Medicinska informatika

Prof.dr. Josipa Kern

josipa.kern@snz.hr
 O nazivu predmeta
predmeta....

Medicinska ili biomedicinska ili

zdravstvena informatika?
 Informacijski aspekt?

Objekt Disciplina
• Javnozdravstvena informatika
Populacija Javno zdravstvo
• Medicinska (klinička)
Individuum (pacijent) Klinička medicina
informatika
Individuum
(stomatološki Stomatologija • Stomatološka informatika
pacijent)
Biološki sustavi
(proteini, sekvence Molekularna biologija • Bioinformatika
aminokiselina i sl.)

Atom/molekula Nanomedicina • Nanoinformatika

 Informacijski aspekt?

Objekt Disciplina
• Javnozdravstvena informatika
Populacija Javno zdravstvo
• Medicinska (klinička)
Individuum (pacijent) Klinička medicina
informatika
Individuum
(stomatološki Stomatologija • Stomatološka informatika
pacijent)
Biološki sustavi
(proteini, sekvence Molekularna biologija • Bioinformatika
aminokiselina i sl.)

Atom/molekula Nanomedicina • Nanoinformatika

 IMIA o nazivlju
nazivlju...
IMIA – Međunarodna asocijacija za medicinsku informatiku
(International Medical Informatics Association)

IMIA WG – Radna grupa koja se bavi problemima i programima

edukacije predlaže sljedeći naziv:

BMHI – Biomedical and Health Informatics (Biomedicinska i

zdravstvena informatika)
Čitamo u novinama
novinama….

Zagreb News,
News veljača 2007
2007.
Nacional, veljača 2007.
Nacional, veljača 2007.
Kern J. Zdravstvo digitalnog doba. HCJZ 2005; 1(3)
http://www.hcjz.hr/clanak.php?id=12548
E-zdravstvo izazvalo kaos unošenja
podataka

Zdravstveni elektronički kartoni, koji su prije nekoliko dana

pušteni u promet, trebali bi liječnicima olakšati uvid u stanje
pacijenta te isto tako pacijentu skratiti putovanje od
laboratorija do ambulante.
ambulante

... do kraja godine očekuje se povezivanje i ordinacija

pedijatrije, ginekologije, stomatologije, te laboratorija i
ljekarne.

... informacije o pacijentu bit će potpuno tajne i zaštićene...

Izvor: Jutarnji list

list, 24
24.02.2007,
02 2007 Autor: II.Sučević
Sučević
E-zdravstvo izazvalo kaos unošenja
podataka

Podaci će se koristiti i u statističke svrhe te će se

prosljeđivati Hrvatskom zavodu za javno zdravstvo.

Doktor Z. L. iz Doma zdravlja Centar kaže da će

ovakav sustav uvelike olakšati proces liječenja. ...
t b vremena dok
treba d k se djdjelatnici
l t i i ne nauče
č služiti
l žiti ovim
i
programom. ... smanjit će se i vrijeme potrebno za
liječenje ... a pacijenti će se i naručivati preko
liječenje,
interneta ....
Izvor: Jutarnji list, 24.02.2007, Autor: I.Sučević
E-zdravstvo izazvalo kaos unošenja
podataka
.... neki liječnici
j ... smatraju
j da ovakav način ne
olakšava liječnički rad te da je uvođenjem “e-kartona”
u ordinacijama nastala zbrka.

Trenutačno vlada kaos zbog unošenja podataka u

sustav i to traje duže nego unošenje u kartone
kartone.

eđut , ... kada

Međutim, ada se susta
sustav u
uhoda,
oda, u
unošenje
oše je će ići
ć
brže ...
I
Izvor: Jutarnji
J t ji list,
li t 24.02.2007,
24 02 2007 AAutor:
t II.Sučević
S č ić
www.cezih.hr
 “Ako je fiziologija logika života,
patologija logika bolesti
onda je
medicinska informatika logika zdravstvene
štit .””Enrico Coiera
zaštite
 Sadržaj
• Pojam i zadaci medicinske informatike te njezina uloga u
medicinskom
di i k radu,
d zdravstvu
d t i znanstvenoistraživačkom
t i t ži čk
radu (Kern)
• Tokovi podataka u sustavu zdravstva (Kern)
• Medicinskoinformatičko nazivlje: vrste podataka,
šifriranje i klasifikacije, primjeri medicinskih klasifikacija
(Kern)
• Struktura
S i organizacija podataka u medicini/zdravstvu
/ –
elektronički medicinski/zdravstveni zapis (Božikov)
• Zaštita podataka i normizacija u medicinskoj informatici
(K )
(Kern)
• Zdravstveni informacijski sustavi, sustavi potpore
odlučivanju, telemedicinski sustavi, evaluacija sustava
(K )
(Kern)
 P j
Pojam i zadaci
d i medicinske
di i k
informatike
o a e
te njezina uloga u medicinskom radu,
zdravstvu i znanstvenoistraživačkom radu
 Medicinska informatika
informatika…
Medicina
M di i
Informacijske znanosti
Računalne znanosti
Kognitivne
og t e znanosti
a ost
Telekomunikacije

Medicinska
M di i k praksa
k
Istraživanje
Edukacija
 Medicinska informatika

...teorija
t ij i praksa
k iinformacijskih
f ij kih procesa u
medicini i zdravstvu

Medical Informatics
The field of information science concerned with the analysis and
dissemination of medical data through the application of computers
to various aspects of health care and medicine.
Year introduced: 1987
 Medicinska
M di i k jje iinformatika
f tik znanstvena
t
disciplina koja se bavi pohranjivanjem,
pretraživanjem,
t ži j razmjenom
j i optimalnom
ti l
uporabom biomedicinskih informacija,
podataka
d t k i znanjaj potrebnih
t b ih za rješavanje
j š j
problema i odlučivanje.

Medical informatics is the scientific field that deals with the storage,
storage retrieval
retrieval, sharing
sharing, and
optimal use of biomedical information, data, and knowledge for problem solving and decision
making.
http://www2.uiowa.edu/hinfo/academics/what_is_hi.html
 Sustavno, MI pokriva…
• UPRAVLJANJE INFORMACIJAMA (vođenje
( j
dokumentacije o bolesnicima u zdravstvenoj ustanovi, organizacija
rada i naručivanje bolesnika, izvještavanje, istraživanje, poslovanje
itd )
itd.)
• KOMUNICIRANJE (e-mail, internet, pretraživanje literature,
telemedicina, pristup bazama podataka o lijekovima, dozama,
interakcijama, bazama podataka medicinskih slika, virtualna
realnost itd.)
• NOVE TEHNOLOGIJE U KLINIČKOJ MEDICINI I
ISTRAŽIVANJU (digitalne tehnologije bazirane na x-zrakama,
svojstvima magneta, pozitronskoj emisiji (PET) i sl.)
U
Upravljanje
lj j iinformacijama…
f ij
 Informacijski sustav u liječničkoj
ordinaciji
di iji …

• Vođenje medicinske dokumentacije

• Poslovanje
• Evaluacija rada
• Istraživanje
• Izvještavanje
ješta a je
Komuniciranje….
 Internet u Hrvatskoj
• 47% stanovnika
80
70,3
70 67 5
67,5

starijih od 15 60
58,7 56,9

godina koristi 50 47

internet 40

30

20

10

• od toga 59% se 0
Austrija Estonija Hrvatska Litva Slovenija
odnosi na e-poštu
 E komuniciranje
E-komuniciranje
• Elektronička pošta (e
(e-pošta
pošta, e-mail
e mail,
email) – metoda sastavljanja, slanja,
spremanja i primanja poruka elektroničkim
putem

• Elektronička lista adresa (electronic

mailing list) – uporaba emaila da bi se
informacija poslala na više e-adresa
 E komuniciranje
E-komuniciranje
• Forum – usluga koju nudi web a koja
omogućava pisanje i razmjenu informacija
unutar ggrupe
p korisnika ((isti naziv se koristi
i za softver koji tu uslugu omogućava)

• Čavrljanje (Internet Relay Chat - IRC)

– sinkronizirano konferiranje, najčešće u
grupi (više-prema-više).
 E komuniciranje
E-komuniciranje
• World Wide Web ((www,, web)) – sustav međusobno
povezanih dokumenata (stranica) pripremljenih kao
hipertekst (hypertext), pretraživih na internetu

• Stranica na webu – dokument pisan ili dinamički

konvertiran u jezik HTML (Hyper Text Markup
Language), vidljiv uz pomoć preglednika (web browser) i
protokola HTTP (metoda prijenosa informacija)

• Website – pod-domena weba (kolekcija stranica)

 Hypertext
• Hypertext – način organiziranja materijala kako
bi se izbjeglo linearnost (ograničenja imanentna
tekstu).
)

• Hyperlink (poveznica) – navigacijski element

u tekstu, odnosno veza prema nekoj sekciji istog
dokumenta ili p
prema nekom drugom g dokumentu.
Klikom na poveznicu automatski se pristupa
traženoj sekciji ili traženom dokumentu.
E časopisi
E-časopisi
http://www.sciencedirect.com
 E časopisi
E-časopisi
Int. J. of Medical Informatics
Traženje literature

MeSH
Uvjeti
j p pretraživanja
j
 Složena pretraživanja
• Kombiniranje uvjeta za pretraživanje
• Primjeri složenog pretraživanja:
– “N
“Nađi
đi sve objavljene
bj lj radove
d autora
t iiz
Hrvatske koji pišu o dijabetesu dječje i starije
dobi”
– “Nađi radove koje su objavili Petrov, Rudar i
Marković”
– “Nađi radove koje su objavili Petrov ili Rudar
u kojima Marković nije koautor”
 Složena pretraživanja
• Realiziraju se uz uporabu Booleovih
operatora (AND, OR, NOT), dviju konstanti
(TRUE FALSE) i pravila Booleove algebre
(TRUE,
AND – ekvivalentno presjeku skupova
OR – ekvivalentno uniji skupova
NOT – ekvivalentno komplementu
• Oznake za konstante:
– TRUE: T ili 1
– FALSE: F ili 0
 Primjeri
“Nađi radove koje
j su objavili
j Petrov,, Rudar i Marković”
a=“radovi koje je objavio Petrov”
b=“radovi koje je objavio Rudar”
c=“radovi koje je objavio Marković”

“radovi koje je objavio Petrov” AND “radovi koje je objavio

Rudar” AND “radovi koje je objavio Marković”

a AND b AND c
 Primjeri
“Nađi radove koje su objavili Petrović ili Rudar u kojima Marković nije
koautor”
a=“radovi koje je objavio Petrović”
b=“radovi koje
j jje objavio
j Rudar”
c=“radovi koje je objavio Marković”

(“radovi koje je objavio Petrović” OR “radovi koje je objavio Rudar”)

AND (NOT “radovi koje je objavio Marković”)

(a OR b) AND (NOT c) (NOT c) AND a OR b

a OR b AND (NOT c) (NOT c) AND (a OR b)

Je li to isto?
 Primjeri
“Nađi radove koje su objavili Petrović ili Rudar u kojima Marković nije
koautor”
a=“radovi koje je objavio Petrović”
b=“radovi koje
j jje objavio
j Rudar”
c=“radovi koje je objavio Marković”

(“radovi koje je objavio Petrović” OR “radovi koje je objavio Rudar”)

AND (NOT “radovi koje je objavio Marković”)

(a OR b) AND (NOT c) (NOT c) AND a OR b

a OR b AND (NOT c) (NOT c) AND (a OR b)

Je li to isto?
Nove ttehnologije
N h l ij u kli kliničkoj
ičk j
medicini i istraživanju…
j
Kompjutorizirana
tomografija
 Nove tehnologije
PET

NMR
 Kliničke primjene UZV
UZV mjerenje duljine oka i debljine struktura
unutar oka.
Mjerenja se provode prije operacije katarakte kako
bi se ugradilo odgovarajuće leće.

UZV mjerenje
j j gglave fetusa UZV mjerenje opsega abdomena
T k i podataka
Tokovi d t k u sustavu
t
zdravstva
Čime se bavi medicina/zdravstvo
medicina/zdravstvo…
 Informacije u zdravstvu služe za
za...
....kontinuirano
kontinuirano unapređivanje zdravlja
stanovništva
– Liječenje
• PZZ
• Specijalističke i bolničke ustanove
– Prevencija
• PZZ
• Javnozdravstvene ustanove
– Planiranje
j i organizacija
g j u sustavu
Primjeri informacija u PZZ
Primjeri informacija u PZZ
Informacije…
Informacije

Izvor: http://www.mayoclinic.com/health/ct
http://www.mayoclinic.com/health/ct-scan/FL00065
scan/FL00065
 Razne metode dobivanja
medicinskih
di i kih slika
lik

RTG - kamen u bubregu

MRI – tumor na mozgu
CT – tumor na mozgu

Izvor: http://www.mayoclinic.com/health/ct-scan/FL00065
 Prava informacija
j - u pravo
vrijeme - na pravom mjestu
(medicinskoinformatički aksiom)

• Medicinsko/zdravstveno osoblje
• Bolesnik/korisnik zdravstvene zaštite
• Medicinska/zdravstvena ustanova
 Tokovi informacija

PZZ Specijalisti

Ljekarna Bolnica
Laboratorij
Recepti…
Recepti
PZZ

Ljekarna
Uputnica
PZZ

Laboratorij

Specijalistički
pregled

Bolnica
Povijest bolesti

PZZ

Specijalistika
Informacije…
Informacije

ili
Medicinskoinformatičko nazivlje
Entiteti, atributi, vrijednosti atributa??

ENTITET

ATRIBUTI VRIJEDNOST ATRIBUTA

(obilježja, varijable, značajke) (podatak)

- dob Dob: 45 godina

- spol 23 godine
- visina 5 mjeseci
- težina
- kreatinin Spol: muški
-…. ž
ženski
ki
Podaci, informacije, odluke??
podaci Informacija
j ((obavijest)
j )

Visina: 160 cm Indeks tjelesne

mase: 33,2
Težina: 85 kg obrada
podataka

odluka
(što napraviti?)

težina_ u _ kg
ITM = ITM>25 (prekomjerna težina)
vi sin a _ u _ m2
Obrada podataka – temeljne operacije s
podacima

• Prikupljanje
pj j • Klasificiranje
j
• Provjeravanje • Sažimanje
• Pohranjivanje • Računanje
• Pronalaženje • Umnožavanje
• Sortiranje
j • Komuniciranje j
 Vrste podataka
• Numerički podaci (npr.
(npr RR160/90)
• Tekstovni podaci (slobodni tekst, npr.
anamneza)
• Klase tekstovnih podataka (klasifikacije,
npr. dijagnoze)
dij )
• Signali (biološki)
• Slike (medicinske)
 EEG i fNMI kod pacijenta s
epilepsijom
il ij

Izvor: www.mni.mcgill.ca/.../gotman/eeg-fmri-main.htm
MONTREAL NEUROLOGICAL INSTITUTE
McGILL UNIVERSITY
 Šifra je
je...
.... znak ili niz znakova koji zamjenjuje/u neki
pojam

Npr. za vrijednosti atributa “SPOL” uvodimo:

M muški
M-muški
Ž-ženski

M i Ž su šifre
 Šifriranje je
je...
... postupak pridjeljivanja šifara unaprijed
definiranim klasama (definiranje sustava
j za određenu klasifikaciju)
šifriranja j )

Npr. Međunarodna klasifikacija bolesti ili

srodnih zdravstvenih problema (MKB-10)
I50 – srčana
č d
dekompenzacija
k ij E10 – dijabetes
dij b t
I26 – plućna embolija A09 – lažni proljev
I20 – angina pectoris F00 – Alzheimerova bolest
 Klasifikacija je
je...
... sustav kategorija
g j ((klasa)) koje
j se dodjeljuju
j j j
prema utvrđenim kriterijima

MKB-10: Međunarodna klasifikacija bolesti ili

srodnih zdravstvenih problema (opis bolesti,
oštećenja ozljede itd
oštećenja, itd.))

MKF: Međunarodna klasifikacija funkcioniranja

funkcioniranja,
invaliditeta i zdravlja (opis zdravlja i stanja u vezi
sa zdravljem)
 Još neke klasifikacije
klasifikacije...
ICPC: Međunarodna klasifikacija j up primarnojj
zdravstvenoj zaštiti (razlog dolaska, dijagnoza,
informacija o procesu liječenja, liječnikove
intervencije i provedeni postupci)

SNOMED: Sistematizirana medicinska

nomenklatura (univerzalna terminologija u
zdravstvenoj zaštiti koja omogućuje lakše
komuniciranje među liječnicima, istraživačima i
dr.)
 Još neke klasifikacije
klasifikacije...
ATC: Anatomsko,
Anatomsko terapijsko,
terapijsko kemijski
klasifikacijski sustav s definiranom
dnevnom dozom (klasifikacija lijekova -
ATC/DDD system)

NANDA: Klasifikacija dijagnoza za potrebe

sestrinstva
ti t
 Još o klasifikacijama
klasifikacijama...
MeSH: Medical Subject
j Headingsg ((osnova za
klasificiranje medicinske literature)

Primjer:
Hypertension: Persistently high systemic arterial
BLOOD PRESSURE. Based on multiple p
readings (BLOOD PRESSURE
DETERMINATION), hypertension is currently
defined
de ed as when
e SSYSTOLIC
S O C PRESSURE
SSU is
s
consistently greater than 140 mm Hg or when
DIASTOLIC PRESSURE is consistently 90 mm
Hg or more.
more
 MeSH stablo
All MeSH Categories
Diseases Category
Cardiovascular Diseases
Vascular Diseases
Hypertension
Hypertension, Malignant
Hypertension, Pregnancy-Induced
Hypertension,
yp Renal
Hypertension, Renovascular
 MeSH: Medical Informatics
1: Medical Informatics Links

The field of information science concerned with the analysis and

dissemination of medical data through the application of computers to
various aspects of health care and medicine.
Year introduced: 1987
2: Medical Informatics Applications Links

Automated systems applied to the patient care process including

diagnosis therapy
diagnosis, therapy, and systems of communicating medical data within
the health care setting.
Year introduced: 1987

3: Medical Informatics Computing Links

Precise procedural mathematical and logical operations utilized in

the study of medical information pertaining to health care.
care
Year introduced: 1987
 MeSH: Medical informatics
All MeSH Categories
Information Science Category
Information Science
Informatics
Medical Informatics

All MeSH Categories

Information Science Category
Information Science
Medical Informatics
Medical Informatics Applications
Decision Making, Computer-Assisted +
I f
Information
ti Storage
St and
d Retrieval
R ti l+
Information Systems +
Medical Informatics Computing