Kofaktory enzym

T. Kuera
(upraveno z J. Novotn)
 Kofaktory enzym
neproteinov, nzkomolekulrn sloka enzymu
ko-katalyztor potebn k aktivit enzymu
pomocn molekuly v enzymov reakci
holoenzym (aktivn) sestv z
apoenzymu (enzym bez kofaktoru neaktivn)
koenzym kofaktor

reakn partner substrtu

nebo reaktant regenerujc enzym
kofaktory
pevn vzan k enzymu prosthetick skupiny
regeneruj se v te reakci (isomerasy)
nebo reakc s jinm substrtem
voln vzan koenzymy
regeneruj se reakc s jinm enzymem
 anorganick
kovov ionty (Mg2+, Cu+, Mn2+, Zn2+, Fe2/3+, Mo)

organick
heterocykly, asto obsahujc fosft
mnoh obsahuj nukleotidovou st molekuly
asto vitaminy nebo jejich derivty
rozp. ve vod B, C, rozp. v tucch E, K
 Kofaktory podle reakce
oxidoreduktas
NAD, NADP, FAD, FMN, ubichinon, biopterin,
lipoamid, glutathion, FeS-klastry, hem, kovov ionty
transferas 1C skupin
THF, biotin, S-adenosylmethionin
transferas dalch uhlkatch zbytk
TDP, CoA
transferas dalch skupin
ATP, PAPS, UDP, CDP, kobalamin,
pyridoxalfosft
 Kofaktor Vitamn Enzymov reakce (pklad)
Thiamindifosft Thiamin, B1 Oxidan dekarboxylace
FAD, FMN Riboflavin, B2 Redoxn reakce (penos 2H)
NAD+, NADP+ Niacin, B3 Redoxn reakce (penos H)
Koenzym A Pantothenov Metabolismus FA (penos acylu)
kyselina, B5

Pyridoxalfosft Pyridoxin, B6 Transaminace, dekarboxylace AMK

Karboxybiotin Biotin, H, B7 Karboxylace (CO2)
Tetrahydrofolt kyselina listov, B9 Penos C1
Askorbt Vitamin C Hydroxylan reakce (kolagen)
Menachinon Vitamin K Penos karbonylov skupiny a
electron

Lipoamid Kyselina lipoov Penos elektron a acylov skupiny

Kobalamin Kobalamin, B12 Izomerace, penos methylu
NAD (NADP )
+ +
 Redoxn reakce NAD
RH2 + NAD+ NADH + H+ + R
(de)hydrogenace na vazb CO nebo CN
proton uvolnn do roztoku
nap. lakttdehydrogenasa (laktt + NAD+ pyruvt + NADH + H+)
FAD, FMN
 Vitamin B2

FMN ATP-dependentn fosforylace riboflavinu

FAD dal reakce s ATP penos AMP na FMN.
Redukce a reoxidace FMN a FAD
 Pklady enzym s FAD a FMN

acyl-CoA dehydrogenasa FAD

sukcintdehydrogenasa FAD
glycerol-3-fosftdehydrogenasa FAD

NADH-reduktasa (komplex I) FMN

 Koenzym Q
elektrontransportn etzec
lidsk CoQ10 (Q = chinonov (quinone) hlavika , 10 = poet
isoprenovch jednotek v hydrofobnm etzci

Redukovan forma Oxidovan forma

 ATP
+ P P adenosin (ADP)

anorganick fosft (Pi)

+ P adenosin (AMP)

anorganick pyrofosft (PPi)

transport chemick energie v buce

fosforylace v penosu signlu
 Pyridoxalfosft (PLP)
prosthetick skupina aminotransferas
kofaktor vech transaminanch reakc a nkterch
dekarboxylac a deaminac aminokyselin

Pyridoxine Pyridoxal-5-fosft (PLP) Pyridoxamin-5-fosft

(vit. B6)
 Thiaminpyrofosft (difosft)
TPP (TDP)
aktivn forma vitaminu B1 (prvn objeven vitamin)
obsahuje substituovan heterocykly pyrimidin a thiazol
reakce
reverzibiln tpen na vazb CC spojujc C=O skupinu se sousedn reaktivn
skupinou (obvykle karboxyl i OH)
penos 2C zbytk v transketolasovch reakcch v pentosafosftov drze
oxidan dekarboxylace -ketokyselin a vznik aldehyd (pyruvtacetaldehyd),
kofaktor multienzymovch komplex PDH, -KGDH, BCADH
 Tetrahydrofolt (THF)
Aktivn forma kyseliny listov (vit. B9)

donor 1C jednotek vech oxidanch rovn krom CO2

koenzym transferas

soust syntzy nukleotid a nukleovch kyselin

Tetrahydrofolt (THF)
 Koenzym A

penae acylu
thiol reaguje s karboxylem za vzniku thioesteru
nap. penos mastnch kyselin z cytoplasmy do mitochondrie
makroergick slouenina astnc se mnoha metabolickch reakc
(-oxidace MK, citrtov cyklus, biosyntzy lipid)
 S-adenosylmethionin

COOH
NH3+ CH
COOH CH2 NH2
NH3+ CH CH2H N
+ 2 N
CH2 + ATP H3C S C + HPO42- + H2P2O72-
O
CH2 N N
H3C S
OH OH
 Biotin
kofaktor v karboxylanch reakcch
prosthetick skupina acetyl-CoA karboxylasy a dalch
ATPdependentnch karboxylas
kovalentn pipojena k apoenzymu pes -aminoskupinu
lysinu.
 Kyselina lipoov
prosthetick skupina, penos vodku
a acylu
amidov pipojena k -aminoskupin
lysinu (lipoamid)
oxidace a dekarboxylace
-ketokyselin (PDH, -KGDH,
BCADH)
 Vitamin K
Fylochinon Vitamin K1
Vitamin K1 (fylochinon) rostlinn
pvod (kofaktor fotosystmu I)
Vitamin K2 (menachinon)
bakteriln pvod (tl. stevo, Vitamin K2
vbakterich velektron-
transportnm etzci)
K1 a K2 maj rzn funkce Menachinon
K1 sren krve
K2 metabolismus kost a cvnch
stn, bunn rst

Syntetick derivty vit.K

 Vitamin K - funkce
kofaktor jatern mikrosomln karboxylasy glutamtu
vznik karboxyglutamtovch zbytk v prothrombinu a
koagulanch faktorech VII, IX a X (posttranslan modifikace)

karboxylovan glutamt chelatuje Ca2+, to umouje vazbu

koagulanch faktor k membrnm

tvo vazebn msto pro Ca2+ tak nap. v osteokalcinu

 Tokoferol, vitamin E
-tokoferolchinon tvoen oxidac z -tokoferolu je
kofaktor v syntze mitochondrilnch nenasycench MK

Chromanolov kruh | hydrofobn alifatick postrann etzec

 Vitamin C
hydroxylace prolinu a lysinu (kolagen)
syntza kolagenu prolylhydroxylasa, lysylhydroxylasa a
lysyloxidasa obsahuje jako kofaktory Fe2+ a askorbt

metabolismus Tyr v mozku

 Ionty jako kofaktory
Ion Pklad enzymu

Cu2+ Cytochromoxidasa, katalasa

Fe2+ a Fe3+ Cytochromy, hydroxylasy

Mg2+ Glukosa-6-fosfatasa, hexokinasa,

DNA-polymerasa
Mn2+ Arginasa

Zn2+ Alkoholdehydrogenasa, DNA polymerasa,

karboanhydrasa
(Se) (Glutathionperoxidasa )

FeS proteins (Fe2S2) NADH dehydrogenasa, sukcintdehydrogenasa

 Ferredoxiny
FeS proteiny Fe2S2, Fe4S4, penos elektron
redoxn reakce v dchacm etzci
 Metaloporfyriny - hem
sloueniny odvozen od cyklickho
tetrapyrrolu - porfyrinu
komplexy s kovovmi ionty
hem Fe, transport O2, penos
elektron
chlorofyl Mg2+ (Zn2+), fotosyntza
 Metaloporfyriny - kobalamin
(vitamin B12)
chemicky nejsloitj vitamin
strukturn podobn hemu
chelatovanm kovem je Co
v lovku 2 metabolicky aktivn
formy: methylkobalamin a
deoxyadenosylkobalamin
reakce
cytoplasmatick methylace
homocysteinu na methionin
mitochondriln methylmalonyl-
CoA mutasov reakce
(methylmalonyl-CoA
sukcinyl-CoA)