ukoliko na hromozomu
nedostaje neki deo, onda je praktino na drugom homologom hromozomu deo u
viku. To nam citoloki ukazuje na prisustvo delecije. Ukoliko se na jednom
homologom hromozomu nalazi delecija i ako je u pitanju heterozigot i na onom
drugom nedelitiranom hromozomu se nalazi recesivni alel taj alel moe da se
ispolji fenotipski (jer je dominantni alel izgubljen delecijom). To se zove
pseudodominansa ili lana dominansa. Evo kako se to na ovim politenim
hromozomima moe videti. Na saljdu je prikazan deo politenog hromozoma kod
Drozophila-e i heterozigot je za tri mutacije (y,ac,sc). Te tri mutacije se ne
ispoljavalju normalno u recesivnom stanju. Ali ovde imamo situaciju da su
izgubljena sva tri ili samo dva lokusa na tom homologu, i tako se ispoljava
recesivna mutacija. To je iskorieno za
jedan drugi tip mapiranja hromozoma
razliit od onih regulacionih analiza. I
dobar deo genoma viih organizama je
mapiran
pomou
heterozigotnih
delecija. Ovo je jedan od primera gde je
pseudodominansa
iskoriena
za
mapiranje hromozoma. Prikazan je
region Drosophile dat prekopolitenih
hromozoma. Zeleno, uto i plavo su
regioni tri gena markera i moemo da
pratimo njhovo fenotipsko ispoljavanje. Oni su u heterozigotnom stanju, to znai
da e se ispoljiti ukoliko jenormalan ovaj (+)alel ili, ukoliko je on delitiran, ispoljie
10
Duplikacije
11
jednom homozomu ima tri segmenta 16A, na drugom ima samo jedan. Na slajdu
moemo da vidimo da taj Bd alel nastaje usled nejednakog crossing overa-a.
Beta globinska familija gena je poznata po tome da sadri puno gena i puno
segmenata koji su puno varijabilni. Ovo je primer da jedan od naina kako nastaju
te varijabine genske familije jesu duplikacije i delecije u genima za metaglobin.
Tada nastaju razliite varijante globina.
Duplikacije se smatraju jednim od najveih izvora evolutivne sloenosti. One
su obezbedile visoku varijabilnos i broj familija gena. Na slajdu je data skala
evolucije globinskog gena. Vidimo da su se stotinama miliona godina deavali
razliiti genetiki dogaaji (nizali su se duplikacije, transpozicije, ponovo
duplikacije...) i je dolazilo do uslonjavanja gena.
Translokacije
12
13
Inverzije
14
struktura nastaje jedan dicentrik koji puca i jedan acentrik (bez centromere) i takvi
produkti propadaju. I to su hromozomi sa delecijama.
I sada imamo situaciju hromozomske aberacije u spermatozoidima
heterozigota sa inverzijom na hromozomu 3. Na slajdu su prikazani hromozom 3
normalan i hromozom 3 invertovan. U jednoj takvoj mejozi nastaju razliiti
duplicirani, delecirani itd. hromozomi koji se vrlo jednostavno mogu ... na kariotipu.
Postoji jo jedan fenotipski efekat kao posledica translokacija i inverzija. To
je pozicioni efekat. Radi se o tome da, nakon to segmenti promene redosled ili
mesto, nije svejedno da li se to radi u blizini heterohromatinskih regiona
hromozoma ili euhromatinskih regiona. Ukoliko se promena desi u blizini
heterohromatinskih regiona onda neki strukturni lokus koji je dospeo blizu tog
heterohromatina moe biti prosto pod inhibicijom i u nekim elijama se takav lokus
ne eksprimira. Tako da, kada imamo u somatske elije u kojima je dolo do
poziciong efekta a u drugim elijama ne, onda imamo arenilo tog tkiva.
*ovo dalje nije toliko bitno, jer je profesorka rekla da emo to znati na molekularnoj
genetici
15