MOLEKULARNA BIOLOGIJA

• Proučava čuvanje, prenos i ekspresiju

(ispoljavanje) genetičke informacije
• Građu i funkciju informacionih
molekula: nukleinskih kiselina i proteina
• Procese u kojima se ostvaruje prenos
genetičke informacije: replikaciju,
transkripciju i translaciju
 Genetička informacija

• Redosled nukleotida u DNK koji

određuje redosled aminokiselina u
proteinu
 NUKLEINSKE KISELINE
• izgrađene od polinukleotidnih lanaca
• DNK grade 2 polinukleotidna lanca
• RNK gradi 1 polinukleotidni lanac
 NUKLEOTID
• Fosfatna grupa
• Pentoza (dezoksiriboza ili riboza)
• Azotna baza
 Azotne baze
• Purinske baze su • Pirimidinske baze su
derivati purina derivati pirimidina

citozin

adenin

timin

guanin
uracil
 5’
Polinukleotidni
lanac
• Više nukleotida
povezanih
fosfodiestarskim
vezama

3’
Antiparalelnost lanaca DNK
Sparivanje komplementarnih
azotnih baza
 RNK
mala
podjedinica
ribozoma

podjedinice
ribozoma
tRNK
 Hromatin
• Jedrov materijal
• Izgrađen od DNK i baznih proteina histona

Hromozomi
• Najviši stepen kondenzacije hromatina
• Vidljivi u deobi ćelije
Pakovanje
hromatina
 PROTEINI
• U njihov sastav ulaze: C, H, O i N
• Makromolekuli izgrađeni od 20 vrsta
amino-kiselina povezanih međusobno
peptidnim vezama u linearni polipetidni
lanac
 Aminokiseline
• Organska jedinjenja sa dve funkcionalne
grupe: amino-grupom (–NH2) i
karboksilnom grupom (–COOH)
• Razlikuju se po R-grupi
 Nepolarne

Vrste aminokiselina

Pozitivno naelektrisane

Polarne nenaelektrisane

Negativno naelektrisane
 Peptidna veza
• Nastaje reakcijom između karboksilne
grupe jedne aminokiseline i amino-grupe
druge aminokiseline

dipeptid
 Primarna struktura proteina
• Broj i redosled aminokiselina u
polipetpidnom lancu
• Zapisana u genima
 Sekundarna struktura proteina

• Dva oblika: α-
heliks i β-ploča
• Uspostavlja se
formiranjem
vodoničnih veza
između H i O
peptidnih veza

α-heliks β-ploča
Tercijarna struktura proteina
• Čine ga α-heliksi, β-ploče i “neuređeni”
delovi
Kvaternarna struktura proteina
• Više polipeptidnih lanaca gradi
funkcionalan protein

kolagen hemoglobin
 Konformacija
- prostorni oblik proteina
• Globularni proteini • Fibrilarni proteini
loptasti – sferni končasti
 Primarna struktura
proteina

Sekundarna struktura
proteina

Tercijarna struktura
proteina

Kvaternarna struktura
proteina
 Funkcije proteina
• Gradivna – strukturna: grade ćeliju i tkiva
• Biokatalitička – enzimi – usmeravaju
biohemijske reakcije
• Transportna – hemoglobin, transferin
• Imunološka – antitela
• Kontraktilna – aktin i miozin
• Regulatorna – hormoni
• Rezervna – albumin
 GENOM
• Ukupna DNK u ćeliji:
• u jedru – jedarni genom: 99.99% genoma
• u mitohondrijama – mitohondrijalni genom
• u hloroplastima – hloroplastni genom
• VELIČINA GENOMA izražava se kao
broj baznih parova u haploidnoj ćeliji
(C vrednost) 9
• Veličina genoma čoveka: 3,2 · 10 bp
 Prokariote Eukariote

• Bakterije • Protisti, biljke,

životinje, gljive
• Haploidne ćelije (n) • Diplodne ćelije (2n)
• Kružna DNK • Linearna DNK
Hromozomi čoveka
 Organizacija genoma
• Unikalna DNK: 45% genoma
• Repetitivna DNK: 55% genoma
• Satelitska DNK – na krajevima hromozoma i u
oblasti centromere (uloga: sparivanje hromozoma
u mejozi, održavanje strukture hromozoma)
• Intermedijarna DNK
– Familije gena (globinska familija, histonska familija)
– Uzastopno ponovljeni geni (geni za rRNK i geni za
tRNK)
– Mobilni genetički elementi – skoči-geni
 Kodirajuća DNK

• DNK koja kodira proteine čini

samo 3% genoma
• Ostala DNK – 97%
 GEN
• Deo DNK koji se transkribuje u
informacionu RNK, ribozomalnu RNK ili
transportnu RNK
• Gen koji se transkribuje u iRNK nosi
informaciju za sintezu proteina
 Geni prokariota i eukariota

• Kontinuirani geni: • Diskontinuirani

sadrže samo geni: sadrže
kodirajuću DNK egzone
(kodirajuće
delove) i introne
(nekodirajuće
delove)
 egzon intron egzon intron egzon
DNK
transkripcija gena

RNK
primarni
transkript
isecanje introna i
spajanje egzona
iRNK
transport iRNK u
citoplazmu
 PRENOS
GENETIČKE
INFORMACIJE
 Genetička informacija

• Redosled nukleotida u DNK koji

određuje redosled aminokiselina u
proteinu
• Prenos i ekspresija genetičke
informacije ostvaruje se kroz procese:

Replikacije – sinteze DNK

Transkripcije – sinteze RNK
Translacije – sinteze proteina
Prenos genetičke informacije
replikacija
DNK DNK
transkripcija

RNK
translacija

PROTEIN
Replikacija
A T
G C
C G
T A
T A
G C
CG CG
AT AT
CG CG
TA TA
GC GC
 Transkripcija – sinteza RNK
kodirajući
lanac
5‘-ATG-AGA-CAT-GTA-AGC-3' DNK
3‘-TAC-TCT-GTA-CAT-TCG-5'

transkripcija matrični
lanac

5‘-AUG-AGA-CAU-GUA-AGC-3’ iRNK
Prenos genetičke informacije
replikacija
DNK DNK
transkripcija

RNK
translacija

PROTEIN
 Genetički kod
• Skup pravila za prevođenje redosleda
nukleotida u redosled aminokiselina
• Čini ga 64 znaka – kodona
• Kodon – niz od tri nukleotida (triplet
nukeotida) u iRNK koji određuje mesto
jedne aminokiseline u proteinu
• SINONIMNI KODONI – kodoni koji
kodiraju istu aminokiselinu
 GENETIČKI KOD

5' U C A G 3'

UUU UCU UAU UGU U

Phe Tyr Cys
UUC UCC UAC UGC C
U Ser
UUA UCA UAA STOP UGA STOP A
Leu
UUG UCG UAG STOP UGG Trp G
CUU CCU CAU CGU U
His
CUC CCC CAC CGC C
C Leu Pro Arg
CUA CCA CAA CGA A
Gln
CUG CCG CAG CGG G
AUU ACU AAU AGU U
Asn Ser
AUC Ile ACC AAC AGC C
A Thr
AUA ACA AAA AGA A
Lys Arg
AUG Met ACG AAG AGG G
GUU GCU GAU GGU U
Asp
GUC GCC GAC GGC C
G Val Ala Gly
GUA GCA GAA GGA A
Glu
GUG GCG GAG GGG G
 Translacija
5‘-AUG-AGA-CAU-GUA-AGC-3' iRNK

translacija

NH2- ??? -COOH protein

 GENETIČKI KOD

5' U C A G 3'

UUU UCU UAU UGU U

Phe Tyr Cys
UUC UCC UAC UGC C
U Ser
UUA UCA UAA STOP UGA STOP A
Leu
UUG UCG UAG STOP UGG Trp G
CUU CCU CAU CGU U
His
CUC CCC CAC CGC C
C Leu Pro Arg
CUA CCA CAA CGA A
Gln
CUG CCG CAG CGG G
AUU ACU AAU AGU U
Asn Ser
AUC Ile ACC AAC AGC C
A Thr
AUA ACA AAA AGA A
Lys Arg
AUG Met ACG AAG AGG G
GUU GCU GAU GGU U
Asp
GUC GCC GAC GGC C
G Val Ala Gly
GUA GCA GAA GGA A
Glu
GUG GCG GAG GGG G
 Translacija
5‘-AUG-AGA-CAU-GUA-AGC-3' iRNK

translacija

NH2-Met-Arg-His-Val-Ser-COOH protein
 kodirajući
lanac
5‘-ATG-AGA-CAT-GTA-AGC-3'
3‘-TAC-TCT-GTA-CAT-TCG-5' DNK
matrični
transkripcija lanac

5‘-AUG-AGA-CAU-GUA-AGC-3' iRNK
translacija

NH2-Met-Arg-His-Val-Ser-COOH protein
 Prenos genetičke informacije

• Genetička informacija je redosled nukleotida

u DNK koji određuje redosled aminokiselina
u proteinu
• Prenos i ekspresija genetičke informacije
ostvaruje se kroz procese replikacije,
transkripcije i translacije:
replikacija
DNK DNK
transkripcija
iRNK
translacija
protein
REPLIKACIJA
DNK
 Replikacija

• Replika – kopija
• Proces udvajanja DNK
• Odvija se u jedru, u S-fazi
ćelijskog ciklusa, pred
ćelijsku deobu
Replikacija
A T
G C
C G
T A
T A
G C
CG CG
AT AT
CG CG
TA TA
GC GC
1. HELIKAZA raskida vodonične veze i raspliće lance DNK

2. DNK-polimeraza klizi po
5’ matričnom lancu u 3’ → 5’
zaostajući smeru i sintetiše
3’ lanac komplementarni VODEĆI
lanac u 5’ → 3’ smeru
5’
3’
5’
Okazakijevi 3’ smer replikacije
fragmenti 5’ 3’
3’
5’
Vodeći lanac sintetiše se
kontinuirano

3. Zaostajući lanac sintetiše se

5’ diskontinuirano: iz delova –
vodeći
lanac Okazakijevih fragmenata
3’
4. LIGAZA povezuje fragmente u
zaostajućem lancu
 Tok replikacije
• Helikaza raskida vodonične veze i raspliće
lance DNK
• DNK-polimeraza klizi po matričnom lancu u
3’ → 5’ smeru i sintetiše komplementarni
VODEĆI lanac u 5’ → 3’ smeru
• Vodeći lanac sintetiše se kontinuirano
• Zaostajući lanac sintetiše se diskontinuirano:
iz delova – Okazakijevih fragmenata
• Ligaza povezuje fragmente u zaostajućem
lancu
 • Replikacija DNK je
semikonzervativan
proces jer se svaki
molekul DNK sastoji od:
– jednog starog
roditeljskog lanca i
– jednog
novosintetisanog lanca
roditeljski
lanac

novosintetisani
lanac
 oridžin

Replikacija kod DNK

prokariota terminacioni
region
• Replikacija počinje
na jednom mestu
(oridžinu) i odvija
se istovremeno u
oba smera, istom
brzinom
• Završava se u
terminacionom
regionu nasuprot
oridžinu DNK DNK
 Replikacija kod eukariota
• Započinje na više mesta na hromozomu i
odvija se istovremeno u oba smera dok se
replikativni mehurovi ne spoje
oridžini

replikativni
mehurovi
 TRANSKRIPCIJA
• Proces sinteze RNK, odvija se u jedru
 Tok transkripcije
• Inicijacija: RNK polimeraza vezuje se za
promotor – deo DNK ispred gena koji će se
prepisivati, stvara se tzv. transkripcioni kompleks
• Elongacija: RNK polimeraza klizi po matričnom
lancu u 3’→5’ smeru i sintetiše komplementaran
RNK lanac u 5’→3’ smeru.
• Terminacija: kada RNK polimeraza dođe do
kraja gena, transkripcioni kompleks se raspada i
novosintisana RNK (primarni transkript) se
oslobađa
 kodirajući lanac DNK
RNK polimeraza
ribonukleotid

RNK

matrični lanac DNK

Smer transkripcije
Obrada primarnog transkripta
• Isecanje introna i spajanje
egzona
• Dodavanje 5’-kape (metil-
guanozin) na početak iRNK
• Dodavanje poli-A repa na
3’kraj iRNK (oko 250
adeninskih nukleotida)
5’-mG-AUCGCCUAGCCACGUGCAUC-AAAAAAAAAAAAAAAAA-3’
Obrada primarnog transkripta
egzon intron egzon intron egzon
transkripcija gena
DNK

RNK
primarni
transkript
isecanje introna i
spajanje egzona
iRNK
transport iRNK u
citoplazmu
 TRANSLACIJA
• Proces sinteze proteina, odvija se na
ribozomima
• U ovom procesu redosled kodona u iRNK
prevodi se u redosled aminokiselina u
proteinu
• U procesu učestvuju sve tri vrste RNK
RIBOZOM
velika
podjedinica Izgrađene od
mala rRNK i proteina
podjedinica

POLIRIBOZOM – više ribozoma povezanih iRNK koja prolazi

između male i velike subjedinice

iRNK
POLIRIBOZOM
 Transportne RNK
• Oblik slova “L”
• Na jednom kraju nosi aminokiselinu, a na
drugom ima antikodon – niz od tri
nukleotida koji je komplementaran kodonu
na iRNK AMINOKISELINA

ANTIKODON
 Met Val Gly Asp Ser Phe Arg Lys
Vezivanje tRNK i iRNK

UAC CAA C C G C UA U CA AAG G C U U U U

antikodon iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA AAA 3’

kodon
1. INICIJACIJA

2. ELONGACIJA

Translokacija

3. TERMINACIJA
 Met Val
INICIJACIJA

formiranje
UAC CAA peptidne veze

P A
iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA AAA 3’

START
 Gly
ELONGACIJA

CCG
Met Val

UAC CAA
iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA AAA 3’

 ELONGACIJA

Met Val Gly

CAA C C G
iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA AAA 3’

 Asp
ELONGACIJA

CUA
Met Val Gly

CCG
iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA AAA 3’

 Ser
ELONGACIJA

UCA
Met Val Gly Asp
Asp

CCG CUA
iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA A A A U G A 3’

 ELONGACIJA

Met Val Gly Asp Ser Phe

iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA A A A U G A 3’

 ELONGACIJA

Met Val Gly Asp Ser Phe Arg

iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA A A A U G A 3’

 ELONGACIJA

Met Val Gly Asp Ser Phe Arg

iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA A A A U G A 3’

 TERMINACIJA

Met Val Gly Asp Ser Phe Arg Lys

PROTEIN

SINTETISAN PREMA
UPUTSTVU U iRNK UUU

iRNK iRNK

5’ AUG GUU GGC GAU AGU UUC CGA A A A U3’G A 3’

STOP
• Translacija je proces sinteze proteina koji
se odvija na ribozomima. U translaciji
učestvuju sve tri vrste RNK. Informaciona
RNK nosi uputstvo (niz kodona) za sintezu
polipeptidnog lanca. Ribozomalne RNK
grade ribozome. Transportne RNK
transportuju do ribozoma aminokiseline od
kojih će nastati protein. Transportne RNK
na jednom svom kraju imaju vezanu
aminokiselinu, a na drugom kraju
antikodon – niz od tri nukleotida koji je
komplementaran kodonu u iRNK.
 Translacija se odrigrava u tri faze:
• 1. U fazi inicijacije sklapa se ribozom od
velike i male podjedinice, iRNK prolazi
između podjedinica tako da se prvi kodon
nalazi naspram P-mesta, a drugi naspram
A-mesta. U P-mesto ribozoma dolazi tRNK
koja nosi aminokiselinu metionin. U A-
mesto dolazi tRNK sa antikodonom koji je
komplementaran 2. kodonu.
• 2. U fazi elongacije sintetiše se polipeptid.
Između aminokiseline na P-mestu (Met) i A-
mestu formira se peptidna veza. Veza između
Met i njegove transportne RNK se raskida i
tRNK napušta P-mesto. Posle ovoga dolazi do
translokacije: pomeranja ribozoma za jedan
kodon prema 3'-kraju iRNK tako da se tRNK sa
vezanim aminokiselinama sada nalazi u P-
mestu, a A-mesto ostaje slobodno. Na A-mesto
tada dolazi tRNK čiji je antikodon
komplementaran 3. kodonu. Ceo proces
(ugrađivanja aminokiselina u polipetid) ponavlja
se sve dok se na A-mestu ne nađe STOP-
kodon.
• 3. Terminacija: kada se na A-mestu nađe
STOP-kodon (za koji ne postoje
odgovarajuće tRNK), za A-mesto se
vezuje oslobađajući protein koji zaustavlja
translaciju. Tada dolazi do raskidanje veze
između tRNK na P-mestu i polipeptida,
sintetisani polipeptid se oslobađa u
citoplazmu, ribozom se raspada na
podjedinice i translacija se završava.