REPLIKACIJA DNK

1.
 DNK molekul

rasplitanje DNK
molekula
nukleotid
stari lanac

novi lanac
 Replikacija DNK je semikonzervativan proces

roditeljski razdvajanje lanaca komplementarno dva

molekul pri čemu će svaki sparivanje baza novonastala
DNK poslužiti kao molekula DNK
matrica za sintezu
novog lanca
 5’ kraj 3’ kraj

5’ fosfat

3’
hidroksilna
grupa 3’ kraj 5’ kraj
FORMIRANJE FOSFODIESTARSKE VEZE TOKOM REPLIKACIJE DNK

prekursor
OPŠTI PREGLED REPLIKACIJE
DNK
 3’
replikaciona viljuška 5’
5’
3’
3’
pravac pomeranja replikacione viljuške 5’
3’
5’

5’
3’
3’

5’

vodeći lanac 3’
5’

5’ zaostajući lanac
3’
3’

Okazaki fragmenti 5’
 Oridžin replikacije

replikaciona viljuška
replikaciona viljuška

zaostajući lanac
vodeći lanac

vodeći lanac zaostajući lanac

• U replikaciji učestvuje oko 20 enzima (proteina)
• DNK polimeraza I –Kornberg 1958.
• Ne može da sintetiše de novo lanac, zahteva prisustvo prajmera.
• PRAJMER je kratka sekvenca lanca RNK od 10-60 nukleotida čije nastajanje
katalizuje enzim PRIMAZA.
• Polimerazna aktivnost-primarna funkcija, 10 nukleotida/sek.
• Egzonukleazna aktivnost u oba smera
• Uklanja prajmere i popunjava praznine
• DNK polimeraze II i III, 1972. god.
• DNK polimeraza II ima ulogu u reparaciji
• DNK polimeraza III –replikaza katalzuje sintezu DNK u smeru 5’-3’ u
prisustvu matrice ili prajmera, ima 3’-5’ egzonukleaznu aktivnost, ugrađuje
1000 nukleotida/sek, sintetiše najveći deo DNK
• RESPLITANJE LANCA DNK:
• HELIKAZA, raskida H veze i otvara lanac
• SSB proteini, ispravljaju lanac DNK radi lakšeg ugrađivanja nukleotida
• TOPOIZOMERAZE imaju i Prokariote i Eukariote, uloga im je da smanjuju
tenziju uvrtanja
 3’

5’
SSB proteini

3’ DNK

HELIKAZA

5’
 3’

5’

PRIMAZA
3’ DNK

5’
 3’

5’

3’ DNK

5’
 PRAJMER
3’

5’

5’
5’

3’ DNK PRIMAZA

5’
 3’

5’

5’
5’

3’ DNK

5’
 3’

5’

5’
5’

3’ DNK
DNK POLIMERAZA III

5’
 3’

5’

5’

3’ DNK

3’

5’
 3’

5’

5’

3’ DNK

3’
HELIKAZA

5’
 3’

5’

5’

3’
5’

5’
 3’

5’
DNK POLIMERAZA III

5’

3’

PRIMAZA
3’

5’
 3’

5’

5’

3’

3’
PRAJMER

5’
 3’

5’

5’

3’

DNK POLIMERAZA III 3’

5’
 3’

5’

5’

3’

3’

5’
 3’

5’

5’

DNK POLIMERAZA I
3’

3’

5’
 3’

5’

5’ dezoksiribonukleozid-trifosfat

ribonukleotid
3’

3’

5’
 3’

5’

5’
dezoksiribonukleozid-trifosfat

3’ ribonukleotid

3’

5’
 3’

5’

5’

3’
LIGAZA

3’

5’
 3’

5’

5’

3’

3’

spajanje Okazaki
5’
fragmenata
 ODLIKE DNK POLIMERAZA E. coli

DNK polimeraza

I II III
5’ - 3’ polimerizaciona
aktivnost + + +
3’ - 5’ egzonukleazna
aktivnost + + +
5’ - 3’ egzonukleazna
aktivnost + - -
broj molekula po ćeliji 400 ? 10-20
 DNK POLIMERAZA III

odmotavanje DNK
heliksa brzinom od 50
obrtaja u sekundi
replikacija koja se odvija
brzinom od 1000
nukleotida u sekundi