Главни биолошки чиниоци загађења који се могу наћи у води и пренети водом класификоваћемо у следеће категорије: 1) Патогене бактерије 2) Вируси 3) Паразити 4) Гљивице 5) Други микроорганизми
Загађивање природних вода патогеним бактеријама,вирусима и паразитима долази од
биолошких чиниоца који се налазе у измети или мокраћи животињског порекла као и у отпадним водама.Зараза се шири преко оболелих особа или клицоноша који по околини сеју патогене клице које шире при вршењу нужде.Клицоноше могу бити и особе које су оздравиле.Нај ефикаснији начин сузбијања обољења јесу превентивне мере против загађивања вода прочишћавање и дезифенкција воде.
Вируси који се најчешће налазе у водама су ентеровирус,еденовирус и неидитификован
вирус заразне жутице. Ентеровирус се преноси фекалним путем до уста док се еденовирус преноси респираторним путем од човека до човека