08/09/2019

Sel prokariot

KEANEKARAGAMAN DAN
STRUKTUR SEL MIKROBA Sel eukariot

PROKARIOT DAN EUKARIOT mikrobiologi-atria

mikrobiologi-atria

bakteri
prokariot
archaea
Sel
eukariot

2.1. SEL PROKARIOT

Struktur eksternal sel prokariot
a. Glikokaliks
Adalah suatu substansi mengelilingi bgn luar sel.
tersusun dari polisakarida, polipeptida or keduanya.
Produk dr dlm sel dan dikeluarkan ke permukaan sel.
2 tipe glikokalik: (d) Spirillum
a. kapsul : sangat terorganisir, melekat sangat kuat
mikrobiologi-atria Bentuk dan susunan Bakteri. Drawings show examples ofmikrobiologi-atria
shape variations
b. lapisan lendir : tersusun longgar, mudah lepas dalam for cocci, rods, vibrios, spirilla, spirochetes, and branching filaments.
Below each shape is a micrograph of a representative example.
air (a) © J.T. Staley, M.P. Bryant, N. Pfennining and J.G. Holt, Bergey Manual of Systematic Bacteriology, Vol 3 © 1989 Williams and Wilkins Co. Baltimore; (b) Courtesy Jeff
Broadbent; (c) CDC/Janice Haney Carr; (d) USDA/Photo by De Wood. Digital colorization by Chris Pooley; (e) © VEM/Science Source; (f) CDC/Dr. David Berd

mikrbiologi-atria 1
 08/09/2019

In Some Bacteria
In All Bacteria
S layer—Monolayer of protein
Fungsi :
Cytoplasmic (cell) membrane—A thin sheet of lipid and
protein that surrounds the cytoplasm and controls the flow
of materials into and out of the cell pool.
used for protection and/or attachment.
- melindungi dari kekeringan
- Perlekatan plak gigi
Fimbriae—Fine, hairlike bristles
Bacterial chromosome or nucleoid—Composed of extending from the cell surface
condensed DNA molecules. DNA directs all genetics and
heredity of the cell and codes for all proteins
Outer membrane—Extra - Mencegah dikenali dan dihancurkan oleh sel darah putih
Ribosomes—Tiny particles
membrane .Controls flow of
materials, and portions of it are toxic (kapsul)
to mammals when released.
ex : Streptococcus pneumoniae , Klebsiella pneumoniae
composed of protein and RNA
that are the sites of protein
synthesis. Cell wall—A semirigid casing that provides
structural support and shape for the cell.

Cytoplasm—Water-based
Actin cytoskeleton—Long fibers of proteins Kehadiran glikokalik gbran prokariot patogenik
solution filling the entire cell. that encircle the cell just inside the
ytoplasmic membrane
Berperanan penting dlm kemampuan sel untuk hidup dan
menyebabkan penyakit. Lapisan lendir membantu
Pilus—An appendage used for drawing
another bacterium close in order to
transfer DNA to it.
perlekatan pd permukaan, ex: bakteri mulut plak gigi
Capsule (tan coating)—A coating or layer of
molecules external to the cell wall. Also
called slime layer and glycocalyx. Kapsul mencegah bakteri dikenali dan
Bacterial microcompartments—Proteincoated
packets used to localize enzymes and other proteins in
dihancurkan oleh sel immun host.
ex: Streptococcus pneumoniae dan
the cytoplasm
In Some Bacteria (not shown)
Endospore (not shown)—
Plasmid—Double-stranded DNA circle
containing extramikrobiologi-atria
genes.
Klebsiella pneumoniaemikrobiologi-atria
Dormant body formed within
some bacteria that allows for their
survival in adverse conditions.
Flagellum—Specialized appendage attached
to the cell by a basal body that holds a long, koloni basah dan mengkilat
rotating filament. The movement pushes the
cell forward and provides motility.

b. Flagella
2. Hook
Segmen membengkok dan pendek, menghubungkan
filamen dengan basal body.
Tersusun dari protein yang berbeda
3. Basal body
Tersusun dari protein yang berbeda
Tempat tertanamnya filamen dan hook ke dinding sel
melalui suatu batang dengan 4 atau 2 cincin
Mrpkan struktur yang keluar dr permukaan sel dan glikokalik Hook + batang + cincin filamen mampu berputar
Struktur Flagela prokariot 360°
1. Filamen Perbedaan asosiasi protein flagela mampu
Panjang, halus, diameter 20 nm, menonjol keluar dari mengklasifikasi spesies prokariotik menjd kel. (strain)
permukaan sel ke lingkungannya.
Tersusun dari molekul protein globular yaitu flagelin.
serovar
mikrobiologi-atria

tersusun dlm btk rantai heliks melingkari core (batang).

mikrobiologi-atria

mikrbiologi-atria 2
 08/09/2019

Susunan
4. Peritrik
Bentuk-bentuk flagela
Sel dg flagel menutupi
1. Monotrik permukaan sel, ex:
Sel dg flagela tunggal

Fungsi
• pergerakan sel: searah, random, berubah arah
2. Lopotrik
sel dg sekelompok Respon dr stimulus
flagela pada salah satu Reseptor pada permukaan sel mengirim sinyal ke
ujung sel flagela shg dpt mengatur kecepatan dan arah rotasi
Pergerakan respon terhadap stimulus taksis
3. Amfitrik
• Membantu perlekatan (adhesin) ke sel host, ex:
sel mempunyai flagel pd
Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa mikrobiologi-atria
kedua ujung, ex:
mikrobiologi-
atria
• virulensi, ex: FliC of Shiga-toxigenic E. coli

Bergetah, mengandung protein, seperti buku untuk

• Pergerakan flagela melekat satu sama lain atau terhadap substansi di
Arah perputaran flagela berputar lingkungan
secara heliks
Jumlah dapat beratus-ratus fimbriae/sel
Kec. Putaran 20-90 µm/detik ≈ 20-
100 pjg sel/detik Lebih pendek dari flagela
ex: Helicobacter pylori , flagela sgt Fungsi :
kuat + sel spiral lap.mukosa 1. Perlekatan sel ke host.
epitelium lambung
ex: Neisseria gonorrhoeae
C. Fimbria dan pili Reproduktif pd membran mukosa
Merupakan bagian luar sel yang tidak dapat bergerak Tanpa fimbria non patogenik
terdpt pd beberapa prokariot 2. Biofilm, bakteri lendir mampu melekat pada
Fimbria substrat karena fimbria dan glikokalik
mikrobiologi-atria mikrobiologi-atria

Banyak terdpt pada bakteri Gram negatif

mikrbiologi-atria 3
 08/09/2019

Pili (sing:pilus) adl suatu tubulus tersusun dari protein

pilin.
Lebih panjang dari fimbria tapi lebih pendek dari flagel
Fungsi: pergerakan melekat pd substrat atau bakteri
lain kmd bakteri mendorong diri melalui pilus
menuju menuju ke tpt perlekatan.
Biasanya dalam 1 sel hanya terdapat 1-10
Pili konyugasi merupakan mediator utk transfer DNA
dari 1 sel ke sel lain melalui proses konyugasi.

mikrobiologi-atria mikrobiologi-atria
Chronic bio-fouling caused Biofilm Three bacteria in the process of
by Iron bacteria reactor conjugating

d. Dinding Sel prokariotik • Peptidoglikan tersusun dr 2

gula dg struktur mirip
Fungsi : memberi struktur dan bentuk pada sel dan glukosa:
melindunginya dari tekanan osmotik
1. N-asetil glukosamin (NAG)
Dinding sel bakteri 2. N-asetil muramat (NAM)
-Kebanyakan bakteri mempunyai dinding sel, tersusun • Rantai NAG dan NAM
dari suatu komplek polisakarida disebut peptidoglikan berikatan satu sama lain
melalui jembatan 4 as.amino
(tetrapeptida) jembatan
peptida.
• Jembatan tetrapeptida berikatan satu sama lain melalui
rantai pendek asam amino
Dinding Gram -
Struktur peptidoglikan
mikrobiologi-atria Tipe dasar dinding sel bakteri mikrobiologi-atria
Dinding Gram +

mikrbiologi-atria 4
 08/09/2019

Dinding sel
Gram negatif (-)

Dinding sel
Gram positif (+)

Tipe dinding sel dibedakan

berdasarkan prosedur
Pewarnaan Gram

mikrobiologi-atria
Dinding sel Gram negatif (-) mikrobiologi-atria

Perbandingan bakteri Gram positif dan negatif

Warna sel pewarnaan Gram Ungu pink

Representative genera Bacillus, staphylococcus , Escherichia, Neisseria,
Streeptococcus Pseudomonas
Perbedaan strukr / komponen Lapisan tunggal Berlapis tiga (multi)
Peptidoglikan Lapisan tebal, > 50% BK Lapisan tipis, <10% BK
Asam tekoat Ada tidak ada
Outer membran Tidak ada ada
Endotoksin tidak ada ada
Protein porin tidak ada ada, tpt lewat molekul
Lipid rendah (1-4%) tinggi (11-22%)
Karakteristik umum
Sensitivitas thdp penisilin Umumnya lebih peka Umumnya kurang peka
Resistensi terhadap gangguan
mikrobiologi-atria
Lebih resisten Kurang resisten
mikrobiologi-atria
Dinding sel Gram positif (+) fisik

mikrbiologi-atria 5
 08/09/2019

Gram +
Dinding sel bakteri
• Lapisan peptidoglikan tebal
Gram – • Asam tekoat : as. tekoat ribitol & as. tekoat gliserol
• Lapisan peptidoglikan tipis • beberapa mempunyai as. tekoat pd peptidoglikan
• mempunyai outer membran • Semua mempunyai as. Lipotekoat
•Dinding sel mempunyai lap. Peptidoglikan tipis tapi diluar Fungsi as. Tekoat:
lap.terdapat dwimembran fosfolipid, lubang protein
(porin) dan lipopolisakarida (LPS) - determinasi antigen

• Bagian lipid LPS disebut Lipid A - pengaturan pembelahan sel

- Lipid A dalam sel Gram – bersifat endotoksin, normal
menyebabkan demam, inflamasi, shock, pembekuan Beberapa bahan kimia berasosiasi dg dinding sel G +
darah pada manusia
ex: Mycobacterium tbc, lepra
- Ruang periplasma mengandung air, nutrien mikrobiologi-atria
dan
substansi disekresi oleh sel. ex: enzim digestif dan Dinding sel dg kandungan as. mycolat sampai 60%
mikrobiologi-atria

protein transport (lap.berlilin) survive dessication

Dinding sel Archaea

Bakteri tanpa dinding sel
• Berukuran lebih kecil mempunyai tidak mempunyai • Dinding sel mengandung polisakarida dan protein
dinding sel spesifik tapi bukan peptidoglikan. Polimer lebih
komplek tanpa asam muramat dan D-amino acids.
• Spesies Mycoplasma mempunyai bentuk bervariasi
krn tidak punya dinding sel. • Klasifikasi terpisah dari bakteria (domain tersendiri)
• Cell membrane contain sterols for stability, their cell • Sel Gram positif arkhaea dinding sel tebal,
ungu
membrane is stronger than that of other bacteria.
• Sel Gram negatif arkhaea memp lap.protein melapisi
• Ciri-ciri sama seperti sel prokariot yang lain dinding sel namun bukan spt membran lipid pink
termasuk ribosomnya ex: Mycoplasma pneumoniae
•
• Penicillin dan lisozim tidak memberi efek thd mikrobiologi-atria
organisme mikrobiologi-atria
ini.

mikrbiologi-atria 6
 08/09/2019

• Resisten terhadap serangan lisozim dan antibiotik ß

laktam ex: penisilin
• Sel G- mempunyai lapisan protein atau glikoprotein di
luar membran sel (20-40 nm)
ex: Methanobacterium, Halobacterium, Thermoproteus,dll

Membran sel prokariot

Struktur
• membran sitoplasma tersusun dari lipid dan protein
• sel bakteri mengandung fosfolipid sedangkan sel
archaea tersusun dari lipid tanpa gugus fosfat dan
mempunyai cabang hidrokarbon dg gliserol melalui
Fosfat (kepala) hidrofilik
ikatan ether dipolester
• Beberapa membran bakteri mengandung molekul sep Strk. memb.sitoplasma
mikrobiologi-atria lipid (ekor) hidrofobik
mikrobiologi-atria
sterol hopanoid yg membantu stabilitas membran

Protein integral
tertanam antara fosfolipid Struktur Internal
Protein perifer berikt • Sitoplasma
Terdiri dari protein longgar pada membran • Struktur Genetik
Glikoprotein protein memp • Storage bodies (inclusion bodies)
gugus polisakarida
• Ribosom
• Aktin (protein fiber cytoskeleton)
Fungsi protein membran sbg protein pengenal, enzim,
reseptor, pembawa dan kanal (transpor) • Endospora (survival, triple-walled)
• Struktur membran seperti fluid mosaic
Mosaic m. protein tersusun spt lantai mosaic
Fluid protein dan lipid bebas bergerak dlm membran
Fungsi: kontrol kandungan sel secara selektifmikrobiologi-atria
permeabel mikrobiologi-atria

mikrbiologi-atria 7
 08/09/2019

Struktur bagian dalam sel c. Struktur Genetik

• Kromosom
a. Sitosol
• Tunggal, sirkular, molekul DNA double-stranded DNA
• Merupakan bagian sitoplasma yang cair
yang mengandung semua informasi genetik yang
• Mengandung banyak air dan substansi terlarut seperti dibutuhkan sel
ion, karbohidrat, protein (enzim), lipid dan bahan sisa
• DNA teragregasi pada daerah yg agak kental disebut
(waste)
nukleoid
• Daerah sitosol prokariot mengandung DNA disebut
nukleoid Plasmid
• Umumnya kromosom tunggal dan sirkular kecuali • sirkular pendek (0,1-10% dr ukuran kromosom), DNA
V.cholerae 2
double strand bebas atau terintegrasi pd duplikasi
• Tempat terjd met. sel ,ex: enzim, produksi a. amino kromosom
b. Inklusi • Tidak dibutuhkan pada pertumbuhan dan metabolisme
• Merupakan suatu deposit dalam sitosol • Digunakan dlm rekayasa genetika- manipulasi dan
•
mikrobiologi-atria
Bertindak sbg cadangan deposit lipid, pati dan senyawa transfer antar sel mikrobiologi-atria

mengandung N, P dan S

Ribosom
 Terdiri dari 60% ribosomal RNA & 40% protein
Dapat mengkode enzim yg dpt mendegradasi
 Fungsi : tempat sintesis protein dalam sel
antibiotik shg resisten thd antibiotik, toleransi thd
logam berat, enzim dan racun  Terdiri dari 2 sub unit
• Ribosom - (70S = 50S+30S)
• Ukuran
30 S = protein dan molekul
tunggal rRNA
Sub unit ribosom 70 Sverdberg
50 S = 2 molekul rRNA

Ribosom adl suatu kombinasi RNA dan

protein,

mikrobiologi-atria A model of a procaryotic ribosome.mikrobiologi-atria

mikrbiologi-atria 8
 08/09/2019

d. Sitoskleton Actin (protein fiber sitoskleton)

• Serat internal (sitoskleton) sering terdapat pd

prokariot berbentuk batang sedangkan batang-coccus
(sferikal) tidak ada.

• Fungsi : memberi bentuk dasar pada sel.

e.Kromatofor
• Hanya terdapat pada bakteri fotosintetik dan
sianobakteria
• Tidak mempunyai kloroplas, pigmen ditemukan pada
lamela dekat membran sel
mikrobiologi-atria mikrobiologi-atria

Endospora
Endospora yang survive terhdp lingkungan ekstrim
• Merupakan tipe sel dorman yang dihasilkan
melalui proses sporulasi dapat germinasi (keluar dr tahap dorman)
• Umum terdapat pada Bacillus dan Clostridium, Sel vegetatif
ex: C. butolinum, C. tetani, C. perfringens, B. anthracis Endospora = spora.

• Struktur tetap dorman sampai 100 th - 100.000 th, Spora bakteri lebih tahan terhadap kondisi
tahan terhadap kondisi ekstrim ex : panas, kekeringan, lingkungan drpd spora jamur
kimia beracun, radiasi uv.
Proses sporulasi
-Kompleks as. Dipikolinat dg Ca •- Dipicu bila tumbuh di lingkungan sedikit C atau N
-Stabilitas as. Nukleat spora •- Forespore dan dibungkus oleh 2 membran yang akan
Resisten terhdp
-Dehidrasi protoplast menjadi core endospora
panas dan
-Spore coat
agen letal •Material mengandung peptidoglikan terdpt antara 2
-Mengandung enzim DNA repair
membran core wall
-stabilitas protein lebih besar
mikrobiologi-atria
cortex mikrobiologi-atria

mikrbiologi-atria 9
 08/09/2019

Proses sporulasi
• Sel induk membuat protein
selubung spora Tahap-tahap pembentukan endospora
- Fungsi lapisan endospora scr
keseluruhan:
proteksi struktur dr kerusakan
- Fungsi :
Selubung spora penyaring
Korteks menjaga core
sewaktu dehidrasi
Core - merubah konformasi
dan melindungi DNA dr
kerusakan terdpt
protein larut asam yg
berikt dg DNA,
- Resistensi spora
mikrobiologi-atria mikrobiologi-atria
memp as. dipikolinat + Ca

Germinasi
• Dipicu bila terekspos oleh panas or bhn kimia Letak endospora
tertentu.
• Endospora mengambil air dan mengembang shg
selubung spora dan cortex retak terbuka dan sel
vegetatif tumbuh.

mikrobiologi-atria mikrobiologi-atria
sporulasi
germinasi

mikrbiologi-atria 10