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农 业 生 物 技 术 学 报
Journal of Agricultural Biotechnology
2021, 29(12): 2312~2319
DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2021.12.005

我国乌骨鸡品种遗传多样性和品种鉴定
贾晓旭 陆俊贤 唐修君 樊艳凤 黄胜海 葛庆联 高玉时*
扬州 225125
江苏省家禽科学研究所，
*通讯作者，gaoys100@sina.com

摘 要 乌骨鸡(Gallus gallus domesticus)是我国优良的鸡遗传资源，

具有一定药用价值。研究我国乌骨
鸡品种的遗传多样性和品种鉴定，
对于品种的保护具有重要意义。本研究对丝羽乌骨鸡、
东乡绿壳蛋鸡、
余干乌骨鸡和竹丝鸡等 5 个乌骨鸡品种的 197 个个体的线粒体 DNA 的 D-loop 区全序列进行
金湖乌凤鸡、
5 个乌骨鸡品种的 D-loop 区序列全长为 1 231~1 232 bp，
了检测。结果表明， 1 231 bp 的序列在 859 bp 处
存在 1 处单碱基缺失位点。共计检测到 27 个核苷酸多态位点，
界定了 18 个单倍型。单倍型多样性、
核苷
酸多样性和平均核苷酸差异分别为 0.862±0.013、
0.00580±0.00107 和 7.137。中介网络图分析显示，
5 个乌
骨鸡品种含有 A、
B、C 和 E 共 4 个分支(单倍型类群)，
但各单倍型散布在不同品种中，
形态学和地理格局分
竹丝鸡和丝羽乌骨鸡遗传距离较远。我国乌骨鸡有 4 个母系来源，
布不明显。遗传距离分析表明， 遗传
多样性相对较低。该研究结果为我国乌骨鸡遗传资源的保护、
选育和鉴定工作提供了遗传背景信息。
关键词 乌骨鸡；
线粒体 DNA；
遗传多样性；
品种鉴定
中图分类号 S831.2 文献标识码 A

Genetic Diversity and Breed Identification of Chinese Black Bone

Chicken (Gallus gallus domesticus)
JIA Xiao-Xu LU Jun-Xian TANG Xiu-Jun FAN Yan-Feng HUANG Sheng-Hai GE Qing-Lian
GAO Yu-Shi *

Jiangsu Institute of Poultry Science, Yangzhou 225125, China

* Corresponding author, gaoys100@sina.com

Abstract Black bone chickens (Gallus gallus domesticus) are excellent indigenous chicken resources in
China and commonly believed to have medicinal properties. The study on the genetic diversity and breed
identification of the black bone chickens is of great significance for genetic conservation. For this study, the
complete mitochondrial DNA D-loop sequences of 197 chickens from 5 breeds (Silkie, Dongxiang Blue-
eggshell, Jinhu Black-bone, Yugan Black-bone and Zhu Si) were analyzed. The size of full-length chicken
mtDNA D-loop of 5 black bone breeds were 1 231 to 1 232 bp, with a single-base deletion from the 859 bp
site in the 1 231 bp sequences. A total of 27 variable sites that defined 18 haplotypes were identified. The
average haplotype diversity, nucleotide diversity and mean number of nucleotide differences were 0.862±
0.013, 0.005 80±0.001 07 and 7.137, respectively. The median network showed that genetic structure of the
mtDNA haplotypes of black bone chickens were distributed across 4 clades (haplogroups): Clades A, B, C,
and E. However, haplogroups were dispersed in different breeds, and the distribution of morphology and

基金项目： 国家自然科学基金 (31672382; 31501917; 31702079; 31372277)；

现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-
41)；
江苏省公益类科研院所自主科研项目(BM2018026)
收稿日期： 2021-05-29 2021-06-23
接受日期：
 我国乌骨鸡品种遗传多样性和品种鉴定
Genetic Diversity and Breed Identification of Chinese Black Bone Chicken (Gallus gallus domesticus)
2313

geographical pattern was not obvious. This study data suggested that genetic distance between Zhu Si and
Silkie was longer than the other breeds, which verified that Zhu Si chickens were hybridized from fast-
growing broiler as maternal line. Chinese black bone chicken had relatively lower genetic diversity and likely
shared 4 common maternal lineages. The results could be used as a reference for preservation, improvement
and identification of Chinese black bone chickens.
Keywords Black bone chicken; Mitochondrial DNA; Genetic diversity; Breed identification

种业是农业的“芯片”，
开展种质资源挖掘、保 (丝羽乌骨鸡, 东乡绿壳蛋鸡, 金湖乌凤鸡, 余干乌
护和评价是解决我国畜牧业种源“卡脖子”的问题 骨鸡)和商业化乌骨鸡品种(竹丝鸡)为实验材料，
以
的技术前提。我国各地自然和人文条件不同，
人们 线粒体 D-loop 区全序列为分子标记，
评估其线粒体
对鸡(Gallus gallus domesticus)培育的方向和目的也 DNA 的遗传多样性，
寻找特异性多态位点，
从而为
不尽相同，
形成了丰富多彩的鸡遗传资源。
《国家畜 我国乌骨鸡品种的保护、
选育及资源鉴定提供理论
禽遗传资源品种名录(2021 年版)》公布的我国地方 依据。
鸡品种种质资源有 115 个。鸡品种按照用途一般
1 材料与方法
分为肉用型和蛋用型，
我国一些乌骨鸡品种还有一
定的药用价值。早在 1 300 年前的《本草纲目》就有 1.1 实验材料
乌骨鸡的记载，
“乌骨鸡，
有白毛乌骨者，
黑毛乌骨
本研究采集丝羽乌骨鸡(Gallus gallus domesti⁃
者、斑毛乌骨者，
有骨肉皆乌者、肉白乌骨者，
但观
cus) 2 个群体 ：群体 1 (Silkie 1, SL1)(n=30), 群体 2
鸡舌黑者，
则骨肉俱乌、入药更良”(国家畜禽遗传
(Silkie 2, SL2) (n=42)；东 乡 绿 壳 蛋 鸡 (Dongxiang
资源委员会, 2011)。对这些具有优势特色性状的
Blue-eggshell, DX)(n=30)、金湖乌凤鸡(Jinhu Black-
种质资源进行评价也是一项十分重要的工作。
bone, JH) (n=29)、余 干 乌 骨 鸡 (Yugan Black-bone,
目前对鸡种质资源进行评价的分子标记很多，
YG)(n=36)和竹丝鸡(Zhu Si, ZS)(n=30)。丝羽乌骨
应用较多的为微卫星标记(包文斌等, 2007)、线粒
鸡群体 1、东乡绿壳蛋鸡和金湖乌凤鸡样品采集自
体 DNA 标记(高玉时等, 2015)和全基因组水平的遗
国家级地方鸡种基因库(扬州)， 丝羽乌骨鸡群体 2
传标记(Wang et al., 2020)。鸡线粒体基因组全长
样品采集自江西丝羽乌骨鸡保种场(泰和)、余干乌
约 16 785 bp， 具有基因结构简单、 缺少基因重组、 较
骨鸡样品采集自江西上饶市余干乌骨鸡保种场， 竹
快的进化速率和母系遗传等特点， 被广泛用于研究
丝鸡样品采集自江苏温氏畜牧有限公司(太仓)。
种群起源进化、遗传多样性和品种鉴定等方面(Liu
每个品种内个体间没有直接的亲缘关系。用常规
et al., 2006; Miao et al., 2013; 贾晓旭等, 2017; 陆俊
的酚-氯仿法提取基因组 DNA， 双蒸水溶解， 核酸浓
贤等, 2016)。翁茁先等(2019)利用线粒体 C 氧化酶
度测定仪测定 DNA 浓度， -20 ℃保存备用。
亚基 Ⅰ (cytochrome C oxidase subunit Ⅰ, COⅠ)基
因对多个乌骨鸡品种进行了研究， 结果表明中国乌 1.2 实验方法
骨鸡品种遗传多样性较低 ，但品种间遗传分化显 PCR 扩 增 和 测 序 所 用 引 物 相 同 ，参 照 Jia 等
著。徐文娟等(2014)利用线粒体细胞色素 b (cyto‐ (2016)，
引物(F: 5'-AAACACCCAAACTCACTAAC-
chrome b, Cytb)研究了乌骨鸡的起源，
结果表明乌 3'；R: 5'-CACTGGGATGCGGATACTTGC-3') 由 生
骨鸡的母系起源为 3 个红色原鸡(G. gallus)亚种，
还 工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR 反应
可能还含有少量的灰原鸡(G. sonneratii)血缘。线粒 体系和扩增条件参考 Gao 等(2017)。PCR 反应体系
体 D-loop 区变异速率约为线粒体其他区段的 5~10 总体积为 25 μL，
模板 DNA (50~100 ng) 1 μL，
含 2×
倍，
被广泛应用于起源与进化和群体遗传结构分析 PCR Master Mix (南京诺唯赞生物科技股份有限公
等方面的研究(贾晓旭等, 2017)。迄今，还没有利 司) 12.5 μL，10 μmol/L 上下游引物各 0.5 μL，灭菌
用线粒体 D-loop 区对我国乌骨鸡地方品种进行系 水 10.5 μL。 PCR 反 应 条 件 ：95 ℃ 预 变 性 5 min；
统研究的报道，
也没有对乌骨鸡商业化品种和地方 95 ℃变性 30 s，
52 ℃退火 30 s，
72℃延伸 90 s，
运行
品种比较的研究。本研究以我国乌骨鸡地方品种 35 个循环；
再 72 ℃延伸 10 min；
最后 12 ℃终止反
 农业生物技术学报
2314 Journal of Agricultural Biotechnology

应。PCR 产物经 1.5% 琼脂糖凝胶电泳检测，

确认 246、256、261、281、310、315、330、342、363、367、
扩增片段与目的片段一致后 ，送往生工生物工程 446、686、711、792、1214 和 1215 位。有 3 个保守区
(上海)股份有限公司测序。 域分别为 1~132、
447~685 和 793~1 213 bp。所检测
到的 27 处多态位点均为颠换 ，其中 A/T 之间颠换
1.3 数据处理和分析
15 次，
G/C 之间颠换 12 次。
以 .seq 格
所获序列根据峰图进行人工校对后，
2.2 线粒体 D-loop 区单倍型多样性分析
式输出 ，利用 ClustalX 软件进行序列比对(Thomp‐
son et al., 1997)。用 DnaSP 5.10.1 软件统计变异位 基于 197 条乌骨鸡序列发现的 27 个多态位点，
点数、简约信息位点数、单倍型数、核苷酸多样性、 共获得 18 种单倍型， 命名为 Hap1~Hap18。各单倍
单 倍 型 多 样 性 和 平 均 核 苷 酸 差 异 (Rozas et al., 型的数量及在品种间的分布见表 1~3。其中单倍
2003)。用 MEGA 6.0 软件统计序列的平均碱基组 型 Hap1 出 现 频 率 最 高 ，共 49 次 ；其 次 是 单 倍 型
成、品种内的遗传距离和品种间的遗传距离，
采用 Hap13，
为 41 次；
然后是单倍型 Hap5 和 Hap6，
分别
邻 接 (neighbor-joining, NJ) 法 构 建 系 统 发 育 树 为 23 和 22 次。Hap1~2、Hap5~6、Hap10、Hap13 和
(Tamura et al., 2013)。采用 Network 10.2.0 软件绘 Hap17 为共享单倍型，
其余的均为独立单倍型。
制 Median-joining 单 倍 型 网 络 图 (Bandelt et al., 2.3 不同品种遗传多样性分析
1999)。
6 个乌骨鸡群体遗传多样性见表 3。总体单倍
2 结果与分析 型 多 样 性 为 0.862±0.013，最 高 的 为 余 干 乌 骨 鸡
(0.897±0.022)，最低的为竹丝鸡(0.363±0.111)。总
2.1 线粒体 D-loop 区序列变异分析 体核苷酸多样性为 0.005 80±0.001 07，
余干乌骨鸡
PCR 扩增片段长度为 1 585 bp (图 1)，减掉两 核苷酸多样性最高(0.00667±0.00166)，
竹丝鸡最低
端非 D-loop 区序列区域片段，
成功获得 197 条完整 (0.00170±0.00127)。平均核苷酸差异为 7.137，
余干
的线粒体 D-loop 区序列 ，长度范围在 1 231~1 232 乌骨鸡平均核苷酸差异最高为 8.205，
竹丝鸡最低
bp，在 859 bp 处发现 C 单碱基缺失(C/-)。碱基 T、 为 2.090。
C、A 和 G 的 平 均 比 例 分 别 是 33.54%、26.51%、 基于 Kimura 双参数模型计算的 6 个群体乌骨
26.61% 和 13.34%，A+T 的平均含量为 60.15%，显 鸡的遗传距离见表 4，
可以看出 6 个群体品种内遗
著高于 G+C 的含量 39.85%，
表现出一定的碱基组 传距离范围为 0.001 71~0.006 69，竹丝鸡最低 ，余
符合鸟类线粒体 DNA 碱基组成的特征。
成偏好性， 干乌骨鸡最高。品种间遗传距离范围为 0.003 62~
利用 DnaSP 5.10.1 软件对 197 条序列进行单核 0.008 47。竹丝鸡与 2 个丝羽乌骨鸡群体之间的遗
共检测到 27 处多态位点(表 1)，
苷酸多态性分析， 占 传 距 离 较 远 ，双 参 数 距 离 值 分 别 为 0.008 47 和
核苷酸序列总长度的 2.19% (27/1232)，
其中 1 个单 0.007 47；
丝羽乌骨鸡群体 1 与丝羽乌骨鸡群体 2 的
一突变位点位于 133 位 ，26 个简约信息位点位于 双参数距离值为 0.003 62。
遗传距离最近，
167、199、210、212、217、222、225、239、242、243、 2.4 系统进化关系分析

bp M 1 2 3 4 5 bp 用 Network 10.2.0 构建 6 个乌骨鸡群体的中介

2000
1538 网络图 ，如图 2 所示 ，单倍型类群 A 由 Hap1~4 组
1000
750 单倍型类群 B 由 Hap5~9 组成，
成， 单倍型类群 C 由
500
200
Hap10~12 组成 ，单倍型类群 C 由 Hap13~18 组成。
100 只有单倍型类群 A 和 E 呈星状发散分布 ，Hap1 和
Hap13 分别处于中心。6 个乌骨鸡群体没有按鸡体
图1 PCR 扩增结果
Figure 1 PCR amplification results 型外貌或地理来源的不同进行分类，
只是单倍型分
M：
DL2000 DNA Marker；
1~5：
PCR 产物 布和比例存在差异。丝羽乌骨鸡群体 1 仅包含 3 种
M: DL2000 DNA Marker; 1~5: PCR products 归属于 A 和 B 2 个单倍型群，
单倍型， A 单倍型类群
 我国乌骨鸡品种遗传多样性和品种鉴定
Genetic Diversity and Breed Identification of Chinese Black Bone Chicken (Gallus gallus domesticus)
2315

丝羽乌骨鸡群体 2 有 5 种单
在该鸡群体中占优势； 没有受到外来血缘侵入。竹丝鸡和余干乌骨鸡先
除包含 A 和 B 2 个单倍型群外，
倍型， 还少量个体 聚在一起，
然后跟金湖乌凤鸡聚为另外一个分支，
属于 C 单倍型类群，
B 单倍型类群在该鸡群体中占 表明竹丝鸡虽然有丝羽乌骨鸡的父系血缘，
但线粒
优势；
东乡绿壳蛋鸡、金湖乌凤鸡和余干乌骨鸡分 体 DNA 呈母系遗传，
因此和丝羽乌骨鸡遗传距离
别有 4、6 和 9 种单倍型，
都归属于 A、B、C 和 E 4 个 较远，
这一结果符合竹丝鸡繁育的实际情况。
单倍型群 ，东乡绿壳蛋鸡 A 和 E 为优势单倍型类
3 讨论
金湖乌凤鸡 B 和 E 为优势单倍型类群，
群， 余干乌
骨鸡优势单倍型类群为 E；
竹丝鸡有 6 种单倍型，
归 丝羽乌骨鸡是我国最古老的鸡品种之一，
也是
属 A、B 和 E 3 个单倍型群，
E 单倍型类群占绝对优 我国少数被列为国际标准品种之一，
具有“桑葚冠、
势(27/30)。根据遗传距离采用 NJ 法构建系统发育 樱头、
绿耳、
胡须、
丝羽、
五爪、
毛脚、
乌皮、
乌骨和乌
树(图 3)。6 个乌骨鸡群体的系统发育树形成了 2 肉”等标准的“十全”特征。同时丝羽乌骨鸡还具有
2 个丝羽乌骨鸡群体首先聚在一起，
个分支， 然后和 药用功能，
是中医医治妇科病药“乌鸡白凤丸”的主
东乡绿壳蛋鸡聚为 1 个分支，
表明 2 个丝羽乌骨鸡 90 d 只能
要原料。由于丝羽乌骨鸡生长速度很慢，
群体虽然来自不同地方，
但属于同一品种，
并且都 达到 1.0 kg 左右，
每年产蛋不到 100 枚。竹丝鸡是

表1 基于 D-loop 区序列变异信息的乌骨鸡单倍型分类
Table 1 The identified haplotypes with the mitochondrial D-loop sequence polymorphisms in Black-bone chicken

单倍型 变异位点 数量 单倍型类群

Haplotype Variable sites Number Haplogroup
000000000000000000000000011
111222222222222333333467722
369111223444568113466481911
379027259236611050237661245
NC007235 TTTCATACAGTTTCACTCACTCGGGCA
Hap1 .C..G..T...C....C.........G 49 A
Hap2 .C..G..TG..C....C.........G 6
Hap3 .C.TG..T...C....C.....A...G 2
Hap4 .C..G..T...CC...C.........G 2
Hap5 ........................... 23 B
Hap6 .................T......... 22
Hap7 ......................A.A.. 11
Hap8 ........................A.. 4
Hap9 C.......................A.. 1
Hap10 ....G....ACCC.GTC.GTC.....G 4 C
Hap11 ....G....ACCC.GTC..TC.....G 3
Hap12 ....G....ACCC.GTC.GTC..A..G 2
Hap13 ....GC....CCCT.TC....T...TG 41 E
Hap14 ..C.GC....CC.T.TC....T...TG 11
Hap15 ....GC....CCCT.TC.G..TA..TG 8
Hap16 ....GCG...CCCT.TCT...T...TG 4
Hap17 ..C.GC....CCCT.TC....T...TG 3
Hap18 ....GC....CCCT.TC....TA..TG 1
NC007235 为标准序列，
变异位点竖读 4 个数字组合为碱基位置，
如：0133 代表这个碱基位于线粒体 D-loop 区的 133 bp 位置
NC007235 is the standard sequence, and the combination of 4 numbers read vertically at the variable sites is the base position.
For example, 0133 means this base is located at position 133 bp in the mitochondrial D-loop region
表 2 6 个乌骨鸡群体单倍型分布
Table 2 Haplotype distribution of the 6 Black-bone chicken populations
品种名 Breed name 单倍型/个 Haplotype/ pcs
Hap1 Hap2 Hap3 Hap4 Hap5 Hap6 Hap7 Hap8 Hap9 Hap10 Hap11 Hap12 Hap13 Hap14 Hap15 Hap16 Hap17 Hap18
丝羽乌骨 1 21 - - 2 - 7 - - - - - - - - - - - -
Silkie 1
丝羽乌骨 2 10 - - - 15 15 - - 1 1 - - - - - - - -
Silkie 2
农业生物技术学报

东乡绿壳 13 - - - 4 - - - - 2 - - - 11 - - - -
Dongxiang Blue-eggshell
金湖乌凤 - 1 2 - - - 11 - - 1 - - 13 - - - 1 -
Jinhu Black-bone
余干乌骨 4 4 3 4 3 2 4 8 4
2316 Journal of Agricultural Biotechnology

- - - - - - - - -
Yugan Black-bone
竹丝 1 1 - - 1 - - - - - - - 24 - - - 2 1
Zhu Si
总计 Total 49 6 2 2 23 22 11 4 1 4 3 2 41 11 8 4 3 1
-： 未检出
-: No detection

表 3 6 个乌骨鸡群体的遗传多样性
Table 3 Genetic diversity measures in 6 Black-bone chicken populations
品种名 样本量/只 单倍型数 单倍型(个体数) 单倍型多样性(标准差) 核苷酸多样性(标准差) 平均核苷酸差异
Breed name Sample size Number of haplotypes Haplotype (number of indi‐ Haplotype diversity (SD) Nucleotide diversity (SD) Mean number of
viduals) nucleotide differences
丝羽乌骨 1 30 3 (A=2; B=1) A (23); B (7) 0.467 (0.087) 0.00221 (0.00075) 2.720
Silkie 1
丝羽乌骨 2 42 5 (A=1; B=3; C=1) A (10); B (31); C (1) 0.704 (0.030) 0.00266 (0.00118) 3.274
Silkie 2
东乡绿壳 30 4 (A=1; B=1; C=1; E=1) A (13); B (4); C (2); E (11) 0.678 (0.049) 0.00457 (0.00138) 5.444
Dongxiang Blue-eggshell
金湖乌凤 29 6 (A=2; B=1; C=1; E=2) A (3); B (11); C (1); E (14) 0.670 (0.057) 0.00615 (0.00174) 7.571
Jinhu Black-bone
余干乌骨 36 9 (A=2; B=2; C=2; E=3) A (8); B (7); C (5); E (16) 0.897 (0.022) 0.00667 (0.00166) 8.205
Yugan Black-bone
竹丝 30 6 (A=2; B=1; E=3) A (2); B (1); E (27) 0.363 (0.111) 0.00170 (0.00127) 2.090
Zhu Si
总计 Total 197 18 (A=4; B=5; C=3; E=6) A (59); B (61); C (9); E (68) 0.862 (0.013) 0.00580 (0.00107) 7.137
 我国乌骨鸡品种遗传多样性和品种鉴定
Genetic Diversity and Breed Identification of Chinese Black Bone Chicken (Gallus gallus domesticus)
2317

在丝羽乌骨鸡基础上，
导入外血，
进行杂交，
培育而 并且可以利用线
大型肉鸡为母本经杂交选育而成，
成。竹丝鸡体型外貌和丝羽乌骨鸡相似，
但生长速 粒体 DNA 分子标记进行丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的品
度较快。本研究表明丝羽乌骨鸡群体 1 和群体 2 遗 种鉴定。
传距离较近，
本身就是一个品种，
只是保种方法不 单倍型多样性和核苷酸多样性是衡量一个群
群体 1 基因库保种，
同， 群体 2 保种场保种。竹丝鸡 体遗传多样性高低的的 2 个重要指标，
数值越大，
与 2 个丝羽乌骨鸡群体之间的母系遗传距离较远， 遗 传 多 样 性 越 高 ，遗 传 资 源 越 丰 富 ( 赵 习 彬 等 ,
双参数距离值分别为 0.008 47 和 0.007 47，
从遗传 2017)。本研究除余干乌骨鸡具有很高的遗传多样
角度证实了竹丝鸡是以丝羽乌骨鸡父本、
以国外快 性以外 ，其他品种均处于较低水平 ，与翁茁先等

表4 基于 Kimura 双参数模型计算的 6 个乌骨鸡群体品种内和品种间平均遗传距离

Table 4 The interspecies and intraspecies mean genetic distance of 6 Black-bone chicken populations calculated by
Kimura-2-parameter model

品种名称 品种内 丝羽乌骨 1 丝羽乌骨 2 东乡绿壳 金湖乌凤 余干乌骨 竹丝

Breed name Within variety Silkie 1 Silkie 1 Dongxiang Jinhu Yugan Zhu Si
Blue-eggshell Black-bone Black-bone
丝羽乌骨 1 0.00234
Silkie 1
丝羽乌骨 2 0.00267 0.00362
Silkie 2
东乡绿壳 0.00505 0.00470 0.00595
Dongxiang Blue-eggshell
金湖乌凤 0.00621 0.00654 0.00649 0.00641
Jinhu Black-bone
余干乌骨 0.00669 0.00657 0.00734 0.00632 0.00665
Yugan Black-bone
竹丝 Zhu Si 0.00171 0.00747 0.00847 0.00547 0.00542 0.00525

丝羽乌骨 1 Silkie 1
丝羽乌骨 2 Silkie 2
东乡绿壳 Dongxiang Blue-eggshell
金湖乌凤 Jinhu Black-bone
余干乌骨 Yugan Black-bone
竹丝 Zhu Si

图2 基于 mtDNA D-loop 单倍型构建的中介网络图

Figure 2 Median-joining network diagram constructed based on mtDNA D-loop haplotype
不同颜色表示不同群体，A、
B、C 和 E 为单倍型类群
Different shades of the circles correspond to distinct populations, A, B, C and E were haplogroups
 农业生物技术学报
2318 Journal of Agricultural Biotechnology

丝羽乌骨 1 Silkie 1

丝羽乌骨 2 Silkie 2

东乡绿壳 Dongxiang Blue-eggshell

金湖乌凤 Jinhu Black-bone

余干乌骨 Yugan Black-bone

竹丝 Zhu Si

0.00050
图3 基于 6 个乌骨鸡群体遗传距离采用邻接法构建的系统发育树
Figure 3 Neighbor-joining tree based on genetic distance of 6 Black-bone chicken populations

(2019)研究结果一致。基因库保种群体(本研究中 检测到，
因此不能区分开来。线粒体多态位点可以
丝羽乌骨鸡群体 1)的遗传多样性小于原产地群体 作为品种鉴定的一个辅助分子标记，
如果要想把各
(本研究中丝羽乌骨鸡群体 2)，
并且在单倍型类群 个品种完全区分开，
还需要引入其他细胞核的分子
分布上也存在一定的差异，
可能与基因库保种群体 标记。
较小有关，
提示保种过程中要定期与原产地群体进
4 结论
行基因交流(Gao et al., 2017)。竹丝鸡作为商业化
品种，
遗传多样性均低于其他乌骨鸡地方品种，
说 本研究利用线粒体 D-loop 区分子标记对我国
明长期人工选择会降低群体的遗传多样性，
提示在 乌骨鸡地方品种和商业品种的遗传多样性进行了
保种过程中，
要减少人工选择的因素。 研究，
并且探讨了品种鉴定的可行性。结果表明除
线粒体基因组位于动物细胞核外，
通过卵细胞 余干乌骨鸡具有很高的遗传多样性以外，
其他品种
遗传给下一代，
可以追溯个体的母系祖先。线粒体 均处于较低水平。我国乌骨鸡地方品种可能有 4
DNA 序列变异具有累积效应，
来自同一母系的单 个母系起源(A, B, C 和 E)。线粒体多态位点不能把
倍型会聚类在一起，
称为线粒体单倍型类群。本研 我国乌骨鸡品种区分开来，
但可以作为乌骨鸡品种
究结果显示 ：乌骨鸡地方品种有 4 个单倍型类群 鉴定的辅助分子标记。
(A, B, C 和 E)，
因此推测可能有 4 个母系起源。王
荣琼等(2020)比较了 2 个不同时期的盐津乌骨鸡的 参考文献
单倍型类群组成， 发现 2
用来评价鸡种的保种效果， 包文斌, 陈国宏, 吴信生, 等 . 2007. 中国红原鸡和泰国红原
个时间点群体单倍型类群组成存在较大差异，
保种 鸡遗传多样性分析[J]. 遗传, 29(5): 587-592. (Bao W
群遗传多样性水平显著下降，
群体中单倍型类群减 B, Chen G H, Wu X S, et al. 2007. Genetic diversity of
少。因此，
在乌骨鸡保种过程中，
可以考虑按不同 red junglefowl in China (Gallus gallus spadiceus) and

单倍型类群进行家系划分来进行保种。 red junglefowl (Gallus gallus gallus) in Thailand[J]. He‐

reditas (Beijing), 29(5): 587-592.)
引入外来母系血缘培育的竹丝鸡，
虽然也含有
高玉时, 贾晓旭, 唐修君, 等 . 2015. 基于线粒体基因组 D-
少量的单倍型类群 A 和 B，
但单倍型类群 E 占据绝
loop 区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源
对优势 90% (27/30)，
2 个丝羽乌骨鸡群体均未检测
进化关系[J]. 农业生物技术学报, 23(7): 940-944. (Gao
到单倍型类群 E，可以利用线粒体 DNA 进行丝羽 Y S, Jia X X, Tang X J, et al. 2015. The genetic diversi‐
乌骨鸡和竹丝鸡的品种鉴定。东乡绿壳蛋鸡、
金湖 ty and origin analysis of Anyi Tile-like chickens (Gallus
乌凤鸡和余干乌骨鸡群体中单倍型类群 E 也可以 gallus domestiaus) based on mitochondrial DNA D-loop

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(责任编辑 张丽春)